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GrainGenes Sequence Report: AA004716

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Sequence
AA004716
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA004716
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GTCCACTCGCGGCTCTTCGATCTGGTCCAACCCCAATACTAACCTGTGAC
TACTCCTGCCCTCCCGCAGCACAGCCTCCACCATCTCCCTGTATCCGGCG
ACCCTCACGCCTCCTCACTCCGACCGCCAAATTCGGCCCACTCATGACCG
TAGCCACCATGCGATCCAGTCTCCACCGCGCGGATCCGGTCGGAACCGCC
TCCCCTCCAATGTCTCCACCGCGCGTAGCCACCATGCGATCCAGTCTCCA
CCGCGCGGATCCGTTTGGAACCGCCTCCCCCTCCAATGTCCCTGACCTCC
ACCGCACTTCTCAGGGGCATGGAGGACCGACGCCCTCCACAGATGGCGGA
CACGAGGAGCAGCACAGAGGTGATCTGGGCATGGAGGCGCGAATCCGACC
TTCCCCGGCCCTCCTCCTCCCCCATTTCTCTAATCTATTCTCTAATATTG
CAGGTCAATTTCATTCATGCTTTAGCAGATCTAGAGCAATCAAACCATTT
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CATCATCTTGTTTCCCCCCTAAGTTTTCTGAAATGGATCGATATCTTGTT
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TTACACCTACTGACTACTATTTTCTCGGTTGTGACCGCGATTCTTGTTCG
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GGACAGCAGAATCTTCAGAGGTGGTTCTGATCTTGCATGTATATGTGTCT
TTACTTTTTTGTGCTTCCCACTTCTGTTTGCCTTCCTGACTATATTCTTC
CGCAGCAGCAAAATTCTCACTGGATCACGCTTCCCTCGGGTGATGTCACG
ACCTTCGACGATGTCATCCTCTACTCCAATTAGTCAGTGCGCATGCACCA
TGGTTGGTTACTACTAATTGTTTGTGTTCTTGGTTTATTGATGTTTCTTC
ACACTTGATACTTTGACACCATGTCAGAATCTTAGGCATAAAATTAGCAT
TTAGATGCAGCTGAACAGCTACTTTGTTTCCTTTCTTTCAATAATAACGA
GTGTTATATTGAGTAGTGAAGCACAAAAGAGAATAATCGAAATTGATGAT
CTATATGTACTTAAGTGGGAGTTGCATGCTCTTTCTTTATATATACAGTT
GAAGCTTGACTGCCTGAGCATGACAGAGAGCTATTTCAGCATGATTTTTT
TAATTTATCATATCATGTTGAGCTTTTGAGGACTTGATGTGGCTGCTAAA
TACTATACCATTTCTTACAAGACCCAACGACAACAGTAAGCTGTAACTTT
TCTTTATCATTTAGGTTAACCTATTTAAATTAACATTTTATTGATCTCCT
ATCATAGTTGGTCTATCATTAGGATTGCAAATAGATATTAGCACCATTCT
TTCTCATTGTGCTTCCGTTCTTCTTTAGAATATGTTAACGGTATCATAGC
TCTTTAGAATCTGCCGCAAGGGCCTGATTCTTAGTATGTTCTTCAATTTA
TTCTTCCAAGAGGGTTTTGTTGTATCTTGATTTGTTAGTGCTTCATCACT
CTTAGTCTATATCCTGATACCTAAAAATAGTTGTTATAAAAGAGTTACAC
TTATGTGCTTTTTCTATTGTATATACTGCTAAGAATGGATATTTCTTAGC
