Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA007961

[Submit comment/correction]

Sequence	AA007961
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA007961
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGGCGCGGGCTTTGTGGATCGTGGAAGAGCTTAGCGATAAGATCGATCA CGTTCCGAGATACGTGAATCGACTGAATAAAAGGAAGAGCAGAAAAGACG CAACAGTAAGGCGTCACAAAATCTCTCTGTCACCTGCGTGTGTTCGTGAG TGTTCTACCAGGAAAGAGTTTCAGAGCGACGAACTGAATCCACCTAAATA TTCCACGTGATCGCGTTGTGTTCCAGGGCTTGAATCTGTCAGGAGCTGCC TTCAGCTCTGAGCAACTGCACAAATCTCATGACCGTTGATCTTCGGACCA ATAATTTCAGCGGAGAACTCACCAAGGTCAATTTCTCCAACCTACCCAAT CTAGAGATCATTGATCTTATCGGGAACAGCCTTACTGGCACAATTCCAAA TGGCATCTACTCATGCGCAGAAACCTGACTGCGCTACGCCTATCATCCAA TAAATTCCACGGCCAGTTACCGGACGGAATAGGTAATCTGAAGCTCCTCA CCTTCCTATCACTTGGTAATAACAGTCTTACAAATATAACAAATGCGCTT CACATACTTGGAAGCTCCAAGAACCTCATCACCTTTCTTATTGGCAAAAA CTTCAGGCATGAGGCCATCTAGTGGTAAGGACGCTGAGTGGAGTGTTGCT CGGTGACCAGGGGAACTTAGTGGGATGCATGATCGTCGGCGCCTCACCCT GGCGCCGGGGGGCTTGCCGTCGCCGGCGCGATCGTCGGGTGGATCGTCGG GCTCTAGGTTTCAGTGTCTTGGGTCGGACTCCGACTCCGATGGGGCTGCT GGGGCGGACCGTGTGGCGCTCGAGGCCCTCGAGGATGTCGACGGGGACCT GGGATGGACGTCGGTGTCGCGCCGGCATCGGAAGACGGGGGAGGAGCTCA AGCAGGCTTTCTGGGAAGAGGTCGGCTTCCCCACCATGGCGTCAAGATTT TGGGAACGGAATTCGGAGTCCCCCCCGGGTGAGCTCTGTTCGCCGGCGGT GGGAGCAGTTCGCTGCAGGTCGTCTTCGCCGGCGTGCCGTGCCGGGGGTG ATTCTCCTCCGGGTTGGCGTCTTCGCTGCAGTCCACGGGTGAAGCCTTGG CGTGGCCCTCTGCCGCCGCGCCGGAGGTCCTCGCCGCCGATCCTGGGCGA TCTGCTCGCTGTGAAGTTGGGAGCCCAGGGCGATCCGATTGTTACGCCGT CTGCTGAGCTGGCTAAGTCGGGTGGGACCGTGCCTGTTTTTTCCTGGGAA GCGGTGTCCAGAAGGGTTTGGATGGCGAGGGTGTCCTCAGATCGATCGAT CCTGTCGCTGCCTCGGTCTCCTTCGCCGCCCCCTTCGAAGACGGTTAGCA GCTCGTTCGTGCCTGCAGCGACAAGATCGTCTCCGCCCAGATCGCCTTCG CGAGGTTCCTTCGCCCAGGTGGTCGCCATGTCTCACCAGCCTCGCGGGAT TCCTGCTGGTCCCAACGTGCCCAGGGGTCCTCCACCTCCGCAGGGTTTGG CTGCTCAAGCTGTGGGGGCGCCTGGGGCGGAGGTTGCTCGGGATCATGGG GCTGCTGCTGGTCCTGCTGCTGGGATGCCAAGGCCCCCTGCTCCTGGGCC