Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA040456

[Submit comment/correction]

Sequence	AA040456
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA040456
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	TTTCCCTTTTCAATCTCCATCCCGAGGAGCCACAGCCGCGAGAAGAGCAG AGATAGCTCAGCCTCCACCCCTTCCCATCGCCGTCGATGTTGCTCCGCCT CCGCCCGCCGGCCGCCGCAGCCGCCGCGGCGAGCTTCTCGTCCTTCTTCC CCTCCGCCCCCTTCACCCGCGCCCTCCCCTCGCCGTCCTGGCGCCCGCGC CCCCGCCGCCGTCTCTCCTCCGCCGCCGCCTCCTCCTCCCCCAAAGGTAA CGCCTCCCCTGCGCCTCGTTCGTACCTTGCTACTCTCCGTTGATTCGAGG AGCTGTAGACATGCCTCTTAACATTTTTAATCGTCCGAAATCGAACAAGG ATGGCAAAAAATTGATGGGTTTAAGCTGTGGCGCTAGATTCGGGCGGGAG ACTGGACGCGCTGCGGGAGCGGTACGACGTCATTGTGGTCGGAGGGGGTC ACGCCGGCTGCGAGGCCGCGCTCGCCTCGGCTCGCCTGGGCGCCCGCACA CTCCTCCTCACCCTCAACATTGACCGGATTGCATGGCAGGTCTGCGCTGA GCCGAGCTCTGTTACAGTTTTCAGTTCTAGGTTTCTCCTTCAGTTGTGTG GGGGCGTATCATTTGCGTAGGGTAAATGTGTAGTTTATGTTCCTTCTGAC ATTATTAGTTGTAGAATATGCAACCGGAGTGATGTGCTAAATGGATTCTG ATCAATTGGTCGTTGCGCCGTAGGAAATGTCTGTAACCAAGTTATGTAGT CCCAGAATCAAGCCATTAAACCATGTCCCGCAAGAGCTAAACAATGTGCA ATGCTGTGATATGCTAGCAGTGGCGGAGATATGGAAGAAAATCTGGACGG GCCGGGCTACAGCAAAGCATGTTTTTTCTTCAGAATTTGTTACTCCCTCC GATCCATAATAAGTGTTGCTGTTTTGAACTAGCTGTTTTGAACTGCGGTT AGTTCAAAACTGTGACACTTATTATGGATCAGAGGTAGTACATTTTTATG TGGTGCTGTATCTGATGAAGAGTTAACATAACTACTGAATCTAAAGCTGT TTCAACCTATGGTAGAAAGAAATTTCTATGTGGTATTTGCAAATTTGGAT ATTCTGTAAGGAGCAAGGAAGTATCCTTAGTCAAGGAGCTATCTGTCAGT TTTTGCGATATTGCGGAAGCCAAAAGGGAAAGCCACTGACTTATTTGTTT TCTGTTATTTTATACAGCCATGTAACCCTGCAGTGGGTGGGCCTGCAAAG TCTCAACTTGTCCATGAGGTAGATGCCCTTGGTGGTGATATTGGAAAAAT TGCAGATAGGTAGAAGTTCAATCTTTTCTTCTTTATGGAGATGAATTTTC TCTTGTGTCTTCGGTGGTTTTGGCTGGGGTATTGGGCTGAGAGATGCTCG CAATGCTACCAAATCAACAAATATCTTTTGGTATACTCATTGCCTCTTTC TTCTGATAGGTGCTACTTGCAAAAGCGTGTGCTAAACAGCTCAAAAGGCC CTGCTGTCCGTGCACTGCGTGCTCAGACTGATAAGAGGGAGTATGCAGTA GAGATGAGGAAAGTTGTAGAAAGGTCAGTATATATAAAAAATCCTTTTGT