Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA023414

[Submit comment/correction]

Sequence	AA023414
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA023414
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	AGGAGAGAAGGAGACGGGCATGCAAGACGCCATGAATCCGCCCTCCATGC AGCGAGATCAGTTGGTTAGTTACAAGATCGCATCGAGGATCGGAAACAAA GAAAATCACAGTATCGTCCATGGCAGGCTGATCCCGACCGAATCCATCCA TCGTCAGTTCACCCCCACCGGCCGGTGCTATTCCACCACGCCGACGATCA TCAGGAATTAATTAATCCACCACCGCCGCCGGCGAGAGAGAGAGACACAC ACAGAGAGAGAGGTCGATCGGTTCTCCCCGTCGGTCGCCGCCATGGCTCG CTCTAGCGCGGACGACATGGATCTGAAGCGCGCGTGCGAGGCGGGCATCC TGAGCAAGGAGAAGGCCCCCGAGAAGGTGGTGCTGTCCATGCGCGTCGCC AAGGGCCGCGGCGTCGCCAAGGGGTTAGGGATTGCCGGCAAGCTCACCTC CCGCCACAACATGGCCAAGCCCCGCGTCCTCGCCGTCACCAGTCAGCATT CATCCTGACCCGAGATCTCTCTTGAATTGAATCCATCGTCCATGATACAT TCATCCTCACGCATCTTCTTTCTTTTCTGATCGATTGGTGGCAGCCAAGG CGAAAGGGCAGAAGACCAAGGCCTTCCTGCGAGTGCTCAAGTACTCCAAT GGCGGAATCCTCGAGGTGATCAATCCATTTCTCGAACAACCTGTATACAT ACTCAGTTCAATTTCATGGAGCAAGAATGACCGATCGATTGGTTATATCG TCAGCCAGCAAAAGTGTACAAGATAAAACATCTGCACAAGGTGGAGGTCG CTTCCAGTGATCCCAGCGGCTGCACCTTCATACTGGTACATACATATCGC TGTTCCTCACAGTTAATTACTACTCCGGCCACTGCAAAATTAACTCCAAA AAACTTTTGCTTCTTCTATATCAATATAAGGCAAAGCTTTTTCCTCGTTT CAAAAAAAAAAAAAAAAAACTCTGCAAAAAACCGTGTAACTTGTCTTACG TAAATACTACAGGGGTTTGATAACCTGAGGAGCCAGAGTGTGGCGCCTCC CCAGTGGACGATGCGCAACAAAGACGACAGGAACCGCCTGCTCATGTGTA TCCTCAACCTGTGCAAAGAGCTGCTGGGTGGCATCCCCAAGGTTGCCGGC ATGGACATCGTCGAGATGGCTATGTGGGCCAAGGTACCAAACGATTAACT TTTTTTCTCACTACTAATTCTGTAGGAAACTTCGAAAATGTTACTCCGTC TCAAAATGGATGTCTTAGGTTTTTTAAAATTTGGATGAATCTATATACTA AATAGTGTCTAGATTTATCTAAATTTTAATAAATTTGAGACATCTATTTT GAGACGGAGTGAGTACTAATGTTTGTATGCTGAAAATTCCAATGAGCGAT GTGCAGTTTGCTAGTGGTAAATGTCCACTCTTTTTTTCCCCAAGGATCCT TCTCTGATAGCCCACCGCATACAGATCAGAATTTGTGTCACTAGTGATGC ACTGAGGTTGATAGCCATACGATAGTAGACGGTAGAATTCTTTGAAGTTC CTGAGAGAGAAGAAAGGTTGACCACTATTGTGGGTTTCCTATATCTCATA TTAATAGGCAATTACAAGGAAACGATCAATACAAATCCTAACCATAATGG CCTGAGTAATAACAATATCAAGCTCTATATATGGCAGGAGACAACCGAAT ACTAATGCTGATTTGGTTTGCCTAACACTTCATAGCATTGTCAATACGAC TTAAGAGAATAACTTTATTTCAGAGTGGAGAGCTTGAGTTTTAGGTTCAG TAAGTGGATTACACTTTCTGTTCGGATGGGTGAGAATTTGGACAGAAGTT CGTTCAAATCCACGGGATTGGCTATGTTTCCGTCATTCCGTGCCTGAACT