GTTCGGCGCTACTCCGCTGCCGGGGATGGCCGGAAACGGCGCGGGTTTTG GCGGGCAGCATGTCTACAGTCATGGCGCTGTTCCGTTTTCGGGTTCACCA GGGATGCATCAGCCGGGAGCTGCACAGATGCGGGGATCTTACTCTTTTGC TCCTCCTGCAAATTATAATTTTATGCCATCTACGGTTCAGCATCGTCCGC TACAGCCTCCGTACCGAGGTCCGCCAGTTGGTGTTGGGGGGATGCCTGTG CAGCAGGTGACTGGTGGGCCATTGCATGATAATCACTTTGTGGTCGGTGT GGGTGCACCTGCTTCTCAGACGGCACTCAAGAGGAAGAAGAAGAAGAAAC AACCACAGGTTCCTGATCAGGGGACGGTTGCACCTCAGGTCCATGCTGGT GGACACTTGCAACAACCATCGGTTCAGTATGCTCAGACACAGATGCACCC TCTGGGGGCTTCTGGTGATCCTTTTCCAGTTCAGGGTCAGCAGTTTCAGT ATCAGTATGATATGCAGGGTCAGCAGATTCATGGTATGTGTGCTACAGCG CCGGTGGCCGCTTCTGCTCAGCTATCTGTCACTACTCCGCAGGTATCTTC AGGTACTGGGGGTAAGAAGCCTGGAAAGTTCGTTCGGTGCTGGAAGTGTG CGGTTAATACCCATGCAACCAAGGATTGTAAGGCGGTCCACTTTTGTTAC ATTTGTGATTGCACTTCACATCCCACTCTGAGGTGCCCAGTGCTTAAGCA GCCACGCTTAACCCCGTATATGGCTGGGATTGGTAATGATCAGACTCTGT TCACACAGATTCCGGATGCTGTGACTCGGGATCATCTTGCGCATAGTAAG ACCCCTATTGCTCTGGTACGTGTTTCTGGCCCGATGGTTTCAGCGGAGGT CGTTCAGAGACAAATTGCCAGGCGGTGCCAGGTGCAGGTTCAGTGGAAGT GGGAGGCGGTGCCACATGGAGATTCTTCTTTCTTAGTGAGCTTCCCGACT TTTGAGGATTTGGACAGGGTGGACGGAATTCTGATGACTGTTCCGCTCAG TACTGCCCAGTTGACCTTCTCGGTTTACAGGATGGAGGAGGTGCCGCATA AGCTGGAGATGCAGCAGGTTTGGCTACATGTGGAGGGAGTACCCCATATT TTGCGTTCCTTTCAGGGCTTGTGGGCTGTTGGAGGACTCATGGGGAACAC GCTTGATGTGGATCTGATCAGCTTGCGGAAGCGAGGGGTCGTTCGTATTT TAGTAGAGATGTTTGATACGAAGGTTTTTCTCAAGGCAAAGGATTCTCTT GGTCACTTTATTGTGTCAGATGCCGTGGTCAAGCATAAGGTATTTGAGTT TCGCTTCCGGGTTGAACCTGAGGGTTATATTCCGGAACCAGAGTTTGCTC CTTTCATGTGGAGAAAAGGAGATGATGATGCGGATGATGAGGCTAATGGG AAGCATTTTGAGGATGCTATGGATACTTCTGAGGCTGCTGCTACCACTCA TGGGGTGGGTTCTGGATCTTCCTCGGCTGTGCAGGGGACTTCTGCACCTA CTTCTACCAGTCAGGGGGTGCAGAAGGTGCTTGCGGTCACCCCTTTTAAT ACTAATCCGGTTACTCCACGTGGTCGTCAACTTTTGGATGCTCTTCCTTT GGATTCCCCTCTTCGCGGGAAGGGTTCTTCTTCGGCGCCTCGCGTTTCTC AGGCTCAGTTACAGGAGGCTCTTCGCTCGGTGTCCATTCCTGCTAGGCGG TCGTGCCCAGCTTCGCCAGCGAGGTCCAGAACACATATTTTGGGCAGATC TATTCCTGTTTCCACTCCTGTTCTGGTGGAGGGGGTTCCTTCGGTGTGTT