Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA002162

[Submit comment/correction]

Sequence	AA002162
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA002162
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	TCTATATAAGCCTCCTCCCGTTCCATGCTTCCCACTCATCCACTGCAACC GATCGAGCTAGCTAATCATCTCGCTTTCGTCTACGCTACACAGTGCACAG CAATCATTTCTCCTAATAATCTCATAATTATTGGTCGATAGCCATGATGA TATCCTCCAGGAGCTCATCTTGGGCTGCACTGGCTCTGCTCCTCGTCGTC GCTCTAGCGCACACCGTTACCGGCGCCGACGAGCTCTCCGCCGGGTACTA CGCGAAGACATGCCCCAACGTGGAGAGCATGGTGTGGTCGGTGATGGCGA GCAGGGTCGGCGGCGGGCGGATGGCTCCCGCCGTGCTCCGTCTCTTCTTC CACGACTGCTTCGTCAACGTATGTCGCAATTCTACATTTATATACTACTA CTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTCTACTACTACTAACTACT ACTACTACTACTACTACTACTACTACTAACTACTACTACTACTACTACTA CTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTATACTACTACTA CTACTACTACTACTACTACTACTACTACTCTACTACTACTACTACTACTA CTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACT ACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTTA CTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACT AACTACTAACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACT ACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTAC TACTACTACTACTACACTACTACTAACTACTACTACTACTACTAACTACT ATACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACT ACACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACT ACTACTACTACTACTACTAACTACTACTACTACTACTACTACTAACTACT ACTACTACTACTACTACTACTACTACTAACTACTACTACTACTACTACTA CTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACACTATACTACTACTACTAC TACTACTACTACTACTACTACTACTACTAACTAACTACTACTACTACTAC TACTACTACTACTAACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACT ACTAACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTA CTAACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTAC TACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTA CTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACT ACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTAT ACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTAA CTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACT ACTAAACTACTACTAACTACTACTACTAACTACTACTCTACTACTACTAC TACTACTACTACTACTACACTACTACTACTAACTACTACTACTACTACTA CTACTACTACTAGACTCTACTACTACGACTACTACTACTACTAACTACTA CTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTCTACTACTACTA CTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTAACTACTACTACTAACTA CTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACT ACTACTACTACTACTACTACTACTACTAATACTACTACTACTATACTACT ACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTTACTACTACTACTACTACTA CGACTACTACTAACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTAC TACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTCTACTACTACTACTAC TACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACACTACTACTACTAACTA CTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACT ACTATACTACTACTACTACTACTACACTACTACTACTACTACTACTATAC TACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACACTACTACTACTACTAC TACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTA CTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTAACTACTAC TAACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACT ACTACTACTACTACTAACTACTACTACTACTACTACGAACTACTACTACT ACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTAACTACTACTACTACTACTA CGACTACTACTACTACTAACTAACTACTACTACTACTACTACTACTACTA CTAACTACTACACTACTACTACTACTACTACTACTACACTACTACTACTA ACTACTACTACTACTACTACTACGACTACTACTACTACACTACTACTACT ACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTAC TACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTA CGACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACT ACTACTACTACACTACGAACTACTACTACTACACTACTACTACTACTACT ACTACTACTACTACTACTAACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTA CTACTACTACTACTACTACTACGACTACTACTACTACTACTACTACTACT TACTACTACTAACTACTACTACTACTAACTACTACTACTACTACTACTAC TACTACACTACTACTACTTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTA CTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACT ACTACTACTGACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTA CTACTACTAACTACTACTAACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTA CTAACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTAC TACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTAACTACTACT ACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTAC TACTACTACTACTACTACGACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTA CTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACGACTACTACTACTACTACT ACTACTACTACTATACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACT ACGACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTAC TACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTAACTACTACTACT ACTACTACTACTACTACTACTAAACTACTACTACTACTACTACTACTACT ACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTAC TACTACTAACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACT ACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTAC TACTACTAACTACTACTACTACTACTACTACGACTACTACTACTACTACT ACTACTAACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTA CTACTACTACTACTACTACTAACTACTACTACTACTACTACTACTACTAC GACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTA CTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACT ACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTATACTACT