Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA041364

[Submit comment/correction]

Sequence
AA041364
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA041364
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GCTCCACCTGCAGCAACCGACTCGTCACAACTCCAACTCGACGCCACCAC
CGGCGAACACAAATCGGCCGAGTAGACGACGACCCCGCCGACGATCCCCC
CTCCCGCGCGCGCGAGAGGAAGTCCCGGCGCCGCCCTCTCTACCGGCCGG
CAGGGCCCCACCGGATCGCCCCCCTCCTCGCGTCGCTCCCCTCTCCTTCC
AGATCCTCCCGGGAGCGGGCGGGCGCTCGGGAGATCTCTGCCAGAGATGG
ACAAGTCCAGCGCCCTCGAGTACATCAACCAGATGTTCCCCACTGGTACG
CGAGCCGCTCGAAACGATTCCGTCCCTCCGCTTCTCGTTCGCCGCAGCAC
CTCGCTCGCAGCGCTGCTGCGGCAATGCGCTCGTTTTCAAGCTTTCCATG
TTCCCGAGATTCGGTAGCTGTTGTTCGAGGCACGTAGGGTTTACAGTTTG
CGTTTGCTTGCTTGGGACTTGGCAGAGGCGTCGCTGTCGGGGGTGGAGCC
GCTGATGCAGAAGATACAGAGCGAGATTCGCCGGGTGGACGCCAGCATCC
TCGCCGCAGTCCGGCAGCAGGTTCGGACTCGTGGTTTTCTATTTGTCACA
GTGTCGTGGTTCGTGTTATGGTGATGCTATAGCGCTGAACTTACATTGGA
TATGCACAATGAAAATGTTTCTCTGAAAGCTCCAGCTGAAATGTACTGAA
TTGCTTGGTAGTATGTGCTTATTACTACACCATATATGATAACGGGAAGC
TATTGTTACTCCACAGAGTAACTCGGGAACCAAGGCCAAGGAAGAGCTTG
CTGCTGCCACAAATGCTGTCCAGGTCATATTTTTTTCTCTTTTCTGTATG
ACTTACATTTTACCCACAATGAAATTACTGGATAGTCTATTGAGCGGCAA
GTCTTAGTAAGCTATAGCTGGATTAGCTCTGGAAAGGGTATATGATGTTA
ATCTGGTACCGGGTGAGCACTTTACGGCATATTGGAGTCTAACTTTGCTG
TGCACTAACAGGAACTAATGTACAAAATACGTGAAATAAAATCAAAGGCT
GGACAGAGTGAAACAATGGTTCAAGAAATCTGCCGCGACATAAAGAAGTT
GGATTGCGCCAAGAGGCATATAACAACTACAATAACCGCTCTTCACCGTC
TTACTATGCTTGGTTAGTTTCCTCACTTCACTTTTTTTTGTAATATGTGC
TATCACGCTTAAAATATACAATCTGCAGTAGAAAATATACATCCACATAA
GCTAACTGATACCACACATACATCATGTGCAGTTTCTGCTGTCGAGCAAC
TTCAGGTCATGGCCTCAAAACGTCAGTACAAGGAAGCAGCTGCACAACTA
GAGGTAAGACACAATAGTAGGTGCTGCTGCTTACAATATTTTCCGCTGAA
CTAATTACTATGACCATTTTTCATTGGCATGACAGTGTTTGTAATTGTGT
GCACAAGTTACCCAAGAAAGCTCCTTACTCTGTTTCTTTCTCCAGGCAGT
AAACCAGCTGTGCAGTCATTTCGAAGCCTATCGGGATGTGCCAAAAATAA
CAGAGCTCAGAGAGAAACTCAAGAACATCAAGAAAATCCTCAAATCTCAT
GTATATTCAGATTTTACAAGGTACACAACAAATGAACTTTGTTTTTTGTC
ATTGATGGAAGCACTGAACTTGGAGCAATAAACTAGTCTGATACTGCAAG
TAAGATCATTGCAAAGGACAAGTTAAATCTCTGTCTTAGCCAGAAACAGG
TGGCCAAACTTGGGAAGTGGCAACCTTTTCATTTCTTCGTCGTTTTTCAA
GTACTATCATCAATAATTGAGGATACCAGCCAGTATAATTCAAATCCAGT
GTAAAAGCAAAAATTTGTTAGGAACCGAAAAGCTATAATCTGTGTTCCCT
