Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA005658

[Submit comment/correction]

Sequence	AA005658
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA005658
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CGCCGCCCAGTTAATGGCGTCACTTCTCGCCTCCATCTTACCCGCGGCCT GCTCCACCTCCGCCCCGGCGCTCCTCCTCCGTGCCCTCCCCCGCACCCCC TTCCGCCGTGCCCTTGCCTCGCCGCCCCGCATGTCCACTTCCTCCTCCGC TTCTCGCGCACCGGCGGCAGCCGCCGCGGCCGGGGAGAAGCCCACGGCGG CGCCGTACGGGTCCTGGAAGTCGCCCATCACTGCGGATGTCGTCTCCGGC GCCGAAAAGCGCCTCGGAGGCATGGCCCTCGCCGGAGACGGCCGACTACT GTGGATCGAGGGCCGCCCCGAGGAGAAAGGGTGAGCAACCGCTGATTCCG TGCTTATTGCTGAAGTGCTTGATTGGCCGATGCACGATGTCTTTTTCCTC CATTTTTTTGGGGTGCTGGTGCCACTCACTATAAAAAAATTGCGCATATT GTTACCAAATTTGAGTTGATAAAACGTAAGGCATTAGCTGGTAGCTTCGA ACTGCTAAATGTTGGTGGCAATTGTGTAAGACTAATGTATATTATCTAGT TTCCTTTAGCTTTATCTTTTATGAGTTCGATTGGTGAGCTAGTCTATGGT ATTTCTTAGCAAGTGTACATACCTGGAGTTGCGTTCATAGCTTGTGCGGG CATCCAACTGCATTCGGCACCATGGTACCAGAGGACTGACTAGTTCTATG ACCTGCGAGTGGATATATCTGAATATGAAGGAAACATATTAGTATCCGGA GTCACTTTCTTTGTTAGATGAGCTTTAGATTCTTGGAAGATTAATGATTC TCCCATTCTGGGAATAGGGAAGACATCTCATATGAGATTGATTCCACGAC TTTTGAATGATCAATACTGCTTAGCAGATGCACAGGAGTATGTGAATGAG GAGACTTGACAAACAAAAAATGTAGTTGCTTGACGAATGTTGCTAAAAGT TAACATGAAATTTGAGAACCCAGAGTGTGCCAAGCTGGAGCATGTGCATG TTGCAGACGATATAAAATGGTATCAGACGAACCAAATGATAACATAAGAC ATGCTTCCTCTTTCAAAATTGATGACACAATAGGTCACATATCAAACTCC TCGGCCCATGTCAATTACAATATTGTTATGCTTCAATTAGTTTGCGTCAA GACTCGGAATTGAATACTTTGAACAACATTTAACTATTTTGTATTCAGGC GTATGGTTATTGTAAAGGAGGATGACAAGCCTGCGGATGTCATACCTCAG GAATTTGCAGCGCGCACTCTGGCTCAAGAGTATGGTGGTGGTGCATTTGC AGTCCAAGATAATGTTGTTGTTTTCTCAAACTACAAGGATCAGCGTCTGT ACAAGCAAACCGAAAGTAAGTGGAATAGCAAGAACTTATAATGAAGTTAG TTCAACATTACTCCACATGTGACATGTCAACAGAGAAATGTGGTTTAGTT GGAATTGTATGGTGTTTATGTTTCTTACTTTTTTTTAGTAATCCGTCAAA CTGTAGCCTTACATTCCATTGCATATCCCTTCATAGGTTACTGCATACTA TTCAAATGGAAAATATGGGGAAGAAGAACATGGGCCAAAAAGAGTGATGC