Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA016869

[Submit comment/correction]

Sequence
AA016869
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA016869
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CTTCGGCACGGTATCCGTATATGTGTACAGTTTCGCACTGGACTCGAAGG
TTCTGCTTCGTGACACACCGGAACCTGAAGCGCCGACCCGTTCACTGATT
CTCCGGCCAGCCATGAGGGTCTTCGCGCTCCTCCTCCTCCTATGGATCTC
CACCGTCGCCACCGCTGCGTCCAGTCCGCCCCTCGACACCCTCGGCATCC
CTCCGCAAGGTTTCCCCCCGGATCTGTCCGCGCTCTGCCCTCTTCTTCGC
CTTCTCTGCCTTCGCTTGGTAGATGCGGTTCTGATTTAGCATTGCTGGGC
GCAGATGAGGCGTACTACAGGGGCGGCGTGATCAAGTGCAGGGACGGATC
GGGCAAATTCACCAGGGATCAGCTCAACGACGACTTCTGCGACTGCCCCG
ACGGCACCGACGAGCCAGGTACCCCGCCTCCTTTTTGCTTATAAAAGTGT
TTTTTTTTTAATGTGGCGTGATTGCTCTGAGATTGCTATAGAGTCTTAGG
TCCATGTCCTGTCCGGGGTTAGTTTTGAACTGTGGAAGTCTTGGGAATCC
AAGAAGCGCCTTAGATATGTGAAAGTTGGGATATTTCTCAGTCAGGCTAA
TGAATTTGCGCCAATGTTGGAATGCGCTGTGGCCGAGCAGTTAATCGTAT
CATGTTTTCTTTCACCTTTGCAGGGACATCTGCGTGCCCAGAGGGGAAAT
TCTACTGCCAGAACGCCGGCCATTCTCCAATCACCATCTTCTCGTCGCGA
GTGAATGATGGTATTTGCGGTAAGAGGCTAATAACTGATGGATTGTTTCT
CTTTGTTTTATTGCTTGATTCTGCTAAAATTAAAGATACATGGTATGAAA
CAAGACTATAGTCAGAGGAACTGGCTGGACCTCCTGTTCCAGTGACCGCT
GTGATTGTTAGAAATCCTGCAACATTATTCTAACTCCCTCTTCTTGTTCC
TCATTTTCTGGTAGATTGTTGCGATGGGAGCGATGAATATGGTAGCAACG
GCACTTGTAAGAATACGTGCTGGGAAGCTGGCAAGGCAGCCAGGGAGAAA
CTGAAGAAGAAAGTAGCTACATATAAAAGTGGTGTCGTTATTCGGAATCA
GGAAGTTGAAAAGGCTAAAGTGGCACTTGCTAAAGACGAAGCAGAGTTAA
CAAAACTGAAGGGCGAAGAGAAGATACTCCAAGGGCTTGTTGACAAGCTC
AAAGGTGAGTGCCTCGGCTACGGTCCTTCTCTAAAGAGGGATATATTGAG
CAAATATTCTTGAAGATGTTAACTGCAGTGGGTAGTTTTTATGTTAACGC
AAGACTGTCCACTATGCAGAGCAAAAGAGATTAATAGAGAAGGCAGAGGA
AGAGGAGCGCCTAATAAAAGAGAAGGAAGAAAAGAGAATCAAAGAAGAAG
CTGAAAAGCAAGCTTCTGAGGAAAAAAAAGCGCCTGATTTCTCTCAGGAA
GCAGATTCTCAGGACACTAATGAGAATGCTCAAGAAGGTGAAAGCAAGGT
TGGCATTTCTTTCTGTATATTGGTTTACCTCCTGACCACATTCCATGTTG
GTTACTGCCATCCTCAGTTTGAAGAACTCACCATCATCCATAATATCAGA
AATTGACTCTACTTGATATGAGTATAGCTTTGAACTTAATTAGTATAATT
GGGAGAGAACTGCCATCAATCAGATGATCTAATTGCATATTCTTATATCA
TTCACACAAGTAATCAAGCAAGTATGAAATAAATGTTTTCTGTAGTTTCA
TATTTCTTTGATCATTCAGTATTTCCTTTACAAAATAAGGCCTTAAATGG
TTTGTTTAGTTTTAGGGTTTGGGGCTATATGAACTGAATTGTTAACCTCT
AAAAACCTACCTGTTAACTTCCATAGTCGCAAATTCCACAAGCATGCACA
CATCAAGAAGACTCTCCATGAACCCTGGAGACTGAAAGCTATCAAGAAAT
AATTTTGCATCGTCGTCAAGGTTATAACAGCTAAGGGAGGATGATGTACC
TGACCACTGTGATACTAGCATCAGCAAGTCGATGCAATTGTAGATACTAG
CATCAGCATTTGTATGGAAGCAAATTTGAATAATCACTATCAACCTCCCT
AACAGATCCACCTGACTGACCTCCTTCACATAAAGCTATAAAGAACTATT
