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GrainGenes Sequence Report: AA037963

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Sequence
AA037963
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA037963
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CTGGTGCCGCCTCCTTCCTCCCTTGGCTTCTTCCTTCTCTCTCTCTCTCT
TCCTCCTTCCGCTTCCTTCTCCGCCACCCCAAAAAACCAGAGAAATTTTC
GCACCAAAAAAAAGTGAGGAAAAAAACGAGGGCGAAACCCTAGCGAGCGG
CGAAATCCGCCGCGCATTGCCTGCCTCCGCGGTTTGCGCGCGCGCGTCGC
GTGCCAGAGCTGGGTCGTTGGGTCGCCGGCGGCGGCGGCAGCGGCGCGGC
GGGCGAGGCGTCGTCGGTAGTGGTTAGGAAGCAGGAGGACGCGATCAGGC
GGTTGTGGAAAACGGAGGCTAGGCCGCCGGAGACGGCGGCAACGGGGAGG
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CTCGAGATCGCAGACCGCGTCTACGGTAACCCCAGCCGCACCCCCTCTTG
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TGGACAGCATCGTGTTGCAGCTCCGCGAGCAGTTTGCAGATTCTCCGTTG
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GCCCATTGCTTCCTTTGGACATCATCATCCACTTCCTGAGGCTTAGTGAG
AGGTGGCTTATGCTGGAAGGGAAGCAAAATATTCTGCTAATGCACTGTGA
GAAAGGTGGATGGCCAGTGTTGGCATTTATGCTTGCAGCTCTTCTTCTGC
ACCGGAAACAGTATAATGGGGAGCAAAGAACTCTAGACATGGTCTACAGG
CAAGCACCCAAGGAGCTTCTTCAGATGTTAACGACACTAAATCCGCAGCC
TTCTCATATTCGATATCTACAGTACATATGCAAAATGGACTATGAGTTGG
GCTGGCCCACAGAACCTGTTCCTTTCACCCTCGATTGTGTTATTCTTAGA
GGAGTACCGAATTTTGATGGAGTCGGTGGTTGTAGGCCAATAGTTCGAGT
ATATGGGCAGGATATTCTAACAGCTGATAAAAGTCGCAATGCTCTTGCAA
CACCATTCAAATCCAAGAAACATGTTAGGCGTTATAGACAGGTAACATCG
AGCTCAGTTTATATCTTAACTGTTCTGCCGTTTGTTTTAGTTACTTATTA
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GCGTCCAAGGTGATGTGGTCCTTGAATGCTTGCATGTGGATGATGGCCTA
GAAAATGAAAGGTTAATGTTTAGGGTGATGTTCAATACCTTTTTTATCCA
GTCTCACATTTTACAGTTGAACTTCGAGGACATTGATGTCTGTTGGGATG
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ACGATATTGATGGGTCACGAGAAAATAAATCTTTGTCATTTGAAATACTA
AATGATGAGGATGCATGCACATCTGTTGACACCAATATTATGCACGAAGA
CATAACCAGAGTAGTGTCAAGTTTGGAAAATACAGAAGATGGAGGCAGAG
ACAGCAGCAATTCGAGTTCTGCTATTTACAAAGATAAAGATGGTGGCTGC
TCAGTTGAAAACAGCAATTCCAGGCAGGAAAGAACAGCTGATCCCAAGAA
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AAACCAATAGTCCAAAGGACATACAGATGATCAAGGAAGTTATCATATCT