ATCATAACTCCATAACTTGCAGAGAATTAGCCAAAAATGTTTGTTTGGTT GACAACTTAAGTGCTTTGTTCTATGTAAATACGAATGTTCATTTTGGTGA CGTCTCATCTAAATCGCATGCTTCATATAGGTGGTTCTGACATAATCGTG TTTTTCTTATTATTTTCTAAGCTGCACAAACATAGCGACCTCACTAATTC TGCATGTGGTACTCCTGACCAAAGGCTATTGACAACATGAATCTATTTTC CTGCATACAAGTTCTCAGATTCATAAAGGTGAATCTCATGTGCAGATTTT TCCGCCTATTAAATGAAAATATTGATGTGATGTGTATTAATCTCTAAATT TGCTTCTATTGCCGACATATATATCTTAGTCCGATATCTTTCATGCTACT TACTTATTGCTCCACATGCTATTTCAGCACACAAAATCTTTTCATTAGAG AGGCAATGGCTACAGAAGTTATGATAGGCAAGAATGATAGTGTTGAGGGT GTTCGAACTTTCTTTGGCATGGACTTTTATGCACCATCTGTTGTACTTAC CACCGGAACATTTATGAGTGGTAAGATTTGGGTTGGTAGGACATCAATGC CTGCAGGGCGAGCTGGAGAATCAGCTTCTCATGGACTTACTGAAAACTTG CAGCATCTGGGTTTTGAAACTGACCGTTTAAAAACTGGCACGCCACCACG GATTGATCGCAGGACAGTTGACTTTTCTACATTGGAAGCCCAACATGGTG ATGAAGAGGTGCGTAGAACATGTGAAACGATTTTTTTCTTGTGATTATGT GTTCTTGGTTATCTGCATTTGGGGGACCAGTTGCCACTTGGCATCTATAA TATAAGTATGTTAAATTAAATAGTGCACCTTTGTACTCTATCTCATATAG TAAGCTTCTGTGGTTTAGTTAGTTTTGGTTTCTCTCTCGCTTAGCCTATA TGTTTTGAATGAGCTGTGATTTAAGCTTAAGCCTGAGATTCAAGCTGATG GCACCTCTTGAAACAGGTAGGATGGTTTAGTTTTGATCCTGAATTTCACG TTGAGAGGGAACAAATGTGCTGCTACTTAACACGGACTACAAAAGACACA CACCAAATTGTTACAGACAACTTGGATGAAACACCAACATATGGTGGCTG GGTCGAAGCAAAGGGACCAAGGTACTGCCCAGCAATTGAAGACAAGGTAT TGTATCATGGACATTGCAAAGATCTTGGAAACAAAAAATAGTTAAGCTAT ACATACTGATTTATTTGCTGATCACATCCTAAATATAAGCAGATATTTCT TTGTTGCAGATTGTAAGGTTCAAAGATAAAGAATCTCATCAAGTCTTTCT TGAACCAGAGGGTAGAGATGTCCCTGAGCTATATCTACAGGTCTCTCTCC ACTCCTCTTTCTAGTCTGCATCTTTTTCCTTTTTCACCAAATTGTTTTTA GTCTGAGACTTTGTTATCACTTGTTCTTATCTATACAATTTTGTGTAAAA ACGGTGTCTTCTGCAATATTTCTTTACTGAAAACCTACAACTTAGACTGT TTATACATCTTATACAGGGATTTTCCACTGGTCTTCCTGAGCGATTGCAA TTACCACTTGTGAGAACACTACCAGGACTGGAAAACTGTGTGATGCTAAG GCCAGCTTATGCTGTTGAATATGATTACTTGCCTGCTTATCAGTGCTCAA GATCGCTTATGACAAAAAAGTTTGAGGGCTTATTCTTCTCTGGTCAGATT AATGGAACAACAGGATATGAAGAAGCTGCAGCTCAGGTTTGTTCATTGTT