Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA004749

[Submit comment/correction]

Sequence	AA004749
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA004749
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	GCAGCCTCCTTCTCCAGGTGCCTGTTTGGAACGAACTCGCCGGCAAACCA ACCAGGCAGCTAGGAAAATCGGAGGGGTAATACTTCCGGCCTACATGGAG ACACTTCCCGCCTGGCACCGGTGGTCCGGCCAACCGGTCATCACCTACAG CTGCGACGGCCACTTCTTACTACCGGCTGCGCTCGTATGGACTAGGATCG CGCAGACGCACACATCCTGTTTGACAATATGTCTCGGGCACTGAAAGGGT AAAAGCGTCTTTTCTTCGTGTAAGTACTAACAACTAAGGAAGGACAAATT CGATTTTGCCCATAGAGAAACAGTTGGGGAAGAACTGGGCTGCAGCAGGA GGACTGGAGGAGGCAGCCATGTCCTCAGCGGGGAAGCCGATCCTGTACAG CAAATGGTTCAGCTCCTGCTCCCACCGGGTCCAGATCGCCCTCAACCTCA AAGGTACGTGTGCTAGCAGCTAGCCCCGGCTCTCGATTCTGCCGCATAGG TCGCACGACCACGAACTGACGGAGGAATATGGATGCTCGATTGTTATAGC TCTACCTCAACTTTGTCAGTTAGCGATGAAGATCTTTCCTTTACTAGTGA CGTGATTCAGAGAAAATTGCTCCGGAATTTTAGAGGGCCGAAGTTTATTA AATTTGCTACTGCATGTAGTGCTAATTTTACACCGTTTTTACCTGTGTTG AAGGTGTGGACTTTGAGTACAGGGCGACCAACCCCATGACAGATCCAGGT ATGCTGCTAAATCTCTGCTCTTTATTACAGCCCGAGTGTCTACAATCTGT GATGGCCAATTACGATAGCAGCCGTATTTTTTTATGGGTTGAGGGACTGA AAAATAACGTCACTGGCGTCATCCTAACCGTAATGTTCCCAGTGATTTCT TAATGGTGAACAGTTAAACACCGCCGACCAACTGAAATTTTCTGGTTACT GCGTGCATAGACACAGATCCCTATCATTATATTGGTGCACATGATTTTAC GCTTGATCGATTGTTTCTTGAAGTGAAATTATATTGCTAGCTTCGTTACT GCAACCAACATGTGGAGAATAATGTAGATATCAATGTCTACTGAGATTTC ACCTCCTAAATTCTTCCTTTTGCTATTTGCTATCATCCACAAAGGAAATA TTTGCTTCAGTCCGTGAGGAAAATTTTGTACCCTGTGGACTCTCTTATGT CTTCGTGAAACTGTACACACGATGCAATACATAAGAAGCTATTGAAATAT TCATATCAGAGGAGTTACTGAACCATATAGAAAAGAGGGACATGATAGGC GATAGCAGTTTGCCAGTGTTAGTACGTACCTAGGTTTATAAATGGAAGTT TGATAATTATTTTCCTGGATCCATGTAGGTAACTCTTTGATTCTGTTGTT ACTATGTTCTCCTTTATAAGTTGCCTTCACGCTTCTTGCTGCTTTGCAGA TTATGAGAAAATCAATCCTGTTAACTTTGTCCCAGCATTAGTAGATGGGG ATTTGGTTGTTTCCGACTCTTTCGCCATCATATTGGTAAGCTCTAACTCT TCAAGACATCTGTTGAGCTTATAAAATAAACTCTTAAAACATGTGTGCGG TGATATGTTAGCAATTAACGAATTTGTTTTATATTGAGCAGTATATGGAA GACAAGTATCCTCAGCATCCTCTCTTATCCCAAGATCTAAAAAACAAAGC TCTTAATTTTGCAGGTACTTGTGTGTTTGAAGTTATATTTGTTTACACAT ACATGGTCAAGGATACCATTAGCACGAAACACTTTGAAGTGCTGAAACAA GTTTTAGATATATATTGGATTAAACTTGTTATGAGTTAACAATCTTACAC ACAGGTGGAACTACCAACTAATGATATCTTAACCCTATCTTATGCAGTTT CTGTTGTTGATTACACATTTTAATTTGTGCACATCATAAAGCATGTTTAT TCCTTGATGCAGATTGCAAGCATAGTGTGTTCAAGCATCCAGCCTCTTCA GAGCCACGCCGTTATCGTGCGTAAAGATAAAATCTTCTGTATTTTCAGGC TAATGTTAAACTTTCATTTTACTTATACTGCGATAATATTCATAGACTTA