Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA040961

[Submit comment/correction]

Sequence	AA040961
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA040961
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CTTGCGCAGCGCCGTTTGAGCTCTCCTGGCCTGCCGCTGCCCCGCCCCCG CCCTCTCCCGCCTCTCCACCGCACACCGCCGCCACACCATCTTGCTCGAA ATCTAATCGGCGCTTCCCGTCCGGCGAGGCACGACCTGCCCCGCGGGCTC CCATCTAGTGGCCGTTCCCAAGCTGTAGTCGTCGGACCTAGCTGCAGCCC CTCGCCGCCCAAGCTTCCAGTGAGGCCCCTCTCCCTCTCTCTCTCTGCGT ATTGCCTACAGCTGCTGCAGCTCTCCGTGCGTGTTTATTTTCTTCTGAGA ATCTCTGTGCGTGTTAGTATCGAGGCCGCCAGTGCTCTCCCGTGCCTAGT TTGCTTGTGTGTGTGGATTTTCTTTAGATTGACGTATGTGGATCTGATAT GCTACTACCGCTAGCTGGTTTTATCCCTTGTGATTCAACCCTATTTTTTC TTTTCTAGTACGATGTGTGCCATGTCTATGAGTTGGTCGCTGTAGTTTGT TGGATGGATTATGTTGCTAGTACATAGAAATATAATTCATACCAACCATG TTATGTATATCTCCCTAATTAATAAGCAGCCAGCTAGTATACTTTACATT GATCAGGGTAGTTGGATATCCATGTGAATGTTGCTGCTAATTAATTTTTC AATTCTTGGTATCCTTTCTCTCTTTAATTCCTTTATCAGATTTATGACTT TTGATAGCTAATTTCTTGATGAGATTATTGTCAGAAATCTATTCTTTATT ATGGAATTGAGGTGTCTCCATCACTAGAAGTTTGATGTAACTCCATTAAG TTCGTGGAAATCTAAGACATTTTGTTTTCCTCCCTGCTTTTTGTTGTGTT GACAGTAGAGGCCCATGCGTTGCACTTATTTCTGACTTATTTCCTCTAGA AGTTCAGATTTATGCATTGTTGAATGCCATGTGAGCTGCATTTGGTTTTA TAATCTTTAAATTAAGAGAATATATAATAAGTCTGCTGAATGACACTTTC AAAATATGATGTGTGCTTCTACTGGTTGTGATTATTAAAATATTGTTGTG TGGCATTGCTTTTAAGAAATAGAAGTGGAGCCTAATTTTATATTGTCTAA TTTGTTTGGTCATTAGGATTCTTGGTCCCAGGAATTCAGGAGCCCTCTGT TTGGTGCAGTGACCCCCCTTGCTTGCTTGCCACTACCTCCCGCACCGGTT TATGAGTCGACCTACTAGTTCATTGTGCGAATAGAAATGTCCATGTATAG TAAATCTTTGATCTGTTGTGTTTATTGGCTTTATTATGTGTACAATTGGG TGCACACCTTCTCTTTTCTTTTCCAAACCGCGATAAGACCTATCTATATT AATTCTACCAACACTATCCACCTGTTTGATTTTCCTTGTGTCCTCTGGTT TTGCTATTATTCTGTCGCGTTTTACTATTGGTTGGGTAGTAATCAAGGGT GCAGCTAGCATGGAAAAAGTTGGACGGATGCGCCTATGTACAACAGACAT ATTTTAAATTTGTTAGATGTCAGTACTGGCACAAATCATTTGTAAAGATG GCACGCAGAACAGCACACGGAAGATGGTTTGCTTAGGCATCTGGCAGATT CTCCCCTTTGGAAAGACTTTGATGAAAAACATCCAAATTTTGCTAAAGAT AGCCGAAATATCAGGCTTGCACTAGCTACAGGTGGTTTTAATCTGTTCAG GTCAATGAATGTCAGCTATAGCATTTGGCCTGTTATATTGATTCCTTATA ACTTTCCACCCTCCATGGTTATGAAGCAACCAAATTTCATCTTATCAATG