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GrainGenes Sequence Report: AA024591

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Sequence
AA024591
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA024591
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GAACCCCTTGTCTTTCCCCACTCCGATCCACCCCTACAACCGCCGATCTC
TCCGGCGTCCAAGCTCCTCCCAAACCTCGGCGCGAAATGGCGACCACCGC
CGGCGCCGCGCCGACGGCAATGGACGAGAAAGCCCGGCGCACCCGCGATC
TCCTGGCCAGCTTCTACAACACCGACCCCGCGGCCGCCGGTGCTGTTCCC
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ATCCATCAACTCGGCCTCCTTCAACCCTGATGTCTACATGGACGTCCTGG
TTCGCCCACCTGCTCCCTGCTCCCTTTATACGCGGTCTCTCAGATCCAGC
TCCCCGTGTCTTGGTCGGATCTTATGGCTGGGCGTGCTTTGGAATTACTA
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TTCCTTCTTTTAGCGAGTTTGAGGTTCTAGTGCTATTACCTGCTATAGTT
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TGTTGGTATGGAGACAAACATGGAACAACTACTTGGAAAGGTTTGCATTA
TGATGTTACTAATGTATTCTTTCGGACACTGTTGAACCAATTCGCCTTTT
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TTTTCAACAAAAGGGAAAACATAGAGAAATTACACCGTACACGCAATCTC
CTCCGGAAAGTTCAAGTAAATCCTGTTCTATTTGTGCTATTCTTCTTAAA
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AAGTTAGGCTATGCAGATCCCAGCAATTGCAGTTTAGTTAAAGCTAAAGT
GGTATTCTATTGCTTCCTATAGATACCTTAACCCTGCCCATGTTATGTGG
TCTTGTTAACCTACGTATGTTGTGGATTTTGTCCTATGTTTAGAATTGAA
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TCTTCTGCATGAAGCAAGTACAACAGAGAACATGAGTTTTGTGCTGTTGT
GCATCTTGTAGTTTATTTCATTTGGGAGTTGGCCTTAGGGTAGCTGGACC
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TTCCATTATTTCATCCCAAATGGACCTTTCACATAATTCCCGGAATCATG
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ATGGGTTTAGTTATACAACACCTTCAGGTAATATATTATGGCTCAGATTT
GTAAGGAAGAGCTAATGTTAATTTTTTCAACTATAATTTACGATTTCAGT
CTTTTCCCTTGCTACAAGGCATATAGTCTAATTCCTATTCTTTATATGTT
AAATAATTGTGTTATCCTAATTTTTTCATGATGTTCACTACTGTTATTCT
TTACTATTTCGAGTAAATTTGCAGGCAAAGTTGTACTCAGATTCTGAACC
TATTGAAGCAAGAGCAGAAGCTGTGGTGCTTCTTAAACAACTTAATTTTC
CTGTATGTATTTTGTCTATCCTTCCATTATTTGCATGCCAGTTTTGGTTC
CATGTAGCTCTCACTTTGCCCTTCTTACGCACGAAAGTTTATAATTTTGC
TCCTCCTTCCACCTATCCTCACTTGCCCACACTCCTGATTTGTAGGATGA
GTACTGTATGGTCAGAAAAGCATATGTAGATTGCATTGAATACAAACATG
TGGTCACTTTTTTGTTCACACTTGACACACAATTTGTTCCTACTAGTATG
CTGTAATGATCACTATGGGACCTTCAGGCATGAGCTTCTCTAACATATGC
AATATAACTGCAAAACAAGCAAAATCCTTGAACACGCGCAAGGTATTTAA
AGATGTGGGACACATAGATGATAACTGGTTCGTGGCCATAATGTCTAGTG