AAATAGCCTATCAAATAATGATCCCTGTTGGACAGACTGTTTGGTAATCT
GACTGTGTTTTCATGCCTATGAAGTGGGAATACTTCGAAGTACCTGCAAA
GTCTTATTTAGTAGCTAATTAGTTTGCTTGCTACATATCTAGTACTCCCT
CCGTCTCAAAATATATGTCTCAGGTTTGTCAAAATTTGGATGAATCTATA
TACTAAACAGTGTCTAGATTCATCCAAATCTTGAAAAATCTGAGACATCT
ATTTTGAGACGGCGGGAGTACTTCATACTACGAAACGGATCCACAAATTA
GTGTACTTTTGCAGCTTAGGAACTGGGAAGGAAACAGAAGATGAAGATCT
ATTGCAGCAGCTATCTGATGCTTGCTTGGTGGTTGATGCTCTGGAACCTT
CTGTGAGGGAAGAGCTAGTAAAGAATTTTTGCAGCAAGGAGCTTATCTCA
TATAAGCAGATCTTTGAAGGAGCAGGTGGAAACCTTGCACATGCTTCTTA
CATCAGTTGCATATTTCATTTGATTACAAATGTACATACTTTTTGCTCCA
TTGTTATTCTTATACTTCTTTGCTGGGGAAACAGAACTGGCCAAGTTAGA
CAAGACTGAAAGGAGATATGCATGGATCAAGCGTCGACTACGGTCAAATG
AGGATACCTGGAAAATATTTCCACCTTCCTGGCATGTTGATTATCTGTTG
TGTATCCAGTTCTGTAAGATTACTAGGTTTGACTTCTCTCCATTGTTGCA
TTTTATGAACTTTCTGCTTTTCTAACCAAGTATATGTTTCCTCCTTCAAA
TTGAGATTTACATAGAACTGAACCAACCATCAATCAACTTGGTTTTACTT
CTTGTTATATGCATTATGTCGGCAATCATATTTGCCCACTAGGACAATTA
TCATCTTTTACCACATGTTAATTTACTGTTGGAAACTTCTTTTCCAGGAC
CCAGCTTGTCGATATCCTGAATAATCTCAAAGAGAAGCCAGATGTTGCAA
CTTTGCTATTGGTAAGTTTGGTTGTTGTTTCTTGGAAATATGGATGACAG
ATGGAAATGGATATTTGCCCTTAATCTTACCATTCTATGCATTTCTGTTG
GCCTACATCATATTAAATCATTTTGGTCTTTGGCTGACTTCTCTAGTGGT
TTTATCTTGCATCCAGTCTCCTGTTAGATTTTTTCTGGCTTTAACACAAT
AATTATGAAAAGAAACAGAATTGTGTACTTCATAATGCATTAGTTCTGTG
TCAGCTTATGTCTTGGAGCCTCAGAGATCCTACGTTGGATTATTATGCAC
TTCTAACGTTATAGTTGAGCATGCAAGTTTATTCATCTCATGATATAGGA
CATCTGCACCAAACAACTTAGAGATTCTTGCAATGCAGGCGTTGCAGAGA
ACCCTTGAATTTGAGGAAGAACTGGCTGAGAAATTCAGTGGAGGAACTAC
AACTGCTCGGAATAAAGAGCTGGAAAGCGACGATGAAAGTGAGGGCATGG
AACAAAATAAAATTGTTTCAGATATACGGAAGAAATACGAGAAGAAACTG
GGTGTGCCCAGTGATGAAGTTGAACAAGTATCTACCACTTAGTCTCTTCT
TTCTTTCTGCACTTCTTCTTTTCTCAATGTACCTTTATCCAATTCTTCTG
CAATTCCTTACTGGCAGGACAAAGAGAAGCAGAAAGATTTATCGGTGCAT
GGTGCTGGGGTTAGTAGTCTATCGGCTATTAGCTAGTGCAGGGTTATTAC
TTAATTGGATTATGAGCCGTGTGTCATGTACTCATATATCATATTTTGTC
GTGCAGTTCAACTTTCATGGAATTATATCATCTTGTTTTGAGCCATACAT
GGCTGTGTACATAGAACTCGAGGAGAAATCTTTGTTTGAACAATTAGATA
AACTTATCCAGGTACGCTAGACATATTTACAATTTGAATCATTGGTGTTT
GGCGTCTACTTAGCTCTATTTTCCTCTCCTATTCTGTCAGGAAGAAAAAT
GGGAAACCGAGGAAGGGAGTCAGACTAACATTTTATCAAGCAGTATGCAG
GTATACAAAATATTTCATGCTAGTTCGAGAATCCTGCTTCCAGCAGTTTT
ACTTCCATGTGTCTGAGCAATTCATGATCAGTCAATAACTGTGTGATTTC
