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GrainGenes Sequence Report: AA012969

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Sequence
AA012969
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA012969
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CCTCCCACAACCTTCAACACCCACCTCCACCCAATTCTGCGGCCATGGCG
GAGCTCGGCGGCATGCTTGCCGCTGCCATCCTCAAGGTGGTGGGCGACCA
GATTGGTTCAGCGATCGGAGGTCAGATCACCCTGCAGAAGAACTTCGACG
AGGACCTGAAGAAGATGAAGATGGCGCTGGAGTCTGTCGAGGCGGTGCTC
AAGGCCGCCGAGAGACGGTCTATTACTGATGAATCGACACGTTTGTGGCT
GAAGCGGCTTAAGGATTTCATGTATGTCATCTCTGACATGATGGACGAGT
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GTTGGAGCTAATTTAAATGTCAAAAGTATTTGTGCTACAGTGAGTTAATT
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TGCTGATAAGAAGATTCTTATTGTTTTAGACGACCTCTGGGAGGGCGAGG
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AAAGTGGTTGTTATTATAACCACACGGGACGAGGGCATTGCAAAGAAAAT
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GGTCTATAATAAAGCAGAAGAGTGCATTTGAATCTAGAGGTGGCGGAGAA
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ATTAGCAGCTAAATCAATTGGACACACGCTGCAATATATAAAATTTAGTG
AATGGGAATCCTTGAGGGATAGCAATATATGGACTTTACATTCTTTGAAA
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GGTTTTTCTACTTGGCAACTTGGTGAGAGATACATTGGTCAGCTTTTGGG
ACTCTGTTTCCTTGAACATTCAAATTCGCAATCGGTAAGTTAATGCACAC
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TAAAATATATTGAAATATATGAGAGCATAATACACCATTGATTTGTTGCT
TAGAACTCACATTTTTTAAAACTACTTAAAAGATCTCATGGGTTGATATT
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TAAACCAGCTGGAAAGATCAAGCATATAACAACTATGCATTCTATAGTCT
ACTAAGGGCATCCACAACGTTGCCATAGCTAAATTTCTGATAAAGTACTA
TTTGGCGTTGGTGTAAAATTTGGCAACAACACCATAATGTAGCTAGTTCC
AAATATTTGTACAACAGTTCCCACAACCGAATAAAGTTACATAGAGAATG
GGTGTTATCTCCTCTCCTCATGCATGTGCATGCACTTTAGTGTTGGTAGT
TGAACAAAAATTATTAAACAATTCAGGATCTGACCGTCGTGGACTGGCGG
TGGCGACCTAGAGCAACTGGTGAAAGATTAGGTGACAGATGATCTTGCAC
CACATTGTCAGGATCTGAGCGAACAAAGTCTCTTCACAACCAATACTGAC
CATGGAAGTTGTAGGCCTCGGTAGCTTTAGCACCGGACAACGTAAAGTCG
GATGGGCCCATGAGTATCTAAAGGATTTATACACTAGCCAATTATTTCAA
AAGACCGAAAGAGGTCGAACAATATATATATATTCAGTAGTATCCACTGC
ACACTTTCAACGACAACCCAGCTCTTTGCCTTTGGATTTAACACTAGTAG
TACCCACGGTGACGTTCCCAGTCTCCTCAACAGACCGAGTTGAACTCTGC
GACTCAAACTGCTGCAGATGACCAGCTGAGACCCTGAGACGGATGCTGTA
CCTGCTGTCTGGGAACCTGGACGATGGGAGGGCCGTGCTCAGCAGAAAGG
CTGTGGCTGTGCTGATTCGCTTTGAAGAGGGAGGGGCTGCTGCCCACACG
ACTGATGGATCTGCTGGCCAGAACCAGATTGTTGCTGCACGGTGCACGGT
GGACTCCTGCACCTGAGTCTTCTTGTTCTTCTTTGGGCGCATGTCTCGGA
GAGACGCACTAAAATACCAGGGCGCTAAAAATGTTTTTGGGCGCATGTCT
