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GrainGenes Sequence Report: AA007256

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Sequence
AA007256
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA007256
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
TGATCATCTGCTGAGTCAGCACGCCACGCCGGCCGAAAATCGCCGCCTGG
GCCTAGCTAGAATCATTTGCCGCCGCTGTCATTCTACACAGAGGGCCGAC
CTCGCCGCCTCCAGGTCCAACGCGGGTCCGGCGAGGGGCCTCCTGCCACC
ACCGGCTTCCTTTCACGCCGCCATCATCTCCTCGGCGGCTGTTCGAGTCC
GTGCATTGTGGAGGCAGGCGGGAGCAACCAGCATTTGGACATATCCGTCC
AGGAGGGCAGCGGCCAGCGCCGATCGACGTGCGTCTAGTGAAACCGAGGC
ACGCTTCGTCTCCTCGCCACGCCGACGCCGACGCCCTGCCTCTCGCCGCA
GTGGCCTGTATTTCTCCCGCTGCTCTCCTCGGTGGCGGGTGTTTCATGCG
CCGCACGGAAGGTGCTCGACGAAATGACCGAGTGAGTAACGGCAGCTTTC
ACAGTTGCAGCGACTTGCAATCTACTTCGCCTTAACTTCCCCCTTCCTCA
CTGTGATGTTGAGCCTAACGCTTCGATTGTGGTGAACAACAGCGTCCCAG
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GGAGGCTGCTTCCTGGACGCCCTCGAGTTACTCCACAGAAGGTACACGAG
AGAACAACTACAGTCTGACCGCAACAATCACATGTGCGTAATCAACTCGC
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AATTAACCAGTAATTCCCATGTCGTTGGTGGCTGGCTGCAGCTACCCCCA
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AGGCTTCTTCCTGGACGATGCAGTTGAGTTACTGGACGAAAGGCACATGG
GAGAGCAACTGCGGTCGACCACATGTGCGTAATAGCAACTTACTTGGCTT
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CAGTAACTCCCATGTTTGTACAGAAGAGGAAAATATATTGTTAACGCGGA
AGAAAAAGAAACTACCCAAGCATGCCCCCCCAAAAAAACATCCGAGAGAA
ACACAACGTTTTAAACAACCAGATAGCCTTACAACATCACAATGGGCTGT
CCAGTCCAAGCAGAAAAAATTCAACATACTTCAAGAAGGTAGACGTGCTC
ATCAAAGGGACGCAAAGTTCATGCTTCCTCACCGCGATCCTGCTCTTACA
CACCATTAATTCTGCATCAGTCGCAGGGGCCCCTGTATATTCCCTCGTTT
CATTAGCATGTTGCCGAAGGGGCCACCTTTTGCAGTTGCTCTGTGCCCAG
TATTGAGGCTTCATTAGCGAAACTAACCACGTGTCCCGGTTTGATGGGAG
CTGTAGCATTACTCTCCGGCTCCACCTCCGCAGACATGGTAGAGCGTGTT
TCTGTTGGTTCGTCTTCAACCACAGGCGGTTCCTCTCGGACGTGATGCTC
ATGTGCTGGTTCCTCCTGAACTGCAACCGGTGTCTCCTCAAGTTCGCCTG
