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GrainGenes Sequence Report: AA038703

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Sequence
AA038703
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA038703
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGGAGCGGAGATCCCCCTTCTCCTCCCCCTATGTTCTCAAATTGGTCCC
CGCCATGCCCCTGGCAAGCCCGCCTCGACACCGTTCGCCGGAAACCATCC
AGATCGTTGTCAAGGAGGGCAACATGAATCAGGTTCGCATCAAGGAATCC
TAGGCGTGGTGTTGCGTTAGAACAAGGTAACCTATTTACCACTCTTTTCT
CATGATGTTTCTTTCGCAGATTAAACGGTGGGACGACGACCTAGGGCACC
CGGTGGACTAAGGCTGCAAGGCCTGCGTCTACAGGGAGTGACGACTACGG
GGATGAGGACGCATATGTCTAGACGCGCTCTTCTTCCATCCGCTCATGTT
CTCCTTTCTCTGTCTCTATTCTTTTGGCTGTAAGATGAAAATGGAGAGAG
GTGATAGTCGCGAGCGTATAACATTTTCTTCATGTCCTACTCATGATACA
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GTCTAGCGATGGGAATACTTGCATTGAGGGGCGAAGGCATGTAGGCCTTG
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GTTGCTTTGGGTTTGCTTATGATATCATGGATATATTAGTTATAGAGTAT
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GATTAGGATCACATTTAGAATTTTGGTATTATAGATATCTTAGTTTATTT
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TTTGGATGGCCCTTTCATACAAGACCTTTCTTGTTTTGTTTTAGTACAGA
TTGTATATTAGGATGGATAAAGGTGTTCTATTTATTTTAATAACTATGTC
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TTCTTTGTTGTTAATATACTGAGCCCTGTCTTGGTTTCCAGACATCTCAT
GGATTTTCTTCTATTAGGGCTTTACCATCCCGAGTTCCCGACACAACAAA
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AAAATTATTATTTTCTCCGTGCTATTCTTTTTACTAACAATATGTTTAGT
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TAGGAGGAAGCCGGTGGGCTCACGCGACCCCAAGAGTTAAGAGATCTGAG
AGAACAAGTAGTTCTCCTTTGTTTCTTAGGATTCTATTGTTTCTAGGTTG
ATAGTTAGGCACATGAGCTTGAGCTGTTAGCAAGACGCGATGTTGCCATC
CGAGACATTCTATTCTCCTTCCTGCAGTCCGGCAACAGGAGCCCCCTGAC
GCTCCTAGCCTCTCGGGCCGCAGAGGTGTTTGTGACGCCGCCAAGCGTCG
GACACGCCCATTCCGCCGTGGAAGCGTTAGTTTCTCTACGCCTTTATGTT
CTCCACGTTGTTGCTGCATGCTATTTGGATTTGATTGATTGATCTTGCAG
GTGGAGGCGGTGGTTCTGGAGGAAAACATCATAGCATCGCTAAGGCGCTT
GCAAGGTATACTGCAGGGTCTGGCATCCGCAACCTTGTGTGCAGATCCTT
TTCCTCTTCAGTTCGTGTCCCAGTTTTTCTTGAAATAGCAGCTTGCATGC