GAAGTCACCACCCCAAAACAAGTGCCGCAAGGGGATGCGGGGGAGATTGA
ATTAGGCAACGCAGTCCACAGTTCAGAAAACATGACATCGACAGAGGCTG
ATAATACTGAAGGACTTGACTTTGCTCTCAAACAGGATGAGGGAGATATT
CCAGGAGAAGAATGTGTTACTTATGTCAATGACACCAAACAAGAGGACAA
CAGTAATATGGAACAACCTAGCATCAGTGACACAAACATACTAGTGATTG
AGCCCACAAATGAGAATAACGGGGTGGAGCTTCCATTGCTAAGGGAACCA
CATCTGCAGAGCACAAGTTCTACCCAGATTTTAAGTTTTGATGAGCAAAA
GATTGAGCAGTCTGATGCCTCCAATAGTAATGGAACTGTAGAACAAACAG
AGGGAACGGAAGCTTCAATTTCCAACTCGACAGGCCAACCTTCGAATATT
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TGATCAATCATCTCCCAGGCGGCGTAATATGCTTCGTTCAGCATCGACAG
ATTTGTCCTTTATATCTCCATTGCAAACAGAATTGAATCAGAAGAACGTT
CCTTCTACAAGTGGAAGGGATGTTTTTGCTACACCTTCTGCATATCCACC
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ATCCCCCTCTACGACCAATCAAAACTGTTTCATCTTTACCTTCATCTTCA
TTTGAAGCATATATAGAGATTTCAACTTCCTATTCTCCACCATTACATGC
CAACTATCAACTGGATGTTAACCCTTATCCTCCCTTTATACCACCACCTC
GACAACTTTATCCATCAAAGACACAGGGAAAGGATCTACATCCAGGTAGT
CTATCTTTTACTGCTTTGCCTGCTCACAACAGGTATGCATCTCACCCTCC
AGCTCCACCCCCACCTCCTCCACGTACTCTTTGTACTCAAAATAATTCAA
GCACCTCGATTTCTCATCACGATCAAAGAAGAGAAGAAGGGTCTTGCTCC
TCTAGTCCTTGTAGACAAGCTATTCTCAACTTAGGTGTTTCGTCTCAAAC
TTTACCTTCCAAAAGTAGTACAGTGATGACAGAATTTCTATTAGGAGCCT
CTAATTTTATAGATACAGAAGTAGCAAACAGAAGAAACATACAAACTGTC
ATGGATGTTCCAACTACTTGTGAAGATACAAAGTATTTCTTTCATATGCC
TTATAGTGCACCACAACCTCCACCTCTGCCTCCTCTGCTACCACAGTTAC
CATTGCCATGTAAGGATAGTGAATCAGAACAATCCCCCTCTTCATCTCCA
CCTCTTGGAACAAATGATCCTTCAAGTTCAAAATTTGAAGAGGAACTGGA
TGCATGCAAGGAGTTCTTGCGGTGTGAAATGATCAATGAAATCTCATCCT
CCAGGGCTCATAGAAAAGAACATGGAGCCATTCCAACCCCACCGCATTCA
CCGGTTCAATTCCTTACCTCTCAACCTCGTCGTTCCCCTTCAACACCACC
TGCAGCCCCACCTTTGCCACCATCCTTGTCCTTGCTCCCATCTCCACAAT
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GTCCTAGAGGAATTGTTGCATCTCCGTCTTTATGTTTACCTTTGCCCTTT
TCAAGAAAAGATTCAACAAATCCACCCGTTCCTAGAGAATGTTTGGCAGC
TCCACCTCCACCTGTGCTCACTCATCATCCAGCTCTTCCTACAAAACATG
CACCTCCACCTCCGCCTAGAGAACATGATGTGATTTTCCCTTTGCCTCCA
ATTTCACCTAAAAGGCATGTCACATCGTCACCTGCACCACCACCTCCTCT
TGGACGACATCAAGCGCCTTCACATCCTTCCTTTTCCCAGGATCATGTAA
TTGCTCTGCCTCCACCTCTAACAAGGGATGCCATAATTCCGCTGCCACCA
