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GrainGenes Sequence Report: AA037525

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Sequence
AA037525
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA037525
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
TAAAACGGGAAAAGGCTTTCAGGCTTTAGCTTAGGGTTTCTCCTGCTGCT
GCCTTTGCTGCTGCCCCGCTTCCCATCTCCGGCGAGAGCGCGTCGACCTC
CGCGGGCGAGGGGCTCCCGCTAATCGGAGCTCTCGGCGGGGCGTTGTCCC
GGATCGGCCGCGTCCTCCGCTCCAGCGCCGGATCGAGGTGCGTTTTCCCC
GTCCACATCGGCTGATTTGCTCGCCGTAGTACTTTCCTCTGCTGTTTCGT
CTTCCGGTCACCGTCGCGCAGCAAGCATTGCTTGGTGGGTTAAGCTTGGT
CAGGACACTTCCGCTCTCGAATCGTTGAACACGGCGGAACGGTCCGGGAG
CGGGCGGTGATTTCGAGGGTGATGGTACGGATCGGTGCGAGTCAGTGACA
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ATTCCACTGTAGTCTTGAAAACTGGATCATGTGTCAACCCTCTCATGCTC
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CACGTTACGCAGGTGGTAGGCTTTGGTATGAAGTGGAGTCATCAGTTGTT
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AGTTTTTAAAAACTATACACTTTGCAACATGTATACTACATGCTTAGTTG
CTTAATCTGCCTTTTAGTAGGATACTACTGAATACTTTGTGAAGAGGACT
TGAGCACTGGCTTGGTGCGATGGCGAATATGAACATAACTGGCATCTTGG
AGAAGGTATCCATTACGCTAATTTACATTCCTTGATAGTAATGAATCTTT
CTGCTCTTTAATAATACTTTGTAACATTACTTTTTCGTGCATGTGCTTTC
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CTTAGTGAATTAAACAAAGAGAGTTTCAAAGCAGATCAAGACCTTGAACC
AAAGTTGACAAATATTATTATTCAACAACTGGAAGATGCTTCAGGAGATG
TTTCTGGCTTAGCTGTGAAATGGTAATTTTGCCATAAAAATATATTCACT
GAATCCATTGATTAAATCCTTAATGTTTCAGCATCCCTGTGATCTTTGTA
TGTGTGTTGAAATTATCTTGCATAAATAAAGGCGAATCACATTTCTTTTC
GTGATGTCGGGATTGGAGAGTTGGGGATCTGGATTAGGAATGCAGGCGGA
CGTCCGCTACCGCACCGAGGCATGTCTGCCTGGTCCAATTGATTCACTAG
TCACGTACTCACAACTCATCAATCATTAACAATGTGTTCAATGAACTAAT
CAGGCGGCTGTCTGCTCCAGTCCGCTGGACTGTCTGGCATCCCTAATCTG
GATGATGCTATTCGCTGCGTTATAGATTGTTTTAGATGCATTAGCTGTTA
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AATTGTGGCGTTGGCTATTGGCCGTGCATGCCGCATGTGGGCTGAGGAGC
TGTTATTGTGCCGTTGGGAAGGAGAGAATTGAAGGCATGCACGTCATGTG
AGAGAGAAACAAGGAGATCATTCACCGCGCGAGAGAAAATCTAGGAATTA
ATCACACCGTTAAATAGGGGTATCTTTGGAAAGTATTTGTAGCGCTGGGC
TTTTCTTAATTCATGAGCCAGAACTTTTACGCCCTATGCAGAGAAACGGA
GGGAGTATTTGTTAAGATGACACTATACTTCCCTTTTATCTCAAAGATTG
