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GrainGenes Sequence Report: AA035876

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Sequence
AA035876
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA035876
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GCGAGCTAGAGAGAGAGACAGAGCGAGCTGCTGCCTGCGCTAGTATTAGC
TCCGCCTCCCCCTCCCACCCTCTCTCTCTACTCTCTCTCCTCCCCCGCTC
GCGCTCCGGAGCTCGAAACCCTCCCCATTTGGCCGCGCCGAACCCTAACC
CTAGCTGCCGGCTGCTCCCCCCCGCGCCGCGGCCTGGAGCCGGAGGGGCG
TCGATCCGATCCGCCCACGCGCCGCCCGCGCCGATCGAGGTAGGTCTCGC
ACGAATCAGCCGGAATTCGCGGCCGGTCCTCTCCCCTGGCGCTCCTTCCC
CTGCCGGCCGTGAATCGGGCGGGGCGGGGGCTCCGTCGCAGGGCCCGTGC
TGTGTCTGGAGGTGGGGAATTTTTTCTGCGTCGGGTGAGAGAGTTTTAGG
GTTCTTTTTTCCGGGGGGATCTGTGTGGGTGGGGGAATTGGGAGCTCTGC
CGCGGTCGATCTCGGGGTGGCGCGGCCTCTCGTGCTCGATTGGCAGCTGA
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GGGATTCGGGCGTCTCCTAGTGGGGACTGAAACGTGGACGGGATTTAGGG
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GTCTATGTGGGGAAAGATGTGATCTTTGGGCTTTAGCGAATAGATGTGAT
CTTTGAGAACTTGTAACTCACTTTCTCTTCTATTTGCTTGATTTACTGCC
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AATTACTACCTGTTTGTCAGTTGTTTGAACCTCTCTTTTATGCATCTCTT
GGGTTGTGCTAATTGGCTCCACTTGCCATCTAGAAACTAACAAAATACAG
CAAGTTCATAGTTCAACCTTGAATTGCGCCACCGTCCTTTTTTGGACTGC
TTTCGTCTGACCTGGGCTCACACTTGAGGTTGTGGGTGCCAATATTTAAG
CCATCCTGACTGCATTAATCAACCATGCTCTTAAATTCTAATGCAGGTGT
ATATCCATTTGTTTGTTAGTTGCATCTCTAGGAGACTTGGAAGTGCTAAT
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AATAATTCCAAACTGCAGAATAGATACGAATAGCCAAGGTAGCTGGCGAA
TCCACTCTTACTTTGCATGCTCTTGGAACTGCTTATTTTTTCTGCAATAG
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CTGAACTGGTACTGCCTTTTCATTTATTTTAGAATCATTCAACAATGTTC
TCATGCAAATATTCTTCAACTTTCGCAGGCTACACATAAATAGAGGGCAC
GTCTACAGATCCACTTAGCTAGTCTTGTCATTCCTGGGTGAGCCTTCTTT
GGTAGCTTCGGTGGGATCATCTTCATCATCCCGGAAGGCAGTGGCAAAAG
CTGGTCACATTGTCATTTGATATGAAACTTTGGGATTTGCCTATTGCAGA
CAGTTCGCGCTTTCACGGGCATTAGACTTGTAGGGACTTTGGAAATGTCA
CAGTTTCACCACACACAGCATGGGGGTGATAGTGATTTTCAGATGTGGCA
GCAACAGATGATGTACAAGCAACTGCAGGAGTTCCAGAGACAGCAACATG
TGCAGCAGATTGATCATGGAGCCAGGATGCAGCCCTCATCTGGACAATTC
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CTTAAATGGTTCAGCGTTTCCGAACACTCAAAATCAAGGCATGAGACTCA