TTGATTCCAGGCCGAAATGCTCCTGGTAGTCATATTGGTGTCTATTTCGA GCCACTAGTTGATGATATGCTAGATATGATTCTTCATGGTTTTAGGACCT ATGATGCTTCTGCGGGGAGCTACTTCCAGTTGTTCCATTAGTGCTGGATG TTTACATTTTATAACCATATTTTACCAAAAAATTCTCTTGACTATTTTTT TAATTGTCCTTATGTGGTTCTTAACACAAAAGCCTTCTAATGTGACTTGT TAAAAAAGACTAAGCTAGTTGAAACTGGCCAAGTAGCCTGTAGGATTAGG AGAGCTGATGGATGCTATTTTTGTTAATTGATACATTGATACATAACTGG GTTTTCATAATATTTGCTAAATGACGCAATCTGGTCCTTTTTTTTGATAG GGAAGTTTCAGTCATGGATATCACTCAGATTCTCCTAGCTGCTCAATCTC CGGATGGTAACCTCCGCGCAGCAGCCGAAGGCAACATTAAGCAGTTCCAG GAGCAGAATCTTCCCAACTTCCTCCTATCCTTGTCAGTTGAGTTATCCAG TGATGAAAGACCACCAGAGTCTAGAAGACTTGCTGGTATTATCCTTAAGA ATTCATTGGATGCCAAAGATTCTGCAAAGAAGGAGCTTCTGATTCAGCAA TGGGTCAGCCTGGATCCATCAATCAAATTGAAGATTAAAGAATCATTGCT CATAACACTAGGATCTTCAGTTGCTGATGCAAGGCAGACGTCGTCACAAG TCATTGCAAAGGTTGCATCCATTGAGATACCCCGTCGGGAATGGCAAGAC CTCATTGCCAAATTATTGAGCTACATGACGCAGCCGGGTGCGTCTGCACC ACTAAAGCAAGCAACTCTAGAGGCACTGGGGTACGTGTGCGAGGAGATTC CTCCTGAGCACTTGGAGCAAGATCAAGTGAATGCTGTTCTGACTGCCGTT GTTCAGGGAATGAACCAGACAGAGCTAAGTTCTGAAGTCCGTCTTGCAGC AGTCAAAGCTCTGTATAATGCTCTTGATTTTGCTGAGAGCAACTTTGCAA ATGAGATGGAGAGGACCTTTATAATGAAGGTAATCTGTGAAACGGCTGTG TCGAAAGAAGTGGAGATCAGGCAGGCAGCTTTTGAGTGCCTTGTTGCGAT TGCATCTACATATTATGTTCACTTGGATCCTTATATGCAAACTATATTCA ACCTGACAGCTAATGCTGTGAAAGGAGATGAGGAACAAGTTGCACTCCAA GCTATTGAGTTCTGGAGCACTATTTGTGAGGAAGAGATTGAACTCCAAGA AGAATATGAGGGATCTGATGATGCTAACTCAACTGTAAATTATCGCTTCA TTGAAAAGGCCCTCCCTTCACTAGTTCCAATGCTGCTGGAAACTCTGTTG AAGCAAGAGGAAGATCAAGAGCAAGATGATAATGCTTGGAACATTTCCAT GAGTGGTGGGACGTGCCTTGGACTCATTGCTAGAACTGTTGGCGATGCAA TTGTCCCCCTTGTGATGCCATTTGTGGAGGCTAATATCACAAAGCCGGAT TGGCGTTGTCGTGAGGCAGCAACTTTTGCATTTGGTTCTATCCTTGATGG CCCCTCCCTTGGGAAACTTGCTCCCCTGGTACAAGCTGGACTTGATTTCT TGCTCAATACAATGAATGATCCAAACAGCCAGGTAAAAGACACCACTGCA TGGACTCTTGGGCGAGTATTTGAGCTTTTGCATTCTCCATGCAGTGCAAA TCCAATCATATCAAATGCGAACCTTCCTCGTATCATGACTGTGTTGCTAG AGAGTAGCAAAGATGTTCCAAATGTGGCAGAGAAAGTTTGTGGAGCAATA TATTTCCTTGCCCAAGGTTATGAAGATGCAGAGCCAGTCTCATCTTTGCT TACACCTTATCTTCCTAATGTTATAGCTGCTCTCCTTACTGCTGCGGATC GTGGTGATGTGACCCATTTCAGGCTTCGTGCATCTGCTTATGAAGCACTG