CGATGGCCGAAACATTTGGCCTGTTATGGTGGTTCCTTGCCTCTGCTTCC
CACACTTTTCTTGTTTCTTCATCCACTTCAGGAAATTTCCTTCAGCTCAC
GGAGGCGCATGATTTTGGCGCCGGAAAGACCAACTAGATCCTTGCAGATT
AGTTGGAGCGAGATAATCTCTGGCCGAGCTCCATCTTCGATTGTTAGGAC
AGTTGTCCCCACAATTTTCAGCACAAGAGATAGGCGGTGAAGGCTCCTGA
ACTTCCCTTCTTGTATGATGAAACCGTCGTCGATGCTGTTGGCAGTCATC
TTAAGGTACAGCAAGATAGGCAGCTCGCCAAGGACTGAAAGGAGATTTTG
TGTCACAGACAAGGTGGTCGAAATGCTTAGCTTAGTGAGATCACGAAACA
AGGCAACGAACTTTGGCAATGTGGCTGAGTTGGAGTTTCCCTGTAGCTTG
AGTGAGCTGAGATGATACATTTGTCCCACCCTTGAACTGTAGTGTTGACA
TAGTTGATCCAGAGCTGACAGGGAACCTTGGGGCAGTTCTTGGAAGTCAA
GGGACAGTGAGCGAACATTGTCTTCACCCAGAGGAGTTTCAATGTACTTT
TGGATGGCCTTGGAAAGATGATTATTCAAGTCGACCTGACCTTGTTTAGT
TTCCTCACAGTCATACCATATCTTCGCCTTGTTCAACCTTTTCATATGGT
CCATAAGTTGCAAAAATCCCTTACCATTGTCAGCAACAAATCCCACTATG
GTCTCCATCATACATTCTTTTGGCAGCCTCTCTGTCTTGAGTGAGTCTTG
CAGCTTAAGCCTACCAATCAGATGAATCAGACAGGGTAGTCCAACAGCTT
CCACTGGGAGCACATTCACCCTTGTCTTGCTTACATCAAGTGTCTCCAGC
AACTTAAGTTGTGCAATTTCCTTGGGAATCTTTGTGATATTGGGCCCAAG
GCTTAGATATCTCAGATTCCATAGCTTGCATATATCTTTAAGATGACAAT
CTTTAACGTCAATGCACCCTTCCAGGTCCAGTACTCGTGTAAGTTTGTGC
TTGTCAAAATTGGAAATAGCATCACCTGCATGCCCTATGACTGTCAGAGA
TCGGACACGAGACAAATCAATGTCGGGCATTGTTCTGGAACTTCCACCGT
TGCTATCATGTATAAAGAAGTGGCGAACTTTTTTGTGCTGAGAACCGAAG
GGCATGATGAATTTCTGAGACATAGACTTGTGCAATGTGAATGCGTGCAT
GATACCATGAGCTTTGCACGTCTTCTCTGTGGCATTCCTGATTGGAACAG
GCAGAATGATACTCCGGTTGATAAATGTCTTGAAGTTTTCATCAGCTACA
CTTTGGTGCCAGCCTTGATGATGGTGATCATATTCTTCAGCCAACCATCG
CCTTCCATTTTTCTTGAGAGGATGGTCCATTGGGAATATACCTAGATACA
ACAAGCAGGTCCTGATATTGTAATCAGGCAAACTGGTGTAATTTTCCTGA
AGCACACCGCGAAGCGTTGGAAAGTTGGTCTCGTCTTCGCGTTTCAGATT
TGTAACCAGATCGTTGCACAGTTTGTTACAGAATTTCCCTGTGAGTACCT
ATTCACAGCTCAACTGGCATGCCACACTATAAAAAGCAAGTAGAAGACCG
CCACATTTCTTCAGGAGTTCTGTCGCACCCAGCAGTATCTCAGGTGTACA
CATAACCAAAGGTATATCTATCCTCTTCGCGGGGATTATTGCAGCATCTA
TTAGCTGCGGACTGAGTGGCCGTTGTCACAATTATTCTGCCATTATCCCT
GAAGGAATTCCTCACTGTATTCCAGCATCAAGTAAGAATTAATGTCATCA