TTATGGTGTCGTATATCGACCACAGAAATTTTTATGGGTAGCAATACACG
ATGCAGGCTACATCTAATATGTTGGCTAGGTTTATTATTACGTGGAGGTG
TCTTTTCACTCTATTATCCATTACAAGTTGTCATGCTAGAGTTGTCCATG
GATGCTTGGAAATATAATCTTCACTGTTGTGTTAGGAAAATCTTGGAATG
TGTGTATGATTAAGTCATCTGATTCTGAGCATCATTATCTCCGCTCATCA
CATTTCTTAGATCAGTGTTTTTATTCTAAAAGGTTTCTTTGACGCAGAAT
AGTAGATCCATATATTTATGTTATTTCATTCCATATATTTCCATAAATCA
TTTTGCTATTGTTTTGACAATCCAGGTTGTTTCTTAGATCTTCTCAGTCA
GACATGATAACTCTATGTTGTTACTCAAGGTATGTATACGATTTGAGTTG
CACATTATCCCATAATTTTAGCGGCGTGATAAATACTGGAGTTGCTTTTT
TATTTATGGACACGCTCTAGGGCATTGTGAAGGCATCCGCCGCACTCCAA
TCGCAGACATCATCTCATGTTTGCTGGATAAGGATCCATGAGCAGGCCGG
GTTATCTGACTCATTATTGGCAATATATCTCTATGAGTTTTCCATGTTTG
ATGAAGTTCCTGCCTTGGTAATGATTATTAATACCTAATGATACCAGGGA
GAGGAGCATAAACCTCTCTACACTTGGGAAACTTGAAATTTTTCTATTGG
CTAGGTTTTGCAGGATCCATGTAGTCTGGTCGTATAGACTAGCTAGAAGA
CTTCTAAAATTTTGTATCTAAATCCTAAACTGAATTCTCTATTGAAGTTC
AACGAGAATAGTCAAATATTGGGTACGTTCTGGTATTTATCTACACATGT
GTTCCATATAATGCTATGTTGCGCGACAGTTACTCCTATGATTTCTTATC
TCTCTATGATATATATTGTTCGGACAGATTATGATAAACAAATGTCCAAT
ATTTAGTTGTTCTGATAATGACATGCCACATTTGATTTGTGTTCAAGTGA
AAGTATATGCTAACGTCAAATATTACTTCTGTAGAAAGTGTATAGTTAGA
ATCTTCACAAAAAAGTGTAGTGGTTAGAAGTTTCTGTACATTTAAATGTA
ATTGACTAACTGGACTACGGGTGAATGAAAACCTATAATAATATAAATAA
TAAATGGTCAAATCCGGTTTGGTTAAGCCATAAATTCTTTAACATATTTC
ATATGACTTATAGAAAGATAGTAGGATTCTGAACTTCTCTTTTCATACGA
AGATGTATATTTATTTTTCATCATGAAGATATAGTACACCACCGAAGGTT
TATGTCATTGTGTATTTATCTCACATGATTTAAGAGCTTGGGGTGTCGTA
TTTCTTTGTTCCCTTATTTATTCTAATTATCTGCAGTCTCCTCTCTATAA
GACTTTGAGCTGTCTCCTGTTATTGCAGTTTATTTCCTCACACTTTCATG
TAATATAGTTTTGGTGGATCCAAAGAAGGGAGTAGTTTTTTAATGAGGGA
GAAACATTTTCATAGAAGCTGAAGGTGTATGGACACTTGAGGTAGTGAAT
CAATCTATCACCTGCTGCCATTAACATACTACATAAATACGTTTCAGATG
TGGAAGTTGAGATGGTGCCCCGTGTAGCACACAAATGGGGAAAATGAGAA
GGGGTAAAACATGCCACAAGATTTTCTCGAATATGGTCAAATATGGTAAG
TAGTGTCACAAAAAATTGTGTATATGGTAAAGTGTACTCCCTCCGTTTTA
AAATATAAGATGTTTTAGCTTTGTGAAGCAAATGTATCTAGACTTCTTTT
AGTATGTAGGTTCACTCATGTTTGAAGTGAATCTAGACAATAAAACAAGT
CTAGATACATTTTCTTCACAAACCTAAAACATCTTATATTTTGAAACGGA