GTTTGTACATGATCTTTTGTAGGCTTCCTATCTTGGCACGATGGGTGCCG ATGAGAGCCTTCAGATGGTTCGGCATTATATCGACAAAGGCTTCAGAGGT GCGATTTCTGCCACTCTGTCAGTTGCCCAGAATTGTATCATCCTTTGAGC GACATGACATAGAAAAACTAACTATTTTCCTGTTCTTTCTTCTGTCCCAT GTCTGCCATTATATGCAGCATTGTTGTTGGTCTGAAGTCTGAACTTGTTT TTAATAATTTTGTTTCAGCGATTGAAAAACTTTTGGAAGGATGTGACAAC AAATATGCCACCGGAGATGAAGTCCAAATGGTTTGTGCTCCCAACCTCAA ACCCAGGCTTTGTTCTTTGATATGCGCTTGCTTTGCTTGACTTACAATTC CTGTTTTGTGTAACATCAACTAAGTAGGTGTTATATATATTGTGGCCATT TTCAGGGAGATGTGTTTCTAGCACCCCAGATCCACGCTGGTGTGACACGC TTCCAAATCGATATGGTATGCAAACGTTTCATAATGTTACTTAAGAGAAA TAGATGACATGGAAATAAGCCAATGTTGTTGCGCTGATTATTTGGAAACC AGTGTTGATGAGCTTCCGTTGATATTTCCTCTGGCAGTCGAAGTACCCTA TCAACAAGCTTACAATGAGCATCCCGCATTTCAAGCCGCGCTTCCTCAAA ACCAACCAGATGCACCTCCATCCCAGTAACGAGGACTTGGATCGAGCTGC GTACACTATCGACCTTTGCGTAATACTAGTACTCCTTCCGGTTCATATTA ATGGCCTCAACTTTGTCTAAATACAGCATCTAGTCTAAATACTTAACTAG ATACATACAAATCTAGATAAAGTTGAGGCTATTAATATGGACCGGAGCGA GTAACAGATTGCAAGTATTTTTATCATACGCTGTGCCAGCACATGTAACT TCAAAATAAGATGCTCAGTGTAAGCGAAGTACTCTAGCTCTAGTATGGAC TTGGGCTCATCGAGACTATCCATGGATGAGCTTGACGTTGATATAAAAGT AAATAAATGCAATAAATGATATGTGTGTAAATTCTATCAAACAAAATTGC CTGGTCAAAGCGAAAGAGACATTTTGGCCTTATCTTCTTCTCCTCTCTAC CTTCCCGACAAGCAATCATACACCTCTAGTCCAAGGTGACTTCATCTCCC TGACTTTCTGGGCCCTGCCTATCTTTTTTTGCAGGCTTGGGCAGCATCTT CCACCGTGCGCCTCTTCTGCTCTGCTCCGTTCACAGAAGGTCACCAATTT CATCACCTACTCATCATACTAATATAGTTTAGCTTCTGCGGTATAGTTGA GGAAGTAGTGGAACAGAAGGAACAACTCGAAGCAATGGCGACGGCGAAGC CCATCCTGTACGGCGCCTGGATCAGCTCCTGCTCTCACCGTGTCAGGATA GCCCTCAACCTCAAAGGTGAGTGATTCATGAGATTCTGGAGCTTGGTCAA GCAGCTGGTTCTTCATTATGCGCTTAGGACTAGGAAAACTTTTGAGCTTC TCCATGCCTGTAGTCTTAGAATTGACTATCTTTTGGGGTCAAATCCTGAA ACATTCTTCAGTAGGAAGGACTCCAAATGCTACCAGCTGTATATATAGTT CTTGGTCTGGTAAAATGTAAAGGAGTATCATAGTCCAAATCTCACAGTGC CAGGAATATTATGTTCCAAGTCCATGAGCACCAACTCTCTTATTGCAGGA AACGGAGCATAATTCAGCGGATTTCCTGTTATTTATTCTCCAATTGTCTT ATAGTAGTAGTTATGTTGTATTAATAACCTTTGATGATATGTCCACCTCC TGAAACTTTAAACGAGGACTACATAATTCTTAGTTTGGAGATATTACGTT CGTCTGGATTAGTGCAGAGCAATTTGATTTTGGAAAATTGGTGCAGACTT AAATGCTAAAAGTTTTAGGCTCTTGTAGTTCAGCAAGCTAATCAACTGAT TCTCTCTACGGTGCAGGTGTGGACTATGAGTACAAGGCAGTCAATCCTCG GACTGACACATGTAATCAAATTACCGAGTAACATCTTATATGCTAATTAT AATGGCCATCACCCCCTTAGGAAAAAAAAATAGCCATCTTATTTCTGGGT TTGCAATGTTGATAGATAAAATAGAGGTCATAGTCAAAATTGATGCAGTG GATGGAATATGGAAGAATATGGAAAATGCTAAAACGCAGCCGGCATGATC GCGTTGAGTTTATATGTGATACATGTTGCCTCAGGATGCCTACTTATGTT ATTACTAGTAGCCGCCTATTCCCCAAACATTAGCCTAGTCTCGTAGATCG