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TCTCAATTTTCTGAACCTTCCGTTCTTGTATCTAGGCAGAGGATGCGATT
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CTTGTCATGTTAACAGTTACCATCTTCTCTATTCATAAATCTTCCAAGAT
TGCACATTCAATCACTCAAACAATGTTGTGTAAACACCTCAAATCACTGT
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GTATGCAAATAATAACTGTGACCCGTTACAATATTATTAGAGCATCTCTA
GCAGATACCGCATCCGGTCCCGTACCGCAAAATAACCGCCAGTTTGCGGT
ACGAGACGGAAAAAGTGGCTTTTCTAGATACCGCATATCGTACCGTATCC
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TCGGTTTTAGGAGACGAATATGTGGTATACCGCAAACGAAAAACGGTTTA
ACAGGAGGGAATATTCAGCTACAGTCGTTCCGCACGCAGCGGCCGGTCAC
CGACGATGCCGCGGCTGCCGCCAGTCGTGCCGCACGCGCACCTCGCCATC
GTTCCGCACGCAGCAGCAGGCAGCGCGCGGCAAGCACGTACAAGCAGCTA
GCAGTGCACGCAGCGCGCGGCAAGCACACGCAAGCAGTTAGCAGCGCACA
AGCAGCGCCAAGCAGCACACAGCAGCTAGCAGCACAAGCACGCACGCGGC
ATGCGCAGGCACGCAGCACAGCGGCAAGCACGCACAAGCAGGGCCAAGCA
GCACGCGGCGCACGCAGCGCCTTTTTCCCCGCGCGACCCCGGCCGCCCTC
ACCGAGGAAGATGACCCCGCGAAGAAGACGATCGGATATTCACGGAATAT
TCCGTTTTGCAGTATGTATATGCGGTATCTGTTCCGCGCCGCCATTTTTC
GGTAAAAAAAATCGTTTTGCGGTATACCACATCCAGGTTTTGCAGTATCG
CGGGATACGGTATCTGCTAGAGATGCTCTTATGTGCATATTGAACTCGGA
GATTTTGTTCATGTTACTCTGATAGAAATATGTTGCCATTTGCTCTGTGA
ATCCCATCTTACTAATTTATATTGTATCTTTGGACAGGTGGACAACCTAA
AATCAAACCTACTTGAGAAGCTCGAAGATTGCCTTCTAAATTTCCAGAAC
AAGCCCACAAATGTATGTATGAGAAATATGAGATGAAATAAACAATTTAA
ATTTTATTTCAGGTGGAAATTCTGTAATCTGGCACCACTTTAGCCTGTGT
TGCCTATGTTATTACTTCGGCGGTGCAGTAAATCATCTATTATTGTTCAT
ACCATATAAATCTAGTCTATTTGCAGTACTCAGTTTGCAATCCTTTTTGC
CAACTTGTATATCATTAAATCATCTAATACTCTCTTTTATATTTGTTTTA
GGCTTCAATTGGTGATATTTCCAAGACATTCCGTGCTTATCTCATAATAT
TTCCTGATTCAGAAAGACGTCTCATTGAACTTGCACATGCTTTGTTCACA
AAGTAAGCCTTCACATATTTTATAAAATTATTAGACCATTAGCTATTTTC
GATCATAGATGACTAAATTCTGTTCATGGTACTCGCTAGTATTATTTTTC
GAGAAAATGCAAGACTTTTGTGTTTCATTGCATTGAATAGATAGAGTTTA
GCTTACATCCTCCTAAGAGGTTCAGAGTTCATTACATCTAGCCAAGGCAA
GTCTAATGTAAAAATACAATGAAGTGGCACATTAAATCCTGTTTGCTAAA
ACAGGAAGTAATTTGATTTTGAAAAGTTGAGACTAAAATAGTGCCATTGC
ATCTCCAGTTCTCAATGCACCTTTAGCGGGTCTACTGTGTTTGTTGCATG
ATGTGCAGAGCCTCTGTTTCTCTGTGAACACTAGTAAGTCAGAGTGTTTT
TTGGGAGATGCATTTCTTTGCCACCAAATCCAACAATTGGCTTAAACATC
CTACTTGAGCCATTTCACTTTATTTTTGGCTCAAGTGTTCTCTAAATTGC
ATGATCCATTTATTTTTTGATAGTGAAGTCATTTCACAATCTGAGTCCAT
GTATCCAGAAAAAATTGAGATCTCAAAGTGCTACAGCACATCACCAAACT
AAGATCATACTTCCGTTCCAAAATTTAAGCGATTCTAGTTTTGTTCTTAG