TCTGATATCTCAATCATAGGGAATATGGTTAATTTCACCTGATTTTCTGG ATCCTAATCTTGCTCACTTTTGTTACAGGGTATAGTTTCAGGAATCAATG CAGCTAGACATTCTGATGGAAAGTCACTAATAGTTCTTGAGAGGGAGAGC AGCTACATTGGGACTCTGATCGATGATCTTGTTACAAAGGATCTTAGGGA GCCTTATCGCATGTTAACAAGGTATGAGTTATCAGTACAACAGCTCTTGG TATTGATGCTTAAAGGACTCGATTGAAAAAAAAGATAGTTAAAGGCTCCT ATGTATTAAGACAAAGGAATGTGTTGTATTATTTGTATTTAACTGTAAAT ACTAGAATCTATGTAATAATTCTAAAAGGAAACATGGCAAATTTTGAGGA TTTGCCACTCCATTTGTTGGAATTTATGGATTTGTGAATTGCCGTCTCAC CGACACGTGGGTCCAGGGATCACATGTCGATGAGATGTGGAATGGCAAAT CTTTAGTGCTAGCGAATGGAGTGGCCTTAGCCCCCTATCACCATAGAGTA ACAAACCATGACTCTCACCAAAGACTGTCAGATAGGGCTAGGGCTAGTTA AATGGCGAGCAGGACAATAGGCAAATGTTTCGGAAGTATGTTTAGTGAAG GATATTACCAACTTCCGTGAAACTAGACAGGAGCACTGCTCATTTATTAG GAAGACTAGCAAATAATGCCCGTGCGTTGCACTGGGACATAAAGATGCAC GTAACCTTTAAAAAAGAAAAACACATATACATGTGCACACAAAATCTCAG AGAAAAAACACACGGGCAAAGATCTATGAGAAAAACACGAGCACACACGT GTATCTTTTGATCCTCTTTCTCAACTGACGGTTGACGATGTCCGTGCCAC CGTCCATTCTAGTCGCAGCCACACACCAGCGAGGCTCAGCTCCGGTCTCT TCCACTAATTTCCCACCACATTCGCCTATGCCTACGCGTGTGACCTAACA ATCCTAACTTCGTCTTTTGCAGTTTCGATCACTACCGACCACATCTGCCA TCGCCAATAATATTTTAGTCGACGTGTCTTCAGGACATACATGGCGCGTT CGGAATACTTTCTCCACTCATGGCGCGACAGTCTCGTATATATTTTCAAA TTCATCCATAAATATCCTTTTCGTTTCAGATTCAATTAGGCAAACACACT TCACGAGCACCGAGCCACAAGTCAACCCTTAACCCCTTAGGGCACCAGCC TGGACGCATACGCCGGCCCTATTGCTCAACCTCCGTCTTCAGTCTTCAGT TCCCAACACTTCCACCGGCACCGTTCTGTTCTATCTCATTGAGTTTCTCT TGCTTGCCTGGTTGACGGCTAATTTTTGGAAGTATATAGACCGGTAGAAT TTGTTTTAAGAAAGCAATGTGGTACTATTATTCTCGGCAAGGGCTCAGGG CAGCAGATAGCAACGTGGGTTAAATTGTTAAATACAAAAATTGTTTAAAA AAAGGCGAACGGTGAAAGGCCTTATTTATTTAAAACGGCCCATGAAGAAT TGTAATCGCCTGCTACCAACTACCAAGTGCGTACGAGCTTGTTCTGAAAC GTTTTTATTTTTTGTGGTGAGCTATTCTTTCGTGAAACGTTTTTTTTCAC TTATTAGGGGTGTCATGATGGTATTATATGTATTTTGGTGGGAGGGTAAA ACAGTCCAAAAAAATGTTGGACCGGAAGAAACACTTCGTCCTTTGTTATT AGGAATAGAAAAGGTGGAGCGATAATTACAAAATCACTTGTTCTCTAAGG