CCTATAGTTTGCACTAGAAGACAATACTTCTTGAGTTACATGCTGTTTTC
TCATGCTTCAGTTATTTATCTGTGGGAGTTCTTTTTTGCAGAGAAATTTG
ATAACCGATTGTTCTGTTGTTATTTCCTACATCTATTTTCGCTATATTTA
CTCATTATTTCTTGTCTTGGTTAGCTTGGCTCCACTTGTCAAGAAGGTTA
GCGAGGATAGAGTAGTGGAGATGACAAACAAGCTTTGTGATAAATTACTC
AATGGAAAGGACCAGCATCGTGATACTGCTAGTATAGCTCTGAAGACAAT
CATTGTGGAAGTTACTACACCATTACTTGCTGAAAAGATTTTAGTTTCTC
TCGCCCCACAGCTGATCAACGGTGTTACCAGTGTAAGCTTTTTATTTCGT
TTCTTGTTTCCCAGGCTTTTCCGTAGTTGTCTGTAGACCTCTTAAGTTTT
AATTTTTCGAATGATTTAGTCTTGCATGATAAGTGATACTGGTTAAGGTT
TAATAATGCTTCTGATAAGGCCTTCTAGTTTTTAAAGGTGTACATATGCA
TAAAATTGTGAGTAGCTTTTTGTCTATCCATTGTATCTCACCCATTTATT
TACTCTTACAATGGAAATGACCTGTTGTATAGTTTGTTCATTTGCGTGCG
CAGTATGGGTGCACATATGTTTACTATCATGTATTGATGTTCCTCTAGTT
ATTATATGCTAGTTAGCAAATAGTGACTTGGAAGTGTTGCACTTTTAAAT
AATTGTGCATGTTTCAAGGATTTCGAGAATATAAATTTTTCAACTTGCTC
CATTATGCTGCTCATCATTTTGGTGCTAAATTATTGCAAATCTCTTTATA
CATTCCTTTTGTTGGCAGGGAAAGAGTGCTGAAATTAAATGTGAATGTCT
TGATATATTAAGTGATGTGCTTAATAGATTCGGCAACGTCATTGCAAAAG
ACCATGCATATATGCTCACTGCACTTTTATCCCAGCTGAGCTCCAGTCAA
GCAAGTGTCCGGAAAAAGTCTGTTTCGTGCATTGGTACGCCTGAATGCGT
TCTATTGTTAATGCTTGCAAACGATTGCATGATCATAGTTATTTATAATG
AGTGTAACATGTTGCTCTCTGTTGCAGCATCGCTTGCTCCATGTTTGTCA
GATGATCTATTAGCCAAGGCAACTTTGGAGGTTATCCAATTACTGAAAAA
TAGAAGGGCAAAGTCTGAAATAACTCGAACAAATATCCAGATGATTGGTG
CTCTAAGGTATATGCATCAATCTTCCAACTGCCACAAAAATTTCTTCATA
ACAAGCTTGTATGTGCTAAGATATCCAACTTCAAGTTCAGGCTAGTCCAA
ATATCGGTTTAATGTTACAGAAAGTGAATCTGGCTGGATGATATACCCAT
AGGAAAAAATATTTTAGGACGTAAGGAGTTATAAGAGTTTTGGTAGTTTC
AATTCATTTGTTTACTGGAACTCATTTCCTAATATGAAGGGGAGCCCTGG
CGCAGTGGTACAGCTGCTGCCTTGTGACCATGAGGTCACGGGTTCAAGTC
CTGGAAACCCAAAGTGGTCAGGCCCTTCCCTGGACCCTGCGCAAGCTGGA
GCTGCATGCACCGAGCTGCCCTTTAACTCATTTCCTAATATACCTTCCTT
TGACTTACAGTCGCTCTGTTGGATACCGGTTTGGACCCCACCTTGCTGAA
GCTGTTCCTTTACTCATAAACTACTGCACAAGTGCATCAGAAAATGATGA
AGAGCTCCGCGAATACAGCTTGCAGGTGAGAATTTATGTTCAGTTGTTAC
TTGGAATGCTAGAACATTTGCTTCTCCGTCGCTATAAATTAACTCCATCT
TTTAGGCCCTCGAGAGTTTTATGCTCAGGTGTCCAAGAGATATATCCCCA
TATTGTGAGGGTATATTGAATCTTGCTTTGGAATATGTAAGCTATGATCC
TAATTTCACTGATAGCATGGAGGAGGACACTGATGATGAAGTGCAAGATG
ATGAAGATGATGAGTATGTGATTTATATTCATCTAATACAAAATTATTGG