TGATGTTTTAGCGCGCGCGGCAGGCGACAACGTGGCAATTGGCAAGAAAT
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ATGAGATCTTTTTGAAGATCATCATGCACATCGGCCTATCGAATCGAATG
ATACAAGGCAGTAAAGCAGGCCACCCTCTCTTCTCACCTATGCACTCGCA
CGAGTTGTCCCATCAAGTTATAGGAGCAGTCTAAGTCTTGCTCACTCTCG
TCCTCGATATACCAAAGGATCTTTTGATCCCAAAATCTAGCCGGTCCTCT
CACAATAGCAATTTGGGCTTTCAAAATTCTAAATGCTCTCTCCACATCTT
TCCTAGCCGCTGCTTGTGCATTATGGAAACCTAGTTTTTCTTACCTTGTG
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CGGTGGACCTTCACCCATTGTAATCTGTGTCACGAGTGGTGATCATTGAA
GAACATTGATATCATTGCAAGAACCAAACATTCTGAAGAAAGCATGTCAA
ATCCAAGTCTCATAATCGCCCACTGCTTCAAAGATAATAGTGAAATCCTT
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TCCAATGCATGCATTCAATTAAGACAAGCATACTTGAAAAGCCCCTAGCT
TTGTTGAATTCCGAACGACTAGCCGTGTATTGAGCATTGGGGGCTCTCAA
GTACTCACCGAACACTTGCACAATTGCTACTACATAGCGCTTGACACAGT
TGATTGCTTGACTTCCACCCATTACCAAGTGTTCATCAACTAGATCCGTC
GGAATACCATATGCCATCATACGCGAGGCGAAAGTCACCTTTTGGTAAGT
GCTATGCCCAAGTTCTCCGGCGGCATTCCTCCTTTGCTCAAAATACTGAT
CATGCTTCATCACAGAGTCCAAAATTTCCTTGAATAACTTGATGCTCATC
CTAAAACAACGACAAAAATAGCTTCTGGGGCATGTGGGATTGTCCACGAA
GTAGCTCTGCATCAACTTGTTGTGACCTTCTATGCTTTTCCTTCACAAAT
TCCATCAACCAAAAACGGAACCACCGTGCTTTGGCCTTTTATTCACATGC
ATAGCCAAATAGCATAGCTATGTTCTCTTCTTATTCAAGGTCCCATTCTT
TATCAGATGAATCGCAGGATGAACCCATCTACAAGAATAAAATCGGACTT
ACTCAAACTAGCCACAACACTCAAGAAATAAAAAGCGGCGACTTGGCGGG
AAGATATACCATGCATTGATTGTATCAAACACCTTGTGTGCGCCGATTTG
CTTGATGGCTATCGGGCGCTGGTCGTCGGACTGCTGAGTGCACTAGATGT
TGAATATGTGTGGAACGGCAACGTAGCAGTGCGGCGGCGGACGGTCCTAA
TCGGCGGTCGCGCAAAGGGCTCCCGTCACCGAATGGCTTCCACCGCCAGG
CGTGCACACGAGGGAACCCTTCCGCACCGAATCGATGCTCATCGGAGCTC
AAATCAACTCATTCGAGCTACGGTGGTGACAGGGAACTAGGGAAGATGAG
TATTTAGATCGGCGGTTGGAGCTTTTTGCGCGTGCTAGAGTTTTCTAGCA
CGCTAGAGCCGGCGCACAAAATATGTCGCACGCTAGAGCGCCTTTTCCTG
CCTCCTGTGCAAAAATCGATGGTTTTTAGCGCACGGCGGTGTTTTAGTGT
GCCTATTGGAGATGCTCTAAGCATGCTCTATATTTTGCGGGTATCTAGAT
ATGTACTAAATGAGATCTAGAGTAGACCCGAGCATTACCAATTGGGCAAC
TTCTTATAGTGATTTTTGATAAGCACATGATTCAGAATAGCTCTTAGGGC
ATGTATAATGGGGTGACATCAGCCTTCCCTTAGACCTACCATATAGGATT
TTTGCTGTGTTGGAAGAGAGATAATTAATAAAGAGGAGCTTTTCTTTCCT
AGATCTCTTATATTCTCTTAAAAAATAAGAGAAGGCTATTTTCCCGATTA
TACCACATGCCTTTTTAATTTAATTAATGTTATTAATTATAAGATATCGC
AATGAGAGATGATGCATTATACACATTGTAGCTCCTGCCTTCTTCAAATG
ATGTGGAAGGCTAAGAGAGTACATGCCTTTCTACCATTGTATATTCCCTT
AGTTCCCATCCGCCCGCTTCTATATGCGCACATCGGACGGTACTTCTCAA
TGGCTGGCCTTGTGAGTAGGTACCCTCATGGAGGCCCGATTAATTTCTAT
AATTAATATAAATTAATTAATTTGTAAGTAGCCTATATATCAACTTGGAA
TATCTGACATTTTGGAATGATTTTGTTGCAGAATATTGAGCTATATTATG
AAGACATTACATTGTTAACCATGCATGACTTGGTGCATGATTTAGCAAGG