TGGGCTTGGCTAACCCCCAAATGAACCAGTCCTTCTATCCAATACCTGCT
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AGCTGATCTCCAGAATGCAATGACAAGGGCAGGTACAAATCAGCCTGAAA
AAGTATCAAGGCCATTTAGCTCTTTAATGGATGAACCTAGTGCGCACGAG
AAACGTGACTCCAGTTCTATGCAGAATTTTCGTGGGAAAGGAGGGTTCTT
AAGCAATAATCCCTTACAAAGTCATGGTGATAATAACAAGGCAGGCAGCC
CTGCTCCAGTAAATCAACTACAACATGGTTTTCAACTTCAAGATTTTCAT
GGTAGGCCAAACCAAGTTGATTTTCAAGTGGGCCTGCAGGAGAAATCAAC
AATGCAGGTAGCGCCAGCAAGTGGTGGGGCTAGCCTTGACCCTACCGAGG
AGAAGTTCTTATTTGGGGATGATGAGGATAGCAACTGGGGAGCTTTGTTG
AAAGGAGACAACAACCATGGTAATTCTGTTGATAATGATAACTTTGGTGG
TGCTTTGCCATCAGTGCAGAGTGGGAGGTGGAGTGCCCTTATGCAAGAAA
CACTACAGCCTACACCCAGTAAAAATAGTCCTAAGGAAGAATGGAGTGGC
CTGAGTTTGCAGAAAGCTCAACAGACAACTGCCAACAACTCAACTTTGCC
AGCTCATGACCAGAGTAAGCTTGCGGCATTAAGTGGCGCACAACAAAATG
CACGACCCTTGTCAGCATCTAGCTATGCTGATGGAGCAAGGAACAACCCA
GATTTTACCAATTTTCATCATGCTACAAGAACTCCGTACGAGCAAAGAGA
AAAAACGCCACATGAATCTCCTCGTGCTACTGTTACCAATCATCAGTCAG
CTGCAGGAGTCAATAATGGGTATATTCAGCAGAGCTTGAAGCAAAAGCAA
TCTGATGAATATGGGAGACAAGAACAAGTGCATTTATCAAATGGCAACTG
GGCTCAACAGAAATCTGAAATGCCAAGAAACAATTCACACCTGACTGGCG
CACCAGCAAGTACACATGGATTTTGGATGTCACAGCAAAATGTTGTTGAT
CATAATATCAACCAAGAGTCCAGCAGTAGCCAGAATGACTGGAAAAGCAA
CAGTCCCCTTGGACAAGACATCACCAGTACCCAAAACGTCTTTAATAGTG
ATGGGAACTTTTGGAAGCCAAGTGGAGGTAATGCGAATTCGGTCCATAGG
CTTCAGCAGATGAAGCCTGATATAAGCACTATGCAAATGCCAAAGGACAG
CTCTGATGGTAAAGGTGTTAGTATGATGGGTTCGAGCATGCCAACAATAA
ATCCGAACCAGCACCAGATGGTCGGTCGAACCGGTGAGCATGTTGGAATA
AACCATAGTATTGGGCGTAGGGGTCCTGAAACCTCAGAATCACTAAGAAG
AAGTGCGGAGCCAAGAACAAATGACCGTGGCCAGGAGTACCAAAATGCAC
TACACATGGAAAGGCATGGACAACATGTGAGCAGTGACCTTGCTGCCAGG
AGGCATTCCTTCTTTGCTGCAAAGGAATCCCATAATTTAGGTCATTCAGG
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CAGGGGTGAACATTAGGCATTCTCCGGGTAATCCAGTTTCCAGCAATCAA
TTTCCGCCCCAGTCACTTCAGGCACAAAATAACCTGAAGCCTCAGTTTGT
CGCCAACTCCCAAGTTGCGGGCAATATGGCTTCAGTTAATGAGGTTTGTC
TGCCTATCTCCTTAGTGAAGAGGATATCTTGCTTAAACATATTTTATTTA
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TAAGCTTTACTTATGCAATTTATTTTGTGACTGTTCCACTTTCTGTCTCA
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TATTCTACTAGTAATGAAGTGAACTTGAAAACCCACATCCCTGTATGCTA
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TTCTACTTATATATATTACAGTATTCATTGACATATTTTGTACCACAAGA