AATTTGTGCACCATCTTTGATGATGAAAATCTTGGCTAGATCAAAGATAC AAATGCAATGCATGTTTCTCCCATCTATTCCCTGCATCATTCTGGAATCT ACAGAGAACCACACCAGAGAATTGCCTCTACTAGAACTTCTTTTCCCGAA CACGTGTCAAAACACACATAATTGGTTATCTGTTCTAGGAGGTTACTTTT CAATCTTTTGACCTCATTTCATCGGTACCAGCCATGGTGGTTGTGTAGGT TTTCCGCGTGCCTCTGCAACCACGGTTATATTTAGCCCCTCCTGTCCAAA ATAGAAGGATTCTTATATAAATGGGTCTGGAAGGAGTACCTTCTATGTTC ACATTTATTCATATTCGTTTTTAATGTGCAATTCACCCCTATGATTTTCT TATTGTAGACTATGAAAAAATCAACCCTATCAAGTATATACCAGCATTAG TAGATGAGGACTTTGTTGTGTCTGATTCGCTTGCTATCATTTTGGTGAGT CACTCACTCACTGTTCTTTCCTTCAGTGGATTACTTTTTCTGTCGAGAAT GTTTCCTTCCTTCAACATTCCAGTTCACATGTTGGATTGTTAGTAGTTAA CAAGTCCCTTTGTTCTGCACTGAACAGTACCTGGAAGATAAATATCCTCA GCATCCTCTCTTGCCTAAAGATCTGAAAAAGAAAGCTCTTGATCTTCAGG TATATGTCCAGCTAAAAGTCGTATAATTCTGCAGTTATATATCTTGTTAA TAAGATGCACGAATTTGCAGCATTGAAATAACTCTTTGGGAAGTAATTAC TTTCAAGCACGCTTTAATCGGTAACTCCAAATAATTAATTACATTCTTTG CTTACTGCAGATTACAAACATAGTTTGTTCAAGCATCCAACCTCTCCAAG GCTATGGCGTAATTGTAGGTTTTTACTGAGAGTTAGCTACACTGACAAGA TGCCGTCTTTTAAATGAGCATTTCAGTACCAGTTTGGTGGTGTATTCGTA CTTTCATTTACATAACTATTTTGCAGGGACATGAGGGTAGGTTGAGCCCG GATGAGGGCCTTCAGTTGGTTCAACGTTATATTGACAAGGGCTTCAGAGG TGTGACCTTTTGCAGCATATTATCTTTATAGTTAAATATACCTGCAGTTA TGGAAAAGAAAAGGGAATTCAGAAGCTCTTGGTTGTAGACCAGGTTTCCT GATATTGTTCAGTTGTGCTGTTTTGACCCTATCGACCGTACTTTTCGGAG ATATGAGAAGTATTAAAGTAACAAATTAAAAGTTTGTTAATCTTATTTTT CATAAAAAATTGGACTCAAATTTTCCAGAGAGCCAGATAAATGTGCCATT GAGTACCAGAAAAAAAGTAGTTCTGTCCTTTATATCTGTTTTTGCTAGTA TTTTCTTTTCTCGTTTTCATCATTACTTTCAAGCTTATCTTGGTTTGCTC TTATTATTCGTTGCAGCAATCGAAAAGCTTTTGGATGGATGTGACAGTAA ATATTCCATTGGAGATGAAGTCCATTTGGTTTGTGTTCCTGACATACACT TCACTAATTCATTTTTGCTTCTTTTCCTTGATCAGTCAGCTCGAGATGTG CTTCCAAGTTGCATCGTCCACACGATCATGCATAGTTTTCTCTAGCATGC CACCTCCATTTCACATTGTTACTGTATAGTCTATATTACGTGACCGCTAT GACGAACAATGATCTGCTACTTGTTAAACTTAAATAATCTTATTCTTGTA AATTTTGTGGTTTTGGCAGGGAGATGTGTTCCTAGCACCACAGATCCATG CCGCCATTCATCGCTTCCAGATTGATATGGTAATCTCCTTCTCTCTGATA TGCTTTAAGGTTTTTGATGATAGCAAGGAGCCAAGGTGGGCTCTCAGCCT ACTTATTCAGGAATCAACAACTACAAGCTTTGCCTTATTGCAGACAAAGT ACCCAACTTTGGCACGATTTCATGACGCATACATGGAGATTCCGGCATTT CAAGCTGCGCTGCCCCAAAACCAGCCAGATGCACCTTCAACCTAATAATC AGGAACTCGAGCCAGTTATGTAATTTCTGCAATAATGAGCGCAGTAGTCA TTTCTTGCCAGTGCAAGAACCTTTCATAACTTACCGGGGAGTTATTATGT GTGTCTCTACACTTTGGACTTTTGGATGATTTATTCATTTAAATAAAAGT CTGTGTGCATCAATCGATGCAAAGGCCAGAGTTTCACTCCCCTCTTCACA TAAAAAGG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.