GGGAGTATCATTTAAATTTGATCACTAGAGACATTATTTTGCTAGATTCG
GGGAGAAATAAGATTGTGATTGTCTGAAGGATTTTTGTTGTTTTTTATTG
CTTACCAAACATAATTATCAATATGAGAGATTAGTGCTGGTGCTTGTCTT
TCCCAAAAATATGCGCACCCGACCTGAAAACATATATTCATGTCTACTCG
AACAGAACACATGGAGTGCATACATGAAAATTCTTTACTGTCATTCACTA
GCAAATAAACTATCCTAAACAGTTTGTCAAAAATAGGCACACATGATTAA
GGTCTATATGCCTGTAAATTATGTGGGAACTTGACATGTACAGAGTGTAC
GCACTCTCCTATTTAGTGTAGAATCATAAATGTATTTATGCCCCTTGCAA
TACATAGTAAAATAAATAGTACACATTTATTGCTATTCTTGCTGAGTGGA
GTGAGATAATGCAAGGAGTCGAGCATTATCGCAACGTCAAAGGTGGAGGT
AGAGTTGAGAGATTGAAAAAAATGTGAAAGGTGACGTGAACCTTGTAAAA
GATCTCCCGGCGTAGGAGAAGCTATGTGTCAAAGCGATGCCGAGAAGGGT
GTCGACATAGATGAGTAACAACAACGGAGCAAAAGGTTGACAACCATGGG
CAATGTGAAGAATTCATCGGAGGGGACCTTGGCTGCATAGATTCAAAAAA
TAAGAAAATGTCCGCACCTGAGGAAAGAATTATGCAAAGTAGGATGTTGC
TGGTCAGAAGTAAAAATACATAGGTTTTATTACTAGAAAGAGAGTCGATA
GACAATCCAAGAGAGGAAGATATCTACATGGGAAATAGAGAAATATCATT
TAGATTTCCTAAGGCAACGCACGTACATTCAACTATATACTGAAAAGTGG
ATCCTCTTACCGAAATAAAATAAACCAATTGGTGTTTCCAATGATCGACT
AATATTACTATTGTGTTTAAGGGGGCCTGCAGTGTCTAGAAAGTTATTTA
CTTCATTTGAAGAATTCACTTCACAAGAAAACATGGTTCTAATGTCTATT
GACCTTATCTATGTCACTTAGTGATTTGTTCGATTCATTTACCTGCTATT
CTCGCGGGTAGTAAACACACAAGCATTTAGTACACAACAAAAAGGAAGCC
ACTCTCACAATTAAATTCAGTTATTCAGGATGCTGTATGAGATTGCCCAC
ATATTTTTTTATCATTTCCACTAATGTTTGCCTATTCTCTTTATATGCGC
CATCAGCTAAACCTTATATGACCCTAAGCGAAAAGATGCAAAGCTTTTGT
TTTAGAGAAGGACGCAAAGCAATTTTCATTTTTCCTATGCATACGCGTAG
CAAGAAAAATAATAATCATGGATACATTGTATGCCACAGAACGGAAATGT
CTATAAATGTTTCTTTCCGTTGAAAAAATATAACTCCATGACAACGCATT
AGCATCTAACTATGAAGGTAAAAAAACACATTGATCATCCTTTATGAAAT
AGTCATCACTGCCCCGTAGCAACGTACATGCATTTTACTAGTCAAGAACA
TAAATAACTGATACACAAGTAGGCTACTCAAAGAGGATTGGATGAGGATA
TATGTCCCCCGAATCTAAGAGGAGTTACGTACTGAACCATCCATCCTTTT
GTTGATCTTATCACACAATGGCTGCATGTCAGCCATATGCAACCTAGATC
CACAAACTAGGACACCAAGATATTTAATAGGCCAACAACTTAGTTGGCAA
CCAAACATGTCAGCATATTTTAACCCTTTCTTAATATCATTAATCACCAT
CATGATTTCACTCTTACTAAAGTTAAATTTTAACTAAGACATTGCTTCAA
ACATGTAAAGGATGAGTTTTAAATGAATCAACTAATTCAAGTCATCTTGA
GCCAGCAGGATAGTACCATCATCATACCGAAGTATTGTAATTCCCTTTTT
