Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA033205

[Submit comment/correction]

Sequence
AA033205
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA033205
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GGAAGCACCGCCGCCAGCACGAGGGACCCCGCGCCGCCTCGCCTCGCATG
CGGGAAGAGGAAGGTCCGCCGCCGCCGGAACCGCGCGGGCTTTGCCCGGC
GGACCGCTCCAGCGGCGGCGGGGGAAGGGGGTAGGAAGAGGGGGCGCTCG
GAGAGGGGCTGGGGAGTCGCCCGCGTCGCCCGCGGGGGACGACGGGGACG
AACCGTTTTCGTTTCAAGGACACTTGTATAGGAGCAAAAAGCACTAGATC
ACAGACATAACCGCACAATTTGGACAAATTCAGAGATATAGATAGCCTAT
TGGGCAAATGGAGTGCCTCAAGTGGGCAGTGAGAGCAGAGAGTATCAGAC
ATAGTTAAACTCTTAGCCTCTGATCTTGTGAAATAAGCAACAGTATGTCT
GACTAGGAACTCTCGAACAGGATACACGCAAATTCCTCAAATATATATTT
TATAGGAAAGAGATCGAACACAGGCAGGACATACATGTAAACTGTGATCA
ATAACCAATCAAAATAATTACACTAAATCAATTATTCCACTAGAAGATTG
TGGCTATCTTACAGATTACTTTGGTTCGTGCTGGGAAAGTGGGAAGCAAC
CAACTGAACTAAACTGTTCGCAAAGTTCATGGTTATATGTATCAACTAAA
CCACACAGCGCGATTTATCTCCTGAAGATCTTCTCTATTTTCACGAATAT
ATTTCCAAATTCACCCAACCAGGCGGAGCGAGTGACCCTGACCTTGAAGA
GCTCGGGGGAGAGGTTGGACTCGAGGAGCCTGTGCAGCGACTCGTAACCT
CCGATCGACCCCTCCGCCGCCTTCCCCTCCTTCTCTTCGTGCGGTGGCTT
GCCGTTGGAGCTCTCCATCTTGTCTTTGGGGGTTGAGGTGAGAGAAGCGA
GTAGGAGTCTCTCTCTATTTTTTCTAAATCGCACTCCTCCTTGCTCGTCT
TATACAATTCCTCCTCGATGCCCGCATGTGATTTGATTCGGTTGGCGTCT
TGTTTGATTGGAGGTAATCGCATGTGACGTGATCATGTGATCCTCGTCTG
ATTAGCACTGCGGCAAAGCGCTAGAGACAGAAAGAGAAGAGGTTTCATCA
CCTCATCATAATAATACGCAAACGAAGAAGGAAAGCGTATACATGGCTAC
GAAGGCGGGTTCCATCGTATATCATGAAACGGACGGCTCAAAAAGCAAGT
AGCAGATAGGCCGCGATAGCTGTAAACCCCCGCGCACCCGACCTCCGTCC
TCCACGATGGCGGCCGCCGCTGCCGCCTGCCGCCTTCTCCGGCTGGCGCC
GCGCCGTATCCGGAGCCCCAGGCACTCGACGCTTACTGGCCTCTCCCTCC
CTCCGACGCCGCTCGCCGCCTCCTCCGGATGGCGCCGCTACTGCGCCGCC
GCGCAGGCCTCCGCGCCTCCCCCCACAGCTAATGCGGCGACGGGGGAGAC
CGTGGGGGAGTTCCGGCGGAGGATAAGGGTGTCGGAAGTGAAGGGCGGGG
AGGACGAAGGCGCCGCGTGGGTCGGGAAGGAGCTCACCGTGCGCGGGTGG
GTGCGCACCTGCCGCGCCCAGAGGACCGTCACGTTTGTCGAGGTGAGAGG