TCAAACTTGTTTAAGTTTGACCAAGTGTATGCATCGGTTGCCAACATCTA
TGATACCAAATTAGTTCCACTAGATCCATCACGAGTCAAACTTTACTTAG
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CGGTTGGCAGAATAGTTTAGGGATTCAAATTCCATGTTTTGAAAGAAATG
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TCTCAAATCTTTTGTTTCTTTGTTTCTTGAGATGATCGAAACAGCTTAAG
TTGGTACGAAAGTAGTAGTTTCTTCTAGCGATCAAGGTATATTATTGTTT
GGTTTGACTGCTTTTTTTGAGGAACTTTTGTAAGGGAAGTCCCTATAGTA
TATAGGAACCCAGATTTGTGTCTACGAGGACTTGAACCTAGGTGGTGGGT
TTCAACCAAATAAGCTAGGCTGCCTTCCTCTGCTGTCATAATATTGGGGT
CTGAGGTGCCAGACTGACGAATGGGCCACATCTGGCGCTCTGGTGTAATC
CATGGACAACCTGATGCATGCTTTGTATCACAGAGTAAAGTCTATTTCAA
GCCTCAAACTCATAGTGCTAGTCAGAAACAAACCCCAAACTCGTAATCCC
TGAAATTGGCACCCTTTAGTTACTCATCCAGTCATTCCGAACCCTGGAGG
TATTTGGCGCACCGGGAAAAGCACAATACCGGCCGGGATTACCTGGTCAA
AATAAAGTGGCATGCAGAGTAGATGTGTGCATCCAGCGGCGAATGATCTG
TTAGTTCTGGGCCCATGGCAAGAGACCCTCACAGCTCTTGAGCACGACGA
TGGAGTCGCATCACGCCGGCCACTCCGGCGCCCCGCTGTGCCAGTGCCTG
TTCCCAGCGTCCCAGCACTCCAGCGTGGTGCCGGACCCAACCATCCTAGA
TGCATTCGATGGCCACGACTGCTTCCACGGCAAGAATTCCGAAGACGTGG
AAATATAGAGGCAAAGAACGAGATTGGGTTAGCAGATGGCAGAGAGGAAG
TGATGAGGAAGATGGATATGACACATGGGCCCAGTGAGACTAGAGACTTA
TCCCAGTTGGGATTGTTGTTTTCCCGGTACGTCAAACTGGGCACTACTGC
TATAAGGTTAGGATTGGCCGGGATAAGTAACTACAGGGTGCCAATTTTAG
GGATTGAGAGTTCTGGGTTTGATTTCGACCAGCACTTTGAATTCATGGTT
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TGGGACTGAAGTAATCTATGCGAAGTAAAATATTTTCTTGTCTCTTGGGC
AGCACGTGCGTGTACATACATTCTTTTTTAGTGAGCTGATACATATTCTG
TGCTGCATAATGGGGACACAAAAGTTGCTTCAATATGACGTAGTATCAGA
TCAACTGAAACTTGCCTTTCAACGAGGCTTCCTTTTGGCTTTTGCTTTTC
TTTTTTCTTTCATTTATACTTGAAGGATTGGAATGTACCTAGAGATTAGC
TCTTCATAAGACTGCATGGAAATCAGCAACCCATTTGCCGGAACCTTAGT
TTACTCGTACTTTGTTTACCTTCTTTCTCTTTCACTTTTTGGTTCCATAT
GTTTCTGTTGGGTCTGATATCTAGCCTACCCCAACTCGCTTGGAACAAAG
GCTTTGTTGTTGTTATACATTTATTATTGTATTGGAAATTCAGTCCATAT
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TCAGAGAGACTTTGAAGGAAAGAATTCCATCAACGGATCTGTTGGCAATG
CTACGTAAGAGCTTTATCTGTTATAGTACCATCATAAATTTGTTTCCAGT
ATATCAAGAATAATAGTGTTAACATCTATGGGCTCCTCTGTTTTTCTTGC
AAAGACACAAGTAGTTGTGTTCCTTTCAGATCTCGTAGTCATTTGTCATT
ATACGAGCTTACAAAAGGCATTGTGCACAAAATACCATACTGATTTGCTT
CCTTGGTTATGATGCTAAGTAAGTTTTAATATTTTACCCAAGCATTTTAT
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CAAAGCAGCGGTCCTTCAAATTGATGGTCAACTTTTGTTAACGTTTTGAA
GAAAATTACTAACTATTCAAATTTAATTGGTGTTGATATTCAACTCCTAA
