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GrainGenes Sequence Report: AA021361

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Sequence
AA021361
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA021361
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
AAGGATCGAAATCTTATCTTAGTAAACAAAAGAGAATTTCCAAAGAAAAG
AAAAACCATCCATTTCCGACGTACGAAGCACAAGCCGAAGCCGAAGCCGA
AAAATTTCCTCTCGAGAGGAGAGGAGGAAAGAAACCCTCGCCACACCTCC
GGCGAACGCGACGCGATGGTGGAGACTCGCCGGAGCTCCGCCGCCAAGCG
CCCGGCCTCGACGTCCCCGTCCCCTTCCCCTTCCGCCTCCGCCCCTCCCC
CGAAGCGCCCCAAGGTGCGTTCCCTCTCCCCGTGCGAATCGGACAGGAAT
CTCGCGCCCGATTTGGCCGATCTGAATCGTGTCCCTGGCCAGGCGGAACC
TCCGGCGTCACCGACGTCATCTGCGCCCGGGAGGGCCGAAGAGGATTCGG
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TATTCTAATTCTAACTAGCTTAAAAAAAAATACTCTCTTGACTAACCGTT
TCATCACTTGGTTGTTTAGTTTTTTCTCCTAGTCAGAGCTTTGCCACACT
GGTCACATTTTGCATGTATACGATATGAATGTTATTTTGATACTAGACTT
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AAAAATACAACTACTTTCTCTTGACCGTCGTCCCACATAACACATATGGT
TAGAGAGATTTCAAAGTGCAATAGAACTTGTACATTTTATTAACCATTCA
TGTGGTTGGCTGTTGAGTTTTCTTAAAGTCAGCTGTAGAGAGAATAAAGA
TTCAGTTTGATGCTTTGTATATCCTAGGTAGCGGCATAGTCGGCACTCTA
AAAGCATATAAATCCTAGGCAGGGTTGCTATGAAGATAAATTGTATGTTG
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GCTTATGCCGATACATAAATTATTGCAATCGATGTTGCCAAGATGTCACA
TTATGGGTTCTGGAGGGCAAAAATTGTAATGTTCCTGTTGATCTTTGTGG
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TGCAAGTTGCGGCACATCGAGGTACATCCTTGTATTTGGTTAATTTTGTG
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TTAGAAGTTATAGGCGACAAGGGCGTTGTCCTATTAAATGGAAGGGCTGT
AAGTCCAGGCGTTAAACTTACCCTTACAGGAGGGGATGAACTTGTATTCA
GTTCATGCGGCAAACATGCTTATGTATCCTTCTATCATTCCTGTTCATGC
AGTTCCCTTCCATCAACTTCCATTCAACTTTTCCCCTTAATGTATTCACT
TCAGGGATAGCAAGCATTATCAAATATTCAGATCTGTTACCTTCATTTTT
TCCTTTACCTACCTACAGATTTTTCAGCATCCTTTGAGTGATAAAGTTGC
TAAAGCGGTGCCATCATCTGCTGTCGGCCTTTTAGAACCTCCAGTTGCTG
GTGTCCAGCACATCCATATGGAGAACAGAACAGAAGTTACTTCAGCTGTT
GCAGGGACAGAGATGTTAGCATCTGTATCTAATCAATCGAAGGACCTACC
AGCAGTGCCGCCTGCATCAACTGGGGAGGACAATCAGAGACTAGTGCAAC
CTGTCACATCATCTGCTTCTGATAAATCAAAAGGGCTCTGCATCAGCCCT
GATAAGGAATGCGAGAACGGGGAAAATACTAATGAGGGTAATTCTAACAT
CGAAGACTCTCCAATGGACGTCGCTGCAACTCCTGTTTCTCCTGATGCTG
TTGCGAACGACACCAGTCGGCAAGCTGACTTTGGGTCTGATGCTCACCTT
GATGAAATCGGTAAGATTTCAACTTATAAGATAAGGCCAGTTCTGAGGAT
GATTGCAGGGTCAACTGTATCCGAGTTCGATTTGACTGGTGATCTTTTTA
AAGCTCTTGAAGATCAGAGGGATCTCATCCGGGATCTTAACACTTCAGCC
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AATTATTAGTCCAAGTGATATTGAAGTTACATTTGAGAATTTTCCTTACT
ACCTAAGGTGATGCTTTGACTTAAGCGTTCTTTTGATTTGCTTGCTCTTT
ATTCTGTATTTTGTAGCCTCTGCATATGACGTGTACCTGAAATTTCATTC