ACCTTGCAGGTGTTCTTGGTAATTAGGAGAAGCTTGAAGAGGTGCAGTGC
ATTAACAAAGAATCAAACATTATTCAACTTGTTTCAGGTAGGCAGTTCTG
TTTTAGCAGTTTTCTTTTCTATCTACAATTCCATCTTGTTCTTTCCAAAT
GTTGTGCTGTCGAGCATGTTTTTTGTTCTGCTAGTTGCCGTTTCTGTTAA
TGATTCTTGAGCGACTAAATCTCTTTGAATAAACCCAATGCAATGTATTT
CTGGGGAAAATGTGCTAAATTTTACTTTGCACTCAACATTAGGTGGTCCA
TATATGCTCATTTGTTTGCAATGTCTGATAAACTGTTCAGTTGGTGATAG
AGTATTAGGACAGGAACCATATCTACAGAACAATAATATACCATAAAAGA
ACCTTGAACAATAATACACATGTTTATAGCTCAGTGACTACGGTTGACTG
CCGTTTGAAGTTATAACAGCTGATAAATTCAAACAGGTTCATTACTGATA
AAACACATTTGTTGTTAGGTATTTCAAAGAATACTTAAGGCCTATGCAAC
GAAGTTATATGCCAGGTTACCTAAAGGTGGTACTGGCATTGTTGCAGCTG
CTACCGGTACCGACGGTCAGATCAGGGTATGACAGTAATCATTACATTGG
TTGTTTTCCTATGCCTTGTTTTGCTCATCTGTTAACAACATTTTATGTCT
TGTGGGCATTACTGCAGACCTCTGACAGGGACGAGAAAATGATATGTTAC
ATTGTTAACACTGCAGAATATTGTCACCAGACAGTAAGTCTTCTGTCCCT
TAAATCACAACTGTGAGGTATAAAAGAAGTTATGGTATTCTTGTTTTACT
AATTAATATTTTCTCTCTTGCTTGGAGAGTCAGAAACATACTAAATTCTA
GGTTCTAGTTCATTCAAGTTAGTAGCATTCTTCAGTTTTTTTTTGTTTAG
AGCAAAATCAGTAAATATATGCAGCTTTGACGTTCAAAAAAATGTTTCTT
CCCTTTCTGGGAAAAGTTAGCTATCTATGTGTCATGCATTGCTGCCGCTC
TTGCAAAATGCCACATTAACAAGCCTGTAATGTATGCTGCAAACATTGAT
TAATATAGAGAAATCCATATCGGCTTTGAAACAATAATAAAGGAATTTAG
AAACCCGAATTTCCCATTGCATATTTGCAGAAACCCTAATCACCCTACCA
TGATGTGATGCCCATAACAAACATACCACCTGGCACTTCCCAGTTCCTCG
TGATAAGACCTCCCACCATGCTTTTCACATCGTAAAGCTGGCATTGGTAG
TGGGTGGCAATAGAGATGGACAGCACAGTGCTTCCTTGTTAGAATTGATT
AAGTTTCCTGATTAATAGATAGGACACTCATATTCTGATCGCAGTTGATC
TAAAAAAGGTATCATATGATGATTTATTATCATTGTTCACCATGTTGAGA
AGCTCTCCACAGATTTGATTATGTCATATCTGCTCAGTGGGAAATGAAGG
ATGACATGGAGGTGGAGAAAAGAGGAGATGAGTGTGTGAGGCTAATGGAG
GTGGCCTGTTTTTAGTATCAGTGTAAAGTTAGGGGGGAAATGTGTTGGTA
GATTGCAAGTTATCCAATACTTGCAGTGGCATCTTGTAAACCTAGCACAG
AGCAGCATGTGGCTATTTTATCCTTATATTGGTTGCATTTTTTGACTGAA
ATACCTCTATATGCTCTTTTTATGTTTTTTGAGCTGAAAGCTCTTTTTAT
GTGACTATTAACTTTCTCCGTGTAAATTTGACAGTCTGGTGAGCTAGCTG
ATAATGTTGCTAAGATGATCAATTCTCAGTTTTCTGACAAGGTGGACATA
ACTGAAGTTCAGGTGATTGATCGTTAAGTTCTGTTATTTCTACTTGATTT
CAGTATTATTATTAGGTTTCTAGGAAATGGCTTAATACTTCAATGCTCGC
AGGATGAATTCTCAGCTGTGATCACAAAAGCATTGATGACACTTGTGCAT
GGAGTTGAAACCAAATTCGATGCTGAAATGGTCGCAATGACTCGTGTTCC
ATGGTCGACCCTTGAAAGTGTCGGCGACCAATCAGAGTAAGATTTTGTTA
