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GrainGenes Sequence Report: AA036147

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Sequence
AA036147
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA036147
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GTTCGTCCACTTATCTCTCTACGTACTATAAACACGCAGATCGCCAGTAA
TCACCCACTGACATGCCGGCCCCATGTATGCTCATTCCCACCAGTCATAG
ACAGCTAATCGATCCGGTGCTTCCCCATTCCCCACGCAAATCAACGCACG
CGAGTAGGCGACCATCTCTCCCTCTTCGCCCCACTCGCCGATCTGAACCA
CCTCAAACCCCCAACCAAAACAGCACCGGGTCACTCCCCTCCCCCTCCCC
GCGCAGATCCAGATCCACCCGGCGCGGCACAGCCGCGGCCACCCGAGATC
CTTCCACCAATAATGGCATCCGCGGCGGCGCCGCCGCCGCTGTCCTCGCC
GGAGTCCGACCCGCGCCTCGTGGAGGCCTTCGTGCCCTTCCTCGAGAAGC
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ACCGCCAAGTCCATCCTCGACCGCCTCCAAAGGCCCCCTCCCCCCTCGCC
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GGCCGCGCTCGAGCTACTCCACAGGCTGATCGCGCACTCCTACATCCACG
GCGAGGCAGACCCGTCAGCGGATCCCTCGGCGCAGCTCGTCGCCACACTC
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TCCATGGCGACTGCCTGCTCCGTGCAGTGCGGGCTTGCTACGATATGTAC
TTGGGGAGCCGTAGCACCGTGAATCAGGCCACTGCCAAGGCGTCGCTCGT
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GAGACGACAGCAGCAGCTGAGGAAGGGGCGAACCCTGCAGATTTGCTTGA
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GTGGTAGCCACATTGGATGATGATGCTGATGTCAGGATTGGGAATAAGCT
GCGGAGGGATGCTTTCTTGGTTTTCCGGGCATTATGTAAGCTCTCCATGA
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GTTCCGTACTAGCGACAGGTACAAATATCCCTTGCCCGAAACTCTGTCTA
CTGTTTTGTCCCAGATCGTCTCAGTTTCTTTCTGTAATCTGATAGCAACA
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GCAGTGATTTGCAAAGGGCATTACACTTTTGAGTAATCTGTAATCTGTAG
TAATGTTGCTCTATGGATAACAAATCCTATAAAAACCAGTATTCAAATTC
TTATTACAATTTACGGAAGTTAGAAATGTGTAGTTTATGCTTGTTGCTAC
GTTATCGTAATAAAAATTTACCATGGTTGACCAATCTCATAAAAAAAGTT
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GGACCTGATACAGATGTTAGGTTACACTAGGAAGGTGTAGCATAGTGTTG
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CGTTTATACTTTTAAATTGACATTGAAACTACTAGTTAAGAAGTTTGAAT
GAATTTTGAAGATAAGATTCTGGGAGAAGCTGGTCGAGGGTAGCTTCTGG
GAGAAGCTGGCTAAGAAGCTGAAAAGAAGGGGGCCTAAAGCCCAGTTGGC
CAGTTCCCATCCAGGAAGGGCCTATTCATGCATAGCAACCTATCTAGTCT
TTGTCAGCGTACATTCAACACAGTGAACCCAGAATTATATACGTTTGAAC
CCTCAAGCACTAGATGCATTATGTGATCGATCCCAGCACTACTACACTTG
