Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA043316

[Submit comment/correction]

Sequence
AA043316
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA043316
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGAGCCAAATTGACACTTTCGCCCATCGAGCCAGCTACGGCTACCCGCC
GCCGCCGCCGCCTCGGTGCCTCGCCCCCGCTGCCTTCCACCGGCGCCACC
CACAAGATCCTTGCCGCCTGGACGTTTCTCCGTCTACTCCAGTTAGACTC
CCCGGCACAGAGCTCGCCCGCCGCCTCCTGCCCGGAATCGTCTGCACCGA
GCTCCGCCTCCAGCCCGAGCACCTCCTCCCGCCGGACTAGCTTCTCCATC
GTGAGCGCCTCCTGCAGCTCACGCCCGACCAAGACCTCCAGCCAGGAGCT
CCACCAAAGCACCCAGGCTCATCATAGACGCGCTCTCCCCAGGTGAGCAT
CCCACGGGTATATCCCGCTGTGAGCTAGCTTGGCACTGATATTGCCCCTA
TGTTGGTGATTCGTAGTATAAACAAAGCTATGCGGTGTGCAGATTTCTTA
GATATCCTCTATTCTCCAGATCTGTACCATTGTATAAACAAATGTTCCTA
GGATTTTGTTATGAGAGCACACACAAGTTATGCTAGTTCAGAAAAAGATG
ACATGCATTTCTATACCCAGCCCATTTCCCAACCTAACTCCCTGCAAAAT
GCTAGGCTGCTGCACTCTGTTTCTTGGGGAGGAAGCGGCGTGGGGGCGGC
ACGGACTGGAGCACGGCCTCAAGCAGCTGGAGGTTTGTCCCCTCACCTCA
CCCATCTCAGCCCCGAAACCTGGAATATGAATGTTGACTGGATTTTGGAT
CTGACTGCCAGATTTTGTCATGTCGTCCTTCGCCGGTGTATCTATGCTCA
TCGACGATGAGGTGTGCACCACGCCCGCAGTGGACGCCGGCGGGGACAGC
GGGTACCACCTTCTTGTGGTAAAAGGCTACTCGCGCACCGTACGAAAGGG
CAAGGGAATCAGCTTTGGGGATTTCATGGTAGGAGGCCATAAATGGTGCA
TCTATTACTGCCCTAAGGGTGAGGGCCCGAGTTGTGTGGACTTCATCTCT
CTCTATTTTTGCCGTTGCTGTGACGATGATAACATTGAAGTGCCCGTGGA
GGCCAAGGTCGAGTTTAGCTTCGTCGACCAGGTTGAGTATCAAATGCACA
TTCGTGCAAGTAAAACATACAGCTTCTCCAGCAAAAGTCCATATCGATGC
TTCCCTAAATTTGTGAGAAGAGATATCCTTGAACGATCTGGCAATCTGAA
GGGTGATTGTTTCACAATCCGGTGTGACCTCATGGTTTGCAAGGATCTCA
ACACCCAGGATGCCGGTGGCACCGTGTCTGACATACACCAACATTTTGAC
AGTCTACTTCAAAATAAGGTGGGTACTGATGTAACATTTGAGGTCAACAG
CGAGACATTCGCTGCACACCGGTGTGTGCTTGCAGCCCGATCTACGGTCT
TCATGGCACAACTTTTTGGCCCCATGTCACAGGGCACTACATCCAGCGCC
ATACAGATCAAAGACATGAGAGCAGAAGTGTTTGCAGCTTTACTTAGGTT
CATCTACACAGATTCATTCCCTGATATTAAAAAGGACGACTACCTGGAGG
GTGATAAAGCAGAAGTTGTTGAACAAGGACAAAAAGAGAAAGAAGTAGAC
TATGCAATGTGGGTGCAAGACTTGCTTGTAGCGGCAGACAGATATGATGT
CCAACGGCTCAAGCTCTTATGTGAAGAGCTCTTGATTGAGCATTTAGGTG
TGAGCTCTGTGGCGTCCACTCTTGCTCTAGCTGAGCAACATTACTGCCAC
GGATTGAAGGAGGCATGCTTGATGTTTATCCAAGTCCAGCCTCCCGAGTG
TCTGGATAAAGTAATGGGCACTGATGGCTGGGAGCATCTAACTACAACCT
ATCCCTCTGTTTTGAACGAGCTCATTGCCAAGCTTGCATCCAATCAGAAG
GACAAGAAGAGGAAGCATGAGAGGATGTAATGGAAGACCTGGATTAACAC
TATTATGCATATATGGGATGGAATCCTCTAGGTAGATGGCAGTCTGCATG
TCTTGCTTTTGTTTCGTCATGTTGTTTGCCTATATGCTGAGCCAGAAAGA
TCCAACATATGGGAAAATGTGGGGTCTGTAATTTCTGGTTTAAGTGTCGA
CATTGATTTGTGCAAGTAACCTAGCTAGTCGTTTCTCTATGCATTGTCTG
