Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA015960

[Submit comment/correction]

Sequence	AA015960
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA015960
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CCGTAATCACCATAGGCAGTCACGTTCGAAGCTCAACCCGACACAGCAAG CCTCGCACGCACCACTCTCCTCCCCATTCTCCTGTCGCCGGAAACGCCTA AAACCCTAGGCGTGTGTGCCGCACGTGCGTCTCGAGGCCGGAGCGGGAGG CGTCGGCGCGGAGATGGTCACCGGAGTCGACGGGGAGAAGGCCCCGGGCC TGAAGCTGGAGACGCTGCTGGCGCTCGGCCTCGACCAGCGCACGGCGGAG AACGCCCTCGTCAACAGCAAGGTCACCGCCAACCTAGCCGCCGTCATAGC AGAGGTAGTAACAACGCTTCCTCTAGTTTGTGTAGTTTTGGATTCGACGG CAGCTCGTCTGTGTGGTTGCTGCGGTCTTTAGGGGCTCAATTTAGGTTTA ATTGGTCAGCCGTGTGGTGAGGATTCTGGTGGCTCTAGTGTTAGAATTGT TCCGAGGAGGGGATGCCTGATTTATCGAGATTTATCTCAGACATGAAGTA TTTTTTCTTATACTTAGCTCGTCCCAACCTGCAAGTGAACATTAAGCTCG AACCGTTCGAAAGAAAAAGTAAGCTCGATCTAGAGATGCCCAAATCTGAC ATCCTATTGTACAGCGTGTCGTGCTACCTCTTTTCTAGGCAGAACAGAAA AATTCTATTTGTTCCAACTTCATTGAATGTTCGTCTTACTGGTACCCATA CCCATGTTTCTAAGGATGATGTTGCAGTATTCACAGTCTTTTATGATGTC ACATTTTTCGAAGGGATACATGATTCAGTCTTCAGTATGACATGAATTGT TTTTAGGATACAGAGATTTCGGTAGTTCTAGTTTTCAGTTATCACTTATA TTATGCTGTCTTACTATGTTACCCCTACTTCTGCTGCTCTATGATGCAAG TTGCATTGGCTTACTGTGAACAAATCAGTGCCATTTATCTCTTCAAAATT GACCATATTTTCTCTTTTAACCTAATTTGCCTATGAACAGGCTGGTATAA GTGGATGTGACAAGTCAGTTGGAAATCTTCTCTATGCAGTGAGTGCCTCT ATCAATGTTTCTGTAGTTTATACATTTGAGTTTTTTGATGCGCGACTTAC AAGGGTGCACTTTCTCTTGGATGAAATAGGTTGCCACTAAATACCCAAAT AATGCACTTGTCCATCGTCCTGCTCTCATCAACTATATTGTGTCAACGAA GGTATATCTGCTACCTTTTCCGTTCTCCAGTCGGCATTCAGCAATCAGTT TGCATCATGTGTTCCTTTGCGGGAGCATAGATGAATAATAACTCTGTTTC AATGCTCATTCGTCTTAATACTGTGAATGTGTCAATCTGATGTATTTCTT TATGTCTCTATTCAGATAAAGAGTCCTGCACAGCTAGATGCTGCCCTGTC ATTTCTTGCAAATGTTGGCCCTGAATCTTTGGATATTGGGAAGTTTGAAG AAGCCTGCGGTGTAGGTATGCTTTTGCAATAGAAGAGTATATGCTTCTGC AAATTATAGCTTATGTGTGCCACAGTCACTGACTGGACACTACAGAAAAT TAATGATGGTGACTTCGTAATGTGCTTGTTCGGATGCTAATATAGGATAA TTTTACATTTTTGATGATCGGATATCAAAGGGACACCTTTCTTTGAAGTA TCATATTCTTGATCAATTCTTTCAGTTGACCACCCTATTGATTGGAGCAT GATGTTTAACTGCAGGTGTGGTTGTTTCGATTGAAGAGATTCACTCAACT GTTGCTGAGGTTCTAAAGGGAAATATGGAAGCTATACTGGAGCAGCGGTA TCACATAAATGGTTGGCTTCCAATTCAATTTTAAATTACTCAATTTTCTG GTTAATTACTTTAGGGAAGTGGTCCTTCATGTTGCTTATCTTTCTTCCAG