AGGGCCATCATTGGGTACATGTTTTGCACTCTACTCCCTTCTGGAAGAGT
TGACATCTCACTCAGCATATCACACTGCAGAGATGGAAATTCCCAGAGTC
ACTAGTGGGTACAAGTTCTGGTTTTGTGTTCTCCACTGGACACAAGGCTG
TGCGCCCCCATGCAATGAGGGTTATGCTTTGACCATTTGTAACAACTTAG
AGAGCCAAAGTTTGATGAATCTTGGAAACCACACTGGACAGACATGTAGC
AGCTGCCAGCTGTCTTTGCTACTGCCACACACTTTAACCTCTCTATGTGG
GAATAATTCCACACTTTGGCCACGTGGGACACTTTAATTGGTTGAGGGTG
TATTTGGAAGTTCATGAAGTATTTACACCCATGAATAAATGATGCAATCT
TATTAATCTTAGCACCTAACCAATAAAAGTTGTGTGGATCACTGTATTTA
GGTTCCACATGTTGCGAGCTATAGGCATATAGCGTTCCACCAATCCTCAT
GTAGTTATCTCGCTTCTCATTATCACGTCATTTTTGTTCATAGTTCAATA
GTTGAACTAAAAGGGCATTATACATTATGTTAAGGTTCTGCGGCGAACAT
AATTTCGTGTGGTTGAATTGGAAGCAATCTTTGGTTACTTTGGCTTTGGA
TCCAAGCATTGCCGTAGTTGCTTTTTCACATAGTTCGCAAACTTTCCAGT
CTTAATTTTGGTGTACGACTTCTGCATGCCCTTCTCTTGTATTCCTTTGT
TTTCTGCTCCTTTGTCACCATTGTTTTTAGCGCCTTATCGGAGTACTCCC
TACAATTCTTTTGAATGTGACGGTCTGGATAACAGTTGGGATACCAAGGT
GAGGTTAATTAGGGGGTATTTAATACTCTGCCCTTATTAAATAATATAAG
AAGCCCATAGTAGTGTTTGGTTGGAGCTCAATTAGCTGGCACATGTCTTG
AATCCTGTTACCTGCAGTTTTTAAACATTTAGCTGCGAAGGGCAGCATGC
CACAATAATTTACACCCCAGATGCATGTTTTTTGGCACCTGATTTTGTTT
ACTCTTTTTTTTTTGCTGTCTGGGCTTTTGCCCTGCACGTGTTTGGTGCT
TGCATCACCTTGTCTTCTGCTTGTTTCGCATTCTTGTTTTCTTGATGACC
CATTGTTCTTCTCACTGATGGATGTAGTAGAGATGGAACTTTGGAACCTT
TAGGGTACCCTCTAGTTTAGCCTAGTTCAAACAAATGAACTAGTTCTCTC
AAAAAGTGGTGTTTTGGCAAAACTTAGTTCATTTTTTTGTACTAAGTAGG
GTAAAGGGTACCCCCGCTGCCATCCTTAGGATGTAGTACTAATTTGGCTT
GTCAACTAGTGCTAAAAAGTCTGTGTATACACTGAAATGAGCGGGCATCA
GTTGTCCAGTTTTGATAACAGAGATGAACAGCTAATGCCATAATTCCATG
CATGACGTTGGACCGAAACCAGGGAAAAAACAGGCCAAATACTCACTTGC
ATCCTGGTAACTCTTTATGTAGCCTTGGTAGGGAGCAATTAGCAGCAACA
CTGAACTCGTGCCAACAACTGAAGTTACTTGATGGAGAAGTAAAACTTTA
TTATGTTGTAATTGATTCATGCAGTAAGTAAAAAATGTTGGAAATGGCAT
CAATGTGCATGATTAAGCTTGGGAAAACAACATATGGTCACATACTTCTC
TGGATCCTCTTCTGGGACTAACTAGGTTGCACCAGACCGTAAAGGTTACT
TGCTAGGAAGCAAATCCTACACTCCTCTGCCTGCAACAGCCTCATTGACT
CCTCGACAATGTGGAACTGTGCTAGCAACAGTAGCTAGCTAGTTCCATAG
GAAAACTGATGGGTTTATAATTATATACATTGACAATTGTTGGTTTAATG
TGTCTCCTTTTCTTCAAAGTAATGCTAATTTGGTTGATGATGAAGTTCTA
TTTGTTGAATAACTATAAACGATAGACAATTAAAGATAGGAGCAGGTTTT
GGGTTGAAGCCTTTCGTTCTAACTAAGTTACATTGCCCATGAAATTCATG
GTGATTGATTCTGTTATGATTGTTAGTATTTCTGATTAAACTGGAGTTCA
GGAACCTATAAGCAAACCAGTTGATAGTGATTGTCCATTTGCCTTGAGGT
CATACCAACCATCTAATTCTGTACAAACTGTTCAGATTGGGATGGTATTG
CTCAGCAGTTTGCACCCACTTAAAACATGTTTTTCAAAAACATCACGATC
