Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA008666

[Submit comment/correction]

Sequence	AA008666
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA008666
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CACGGGCGGTCACTTGGTGGGCTGCCGACCTGCCGTGGGCATACCCACTT ACAGCCTGCTGTAAACGCCCGCGTTGTACGTGCGACTGGGAGCGAACTCA CGACTGCTCGACCTCGCGAGTCGCGACCTCGCCCGCGAATCGGACCCCGA CGGCGGCGCACAGGTAAGACCCTCCCCGCACATCCCTTCCCTGGCCGACC TCCCCCTGACCTCCCTCTTCCATGGCCGCTCCTACCTCGCCCGTTCCTGG CCTGTCTATGGCCCTCTTCCCCTGGCCGCCCCCCTCCCTGCCTGGTCTGA ACCCCAGTTCATGGGCAGGACCAGAACGGCGGCGGGATGGTGAACTGCGG TAGCGGGAGGGTGAACGGCGAGCGGAGGACGACTGGGCGGCGAGTTCTGG GTCTATCCCTTCTTGGCCATGTTTGTCGCGCCTCGGTTCCGTTCTGCATC TGTATCTCTCTCCTGTTGTCCCAGGCAACAGCTCAACTGCTCCCAGGACT CAGCGAGCCCGTCCGGATCCGCCACATCGCCCTCCAGCGATGGCTGACGA CGTGCGCGAGCTCCTCCTCTCGACAACCGCTGACGCCGACCCCTCCACCC CGCTATCCGCGCCCGACCTCCGCCTCCTCATCGACCGCCTCCGTCTCCGC TCCGACCGCCTGCACGCCTCCGCCCTCTCCTTCGCCTCCTCCAACCGCGA GCCGCTCGCCTCCGCGCTCCTCCGGGCCGCCGGCTCCGCGGCATCATCGG CGTCCCTCCAGTCCTCGCTCGAGTCTGCGCTCTCCCCGCTCTCCTCCTCC CCAGACCTGTCCGACCTCAGGTCCCTCTCTGATCGCCTCCTCGCGGCGCG CCGAGAGCTCCGGGAGCGCCAGGAGCACCTCGCTGCCGCATCCTCTGTAG CTTCAGTCTCCGCGCGCCTTTGTGCCGCTCGAGCCTCGGCCAACCCCCTT GATGCCACCACCGCCGCAGCCGAGCTGAAGCCTCTACTGGTGGACCCTGA GGGATCTGGATCCGGTGGGGACGAGCCAGTCGTGTTTGGACTTCTTCGGG GCGAATGGGAGAAGCTCGTCGATGAGGTGAGCAGTCTACTGGTTCGAGGT GCCTTGGCTGATGTTAGGATTTGTGTTTGTGCTAACTGTTGTGCTGGTTG GTTCCGGCGATGGTGCAGCTGCAAGTGGGACTTGCAAAGAACGTCGAGGA GTGTGTGGAGTTTGCACCAGAGGGAGGGAAGGTGATGGTGAGTGCTGGAC CCAGAGGTAGTTCAAATGGGACGTGTGGTGTTGAGCTTCGTGTGGCACTG CAGGCTTTGGAGGTGAGGTTCACTGACTAGGCAGAATTTATTTATCGACA GAGTATAACTGCCTTACATATTCTATGCCTTGAACTCTTGTGGTTAGTTT GGATAGACATCTATAACACCACACGCTAACATCATTCAACCTTATTTATT GTTAAATAATGAACAAATCTATTGTTAAGGCAGAATTTTTTGTATTTCTG ATGTGGTCTTCTTAAGAACCCAAGCAACATTTTGATTGACCATTTGTTAC ATAGCAACTAGACCAAACCAGTTTAGTACATGGTGGGTATTTCTCTCTAT