AGATATCTGGTGGGCGGTGTACTCGACGATGGTGCGTGTTGATGCTCAGA
TCGTGGAGTGCAGATCCATCTAGACCATGAGATTGGTTTCTTTTCTGTTA
AGTACCTAACTTGTTCGAACGGATTGTTAGATGCGTGGTCGAGCACTTCC
ATAAGCCGATCCGTCCATGAATGCTACCATGGCTCTTTTCGTTGCTGCCT
ATGTACAATCGAATCCTGACCATTTTGTTTATCACCTCACCAGTTAGTTC
ATGGGATTTATTAGCTGCATGATGGATTATATCTTTATTTTACAGCGTTA
GAGATCTTGCAGCAGAATTCAAGGATGGTACAGCGAGCCATCCTAATACT
TGGATCACTTTATTACTCTCTCTGCCACCGATAAGTAGTAGTAAATGACA
ATTATATTAGATAGTAGAAATTTCTAGATAGGACGAGAGAAAACGCTCGT
GGGAGAGGAAAACGCCGCCGCCCTCCCTTTGCCCTCCTCTTCTGGCCTGG
ATCCACGCCACCGGCAGTACGCTCCCCTCTGCCTCGAAATTTACCAGCGT
TGCCTTACCATCCCCTGCATCTTGAGCGGCCGGCGGAGCCGTTCGGCGTA
GCAGCGTCGGCGAGCTCACGGCCGAATGGGATACTGTGCGAGTGGAGAGA
TGGGAAAGAAGAGGGGATGGACATCCGAGAGTTGTGGTGCTGGGATGAGG
CATAAGGGGAACATCTCCCCTTGATCTCCGACTACCAGAGTCGCGTCCCT
CCTCTCGCTGCTCCGCCTCGTCGTCGATCACGATGGAGCGGAGATCCCCC
TTCTCCTCCCCCTATGTTCTCAAATTGGTCCCCGCCATGCCCCTGGCAAG
CCCGCCTCGACACCGTTCGCCGGAAACCATCCAGATCGTTGTCAAGGAGG
GCAACATGAATCAGGTTCGCATCAAGGAATCCTAGGCGTGGTGTTGCGTT
AGAACAAGGTAACCTATTTACCACTCTTTTCTCATGATGTTTCTTTCGCA
GATTAAACGGTGGGACGACGACCTAGGGCACCCGGTGGACTAAGGCTGCA
AGGCCTGCGTCTACAGGGAGTGACGACTACGGGGATGAGGACGCATATGT
CTAGACGCGCTCTTCTTCCATCCGCTCATGTTCTCCTTTCTCTGTCTCTA
TTCTTTTGGCTGTAAGATGAAAATGGAGAGAGGTGATAGTCGCGAGCGTA
TAACATTTTCTTCATGTCCTACTCATGATACAAATGTTAACCGACGACTA
TCGAGCCTGATTATCAGAACAAATGTTTACTGCTGAATAGAGAAAGAATG
AATCCTACAGGTATGCAGTAACCAGAGACCATGCTGGTCCTCTTTTTTTA
GTTAGTACGGCCCAGGAGTCAACCATGGTTAGCCACATAGTATGATTCCA
TGTTCTTGAGGTGATTATTTATTTCTATAGCTTGCTTCTTTTTCTAACAT
TATGACAAGTTATGATTTACTCCACACCCGAGTAAAAATGAAATTACCAT
GTGATAGTTGGTTTTGAATCTTAGCGGTTGGCTAACCAAGATTCAGTTGG
ACACAAGATATTGTGGAGCCGTTCTTCCGACCATGGGCTGGAGCCTGGAT
GCGGAAGGACGATGGGCTGCTGTTCCAGGTAGTGGCGTTTTGGTCTAGCG
ACAACAGCTCTTTCGTATTCCCATGGAACGAGGCCTCTGCGACACTGGAG
GATGTGCCAGTGTGCCGTCCTAGGCACCTCGCTAGAGCCGGCCTCCAGCC
GCCGTGCTGGATCTCAGGGCCTTCTTCCTCAAGTCTAGCGATGGGAATAC
TTGCATTGAGGGGCGAAGGCATGTAGGCCTTGTAGATCCCACCCACTACG
GCTGATTGTGTTATTGTCCTCATGCACCTCATATATCTCGATGAAATATG
CAGCTAGGAGTAGATCAACGTGATGCTTCCTGCTAGGAGCAGCTGCAGCT
TGGTGCAGACGACCTGCAAAGTGCTACGAGTATTATCGTTCATCTACATA