AGAAGTTTGTGCATGTGGTGAGCAACACCCTCAATTCAATAAAGTAACTA
GTCTTGTTAAATATGTAATATGAAAAGTTTGGGCATGTGGATTATCAAGC
CTAACATACCAAGGTACATTACTGTTCACTTTCCAGGTAGAGCAGCAGTT
CTCAAAATATGCTATGATGTTCCAGCTAATACTATTGTATTTTTATACTG
ACCGTGCTATAGCCACATTTTCTTACCAACTGCTACATTTTGCTTGATGT
TTTTTATATCAATATACTTATTTTTGGCCTAACTATTTTTATTTAACTCG
GTCAGGTTTCTAGGTGCTATCAAGCAGTATTTGTGCTTGTCACTTTTGAA
GAACTGTGCCTCATCACATATGATTGTTTTTCAGTTATCTTGTTCAATCT
TTATTAGCCTGGTTGCAAGATTTAGACCAGGATTGAAGGCAGAGATTGGT
GTGTTTTTTCCCATGATCATTCTGAGAGTTTTGGAAAGTATTGCACAACC
AAATTTTCAAGCAAAAATGATAGTTCTTCGTTTTCTGGAGAAGCTCTGTG
GTGATTCTCAAATCTTGGTTGACATTTTCATTAATTACGACTGTGATGTC
CACTCATCGAACATATTTGAGAGGTACTTCATCACTCACTGTTCATTGCT
ATAGTTGAGTACTAGTGAGGTTTAATTTTTGTAAATGCCATCCAGAAACC
CTTTATCTGCTGTGTTACATTTTCTTGGACAACAGGATGGTCAATGGCCT
GCTGAAAACTGCTCAAGGGCCTCCTGCAGGTATCCCTACCACATTGGTAC
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TCTCGACTCTCCTAAAGTTGATTCAGAGCAAAACGATAATGATGGTGGAA
ATGAGTTTCCCCAGACAGAGAACAATGGAGATGCTTCTAGTGAAGTATCT
GATTCCCATTCAGAATTATCGAATGGGGTTTCAGAGGCTGCATCTCTGGA
GCAGCGCCGAGCTTACAAAATGGAACTTCAGGTGGATCTCATTCCACATA
CAGTTACTTTTATGCATTTTTTGATGATAATATGGCAATGTGGTGTCAGT
TCTCGATTTACTCATCACAGTTCCACTATATCTAAGATGATTTATTTCCG
TCTTCTTATGTGGTCAATTGATTTATGAATGACAGGAGGGTATCTCCCTG
TTTAATCGGAAGCCTAGAAAGGGAATTGAATTCCTGATAAATGCCAACAA
GGTCGGGGAGTCAGCTGAGGAAATAGCTGCTTTCCTAAAAACTGCTTCTG
GCTTGAACAAGACAATGATCGGTGATTATTTAGGGGAAAGGGAAGATCTA
TCCCTTAAAGTCATGCATGCATATGTGGATTCTTTTGATTTTGAAAATAT
GGATTTTGATGAAGCAATTAGAACCTTTCTTCAAGGTTTTAGATTGCCTG
GTGAAGCTCAAAAGATTGATCGGATTATGGAAAAATTTGCAGAGCGTTAC
TGCAAATGTAACCCAAAGGCCTTTTCCAGTGCAGATACAGCTTATGTTCT
TGCTTATTCAGTAATAATGCTTAACACTGATGCACACAACCCAATGGTCA
AAAATAAGGTATTTTGAAGTTATGTTTGAGTCTGCACTTTATCCATTTTA
TGATGCTATTTTAATATAATAATTGATGCAGATGTCACCAGAAGATTTCA
TAAGAAACAATCGTGGTATTGATGATGGGAAAGACCTCCCAGAAGAATTT
ATGAGATCCTTGTATGGAAGGATTTGGAAAAAGGAAATTAAGATGAAAGA
AGACGATTTTGTTCCTCAACAGCAACAATCAACAAGCTCTAATAAAATTC
TTGGGTTGGATAACATTCTTAACATTGTCATACGCAAACGAGGTTCAGCT
ATGGAGACAAGTGATGATCTCATTAAGCATATGCAGGAGCAATTCAAAGA
AAAGGCCCGTATGTCTGAGTAAGTTATGTTTGACATCTAGATGAATAAGC
ACAGTCTACGCTGTACAGTTTGCCTGATCATTTTATTTTTGTTTGCCCAT
TTGTAGATGCAGTTATATTATTCTTGTTGATATGTTTCATTGCAAATAAT
ATTTTTTGTATTTTGAATGATGATTTAGGTCAGTATTTTATCCAGCCACA