GTAACAATTAAGTAGCGGGTAGAAAAATTATTTAATGTAAATAAGAGATT
AACATACAAAGTACCAGGCAATTCAAATAGGAACCCTTGTTGTTGTCCCA
GCGCTGCTACATCTTCTCCAGCTCCTGATCGCAGGTATCCCAAAACATTG
GCTGATGGAGTGATGGCCGTGATCTTGGGAAATGCCCTTCTTGATATGCA
GTACAAACAAGGTACAGCATGTCAGGGTTGAGCCTTCACATGGCAGGTGA
CAAACAGGAATAATCATAAACAAACACAGGAAGAAAAGGGTGAGTTTAAC
CTGCTAATTCTAGCATTATTGGTGTGCCCTACATTTTGGGCGAGAGAATC
CAGTGATTGTTTTCGGTACCTAGGAGTGAATTTGTGCTTTGTACTTGTAT
GTTTGAAGCCTTTTGCCAAGTTGCTGCAACTGAAGTGATAAGAACATAGG
GAAAATGACAATTTTAGCTTGTCTTATTCGAGCACTCGAGCAAGTGTTCT
CTATTTTTAAAAGTGGCATTCACTCCCGTTGGCCAGATAGTCCGTATCAT
CCATTTGGTTGAACTTGGCTTTCAAGTTGTCGATTACTTAATGTGCACAC
AAAGTACGCTAAGTGTGTTGTGTAATCCGTTCTGCTTCACATGGATGGTG
GCGGTGTGTATAGAGGATTTCATACTTGGAATTAGTTAGTACTACGTGTC
CACATCACCAGATAAAGTGATGCTGATCTATCTCAAGCAGAAAAGGGTGA
ACGGAGTTTAGCACTGACTTGTTTGTTGTGTCGTAACATATATATGAACA
TCCCTTGGAAAGTATATATTGATCAATGTCTCGAGATTTTCCCTTCACAG
AAATCAAGGATCCAAATTCGCAGTACTTTATATAGTTTGCAAAATTCGGT
ACCCCAACTGGCTGGCCCTGGTACCTTCCAACAAACAAATGGTATGCTGG
AATGAGCTTCTCTGAGATGGAAATATGCAAACCCTCTCTTACCCGAGGAT
CTGCAACACTCTATGATGCTTGTGTCCCGTATAACTCATCGTACACCAAG
TTGAAATCCTTGAACCTCCTGAATTTGAATCCCAATTTCAGGTGGCCTCT
CCATTTGGTTTTGCTTGCTGGTACCTGTATTGATCTTTCCTGAAATACAA
TGTGTTACAATTGATACTCAGATAATTACGTCAAGGTGATACAGCTATAC
TGAGAACACTCCTGGCCTCCGCATAACTAGAATATGCACCATCTCTTGAG
AAAGGAACCCGCTCTCGGTTTCTGATTACTGCTGCAGTTTCTGATTGCAG
GTATCCCTAAATATTCACTGATGGCCGTGGATCTTGGGAAATGCCCTCTT
GATATGCAGTATAAATGAGGTACAACATGTCAGGGTTGAGGCATCACATG
GCAGATGAGAAACAGAGCATAGAAAGTTACAATTAAACACAGGAAAAAAA
CTGGAATGCTGCTTAGACATATTCTGTCAGAAACTCTTGAGCGAGTTTAG
ACCTGCTAATTCTAGCATTATTGGTGTGCACAACATCCTGAAAGTGACAA
CTAGTATGCAAGAGAGAATCCAGTGATTGATTTCCGGACCTAGGAGTGAA
TTTTTGCTGTGTACTTGTAGGTTTGAAGCCTTTTGGCAAGTAGCTGCAAC
TAAAGTGATAAAAACATAGGGAAAATGATATTTTTGGCTTGTCTTAGTCA
AGCACTCACATACGTTCTCTATTTTTAACTGTGGCATTCACTCCCGTTGG
CCAGATTTCTGTCATACAGAGCAAGTGAAAGACCACCATATTTCTTCAGG
AGTTGTGTCGCACCCAGCAGTAACTCAGGTGTAGACATAACCAAAGGTAC