GGTTGAATAAAAGTAAGCAAAAGTGCAACATCTACAGTCTAGATAAAATA
TAAGCAAATGTTTTGGTATCATGGTAATCACCATTTTTTGATATGCATGG
TTCTTTTCTACTTGTGAGATTTATCTAATCATGTTGCTTTGGGTTTGCTT
ATGATATCATGGATATATTAGTTATAGAGTATAGTGGTAGCTAAAGAACT
TGATCGATTATAGGAACTGCAATTCATTATAGGATTAGGATCACATTTAG
AATTTTGGTATTATAGATATCTTAGTTTATTTTTTGTAAAAAAATTTCAT
TGCACCATTTTATGCGGTATTTATGCTTTAGGGACATGGACGGACTGTTA
GATCATCCAAGGATATCGCTGAACATCTAGAGGTAATAACACCATATATG
TGGTATTCATGTTTGGGGTCAGATATATTTATACTACACATAAAGATAGA
ACCTATAATTTTGTATGGATGATTAAGCATTATGTGGCTAGCCATAGATG
AGAGTATTTGCTTTTTTACTTACAAGTCTATTTTTGGATGGCCCTTTCAT
ACAAGACCTTTCTTGTTTTGTTTTAGTACAGATTGTATATTAGGATGGAT
AAAGGTGTTCTATTTATTTTAATAACTATGTCGAGTAAATAGATTGTCAA
AGTGAGCAACCATTTTTGGACAGAACAACTTGCATTTTTTTATCATTTAA
TAGACAGTTATTGATAGCGCAACACCTATATGTTCTTTGTTGTTAATATA
CTGAGCCCTGTCTTGGTTTCCAGACATCTCATGGATTTTCTTCTATTAGG
GCTTTACCATCCCGAGTTCCCGACACAACAAAGAAACCCATCAGATAACA
TTCTCTAGCTACCTAAGACATGATATGTAGGAAAAATTATTATTTTCTCC
GTGCTATTCTTTTTACTAACAATATGTTTAGTTTACCCCAATGCAGGAGG
TTATTATGGAATCATGAATTGACGGTTAATGATGTCGGATAAATGATGCT
GACTGTGCATGTGAGAAAAAAATCAAGGGTTTAGGATTATGTTGGCTATA
TAGATTTCGAGATGGAGGCCCTCAATTTTCTCGACAGGGAAATAACGAGC
ATATCTACACAGACGTCAAGCCATGTCATTCGGTATTTCATTTCAGAAGA
TTGACAACCAAAGCTATGCCACTTTGGCCTCACACTGTTTGGATACTTGG
CCCCTAAGTACTTCATGCACAACAAGATCAGCGACAAGATTGACATGTAC
GCCTTCGGCGTCGTCCTGATCGAGCTTGTCTTTAGGAGGAAGCCGGTGGG
CTCACGCGACCCCAAGAGTTAAGAGATCTGAGAGAACAAGTAGTTCTCCT
TTGTTTCTTAGGATTCTATTGTTTCTAGGTTGATAGTTAGGCACATGAGC
TTGAGCTGTTAGCAAGACGCGATGTTGCCATCCGAGACATTCTATTCTCC
TTCCTGCAGTCCGGCAACAGGAGCCCCCTGACGCTCCTAGCCTCTCGGGC
CGCAGAGGTGTTTGTGACGCCGCCAAGCGTCGGACACGCCCATTCCGCCG
TGGAAGCGTTAGTTTCTCTACGCCTTTATGTTCTCCACGTTGTTGCTGCA
TGCTATTTGGATTTGATTGATTGATCTTGCAGGTGGAGGCGGTGGTTCTG
GAGGAAAACATCATAGCATCGCTAAGGCGCTTGCAAGGTATACTGCAGGG
TCTGGCATCCGCAACCTTGTGTGCAGATCCTTTTCCTCTTCAGTTCGTGT
CCCAGTTTTTCTTGAAATAGCAGCTTGCATGCAGATATCTGGTGGGCGGT
GTACTCGACGATGGTGCGTGTTGATGCTCAGATCGTGGAGTGCAGATCCA
TCTAGACCATGAGATTGGTTTCTTTTCTGTTAAGTACCTAACTTGTTCGA
ACGGATTGTTAGATGCGTGGTCGAGCACTTCCATAAGCCGATCCGTCCAT
GAATGCTACCATGGCTCTTTTCGTTGCTGCCTATGTACAATCGAATCCTG