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TGCTGCCTTCAGTGTCCCACTTGACCAGAGTGATGATGAGATTGTCATAT
CCCAGTGCCTCGAGGGATTTCGCTGTGCAATACATGTCACGGCAGCTATG
TCGATGAAGACTCAAAGGGATGCTTTCATCACTTCCCTTGCCAAGTTTAC
ATCACTTCACTCTGCTGCAGATATCAAGCAGAAAAATATTGAAGCCATTA
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GAGAATAAAATCAATAAAGGAAACAAGTGGTACTCAGAAGTTTGTTTCAT
GTTGGTTGACTTTAAGGGTAGTTGTAGCTGATTTTTGACTTAATTGGTTA
ATGCTAAATTTTCGGAAAGTGCATTATAATAGCTGGCTGTGATGTTCTGA
GAAGAGCTTCTGAGTATCTCTATTAGAGTTGCTATATTTGCTTCTTGCGT
GTACTGACTATTTGCTATCTTTGTAATTCCCTAAGTCATTCGGGTTGGCT
GAGAAAATGTTAAAAACTTACTGCTCAGAGAACTCACTTTTAGTCTCGTT
TGGTCTGCCATTTGAATGTATCTACCGTACGCTTTTATTACAAGCATATG
CCATCATGCTAATTGCAGTTTGCCATATCTTACTTAGAGCATAGTGAAAA
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GAAAAAGAAGGCTCTGAATGCTGGTGCTGCTTCTAAAAGAGGTACTTATG
ACAGTGCTGGTGTGGGTGGAAAAGCTTCTGGTGTTGATCAAATGAATAAT
TCGGTGGCAATCCTCTTGGAGCAAGTCGGGATGGCTGAAATGAATCGTGT
ATTCATAAGAAGTCAAAATCTCAATAGTGAGGGCATAATTGATTTTGTAA
AGGCCATTTGTAAGGTTTCAATGGAGGAATTACGGTCCGCATCTGATCCA
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GCATTACAATATGAACCGCATCAGGCTTGTCTGGTCGAGCATATGGCATG
TCTTGTCTGAATTTTTTGTTACCATTGGCTGCTCTGAAAATCTGTCAATT
GCAATATTTGCTATGGACTCATTGCGGCAGCTGGCAATGAAGTTCCTGGA
GCGAGAAGAACTGGCGAACTACAATTTCCAAAACGAATTTATGAAGCCTT
TTGTTGTTGTTATGAGGAAGAGTAGAGCTGTTGAGATAAGAGAACTGATC
ATCAGGTGTGTGTCGCAAATGGTATTGGCCCGTGTTAGTCATGTGAAGTC
AGGATGGAAGAGCATGTTTATGGTATGTTATCTTTACTTGCGTATGCACC
TTGACTTTTGTATGATGCTGTTTGGAATAGCTTTATTAATGTTCCGCAAT
GCTGACTGTTGTGTGCATAATTTTTCAGGTTTTTGCAACGGCATCATATG
ATGATCACAAAAATATTGTACTCCTGGCCTTTGAAATAATTGAGAAGATT
TTGCGAGATTACTTCCCGTACATTACTGAGACTGAGTCGTCGACTTTCAC
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ATATAAGCCTCAATGCAATTGGTTTTCTTCGATTCTGTGCGGCAAAGTTG
GCAGAAGGTGACATTGGATCCTCTTCTAGGCTGAAGGAAAGTCCATCTTC
GAACAGCAGTGCACTCTCGCCTCATTTGACCAAGGATAGAAAGCAGGAAG
GTGCAGTCCATGTCGATAAGGATGATACTATACACTTCTGGTTTCCTTTA
TTAGCAGGTAATTGCGTTCTCCACTTGGCTCAAGGTAGCCTTTCTACTGC
TTTCCTTTGAATTATTTTCTAGTAATAATGTGTGGAACCAACTTTTCAAA
CCTTGCAGGATTATCTGAACTTACCTTCGACCTTAGACCTGAAATTAGGA
AAAGTTCTTTGCAGGTGTTATTTGACACATTAAGAAACCATGGCCATCTT
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GACAAAATGCAGAAAGTGATCCTGCAGAACTTGATCAAGATGCTTGGATG
TACGAAACATGCACGTTAGCCCTTCAGTTAGTTGTAGACCTTTTTGTCAA
GTTCTATGACACTGTCAATCCACTTCTGAAGAAAGTTCTTTCGCTCTTGA