CTCCTATCAACATAATCATAAACATAACCTTTTCACGCAGTGAGAGTGCG
GATGAATACACAGACGACGAGGATGCAAGCTGGAAGGTTCGTCGGGCATC
GGCGAAGTGCCTGTCAGCAATTATAGTATCTCGTCCTCAAACGTTGTCCA
AGATGTATCAGGAGGTATGTGACAAAAAATAGTTAAACCAACATAGTGCA
GTTTGGTTCTTCATGACAGCATTATTCTGTTTGGCACATAAAGTTTTTGA
ATTGATTTCAACCATTTATTACCTGGTTTTTATAAGTAGTCGACTCATTA
AGTGCATCTATGGAATATGGTGTAATGTATTTTGTTGTATCCACTATGCA
GGCTTGTCCAAAGTTAATCGACCGCTTTAGGGAAAGAGAGGAGAATGTAA
AGGTAGGTGCATGATATTTCGTTGCTAACTTAGATTTCAATTTTCGTTGT
TTATCAATTTTCTGAAGTTTATCTGTGATCCTAGATGGACATCTTCAACA
CGTTTATTGAGTTGTTACGCCAAACTGCTAATGTGACGAAAGGTCAAGGT
GACATTGATGAGTCTAGGTAAACAAAATATCTGTTTCATTGAATTTTTAC
CCATCTGTACCATATTTTTAAAAGAATTTGCCATAAGCAGCAAATAATTT
CAGTTGTTTCTATGTTTGCATTAATAACCTGAGCGAGCCGTTCTTGGTCA
GAACTTGGTACGACTTATTTAAATGCACATGTTGTGATCCGGTCCAAATA
TTCAATCTGACTTATTATGCTCAGGGGAAGTTTTTTCTTTATCGTGATTG
CAAATTCTATGCACTAAGCACTAAGCCCATATTGTCAATATGTATGCTTT
GCAGCCCTAGATGGTTGCTGAAGCAAGAAGTACCCAAAGTTGTCAAGTCT
ATCAATAGGCAGTTGCGTGAAAAATCAATCAAGACAAAGGTTTGTTCAAC
TATCTTGTGAAGCATATGTGTGCACTTGTAATTGTGATCTATAATGGTTT
GTTGGCATTTACAGGTTGGAGCATTCTCAGTATTGAAGGAGCTTGTTATT
GTACTACCAGATTGTCTTGCTGATCACTTTGGGTCTCTTGTTCCTGGGAT
TGAGAAGGCTTTGAATGTTAGTGATTTCCATTTTGTTGAGACGTTTCTTG
TGCTGGACTTCTATTTGTTTTTAACACATTTTATTTGATAGGATAAATCT
TCTACCTCGAACCTAAAGATTGAAGCCCTTGCGTTTACAAGGATCGTCAT
GGCTTCACATTCACCCTCTGTGTTTCATCCATACATCCAGGTATTTTAGC
TACTATCTTTAATGAACTACTTGAGACACTTGTAGTCCTGCCTCATTGCT
AATAGCAGAATAAAATATCCAGGCACTTTCTGGTCCAATATTATCTGCAA
TTGGAGATAGATATTACAAAGTCACTGCTGAGGCTTTACGGGTGTGCGGA
GAGCTCGTCCGTGTCCTCCGTCCAAATTTTGAGGTTAGCCTTCTTCTCCA
TGAGCTGATATTAACTTATAAGCACCCGATTATGTTGATTTAAGCTCTTT
CTATTCTTTTATACAGGCACATTCTATAGATTTCAGACCATATATTGGTT
CAATCTATAAAGCTATATTGGCCCGCTTGGCAAATCAAGATCAAGATCAG
GTTTGGAACTCTCTTTCCTACATAACTGCCTCTCCCTGTCTCTCTGTGTC
TCTCGCTCTCTCATGCTCTCGTATTTTTCCAGGAAGTTAAAGAGTGTGCC
ATATCTTGCATGAGCCTTGTGATCTCCACTTTTGGTGATGGTCTTCAAAG
GGAATTACCGTCATGCCTTCCCATACTTGTTGATAGGATGGGCAATGAAA
TAACACGACTTACAGCTGTCAAGGTAACCTATTATCCGCACTTTCAACCG
GAACAACTAGGGACATGAAGTTCAGCGACTTTACCTTACCCTATTTAAAA
GTTGAATTTCAGTATTCTAGTCAACGATATAAAACCAAATGTAAATGTTC
TGATCAGTGCTGGGCTTGCTGTGTTGGTTTGGAGAGAGATTGTTTTGTGG