TTTGTATCATGGTCAAGGGTATCACGGCGATAGGGCGAGGCTAGGTACCT
GACCACCACCGCAGTGCCTTAGTGCCCTATGCATGTTGCAAGGGATATGA
TACTAGATACTAGCATCCTTCTTTGTATGGCAGCAAATTTAGGTAATGCT
ACCTCCCTGACCCTCCCCTTTATTGAATGAGTAATCACTATCAACCTAGC
TGACAGATCCACCAGACTGGCCCCCTTCCCATAATTTATTGATTCTTCTG
TCTCTTCTTTCTTGCTTGCTCAAGATGACAATATCAACTCCTCAAGGCTT
CAATATAGCAGGAAAAAACAGTGAGGTGAACTAGAAGAAACATATAGGTA
GCTGGGAAGGGGGCAGGAAACACACCTCGACAAAGGCAAGCTGAACTGCT
GCTACGAGCCTATGATAACTTGGAGTCCGTTGATCCCTCCGCGGCTACTT
TGCTTAGGCGAAACCTAAGTGACACCTTAATGACAACAACCACGATTAAC
TAAGAAAGTTCATATGACTGAAGTATATAGAAATGATGACCATTGCCAGC
GCATAATGAAGTCCTTGTAAAACAAAACTGATTATAATTACCTTAGCAGT
TTATATTCGAAATTTTGTTTAGTCCTCACTCCTACCATACAAGAAATAGG
CACTTATTGCACACCTTGTTACTGTAGTAAGATATTTAAAATAGTTTATT
ACGTTGCTTCTGTTTAACATAGGTATCTGAACATCATGATGGACATGTCA
CGGACCATGACAATCACTCACCAGAAAGCAAGACATCTGCTGAAGAGGTA
TAACTTAGCTTTGGTAGCCCAAGATCAAAATTTTATTTGCCTCAGTTATC
AGAATTATCTATTTATATATATACACTGTGTTTCTGTGTCAGCATGACAT
TACAGCTGGAGCTGGAGATGATGCACCACCTGAGACATCTGCAGTACCTA
CAAAAGAGCAGGTGGTGTAATAATTGCTTTGCAGCTAACTTGTACCACTG
AACTTGTTTAATATTTTTCTTTCCAATTTGATAGCATTATACAGATTTAT
CTGGTTATCTTCTCCCTTCCAAAGATTAAACCCATATAAATAGGCAACTG
CTTATTCTCCCCCTTATGACTCGTAGAACAATATGCTTACATTTTCTCTC
CAAACATGTTTAACTTTTTGCCCTTTATGTGCTCTCATCATGTACATCAG
GTTGGCCAAAAGCTAATTAGTTATTGCGAGTTAAACCCAATTATGCGCAT
AATGCTACGCGTGGCTCGCCATATGGACTGCACATGAACAAGCCATGTGG
GCGGACATGCATCTGGGGCTGAGCGCAGAGCTACCATCAGTTGGCCCTAG
CATGCAACCAAATAAGGGCATGGATCATATTTTTAGGGAGTTACAGATTA
TTTACTATTTGTTAGGTATATGATTTAGTTTATTTTTGCTACATAAAGGG
GTTTCCAGAGCTATCTTAATCCAGCAAGAATCAACCAAAGTTATTCGATC
TCATCTATAGCTCCCCTCTTCCCTAACCAGCCACCTGGCCATCCTCTCAG
TGGTATCACTCACAATGATCTTATGTACTTAGTGGTACCACAACTATCTT
AGAAACCATATGCTGGTCCCCGTAAAAAAAGGAAACCATATGACAGGAGA
TGGGTCAAATGCATCTACTTAGTGGTAATTTTTGTAATCTATGTTTTGGA
ATGTAGTTTCTGAGAACGTCATGACAATCTACATGCCATCCTTTTTGTAT
CCAAGTACAGTCGATAAGCTCCGCAATGTGCTGTCTACATTTGTGATGTC
CCATAACTGATAAGCTATATCCGCCAGGCTTGTCTTTTCACATTGTTATT
GTCCTTATGTCCAATTATACTTGGTTAAGAGCAGACAACTTTTTGGAGAC
ACTGTTGCTTTGACTTATACTATTAGGACACCCAAAACAATACTCGTATC
AATTTCTGTCGGTTTCTTGGGAGTGCATTTGCATCTCAGGTTATGAATCA
TTCTGTATATTCTGCAGGACCCTACTTCTGTCAACTCTGAAGGTTTATCA
AAGGAGGAATTGGGTCGTCTGGTAGCTTCTCGCTGGACTGGAGAAAATGT
AGATGATGTTGGCAAAAACGATAAGAAGGGCCATGATGATGATGAGCTGG
ATATACCAGAACCTGCAGATGCAGCACTTGAAGATGAGCATGATATACCA
GAACCTGCAGAAGAGAATTATGCTGGGTATCATTCAGAAGTTGAGGATGA
TAGGCACAAATACGATGATGAGGAGTTATCTAATGTGTCAGATGATGAAT
ATGTTGATAATCATGAAGAACCTGATGGGTCTTATAAATCTGATGACGAC