TTGGTAGCCTATGCGGACAGGTTAGGAAGAAGCACCCCTGGGGCGATGCT AAGGCGACAAAGGTGGGAAAAACACATTGCTATAAATAAAGCACCTGACT TGTTTTGGTTGTATTAACTTCATTTTGAACTTCATATTTTGCTCATACAG GACGAGATTGAGAAGAGGCTTGCAGAGATTCTAGGTCCAAAGACGGAAGC TGATAATGTAAAACCTGTGAAAAAGAAGAAGGAAAAGCCAGCAAAAGTTG AGGTTGGAGCTGAAGTAGAGCCTTTCTGTTTAAAGTTTGATGATTTGATT ATTGTGATTATTGAATTAGCTAGCCATACTTTCTGTGAAACGCAGGAGAA AAAAGTTGCAGTAGCCACTGCTGCTCCACCATCTGAGGAGGAACTGAATC CATACACTATATTTCCTCAGCCAGCAGAAAACAATAAGGTATCATAAATT GCAAGTTAAACTGATTAAATGTCTGTTAGTGTTATGTATCTTAATTCAGC AAATTACTGTTCTATGATATCCCCATGTGGTTACTATTGTTCTTCTAAGA ACTTCAATTGGCTGTTCTGTTGAAGTTTAGGTTATCACCTATAAGGAATC AACTTACGTGGTCTTTATTTTTTTAACCGAGCTAGGTTCATACGGAAATA TTCTTCAGCGATGGGAACATTTGGAGGGCACATAACACAAAGGAGATATT AGAGAAACATCTTATGGCAACTGGTGGAAAAGTGATGACCCGTTTCCCAC CAGAACCTAATGGATATCTTCATATTGGGCATGCCAAGGTTTTAGAATCT CCATGAAAAGCATTTCCCTATATACCACTTGCATGAAAATGGAAGATTAT GCTTACGTTCTTTATCTGATTCAGGCTATGTTTATTGATTTTGGACTGGC TAAAGAGCGCAATGGTCATTGTTACCTTAGGTAACGCCATATATTTTTCC ATTTGGAACAGTTTTCTCCTGCCTGCTATTTTGTATCCTTTCTTGGCCTG TTGAGGCCACTTTAAGGGCCGGGCCATTTTGTACCTCTTTATTTATTTAC TCATGCCTGTCTTGACCATGTCATTAAAAAAATACTGCTTGAAATTTATG TTTTTTTCTTACACTATATACTGCTACTATTTAATTATGTACTCCCTCCG CCCCAAAATGTAAGGTGCCTAAGATTAGTCAAAAAGCCAAATCCTACTAA TTTTGACCAAATATTTAGGAAAAAATATCTACATCTACAGTATTGAATGG ACACATTGAAAAAGTATACTTTATGGTGAATCTATTGATATTGGTTCACT ATTATATTGTAGTTGCTCATATTTTTGTGTATAAGCTTGGTCAAAATTAG AAAACGTTGACTGTTGACTAATCTTAGACGCCTTACATTTTGGGACGGAG GGAGTATTTCCATTTTCAATTAGGAGTTCCAATTAGTTTTGCTTTATCTT GCTGCTTTTGTTCTTTTGTGGTCACATTCACTAAAAAAATGGACTGCTGT CTATTTGAACAACAGGTTTGATGATACAAACCCAGAAGCTGAAAAGAAGG AATATATTGACCACATCCAGGAGATAGTCCAGTGGATGGGATGGGAGCCC TACAAAGTTACATATACAAGTGACTATTTTCAAGCTTTATATGAGCATGC AGTTGAGCTAATACGGAAAGGACTAGCCTATGTGGATCACCAGGTTTTTT TCCTTTCTCCTTTCTTTGTCATGGTACAATAGTATATATGAAAGCCGGAA ATGGACATAGATCGAGTCCTTGAGAAATAAAATGTGCAAATGCTGACTCT TGTATGATTTGCCAGACTGGAGAACAAATCAAGGAATGCAGGGAAAAGAA GATGGACAGTCCATGGAGGAATAGGCCCATTGAAGAGTCACTGCAATTAT TTGAAGACATGCGACGTGGGATGATTGCTGAGGGTGCAGCAACTCTCCGA ATGAAGCAGGACATGCAGAATGATAACAAAAATATGGCTGACTTAATTGC TTATAGAATAAAAGTAAGTTACTCAACTTGATTGATGAATTGAATGTCCA TATCTCATACATAACTCAATCTTTTGATGCCCATATAGTTCACTCCTCAT CCACATGCCGGCGACAAATGGTGTATCTATCCAAGCTATGATTATGCCCA