CAGTTTAATTAAAGTAAACATAGCTTCAGTAGAATACTAAAATGCACCGA
TTTCTTGTGTGGATCTTGTCGGCAATTCTATTTGTGTACCCTGTCGTCAT
TTGCTTAATGCTTACTGGTGTTGTTTCCAGACAGTTTTGTTTGCTATATG
TTTCCTGTATGGCTATAAAGTGCTTTTGCTGTTTTGTTATTGTTTTCAAA
ACGTTCATTCCTTTACAGGCATTTGCGGTGATTGCAAGTTCACCTCTTCA
GATCGATCTCAAATGTGTTCTGGACCATGTTGTTTCTGAGCTCACAGCTT
TCCTTCGGAAGGTAGAGATATATTGTATAAATTGTTTGTTTGTTGCCTTC
AAAATTTGTCCACTTTAAAGAGGACACCAAACTTGAACTTGAAGTTAACT
CTTTATTGCCCCCTTTCAACAGGCAAACAGAGCTCTTAGGCAAGCAACAT
TGGGAACCCTGAATTCTCTGGTTGTTACATATGGAGGTCAAATTGGGTCG
TCCTCTTATGAAACGATAATTGCTGAACTTTCTACTCTCATAAGGTTTTT
TCCCCGCTTGGCTTTCTTCAGCAATTCTCCATTTTCTGCCTACCATGATG
ACTGATGTTGTTATATTTATTGCTGCAGTGACATCGATTTGCACATGGCT
GCTCTTGCATTGGAACTGTGTAGCACAATTATGGTCGACAGACGTTCCAT
TCAAAATGTTGGTTTAGCTGTGAGACAGAAGGTTTTGCCTCAGGCCCTTA
TTTTGATCAGGAGTTCTCTGTTACAAGGTCAAGCACTGCAGGTATATATT
TTTCATATTTAAGTATAAACACTTGATATCTTCTTATGCTCCAACTGACA
GAGGACATTGTTTCTGTCACAGGCACTACAAAAGTTTTTTGCTTCACTGG
TCCAGTCTGCAAATACAAGTTTCGAGACTCTGTTGGACTCCCTTATTTCT
GCTGCCAAGCCATCACAGTCAGGCAGTCTTGCCAAGCAAGCGCTATCCTC
CATTGCACAGTGTGTTGCTGTGCTATGCTTAGCTGCTGGTGATCAGAAGT
GTGCATCAACTATTGAAATGCTTAAAGGCATTCTAAAGGATGACAGCTCT
GCTAATTCTGTAAGCCTTTCTTTTCCTGATCATGGATGTCTTCTGTTCAC
TAGATTAACACTTCTATATCTATGTGATGCTTGCAACCGTTCTCTTTGGT
AATTCATGACAGTTAGCTTTAAAGAAAAATCCATTCATGGGCATCGTCTA
CCTAGTAGTATAGCATTGTGAAATCAGGATAAAACATGCTCTCCCATAAT
TTAGTATTTCAACGCTGAACTCGCAATGGAAGGTCAAGTAGCATTGTTCG
CCATTTATAGCCAACATATTGATTGGTGCTCTATAGTCTAATGATCTTAA
AACATTGAACTGTAGTTAAGCAGATTGTAAAGTCTTTGTAGGATTAGTGC
CTAATTATGATGGTAATAAACAATCTTTATTATTTGCATTGTTTGATTGC
TTATATTTATGTTTAACTCGACGATGAACTATGTATTCTCTTTGTCATTT
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TTGAGAATATTGTCATTGAATCATTCCAGTCACCCTTTGAGGAGATAAAG
TCTGCAGCATCATATGCTCTTGGAAACATTGCTGTTGGCAATCTATCAAA
GTATTTGCCATTTATCTTGGATCAGATTGACAATCAACAGAAGAAGCAGT
ATCTCTTGCTTCATTCACTGAAAGAGGTTAGTTTCTAGTGGAATTATGTT
TGTAAAGCACCTCCTGTAAGACTTGTTTAATTTGTGCTCTTTGCAAAATC
TATCAGGTAATTGCACGTCAGTCTGTTGATCATACTGGCCAGAGTGAGCT
CCAGGACTCAAACATTGTGAAGATACTGGCATTGCTCTTTAATCACTGTG
AAAGTGAGGAGGAAGGAGTCCGGAATGTGGTTGCTGAGTGTTTAGGCAAA
ATTGCTCTTATTGAACCTAACAAATTAATCCCTGCTCTCAAGGTATGAAA
