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GrainGenes Sequence Report: AA027114

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Sequence
AA027114
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA027114
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGAGGAACACTCCTTTCTGTTTCTTTCTGCTCATCTGTGTGGCCACGTG
GCGTGCAGATGCATCGCAGCAGGCTCGACTCAGAGAGTTTATCCACTCCA
GGAGGACCAGCATGGATAGCAGCAGCAACAGCGCACATGAGCCCATGGTA
GGAGCTACTGCTACCAGTAGACTCAGAGCAGAGTACTCTGTCACTGAGCA
GGCCAATCTGAAGGATGCTGACAAGATCACGGCGTTGCCTGGGCAGCCCA
ACAGCGTCAGCTTTGGCCAGTACAGCGGGTACGTGACCGTCGACGAAAAG
AACGGCCGCGCCCTCTTCTACTACCTCGCCGAGGCAGTGACTGACGCAGT
GACGAAGCCACTAGTTCTATGGCTTAATGGAGGTATGGCTATACTAGAGA
GATACACATCATCATGTCCTCTTTGCGCTTGTGTGTTATCTCTCGTACAA
ATATTTACCAGAGTAGATATCTTGTTGATGCACAGGTCCTGGATGCTCAT
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AGTGGCATGACGATGTGAGGTTTTGCAGAGGCTAATGTCATCTTCCTGGA
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TGCCATGGCCGTGTATGATTCCGCTAACACTGATCCCTACGACATTTATG
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GTAAACACACTTTTCTTAGAGTATTTATTTGCTGAAGAAGAAAAGATCTT
CTCCGAACTGTGCAGATACCAGGGTATGATCCATGCAGCGCCTATTATGT
AGACGCTTACCTCAATGATCCCGAGGTGCAAAAGGTTTTGCATACTAGAA
CGACAAAGTGGGCAGGCTGCACGTAAGACTTCTAAATTGCACGCAAAAAA
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CCGATGCTCTACTTGCGCAGGGACTTGCACTGGAAAGATTCACCGGCGTC
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TGTTCAGGTAACATGGCACCTTCTCAGATTAAACCGCGGCTACGAGCAAC
TGATCTGCCAAAGAGTGTAACAAATCAAGACATGTTTTCAGCGGTGATTT
CGACTCCGTGTGCCCGTTCCCCGCCACCAGGTACACCATCCACGACCTTG
GTGTTGCCGTCACAGAGCCATGGCGCCCATGGACCGCAAGCAAGGAGGTA
AACGTGACGACCGGATGTTATTTTTTCACTTGTCTGTTCGTGCTAACGCT
GATAATTTTCGCAGGTTGGAGGGTATGTTCAAGCATACACGGACGGTTTA
GTTTTTGCGTCTGTGAGGGGAGCTGGTCACCAAGTCCCGTACTTCGAGCC
TGAGAAAGCACTGATATTGCTTAGCTCCTTCCTAAAAGGAATGCTTCCAA
TCAATGAAAAGGGACAGTAATAATGGACCTCGGTAAAAGTTATGCACGAA
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CTGTAATTTGTAAAAGTCTAGATTTTTTTCGGTCAGATTACTTTTTGGCC
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ATGGCACGAGCAATGTGCCACAAATCCTACTCCTAGATTGCCGTCTAAAT
