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GrainGenes Sequence Report: AA031892

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Sequence
AA031892
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA031892
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GTCATCCACTGGATCCCCCCGCGCGCTCCCGTGGCCGCACACCCGCCCCG
AAAAATCTCTTTCCCGTACGACGCCGTCGCCTTCGCCACCAGCACCACCA
CACACCGGTGGAGAACAAAACGCGTCCCCACGATGCCCCGCGGACGCCAC
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GGCGCAAGTCCGGCCGCTCCTCCCTCATGGGGTCAGTCGACGATCAGAGA
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ACGGTGGAGCGCACCAACAGCTGGGAGCGCGCGGAGAGGGAGAAAGACAT
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GTCATACAGTTTCCTGATCAAACTGTTCCACCGTATTGTTTATTTTTTTT
CCAGATCTTCGCGTCTGACAGCTTCCTGGAGCTGACGGAGTACACGCGAG
AAGAGATCCTGGGGAGGAACTGCAGGTGAGAAAAAAAAATGTCTGCAGAT
AGTTCGTTATGCGAATAAGCCCTGCTTCAAGATTTTTGTTCCGCAGCTGC
GCATTTCATTGGCTGTCGGATTAAGGGTTTAGAGTTTATGTAGAAATAGA
GGGTGTTTTTGGTTTTAGCTCAAGCTCACCCCACCAAACTCTCACTACCT
ATAGATTTGGTCAAGGTTTTGGTTGCTCAAGATTTGACCATTGTTAGCAA
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GTCGTGGCGCGTCGACCAGGAACTTCCCTGTGCTCTCAAGGTCTAGGATC
AGTGCCTGAACCCCGACCGCATTGGGGAAGAGCAACAAATTTGCTCCCGT
CGATCCTTTTGCCCTATCCCGCATCGACGTTGTTGCCAACTAAGACAACA
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CGATCCTAAATAAGTGTCGTCATTTTGAACTAGAGTTAGTTCAAAACCGT
GACACTTATTTAGGATCGGAGGGAGTACTAAAAATACTCTTGTAATAACA
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AGTATGAAATGCAAAAGATAGTACTAAATCACTTCTTTGGTTCATTCGAG
CCTCTCATAACCTCATCAATAGTAGAAGAAGAACCAATACCTTCAAATAG
CAAGCATATTTCATAAGAAAGGCATTAACATGAGATGAAATAGTCAATCG
TTGATAAACTTACCAAAACAATGAGGTAAAACTCCTCTACGTGGCTTATA
TGATTGAAAACTATGTACAATAGCATCATCATTGATAGAGTGAAATACAT
CTCGTTTAATATAGAACACCATGATATAACTCATCCAATCATCACCCATT
TTATCCTCAACTCGGTCTTGATAATGTTCATAGCTAAGAAAGCTCTCTCC
AATGTTGTTGCAACCGGTAAAATTGATGCCAACTCAATGAGGCGATATAC
CAAATGAAAAACCATGTGTCTATCAGTCTGAACTATCTTCATAGAAAGAT
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ATGAATGTATCAAGTTGATTTCTAAGGACAAATAAAATCTCATATATGGA
AAGTCCTCAACATACATCTCAGCGAGTTAACACGTTTTTCTTCATCAAAA
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AATAGATTTTTCAGCAAATTGGGTATTCAACTCAACAAGAACTTGGTTAT
GCACAACATTAAATATTTCATATCTAAAGCGGCGACAATAAGTTACTATT
GTACATCCATGACCCCTTGAGCGACCTCGAGCAGGTATTGTATCATCCAT