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ATTGCATTTCTTTTGACTTAATATTGCTACAATTTGATGCTCACAGGAGG
CTTATGGGAGGATGCAACTGCCATTGACGAAGTTATACCGGAGGCTGCGC
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TCATGTTTCAAATTATAATATATCAATATATGAATTATTCATTCTTTTCT
GTGTTTAACAAAATCTATACTATCTGATTTCATATTATGTCACTAGTTAA
TTTGTTTTGCCTAAAATCAAGTATGAGTCACATGGCTAAATATGCATATA
TTTCTCCATTCTTTAGTATTATGTTGATCCTTTCTGGTCGTTTCTTACTT
CAGAATATTGGTTGAAGCCTTCTTGCTTTTTCCTGGCTGGACTGTTGTTA
TGTGTTACAGTACCACTTATGACAGGGAATATAGTAATGGAACAAGGGAC
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TTATTCAGGGGATAAACTGAATATATTATTCAGTTCCCTTCTGTAGTTGC
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CTTAACATGTAAACGTGTCTTTGCCGTGTAGACTACCCGAGACATTATCA
GGCAACACATAGCAACAGCCTTTCTTCATCTTCAAACTGAAATATCAGGT
TGCTCCCCTCCCACCCCAGTTTGTTAATTTGCAATTTTCGCGCAGAACTG
CTTGTACCTTTGATTACTGTTCAGCTTTCATTTGACAGTAACTTATTTGA
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GGATAACTTACATTTATTGGGCATGGCTGAGCAGATGTACTGATCAGAAC
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ATAGAACAGACAACAATTCCGAAAGTGACAGAGGTATATTTCTGCACTTG
ACAGCCTCGTTTCTTTCATTTTGCATACTGAACTCCAGTGAATGTGCGCT
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CTGGAGGAGGTGCACGCAGCTATGAATATGGACCACCTTTTGTACCTGGG
GAGATATGTCGGCTCTATCGTTCATCTGGGGAGAAATTTTTGAACCATGT
AGGCATACATTTTCCGAACCTTCCTTTCGCTTACATTGCATTACTTGAAT
TCTCAGTAGACATTGCTTTTCTCTATATGGACTATGGAGGTATGCTCTCT
GTGTGCCAATTGGTCAAACTATTCAGATTGAAAAGAAAAAGGATTATATG
GCTTGACCAACCAGTGCTTTCATTTTTTTGCATTGTTATCGTAGCAAAGT
GACGTGCATTATTATAACTGAGAATCATGTGATGGGTCTACGCTGTTTTG
GTCTGTTCCGAATTTTCCGAGAATGTTTACCCCTTCAGCTCTGAAATACG
GTAGTACTGTAACCCCATGCAGAATGTTGAGTATGTGAAAGGAGGTTGAA
AAGTAGCATCACGGACATTAGATGCCGAAGGAACTTAGAATGACCTTCTG
TCATGAAAAGCTTTCAGCCATAGTATCGTTATTTGGTCTAGAATGTTGAA
CTTATCATTTTCAGTAACCATAACACAGTTCACATGCGGTGGAGCCTAGT
TGGGAACATCTATGTAATTCAAGCTTTTGTTATCTGAGGGTGGCTGCTTT
TCATTCACTTCAGAAGTACATCTTTGTTTATATGGATATAGCTTAGTATT
GTTTTGTTTTCTTGGATCAGTACATAAATATGAAGACTCAGAAGATCTCC
AAACTTCTTAATAAGCGATTTTCGACACCAATCTGGATAAAGGTTAGCTA
TCCTATTCAACATGAAATAGTATTTTTAGTCATTACAATTCAGTTATTTC
TGGTTTTTGCTCAAGTTTTTATTACCTCTGTGTTTATTTGACCAAAACAG
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TCTAGAAAATTCAGGTGATTTGGCCTGATTTACTATTAATGCTGCATGTG
AAGGATGTTGCATGCACTTAATCCTACAGACTGACTGGCCATCTGCATGC
GCTGAACTAATGCTAGACAGGGCAATTTTGGCTGTTGCGCTGCATGCGCC
AATTAATCGCCGATTTAATAGCTTTTGGAGTAATTCTAGGTTAACTCATT