CGGCTGAACTGAACAACACCCATGGTAGCATCTCTAAGGGCTAGTTTGGT
TGTTGGGGATGGAAAACCCTGACAGTAAACCCCACAGGGGATTTCCTTGC
CCACAAGGGACCCCCTTCCACGATGGGAAAATATCCCCTTCCACGATGGG
ACACTAGCCCTTTTGGCTAGTTTGGTTGTTGCACACAAGGAATCTCTAAC
TGAAGCACATATGATTAATATACTGCAATCTCAAGCACAACCAGGATTCT
TATTCTTATAATTAATATACTGCAATCCCAAGTAGAACATAGGCTATAGA
GAACTAGGATTTTTTAAGGTTTAGACTACTACAAGGCATTGTAGCACTAC
CAGACAAGTATCCAGGTAACTTTTCAGCACACTGTATAGGTTATTGCCTT
ACTCGGAGTAGGTTCTGGGGTCTAATTTGCTGACCACTGCAACCGAGCAC
AATCAAAGACCACAAGCAACCGCTAAGCATTCATGTAAGACTGAAGGGCA
CATATTCAGACAAAAAATTGGTTACTGCTTTTCAGTGCACAAGTGGTTCA
CCTGAAGTTTGGTCTTGATGGTGTCGATTGGGTACAGAGGCGTCTCCACC
ACGACACCAGCGGTTCCTCCGGTTATTACGTCCTCTGCGAGCATACAAAA
CATCACACAAAATCATTTCTTTTCATCTGCGACCGCATATGTGCTGAAAA
ATTTAACAATATTGTGTGCTAACAATCATAATCTCAGTCATGTACAAATG
CTCTAGCAGGAATAACAAATACTCCCTCCGTCCTAAAATAAGTGACTTGG
CTTTATCTGATTCACATGTATCTACACACTAAAACGTGTCCAGATACATG
CAAATCTAGATAAATTCAAATCACTTATTTCTGGATGGAGGGAGTATAAG
GAATCAATTCATAAGCAGTACAATTAAGTGCTTGGGTATGTAGAGGCAAA
GGGACATGTCATGCGAACAAACCATCCATAAGTACAATTTATGCAGCGAA
CAAGAAGCACTAACAACACCTCAATATGATCGATACAAGAAATTAATGAT
GCAGGAGGAGAGAGCCACATTGCCATCACGTCAACAGACAACAGGAACAA
CTATTTGTTTAGGCACAGGGAAACAAAGAGTAATATATGCACCAATAATC
TGAAATTTGTAGCAATATAAAACTAACATCATGATGCAAATTCAGTGTGC
AGTTACATGAACAGACATAGATGGACGTGTATCTGAATTTTATAGCAAAA
TATTTCATTCAAACCAAGAATATTTGTCTACATCTAGGTAACAAAGCTAG
ACGCTGAGATGCGTAAATTTTACTAGGCATGTAAATGCTAAGCACAATGT
GCACTGATTGAACAAAAAACCAATCAAATTGAACTGGATATGTACCAAAT
CAATAGATATGGCTTGCTGGCTAGAAGGTCTTTCCTGCTGGCGCTATAGA
TCTTGCTAGTTTCTTGCTAGAAAAAAAAAGATCTTGCTAGTTGCGATGTG
ACTTGTGGATATGCGGGCTGAGGCCATAAAATCTATCGGTGAGGACAGTG
GAGAAGGCATCTGTGGATGTGCCATGTGGATCTCAGCAAAGAACAAGAAC
AGGGAGATGGAGGTGGTGGAGGAGGCGGATGCTCCTCTAACCTTTGGATC
TTATGACGGCTCGAGACGTGGAACGTTTTCCCGTGGAAACAGCTCGGATC
GAGGTGATACACCGATGCAGGAGGGTGTCCAAATGGACCGCTGGTTTTTC
CCGGGCTAGCTTGCCCCGTGGAATCTGTGCCCTGGGTTTAGACGGGTATC
CCAGGAGGATTCTCTGCAACCAAACAATCCCTAACTGGCATCACCTAGAG
TCCAAATTACCCCGTGCCTACGCAAGATGCATTAATGACTCTACCTACTG
ACCAAATGGATCGATAGCCATATAGGACTAAACTGCATTAAATTAGTTTA