GGTTGTCACCGCAATGTTATATTTGATACAAAAGTCAGTTGTTTCTTTTG
TGAGTTCATCCCAACCATCATCTCTGATACCTTGAAGCTTGTCCAATATT
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CTAGAGGACACCGTTATTTTCCGGCGTTTGCTAAAACACACTATTGGAAT
GAGGCTTTGCCCAGTACCATTATTATTTCGTGACAATTTGCTAGAACACA
CTGTACTGCCCAAAACGGAAAGTTTGATGTTTTAGATTATCTTTTTACCT
TGTTGCAAATATTTCTAGAATTTTAATTGAAATACAAGATGTTTCAGATA
GAAAAAACTATCCAGCTTTTTCCCAATTCCCTCGTTGATTTTTTTCTTAA
CCACGATGCTGCATGCTGCAATGGATGGCGACTTGGCCTGGATGTTCCAA
CTTGATGTAAACTTACGTATAGTTTCTAATTCATGTTCGGTATATGCATA
TGCTGGATTTGGTGAATTTGAATTAGAGAAAAAAGTGTTCAAACCGGACA
TATGATGGTCATCCCAATAAAATTAGTCAAACTTTCCATTTGCGGCATGC
AGTGTGTCCTGGGAAATGTGTCACGAAATTATAATGATACTCAGCAAAGA
CACATTCCAGCGATGTGTTTTGGCAAACGCCAAAAAATAACGGTGTCCTC
TAGCAAATTTTTCCATAGTTTAATCATAAAATGCAATAAGAGAACAAATT
CAGAGCTCTCCATCTAAAAAATCAAGCAACCTGATGTGGTTCTTTGTGTA
AGAATTTCTCCATCATCATGAACATTCTCCAATACATGAAGAACAAATTT
CCACATCATAATAAATCAACACAAAGTTTTATGGGGTGTGCCTCACCATG
TGTTCCTAGGTTTTACAAGGTTGATTGCTTGGTTTTTTTCTCTTCCTGAG
AAAAATTCCCCATACTTCAGTTGGCTAATCATAGTGTCATGTTGATGTTG
CGCTACTTCATCATATCTTTTACAAGAAGTATTAATAGTGTTGACAATCA
AAATAATATTGTTAAAGAAATCCAATATGAAGGAACAACACTTAGAAACA
GCAACAACCACTAACTGCAACTAATGGGCAAAACAATGATTGTAAAATGC
ATATGAATTTTTATCTAATATTAATGTACAAAATCCCACAAGCCTCAAAT
GACCGAAGAAACGTCACCGGGATGGAGACGAAGCCCCGAGAACAAAAGAA
ATAGACGGAATTGACACCCCGTCTCGCCAAACTTCTCATATTTGCAGGGA
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AAACATTGAAGTTGTTCCTCTGGACAGCATTTTTTTTTTTTGAGATTAGG
ACAGCAGTGCTTTTGGATGGCCATCGTGGGCTATGGGCCGGCCACGACAT
GAGAACCCTGACTGATCTGCGGAGCTCTTCTCAAGAGCACAAATAACCGT
CCCGCTAAAAGAACAAAAAAAAATCTAAACAGAAAAAGGAAAAAATGCAA
AACTGCCCGGCTCGGCAAGCAGCGCCACCGCCCCATGCCGGAGATCGCCG
CTACGGCGACAGGTGGGAGCTCTCCATACTGTGGGCCTGGTACCCCACCA
TGGCGAATCGCCGCTCCTGTTGCGGCGGCCGCCGCAGAGTTCTCACAAAA
CCCCAACCGCTCGTCCCCAATCTTCTATGTGCGATCGGCGTTGTAGCCGC
CGCTTCTCCTTGGCCATGGGTGAACGTGCGTGTGTGTGACTCTGTTCCAT
AGCATTTGCCAATGCTAGTCCTTTTTCTTCAGTTTTGTCCATTTAGTCTG
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CGGAGACTGACCAGACCACCGTTGACAAGATCAGGGAGGCTATCAGGGAG
CAGAAGGAGGTCACTGTCCAGCTAATTAACTACACAAAGAGCGGTAATTT
TGCGTCATTTGGTGACAGATTCCTTTGGATCGGTGTTATCACTGCACGAT
CCGCATTCTAATTCTGCTCTTTCTAGGCAATTGGTCTTTAAGATTTATAG
TTGGACTGATTGTATCTGCTTTTGCTTGTGATGGATCAGGGAAGAAGTTC
TGGAACTTGTTCCACCTGCAACCTATGTGGGATCAGAAGGTACTCGAATG
TTACTGCAATGTAGAATTTGTTCTGGAGCTTACAAATTTGCAGGGATTTA