AGAAACGAGACTCTTGTTGCTGCACTTTCCAATCGCCATGGTCTCGATGC
CATGTAGTTTCCAACTGCCAACGACTGACTAAAGTGGCGAGGCATATAGT
TTGCCAATTTGTTTCTGCGAAAATGTTGACATACGCTTCAGAAAACCTGC
ATTATATGATGGGTTAAACTGACCATGGCACACCTGTGTTTCCTGAAAGA
AAAAAAGGATTATCAGATGAGAATAGATGGACATATATTTCAGAGACTGG
TTCGCAACGGCTTTCTCGAATGAAGATTATACATTTTTGTGAGCCTTGCT
GTGTTGTATAATATTGTGACTTAATGGAAGCTTTGACCAGCTCCATTAAT
GTATTTTGCTAAATCATTCGATCTTCAGTTCTTATAGATATCCAATTTTT
TGAAACATTTGAAGATTTAAAAGCCTTGTACCAGGAATACATGTAGGCAT
GTGTAACTATTATGATGCCAGACTGCATATTCTCTTTTCACCACATACTG
GCTAACTAGCCTGGCTGCCACTTATAGGATTTTTGTTAGGTGCTTTCTAT
GACCAGGCTCGTGTGTTAGTCATGTGAGGGGTGCCCATCTTCATTTTATC
TTTTCACCACATATTAGATAACTAGCCTGACTGCCATTTATAGGGTATAT
TTCCCTAGCAAAAAGAGTATATGCCCCTTCTGGCTCTATAGGTAAATCTC
TGTGGAACTGACTTGGTCAACGTTTTAAAACATTGACTAATATATGTAGA
ATTATATAGATTGGCTAAGTGAAAATAATGTAGTTGGACTTATAAATTAC
TCTCAAAATATTCATTTGCTAGCATTATGATACATAGTCACCGTGTTGAA
TTCGAGACTGATAAGTCAATTCAACTTACTTTTGTCTACAGACGGAGCTT
TTTTTTTCTTCCAGGGTCTAATACATCCTAAGACTGTTCTTTTAGGTTAA
TGATGGCTCTTGCTTGTCCAATATGCAATGTGTGTTAACTCCTGAAACTG
AAGGGTATGACCAGGTATGCACTTGTCTACTACTTACAAGTTGCTGTATC
AAGAAACTACAATCATCTGAAAGCACATAGAGAGTAATGCTGTTTATGCT
ATGTGTCTTCCATCATTTTTGTGATCAGGAAAAACATGTTGCTTAGTCCA
TTGCTTACATTGTGAAAACAGCAGGTCCAACTCTGATGTTTGTTTCATGC
CACCAACAAATCTTAATCAGACTGGTCATACTTTTATCAAATATTCATCT
GGACAAAGACACATCAACTAAAAGGCTAATGAGATACTGTTGTGCCTCCA
GTTCCAAAATATTTGATGTTTTAGCCTTTTTCTGAAACACATGTATCTAG
ACGCCTTTTAGTGTGTTGGTTCACTCATTTGCTCCGAACCTACACACTAC
AAGGCTTCTAGATACATGCGTTTTAGAAAAAGTCTAAAACATCTTATAAT
TTGGAACGGAGGGAGTATATGACTCCATATTGTATAATTGTATTTGAATG
ACGTAAAGTACTGATTTTACCCATAATTGCGGATGTTATGATCTGTTTAT
TTTATTTATGCTGCTTATATTATACATTGCATTAGTTGCAGTTAATAGCT
AAACGATTGTAATAAATTTTACTGGTCGATATTTGCAACAATGAATGTCA
GATAGACTCTATCACTACCGGCGCATCAGTGTTAGTGGAGGGAGTTGTAG
CAAGCAGCCAAGGTGGTAAGCAGAAAGTGGAGCTAAAGGTTTCAAAGATC
ATTTTGGTAATTCATTCTGCCTATATTTTCCCTTTACTTTTCCCTTTTTG