AGCTAAAAAGTTGGTTTGAAAAAATTACCTCAGCCACTTCTTGTGTGCCT
TGGTCGCAGAGCCGGCTCTAATAAGCCCAATAAACCTGAACGGAGGGAGT
ACTGGTTGCAGAGCTGGCTCTAGTAAGCCCAATAAACCTGAACGGAGGGA
GTACTGCATATGACTGCACCTGCTTTTCAAAACATGAGCTCATGCTGGAA
GCTCTTTCTTTGCAATGGGCCTGGGCGAGGGGGAACATGCCAAGTATCTG
CCCAGGATCATGTTTTCTTAGGTTTATTCCGGATGTACAATGCAATTTCG
GTAGTCATTTTCCATTTCAGTTGGAAAATGCAGTCGGATGTTTGGGGTAC
TATCAGTGATCAGCTCATGCTGGAAGTTCTTTTTGCAGTCTCTAATACAG
TAATATCTGTTTCTCACCCTGCAGTTCAATGGTGTAGTATCTGAAGTCAA
GCAGATCTTGCCTGGTTTAATTCGGCGACATCGGCATTCTGATAGCACTG
GCAGCACCACTTCCTCTAGAAGCAATCCGATGCGAGAGGACATGTTGAAC
CGATCAAACACAAATCGTACTAGAAGTCAATTTCTAGAAAATCATCTAGC
TAAATTATTCGAACAGAAAATGGAAATATTCACCAAAGTTGAATACACAC
AGGTGGAGATCTGCTTCACTTTCCTGCTATATAACTCATGAAATTGCCTA
TTTTACTTTCTGTTTTATAATTTGTAATACCTTAGGAGTTTTGGATCCCT
TGTTGATTTTAAATCTTTCTCCTTGCTAGTATAAACGTATCGAGTTGATC
CCATTGATAATTTAATTTGTTCAGTATCTGGACTAGAGCTGTAACTGTCA
CCAGAGTTAGGGCAGAATTTTGTTACTACTACTCCCAGTCACATGAACTT
GTCACATTGGTGATCTCATATTCAGTTCTTACTTTTTTTTGAGGGTTATT
CAGTTCTTACTTAGTCGTGGACCAGCAGTATCTTTCGACTGTATGGAATG
ATCACATGAAAAAGATGAGTACATATTACTGAATTGTCCTAAAAACAATT
TTTGTAATGTTACACTGTTTGAAGTACAGCTTTGCATAAATTAATTGACA
AACATGCACGTTTTAAAATGAAAAAACATCAAGAAATTTCCATAGGAATA
CAAAGTACTGTTCTCTAGAAAGCTATCACAGTCCAAATGCAGCACAAGTC
AGAGTGCATCTTCTGAAAGAGGTCATACATCAGCTTATGATTGAATTTGC
TGACACTTGCTGTGGCAGAAATGCTTTATCAAATTTGTGATTAAGTTGCT
AGGTGATCATGTATTTTTCCCTTTTACGTACGTGTACATCATATATCCAT
TTTTTACAGTAATTTCTTGTGTGATGAGTAAATTCCAGGAATCTGTAATT
TCCGCTGTACTGAAGCTCTGCCTGAAAAGTTTGCAAGAATTTGTCCGGCT
TCAGACTTTCAACAGAAGTGGATTTCAGCAGATTCAGTTGGATATGGAAT
TTCTAAAGAGCTCACTTAAGGAGTTTATTGATGATGAAGCAGCTATAAGC
TTTTTACTTAAAGAGGTTAGATACCACCTAACATTGATTCACTGGTTTCT
GTAAGGAATCGATCCAAAATAATGTAGTAGTTTTATTTATTTTCCATAAT
ATGCCTGCTTGTAATTCTGTCTATATAGAACACTAGGCATAAGCATCTGC
ACGCATCACATGTGAATAAGAGTTAGGATCTTTAGGGTGAAAAGCATAAT
GTAGTACTCCCTCCATCCAGAAATAAGTGACTTGCATTTGTCTAGATTTA
CATGTATCTAGACACGTTTTAGTATATAGATACATCCGAATCTAGATAAA
TCCACGTCACTTATTTCCGGACGGAGGGAGTAGTTAGGATCACTAGGCAT
AAGCATCTGCACACATCTGCTGCATATTTAGTTTGTTGTTGTGAATCTGT
CTCTGGAAGATGTTTGAACATTGATTATTTCCCCCTCCTTTGCAGGTGAA
CAATGCTGCACATGAGAGATGTCTTGACCCAATACCTCTCGAGGCCCCAA
TATTAGATAAGCTCATAAATGCAAAACTAGCAAAAATTAAAGAGCAAGGC
CCAAATGTATAGTAGCTATGTACACATCGCATCGTTCACCAGCATTCAGT
TTCACTCAATTTAATTTAATACACAATATTCAGAACTATGTGCATATAGG
TGTGGGCTTGTTGTAGCATGTGACC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.