GTCGACATGGTGTGATAATGATTGTGCGTTTGTGGTACTATGGATGTAGG
GGGAGCTTCAATACTTTATCGGCGTGCAACTTGATGGAAGTGATCATGTC
GAACCCCTCAGGAACCGTCTCTCAGAGACCACTGAGTTACAGAGTGCAAA
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CTAGAGATGTAGTCAGTTCGGGACTTCGTTGCTTAAGGTCCATTGCTTTA
TTTTTGGGGTGTTCTTTGTTCGATATTCCATAAATGTATGGCTTATTGTC
TTTGCAAGCAGTGTGGACTGTAGTGCTAGTTCTGTAGTCCACAGTCTATA
TAAGTTCTCAAATGGGCTGGAAACTTTGAAACATCATTACAATACGGGGC
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GCTGACTATTTTTAGTATGAGATCTAACCAGGTCAAAGCTACAGCAGGCA
ATGTAGATGAAGCAGTCAGGGAGCTTCCTGATGCCAACTTGGTAAGGTAC
ATCTACTTTTTGATGTTTTGCTGTTGCTAAAGGCATCTTAACTAATTTTG
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ACCGAAATAAATTTCTTAGTTTTTTATAAGTGAATAATACAAATAAAAAT
ATGCAACACAAGCAATACCATCTTAAAATTCAATGAAATGATGGAATGCA
CATTGGATTGATTAGATGGGTTGCTCCTTGCAGTACACAAAAGAATAGAA
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CAAAACCGCACAAACGGGATAACTCTTCTTGGAAAGCTATAGAAAAGGTG
CGTTCTATCTGCTATTTTACAAGCAATACTTTGTATGGCTCCAGTAGTAA
TAGCGGAGTCAAATTTTCCCAACCTACATGATACCAGAATACACTGTATA
TCAAATTGTCCCAGCCTAGGTCCAGCCAAACGTTTCTGTATAGATAGTAT
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TGGCAGGTACAACTTCTCAGCAGTCTTCTATACTGTATGGTTTCTTAAAT
TTTAACATTTCTTCTAATAGTCTAAAATATTACAAGTTGACTGCATCATC
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ATAGCTTTTAGCAAACAGGGGCCAAGTTGTTTTTTGTCTCTTGCTTAAAA
GCAAGAGCTTAGGTCTAATGATAATTTCTATATTGATGAAGGAAGTTGGT
ATGATCTTCTAAGTACATCAGAATTTTCATAATTCCACCCTTATGAAAAG
CACGCTGTTGACTTGTTACGGTAGTACAGCACTGCAAAGCTTCAAGAACA
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CCTGGCGACGTCATGCTTAGTTCATGTATGTGGTAGCCATCATTTATGGT
TTCTCACTTCAGTGTATTAGGCAATCTCCCAATATGCAGCTCTGTATTTC
TTACTAAACTTAAGTACCATGTTTACGTCTGGTTCTATTTCTCGTAGCAA
TTGTATAGCACTTTAACCGCACCATTCTTTTTTGTTTTCAGTGTACATTT
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AAGACCTTTCCTGCCATCTTGGTGGTTCCTTGACCCTTGTAATAAAATGA
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ATTGAAGCCCCATAAATAGTTGCTTAATGTTAGCCTCCATGGTTTCTAAT
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GGAGGAGAATTATTTGCGGCGCTTGATAAGCAACCCCTGAAAATTTTCAG
AGAAGAATCTGCAAGGTGGCTTCTCAAATCTTAACATCTGGGTTACTCCT
CAGTACATGCACATTACTACTTTGAAATGGTTATTATCTTCCAAATTTGT
CCGCTATTTGATTATCGGCTTATCAGCTTTGTACTTTCTAATATGGAAAT
AGCTTCCTCCAACGAAAAATATCACTGGATCCTACACTTAATACCGTGAT