ATACGAAGTCCAAACAAGCTTAAGTCCCCAGCATTATAAATACACTACTC TCAGAGTCATCAGCAAGTCGCGCATCCAAGCTCCCGCTCGCATCACGGCA TTAGCGCCAAGGCGGAGAAGGGGGCTGCGGCGCTAGCAGAGGAGGCGTCA CGTGCCGCTCACCACGTGCTCGCCTGCTAGACTTTCCCTATCCGCCACCG ATCTCGTCCTAGGCTGTAGCCATGGGAGCCTTGCACCTTGCCTGTTGCCA CTGCCTTAAACCTGTTCGACGGAATGCCCACCAGAGCAGAGCAATGCATT GACCAAGTGAGTCGCGTGAAGTTCACCCGTGTTGGCAATCATAAAAAAGT TCATGCTGAACCATACAATCATGTTGACCTTTTTCAGTGTGCCCTTTGCA TATGAGTTTATGCGAGACTTTTATAGCATACTAAGCATATTTATGCCATT TTTTCAGCACCACAATTTTGAACACTTGCATTTGAAAAAAAATACTAAGT TTGACAAAAAACAAAAAGCAAGTACTTAGTTCTATCACGCATAAATCTGT ATAGGAGTAGTACAGCCGCCTTTAGACTGCATATGAGTATGTTTGAAGTT GTTACCTAGGACACATAATCCACAGTCTTCATGATGAAGGCACATAGATT AACTGTTGCTGTATGCTTAACTGTGCTTGGACCGTTTCGCTGTTCAACAC TATCAGGAGATGCAGCATATTAGACTCGGAAGTTGCATATAATTTTGTAT AACATGAAGCACAACGCTAAATTACAATGCAGGAGAACACTACAACAAAG GCTACACAGGTGGCCACGAAAGATGGCCCCATGGAATCGTTTTTCATGGA GGCTGAGTCGGAAGTTACCATTGAGAAGGACCTGGTTTCACAAGCGGAAG AAGAGGACATTGAGGCTCTCCTCGGCAAGTAAGTTACTGAACCGATAGTG ACATAATTTGGATCTGAGAGGAGCACGCACACTTCTAATTCTTGCATAGA GAATAGGATAATGATGTTGGCAATTCTATTACCGCAGCTATGTCATGGCC ATTGGTGAAGCAGAGGCATTTTCAGAAAGGATGAAACGTGAACTTACAGC TCTTGAATCTGCAAATGTTTATGCCCTGATGGAAACGGAGTCGATTGTGG AAGAGGTATGTGAGCATTTTCACAATTCTCTCAATGCATTCATATCATCT GGATGCCAGTTAGAGCATTACTCTTCCTCTATGTAGCACCCAGTGTCAAT TCAGTATCGGACTTTTGGCTACTTTAATCTCGTATTGTATCATCACGAAC TTGCACATTTTCTATGTCTGCCATTATAGGTTCTTGCCTAAATTTTAGTT ACCCCAGTTTTATATCTATTTTCAGCCTACCCTTTCCTAGAAAAAATAAC TAATTAATTAGCCACACACCTCCTAAAAGTAGTAGTGCTGTTTTTTAGTG AGCCAACGGAGACGTTTTCATTAATTAAGAAGAATAGAAATGTCCAATTA ATTAGAGAAAAACTAGGCGAAAACCCACACAAACACCTGAAACCGGCCAT CACAGAACATGACAGCCTGGCATCATCACCAGCCGGCCTGGCTACCAACA TAAACTGCACACACACTGTAAATAAAGAAGACAAAACCCATTGAGGTTGC CTGCAAGCATCATCGTCATCACCCATCACCCTCCGTCCACCGACTCATAC TTTATGGCAGACAGCTACACAAAGTCCATGACAGCTCGCCATCAGAAACA GAGTTGCTTAGTTCTGGCGTGTTATACAGTCTGCCACACACGCCAGCACT AAGAAACTCTGTTTCTGATGGAGAGCTTCGAAGGGGAAAAGAAAGGCAAG GCAAGGCTCGTTCTGATCAGGATATCACCGGTCACCGCCCGGACGATGCC ACGGTACTTTTGACGGCATAGCGATAAACAGAGCATGATCCAGCGAACAC GACATAAAGAAAACTACCAAAAGCTTGCTGCGACACAAACCCCACTCGTA ACCTCTAAGGAGGGGGAAATGCTGATCCCCACGATCGTCCATCCTAGAAA ACCCAGACCTGAAGTTTTCCTTCAAAGCCTGGAAAACCGGGAGGAGCAAC