AATAAGATGGGGCACCAGTCCAGCTACCAAATTAGTAGCCTAAGCCTAAA
ACACCATTTTAGAAAACCCTCAAGAACCAAATTAAAGAGTAAGGGGGAGA
AAGGATCACCTTGCCTCACCCTTCTATGGTTGCCAAAATCTCTACCTCTA
GTATTATTAATCTTAGCACTCAAAGTTCCATTCTAAACCATGTTTTCTAC
AAGCTTACATCAGAACCCACTAAAACCTTTATGAGCCACACACTTGAGTA
GATAATTACAATCCATCTTATCATAAGCTTTTTCAAATTTGATTTTCAAA
ACCACCCCTCCTATTTTTTCTTCTAACCTCATGGAGGATACCATGAAGAG
ATATCACCCCATCCATAATATATCTCCATTTAATAGAAGCAGTTTGGCGT
TCAGAAATTATCTTATCCATATAAGGCTCAACTCTAATAGTTACTACATT
AGTAATAAAATTATAAAGCACTTGCAATAGACAAATATGTTTGTACTTAG
AAATAATATCAGTGTAGGGAGATTTTTGGAGTAAAATGATCATGCCAAAA
TTGATCCTATAGAGGTCAAGCACACCAACATGCAAATCGGAAAACAATGA
TGTGATGTCATGCTTCATAATGTTCCAACAAGCCTGATAGAGTTTAACAT
GAATCCCATCAGGACATGGGCTTTATTCCTAACCATAAGATCTAAGGCAT
GTTTAAATTCTTATTTAAAGAAAGAAACATATAAATTGTCATTATCTTAT
AGAGAAATTTTTTCATTATCATGCTAGATTTAATGATCAAAACACAACAA
ATTCCCCTCACCATGGCCAAAAATGTTCTTATAGTACTCGGTTGCATGAG
AACGGAGATCAGAGGTCCCCTGAATCAAAAAATCATTATGCTTAAGAGCA
CTGTTCAAAAAATCGGCCGAATCAGCGATTAATCACTACTAGGGACCTAA
TCATGTCGATTACCACTAATGAAAAACATTATGCTTAAGAGCATTGTTCA
AAAAATCGGCCGAATCAGCGATTAATCGCTACTAGGGACCTAATCATGTC
GATTACCACTAATCGGTTGTGTTAATCGTTTAGCATGATTAATAGCTCTA
ACACTCCGATTACTAGGAATGTTCCCGATTAACTACTACACTTGGTCAAA
AAAATTGCAAAATTATGAACATATATCGCCCATCCATCTGCTAGCCCGCC
CCAATGAAGTAGGTTTTGCGAATCTCCCGCTCAATTCCTGCCTCTAGGAT
CTCGATTCCCGCCATCACCAGTCAGTTCCTTGTCGTTGTTGACCAGTTCC
TCGTAGTTGCCAACCAGACCTCAAATACAGAGCTCGAGCGCCTTGAGGAT
CTCATCCGGGAGCTTGAGGCTGCCTTTAATAGGGTAGGTGGTTGAGGTGG
AGGAGGATTCATACGTGTTTTAGGTGCTAATTTTTGTAGGTTTGCACCGA
TTAACAATCGACCTATTAAATCAGTTAATTTTCCGAATTCTGATTAGTCG
CTACTCCCAAGCCAACCGAGCAGTTAACGATTACCGATTTCCTTAGCATT
GCTTAAGAGAATAGATGTGATTCTCCTCCTTCTCCCATTAGTAATCTTAT
GAAAGTATGCAGTATTATTATCCCCTATAGTAACCATTTTTCACTAGATC
TATTAGACCAATACTTTTATTTATGTTCATAGATTTGCATAATTTTAAAC
TGAATGAAACCTTCTCTATCAAAATGAGCACTAGAAAGGAATGAAACTTC
CTCTAAAGCCTCCAACTGTTCCAATTAATCCATGAGCTATCTCTTTTCTT
TAATGTTATTTCCCCTAATATTGATACCCCATCTCTTCAACTATTCTTCA
CATTTTGTAAACTTTTGCTTAACTATACTTAGGTTATCGCTGGCATGAAT
AGAGGAGTTCCAGGTTTTTTCAACCCTACACTAGAACTCAGAGTGTTGCA