TGTGTTGTTGTTTTGTGCCTTTACCTTCATGTAAATCCCTTCTCTAGTTG
TTATCCAGAACTATAATAGTGATTCTAAGGCAGTTTGTGAAAACCTTTGA
GGCGAACTTACAGTAATTATTATTTATTCACTACTTTTTATTTATTTGTG
TTCTGTAATGAAATTGCTATGAATGTGAATGAGTCTTGCACTAAGTGTAA
GTTATCAAACTAGTTCTTTGCGCCATGAATTGGATGAGGAGGATTGGTTT
GAGGTTTAGTTTTAACTGGTATTACCAATGATGCTTTGCTGTGGGTTTGT
TTGATGATAATTTGTTTTATTAACACTAATTAATGTGTTCTTAGACCATT
TATATCTCCAAAGGGTGTCATGCAGATGTGCCTTTTCTCAAAATTGACTC
GATCATTTGAACTAATAGGTGTCTATTCGAAACATATGTCTGATCTAATG
GTTATATTGTGTTATTGCTTAATTTAGATGAGACATTATGAGTCAATTTT
AGAGTTAAGGGAGATTTAAACCAAATCCTAGCCCATAGCCGAACAGGGAC
AGCTGCTACTTTCATACTTATTTGTTATTACTCAGTACTGGCAGTGGTTC
AGTAATTAACTAGTTGACCATATGGTTAGTACATGGGGCCAACTTCTGTT
CCACAAACCATGGAAAGAATTTTGATTATAGTATGATGAACAGAAAGCCA
AAGGAAGCAAACCTATTCTCCAAGGCATGGTAAACTCTCTTATTAACTAA
ATTACTGTGTGATTCTTTACTTTATTCATTATGTAAATATCAACTAGCTT
ATGTATAATATTTATAGATTAGTTTCATTAATACTTTATTAATGCGTATG
TACTGTTGGATTTTGTAGCATGTTATAACTGTTGTTCCATTCTCACCCTC
TGCAGAAAACTACAGGATGGTACACAAAGATGGGTGAGAGAATATGGACC
CCTTGCTGCCTTTAATTTGTCCACTCTTGTGGATACTTCAACATCTACAC
AAAAGCTTTTCCTGAAGGGAATGCCCTCAGTTTCTCTCATAGGGAGCAAT
GCAGGTGTCAACTATGGAAGAAGTGTTGGACCAGATTCTACAACGTTAGA
TAGGAATAATATCGACTTCAATATATGGCAATTGCAGCCTCTCAAGAGCT
GAAGTGGTATGATTTCTGTTTTTTTTTTTAAATTCTTCCAGGAGGTGCTG
TTAGGAAATTCAGTGAACTTGGTTCTGTACTCAAGTCTGTGCATCTGGAA
ACAAGCTCATAAGTTTGTACTTAGTGGAAAAAAGGATTGTGAGAAACCTC
ATTTGCCATCTTGAGATGGTGGTCATGCGGGATTACATTTTCCTTGGTGA
CAACACAAGGGTTTCTGGATAACCTTTCTCATAGAGGGCATGCTTTCATT
GATGCTATTGAGTTGCTGTAGAGCTTCAAAATGAGGGGTTCTATGGATTA
TGATGGTTTGGTTAAGGAAATATTGCCTAAAGCTTATATGATACAATATT
GCTTGGATCTGGGTTAGTCTATAAGTACTAGACTAGATGCAAATATGATT
CCACTTGGTAGTAAGTTGGCCAAGGCTGTTGATTTAGGGGGAAGAATTTT
GATAGGGACCTTCTCCTAGATGCTTGCTTTTCTCGAAACTTTTATCCCAT
TTTTGCTGCCGGTTGCACAGATCTAGGTTGACTTGTTTGTGGTCTGAGTT
CATGTTTTGTGCTATTGGGGGTTTGAATTGTTGAAGTTATTTCGGTTTGT
TTGATCTGTTGCCATAGCTGTTGGGTACAGGTTTTTTTCTTGTCACTGAT
ATTGAGTTGATTACCTCTTATAGACCATGCATGATCAGGAATCAGGATGA
TGTGTGAACTATTTCTCGGTACGTAATTTGGATTCAGTGTTGCTGTTAGA
TAAGATGCGCAATGGTAAAGTTGTATATTGAATTCATATTATTGCAACAC
TTGTCACAAGCATTTATTGATTTGTGTCTGATAAGGTCGGTTGGAGCAGT
ATTTACAGTTTACTAGATGTAGCTGTTTGTTTGAGCCGAAAGCTATTTTT
GGCATGAAGTGAAGCACGAAGGAAGTGTAGCTAATCTCTTGTACATGATT
TTTGGCATGGAAAATTTTGAGTATATGATATCTAACAATGCTACTAGACC
AAGGAGAGTATAATTTCATGTTTTCTATCCTTGTGTTTCATGCAGCTGGA
CTGTTTTTGTACCGAGTCTAGTGATTTATTAGTTTCATTAACACTTTCAT
TTGTTTGTAGAAAATCTAGAGAAATATCTCTGTTACATTTTCTTAAATTT