TCTTATGTATTGCCATGATAACTTCTTTCAGCATTTTTAGTAGCAAACTT
ATGCTTGTGGTTCTTCATGATGATCCTGACAGAATCTATGTTTTATGCAG
TCAACATATGCTACAACTTCTTCATAAAGTGGACAACTCAACAGATAGCA
ATGCAGTTGCTGACATGCCCAATGGTTCTCTCGATAATGTTGCTGCTTCT
CAGCAACAACCTAATCAATCTGCTTTGCAAGGATTTGGGTTAAGACTAGC
ACCACCGTCCCAACGACACTCAACTTCAGATCATTTATGGTCTAGTCACA
CTAATGTTGATGGTAAGCAACCTGAACAGTCGGCAAGGGAAGAACGCCAA
GGGCAGACACCTTCCACTGCTACCCAGTATTCATCACCTGCTCCGACAAC
CTCACAACCAACAACATTCCACTCTTCAGAAATGGGTAGTACTGGACAGC
CAGTTGGACAGTTCCCCCAGCTAAGTTCAGGCCAGCAATATCCTGTGCCA
GAAACAAGATCTGGTTCTGTGCCCACTCTTCAACAAGGCAGCTCAGCAAC
AGTATTCAAGAATGTGTGGACAAACATATCAGCACAACGTCTAGCCGGTA
TCCAATCTAACAAGATTACACCCAATATTCTCCAGTCTATGATGTTTTCC
AACAGCGCTTCAGATTCCAACTTATGGGGCTCGCAAAAGGCAGACGACCA
AAGACAGAAGGCATCAACGCCACCAGATGTTGCCACAAGTTCTGCTAATT
CACATAGTCAAGATACAAAACAAGCTCTGGACACTGATGCAGGGTTAGCC
TCTTCAGAGATGGCAAATTTTGATTCCACTGGAGCTGGTGTACTCCGAGG
GAATCAATCCCTGCAGAAGCAGTCTTCAGATGGGAACTTCGCCATTCCTG
CTTCAGCCTTGGCACAGTTGCATCAGCAAGGTATCATGAACCATAGGCAG
GGAGAGAGCCCTGCAGCTAACTTTCCGGCTTTGAATACTTCTCACAACAT
TACTACTAATGGTAGTGGCATTGGGTTACATGGAAGCTCAGTATCTTCAA
ACCTCCAACAGCAAAACTTCTCTCTCCTGCATCAAATGCAAGCATTAGGT
CATGTTGATACAGATCCAGGCAATACAACTGGAAAGATGCTTAAACCAAA
TGAGATAGTTTCTGAAGCATCGCAAGTTGACTGGAAGTCTGCTCAAAGGT
TTGCACATGGAGCCAATAACTCAGTCAGGTCGTCCATAGATAACATTGTT
GGTACTAGTGTACAAGGGTCATTCCCTTCAGACATGAAAATGCTAAGCTT
TGCTCCGAGGAACAATGAGGAGAGAAGTACAAGCATACCTTCACAGATTC
CTTCCAGGGAACTTGCCTCTCATTCTATGGTCGTGCGGAATGATCATCAA
AGTCAAGTTCAGTCTCTTGGGGCCAATGCAGCATCAAATTTGGTTGAAAG
AAGTGAGAGACCTGGGATAAACCCTCAAATGGCACCTTCATGGTTTGAAC
ATTATGGAAACCAAAGAAACGGTCAGAACCATTCTGTGTTTAATGCACAG
AGGACTCCAACACTGCCATATAATGCTCCAAAAGCTTCTTGGTGCATGGA
AAATAACTCCCCTGAGCATAGAGCTGATTCTGACCTGTCTGTCAGGCCGT
TGGTGCCTTCCAATGTGAAGGCAGCTTTGATGAGAAGGTCAAAGAAGCGC
AAATCTACAGAAGCTGCTCTTGTTTCTTGGCATAAAATCACTGAAGGCAC
TCAAAAATTGAGAAAGATGAGGTAAATTTTCTCCCCTTGCAGTGCAGCAG
TTTGCACCAGCATGACAGCATATTTTTTGTTCATTATTTCTGGAGTTGTT
TATCTTATGTGGTCTTGATATTGCTAACGATTATGACTATCTCCAATTGC
TTGACAGCACGAACGAGATGGACTGGGCTTGGGCAGCTAATAGATTAATT
AAAAAGGTCTGCACAGCTTTACTTTTTCAGCTACTTTGGGTCTCATATAT
TGGTTCATATAATTTTTATTTGATACTGAATTGAGTTTCTTGACAGTCCG
AGGATGATCCAGAAAGTCTAGAAGATTCCCCTTTAAATTATCTACCACGC