CGCGGAAGCTGACCCAGGAGGGGTCGGCTGACCGCGACGTTCGTGTTCAG CTTCGGGATGCTGTTATGCTTGGTCCGATCCAGGCGGGGGTGGCCGACCA TGACGCCATGGATGTCCGTGTTCCCCTGGTCAGGGAGGACCTGGGGATGC TTGGGGCCGTCTCGCCCACTTTGGTGGATCAGGAGACTCCGGCTGGCGAT GTGGGCGTCCAGATCCAGGAGGGGTCTGGGTTCTCTTGGTCTCCACCACG GGTTTCTTCGCCAGTCGATGTGCAGATGAGTGGCACAGTCTTCAGGCGGA GTGCGCGCCATGGAGTCGATGCCTCTGGGGCGTCTGCGTCTGATGAGGAC TCCATGCTCAAGGCTATGCGGCGTAAGGCGGAGAGGAACTTAGATTCGCC AGGTAAAATGAGTTCTCCGAAGTCTTTTTTGTCTTTTTCTACTCCTGTTA TGTCTTCTAAGCTATCCAATGTTGGAATTAGTATGGGTAGATCTGTACAG GAAGTTTCTTTTTCTTCTAATGCTTTGCGACACATGGAGGTTGACCGTCT AACGGTTACTCCTAAGGTCGGTGTTTTTCCTGATATTTCACTAATTGAGG AAGAGGAGTTGCATGCCACAGTAGATGGTCAACTCCTTTCTCACTTAGTC GGTGAAGTATCGGAGGTGGACTTTGATGAGACCGGGCTTGCCTCTTTGTA TGAGTTGAAAGCTTCTGGTCGAAAATCAAAGAGCCAGCGGTCGCGAAAGA AATCCCGTGTATCCAAATCTCCTATAGTTTCTCAATGAATGGAATGTTTT CAAATAGCAGAGGTCTTCGGGACTTGGCTAAACATTTATTCTTTGCTGAT TGTGTGAGAGATTATAATTTGGATTTTCTGGGTATTTCTGAGACTGGTAG ACGGGATTTTTCACAAGCCCTACTCAATCGCCTTTCTGGTGGAGTGGACT TTACGTGGATATCACGTCCGCCGCGCGGTCGATCTGGGGGGATCCTGTTA GGCGTCAGAGATGAGACTATGGAAGTTTTAGCTAGTTCGGTGGGAGATTT TTTTATAAAACTCCATATCCGTAACAAGGCTGACAATTTCACATGGTCTT TAGTCGCCGTATATGGGGCCGCTCAGGATGTTTATAAGGCTGACTTTTTG CGTGAGCTTGTGAATTTGGCAAAGGATAATCCGTATCCTATTCTTATAGG AGGGGATTTTAATTTGCTCAGATTTCCTCACGAGAAGAGTCGGGGCCGGT TCGATGAACATTGGCCTTTTCTGTTCAATGCGGTTATAGACAGCCTGGAC TTGAGGGAGGTTACAATGTTAGGAAGGCAATTTACATGGGCTAATAGTCT TCCGGAGCCAACATATGAAAAACTTGATAGAGTGCTTATGGATACTGACT GGGAACAAAAGTTCCCTATGGTAACTGTTCGCGCTCTAGAACGTATCGAG GCTTTGTCGGATCATGCTCCTTTACTTTTATCTTTTGGATCACCGCCACG AAAGTCTGCAAATGAGTTTAAATTTGAACTCGGTTGGATGATCCGTGATG GGTTTTTTGAGATGGTTAAGGATATTTGGGAAAAACCGGTCGGTGGCCAA ACGCCTATTCTTCGATGGAATAATAAAATGCGTACTTTACGCAAGTTTCT TCGGGGCTGGGCCAGGCACATGGCTGGTAACCTAAAAAACGAAAAATTAC GCCTTACATCTATAATTGATGACTTAGAAGCTACCGCAGAAGTCAGGCCA TTAACTGCACAGGAAATTGAGCTCAAAAGCCAATCGAATGCGGAGATAGC CCGACTTCTGCGTGAGGAGGAACTCAAGTGGTACCAACGCTCTAAAGCAA