CCACCTCCACCAAGAGAGAGCGCCGGGGAATTCCCTCTACCAGAATGTAA
AGTTGGAACTTCAATTCTGCCACCACCTCCTTTTTTTGATGGAACGGAAA
GAATTCCACCTTCACTTTCCTCTGAAGGAAGTAAAAGAACTACAGTGCCT
TCTCTTACTGGAGGACCAGAAGGAACTCCACTACAAGATCGATTTCAAAG
TGGAGCTCCATCGCCACCGCCATCCCTCGGAGGATATGGAGCATGTGGAG
TATGTGGAGCATGTGGAGGGGCATCTCCTCGGCCACTTCCCGGAGGGTAC
GAATGGGTACCTCGACCTATTCCGCTACTTCCTGGGGTACATAGTGGAGC
TCCACCACCGTCACCACTTTCCGGAGGACACGAAGGGGCGCCTCCACCTC
CTCCGCTAGCTCCTGGAGCATATGGAGGGGCTGCACCGCCGCCGCCACCT
CCTGGAGGTTATGGAGGGGTACCTCCACCTCCTCCTCCACCCGGAGGAAT
CGGAGGAGTTCCGCCTCCACCACCGCCTATTGGAGGACTAGGAGGAACTC
CACCTCCTCCACCACCTGCTGGATTTCGAGGTGGAGCTCCGTCTCCTCCT
CCTGGAGGGTATGGGGTGTCTCCACCACCGCCTCCTCCAAGAGGGCATGG
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CATCTCTAAAACCATTGCACTGGGTCAAAGTAACAAGAGCAATGACAGGA
AGTTTATGGGCAGAACTTCAAAAGCCAGATTCTAATAGGTACTCTCAGTT
ATTTCAACTGTTTGTTTGCTAAAAGATATAAATTCTCATAAAATGTTCTG
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AATCTTATTCCGCTAACTGATAGCACCATGTATGCAGCGAAACCGAATTC
GATGTGAATGAACTGGAGTCTCTTTTTACTATTGCTCCAAAGGCAAAAGG
TGGCTCGAAATCAGAAGGGGCTGGAAAATCTCTTGGTTCAAAACCTGATA
AAATTCACCTGGTAACTTGCTCCAATAATTTAAAATAAAACACTGCCCAG
TGTTGGATTTCATTTAGCTCTGCTATTCTACTGAATTTTTTAATGGCGTG
GAAGTTTATTGTGCATACAATGTCATACTCTGCTTCATTTCTTAAAAAAA
ACCTGTAATTTCGTAGGACAGGTCTTAAAGTGTGCAATATTTTACCCAGT
TTCACAGTATGTTAATTACTTTAGGTTTAAACCACCATTACATGATGCTT
GCTCTCTAACGCATCACATGTGAAGTCATGCCACCTCCAAGTTACCCTGT
GAGACTGAACTCATGGTGAAGTTTAGAACACGCAGGTTGATATGGCCTTC
TCATGAACTAAACTTACTATAGGGAAAGAACATGGGCGGTGTTTCACACT
CAGTTTTGCATTTGTAGCATGTGTCAATTAATAGATAACTCAAAGTATGC
TTTTTTACATGAAGTGATTTGCATTGGACTTATTTAGTTGAATTTCGTTT
CTAACTTGTATCGTTGTGATGCAAAAAAACTAAGCCCTGAAACTTTTGTT
GATGTCCTTGAAACATCCACAGATGGATATAAGACGGGCCAATAACACAG
AGATCATGTTGACAAAAATCAAAATGCCACTCTCCGATATGATGGTAAGT
ATCTCGCTACTAGCTTCTACCTCTTTGTTTTTAGAGAATGTGCAAAAAAA
TATGTGCCATATTTTGATTGAGTAGGGAGCAAACATACATACACGAAAGG
GAGCTTAGCGGCAAGACCAATGCCATAAGCAACCCTGGTAGCAAAGAACA
CACATATTGATCAAGAGACATTCAGGGGGTGGTGGGCATCCCAGAGCTGG
GACAGTACCTCACCCTCTGGCGTCGCCTGGCGCTTGTCAACCTGACTGAT
CAACCGGACCAGCTGATCTGGAGATGGAACACATCTGGTATTTACGCGAA