AACAAGTCAGAAGAACCTTTACTGGCATAATGCTTTGATGTTGTCTGTAA TCATCCATTAGAAGGAATCAAAGAGCTTACCATTTTATCGATTTAGTGTG ACTCTTTGAATCACAGTTTGACTGACCTTTTCTGCTGTTGGCACTTGTGG ACATTCAGTCGTTCAGAGCATCGTCTACTATTTCGATCCGATAATGCTGA TAGTCGGTTGACCCCTTTGGGGAGAGATATTGGTTTAATAGATGATAGAC GCTGGGAGCTTTATCAGTCAAAGCAAGCCCGCATTAAAGAAGAGAAGGAA CGGTTGAAGCATACACGAGTATCAGGTAAGATTTATACTTGAAGCTGAAT TACCGTATGGATTTATGCAAAGTTTCAAAATGGTATTGTTTAACATGTGC TCACTTTGTTTAATTACAAGCATGGTTTATGGTTCTCTAATTAAGTATTC CATTTGCAGGAGATGAATTCGCTGCTGAAGTTACCGCAGTATCCAACCAA CCTATAAAGCAGTCATCAACACTTGAAGCCATACTGAAAAAGCCACATGT GCAATATAAACTTCTGGATAAGCATGGATATGGAAATGAGCATTTATCTC GAATAGAGAAAGACTGTGTGGAGATTGATATCAAGTATGAAGGATTCATA GCACGGCAGCAGAGTCAATTACAACAGGTAATTTGCTTTACCATCATGTC CTTTTATTCTGAATTAAATATGTAAGGGAAGTTCTTGAAGTGTAAGAAAA ATGGTTAATACATGTTTAAGAAGTTTGTCAGGCAGTGATGCATAGTGCAA GTATCTGCCATTCTATTTAATTGTTTTTTTTTGCTTTGTTGAGAAACTTG TATTTAGCTTTTTGGTATCAGTACTCCCTCCGACCCATATTACTTGACTT GGATTTGTCAAAATTTGAATGAACCTATATACTAAATAGTGTCTAGATTC ATCCAAATCTAGACAAATTTGAGTCAACTAATATGGGCCGGAGGGAGTAC TAGATTTTCTATCTTTCTCCATTCAATTTTTTTGTCTTGCCCTGTTGAAG GAAAAAAACACCTCCATTGGCATCAGTTATTTAATCCGTCTTGTTTTGCT ACTTGAAAAACCTGCTGACCCCTAATTATGTTTTTCCTCTTCATCAGATT ATAAACCAAGAACACAGGAAACTTCCTGAAGACTTGGATTACTATTCAAT GTCAAATCTATCACTTGAAGCTCGTGAAAAACTTTCCAAGGTATGTGAAG CATCTGCTTCTACAGCACATTTGTTTTTCCTGGGCTAGCACTGAGAATAT GTTCAAGAGCGTGACCTGCCAACATAAATCTGTAGCATGCATTATTCAAT CCTTCATTTAGCAAGACACATCTTGTGTGCACTTCAGCCTTTGTATCAAC GATTTAGAAATGCTTAGATGTCTTGATTTTATTCGAACAATCCTCGAGGT TTCAGCTGCTACAAGTTTGAACTGCTTGACCACGTCCTGTATGAACTCTA CTGTCGTGTACATACTGACCCAGTGTTTAAAGCTTGACAACTGCAGCACC GTACCATTATAAACAGTCCCAGTTTCATAAAACTCATACCCTGACAATTC ATCTGCAGGTAAGGCCACAGACCTTAGGCCAGGCGGGCAGGATCGGGGGC GTGAGCCCAGCCGACATGACGGTCCTTCTCATTTCGATGGAGAGCACCCG GCGCATGGCTGAGTACAGGCGAAAGCAAGACATGCTAAGGTCTGCCGCCG CCAAGGCAGACGGACCTTCAGAGGAGGCG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.