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TAATAGTCTTGACTAGTCAAATGACTCGAAGTTGATGAACAAAACAATTT
AACACCTATTGCATCCTATTTACTCGTGTTTAGTTTTACTTTTGACCTTG
ATTATCTTGCTTGCTTGAGTAACCTTGCGATATAGGTTAACTTGCAGAGT
TACATTTTAGAGAACCTCTATATCTGCACTCAAATGAATTTTACGATCAG
GAAATTCCTGTTCCTGATCAATTACTAATTGCTTTTCTTGTTCTAGAAAC
TAGCTGTGTTCATGTGTGATATTTTTGTACTAGTTCCTTATATTTCTAGT
CTTGCAATATTTGAATCTTTTGCTAGCTGACATAAGCTTATCTACACAGC
GACACCTAAGATAATATGTGTATGCATGTTTTGGAAATTTTAGTCACTGG
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TCATCAAATACTTGTAGTTTATAGTACTCCTACCAGTGGTGGAATGTCAG
CCAAAAACTAAGACAGGCCGTAGTTTAACAGTGGGCGAAAGCAATCACAT
GGATCTAAAATCAAGCAGGAATTCTTCTGTTGCACTTCTCAAAGACCGGG
CCAGGGCCCTGTATGGTCCCGCTGACGGTCCACCAGTGCTCCTACATAGC
TTTGCTTTGTGTTAAGGAAACATCTATCTCCTCACAACCACAAGACTGTC
CACTTCTTTTGTTCTTCTATTTTTCAGTATAAGTAATTTTTGAGATTTTA
CAATGGCAAGTTAAAGTTAAGAATATGAGTATATTATTATACTTACTATT
TTCTTTTCTGTAACTCTGTTTTGATTTACGTTTTTTGTAGGTTTTATGCT
GCAGAGGTTGTGATTGGTCTCGAGTATCTTCATTGCCTCGGTATAGATGT
GGCCTCTTAAACTTAATAATTATAATTATTGACCAAGTTTCTTAGTAAAG
GCTGTGCACTAGTAGTGTTTCACCTCTACGTATGTGGTGCTCTACTTGTA
TATTTCTTTAACCGATTTGGTATTTCTGTCTGATATATGAGGTTTTTAAT
TTGCATATGTCTGATGCAGGTATTATATACCGTGATTTGAAACCAGAAAA
TATTTTGCTCCAAGAAGATGGGCACGTTGTGCTGACTGATTTTGATCTCT
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GGGCTGTTAAATCTTGAGTAGAAAATTTGATTGATCCCTTATCAGCTAGT
GATAATTACCATTTGTATTAATAGAACATGTAATGTTGATTTGATAAGAA
TAAACCAAAAGAATTCTCAAGTAGCCGTCTTAAAATTCCTGGTATTCAAG
GTGAAGATAATAGATTGCCTAATTGTGAAGAACATGAGTAATTTTTAGCC
TAGATTAAAAGCTGGAGTGGACCGCCAGCACACATAGCAGTCAGCCAGTG
CTTGTGTTGCATGGCCCTGGTTTGGCATCTCCAGAGCAAGCCCGCTATGG
AGCTTGGACTGCATAGTTGGCAAATCTGCCTGGCTCAATAAAAAAGCTAG
AAAATTTATAACTTTCATGAACTAACTCTTCTGTATTTACTGTAATAATA
ATGCCACATGAATACATTATCAGTATTTAAAAAAAGGGCAGCTGAATCGC
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TTGGTTGCCTTCAGTTACATATCTTTGTTTTTCATAAGAAATTTCTGTGA
ATAAATACTAGGCCAGAACACTTATGATGCTTATCTCCCTGCAGGTTATA
AAGCATTCCACGTCATTAAAACGAAGGAGATCCAAAGAATTTCTCCGCCC
TTCAGTTGTCTCAGATCCTTCCACTCCATCAAATTCGTTTGTTGGAACTG
AAGAGTACATTGCTCCTGTACGATACCTTGCTTAGTCATTGCATCATCAG
CTTGTTGGCTTTATTATACATATTCTCACTGTTGGATAACTGTTAACGAC
ATAAATTTAATGTAACCTGCATCATCACAATACGTTAGTATACTGTTGTC
TCCATTACAAAATTGATTTATTTTTGCATAAGCTTCTAGTTACAAAAGTT
AGATGATCTTGAACTTATATAGATCTCCAAATATACCCATATGGTTTTCT