ATCCTGCTACCTAGCATTGTTCCAAGGGGACACCACTTGCAGCGCTTGGA
AACTGATCTGGCGAACATGGGCGCCACCTCGCGTCAAGATCTTCCTCTGG
CTCGCCAACAAGAATAGATGTTGGACAGCCGACAGATTGGAGAAGTGAGG
CTTGCAGCACCACGACAAATGCGTCCTTTGCGACCAGGAGCCCGAAACCA
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GTGCTTGCCTGGCTCCAGATGCCTTGCAGGCCGCCTGATGGAGAGGCATC
GCTCAACCACTGGTGGCTAGCTGCAAAACGGATCACACCCAAACCCCTCC
GCAAGGGCCTCGCCACTGCAACCCTGCTAACAGCGTGGATGATCTGGAAG
CAACGCAACTCTGGGGTTTTTGATGGCGCCTCACCATCCATACCACAGCT
CGTTGCGCGAATCCGTGAGGAAGCCGCCTTGTGGGTTAGAGCAGGGGCGA
CTGGTCTTGGTACCATCACCCATAGGACCTGGGATGTTCATTAATTAGCT
CAGTTTTATTGTCTCTGTGATCCGCCTCCTCTGAGGCTTGTATGAAACTC
TTCTATGCAATGAAAAGAAGCGCAAAGTCTTTGCGTTTTCCCGAAAAAAT
TTCCTTCTAAATAGTGTAGAAGATCCAACATAACTTGTTTCCATCAGTTC
TGTTAGAGTGGTAAAGTGAAGATTGGGCATTAACTCAAATATCAATGACT
TATAGGGAGATTTATGTTTGCTTGAAAATCTGAAATATTGCTTGGAAGTC
CTTGGCATATCCGTTTTTCAGAATCACATTTTTTTAATGAACTCAAGAAC
TCACTTATAAAAGCTAAAGCTGCTTAAAAATATCATCTCCCTGTTTTGTA
TGTGGGGTCTACCCAAAATCAATTCTGGTTTGTTAGCTAGTCGAGTCAAT
TGTCAAGTAAGTTTAAAGTGCACTGTTCATTCAGAAAATCATTGTTCTTT
TGTAGTCACGTGACTGCATATAAGATATTTTTATATACTCCCTCCGTCCA
GAAATAACTAACTTGGGTTTGTCTAGATTCGAATGTATCTATACACTAAA
ATGTGTCTAGATACATTTGAATCTAGACAAAACCAAATCAGTTATTTCTG
GACGGATGGAGTAGTAATTATACTTCCTCTACCTACATGTCCTTACTTTC
TCTATGTACGACAGAGTTCTGCTCTGGCTTTGGATGATTCAATTTTAGAC
GCGGATCAGGTTGAAAATCTCATAAAGTTTTGCCCAACAAAAGAGGAAAT
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GTCCATTGTTAATCATGCATAATATTCTTCTCGAAATTTCTTGCAAAAGT
TAGTAAAGTATTTTTTAATTTTTTGACTGTCAGAACTACACCGGAGACAA
GGACAGCCTTGGAAAGTGTGAGCAGGTAAATCTATGTCTTTTGACTTACA
AGTATACTCTCGTGTTTTATCTAAGTATACCTGATTATCTCATAATTAGA
GCTCCTTTTCTGTTACTATTTCTCTGGTTGTATTTGATCTCAACTGAAGT
TTTAATTATATGTTACATTTGTACTTCGGTTTACCTTACTATTTATCTTT
ATTCGGTATGCAGTTTTTTCTAGAATTGATGAAGGTGCCAAGGGTTGAAT
CGAAGTTTAGGATATTTGCATTCAAGATTCAGTTTCAGTCACAGGTCATA
CAGTGTTAGTTTTTTGAGATTAACGTCATTTGTGTTGTTCATGGCTTTCT
CACTCTCCACTTATTTCTTTCCTGCTTAGATTAGGGATGTTAGAAGGAAT
TTGCAGACTGTGGGATCAGCTTGTGAGGAGGTAAACATTCTATCCACTCA
AAAGTTTCTCACATCCAGTATTCATGTTTAGCATGCAAGAACTCATCTCG
GATATGACAATCAGCTCAGAGGCTCTGAGAAGCTGAAGGTGATCATGAAG
AACATTCTGTTAATTGGGAACACATTAAATGAAGGAACACCAAGAGGTAA