AATTTATCTTGGAAGGAGATGCGAATACTAGATACTTCCATGCTGTTGCC AATGGCAAGCATAAGAAGAAACGTATTCATTCTTTGATTCAGGATGAAGG TATGATTGAGGGACAGGAGCATCTGAAGTCATATATCACTACTTATTATA AATCTTTGTTTGGGGCCCCAGAGGAGAATTCTTTCTCTATGGATGAGTCC CAAACGTCCGATATCCCTCAGGTTTCTGACGAACAAAACAGCTTTCTAAC TGCCTCATATACCGAGGAAGAGGTCAAGAAAGCGGTTTTTCAAATGGAAC ATAACAAAGCACCAGGGCCTGATGGCTTCCCAGCGGAATTTTACCAAAAT TTCTGGGATGTTATTAAGGATGATCTGATGAATTTGTTTGGGTTTTTACA AATTGGACAATTGGATCTCTTTAGACTTAACTTTGGCAATATAATTTTAC TGCCTAAGGTTAACAATGCAGAACGTATACAACAGTATCGTCCAATCTGC TTACTTAATGTTAGCTTTAAGATTTTTACGAAGGTTGTCACGATTAGACT AAATTCAGTTGCTGAAAATGTTGTTAGCCCCTCTCAAACCGCGTTCATGC AAGGAAGAAATATCCTAGATGGTGTTGTAATTTTGCATGAAACAATCCAT GAACTACACTCAAAAAATTAAATGGTGTATTGTTCAAGATTGACTTTGAG AAGGCATATGACAAAGTTAAATGGTCTTTCCTCCAGCAAACTCTCCGCAT GAAAGGTTTTTCTGAGGAGTGGCGCTCTCTTATTCAGTCGTTTGTGTCTG GGGGTAGTGTTGCCATTAAGGTAAATGAAGATACTGGCAAATACTTCCAA ACCAAGAAAGGACTGAGACAAGGTGATCCACTATCGCCTTTACTATTTAA TATAGTGGCTGATATGTTGACTATCCTTATTGAGAGAGCTAAGGCTGATG GTCAAATTGAAGGAGTGGTTCCTCATCTTATTGATGGTGGACTTTCTATT CTTCAATACGCCGATGATACAATTCTTTTTATGGAACATGATCTGGAGAA GGCTAAGAATCTGAAATTGATATTATCAGCATTTGAGCAGCTATCCGGGC TTAAAATAAACTTCCATAAGAGTGATTTGTATTGTTTTGGCGAGGCCCAA AACGAGGCTTACCTATATGCTGAACTTTTCGGCTGTGGTCAGGGCCAGTT TCCAATCAATTATTTGGGAATACCGATTCATTATCGGCGTCTCACAATTG CTGAATGGAAATTTGTTGAGGAAAGGTTACAAAAACGACTTAATAGTTGG AAAGGTAAATTGTTATCCCTTGGTGGAAGACTAGTACTCATAAATTCAGT ACTCACTAACATGGTACTGTATATGATCTCGTTCTTCCAATTGCCAAAAG GGGTCTTGACCAAAGTGGATTATTTCCGTTCAAGATTTTTTTGGCAAGGG GATAGTGAGAAAAAGAAATATCGACTGGCCAGATGGAATGTGGTTTGCCG CCCGAAGGAATTTGGTGGACTGGGCATACATGATATGCAAGTCAAAAACA CTGCACTCCTGGGAAAATGGCTTTTTAAACTACTTACAGAAGATGGTGTT TGGCAAACCATGCTATGGAGGAAATATGTGGGGTCCAAGGCTGTGTCTCA AGTGGTTTGGAAACCCGGTGATTCACATTTTTGGGCGGGTCTTATGGCCA CCAAGAAGCATTTCTTTCGTTTTGGTGCTTTCGAGATTAAGGATGGATCA CAGATTAGGTTTTGGGAAGATAGATGGCTTGGCCAATCTACTCTTCGCGA ACAATATCCGGCTCTATATTCGATTGTTAGACATAAAGGGGATACAATTT