ATCTATCCTTTTAGCGGAGATTATTGCAGCATCTATTAGCTATGGACTGA
GTGGCTGTTGTCACAATATTCCATTATCCCTGAAGTAATTCCTCACGTTA
TTCCAGTGCATCAAGTGCATGTCCTTAATGTCATCAATCAGTTAAGTAGC
TGGTAGAAAAATTAATTGATGTAAATAAGAGGTTTTCAGACAAAGTACCA
GGCAATTCAAATAGGCACCCTCGGTGTTGTCCCAGCGCTGCTACATCTTC
TCTAGCTTCTGATCGCAGGTATACCAAAATATTGGCCAATGGCCATGATC
TTGGGAAATGCCCTTCTTGATATGCAGTATAAACAAGGTACAACATGTCA
GGGTTGAGCCTTCACATGGCAGGTGAGAAACAGAGAATAGTCATAAACAA
ACAGAGGAATAAAGCTTTCAGATATTCCTTCAGAAACTATTGAGCGAGTT
TAACCTGCTAATTCTAGTATTATTGGTGTGCCCTATATTTTGAAAACGAC
AACTAGCATGCAAGAGAGGATCCATTGATTGATTTCGGTACCTAGGAGTG
AATTTGTGCTTTGTACTTGTATGTTTGAAGCCTTTTGCCAAGTTGCTGCA
ACGGAAGTAATAAGAACATAGGGAAAATGACAATTTTAGCTTGTCTTATT
CGAGCACTCGAGCAAGTCTTCTCTATTTTTAACAGCGACATTCACTCCCG
TTGGCCAGATAGTCTGTATCATCCGTTTGGTTGAACTTGGCTTTCAAGAT
ACCTCATTTAATCTCCTATTGGTTTTCCTACTCCAAGTGGCTGCAGTATT
ATAAACCACCTTAAGCATGTTTTTATTGACTTGCTTGCTCCGCTATGCTT
TCTGAGGCAAGGTAAACTTGCCCCTCAAGCTCCTGCCTCTATTTCCTCTC
AGCTTCCTGCACAAACATATATGTATATATATATCCCTCCACTTCACTTG
TAAATACCTACCTTTTTCAGAAGCAGAGTGTGTAGTTTCAGGCATGGAGC
AAAGCATGGAGCCCCTTGTTGGAGGCAGCACTCAGAATACACGTATATAT
CCCTCCACTTCACTTGTAAATACCTACCTTTTTCAGAAGCAGAGTGTGTA
GTTTCAGGCATGGAGCAAAGCATGGAGCCCCTTGTTGGAGGCAGCACTCA
GAATACACGTGGGGTAGGAGAGAGCCTGGTTGTGATTGAGGTTCGGAAGC
AGCTGTACCTTGCTGGGCCCCTCATTGCCGGATGCCTCCTGCAGAATGTT
GTCCAGATGATATCCGTCATGTTCGTTGGCCACCTCGGAGAGCTCGCCCT
CTCCAGTGCCTCCATCGCCACCTCCTTTGCTGGTGTTACCGGTTTCAGCC
TGTTGGTATACTATGTCGTCACACCCCTTTTATTTTCATTTATGTTGGAC
CTGCTGAACGAACAGTTAACCGGAGTTTAGTATCATTTTTAAGGCTTTGC
CATGTGTTTGTTCATTATGATTTCAGTCTGGCATGGCGAGCAGCTTGGAC
ACACTGTGTGGGCAAGCCTACGGAGCAAAGCAGTACAATCTTCTTGGCAT
CTACAAGCAGAGGGCAGTTGTTGTGCTTACTCTGGTGAGCTCTGTTGTCG
CTGTGATCTGGATGTATACCGGTCAGATCCTTGTGCTCTTTGGCCAGGAC
CCGGAAATCGCCATGGGGGCAGGGAGCTACATCCGGTGGATGATCCCAGC
ATTGTTTGTGTTTGGACTGCTGCAGTGCCATGTCCGGTTCCTGCAGACGC
AGAACATCGTCCTCCCGGTGATGTTGAGTGCAGGCGTCTCGGCGCTGAAC
CACGTGTGGGTGTGCTGGTTGCTGGTGTACAAACTTGGCCTGGGTAACAA
GGGCGCGGCGTTGGCCAATGCCATCTCGTACCTCACGAATGTGTCCATCT