ACTACTACTAACTACTACTACTACTAACTACTACTACTACTACTACTACT ACTACTACTACTACTACACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACT ACTACTACTACTACTACTACTACTATACTACTACTACTACTACTACTACT ACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTAC TACTACTACTACACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTATACT ACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTAC TACTACTACTACTACTACTAACTACTACTACTACTACTACTACTACTACT ACTACTACTACTACTACTACTACTACTAACTACTACTACTACTACTACTA CTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTAATACTACTACT ACTACTACTACTACTACTACTACTACGACTACTACTACTACTACGACTAC TACTACTACTACTACACTACTACTACTACTATACTACTACTATACTACTA CTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACT ACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACGACTACTACTACTAC TACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACGACTA CTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACCTACTACTACTACTAACTA CTACTACTACTACGACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACGACT ACTACTACTACTACTAACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTA CTACTACTACTACTACTACGACTACTACTACTAACTACTACTACTACTAC TACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACGAACTACTACT ACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACGAC TACTACTACACTACTACTACTACTACTACTACTACACTACTACTACTACT ACTATACTACTACTACTACTACTACTAAACTACTACTACTAACTACTACT ACTACTACTACTACGACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTAC TATACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTAC TACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTA CTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTAACTACTACTACTAC TACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTG CTACTACTACTACTCCTACTACTACTACTACTACTACTACTACTGCTACT ACTACTACTACTAATACTACTACTACTACTACTACATACTACTACTACTA CACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTAACTACTACTACTACT ACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTAC TACTACTACTACTACGACTACTACTACTACACTACTACTACTACTACTAC TACTACTACTACTACTACTACTCCTACTCCTACTACTACTACTACTACTA CTACTACTACTACTACTACAACTACTACTACTACTACTACTACTACTACT ACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTAACTACTACTACTA CTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACT ACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTAC TACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTA CTACTACTACTACTACTAACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTAC TACTACTACTAACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACT ACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTAC TACTACTACTACTACTGGAGGAGGACGTCGCTACAGCTACTCGCCGTTGT TGCCGCGGCCGCCGTTGCCGTGACCATCATTGCCGCGGCCACCATTTCCG CTATCGCCGGCCCCGTCAATCTCCATCGTGACAGACCAGATGGCCCGCTG CTGGAGGCATTCGTGGAAACGGTCGCGCGCCAGGCAGCGAACCACCCCCT TGCCCGTCGCCTTCCTGCGGTCCTCCGCCGCCCGGTTCGTCAGGGCCTTC TCCATATCGGCGGCTCAGTGGTCCCTTGCCTCCTGGTTGGCGAGCTTCCT CGCCGCAACAATGACAAACGCCTAGCGCTAGGCTTCTATCTCAGCCGCGA GCAACTCCGCAGGAGCTGAAGCTAGAGCCAGAGCCGGAGCTGGAGACGAA GAACCATTGGGGACGAAGCCCAGCGCCTGCGCGATCTGCAGGGGGATGGC GATCGCCTCCTCCTCCCCCTTCTCCTCCTCCTCAGCCTCCAGCTGATCCA CCTCCTCCCTCTCCTCATCGGCGTCCTCCTCCACCTTTGTCTCGTCGCTG TCGGTGCTCCTCCTCCTCCGAGTCGGCGATGTGCTCGCGCTGTGCGCTTT GGCGGCGTGGCGAAGCTCGCGAACGGCGACCTTGGCGGCCTCCTTGGACA CCTCCTCCAGCGTGGTCATGGTCGCCTCGTGACGGATCTCGCGAAGAGCC GCTGATGCGGCCTCCATGGCCACTTCCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTACTACTACTACTACTACTACT ACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTTACTACTACTACTACTA TACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTTACTACTACT ACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTAC TACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTATACTAC TACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTAACTACT ACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTAC TACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTA CTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACT ACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTAC TACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTA CTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACT ACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTAC TACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTA CTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACGTAATACGCG TTTCATTTGCTAAATAGTACAATTCATGGCCAATCATACATGACAGGGAT GTGACGCCTCCGTTCTCCTTGACGCGACGCCCTTCTCCGAGAGCGAGAAG GACGTGGAACCCAACACATCCCTCACCGGCTTCACCATGATCGACGAGAT CAAGTCTGTGCTCGAGCGTGACTGCCCGGCCACCGTCTCCTGTGCCGACG TGATCGCGATCGCATCCCGCGACGCTGTCACTCTCCTCGGAGGTCCCACC TGGAACGTGCCCCTCGGCCGCAAGGACTCACGCTTCGCCGCCAGAAGGGA ATTCACCAAGGCACACCTCCCGAGCCCTAACGACAACCTCGCAGAGCTTA TCAGAATGTTCGGGGAGCTTGGCCTTGACGCCCGCGACATGACCGCGCTC TCCGGCGCGCACACCGTCGGGATGGCCAACTGCATGCACTACAGGGGGCG CGTCTACGGTACCAGCAACACCAAGTACAACATCGACCCCTCCTTTGCGG AGTCTAGGCGGCAGATGTGCCCGCCGCAAGGTCTGACCGGTGACGCCGGC AAGGCGCCGTTCGACGTGACGACGCCCATGAAGTTCGACAACGCTTACTA CCGGGACCTTATCGCGCATCAGGGTCTCCTCAACTCCGACCAGGCTCTCT ACGGTGGTGGAGGCGTGGACAACCTCGTGGAGATGTACAGTGCCGATGGT GGTGCTTTTGGGAGGGACTTCGCCAAGGCAATGGTGAAGATGGGGAACAT ACCTCCACCACAGGGAATGCCCACAGAGGTGAGGCTCCAGTGCTCCAAGG CAAACTAATGATGGCTCCATGCATGCCAAAGTGGATGCTACCACCAATTA TCTTGGTTTATTTATCAAATGTCCAGATTGTACTAACAAGTAAATTGTAC TTGTATTTCATTTAATTTGTGTGTCTCGTATGTAATGTTGGCATAAAATG ATCCGATACATGTTGTGATAAATGGTTTTTCTCTCGTACTAGATCTCAAT TGCA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.