TGCACATGGTTCCTAAACCTTGTCTAAATTTTGTATTTCTGTATAAATGT
CAATACTTCCTATTATGCACGTTGGGTACATCAGGAAATACTTGCTCAGT
AGTAAGATAAGATCTCTCTTTTGAATGCTAACATTGCTAAAAAGGATTGG
TGCAGCTTAGTTGTTACGTGCACGAATATACGATTTGGTAATGTTCTAAT
AAATATGGAATATTATTTTTAAATAGAAAGGATAGTTATTTGGGGGCATA
AACATTGCATTAGCACTCTTGAGGTGTACTAGTGCACTAGGCCATAAACC
ATGTCTAAAAGCTGTAAAAAACTGAAATTAATTTATGACATTGATATAAT
GCACATCTAACACATCATAAAATCTCATATCCAAATTTGATCCACTGCTA
CTTGAACAAAGAAGAAGAATCAGGCTATGAATAGTATCAAGCTCAAGTAT
AGACTGAAAAATATCCTCCTGGCACTATTCATATGTAGTTTTGTCTTTTT
TGTTTCTTGGGTTACATGTCGAATTTGGATCTGAAAATTTGTGACGTTGT
ATATGCATGTTAGTATAAACGTGGTTGATTTTTAAAAAAGGTTTTGAGTG
TTAAACTAAGAACCTAGTTCGCTAGTACACCTCAAGGTGGTAATGCACCT
CAAGGTATAAAGGTGGTTGATTTTTTTAAAGGTTTTGAGTGTTAAACTAG
GAACCTAGTGCGCTAGTACGCCTCAAGGTGGTAATGCACCCAATATGCCT
ATGACAGAGATAAAATTAGATATATAGATCAAATCCATATCCTGGATTCT
TAGGGGTCAAGTACGTCCTCCTATACAAGGGACATCATCTGTGCGAACTT
TCAACAAGCAATAAGATAATACTTATCAATTTATCATCTCCCTCCATCCT
CCCTAACCAATGTTCTACTCCTTCCGTTCCAAATTAATTGACGTGGCTTT
GTCTAGATACACATGTATCTAGATGCGTTTTAGTGTTTTGGTTAGCTCAT
TTTGGGAAAAAAATTGCATCAACTAATTTGGAACGAAGAGAGTACTACCC
AATCCCCTACATTTTGCTAGCTGGCCATCTTCAATGGTAGATTGGTAACT
ACCCAGTTTGTTGCACAAGTTAAATCTCCTACTATTAGTAATGTTTTTGA
TGAATTCTATGCTCTGATAGGCTAATAGGCACGGTATATACCCTTTACCC
CTTTTGCTATCTTTAGACAAGAAACTCTGATACACTGGTAATGTTGATGG
TGCATCTGTTTTTTCCTTTTTTTGTCAAGTTGCAGACAAAAATCACACAT
AAACATAATTCTAGTGCATTTTTTGGTCCTAATTTAGTTTTTTACCTTCT
CTCCTTGCAGATTGGGGAAAGTGACCCCACATCTTTTCCCATACAGAAGA
AGCGAGTATCAAGAGAATTTCTGAGAACTGTGGCACATCTCCGTCCTCGG
ACAAACACTTTTGGTGCAGTATGGTCTTGTTGCTAGCTTTTCCTTTTTCT
GTTTATTTCTTCTCAAGGAATTACCAGTTTGATAATGTTTGGAGTTCATT
TAGAGATGCATAAGCCATGCGTCTTGGAAATTATTCATGCCCTTTTGGTC
CATTACTTGACCTGCGACTTGTTTGCTATTTCTGTTATATCGGCGTATAA
GTTAGCACACATGACTGGTATGGTTTGCTATGCAAAGATTTCAGAATAGG
TGACCATATGGTGCTAGTGAGCTGTTTTACCAATTTGTAGGACTTCAAAA
CTTTTGTAAGACTGCAACAGACAGACTACGGACCCATGTAGACATGGACA
TGCCAAAGCAATGTGTATGATCGCTTGTCAGCCGCAAATCTGACAATCTT