TATTGTTAAACACGGGATCATCAGGACAATTCCAAATCTAAGTGAAATTC
AATGTCTTTTGCTGGGAAGACAAAAACTGTATAGGTCTAGGTGATCATCA
TTGACACTCCTCGTCGTTCCATAACCATAATCATAGCTTAGGATTACATC
AAACTAGAACCTTCATACTCAACTCTTGTAGCAGATGTATATGGACAAGG
TATGTATATGTACTGATAAAAAAACTCATACAGCACCAGGACTACATGCC
AGATGGTGCTTTATTCTTTATTTTTAACTTCAATAAGCCTGTATAGAACT
TGATGACATATATCCAACGAATGTAAAGTTCGGTTAAGCCACGGTAGAAT
CACCTTTTTTCCTTGAATAACTTTGGAACAAATCTACAGGAAAAAGGCAC
TTTTTATGCTACTATTGGTTTGATCCACTTTCTCCTTTGAATTATTTTTG
GGACTTAACCACGAAACATCATAGCCAAATTTAATAAAGGAGAACACCAC
ACATTACTTATTTTCCAAGAATATTTATATTTAAAAAGGAAAACATAGAT
GTAACTTGTTGTATGGAGTATACACATAATTTTGGTTTATAAATATGGAA
AAATAATTCAAGGTCCAATAGATAATTTCCATATAAGGGAAAACACTATT
CGACCTCTACATGCAAAAAATGCCGAAATGATTATGCTAACATGGAACCA
ACTCTAACCTCCGTTTTCAAAGGCTCAATTTCCTGGTTGAATGGCCATTC
CGGTAAAGTATCACAACTACAACCAGATGATACAGACATAGACATGCTAA
AAATGATTAATTAGTTTCCTTGTATAAAAACCAATGTCATTTATGTGATC
AACATAACTGCCACACCCACACAGAACGTGTGACCGTAGCTTTCCACTCC
CTCCTCCAAATAAAAGGCCTCCTCGAATGTTCGGCCTAACTTTCAACATG
AACTCTAGTGTAACAAAATGTATGTTACCTAAAACAAAAGTTATACCACT
GGCAACTTATTACAAATAAGAATCCAATTGTTTACTTTAGTGGCATATAA
CTCGTATGTTGTTTGTCAACTTCAAGATCAAAGTGAGACTCAAAATTTGG
GTGTCACTCGTATATTTGGAATATGGAATATCTACTAAGCAAGCAACTTC
CTAAAAATAAAATACTCGACCATGATACAGAATTAAATAGCCTGCAAAGG
GTAGATTAGTTACTTTTTATTGAAAACAGTGTCATTTCAACATAGTCAAA
TCTGTCAACTTAATTGCCACACAAGCTAGAAAAAATGTGTGACTCGTTCG
ACGAATATAATAGCAGTAACACCACGGTAGAAGCACTTTTTTCCTTGAAT
AAGTTGGAACAAATCTTCACAAAGAAGTCCACTTCTTATGAAAAACTATT
GGATTGACCCATTTTCTATTTTGAATTATTTGTAGGACTTAACCTCTAAA
TCAGCATAGCTAAACTATTAAAGAAAGAAAAGATAGATGTAACTTGTTAG
ATGGAGTATATATATTTTGGTTTCTAAATATGGAAATGTTCCCCAAGGTC
GATTTTTTTTTCATATAACTGAAGAGAAAACATTCTTCGACGTCATCATA
CAAAAATGCCTAACATTCAATTTATTACAAAGTTGATATAAGAATTGTGC
CATAGTACAGGAAGGAAGCAACAAGCTACACAATAAAGTGAGAAAAAAAC
ATAGACATTACATGTAGTCGTTATTAAACCTCTCCACTCCTACCACCTAG
ATCTAACCTCTGGGTTATGGAAAGTGGTGGTTGTTTAACTCTTCCAACCT
AAGCTGACTAAGCATGGCTTGAGACTTTATTTATCTAGATAGAGTCAGGC
AGATATATCTTTTGCTTAAAAAGGCTATCAAGTCCGACTCCGCAGCTGCA
GTAATGGCCATGGTAGCAACCAACTGATGTAGAATTAAATAGCCTGCAAA
GGGTGGTTAAGTTGTTCTTTTATCGTAAACCGGGCCATCTATACATAGCC