ATATATCAGTAAGGCCCATCAAATCCTGTGTTAGTATGTTATTATATTCT ACTGATAACTATTCTGTGAGCTTGGTCAAATGCCTTAGTAGGAAACACTT AGGTATATGAAACACTTTGTCATACCTTTGTATTGTTTGATACGCAGATA ATTGATTCCCTAGACTATGGAATGGCAAAAGTCGCAGACTTGATGATAAA GCATGTACTAATTCCAGCAATCAGTAACATATCTGTCACAGTTTCAGTAA ACGTACTTGAGAAAATTGGCTCCACATCCTCAGTATCAGTCTTGGTTATT GCCCCTTCAGAGGAACTGCAGGTAAGCATTCCATAGTGTTTCCTGGTTCA CTGGAGCTGATTGTTCCAAACTATCTTTATATAAATTGGTTATTTTTGGT TTTCGGAGGCCTCTTTTTGATTCAAAGGAGGATTGTAGTCTTAAATTTTA TCTGGGTTGTTTAGTTTGTTGAATCCAAATCCATAGGATTTTTTCCTAGG GATTCCTGTCACAACCGAGGTTACGAAGGGGGTGGTCGTGAGATTTAGGA GGGTGGATAGATCGTACTGGAGGTGAAACCTCCCCTTTTCTGTTTATCCT CTTGGATACCTGATCATAGGAAACTACCATGCTTTATAGCACAGCTGGCG ACTAGAAAGGAAAGATCCCAAACTGAATCCAAACTAACCAAAATAACAAG ACTTGAAAACCAAGAAAGCACTACCGAGGACTTATCTCCTAGGGATGGTT TGGCTGGCCTCTAACTTTGTGGTGGCGGCTGTAATGCCTGCCCCACATGA CAATTCCTCCGCACTACATTTCATAGCAAAATTCCATGGACTCCAATCTC TTGGAAAGATCCCTATGTTTTTCCTATGGTGTAACCAAACACCCTTTGGT GAAAATTCCTGTAGTGTCAATCATACAGGATTCGAAAATGCATGACATTG CACTCATATTTTTTCCTATTCCTGTGGTTTTTATAATCCTAGTGAATCAA GCAGGCTCCTATCTGCTTTATTCCCAGCTGTGTACTTACTATTCTTCTAA GCTATTACCGCAACGTGTATGTGGAATACGAGCTGAATCGAAGATGCCAT TTCTAATGTTCTAATGACGAAATAATTTTTGGCTGTTACATAGGTGAATT AGGTCTTTGCATATCTAGAATTCCGAGCCCTCAGGCAATCAAATGCAGTT TCTTGGAAAATGACTGTCATGTAAACTTTATTATTATTTGGGTTGTTTTG GACAATCATGTAACTGGCTGTTATTGCTCAAGGGCTACACAGATGGTTCA GAACTTTACTCAAGAATAATTGATGTCATCAAGTTTGTGCACAAGTTCAT TTGCGTGGAAAATATCACTTGGATGCAGTCCTTTGCAAAGTTAACCTGGT CAAGAATTTCTAATCTCCTTATCACACATTTTCTCTCCAAGGTATGCTTA TTTATTTAACAAACAAATACTTGACTATTCATTTTGATGTGTTTCTTCTT GTGAACAACCCTTAGCTGATGTGCATGCTTGTCTCTGTTAATGACCCTAT TTGTTCAATGTCCATTGAATTGTCAATATTTCTTCTGTTGCAATTCTATT TATCGACTTGTGAGTTACGACTGCGCTGTTTGCAAAACACATTTACTTAT CCACATTGACCACTTCTCTTCCATGCCACGGTAAAGCTGGCCACCAAAGT GAGCATCTGGCTTGTAGATTGATCTTTTGGTCCCATTTGAAGATAATAGC TTTTTATCACAAAAGTGGAAATGATCAGACTGGCCTGATCTAACTCTCAG