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GTGATCTGATTTGTGGCAGTTTGCCTTCCAATTCTGTGGGAGATGGGGCA
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GCGCACCCGCCTTCTTCTGGCTGCTGCTCATGCAGCCAGACGTGTTCCCT
GGCCACATCCTTTTTTTTTTGAGAAAACGCAAAGGAAGCTTTGCGTTTCG
TTTCATTGAAAAGACAGGTTTTGATACAATCCTCCTAAGAGGCAACCAAC
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GTCATTGGCACAACATCTTTATGCCCTTTGGCACCTGCTTGAATCCATGC
TGCCACTTCGTTTTTGATTTCAGCAATCAGGATAGTGGCTGAAGGCCATG
CACTTTCGAACACGCAATTGTTGCGGTGTTTCCAGATCATCCAGGGCACG
AGGAGGGTGATGGATGCAAGGCCTCTGCGCATTGGTTTTGGGGTGTGTTG
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CGTGGCAGCGCACATGTCATGCACAACCAGGAGAGGATGCTGTACCAGAT
CTGCTTGGGGAGGGGCATTCAAAAATGAGGTGGTGCATTGTCTCGAATTG
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GCCGCTCCGCAGTCCAGCATTGGTCGAGGTTGGCTAGCCAGTGAAAGAAT
TTCACTCTTGCAGGAGCCCAGCTCTTCCAGATGAGCCTCCAGGTATCGCT
GTTTGTTGCTCTGTGAAAGCTGGCTATATAGGCAGATTTGGCAGAGTAAT
CGCCACTGGATGTCCACTTCCACACTAGCTTGTCTGCCTCAGCGGACAGC
GTCGTGTTTCCGATCGTGCGCCATAATGTGAGGTATTGGCCGATCTTGTG
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GCTCGGTTCGTGTCGGTTTGGTTCAGCCACTGCCAGCGTAGGCGCAGCGC
CATGCCTGTTCGTTCAAGGTTTTGCACACCTAGGCCACCGAGAGAGGTGG
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TTCCTCCCTTCCCATAGGAAGCCTCGTTCGATCTTTCCCATTTGCCCTGG
CCACATCCTTGATGACACATCCTTGGCGTCCTAGATGAGATGAGGGGCAT
GGAGGTTTGAAAAGGGTGGATGCTTGAGAGGCAGAGAAGTGATCACAAGA
ATGACCTGTATGTGCACGTAGAGTGGTAACTCACGGCGCCTTTGGCTGTC
TGGTCGATGCAAAACCGTTGCTGTTATGAATATGGTTTACACACCCAAAA
GCAATGGGGGGCTTGGTGTTATTGTTCTATCTGTACAGAATGCCGCCCTC
ATGGTCAAGGTCAATTTTCTTCATAAATTCTACAATAATGAGAACATCCT
ATGGGCTAACCTGGTATGGTGATAGGAAAACAGAACGCCCTCATTCCACT
CGTGCGGGTTCTTTTTGGTGGCGTGATGTCTTCGGACTTCGTGAAAATAT
GAAAGAATCACCAAATTCCTTTGTGGAATCCCAGACTTCACTCTGTCGCC
AATAATGATCAGCTTTGTTTTTGTGGAATAAACTGGGTGATTACCGCCAT
GAAGATGACTGGATGATATTGCGTAGGGGATTGGGGAGTAGAACATAGTT
TACGGCAGTACGATCGAGGGAGGAGACTCGATTGATTAATTCTCATCACT
TGATCTAATCTATTACATGTTAGTCCTTATATATGATGATTATCTTACAA
GTCGGACCGCAATTCTAACTCGATGGTATGGGCATGGTTGTAAAAGTAGA
CGCAAACTTAGAATCACACTTGTTATTTAAGAAAACCAATTGAGAATATT