AATGAGATTGTAAGAGTCAGCAACATACCTGAAACTTCAAGCATTATAGC GCAGTTATTGCAGGAGATCATGAGAAGATTGAACCTTACATTTGATCACC AAATATATTCATCAGGTGACAAGGAGAAGCAAAGTGATCTGCAGGCTTTG CTGTGTGGTGTATTGCAGGTCATTATCCAGAAACTGAGCAGCTCAGATGC AAAGTCCATAATTGCCCAGAATGCTGATCAGTTGATGCTTCTGTTCCTCC GTGTCTTTGCCTGCCACAGTGCTACTGTACATGAAGAAGCTATGCTTGCC ATTGGTGCTCTTGCTTATGCCACTGGTCCAGATTTTGTGAAATATATGCC TGAGTTTTTCAAGTACCTCGAGGCAGGCTTGCAGAATTATGAGGAGTACC AAGTATGCTCCATCTCTGTAGGGGTGGTTGGTGATATTTGTCGTGCCTTG GAAGATAAAATTTTGCCCTTCTGTGATGGAATTATGACCGTTCTTCTCAA GGACCTCTCAAACCCACAGCTAAACCGGTCTGTCAAACCTCCGATTTTCT CATGCTTTGGAGACATTGCTCTTGCCATTGGTGAGAATTTTGAGAAATAC CTGGCATATGCTATGCCAATGCTTCAAGGAGCGGCCGAGCTTCTTGTTGT TTTGGATCAAAATGATGAGGATATGGTTGATTATGGTAACCAGCTCAGAC GTGGCATATTTGAGGCATACTCTGGCATACTTCAGGGCATAAAGGGTGCA AAAGCTCAGCTGATGGTACCTTATGCAGGCCATCTATTGCAGTTCACGGA AGCTGTGTACAAGGATAGTAGCAGGTACATGTCATTTCTGTTCCCTTATA TTTGTTACATACATACATGGGCGATTGGTCTTGTTCCTTAACATGATGTA CATGTGTTTTTACATTCAGGGATGAGAGCGTGACCAAGGCTGCGGTTGCT GTCCTGGGGGATCTTGCAGACACACTTGGACCAATCTCCAAGGATCTGTT CAAGAGCCACCTCTTCCATGTTGAGTTGTTGAGGGAGTGCCTCGATTTGG ACGACGAAGTCAGGGAGACGGCATCATGGACCCAGGGAATGATAAACCAG GCAATAGTTTCTTAGTCTGAGAAATTGTCTTGCTTTGTCTGTTATGGCGG TGGCAGATGTTCTGTTTTGTTGCTGCGCCAAAGTCTGTTTTGGCGCGCGC AGATGAACGGAAGGATACCAAAGTATATGTAGCGTCGGTTGTAGGAACCA TGTCATAGGCGTCTTCTGTGTTTGTTTTATTTCTCGGTCTGTCAAGTCGG TATGGGTCACACATTTTCAGTGTGTCAAGTCGGTGTGCGTCGCATTTGAC ACGGCAGTGGGGTTATGGCATTGGATGTCTTGAACAGCTACTAAGCTTGT TAGTGTATTCTGCTCTATGTTCATCCATGCTATGCTGCTTGATGGTACTG CTATCGTGGTACTATGACAGAGTTCTTTTGCTCTAGTATCTCTTGTGCAG GTGTTGTTTATGGGTTGCAGTATGCAGCTGCTGCATTCAGGTAAGCAAAC TGGTGAGTACAAAATTTTGTGATTTATTTCGCCATCTTAGCCACAGGCTA CACCACATAACAAGGTGCAATTCGAAATGTTCCTATACGCGTGGAGACGA ACTCTTTTGGCAAACACCGAAGCAAGGCAACCTGTATGTTGTGTCAAGGC ATCTCTGCCCTTCTGGTGTCATCATCTTCAGGTGGCCTCTGTGGAGAACT GGAGATGATCTCCCTCCAGCTCTGCCCACCACAGCGGCGACACCTTGCGT CGGGTGGCGTGCTGGTGATCTCCCTCAGCTGCCTCGCGACCTCTGTCATC GTTGGTCGCCGCCTTGCCTCCTGGTCGGTGCAGGAGCGTATCATGCTATC AAGCCCGTCGATGGTCTCGGCCACTCACAGCCGCGTCAGCCAGTCCACGT GA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.