ACACTGGCAATGCCTCCGAGGACGCCGGAAACGGATATTTACCAGGAGTT ACCCTGGCGTCCCACTGCCCACATCAGCCAGTCAAGCCCACATCCCATAA CGCCACCAATGGCCGCTGCACCACTGGCACGGCCATGCTGACTGTCAACT CGAGTAAAATGACTCGGGTCTTTGCATATATCGCCGGAGGATCGTGCCAA GAAAACTAACCGCAGAAACATATCAAATGCTCATACAATTTTTCACCCTC TGATTTAACTTTTTTTTGACTCGGGTCTTTGCATATATCGCCGGAGGATT AGCTTTTATGTGCAGAGGTTAAACAGTTTCATCTGATTTATTTTTATTTA CCATGAAACAGTAGGGGAGCTACCCACCTAGGAATTGGATCTGATTATTG TTTGTAGCCACATTTGAATGTACCGGTTGTAGTTGGTTTTATACCTTATA TACATCTTACTTATTGTCAGAGAAACCTAATTCATTATACAACTTCAAAT TTTGGGTTCTACAGGTATTGGGGGGATTAGAAGTAGCTAGTATCTGCGTT GAAGATATGGATGAGTGGCTTGGCATTTTCAATATCAAGCTCAGGCATAT GAGGGAGGATATACAAACTGTAATTTTCCTTACCTCTACTATATTTATGA ACTATATTCTGTTGGTTCTCTGGATATGTTATGTGTGTGTCCCTTGCCAA GCGATCCTGTTCAGAGTACTTGATACATCTAAATGACAAAGTTTGGGAAT TTCCTATGAGACAAGAGAGTTTAAATACATTCATTGTAATTTTCTGTCAC AGATTCATGCTTTGTGTATCTTATCATTCAGATCCACAGTATCTGGAAAT CTAAAAGTTAATACCTATGATGTGTCTTTTCCTTAAGAAACTACAAATGG ATTTCTTTTCACATATATATTTTGTTGTTAGAATTTTGAAATCATAGTTA GCACTTAGCAGCAAGAATACTGAAGATAATCAGACTGGATTATGATATCA AGTTATTGTTTTAAAGTGAGTTTTTTACATGCAGTTTAAGAATGAGTTGG AATAAATGAGTAAAATATTTCTTTCATCACCTTGAGTATAAGATTAACTA ATGTCTTCCTTTGATTTTGCAGATAGAATGGCGTAATAACAGGTTGGAGC AGCAATCTGTGAGTAATGTGGCATTAACTGAGGAGCTAGACAAATTGCTT GTATTCTTGCAAATACCACCAGAGGTGGGCACTGAATAACCTTACTACTC TTCTGCATTATATCCACCTATGATATGTTAATTACCAAATTCATCTGATT AATCATGGTGTAGTTTGAGGAATCATTGACTGGAGGCTCATTCGACGAGG GAAATATGGTCAAGAATGTAGAAGCCTGTGAATGGTTGACCAGTGCTATA AAGAACCTAGAAGGATCCAATCTGGATCCATGCTATGCGAAATTACGTGC TGTACGTTCTACCTTTTCCTTGTATTATCATTATTCTGTCCTGGTGATTA CCTTGCTCAGTTTTTTATCCTTTAGTAGCTATTGTGCATCATTATTTAGA TTGAACAGAAAATTGTTGAAGAACTCCATCTTTTGGTAAGTTACCAACTG ATTTGGACCACACACACAAAAACACGAAGGCATAATATGTAAACGCTAGA TGAATCTCGTCGACACTAGTAGAAACTTATAGCAAACAAGCAGACTTCTC AAATGGATGGTTGCTGAAATGATATTCACCTCAAAGAAAATAGGCAAATA TTTTAGAATCGCTTCAAAGCTTTACTGTGTCCTTTTTTCTTAACAAAGGA GATAACAGTGTTCAGAAACTCGGGCCTTTTAGTTTGGTATTCAGTTCTTT ACAAGCCAAATACTGACTTTTTTTCTAGTTAACTTTGCTATGAATTTTCG GTAGTGATATCCTATTAGCATGGAAGTTGCAACTTATTTAGCTTTAAAGG TTATCAAAATAATATTTTCTGAGCCAATGTGCATTTTCTGTTGAAATCCA TACAGGTTAGAGAAAAACGTGCAGAATTTGTACTTCTGAAGTGCACATTT GTTCGGAGGGCAGCAGAATTTTTAAGAAATTACTTTCCAAGTTTGATTGA