CAACATAGCCGATACAATATAGTACTGAAGCCTGGATTGAGTGTTTAATT TTTTTATCTGAGAGATCATCTAACAATGTAATCAATAGGTAGGCTAGCTA AAGCTCTCTACCCTAGTCCCTCATGAGTCATGAATCATGATTCCTTGAGA AGAACTTACATTTAGGTTGAATACTTATCACTGGCAGCCGATGTGATCTG ACAGGAAAACTAGGTAATGTTGTTTGACTGTAAAGCGAAAACTATAAGGA AGGCCTCAGCCTTATATGATTTGTTAAATATGAAAATTTGTACAAGAATG CTGTACAAGAATGAGTATACAGGATGGGTAGGGAAGGTTGTAGACTTGTA GGGAATGACACTAATTCATATCAACTCCAACTCTTTAACATTTGGAACCA TTTAACATTTCATCTTCAGAGAATTAAATTATGTTGTTTTTTATTTGAGA TTATTTCACATGATTATTTCCATTTATCAGTTGGTAGTCTACCTGTGCCG CTTACACCCGATTATGGTGCACCTGACGTCAGTTATGCTGATGGTGTCTT TGATCCACACTTCAGCCGTTATGTTATTGTGATGGAAGGTACTTGACATT TGATCTGTTTACAGACCTGCGTACCGTATATCTAGTTACAGGATGAACTA CTGAACTGTAACATGCTCAAATTTCTTGATAGACCGGCGAACAAGTAGCT TGAATCCCACTACAACAATTGCATCTGTAAACTTAAGCGGTGGGGATGTC CATGGTAAGAGTGGAAAATTCTATAACTTGTACGAAGTAGATCTATGTTT TTGTTTATTTCTTGATATTTATTCTGGTTTAATGTTTTGAATAAATGTTC CTCACATATTTTCTGTATTGAAGAACCGAAGGTGCTGATCAGTGGAAATG ACTTCTATGCTTCTCCTCGAATTGATCAAAATAAAAAGCGGATGGCATGG ATTGAGTGGGGTCATCCAAACATGCCATGGGATAAATCAGAACTCTGGGT TGGCTACTTCTCTGAAAGCGGGTAAATGGCATTGCCTTTTGAATTGGACA TTATAACATGCTCTCTTTTCTTGCAAGATACTTTATAAATAAAAGGAACC TAGTTAGCCCACACACCCATATGGAGGATAACCAGGCACTGTATGAGGAG ATGCATTCTGCGTATCTACCGTTATTTCATTACATCTGTATGCCCACCTG TAGGCACCTTTATGTATTATAATATCTCCAGAAAACTTGTCTGTTGCCAC ACTATACTTAAGAAACACATTTCAGTAGTTAAAAGTGGAAAACCAGATGC CTCCTGCACTTCTTTGAGAGAAACTTCCTACCCTTTTATGTCATGTGGGA CATGATAACAACTGACAGGCCAAGTTTTTTCGGTTTACTTGTAGTACAAC TGATCTGGCTTATATAATGGCAGTTGGAACGCTTTAGATGAATCAAGAGA TAGGTGTAAATTTCCAAAATGTCTCCCTCTTCTTCCTGTGCCTAGGTGAC ATACCTGCACCACATGACTCCGGGGTAACGAGACTTCTGCCCTCACCCTT CCGTCGAATGACTACGATATCAGAAGTCGGATAAAACCCTAGGCCACTAC AACCCCCAAAGCCAAAACCAGTGACATTCTTTTATTGTCCGTTTCGATGC ATATTGTTGTTCTCACTAATGAACAGTATAGTGTGTGCATTTTCCTAGAA GCATAAATATTATGGGATCCTGTTACATATATGAGCTTGCATCATGGTAC TGACTAGTGACTACTGAAGTTAGTATGTTGCACCAAGCTCTAGTATTACA TTCCATTTACCATCGGCAATTACCTTTTCTAACTGTTGCTGATTTGTTTG