AATCCCTTTTATAGTACGCCTTCAACTGATATTTCATTTTATGTAATAAC
CTTACTGCAGCAATATGAAGAAAAAACCAAAATACCAAGCCATTCACTTT
ACAGACATTGATGGCCTAGATTTAATGGGCAGTCAAAAAATATGTGTCTG
TTCCAAGTAACACTGCAACATTATCAGGAACTTGTTATTATTTTATTTGA
CTAAAAGAAGAGGAAGAACTGCCAATTGCAGTCTATCTTGTCGGAAGCTG
TGCATCCTGTTGCTTTGAGGGAAAAAATACAAATGCAGTAATCCCTTAAA
ATCAAAGCAATCACCCCACCTATTGATAATGGTGGAAGCATGGATGGTCA
ATTTGCATGTAATCCCTAAAAATCATAGCAATCACCCCACCAATCAATAT
TGAGAAATTAGCTCATTTACTCACAAATATGCTAGCACTATATATATTTA
TATACCCATAGATTGGATCGTTGATATTTTGGAATACTGCCTTCTTCGGT
TTGTTGCAAGTACTATATAAATAACCGCTAAGTGGACATGCGTAGTTCCC
GTACTTTATTTGAAAGCTAAGTTTTACATTGTTCCATCACAGGTACGTGA
ATGGCATCAGCTCTATTTTGTCCAGCACTGTCCCTGTACTTGGTAGCCTC
CTTTCATCTATCTACTTCCAGTATTTCCTGGACAAAGTAAGTCTATAATT
CTTGAATTATCGATAAAACCTTGTAGGTCCTTGTTACTTTTTACTGTTGA
AAGAATATCATCTCTATAATCATAGAATATGTGTTGGTTACCAGCATGGT
TTACACTTCATTTTGTGATGCAGCTGGCGGCCTCACTTGGTCCTCGGTTT
TATCTCAACATATACAAGTGCAAGCATATATCGGAAACTGGTGCACAGCA
GGTGCTTATAAATTTAACAAAGCTATTTTGTGCTATTTAGCATATTTGTC
ATCACTTTGCATTGTTTCTTCAGATGCTTTTGGACACTCAAGCAGTTAAG
ACTATTCTATTGGACATCCCAGCTCTTGGAAAACAGGTAAGTCTTGTCAG
CACAAAATCATCACGGCATACTTCATAGCCTAAATATCTTCAGTTAGCAG
TGGTCGGGTTGAGGAAACCATCCAGGTGGAGTAGTTATTTTTGTACCAAA
TATAAGTTGAATCTTTGTAAGAAATTGTACATGCTTAGTGTTAAATATGT
TCAAAATCAATCAGATTCTTATATTAGTCGGAGAAGGTTAACAACCAACA
AATGCAGTAAATTGCTTTCTTGACTTCATAAGGCAGCATATGTGTAGTAA
ATACGTAACTGCAAGAAGGATGCCCTTTTGCGTTGTTTCCATATTTCACA
TTTGTCTTCTTTGTGTTGTATGTGACAGACAACAGTTGCGGCTAGCTACT
CGAAGTTTGTAAGCCGGGAAATGAGTAAAGCTGAAGCACTCCTCAAGGTA
AATTGGGAAACTACGTTTTGATGATTTGTATGAGTATTGTGGGAAGGCAC
TTTGCATTACCTCCAGCTAGTATCAAGCTAATAACATTGCTGGATGCAGG
TTATTTTGTCACCTGTTGATTCTGTTGCTAATACCTACCGTGCTCTCCTT
CCGGAAGGCACGCATCTTGAGTTTCAGCGGATACTTGAGCTCAAGGTTTT
TGCTTCAGAATCTGAACTATTTTATACCCCAGTTGCAATTTCCCATCAAT
CTGGTTGACCCGACACACTTATTTCGTTCATTGTTGTTTGCTTTGTCACA
GGGTTTGAAGAAAGCAGACCAACAAGCTATACTGGAAGACTTCAACAAGC
ATAGCCCCAGCATCAAGCACCCTACCATAACTCCCACGGTTGCACCACCA
GTCCCAATCGCATCTGTCCCGATCGCACCACCAGTCGCAACTCAAGCCGT
ATCGGCGACAGCATCGCCAAGCATGTCCACCGCCTTGACGGGAGCACTGG
CCAACCGAGAGGATGTGCTCGCCCGTGCCGCGGCACTTGGACGGGGTGCT
GCCACGACAGGGTTCAAGAGGTTCCTCGCATTGACAGAGGCGGCCAAAGA
CCGGAAGGACGGGCCGTTCCGTAAGCTTTTCAACGCGTAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.