CACATCCAGCTGAAGAAAAATGTCAAATTACATTCTTGTTATTAGTTTCT
TTCTGAAATTTCTTGTCACATTCTCTCAAACATTACACACCATTTGTTCC
AAACTAGAAATAGCTTCCGCTCTTCCTCTCCCACTTTAAGTTTCTTCCAG
TTCAACAATCCTAGACTAGTAGATTTAGTCCATCTGAGAATGGTGCAAGT
CAACCAGGAAATATGGAAAACTTGTTTGTCGATGAAGAAATGAACTTACC
CGCGATCTCACAAAAGTATCTTGGATGATGTGGTTCATTTTGGTGGTGTC
TTTTCAAGCACATATGATCTATCTATATACCAATTTCACGTCTTGATTTT
TATTGTAACAGTAAACTGAACATTATATACTAAGTAACCTATTGGAGCAT
TTTTTTAATTGCTGTGCACTTAGTTGTAAACTTTTTCTGAAGAGTACATA
AGAAGTAGCAGACTGGTTTGTTTTTCATGTTGGTTAGCAAATGTATTTAT
CTTGGGAGGGGAAAATGATGGTATGATGCAAATGTGCATCTTTAATTTCC
TTTTAATATCTTTTTCTTGGTACCCATTTATTTCAAGAGAGTGCCTAGAT
CTCAGACGCCCGAGAACTAGTTATGTCTAAGTCGCTGATGTCATCCTAAT
ATTTGTGCTAATTCTCAGTTGCAACATAGTCGCAACTCATAAGATTTGTA
CTAGTTCTCAGTTACAACCTAGTTGCAACTCATTAAATTCTCAGTTACAT
CCGAGTTGCAACTCATGTGTAACTTCCATTTTGCACGAATCACGAGGTAA
ATCAAACGGTAAAAGAGACGACTGAGACTTAAGAAGTTCTCAGGCGCCTG
AGAACTAGCAAATCCGTTATTTCAATTGACATATGGTAGATCTCTCTCCC
AGTGCAGGCTTGATACTGGGTTCTTGGTTTCGGTCATTGGGGTTAATATA
TTCTTTCAGAGAGTTTTCTGTCATTGGGTAACAGTGAATTGTTTTTTGGT
TGCAGTGTTGATGCTTGTTCTGCCCCTGTTCAAAGCTACTGGCAGTATCC
TGCTGCATATCGCACCTGTCAACGTAGTATTTGTGTAATTTGATCAATGG
AGAGCATCTATGCTTCTGATATGCTTGTTACTCATATTCTTCTTTTCTTC
TTGCCTCCGGTCATGCCTATACGAAACACGACGTTTTAAATTTCGAAAAC
AACACATCGTCATCATGTTCCAAATTAAGCTATGCACAGAACGACCATAT
GAGAACTTGATATAGATAAACAAGTATCATTCCACTAGTCTTAACTGGGC
TAATTTTTTTTAAATAATATTTTTTTTTTGGAATTTCACAAATAATACAC
AAAACGGGGAAATTGCAAATCTGTTGGTCGGTCGGCCGTTCGACAGACGA
CACCCTGTCTTCGTCCGTTCAACAGACGACACCCTGCCTTCGTCCGTTCG
GACGAATCACCCTGCAGGCAACGTTGTCGGCTGTTTGATAAAGGAGGGGT
TTGCAGGGTGATTCGTCCGTTGAACGGATGAAGGCAGTGTGTCGTCCGTT
GAACGGACGAAGACAGTGTGTCGTCTGTTGAACGGACGAAACGAGTCTGT
CGTCTGTCGAACGGCCGACCGACCAACATATTAGCAATTTGTCAGTTTTG
CGTATTATTTGTGCAATTCAATAAAAAAATGTATTATTTTAAAAAAAATA
GCCTTAACTGGAGCTATGCAAAAACTTAGCAAGTAACACGAATTTCTGAA
GTCCTATCCAACAAAAGCATTAAAGATAGCACTGATTAATCATCCTTGGA
CTTGCGAAGATTAGTTCAGCCCCTCCCGGACTATTTATGTTAGTTTGTTC
AGTTTCGTCAGTTAGGAGTGTTATTCTCCAGTTTCGTCAGGTGAGAAACA
GAAGCTTGATCTAACAAACTATTTTTTTTTTGCCAGGAAAAGATGTTTTT
ATTTAAGTGTTGATAGAGTTACAATCAGCTGAAATTTGGCCGTGGACTTC
CAGAGGGGAGTTGCCCAGCCAAACTGCCGTTTTAGGACCTACTCTACCAA
ACTTAGCTAGTTCATGACTTACACAATTTGCTTCCCTCTCAATCCTAGCT
ATACTAACATTTCTTTTCTTACTTAACTCCCTAATATTTTTAACTCTCGC
AGCATATACTGAAGTATTTGCCGTCTGGGGCTTGACAAGTTCACGTGCTT
CCACGCAGTTAGATTCCGCCACAAAAGGCAGCAACGTCGTCCAGTGGAGT
GCCAGGTTGATACCTTCCTCTAGCGCGTCGAGCTCCGCATCCACTGCGTC
CATGCAGTGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.