TGTGCAGAGACTTGACCAAACGGGTCTGTGTTGCTGGTGGCAATCCAATG CTGGTGGAATCCCCTGCCGAGCCTAAATGGTCACCAAAAGGTGTAATTTT ACTACTAAATTTTCCTGCATTCCTTGTTATTTCTTAGATATGTTAGTATG CTTACTAGAGTGATAAAGATATTCCTATTTAGTGTAATATTTGGCTCTTT TGTATTTTTTCTGAACAAAGTCAAACAGATCTTTGTAGAAAGAGGATAGC AAATTTAATATTGTGAACTTGACAAGCATTTAAATATCTTCTTGCATACT TTCTTCGGCTGTGTATCTCCATAGCTTCAATACAATCTTCTACTTGATGA TGGAATTGGGACTATATTATGTTTATGTTCACTACACTAATTTCTGTTGG TCTGACAATATATCTATTCAACATTTCCTGGAGCTGCTTTAACTAATTGG ACTATTATAGTCCGTATCCATGATATGTAATTTTTCTCCATGGATCAAAA AAGGTTATTGTGAATATAGAAGTACATCACTTTGTCTTTAATCAATAATT GCCAGTACGTATTATTTTTTTCTAAGCCTTTTGTCACAGTTCACATTGCC TAGTGATTGAAATGTTTGATATTCTATGCAACTTTAGAATTATTATATAG CTGCTTCCACGACAATAAGGTGACTACTGACTACCATAATTTGATCCTGG CTTAGAACAAACTTACTTTAACACATGTAAACTTGCAGGAGAACTGTATT TCGTAACTGACAGAAGGACTGGATTCTGGAACATTTATAAATGGGTAATT TGGTTCTCTTGTACTTGAGCTCTTTAGTAATATCCATACATTTTGTTCAC ATTGTTGATATTTTGTGTTGTGGAGAGTAATAACATCAAAGCTCATGACT CATGACATGATGATTAAATTATACATTCCTCATCATCATCTGATCTTTGT TTGCATAAAGTATCTCTGCACTTTTTTGTATCAGGTTGAAGACACCAATG AGGTTGTTCCTGTGTACACACTAGATGCTGAGTTCACAAGACCATTGTGG GTTTTTGGCATCAGCTCTTACGATTTTCTTGGAAAGAGCAATCACATTGT TTTCACTTACAGGTTCGATAATTCTGTGAAGTTGTTTCTTTCATTGCCAT ATTTTGTTGATAAACATCTTTTAAATATCGCCCCACTACTTATATCACAC AGGCAGCTCGGAAGGTCATATCTTGGTGTTCTAAATTGTGATTCAGGTTC TGTTTCATTGCTCGACACCCCCTTCTCTGATTTGTCCAATTTGGTAAGCA TCAGAATCCTAATGACCTCTATTTGGAACTTCAGTTTCATGTATGTACTA TGGCATGCTACTTCAGTTTCACGCCTGTAGTTGTGATGACCTCTTTATCG GTCTGTCAGGTAACTGGAAATGATTACTTCTATATCGAAGGTGCCTCTGC AAGTGTTCCAATGTCAATTGCAAAGGTTTCTAGGATGTGATATCCTCATT TTTGGTTCTGTATTGATGATGTAGTAGTGCATCAACTGATGCAACACATG TTGTTTCTTTCCAGGTGACTTTGGATGAGAGCAAAACAAAAGTAGTTAGT TTCTCAATAGTCTGGTCCTCCTCACCAGATGTTGTGCAGTATAGGACTTT CTTCAGCACCCCGGAATTTATCGAGTTCCCTACATCCAACCCTGGGCAGA AGGCTTATGCCTATTTCTACCCACCTGTAAATCCCATGTTTCAAGGTTTA CCAAATGAAAAACCTCCATTGCTTGTCAAAACACATGGTAAGGGAATCAA TGGACACTTTTGATGTCTCAAAATAATTATTCACATTCAAGTTTGTGCTT