TGGCTCTCTACATCAGGCTCTCCCCGTCCTGTTCGAGCACGTGGACAGGG
TTGTCAAAGGATGCTTTCCGTGAAATCCCAAGCTTGTTGAGGCTTGCGGT
TCCATCTGCTCTTATGGTTTGGTGAGTTGGAGTGTGAGCCTCTCAAAATT
TTAATTGCAGACAGCATTCCCCGTGTTCCATTTCTAACTGAACTTGATCA
CAGCTTGGAGTGGTGGTCATTTGAACTCCTGGTACTTCTTTCTGGACTTC
TTCCAAATCCTAAGCTCGAGGCTTCCGTACTGTCCATCTGGTGAGCTATG
TTTTGATGGCGTACTTCAGATTCTCCTTGCTCTTTTGCTGCTACTAACCG
TTGAATCTCCTGCAGCCTAAACACGAGTTCGTTAGTATTCATGATCCCAT
TCGGTCTTGGCGCAGCCATAAGGTCAGAATATACAACTCAAGCTCATAAA
CCTGTATTCTGCTAGTATTCAGTGTACTGGCAGTGTCGTCATCGTTTATT
TCAACCTTTGTAGCACCCGTGTTTCAAACGAGCTTGGGGCTGGTCGACCG
GATGCTGCCCGTCTGGCTACTCGTGTGACCATGATTCTAGGTGTCATAAC
AGGCACATCAGTCGGGCTTCTTATGGTTTTGTCGCGCAATTTATGGGGGT
ATGCCTACAGCAACGAGGGGGAAGTGGTGGGATACGTTGCTAGAATGATG
CCAATTCTTGCGGTGTCCTTTTTGTTCGACGACCTGCAGTGTGTCCTTTC
AGGTAAATATGGATTTCGCTAGCTAATCTGGCAAGTACTAGAGCCTATTT
TATACACACTTTTCTTCATCCTTGTCTTATTTTATCTTCTGTTAGAACCG
TGTTTACTAGTATTATATCAATGTATGTACGGGAGGATGTTTGTACCCAA
CATTAATATTACTTACCGACCTTGATATTTTTCCAGGTATTGTTAGGGGC
TGTGGCCGGCAAAAGGTAGGTGCTTATGTTAATCTCGGCGCATACTATGT
TGTCGGCATTCCAGCAGCCTTGTGTTTCGCCTTTGTCTACCATCTTGGTG
GAACGGTAATTTCACTAGCCTCAGATAATTAAGAAATTGTGAAGTCCATC
TCTTGTATTCATCCGAGTCGAACGACCTTGTGATAGATATGCATGGGTCT
GAATTTGTAGGGATTGTGGTTTGGAATCATGTGCGGAGTTGCAATGCAGA
TGCTACTGCTCCTGTCCATCACCCTCCGCACCAGCTGGGAGAAAGAAGTA
AGCACATCAAACAAAAACTTTCTGCACGTATGCTGCTTTATCAGTCTCTT
GGCGATATTAATTCAGGGCATATTATCTGTTTTTGCTGCTTCCGTCTGTA
GGCCTTGAAGGCCAAGGCCAGAGTTTCAATTCGTCTGAACTGACGACACG
GAAATATCCTAGACACACAATTTCCATGGGCACAAGGACGCCTCAGGAGG
AAGAAACCCTTGGCATTTAAAACACGAGCAAGCTTTTCTATGGAGAAAAT
GGTCACATGGCATTGCAATGATATAAAGAACCCATGAAGAACGTGTCAGC
AACGGAGAATAATTTTAAGTGTATCTGGGAGACTTCAAGTTTGTACGCAC
TTCTATTGTTTTTTCAGTGCCCTCTGGCCAAATTAGTTTGAAATCTTATT
AGATGTGCCTGTTGTTCCAGGAACATCCTTTGTGTTGTGATGTGTCACCT
GCTTGATCATTGGCTGCACAGCTTCAGAGAGTCCTGATAGGGTAAATGCC
ATTGTTTAGTCAACCTAGATTAAAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.