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GCATTTGTTCGCCTGATGAGCAGTGCTGGATCTGTCTTTGTGGATGAAAA
ATGGCTAGAGGTTGTGCTGTCTTTGAAAGAAGCTACCACAGAGACACTTC
CTGACTTTTCTTATATCTCATCTGGAGCTTACCTTGAAAATGTATCAATA
GAAAATGGCGACTCTTCAGATAACAGGGAAGAAGAACCTCGACCATCAGA
GGATGGTACTGAAGAAACGTCTAGATCAAGGAACTTATATTTTGCAATTG
CTGATGCCAAGTGCCGAGCTGCTGTTCAACTCCTATTGATTCAGGTCTGT
AGTATTTCTTCTTATCTTGATACTACCTCCGTTTAAGGCCTACTTCCTCC
ATCTCAAGGCTTAAGGCCTATATTTTTTTTGAAAAGTCAAACCAACTGAA
CTTTGACCAAACTTTTAGAAAAAACTATCAATAAACATGATATTTTGTAG
ACATTGTAAGAAAATATATTTCATTATCTATCTAATGATATTGATTATGT
ATTTTGCATATTAATATTTTTTGGTAAAAACTTGGTCAAACTTGACATAG
TTTGACTTTTCAAAAAAAATATAGGCCTTAAGCCTTGGGATGGAGGTAGT
ATAAATTTAGTCAAAAGTCAAACAGTGCAAAGTTTGACCAAGTTTATAAA
ATAAACTATCAATAACTATGATAATAGATAGCTACATTACGAAAATATAT
TTCATAATGTATCTAATAAGATTGATTTGACCCTATAGAGGTTTATAGTT
TTTTCTAAAAGTTTGGTCAAACTTTACAATGTTTGACTTTTGACTAAATT
TGTAAGCCTTATTCTAAGGAACGGAGGGAGTATCTGTATGCCTCTAAAAG
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GTTGCACTGTAGGAACTGATTTCTTGATTCATAGGCAACAAGACTCTAAT
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CTGCACGTGTTCTGCTTTATCATGTTTCTCATGCAATAGGCTGGTAATTT
AAATATGGCCCCTGTTTTAATTACTTGTATGTACTCACTTTCTGTAGGCT
GTGATGGAGATATATAACATGTACAGAGCTCAGTTGTCGTCACAGAACAC
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TAAACAGTGACAATGACCTGCGGACCAAGTTGCAGGAGTTGGGCTCTATG
ACCCAGATGCAGGATCCACCATTACTACGCCTTGAGAACGAGTCATACCA
GTTGTGCCTCACTATTCTCCAGAATATATTTTTGGACAGAGCTCCAGATG
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CTTGAGGTGTACTTGAGCACAGCAAGGCCTGCTCACCTTTCCGGTGGTAT
ACAGCCACTTGGCCATTGGCTTATTCCGGTCGGTTCTTCAAGGCGGAGGG
AGCTTGCAGCCAGGGCACCCCTTGTTGTCTCAACCTTGCAAGCTATCAGC
GGTCTTGGTGACTCGTCTTTCGAGAAGAACCTCGGCCAGTTCTTCCCCCT
CCTAGCTGATCTCATAAGCTGCGAGCATGGTTCAGGCGAAGTGCAGGTGG
CCTTGAGTGATATGTTTAGCACTTGGGTTGGCCCACTCGTGCTTCAGTCC
TGTTGATGCTGAGCACCCTGTGATATAGTATACCTCCACATGTAAGTTAT
TCTTTGTTTCAGTTTTTATATCGTCAGATTACTCCCTTTCCCCCATTTTG
TTGTGTTTATCATTTTAGTTGTGGGAAGTGGTTTCGAGCGGAACTAATCA
ATCATGTAGATCTTTTTCCCTTCTATGCTCTTGGTTTTCCGCATTGGGAA
CAGTGTATGTTACAAGATGATTAAATTGTACGCCATAGTATAGTTCACCA
AGTTTGGAGCAGTTCTGCTTTGCATGTTGTAGTTGCAGCTGTTGATGCAC
AGGCAGCTCCAGCATTGTGTTGAACATTTCGTTGGTTTCCGTTTATCATC
AGTTCAATCCTCAAGCCAGAATGATGATTTGCT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.