TGCTGCAGATGTCGCATCACTTTCTAGTCATAAATATATTATATGCACAT
GTTGATAGTTTTATCTGTTAAAACAAAATGGATTCTGGTCTGGAGCATGT
CTTTATTACCATTCGGTTATGGATATAAGAAGCTGGCTAGTGTTCTATGC
TTATTCTCTATTATACTTTCTAGCAAGGATTGCTTACTGACCAGTATGGT
GCTCATTTAGGTTGCAAGAGTGAGAAATGCTCTGGCGTACGCAACTCATA
AGTTTTTCCAAGACAGTGGATTTGTTTGGGTATCAAGCCCTATCATTACT
GCCTCTGATTGTGAAGGAGCGGGGGAGCAGTTCTATGTTACTACTTTGGT
TAGTATCTCTTCAGTAAGCTTGTACAGATAGACTAGGTATGGTTTAAAGC
GTACCTGCTGTGTGGGATGTTCAGCTCATCATGTGTTTACTTTTGCTGAT
TTGTTGTGTTCATATTGTAATAGTAATATTTACACAAAATTGAATAAGCT
TCTTTTGTGTTAAGCGCAAAATTTTGTCTGGGCTTTATGCTACAATCAGT
AACTATTAGGTCTGTCAGTTGCCTTATCCTCATGTTCGGAAGGTATATGT
TTGTAGTTTTCGTACCTTCGTAGCTGATTAGAAGACTTCACATTGTGTTG
AATAATAAGTATATGGAAGAAGATGACATTTGCTACTGGGACGAGGGCCC
AAATAATAACATGAGTTGGTCCATACGGAATTGTCCCCATGCTCTGCGTT
TGGGTTTTCTGAACATTCCATATTGCTTAGTACAAAGGTTGTGAGGAATG
GACTTACTCCTTATGTAACTAGGATAAGACTAGGACAAGCTGAGTACAAC
TGAGGGACACCCTGACCAATATGGAAGACTTTGCAGACACTTCTTAGGAC
TATGACTAGGACTCTACAGCATATTCACCATTGCTTCTGGTGCTAATGTT
TGTGGTGGCCAACGCTGGTAGTTCTTTTCTTTCCACAAAAACCGTTCACA
GTAGAAGTGTAAGATAAACACTGAATGAGTGCACTACTAATTCAGTGTGC
ATTTGTCATTTGGTCAATTTTGAATAAAACTATGTTCTACAAATCAGTTA
TGCGGGGGTTGAATACGCTCTATACTTTGGCATTTACCACTGTTTTTCTC
TCATATATTTGTGTTTAAGTTGCTCAATTTGTTTCCGTTTGTGTTCCAGC
TTTCAAACAGTTCTGAAGGTGGCTGCCTAGTCAATAGCATTCCTTCGAAG
GATGGAAGGGTTGATTGGTCACAGGTAAACTTTAGCAGTGAATCTCCGAT
GCATAAATCTTTGATATTTTCTCAAATGTCAAATGCTCTTTAGTCCCTGT
AAGCAATTTTTATCTATATCATTCTGGTGATATATGCTATTGAGCATGCT
GTTTGTCTTCACAGAACTGTTGTTCAAGCATTCTTAACGCTTCCATTATT
TTTTCATTTTCATAACATTGGTTATTTGCATGTAATTATGCCAGGATTTC
TTCTGCAAACCAGCATTTCTGACGGTGTCTGGACAACTCAATGGTGAAAC
ATACGCTTCAGCTCTATCTGATGTAACTTCTATTTCCTGATTCATTGGAA
ACAGTTAGCCTTGTAGTTTTTGCCAGTTGTAATCAATCTTCTCATTCTGT
TCCGTTCGTGGCTTTCTACAGATTTATACATTTGGCCCCACATTTAGAGC
TGAAAATTCAAACACTTCAAGGCATTTGGCTGAATTTTGGGTATCAAAAC
ATTCTTTTACATTTTCTTTTGAGAATCTGAACTTTGTGAACACTGATTAA