TTTGCGTTTATTTCATTAAAAATGTGGATTTGTTAAGTGAGTTACGGGAT CCTCTGTCTTCCATGATGACAACAAAACTGTGGATTTTTTATAATTTCCA CAATTTTCAGGAGGACCTACTGCTGAAACACGTGGAGTTCTAGACCTTAG TGTTCAGTATTGGACAAGTCGAGGGTGGGCATTTCTTGATGTTAATTACG GCGGAAGCACCGGTCTGTTCTATACTCTAGTATTCAGATTACACCTTATA TAAATGTTGAAAACTCTTTGTTAGTTGTGGGCTATACCGATTGTTTTCAT TTAAAGTATTAATTCTTATTACTGAATTGAAACATAAACTGAAGGTTATG GGAGAGAATATCGAGAGAGACTATTGGAGAAATGGGGTATTGTTGATGTT GATGATTGTTGCAGCTGTGCAAGGTTCCTGGTACGTCCTATCATCAATGG TTCTAATATTAATGTATTATAGTAGCACTTTTAGCAATGGTAGGGATTCA CCTTAATTCTTATTGTAAGGTGGAGAATGGGAAAGTAGATGAACAGCGCC TCTGTATAACTGGGAGATCAGCAGGTGGATACACTACTTTAGCTTCACTC GCATTCAGAGATACATTCAAGGCTGGAGCATCTTTGTATGGTGTAAGTTC TGTCTTTTGAGGATCTATTCTTTATTTGGTTACTGTAAGCAAACATTCAC CAGATAGTGTCTGCAACTTCTATATTTAGCTCCGTGTAAATAGTGTCTGC AGTCTTGGACTGTTCCTATGACCTGTATATTGATCATCCATGAGTTGCAT TATGTTTCCATTTGGCCATATTTGATCATTCATCCTCTATTTTCTATACG AAATAACATCCCTTCTCCATTTCATTATAAAAACAGAATGAAGTGACTTG AAGCAGAACAATTCACGGCAGATGCTAAGCCCTACACTTAAAAGAGAAAC CTATTGCTGACCTCAAATAACAGAACTCTCTGAGTGTGAGTGAAAGCTAT GACTAGCATTTAAGATTTTACAAGCATACAGAAATGCTCAACCCTGGCAG TAATTTTTTTAAAAAGAAAAAAATAATTACAAGGAGCTATACAAGAGGGA TAATGACATGACTACACGAAGGAGCCAAGCCAGGATCGTAGTGGCACCAC AAGCACATTGTTTTTTCTAAAGGAGAAAGCAAAGAGGTCTCTCTTAGTTC GTCTAGAACTGTAGGTTTTGTGACTGGATGATCTCTGTACCTGGCTCAAG GCATGAATATTGTAGAACATGTTGTGTCCCTGAGCCCTCACCCCCCCCCC CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCTTTATAGGTCCTGTTTGGAACTCAGGCAA TTTTTCCGTCGAACTGTTCCTTGTGAAATTTGTAAGTTCCAAACAGGGCC TGTTGTGCCTTATTGCTTAATATATACAGCCAAGAATTTACCCTCACGAC TTATGTGCCGGCTTTGAGCACATGCACAAGGAATGCCTTCTAGGGCTTAT GGCCAATTATTAGTTGTATATATGCTCCTGGTCACCGCCTTGCCTGTCTA TCCAGTTTCACGGTTTGTGTAAACCAACAATGAAGCTATGAATAATTTGA TAGATTGGAGAGTCAATTTTGGATGTCTTTGAATGTGATATCTTGGACAA AATTAGCTCTTTGGCAAGTCGATTGTTATTATATGAAACTGGCTGTATGT AGGTGAATGAAATGTAGTACTAGTCTGTTCATTTTGCAATTGTTCTTCAT CTTTGAAAGTCTTAAGAACAAGCTTGTCCAAAGATTGTGTTGCCTGTGTG