AAAAGGTTAATCGTGACCACAAGGTTGATTCAGGAAGTTTTCCCTGCTAT
ACCAGCAAGAGTTCTCAGAGCACAAGCTGTATCAGCTTATGAGAGTGCAA
CATACAATATCGCTCTGGTGACACTAGGGGATACGTGCATTATCTCATCA
GATAACTCCCGCGCTATTACAAATAATGAAAATAAGTAAGTGTTTGTAAA
GTGAACATTTTTTGCTCGTTCTCTTGTGGGCATTTTATAATCCCATTGCT
TATTCATGTCCTAAGTATTGCACTATTATCGATCAGCCCATCTGAACAAG
GAACAAGGGCCAAGCAAATGGAAGACAAGTTATCAAAGGTTGTGGAAGTC
TTTGTTGGAAGAATCAGTAAAATGGAAAATGACTATCTCAGGTACAAGCA
GCCTATCCAGAAACAGCATTGCTGCTTCTCATTTATTTCTGGACCTGTTC
GGATTTGTGCGTTTATAAATTTCCACATCTGTTGTTAGAATATTTATATA
TGCAAAAAAAATAATGATTTTAATTTTATGTGCACTGTACTAAAAAGATA
AAAGCTTGCTAACTACGGAAGCATATGGGCCTTTCGGATGACTGGATGCA
CCAGTCAATATTTAGGGACTTGTGAGGACTCCCGTATTAGCTGGCTTGGT
TCTTCTTTTCTTTACATTTTTGCCAAGGCGTTAACTTGTTGTAGTGTGAA
TTTCTTAATATTGGGCTACTTCATTTGTAATGTTTTTAGCCTGGGTTTGG
TCACTGGTGATATGAATATGGTAGGAATAAACGTTGATATGTTAAGTTCT
AACAAAATGGACAGTGAATATCACATTGTTATTCTCCAATGAACCGTCAG
CAGTCTTTCTCATCATTGAGTTGAGCTCTAGTGATCAGAGTCATGACATT
ATTTTATACGAGATACCAAAGGTCCATGAGGATAAATGGGCAACCTCCAA
GCCAAGAAAAGGCTTCGGGTGTGTCACTGTCACTGCCTTTGACACTTGAT
CAGTGATTTAACTCAAAGAAAGTCACATTATTTCCCTGTTTATTCTTAAG
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CTTAAACTGTGTTGCATTTCTGAAAAATCTTAACTAGGGCTTGTTTACCT
TAAATTTCCTGTAAACTCCACTCATGACATCAATTGTATTTTTGCTTCTA
GCTCTTCTTTCTGCCCCTGTGATGAATTTCAAAACTACCTTTTTGTTATC
CATATTTAGCTGGACTTGTAAAGTGATTGTTTTCAATTTTTCCTCTCGTT
GCAGTTTGAGCAAGAGGGCTTCAATGCTAGATGTGCATCTGGAGTGCCAG
GATTTGGAAAGGATTTCTATCGTAAATCGCTTGGGAAGATTCCATGGCCG
GAACCATGCAGCCGGAGTTGAGGCCTCATCGGGTTCACAAATGGTTTCTC
GCAGAATTTTCCCTGATAGACATGTCATGTCTTTTGCTGTGCCAGGAAAT
CTTCCTGAGGGGGTGATCTGTTTTTCACTCTAGTGCAACGATCTCTTGCA
TTGTTCCTCAGCCTCTCAGATCGCCTCTGGGGTTACAACTGCGATTTCCA
ATGCTCCTTTCTATCCTGCAAGGCATGCCGTTATACAGAAGGGTCAGATC
CAGGGGTCGTTTGGAAATCTCAAGCGTCACATGCGCCAAGGAGATGCCAA
GGGATGTGTCCAGCCGATCAACTCAGTGCGGGCTGTTGTTATTTCTCCCT
TGTATGAAGTATAGGTCCCCTGTATATTGTGGAAAGTAAGGAAGAAAGAA
AACCATGGACCTCGCATCATTTTGCTGATGAAGGAAGGGGTATTAGCTTT
CATAATTTGTTAGAGAGGTTGATGCTTACTAGCTTAGCACATCTAGCGAA
AATTTCGCTACTTGTCATCTTTTTATCCATGATGATGAAGTTGTTGGCAG
GTTAGAGGGGTGAATAATAATATTTGAGAGCCTTCCTCTGGGTTCTTTTG
TTCCTTTAGGATGGGATGCACAATTGGCTAGTGTTTCCAGTCGAACTGAC
CTCCTCCCCTTGTTTAGTCAGCAGTTGATTACTCTTGTGTTATGTAGTGC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.