AAATCCATCAATATAGCGTGTGCACTGACTGAAATGTGGGACTGTAGCTT
CCACTCTACCACTCCCAACCAATCTCCAAAAATGGGAGACACGATACATG
ATGGCATGACTAATCATCTCAAAATACTCATTCCATTATGCCCAACCATT
ATAACACCAACCAAATCTATCTTCATCCTTTTGGCAATACCTACTTATTT
AATTACAGGAAAATCCATACAGAAAAATTTATTGAAAAAAAGTTTGGTAG
GAGTATGAACATAAAATTTTGGTCTAAAAATATGAAAAAAAAAATGAAGG
TCTAAAACTTTGTTGGAGCATAAAACCTCTCAGCCTCTCCATTCGAAATG
CAGCGCAAACTAATTTATTATAACGTTGATACATGAGTTGCAGCACAGGA
CATGGAAAAGGCAAGGGACGAGCTAGAGAAAAAGAAAAGGAAATATTACA
TAGCCATCTCTAACCTCCTGTTTCCAAAGTCTCAATTTCTCGTGATAGAC
ACATAGACGTGCTTAAAATGATTGATTAGTTTCCTTGTATAAAAACCAAT
TTCGTTTCTGTATAATCAGATATTGATCAAGGTAACTGCCACACCGACTA
GAATGTGTGAGCGTAGCTTTCTACTCCCTCCTTCCAAATCCTTGAACTTC
GGGCCTAACTTTGAACATGAGTTCAAGTAACGTGAGACTCAAACACTTTT
GCAATAAGAGTCCAATGACTTACTTTTGTGGGATACTCATATTTTGCTCA
TGGTCAAAGTGGGATTAAAATTTGGTCGGCCCTTACACATTTGGAATGTG
GAGTATCTGAGAAGCAAGCAACTTCCTAAAATACCAGACCATGATATAAA
TCAACTGATACATAATTAAATGGGCGGCAAGGGGTAGGTTAATTACTTCT
TATTGAAAAATATATCATTTTAACATAGCCAAATCAGTCAACATAATTGC
CACACCCGCTAAAATGTGAGAGCTTCGCTTTCGCTCTACCACCTGCTGCA
AACCAACCTCCAAAACTGTGAGAGAAAATACGAGGTAAGCATCACGCATA
ATCCCAGCCATTATATATAGCCCCAACCCAACCCATCTTCATCATCCTGG
CAACTACAACTCATTTCACAAGAAGAGATCATGAGGAACACCACCTTCGG
TCTATTCCTCCTCATCTGTGTGGCCGCGTTGCACGCAGATGCATCGCAAG
AGGCTCAACTCAGAGAGTTCATCCGGTACAGAAGGAGCAGTAGCAATGTC
TACAGCGTAGATGAGCCGAGGGTACAAGTTACTGCTACTTCCAGGATCCT
CAGGGCAGAGTACTCTGTCTCTGACCAGACCAAGCTGAAGGCCGCTGATA
AGATCTCTGCGCTGCCAGGGCAGCCTGTGGTCAACTTCAGCCAGTACGGC
GGATACGTGACCGTCAACAAGAAGAACGGCCGGGCGCTCTTCTACTACTT
CGTTGAGGCAGCGACCGACCCGACGGCGAAGCCACTCCTCCTGTGGCTGA
ATGGAGGTTTGTCACTTTGAATATGCTTCCAGTTGATTAACCTCTTGCGT
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CTCGTCGATTGGCTACGGGGCGATGATGGAGCTGGGCCCATTCCGCGTGA
ACAGGGACAACAAAACTCTCAGCAGAAACATGCAGGCTTGGAACAACGGT
GAGGCACATGCTCACAGCAACTAAACCACCATCGATCCAATATGTACACA
TATTTCTTGTAAGTCACATGTGAGATTTTGCAGTGGCTAATGTGATATTC
CTGGAATCGCCTGCCGGCGTCAGGTTCTCCTACTCCAACACGACCTCCGA
CTACGGCAGCTGCGGAGACCGGAGGACGGCGGACGACGCACTTGTCTTCC
TCGTCAACTGGCTCGAGAGGTTCCCGGAGTATAAAGGCCAAGCCTTCTAC