TTCTATGCTAAATGATAAAGACAACTTCTCTCAGGTAAAACAGACTCCTA TAATTGCAACTTCAATTTTTGAATCAAAACAGCACTTGTGTGAACATAAT TGTAGAAACTTGCAGAAAGGGCAACTGCAGAGGCCTGACCATTCTGATAT GAGGTACAAATGCAGGAAATATGCAAAGCTTCTACAATTCATCAAGGTTA CTTGCATGTTTTCTTGGTGTGAGATCATTATCCTTCCACAAATAGGGAAT TATTAGCTTACTTGATGCTCACTTCATACTATATTTTTGTAGAGTCTGGA CAAAAGTTGTATGGCCCCTTTGCGGAAAGCTTACTGCCATTCTCTGAACT TGCTAATTCGACGGGAGGTAAGGTAGCTAATGTGCATTCTCGAGTGAAAC CTTAACTGTTTACATTTCAAGATACCTGATGCATCTATTTGGTAGAGCTG CTATGACCATGCAAAAACAACGACCCTGTTTTTCCATTTTTATAAATGAA CATTTTTTTGGTATATAGCATAGCCTGTGGGAAGCTATCCTCCAGAACAG TGAACTATTTATCTAATGCATAATACAACCTTAGTTATTTGGTGAGCACC TTATTGAGCTACATACAGCAAAATGGAAAGTAAAACTGGACATAACATGT GCAAGTTTATTGTAGGCCCGTGAATTTTCTAATGAGCTGCGATCTAGCTC AAAAGCATCAAAGAGCAGCACACCATTGTTTGAGGGTCCTGCAGGTGCAA ATCAGCCAGCTGGTGTTATAGATAGCTCTGCAGATGCGTACGCGAAGATG ATTACTGTATTTATTCCATTTCTTGTTGATGAGGTTGTTTGTATTCTATT TTTATGTGAAATTTAAATCCTGTTATGTTACTATCACATGCAATCTTTTT TATCATGCATATCTATGATGCAGAGCTCATTCTTGGCACATTTTATGTGC TTCGATGTTGCTGCATTCGATGATTCAGATAGCGAGACAAATAGTCCTCG AAGCACTTCAGAAGCCTCAGCAAGCAGTGTTAAACCAAGTAAATGAACCC CTAACAGTCAATTTAAACAGTGTTCTCACGATGATTAAATTCTTCTTGCT TTCTATGATACAAAGCTATCATCTTACCACTTTTTGCAGGTAATGACGCA GCCGATTTGGGATTGCTAAATGGATGCTTACAGGAGTTGCTAGATGGTAT TCAGGTTGGTGTTCTTGTCTTCTCCGCTTGTAAATTTGGAGGCAGGTTAA CTACCGAAAATTCTTTTTGGATAAACATGAGACTATAATTTGAGCTATTC CAGGCGTGGAGACTTCATATGTTTTACATGCCATATTTTCAGGAGGACTT CTATGCTTTAGTTGACTGGGCATTCAAGCTAGATCCATTGACTTGTATAG CAATGCACGGCATAACAGATCGATATATATCTGCTCAGAAGGCAGAGGTT GCAGGATATGTGCCTGTGCTACTTGATGACTTGGAGACAAGAATAACCAT TTTGTTTGGCAGGGTTTGACTCTACCTCTAGGCAGTCGTTATTCTGCTCG AGACTCTATCTGGTTCCTTAGTGTTTAATTTTTTTGGGCATGGCAGTTCG TAGATGATGCATGTTTCCAGATCGAAAAGTATGAGCGCAATGTTAAACAA GTTGGAGTAGTGCCATATATTCCCAGGTACATTATTATTTGTCATGCTAC TTATGTCTATATATCGGTTTTCACTGTTTCCTTTTCTGTATATAGGTTTT CTCAACTTGCATCGCGTATGGAGCAGTATATCAATGGATCCAGGGAACTT GTTGACCAGGCATATACGAAAATTGTAAGACTTCAGTGCAATGTGGAGCA TGTGTTTCTCAGTGAAGAAATTATTATTAACTAAGAAAAAATTGTTTGCA ACTAAGAATCATGTTAGAAGATGATCACTGACGGTTCTGTTCAACCTACT CCAATGCTACTAGTCGGAGCTATAATTACACTATAGACTAAGTTACTGAT TTAGGGGATATTTTTCTGTGACTGAAATAGGTGACCATTATGTTTGTGAC TCTGGAGAAAATTGCTCAAGTGGAGCCCAAATATGTTGATATAGTACTCT