GCAGCCATGGATGATGAAATACTTGTCGTCAGCAAAGACGATAATGTTGA
GGGAAACTGCTATCACTATGCATTACTGGATGATTGTAGCAAGCCATTAA
TTTCAGAGTTATCTAAGATAAGATCACTCCGTTTCATGAAGTGTGACAAA
ATTAAACTTCATGATGCTGCATTTTCACCTGCTAATTCCCTGCGTGTCTT
GGACTTGAGTGAGTGCATCATACATAAGTTGCCAGATTCTATTGGTGTAT
TGAAGCAGCTAAGGTATCTTAAAGCTCCGGGAGTCCAACATACAACTATT
CCAGATAGTATCACCAAACTCTCGAAATTAATGTATCTGGACATTCATGG
ATCTACTGCAATTGTGGAGCTACCAGAGTCAATTGGAGATACCGAAGGAT
TGGTGTATCTTAATTTGTCAGGTTGTTCAGAACTTGCAAAACTGCCAGAA
TCTTTCAGGAGGCTACAAAAATTGGTGCACTTGGATTTGTCAAACTGCTC
TTGTGTTCAAGGTATATCGGTACTCTTGGGGAACCTCACACAACTTCAGT
ATTTGGACTTATCGTATTGCCCAAATATTGGTGAGCTACCAGAAGCTCTA
GGTGGCCTTTCCAAACTGCAGTATTTGAACCTGTCATTCAGCTCATATCT
TAAAGGTTGCAAAGAAGCAGATGTTTTGGGCGCCCTCACCAATCTCGAGT
ATTTGAACTTATCTTCAGAGGGTTGTGGTCTCAAAAAGCTCCCTGATGCT
TTGGGAAGATTTATTCAACTCAAGTACTTGAACTTATCAGGTTGTTTGGC
AATGAGAGAATTGCCTATATTATCTGGGAGTCTAAAATGTTTGGTTCATC
TTGATTTATCAAATTGTGAGATGGTTAATAATCTACATGAAGCTTTGGTT
GGTCTTACAAATCTGCAGTATTTGAATCTAAATAAAACAAGACTCCGTTC
GCTCCCAGACAGCCTGAGGAAAATTCGGTATTTAAATCTAGCCTGTCTGA
ATAAGAGAATAGCTGCTGGAATTGGCTTTGCAAGTTTAATCAACAATGTC
TGTTGTAATATGTCCGATCTAGAGCATTTGAACTTGTCCGGTAATTGGTT
TATTTATAGTATACCTGAAAGTCTTTGTAGCATGAGAAAGCTGCATACAT
TGGACCTCTCCAACTGCATTAATCTCGGGGAGTTACCATCAAGTATAGGT
ACAATTGAGAGCTTGAAGTATCTGTATCTAAATGGTTGTCCAATTTCCAA
AGTCCCTCAGCTCGGTAGCAGTGCAATATCATTGCCACACCTTGTGGTGC
AGCCTGGTAACAGTGACTCTAGCAGCAACCTCATCCAACTACAACAAGTG
GATCCCGTTGTCCTGCAAATAAGTAAACTTGAAAATGTGAAATCCGTAGG
AGAGGCACAACATATAAAACTAATGGAAAAGAAAAGCCTTTATGATTTGA
AGCTGGAATGGACGGGGGATGCTGAGAGATTTGTTGATGATAAAATGTTG
TTGGAAAAATTAGAGCCACCAAGCACATTGAAGAAGTTGGAGATAAGTGG
TTACAATGGTGTCATCTTTCCAGCCTGGCTAGTGCGGGACCAACTACTAG
ACCTAGAGTCACTGGTCTTCAGAGGTATGTTGAACCTGGAAGAGTGGAAC
ACGTCATACTCTAGTGGTGAGGAGCACATGCTTGATAAACTGGAAATACA
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AGATCACACATCAATGCTTCAACAAGTTATAATGTGTTGCCATTTTTTTC
TTGGGATACTAGGTTGTCAGTTCAATACTGCAAAGTGGCTCTGCGTCATT
GGAGGTTGCTTGAGCACTTGCCTGGAATCCATTCTTTGTCCATTCATAGT
TGTGGTGACTTAACCGGCTCACCAGAGAACATGAGGCCACTGAAAAAACT
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GGTTAGGAGAATTAACCTCTCTCCAGGAACTTGAATTGAGGGATTGTAAA
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TACCCCTAATGATAGTGGCCACTACTAGTGTATAGATCGGCATAGTAACT
TGGGGATTTGCATGCAGTACCGGCCAGTGAATCAGATTTGGAATCATCCT
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CCAGAGAGAAAGTTAGAGCTGAAGGAAACGGCTAGGCCTCTCAGGCTTAA
TGGTGAGAGGCAGGCCGCAACAAACTCGCCAGCGCCACTCGAACGTCGAC
AGGACCCGAAGACATCGACACAACCGGTAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.