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ACTTAGTTTGTGATCTTGCCCAGGAAAAGTACACATTTAAGCCTGTATGA
CTTGTTCATAGGGTTCGTTAGGTAATAGATGTAGACCAGGTTGCATTTTT
TAGGTTAAAGAGGTGCCCATGAAGTGAAGCATGTTGTTCTTTATTGTTCT
TTCACACAATATATCTTTATATATATTCACAGATTTTTTTCTCATGCAGC
GAGAATACTAAGAATGTGCTCTTATCATGTTCATTCCTACACTTGGAAAA
GAAGGAGTTTGTTAAGCAGTTTTCTGAAATTTCATCAATAAACCAGCGAA
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CTGTTGAGTAAAATTTAGGTCCTTGGTTGGTAATTAGTGTATCGTTAGTG
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ATAAAGGCACTTGCCAAGCATTTTGATGCTAGACTACTTGTTGTCGATTC
GCTCCTGTTGCCTGGGGTGAGTTTTCCCCTAGTAAGGACATACTCAGAAG
TTTGAGAAAACCTTGAAGAGTGATTGTTCTCAGTGACATATTTGAATCAA
AAATATTTGTAGGTGCCTTCAAAGGACCCAGAAACCCAGAAAGATGTTGT
CAAGACTGACAAGTCAGGGGACAAGGCGGGTGTAGAGAAATTGACAATTT
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GTTGCACCAACTTCCAGTGTGAATGCTGATATTGTGGGCACATCCACTCT
ACATTCTGCAACTTTGCCCAAGCAGGAATCCTCAACAGCTACATCGAAGG
GCTATACTTTTAGAGAAGGTTTGTTAGCAACACAGTATTATTGATAAGTA
TTTCTAGTTTGACCTTAGAAATAGTTGCACTGACACATCTTTTGTAGGGG
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TTTTTGTCCAGAACTTCGTTTGGTGTAAGCGATGATTGTGGAATTGCTTT
CAGGATGTTTGGGTGGTTAAGAGAGGTGATAGAATCTCTCCTATTATTTA
GTAAAAAACACTAAAAATATCAAGTTCATTGGGTGGACAGTATGTACTGC
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CGGCTGTAGGCCTATCGTACAGGCACATACGGCAACAGACATACAGCAAC
AGTAAAGGATTGCCTCTCAATAAAAGCATTTCAATTGTACCTTCATATGC
TTTGTTTACTTGGCACAGCAGAAATAGGAAATTGACAACATGCAATCTGA
ATTTTTAGTAGCCACAACCCAATAAGTATTCTCTTTCTGTTGCTATTATG
CCAACTCAGATTTAGCTTCATATAAATACATATCCTTTTGTTCTGATGGC
CATATAGTATTGCTAGTGACCAATTTCCTTATGTATGATTTGTTGATCAA
TCTCCTGATTGGTCTTCAGGGGCCCAAGTTATGGTTACCGAGGCAGAGTG
ATGCTTGCTTTTGAAGAAAATGGATCATCTAAAATTGGAGTCCGATTTGA
CAAGCAGATCCCTGACGGTAATGATCTTGGTGGTTTGTGTGAGGAAGATC
ATGGCTTCTTCTGCTCTGGTTAGCTAAAGCTTCTGCATCCTACATGTTCC
AGAGTTCTTACGGTTTGTTATTTATTGCTGATTATTTATTGTTTCCGCAG
CTGAACTACTTCGCCCAGACTTTACTGGTGGCGAAGAAGTTGAGAGGCTA
GCTATGACCGAGTTAATTGAGGTACTGCATCTTTTTTGGAGTTTGAAATT
CTACAAACATAATTCAGCATCATGTCATAATACTAATAGGATGATTTTCC
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TGATCTTCTATCCTGTAGGCGCATCCTGGAGGATTTCTATTTACAAAGTT
CGCTAGTAGCAGCCAGACGCTATTTGACCTTTTCCCGGTAATTTGCACTC
TATTTATTCTTCATATTATTTTCGTTGAGTGTTTTTAAATTCAATACAGT
TTTTTGCTAGTCCTATGAACCCATGACGCTGATGTTTCCTATCTGTTTCA
CTGTGTTGTAATGCATTATTGTTTTGACAAACTCAGGATAGCTTTGGTAG
CCGGCTGCACGAAAGGAGCAAAGAAAGCCCAAAAGCGATGAAACATCTAA
ATAAACTTTTCCCTAACAAAATTTCCATCCAGCTTCCACAGGTGATGATA
TCCCTTGTTACACTCACTTAAGTTTCTTAAGTATGCTGTCTAACCTAAAG
AGTAAAATTTTCAGGATGAAGCACTACTTACCAGTTGGAAGCAACAATTG
GATCGTGATGTTGAAACCCTTAAAGCGAAATCCAACATTGGTAGCATTCG