TACAGCTTATATGCAACCTTGGGTTCTATCAACTTCTTTGTTTCAGTTGT CTTGTTTGTGGGCATGTGCTTGGTAATCTCTGTCTGTGGAAAGAAAAGGA TGCGCCAGATTTACTCTATAACGATTCCCACAAAATAGTGTTTTATATAT GTTATAATAACCAGAATGATCATTAAATTATGTTTTTCAGGCTGTTCCTA ACGAGGCATCCAAGCTAATTGAGTTCCAAGATGTTGTAAGAAGTACAACT GAATTTGAGAACACCCTTAGGAGTATGATGTTTATTTCGCCTGACAGGAA GGATGGCAAGTTGACCCAATATGTTAACGATGTTGAAGTTCATTTTGCTG TAAGGAAGAGAAATGAGATATTAGTGAAAGCAAGAGACATTCTTGTACAA TATGAGTACGACAATCCGCTTGTGAGTACCAAAATTTATGTTTGTCATCA GAAAATGACTTAGTTTGATATGTGGGTTTCGTTGTAGCAAACATATCAAG GAACAACGATGCTTGCTATTGCAGGGATCAGATGAAAGAGGAGATTCTGT TATTGATTTACTTTTCCAGCGAGAGAGTTGTTTTATATCTAAGTCAGCAC TTCAGTTAATGAAATTGGTTCATGGAGCCCTCAAGGTACGCATGCCTCCA CATTTTCTCATTGCTTTGCTACATCTATTGGCGCGATTGCTTGTACTAAT GTAACATGTCATTATTGTTCCTAATTACAACCACATTTCTGTTTGCAAAT ACTGTCTCCCGCTTTTCAGTGCTTTCTTGCTGTAGAATGTCACAAACATT TGATGTACATCCGTTTCTGTTGTTGAATAATCCGTGCAGGATGCTTGTTT GTCATCCACAAGAGTCGCAAAGGAGTTCTGCTATGCTGCTAGGGATGCTT TGCTCTTGTATAAGGCTATTGTGCCAGTTCAGGTTTGTGCATGTACTAAA GTTGCATGATAGTTGTGTATTGTGTCATGAGTGACATTAAATCTCCAGTT GTGACGATGTATGTCATGTAAGCATGTGTCTCACAGACACATCTAGGATA TTCTGACATACTATTTACTCATGTGCCTTTTATTTGGACATGTTAACTAA TAGCTAAATGTCATTTTTTTTAATTATGATAACTCAACAATTGTGTTATT CTTCAGATTTCAGATAAATATGTGATGATTCCCTTTTTCATCTGCTGGTA TAAAAGTATTGTGATACCAAGGCTCAAGGGTCTGTTTTATGCTGTAATCA GTTTATAGTGACATGGCAAAGAATTCTCGCCTTAGCAGATATCATTTGAT GATTTCTCCTAGTATGTTCTGTTCACTGAACTATAAATTACACCTTTAAT ACATGGGATTGCAGAATAACTAATTCTTATTTTGACTACAATGTTGTATC AGTAAAAGCCTTCCTGATGTACCTAGTCTATGTAAATTGATTCACGCATC ATGCACTTATTGTGCCCTTAGGTGATAGCATTTACAAGATCTTAGCTTTC ATATACTTAATGTGTTCTTATGGTTTCAAATGTTCTAGATAAACTGACTC CAGTGATTCTGTTGTTGGTTCACATTATTGATGCTGTCCTATTATGAAAT CACACGATATTCTACTCTTCAGTTCTTTGTTCTAGTTACTGTTATTTTAC CTTAACGCCATAGCGATTAAATTTAGCTTTGTTTCCTTTTAATTAAGCTA GCGAAGCAACTCAATAGTGTCAGTCAGGTGGCTGCCATCATTCACAACGA CTTCTACCATTTGTCCCAAGAAATTCTTGGTCTTGCATTTGAGGTCTGTA TATCCTTCTATTTGCTTCTTTTTATGATTTATCTTGGGTGTTGATGTACG