TTGCATGGTGGACTCATTTGAAAACATTACACACTCAGTAAGTTTCCCCT TTTCACAATAGCTCTGGCTTGTTTGAAATATATAACATGACTAAACGAGT GTTTATTTATTAGTTGTGCACGCTTGAGTTTGACATACGTCGCCCGTCAT ACTACTGGCTACTTGTTGCCTTGGGATTGTACCAGCCTCATGTCTGGGAG TATTCAAGGCTGAACATATCAAATACAGTGATGTCTAAAAGAAAGGTATG TTAAAAACCGAGAAATCGATATTACCCTGTTGGATCTATATTTATGAATA TCCATTGTCCTTGTTCTTCTGCAGTTGAACCGGCTTGTGACAGAGAAGTG GGTAGATGGATGGGATGATCCTCGTCTGTTAACACTGGCAGGACTGCGAC GACGGGGAGTGTCAGCAACCGCAATTAATTCATTTATCCGTGGAATTGGG ATAACAAGAAGGTAAAAGCATGAATAATAGTGAAGGTTTGCATGAACTGT GTTTTTGGCCACAACCCAAAGTCTCTGTTTCTGCTACTGATTGGCCCTGG ATATTCTTTATGTGCAGTGACAATAGCTTGATTCGTGTTGACCGTCTTGA ATATCATATCAGAGAAGAACTCAATAAAACAGCTTCTCGAACCATGGTTG TTCTGCATCCTCTAAAGGTTTGGCATTCTGTTCCTGCTGCAAACTACTAC ATGTGTCTTTATAAGTTCCCAACGCACTGATGGTGCCTCCCTTTGCTAAA TTAGGTTGTTATAACTAACTTGGAAGATGGAAAAGTCATAGACCTTGATG GAAAGAAGTGGCCTGATGCTCCTGCTGATGATGCTTCATCCTACTACAAG GTGCTCTCTTGCTCAGTATATGATTAGGAGAATATGTTTTGTTGTTGTAT ATAGCATGACTTGCTTAAAATTAATTCAGAAGAACGCAATAAATTTGCAG TAGCAGAAATATTTAGGTTCACTATATCTTTGATGCCTTATAGGTTTTAC CTAATGTCCATGGTTCATAATTTTTTTTGTGCTACCTATCTACAGGTTCC TTTCTCAAGAACTGTCTACATTGAGAAAACTGATTTTCGCCTTAAGGACT CGAAAGATTACTATGGGCTAGCTCCTGGTAAATCTGCCCTGCTAAGGTAA TTGATCTAGAAATGCTGTTCTTCTGTTATGAAAATAGATTTGAATTTACT TCACTATTGATGGTCCACCTGCTCCATATCAGCATGTTTACGACGTGGTA CTTGTATGACTAGGTATGCATTCCCGATAAAGTGCACAGAGGTTGTTTAT GGTGATAATCCAGATGATATTGTCGAAATTCGAGCTGAGTATGACCCCTC AAAGACTTCTAAACCTAAGGTAACCGGTCATTTGGATCTTTTCAAATCTG ACAATTCTAGTTAGGGATGGGACACAATAAAAACTATTTCAGATGTTGAC TTGGTTTCTGTGTTATTCAGGGTGTTCTGCACTGGGTCGCCGAGCCAGCA CCTGGAGTTGAGCCATTAAAGGTTGAAATAAGATTATTTGAGAAATTATT CCTATCGGAGGTATAGTCTTGCTTGATTTTCTTGCTCTCATTAGAGATGT GTGTGGACTGGAAAGCCACTTATGACTGTCTTTGTTGCCCCCTTAGAATC CGGCCGAATTGGAAGATTGGCTGGGTGACCTTAACCCCAACTCGAAAGAG ATTGTAAAGGGCGCATATGCTGTACCATCACTTGCGACCGCAGTTCTAGG TGACAAGTTCCAGTTCGAGCGGCTTGGTAATCTATCTCTGAACCTTTGTA GTGTTGGCATTCGCCTCTTGACGCAACTGACAGTTGTGCTTGGATGTAAT TTCAGGGTACTTCGCTGTGGACACCGACTCGACGCCCGAGAAGCTCGTGT TCAACAGGACTGTTACCCTGCGCGACTCTTATGGGAAGGCTGGACCCAAG TGACATTTAATTTAGTGAAAAAGCTTGATTTTGCTTGGTTACAGTGGCGC TAATAGGAGAAAACGTTGTAATGCCATACAACATACCAATAGCCAGGTGG CCTTTTGATT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.