TGGAGAATTACGCAGCTTTCCAGCACAGGTTTTTTTCCTTCGTTTGTGCA CCTTCAATGTACAATGTTTGTCAAGAGTTAACACCACTTTTATTAAGAAT GCCGGATATCTATGTATGTATATCCAGAATACCTAATGTTCTCAATAACT CATTAACTGTTATATTCTATCTTCTATACAGTCTATATGATTTAGCGAAT GTTGTCCCAACGCTTGCTAAATATTATCATCAAGCCAGTGAAGCTTACGA ACAAGCCTGCTCGCGCCATATTAATCTTGTTATATATATTGTAAGTTTTT TGTAACTCCTTTTGGCTCCGCACTGCCTTTGTCCATGTATACAGTGAGGC ATTTATATTTCCTTGTTCCAAGTTTTTGTTTTGTATACTTGTTTCTTTCA GCACTTTGAAAAGTTATTCCAATATGCTCGGAGAATTGAGGAACTGATGT ACAACATGAGTCCTGAGGAGGTAAATAGTGGCATTCAATCCTGCACTTGA ATTTGGAATTCACAATTTCCATGTGGCTCTGATTACATGCTATTGCACTG ATAATCTTTTTAATCCATTTCAGTCGTGGTGCATGTCTTGATCACTTATC TACTCTCAGTAGAAAAGAAAAATAAGCATATGTCACGACCAACAATTATA TGAAAGTAGTTATGTTTTTTTAATTGAAACATGATATTATTGGTGCTTTC CCTAATGAAACTGCTTATTTTTCTATATTCACATAGCAAGTTGTAATATG AAATCTCTCATGTATGAAATGTCCCACCAGACACATCCATTCCATTACCT AACTATTTAACGCACACAAAGTTTTCATACTGAATATTAGTCCATAGTGA TCATTTTGTTAATATTTTACATGTATCTCTCTTATGACATAATTGTACAG ATACCGTTCCAAGTTGGAATGTCAAAGGTAGATTTCCGCAAGATGTTGAA GTCCAGCCTAACTGGTGTATGTACTGAGTACAATCATGTTTTTTTCTCTT TACTATTAATTATCTGAACTGATCTCACATATACTTTTCGACCATTTCCA TTTAAATTTGATGACAGCTGGACAAAACAATCAATGCAATGTATAGAAAA CTACAGAAGAATATGACCGCGGAAGAGTTGTTACCTTCTTTATGGGAAAA ATGCAAGGTATTCTATTGTCTTCAATTCTAAGACTAATAGATAACGAGAA AGTGCCAGTTCCATAATGGTACATATTAGTGTCATGTGGGCTGGTGCATT TGATTGGTGCACCTGGTAAATTTTAGCTTGTAAAGCATGAGTATTTCGTT CCAAAATATCAAAGAGAAGTGTCTTGCTAATTCTATCTTGGGTGACTCCT TGGTTGCAGAAGGAGTTCCTCGATAAATACGCAACCTTCCTCAAACTGAT TGCCAAAATATATCCCAATGAAACGGTGACATCTGTGAATGATATGAGAG ATACCCTAGCTGCTATGTAGCAACTTTGCTGTTTGGTTAACTTTACAAGG TAACATTCTGCAATTTGATTCTAGCTGTTGTATCTTGCTACTTACTTTTT CTTTTGCATGGAGAACTTATTCGTCTTATATTGTTTTCTGTATGGTGTAT GAGTTGGTTTAGTCTTTCCGTTATTTATTCAACTATTTCGTTTTTAGCAA TCTCTCTCTTAGATAGTACTACCTCTGTTCCATAATATAAGCCTTTCTAG CAAGCTGTTTTAGTTTGCTAAAAAAGGCTTATATTGTGAATCGGAGGGAG TAACATTTAAGAGTACATTCATTTCACACAATCCTTTGTCCAGGCATTCT GGCAATTTGGTTGTGAGAGGGATGAGCAGATCGGCTTCGATCCTGGGCGA GTGAGGTGGTTGATGGCATGCTTCACCAACTGCTCGGTGTATCATATAGA AGTATATATCCAAATCAATAGTGACAACTGAACACTTTTTTTCCTTTGCG TGATGACCAAATGTAGGGCAGTGTTCCTACTAATCTTGCATGTATGTAAG GAATAAAGTAACACGGTGTAGATTTTTGTGAGACTTAGGTCCTGCATATG TTCTAGTTTTGCACAAGAACATGTCACCT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.