TGTGGACAATTAGCAAATTTACATTTCATGTTGCATTTATTATGATTACG
GATCTAATGGGGCATTTCATATAATTTTATAGGAACGCACATCTAGCCCA
GCAGCAAACACAAGGGCTACAGTTGCAATTGCCATAAAATATTCAATCGT
TGAACGACCTGGAAAAATAGATCCAATCATGTACTCTGAGATTTCCACTT
TCCTTATGTTGATTAAAGATAGTGACAGGGTAATTCTACTTCTTGAATTA
GTCTTCACATATTTACTAACTAATGTTCATAAAGTAAGACGTGAAGCTGA
CAATTGCGTTTGTTGTTTGCATTTCGCAGCACGTGAGACGTGCAGCTGTC
CTGGCATTGAGTACAGCTGCCCACAACAAGCCAAATTTGATCAAAGCTCT
TCTTCCTGAATTGTTGCCTCTATTGTATGACCAGACTGTTGTGAAGGTAT
CTTTCCTTATTTATGTCCTGGAGGTGTTGTATAGTAATTTATACTCCCTC
CGTTTCAAAATATAAGATGTTTTAGGTTTGTGAAGAAAATGAATCTATAC
TTCTTTTACTGTATAGATTCACCCCAATGTTGAGTGAACCTACGTACTAA
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AAACAGAGGGAGTACCTAGGAAGGAATGAACTAATGATATTCTTCTTTTG
CAGCAAGAATTGATCAGGACAGTTGATCTAGGTCCTTTCAAGCATGTCGT
TGATGATGGGCTTGAACTTAGGAAAGCTGCATTTGAATGTGTGGACACAT
TGCTGGATAATTGTCTTGATCAAGTGAATCCGTCGTCCTTCATTGTTCCT
TTCCTCTTATCTGGCTTAGGCGGTAAGTGCAGGTTTTTGACATTATATTT
TTCTTCACAGTACTTTAAAGGGTGGGTTTGGTTGTGGCTCGGTTCCCAGA
TAAGCTAAACACTGGCAACCCAATTTTTGCCCACGCTTTGCAGGGCTGCA
TCAGATATCAACCAAACATACTGCATATAACCAGTGATATTGTGTATAGC
TTAGTTTTTTGAGTTCTCGTGGATATATGGCCCACATTACTTATCACTAT
GTAGTCCTCTTGTTCCTTTCCCTAGCATAAGCTGGCATATAACATATACT
ACATCCGTTTCAGAATATAAGGCGTTTTAAGTAGACTAATTAGCCTCCCT
AAAACGTCATATATTATGAAACAGTGGTAGTACTATCATAATCTTGTTGA
ATGTGTTTTGTCAATCTGGACTTGCTAATCAGGTCTTACTGTACTGCTTA
TTGCAGATCATTATGATGTAAAGATGCCTTGCCATCTGATTCTCTCAAAG
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GACCTTTTAAGGGATGTTTCATATTGCGAATGCCCTTTCTAATATTATTG
TTATCTTGTTTCAGTTTTGGACTCATTAGTTGAACCTATTGAGAGAACTA
TCAGTCACAAACCCAAGGGCGATGCAGTTAAGCAGGAGATTGATCGTAAT
GAGGACATGATCCGCAGTGCCCTTCGAGCCATTGCTGCTCTAAGCCGCAT
AAGGTAAAGCTCGATCCCATCTTACAATCTCACGACTAATTCTGGTTTAG
CCAAAACAATACTCGTCTTGTTTAATTGCACTATAGACGATCCATTGGCC
ATAGCTTTTATGCCTGACGTGACATTTTTTATCTCATGACTTTCCTGCAG
TGGCAGCGACTACAGCATGAAGTTGAAGAATCTGATGAACAAGATAACGG
CCACTCCTTCACTTGCCGAGAAGTTCAACTCTGTGCGCAGCGAATGAAAG
CTGAATTTTTGTACATGGGTAGAAAATAGGTGAGCCAACTTGGTACATGG
GCCTGCCGATTCCCAGGCGAAGTTCCAACCTATTGCGCTAGGTTAATATA
TACTGGACCCTTTTTGGCTGAAAGGCCGTGCGAGAGAACATGGGGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.