GCCAAGATTTCTTAAACCTAAATTCTCTAGATTTAATTTCAATAGCCTCA
CACAAGTGTCAACCAACAAGGGGTTATGATCATACATAACTCTTGGTAAC
TTTCATGCATTTGTCAAAGGAAACACATTTTTCCCATTCAGAGTTAACTA
GGGTCATGTCCAATTTTTCTAGCATAGGAACTTTCTGTTTATTGGACCAA
GTATATTGCCCACTAGACGACTTAATCTCTCTAAGGGCATACGAGTTTAT
AATGGAAATAACAAAATAAGATTTTTTTTTGCGTTGCCCCTTTCTTGTTT
TTTATTAGAAAAGCGAATAATATTAAAATCACCTCCAATCAAAGTCGTAA
TATCTAAGTTATCACATATTCTAGCCAAATCAGTAAGAAAAAACTCTTTA
TTTTCAACCTGCTTAGCCCCATAAATGTGACAATAAGATAAAGATCTTGT
TGGATCCTTGTGTCATGAACCTTAGATTTAACAAAATACATGTCAAAGAG
GACACACTGGGTATTTTATACCATACAAAAGCTCACCTAATCGTCCCGTA
GATGGGGACCAAAACCAACTATAAAGGTTATCTGGATCAAATTTTCTACA
AACTTTAGCATCTACATTCTTCATAATCTCTTGTAGGTCAATAAAATCAA
GGTCATGTTCACTCATAAGATATTTCAAACAAAAGGAAAAACCTTTCTTC
CCCACCCAACTACAATTCATAATGAGCCTAATCATTGAAACTTAATGTTT
TTACTTCTCAACCTAGGAACAGGTAAAATATCACATAGAGGGTGATTTTT
ACTTGTCCTACTAATAGAAATAGTACCACACAGGGATACACCTTGAGCCA
ATTTTTTGCTAATATATTGTTTCTTCAACTTTTTCTTACTAGATCTTTTA
GAAATAACATGAGTAAAGCCATCCAAAACATGAGGAATAGACACTTCACA
TGAAGTTTCCTCTTCAGAATTAAACACTCTATTTTTATCTAGAACCAGTT
TCTTATTAGAATCCTCAACAACAACATTATCTTGAATAAAGTCAATAGCA
GATTGATCGTGTTTTGATTCCTCCTAGAATTTTCCTAGTCTTTAAAGAGG
TGTACAGTTTCAAGGGGGAAAGATTTAATATCCCCAATTTCTAAGGCTTT
GTCCATAATTTCATTATCACTCAAGGCACAAAAGGAATTGGTAGAAGAGA
TGAGATTATTACCTACAACATCCCTAGCATTAATATGATCCATAGCTCTT
GTAAGCACTAGCAAGTTAGAAACGCCAGTGGCTTGAATCCTTGAACTATT
TCTAATATGTACAGGTTGGTCTGGAGTAGGAACAACTGGCCCCGAGACCA
ATTATCGCGTTAGTGTCGATGTCCGATGTCGTCGGAGACCGACGAGCTCA
CTACCGGTAGCTACATACCATGCCTTAGACGTGGAAGACATGGAGAGGAC
CTGGAGGACATCACCGATCTAGGAGGAGTACTCGAGCGTGTTGGGAAGGT
CCTAAACATGGTGCTCAATGTCCAAGGGGTGCCTAGGAAAAATTGAAATG
GGTAAGGCTTTAGGGTTGAGAGGTGAAGCTGAAGGGGGAAATAGGAGGTC
GCGGGTCTCTATACCCTGCTCCCAACTTGGAGATCCTCTCGGTGGAGCTC
CTGGCCATGGGCGATGAATAAGAAGTGTAAAGGAGAGGGATCTCGACCAA
TGTCGACTAAGAAGGAGAAGAGGAGGTTTCGAGGTTTTAAGGGGATCAAG
GTGCACTATTTATAGTTGATTGGAGGCGTACTGTGTATTGTGTCCATGGT
ATCCGCAGGAAGAGCTCGGGAGAGCGATTGGGTGAGAGAGGTGGTGCTTA
GCCGTTGATGGGAGAGCGAGGGGATATCGACATGGTCCAGAGAAAGACAA
GGTCTAGGAGCGTACGAAGCTGGGGCTCAAGCTAGTGGAGGCTGGTGGTA