CCGCTCCTTTTGTGTCTTATGTTCTGGGGGAAGATGATTGAGCCTGAGCT
TGCCTTTGCTGATCTAAATGATGACATGGCTTGTGCAAGTGCATATCTCC
AGTATGTAGTAGGTGCCCTTGTCTATCAAATGTTGCTTGATACTAATTCT
GTTAGTAGTTATTTCTTTGTGCAGTACGGTGATATGGATCCTCTATGTTT
ATTCTCAAGTAGATGTCTACACATAACACTATTTACCTAATTACTGTCCT
TTTTCATGCAGGTAAAGTATATTCTTGAGAACTGCAAAGAAGATATGGAT
TTTTTCAATACATGGATTGAGAAGGGGATCATAGAAAGACTAAATGTATA
CCTCTTATTTGTAGCTTCCTTCTATTGCATATACAGCAGTGGTGTATATC
TTTGTTTGACTCAATGGGACATATTTTACTAATCCTGAAATATTGTTTTT
TTTTCTTGCTTGCAGAGTGTAGTTGAGAAAAGCTTTGTTCAGATGTCATA
TTCTGATGCTATCAAGCTACTTATTGGGTCCAACAAGAAATTTGAGTTCC
CGGTAATTCATGACTTTTATGGACACTGTTTTTATTGTTACCCATAGTGC
AGTTTTGTAATTTAAATTTCATTACTAGTCTATGGAAGTAAATACTTCTG
CATAATGAAAAATTAGCTGCATACTTTGCTTGTTTATTGCCAATACATGG
GACTGTGGTTGGCTTATGCTGTAATTCTGGCTTCTGTTGGATGTAGTCTG
CATCTTAATGTTGACTGAACAAATTTTGGTTGCTTGTTAGTTGTTACAGA
TTTGTCTATGTTCTTTCTACTTGTACAGATTTAAGCTCCACATACTGCAG
TCTATAGTAGTATTATCTAGGCTTTAACCGTCCTTTCTTTCAAAGGGTGT
AAGGCAGAAATCTAGTGATTATTAAAATATAACAATGAAAGTTCTTTCTG
ATTCTTTTGTCTGAAATACTTTCCACAGGTAAAGTGGGGGTTGGATCTGC
AAAGTGAGCATGAAAGATATATCACAGAAGTCGCTTTTGGCGGGCGTCCT
GTAATCATTAGAGATTATCCAAAGGTTTGAATTGAACACCTGTATTTAAG
TTGTTCATCAAGAAAGTAATCATGTCTTAAATTAACTATCATTATCTTTA
GGACATTAAAGCATTCTATATGCGACAAAATGATGATGGGAAAACAGTTG
CTGCAATGGACCTATTGGTTCCCCGGGTAAGCACATAGTCAAGACCTCAA
ACATCTCATTGTATTAAGCTTAGTGTACAAACGAATCAAGTGGAAGAGAA
GGATTTTATAAATTTGAACAAATAGCTTTGTCATCATATTTATGCTTTTG
TTCATTTTCAGGTAGGTGAACTCATTGGAGGAAGCCAGAGGGAAGAACGT
CTTGATTACCTTGAAGCACGTCTGGATGAAGGAAATCTAAACAAAGATAG
CTACTGGTGGTATTTAGATCTGCGGCGATATGGATCAGGTTAAGTACTGT
AGCCATGGAAAGCTGATAACTTGATATATTATCTTGCTTTTTTGTTCCAG
ATCATTCGAAATTTCTTAGGTAGCTATATCTTACTGTATTGTGCATTTTG
TTTCTTGTCGTGGGACCTAACAAACTTCTACCTTTTATGTTACAGTTCCT
CATGCCGGTTTTGGTCTTGGATTTGAACGACTTGTACAGTTTGCAACCGG
AATAGACAACATTAGAGATGCCATTCCATTTCCCAGGGTTCCTGGTTCTG
CGGAGTTTTAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.