TACGGTAAGTTGCGCAGGAAAAACAGTTCATGCATATCGCTTGGAAATTT
GTACTTCCTGATTTAGAAGTGTAGTCATTCAGAGAGTAATCTTGTGCGTG
AAGCCTGAGCCATTCGTGGCTAGTATTTGTTCAAATCTGCATGGGTTATG
TAAATTTCTATAGTACTAGCCAAATGCTCGCGCGCTGTTACGTAAGTTCT
TTGGATTGTTTGTTTAAACCCTTGTGTCGTCATAGTTATTAGCTTTGTAA
GAGTAAGTATCTGTTCTTAATTAATTTCAAACAACCTTTCTGCAATATTC
TCAAGTGATTCATTTGGTACTATGTTGTTTGTTACACCTGCTGTATTCTT
GCATTTACAGTTATTTTCATGCCCATATTCTCTTGCTGACTACAATGGTA
GCTATTTTCTTCCCAATTTAGAATGTGGGTATATATGTTAGATAGTTATG
TGGTTCCTCATTGTTCTGTAATGCAGTTTCTGAGTCGCAGCGCAATAGAA
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GAGTGAGTATTTCTTTTTATCTTTGCATTTTATCTGTAGAATTTTGAACT
AAAGAATTTGTTGCTTGAATCTTAGATGTGGACAAGATTGTCGGCTATGC
TGTCAGTTATCACCTTAAGAACACTGAAGTCGAAGCGTCCAAGGACGGTA
AACTTGTTCTCACAAGCGAAAGGTAGTCATGGTGTTGCCAGTTTCCTTTT
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TTGAGAAAAGGCTTTTGGCAGATGTTATACCACCGAATGATATTGGAGTC
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ATTGGTTATGCTCCCACTCCAGAGGCCTGAATTGTTCTGCAAAGGGCAGT
TAACGAAGGTAGTAACAAAAGGCTGTAGTATGCATATGGTCTCTCACGTA
GGGGCTTAGGTTTCTTTTGACTGTACGTTGCACATCATGATTACGATATT
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CAATTAGTCTATTTAGGGTTTTCAACCTTGAGCTCTTCTGAATGCGTGAT
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TGGGTTTAGCTCGATAGGTAGGGTAATCAAAATAACTTTATTTTTTATTG
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TTTGTTATTAAGAAAGTATTTAAAACTGTTTGGTATTAAATTAGGGCCAT
GGGTGTACCAGTAATTTGTGATCTGTTTGGTTTGAAGTTTAGAAGATTGT
ATTTACTACCTATTTATTGTTCTGATTAAGTCGAGGATCTTAGAAGTGCT
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GGGGTATGGTTTCTTTTTAAGAGCAGCTAATATGGTAAATTATGTTATTC
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ATTATCTTGCTATTTATTCAGTCTATTAAGCATATAATGTTGGACAGGTC
GACAGTATGTTAGGAAGGAGAGAAAATCCAGGGGAACATGAAGCCATGCG
CAAGATGAAAAATGAATTCATGGTAAATTGGGATGGGTTGCGCACTAAAG
ATAAAGAGCGTGTACTTGTTCTTGGTGCCACAAATAGACCATTTGACCTG
GATGAGGCTGTCATTAGGAGATTCCCCCGCAGGTAGTAACCACTCTCATG
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GGAAGTGACCTGAAGGTATGTTTGATATTGATTTGCTCTCTTCTATGCTG
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AATCTATGTGTAACTGCGGCACACTTCCCCATTCGAGAAATCCTAGAGAA
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TTGTTTTACATCATTGTATAGATGTCATTTTCACTCTTATTTTGTGGTTA
CCATTAGGAATGTTTCTTTTCTTTTATTATACTAAGTAAATGTTTCCTCT
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GCACGGAAGCGAGGACGTCCGTCCTCTTAGTTTGGATGACTTCAAATCTG
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ATAGGTTTGCGCGAGTGTGTCATCCGATTCCGCAAACATGAATGAGCTCG
TTCAATGGAACGACCTCTATGGCGAAGGTGGTTCAAGGAAGAAGAAAGCA
CTGAGCTACTTCATG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.