GTCAAGGTGTTCGACGAGGTGTCCTAGCCTCGAGCAGGTTGGTACAATGC
TTGGTGTCGACATTGTCGTTGATGGATTTAGGTGTAATGATGTCTAGGAG
TGGTGAGGCATGTCGGTGGCGCTAGGAGTGCACCGAAAGGGCGGCAAAGT
GTGGCATGAGAGTCCAAGGATAAGACAGGAAGGGTACGGTGTGTGGGGTC
TTCGAGGGACACATGGAGGAGAGTTATGGAGAGGTGACAAGCCTTGAGGA
GGTCTGGTGCTATGGTTGGCCGAAGGGGCAGCGACCTGGCATGTCGAAAG
CACATTAGTACGGTTGTTCTAGGATAGAGAGAGAAGTAAGGATGTATAGT
GGATGCAAGGTATAGCTAGGGTAGTCCGGGATGTTTTATTCGAATTTATT
TGATGAAATTGATTCATTTACATTTTAGCTTAATACATGTCTGCAATATG
TTTGATTAAATGGTCGAAAGAGTTATAAATTTGAATTTTCAAAATTTTCA
TAGGTAGAGAGATAGGGAATAATTTTTGAATGTTCCTGATATTTTCCTTA
TACTAATTTGGTTAGTATAAGTCCATCTCTTATTCAACATCCATGTGTTA
CCCGCAAAAAAAAACATCCATGTGTTGACTAGTGCCACGCAGAAATCCCA
AACATGATTTCGAAGTCCTTAGACCGGGATGAATGAGTTCGGGGTGCTGA
TCTTAGAGATTCGAAGTATAGGGTTCAACTCGAACACACTATACGGGTTT
AAGGTTTATTTCAGAATTCTATTTACTCACTTTGATTCGTGCTCGTGCTC
GATTCCTCTTGATCGTCGGTGTCCTCGTTGTCACATATCCCTATGCCCAC
CACCCCGTGTCCTTGTTTTACGTCCATGAAATTATTTGGAAACCTTTCAA
TCAGCAACCGTTATGTTTGGAGACTTAATTTCCCGATTAATCTGGAAAAT
CCTCCTCTAGCACAACTGTCCTGTCACACCATGCCTGCCCGCACCGCCAG
GAAACTCCTCTGCTCCCCTGCCATCCCTCCAACTTTGGGTCCCTTTCATG
CATCTCTCTTCCACCCCTCCCTCCTAAACCTCTCTTTCGTTCCGGTGGCA
GAGAGCGACGGGCGCAGAGGACGGCAACAATAGCGTGGTGGAGGGTGGCG
AGCATGCCGAGAAGGTGACCAATGCCGATCATTGAGTAGAAACCTAGCAA
CATGCAACATCTTTAGGTTTGTCCACTGCATGCCAAGGACACGATGCCCT
GAATCCTGATTCTCCACCCCTTCCACGCTAGCGGCCGCCTCTCAGACCTC
CGACTTCCATGCAGCTACCGGGAACTGTGCTACTACCTCATCCTGGACGC
ATCCGCCATGGCCGACCTCTCTGCTGTTGAGTGCGTCTCTGCCATCACCG
ACCACAGCGTCATCGACGGATGTCGCCCTGCGTTGGGGAGCTACCCTCTT
CTATGACGCGCTCGTCTACGGTCGCTGAATTCAAGAGGCGATTTGGGTGT
CATGGCTCTGTTGTCTCCGTTCCTTTTCTTGCTAGGGTGCCATCCTGCTC
TGCTTCCCATTGTTGTTCCTGGAGACAGTTTCGGAGTTGCGGCTGTCTTC
TTTCTTCAGGGTCCTCAAAACTTAGGTATCTGCTTCAAGTTCTGTTCTAT
TACCATTTCGTATCTTCACAATTGTTACCATGTACTACTTGAAATTTCAT
GTACCTTGGCAGCGGTTCTTCATACTCAGTTTGTACATTGACTATAGAGT
TGTTGTTACCTTCTTGCCGTTCCTAATTTCTTTTATTATTCACCCCGTAT
GCATTTATTTCTTCTGTCAGCTGGTGTGTCGTTTGTCATGTGTTCTGAAG
AGAAAGGGTGTCTGGTACCTCATGGGTTTCAGAGATGTTTG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.