CGTGACTTGTCCAATAAGGTGTTGCTGGGCAAGGCATGGCTTTTAGAGCT TATGCTGTTATGCACGAACCCTAGCTTTGCGGAAGGGGGCTTATTTTCAG AAATAGAAGGTCCCAAATCAAGAGAAGATAGCATGCTTATATTTGGTCAT TTGCATTGGTTGACTGGTTGAAAAATGCAATTGATTAGTGCCATTTCGGC TGCTATAATTTTCATTTCATTATTTTCTCTTTGTTTGTATAGACAGAAGA ACTAACTCTTTTGCTAAATTGATGAGCAGATTGGTGATTTGTCTTTGCTG AGAGCAGAGACTCACAAATTTGAGTCCCACTATATGGATAATCTTGTCGG TAAGAAAGTATCTCATCATTTTTTTTTTGAAAAGGATATTTGTCCCATCC TTGGTATGAGTTACGTAGTTAGTAATTACTTTTTCCACTATATCCTTTCA GGAAATGAAAAGGCTTACTACGAGAGATCACCAATCAACTTTGTCAATAA ATTTACATGCCCAGTAATTCTGTTTCAAGGGCTGGATGATAAGGTAGGTG CTGATCATAAACCACATTAGTTATCATGAATTCATGAGTAAGCTGGTAGA ACTATGTAAATGTGTTTCTATAACATATTACAGTTACATGAGGTGAAACC TGACTATATTAAAACGTGTGTTGCAGCCTTTAGTTGGAAGCACTGTTGAG CAGAGAGATACATTCTGGCACTTTTGACTCTTTAAAATTCTGTTCCTTCT AGCTACTATATTTGACTAAAATATCTAGTACTTCAGAAATTGGCAAGTTT TTGACCTGACCCTGGAAAGGTTACCTAAGCAATGTATTAGGTGTAACCGT GGAATTCCATTTTTTTCTGATAATTGAATATCAAAGTTGGGAGGCAAAAT TATCAAAGTGAAAAGTAATTCCGTAACGTCTTCACAGAAGTCCATTAACT TGCGGAATCATAGCTGCAACATTTCCTGAGGGCCGGCAAAATCATAACTT GCGGAATCATAGCTGCAAAATTATCAAATGTTGCGGAATCATAGCTGCAA CATTTCCCTGTGAAAATTGTATCATGCAATCTCACAAACCAGAAGTTTGC TCTAGTCTTGTGTAAAATCAGAATCTGCATTTAACTTGCGGAAGTGTAAG GCTGAAAGCCTCAGATAGACCATCGCGAAATATTTCACACCTTAATCAAT ATTTTGCAGGTTGTACCACCAGATCAGGCACGCAAAATATACAAGGCCTT GAAAGAGAATGGCCTTCCTGTTGCGTTGGTTGAATACGAAGGGGAGCAGC ATGGGTTCCGCAAGGTTGAATACTGTACTAATTACTTTTCTGCACCTGTC AACCGTGTTAGCTTTCAAGTTTGTCATGGATTTCAACTTTTCCCCCCATT TTGAACAGGCTGAAAACATCAAGTTCACCTTAGAGCAGCAGATGGTGTTT TTTGCTAGACTGGTCGGTAAATTCGAGGTGGCGGACGACATAACTCCGAT CAAGATTGAGAACTTCGATTAATGTGTGCAGGAAACGAGTGTAGCAGCAG ATTACATCTTCTTAGAACTTGAGCTTCTTACAGGTGGTTTAGGCGTGTAG CTGGTGTCTGTGTCGAACTTCATCATCCTTTACTTGATTTTTTTTCTGGA ATTTTGTAGAGATTCCTACAACAAACATGGGTCCCGGCGCAAAATAGAAA CTGCTAGTGCAAACTCATGTCAGTGTCATTTTCTTAGACTTGGGTTTTTA CAAGTTGAGTGACTGCTTGTTTTAGTTTTATTTGGCTCTGGC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.