TTTGAATAACTTTAAATATTATTACATGGGCAAAAATATTAATCTTAGCT
TGAACTTACGCTAAAACTTCATCTATTTCATGAGTACTTTATAACAGAAA
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CTCAGATCCTTCCACTCCATCAAATTCTTCTAACGGCTTGATGCCGTTGC
TATTTCCGAATAATTAACATGATTTCCTTGCCATATGTGTTGGTTATTTT
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CTTGGTAAGGCAATAACACTCTAATAATTATTATTTATTATATAAATTAC
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ATTGTCTGAGGGTCAGCTAAATCTTGTGAAAAAATAGTGACAATAACCCA
TGCACCATTCAGATAAGACCTGAAACATGGTTCCCAAGCAGAGTGCCATC
TATATTGCTGGTTTGACTAACAAATTAGTGGTTGTTGACTCTTCAATACT
ACATTGTTGTTTATACCAATTTTCTAGTGGATAAACATCTGGTAGATATG
ATCATACATCTGCAACATGTTTTGATATTTATATCTACTGTGATTTGCCC
CTATATGTAATAATGTAATATATCGATAATTAGAAAATTTGTTAGAAAAA
CATGCATTATTAAGTATCCCCAACCATGAGAGCTCGTGTGATGTGAACTA
TTCTGATGGTAGGTGATGTTCATAGTTAGTACTGAGAGGTCAGCTAACAT
CCTCTACATGCTATAGGAATTCTGTTGTATGAGATGTTGTATGGGCGTAC
ACCTTTCCGAGGAAAGAACAGGAAGAAGACATTTTATAACATCCTGCACA
AAGATCTTACGTTTCCCAGTAGCATCCCGGTAAGAATTTATCTTTTTGCA
ATCATTCTTGCTCAGTTTTCTTTGTTTTAAACTGTGAAGCTTGAATGTAA
TTACAAAATTTAGAGTAAGATACAGTGTTACACAACTGTGTTTACAGCGG
CATGAATAACAAGCCATCATATCTGTCTTAGACTGCTTCAGTATATAGTA
CATTTTGTTTGTTTGTGTCAATTTGTTAACAGAGATACACTCTTCAGGTT
AGCCTGGAGGCGAAGCAATTAATCCACGGACTACTTCAGAGAGATCCTTC
TGCTCGCATAGGTTCAAATACTGGTGCAAATGATATCAAGGAGCATCCAT
TCTTTGAAGATATCTATTGGCCACTTATACGTTGCATGGTGATCTAAATT
TTGACCTGCAGAAAATATTTAAAGAATGATAGTTTACTGTGTTCCTAACA
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TGAAACCAATTGGCAAGGAAACTCTACCCCAAGCAAAGCCTGAGGAAGGT
GTTCTTGATACATTTTAAGGTGAATATAGCCCCGGGTGATTCTACAACTT
GTTCTCCATGTCAAATAATATTTCTCATTTTTTATTACAAACTTGCCAAA
TAGCTAGCATATCCACAAACTTTGTTGAAACCTGTAAGTATGTAGTTGCA
AGAAGATGAATAATTGAAATCTGTAATGATTAGAGGATAGTCAAACACTA
AATATGTATATATAACAAGATTATGAACAAGTAAATGAGTATGATCATGT
CACATGCTTGGACGCTTGGTCTGTGTATTGTTTTTTTGGTTTTTGCATAA
TCCAAGCAGGCCACTGTACCGGAAAATACCACTAACAATGGCATAGTTTT
TTATTTATTTTGCAGGACAGATTGAACAACATCAACGTGGTAGGAATGGT
TGTTCTTAACCATGTACTTAAGAGGCTTGCCTGTCCTGCATGATACAAGG
AAGTATGCCAGTATGGTCTTCAGTGTTTTTCACTTGGAAGATGCCTCGAG
ATCTTGTACATGAGCTATTCTTTTCGGTAGATTAGGAGCTTAATGTATCA
CGTAAATAGGATATTCTTGTAAAGTTTTACTCTTCCTGGAGATGGTTCGA
CAAGATGATGTACACGACATGGATAATTTACCTTCAGAAGTTTTCGAAGA
ATGTATTTTACGAACCATAAGATGATCAGATGCCTAGTTACTGTTTGTAT
CTTGTCATTATTTACTCTTGCTTAGCACGTTTCAAAAAT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.