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AGGGTATCCTGGTATGCCCGATTAGTTACCCAGTTATATACATTTTATAG
TCATGGCATACTTTCAGTGGTTTCTTTTACAACCCTCTTCTTGGTTAATT
AGGTTGGCAATCCGTTCCTTGATGGTGCCATGAACACAAAGGGGAGGAAT
GACTACCTATGGAGCCATGGGGTGATATCAGATGAGTCAAGGGCCAACAC
CACCAAGAACTGCAAATTCGACGGGTCAGATGGCGACGCATGCAATGATG
CTGTGCTCCATGATTCTGCTGACACTGATCCCTACGACATATACAGACCA
GTTTGCATTGAATCATCCGATGGAACATTCTACCCCAGCAGCTATGTAAG
AGAGCAGCACTGGATTATAAGCAGGCGCAGTTACCCTGAATATTTGCTTT
CAGAATAAGATTTTTCTGCTCCAAATTTTGCAGTTACCGGGATATGATCC
TTGCAGCGACTATTACGTACAGGCCTACCTCAATGATCCCAAGGTGCAAA
AGGCTTTGCACGCTAGAGCAACAGAATGGTCACACTGCATGTAAGACTGC
TTAACTGAGATCAAACAAACTATCTTTACGAGCAAATTAGCTATATGTCA
TTGTCCTTAACTGATGGCCCACTTGTGTAGGAACTTGCGCTTGAAAAATT
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ACGTAAGACTGCTTAACTGCGAGAAAACAGAACTACGTTTATGACCAAAC
AAACTACCCTACCCTTATGAGCTAACCGTCAGTCAGTATCCTAAACTGAT
GTTCTACTTGTGCAGGCTCTTGGGATGGAAAGATGCGCCGGTTTCAATGG
TGCCAACACTCAAATGGCTAATGGAGCACAAACTGCCCGTGTGGTTGTTC
AGGTAACACATATCGATCCCCGATTGAACTGCAATGGTGTTTCTAACATG
ACAAAGAAAGTGTATAACGAATAAATGTTTTCAGCGGCGATTTCGACTCC
ATATGCCCGTTCACCGGCACAAGGTACACCATCCATGACCTCGGTGTCAC
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CTACCCTCCTGATCTTCACATGTTTGTTCGTGTTATTACTGACACTGATG
AACGGTTGCAGGTTGGAGGGTATGTTCAAGGATACACGGGAGGGTTAGTT
TTTGCAACAGTGAGGGGAGCTGGGCATATGGTCCCTTACTCAGAGCCTGA
GAGAGCGCTCATATTGGTCAGCTCCTTCCTGAAAGGAATGCTGCCACTCT
AATACTCTATGAGAAGGGGGCAATGATATCTAGTATATGTGATCTGGAGT
AAAACTTGTGCATGAAATGCTTGAACACCGCACATCAGGTGCCGTGCAGC
TCCTTCCTGAAAGGAATGCTGCCACTCTAATACTCTATGAGAAGGGGGCA
ATGATATCTAGTATATGTGATCTGGAGTAAAACTTGTGCATGAAATGCTT
GAACACCGCACATCAGGTGCCGTGCAGCCATGTATGTTGTTACCTTTGTT
ATGAGCTCATAACTGCTGATTCTGATCTGTTCGAGAATTGTTTCAGAATC
CTATTTGATAGGCAGAGCAATTGTGCAGATACCGGGGTATGTATGATCCG
TTCATAAAAAAACTCTTGGTCCCAATGACCACTCTTAGTAAATTCTAAAT
CCAAACCAAACGTATATACTGATCCAGGAAAAAAGAGTTGTTCTCAAACC
AATGCGAATTTCCCGGTTGATTTTGAATAAGAAATATTCACATATCTTCA
GATCTTACCTGGACTCTACCATCGACTCCGCTCCTCGTGGCATCCACGCC
GCCATCGGCCTGCATACTCAATGCACTAGCATGCACAAACGTGGTTACTC
CATGGTTTGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.