TTTCTGGGTTTATGGTGCTTATTTTGCATCCATACAGTATGCTTCAAAAC
TTAATGACTGGTTTAAGTGTTCTTCAGTCCCTTGCAGGGAAGTCACCGGA
ACTACTGGATTTTCACGAGGATCTTGGTAGTTTGGAAGCTGCTTCGAAGG
TATTGTGCATGTTGTCTAATGTGGATAATTTACATAGATAATATTTATTA
TATCTTCTTAAGTTATTTAAACAGTTGCAACTGAAAGCATTGGCGGAGGA
ACAGCAGGCAGTTGTAAAAGGCCTAGAGAAAGTTGAACAGGAATTAACTG
CTTCAGAAAGTGATGGGCCAGTTTCTGATGCTTTCCGTAAGGTACACTTG
GCAACTTTTTCTGCTGTCTCGAGTCCATCAGATTTTATTGAAGCATTATT
GGTGGCTATTTTATATGTTGTTTCGTTATGTCATCAAGCAGACGACTTAA
TGTTTTCTTGTATGGTGCAATGTAGACTTTAAAGGAGTTCCTTGATGCTT
CTGGTGCTGATGTACGCGCCCTATCAGCACTCTATGTTGAAGTAGTAAGC
CTTCCGTGGCCCTCATTGCTTTCATTACTAACAGTGTACACTTTAAATCT
GCCCCCTCTTGACGTACAAGTGCTGACAGGGTAGAAGTGCAGATGCACTT
TCCCTTTATTTTGGAGAAGACCCTGCAAAATATCCTTTTGAGCAAGGTAA
TTTCTTGCCAAGTTATCAATTGAATTGGTCTATGGGAGATGCTGATGAAA
GAGCGTATATTTTATTTCCTCCTTTTTCTTATATGCTTGTGTAGCTATAG
TGAAGATAATTTGTGGTGATCATTGATGCGTATAGAAATTATGGATGTGT
TTGGACTGATTTAAATGGTGTAGGTAAACTGTACCTGCCGGTCACCAAGA
CAATAATACATTTTCAATTGTTTTATGCAATAAGATAATTGATTTTTTCA
CTTGGAAGTCTGAACCAGGTTCAGAAAACTTCTCGAGATTCATTGGTAGC
TGTTCAAAATTTGAACCTCAGCTGAATTAATGATGATTTTCTCCAAAGTA
CTCCGAGCTAGACTTATCGTGGCTTACTGCTATTTTCCGACTTAAGCCAT
TGGCTTATAGGGATCAGTCTCCAGTTTTATCAACACTGGTGGAGTGGTTG
GGATCATGATTTACCTGGCATCTGATCTTGTCTGATTTGCTTATTTGCCT
CAAGAAAACTCCTAAAATCTGCTAACTAGATCTTCTGTGTAATTTTTCTC
TTCTGTTTTACACTTAAGCTTGCTCTCTTTGAGCCAGTGAACATGAATGT
GAACTAGAAGAGTTTGTTTTATGCGATTTCAGACTTGCTTTATCATTTAA
TCAATGTTAAATGTCTTTCCTTCACTTTTAAAGTAAAAATATGATATCAC
TGGCCTTTGTTCCTTCTTTGATTTCCCCATCTACGAAATATTTGATTGTA
ATCTGATATCCTCTTACTCATATTGAATCTTGAAAACTGTGCAGTTGCTT
CAACCCTTCTGACCTTTGTGGGATTATTTCGGAAGGCACACGAGGAGAAT
CTGAAGCAGATTGAGGCTGAGAGGAAGAAAGCACAGAAAGAAGCAGAAAA
GGAAGCATGCCAGGACAGAACTCCTGTAAAATCAAGAGATGGACTTGGAG
ACAGATCACCAAGGTCACCCTTCAAATGATATCCTCCCAGAAACTTGGAT
GTGGTCATCAGTTTTTCCTTGAGCAGACGACCTCTGCTAGCCATGCAGAT
CTTCAGGAGGCTCGACTGACTGTCGGCAAATGCACGACTTCCTTGGGGAC
ATCTTATGCTTACAAGACAAGGTAACATGCATATACGCTTTTTTTTTTCA
TTCTAACTTGTGAAATACTGTTACCTGTATGGCCCTAACCTAGTCATTTA
TTTTGCTTCGTACAGATACTTTCGGTTGGACATCCATGCTTGATAGCTCA
TGACACTGTACAAAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.