CAGAAAAGCAATTACCATTCAGGTATTATATTCGTATGACTTGACAAGTA
TTCATGTTCTATCGTATATGATTGTTGATTATTGATTATATTTATTCGAT
TTGTTCCTTCAGATTTAAGTACCTCGGGACAAGCATCATGGTTAGACAAG
ATTCAGCAAACTGTACAAAATGTTTTACAAAAATTCAACTTTTTCAAGAC
CCCTGTTGATTTGTCAGGTCAGTCGTACAGACTAAGTTTGTTGATCCTTT
ATGAATTATGTGAGGATGTTGTAAAACTTACGCATCTTTGATTTTAGAGG
CTTCTCAAGTTCGGAAGGAGTATGATGATGCCAGCTCAAAGCTGTCCAAC
ATTCAGTCTAGGATAACATCTCTGACAGATAAGCTAAAGCAAGACTTCGG
TAAGTTGAAAACTTTGTTCCCTCGGTGGTTAAGTGCACCCCTCAGTTCTA
CATATACTTAGCTACTAATTTTGTTAGGGATGTTTTCTGTGTTCTTGTGC
TTGCCATTGTTGAAATACTTCTCACATCATCCAATTAAGTGTTTTGTTCT
TATTGTTAGGATTAATAAAAATTGTGCTAACACGGTTCGTAATAAACAGT
AACCTATCAGCATGATTTTTGCCTAGACTGAAGCATTTAGTGACTTTACA
ATGACTAAAGAATAACTTAGATAGTCATTTACAAGATAGTGTATTCCAAC
CATATACAAATTAAAAATAGGCATTTCTATCTTTCTATCAAATATCTTTT
CTGGGTTTTTGCTTAGCCAAGTTTATTAACAAAATTTGCATTTTGATTTT
TGGTACCATCACTATTTGAGGCCTCATTTCTGTAGAACATTATATATTGC
TCTGTATTACAAGTTACTTGCTACTCTAGATACTGACTTCATCCGGAGTC
TTGTTACGTTACCTGAGTAAATTTCTGGAAAAACTGTAATTAATCGAAAA
AGTCCATTCTTGTTAGGCAAGGAGAAGGAGTTCTATTACTTTTATGACCA
GTGCTTTGAGGGGAAGGAGGGCAAGTATGTATATTTTGGGCATCCAATCA
CACATGATATTTCGAACATTTCCATTCATATTATATTTAGTTTAATTTAA
CTCATTCGTGAATTGTGATCCATATTACAGGTACGTTTACAAGGTCTGTC
CATACAAGAAAGCTTCACAGGTTGAAGGACACAGTTCCACTAACCTAGGG
TATGTTTCTCACACCTTTCAGATTCTTTTTTTTTTTGGTTATCCCAAATG
TAATCCTTTGATGAAACTTCATATATGTAAGTAACATAACTTCAGATAGT
TTCGTCCACATCATGGTGATATGTTGTAGACATTCTCACATTCATGCTCA
ATATGCACAAACACTGAGTTATACTGCAACAGTGTTATTTAAGAAAATTA
TTCTTAAATAACGTTTTGCAAAATTATTCTTGTATCGGAAATTTAAAATT
TGTGGGTTCAGGCGCTGGGACAAATTTGAAGAATCCTACAGGATAATGCA
CTTCTCAAGCGGAGACAAATGCTGGAATGGCCCTGACCGAAGCCTAAAGG
TACTCCTCCCTGTTGTTGAGGGATGCATTCTACTTGCGCATAGTTCTTTG
TGTCTGCAGGTCTTAAAGTATAACTGTGGCTTAACTTGTATGCAGGTTAG
GCTTAGATGTGGGCTGAGCAACGAGCTTAACGGCGTGGATGAGCCCAGCA
GATGCGAGTATGTACATTATTCATTCATGATACATCTTACAATCTTTTAC
CAAATACACATCATGCCATCTTATATGTACTGTGTCCATTTTCTATGTTC
AGGTATGTCGCTGTATTGTCAACTCCGGCACTATGCGTTGAAGAGAAGCT
GAAGGTTCTTTTTCTCCCGATAACGAATGTCTTTCCTTTCTTTGCATTGA
GATCCGGAGCTAATGAAGATTTGGGGTTTATATAACAGGAGCTGCAAAAG
AAACTGGACGCCGTGTCTTCAGACCTGTCCGGCCACGACGAGCTCTAAAT
CGTCTCACGAGGAAACAGCGACTCCACCATTACAACAACCATATAACCAT
ACGAAAGGCTAATGAGGAGCACATGGATAGAAAAGCCTGGAACTGGAGAC
GGAGCTTGTGAGTGTAGCCTCGCGGTTACTGCCAGAGCAACGTTAGTTTG
GTTTAGGGAGATTATATTTTTGAGCAAAGCGGTCGGACGGTTGGATTTTT
CACATCAATCCTGGTTTGCTAGTAGAGGCAAAACTGCAACCGGACATCTT
CCTTTTTCTCCCTTTTGGCGTTTTCTCTAATTATTTATCTAGATCATCTG
AAAGAGACTACCCTTATCCTGGATACTTGATCTGGATGC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.