CCACAGTGTTGGAAGACTTTCCTCCTGATGTGTCTTTCAGAAGAAGTCTC ATCGGTCCTAGATTGGTATCTTGGAACAATCTACTATTACGGTTATCCAG AATACAATTATCGGATGGTGTTGATGTGTTCAAATGGAAATTACTAGAAA GTGGTAAATTTTCTGTTGGTTCACTATATAAAGCTTTGATCCAACCTGAT ATCCCGGTCGATGTTAACGATAATAATAAAATTTGGAATATGAAAATACC CCTTAAGACGAAGATATTCGCTTGGTATTTACGGAAAGGGGTAATTTTAA CGAAAGATAATCTTGTAAAGAGGAATTGGCATGGAAGTACACAATGTGTT TTTTGTCATCAAGATGAGACAATTCGCCATTTATTCTTCCATTGTAAATT TGCTCGCTCTATATGGTCATTCATCCAAATAGCTTCTGGTTTATCTCCGC CACGTTCTGTAACCAATGTTTTTGGTAATTGGTTGTATGGAATTGTGGAT AAGTACAGAACTTTGTTTAGGGTGGGAGCGCTTGCCATTATATGGTCGCT ATGGCTATGTAGAAATGACAAGATTTTTAATAACATTGTGTCTTCTCCTC TACAGGTTATCTATCGAGCCACGGCTATCCTCCGCTCATGGAAGATTCTC CAACGTTTCGAGTTCCGCGACTTATTTATGGAGGGATGTAAGCGATTGGA GGACACGGCGAGGGATATTTTTTCCCAACATGGATGGCCACGTGATTTGA GGATTGATCTGTCTTAGATTTTAGTCATTTATTTTCATAGTGCCTTTGTG TAATATTTGTATACTTTTTTCCTTAGCTCTGTCGGTTGTGTGGCTGTGTG CATCTTGGTTATGCAGAGGCCGGGTGTAAACATTATCTTTAATAAATACG CCCTTTTCCAAAAAAAAATGAGGCCATGCCAGAAGATGACACCCTCGGTG GTTTTGAGAGTGTTCAGATTCTTTCCTTAGACGGTTGTTCATTGTCTGGA ACAATACCCCATTGGTTATTGAAGCTCGAACATTTTTGGGGTGTTAATGT TACATGGGAATCGGCTTACTGGACCAATACCTGACTGGATCAGCAGCCTA AGCTTCCTTTTCTATCTGGAAATTTCAAATAACAGTCTCACAGGGGAAAT TCCAACAGCCTTAATGTGGATGCCGATGCTGAGATCAGAGGCTACAAACC ATTTGGACCCGAGATCCTTTCTATTGCCAATTTATTTAGGTCCATCACTT CAGTTAAGTGTGGCTAGTGCTTTCAGAAAAGAGCTGGTACTGAGTATGAA TAAGTTGTACGGTGAAATCCCTCGGGAGATCGGACAGTTGGAAGCAATTT GGGGACTCGACTTCAGCTCTAATTTACTATCAGGAGATATTCCGCAGTCG ATCTGCAACCTCACCAGTCTGCAGTTGCTAGACTTGTCCAACAATCATCT GACTGGTACAATTCCATCGGCACTGGTCAATCTGCACTTCCTTTCTGAAT TCAACATTTCTAAGAATGAGCTACAAGGGCCAGTTCCAACAGGAGGGCAA TTTGGTACATTTCAGAGCTCTAGCTTCATCGGTAACCCAAAGCTGTGTGG CCGTCTCCTCAACTGCCAGTGTAATTCGACAGAAAACGCTCCCTTCTCCA TCACCTCAACAAAGCAATGGAGCACCGAAGTCATCATCTTTTCCATTGCA TTTGGTGTGTTCTTTGGAGTCGGAGTGCTATATGACCAGTTGGTGTTATA CAGGTTTTTACGTTAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.