CAAATGTTATTTTCCGGAATCTTTCCTACATATACACATATTTGCCACAT GTTGATTTATGTGGGTGTTTGTCTGGTTGCCACACTACTTATTTATATGA CCCATGGCCCCGTGCGTCGTAGATTCAACTTTTTCCACAAGTTGCCAGAA CTGTGGTGATCATTTTTTTTTGTTTAAACTTTACCTAACCTTGTTTGGTG CTAAGTTAGCCTCAGGCCAAGCAGCCCCTTAGTTTTGTTGTCTATTTCCC TGTTTTTCATTAGAAATTACTTTATGTAGTCACCTTTCTTTTATAAACTC AAATATGTGTGTTTTTGTATGTAGATTAATGTTCCGTAATGATTCATCCT CAAGTAAAGGAAAAAAAAGACTCAGACACATACTGCTGTACATTTTGTCA GTCTTTTTTAGACATCTGACTGAATTTCCCACTTTAAGCTGCCTACACAT CTGTAAGATGGAGATGCGTTTTCCTAACCTATTTTAATGCTTTTGTCCAG TACCGCGCAGATTTTCCTAGTGGTCTGCAGAAACTAGTTGTTTTTGTGGA TTTAGCTCCAATCTTCTCCCAGATGGCAGATGGTATACTGAAAGGCCAAA TACAACTTGCTACAGCTAACTTAAGCGAGGTATTCCATTACATCTTCTGG TTGTAACACCAAGCAGATTTTAAGTTTGCACATCGAAACTGTGTGGTAAA AAATGGCAGGCAGTTTTTTCCTCATCCAGCTTTTGACTCCTTGCATCTAT CTAATTCTTAATACCATGTCCACTCTCTTTTGACATCTCCACATGCACAA TAATATTTCTTCCTTTTCTGTCTGTGCTACATTTTTGTAAGTTCCTAGTT TGCCACTTTATTTTCCAGGCTATAGATGGCGCTGATGGTTTTCAGAACAC ACACCAATCTCAGCATTATGAATCCGCAAAATTTAGCATTGAGCAGGTAT GTCTCATAGCCAAAGAATATGAGGTACTTGGAACTAGAAGAAATATGGCA AATAAAAAGTCTGCAATAAATTCTCTTGATATATTATCCGTGACCTGCAA TTTGTTTATATTATTTTTATATTCGCCAAATCTACAACATTAATTAATTA TGAATAGTCAACTAATGATATATATTGACCTCCTTTCAGGTTGTGTTCAT CTTAGAAAAGATACACATTATGTGGGAATCGATACTGCCCAGGTCAATTT ACAGGAAAAATATGTTTCATGTCCTTGGACCTGTCTTTTCTAGCATAACA GAGGATATGCTTCTGATAGATGACATGGCAGCAGAGGAGACCTTACAGGT GATAATATTCTCCTTGAAAGGTTTGAGCTGATAACTCTTGATGTGTATTA ATTATTAATATATGTGATACACTTCCAGCTGCAAGGCCTTATACATTTGG CTCTTAAAAACCTCTCCTCACTGTTTCTGTCCCTGGTTGAGCGCGATGAT GATGGCAAGTTCTTGGATCATGATACCTGGGTCCAGCTGGATGAGAATGT ACCATCTTTAAAGAAGTTCCGAAAGCTAGCAGGTATATTTTGTCTCAAAA TGTGGAAATATTTTAGCGTGTTCATATACTTTTATGTTCGCTCCACTAAT ACTGAAAAACATCGATGTTACTCAGAGTTGCTTGATATGTCATTGAAGTC CATTACAGCTGCTTGGGAAAGTGGAGAGCTAGTTAACTGCGGTTTCACAT CATCTGAGGTGAGCAAGTTCATTTTACTTTTCTTTTCACATATATAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.