ACCATTTTGTTTATCACCTCACCAGTTAGTTCATGGGATTTATTAGCTGC
ATGATGGATTATATCTTTATTTTACAGCGTTAGAGATCTTGCAGCAGAAT
TCAAGGATGTGATTTTCTTGGACTCCACCCGATGATTTTAAGGTGCGTTT
TTTTTACGGAACAACACCCACACCGCTTGATGATTAAACGAAGAGGGGCA
AATCAGTTACAACAACTACACAACGGCCAAGCCGTCACTAAAGAAATGAA
AAAAAATACAATCTGAACACAATACTTAATTGTGCTATGTCAGCTCTAAC
TCTGTCTACCCCTCCATTGGGGAGTAGGCTCTTATGCTGAAAATGTGTCG
ATTCTTTTCATTCCAAATCTTCCAAAGAGTGTAGGCAGTCAGGGTAAGGG
TTTTCTGCTGTTCTCTTGTTAATCAACTGCAGATGCTCCCACTAGGGAAT
GATTTCCGTTGAAGCTCTTGTGATTTGGCATAGTTGTGGATCATCCGGAA
CAAACCCATACCATACCTCTTTTGTGAACGGGCACTACAGGAACAAATGG
CTAGCATCTTCAATGATTTGGTCGCAAAGACTTCACTTATCATCATAATT
CCAACCTCTGCTACGGAGTCTCTCGGTAGTCCATAGTCTGTTTTGGAGAA
GCAACCACAAGATGAATTTAATCTTTCCTTCGATTTTCGTCTCCACGCCT
TCTCGAGCACTGGGATTTTGATGAAAAGGTCATTGCAGCTGAACTGAATC
TTATAGGCTGAAGAAGCAGTGTAGTGTCTATCAGATGAAAGAACCGAACT
TGCCGGATCTGGCTTGTTTGTTAACCTGACAGCCTGAATTTTCAAGCATA
AAGAGGTGTGATTTTGAAGGGGGTGTTCGCGTCAGAACTCGGGTGCCTGA
TTACGACATGTTTCGTGGAGAAGAGGGCTGCATCAAAACTCGGGTCCCAT
ATGTTCGTTGCCAACACTATACCTCGGAAGGTTGGTCAAGCATTAATATC
CTCCCTGAACTTCTAAAGTCTGAAGATTGTTATTATTTCTTCATATTACT
GTTTGTAAATTACAGCAGGTAGACATGATCCTGATTTGTGTTGATTTGAT
GATGACTTGATTGCAGCGTGCTGGAGTCGGTGATTGTGATCATATGACTC
TACCATGTACTATGGGGCAACAGAGAGGAAGCATCTGCCGCAACTACAAC
ACCGCTTCTAGACATACTAATAATGCTACCATCTTGCTAAACATGCTGAG
TTACTATATCTATGGTATCTTTTTTTTGCTAACCCCTAGATGTCTGAATT
CAATAGAAAAACCATGGACCTCCGGACATGCACTGATGCACCCTTGTGAG
AATTTTCAAGATTAGTAAGACTATGTTAATATATTCTTTAGAACACCATT
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AATAACTGATAAATGGCTTGCTAATGTCAGCTGCAAACCTGAATTCCGAA
TGAAACTTGTTGGGACTTGTTTTTATTTGATTGATAATGGTCGTAAGTTT
ATGGTTGTGAGTGGAAAAATAATATTATTTGTACTATTATTTTAGGAGAA
GTGTATGGCCTTTGTGGTGTACATCAGCATAAGTAAATTGGGAGATCTCC
ATTTCTGGGTGATGGGTGTAATCTTACATGATAATTGTATGAAGATCAAA
AAAGAGATGTCCTGAAGCTTGTTAGGCAACCCTTGTTGTCGGGTTACATG
AGGTAGTATCTACTTCTTTCTGGTAGATGTTGGTATTGCACCAATAGGAT
CATTAAGGAGAATTCTACTATGTGCAGGTTTTGGGAAGCCGAAATAAATA
TTTATGATCTGGAATTCATCATTAGTGGTGAACTATTTGATATTATTGTG
CAAGCCCACTCTTCTTTGGCATTTCCTTCATTGCCAGCCTTGACTTCAAT
ATTG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.