Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA043349

[Submit comment/correction]

Sequence
AA043349
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA043349
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CTCGCATACGAGAATCCCACGGCCCATCCATTCGTCGGGCAAGGGCAAAG
GCCCCAAACCAACCCGCAAGCCACACACCACCACCTGCGCCACACCATCA
CCGCTCCGACGCGAGCGAGTAGGGTTCTCTGTCCGCTTCCCCTCGCCGCC
GCTGCTCCTGCTCGCGCGAGGTAGAGCTCAGCAGCCGCCGCCGGAGGCGA
GATGGCGGCGCTGGTGGCGACGAGCATGGGGGTGGTACGGGAGGTGCTGG
GGGACTCCGTGGTCGACGAGGTCGACCAGCCCATCGTCGACTACATCGCC
AACGTCCTCGCCGACCAGGACTTCGACTTCGGCCCCCCCGACGGCCACGG
CATCTTCGACGCCCTCGGCGAACTCCTCATCGACGCTCGCTGCGTCTACG
ACCAGGAGCACTGCCTCGAGGTACTTGAATCACATCCCCCAAGCCCGCCG
CCTCGAATCTGATCGCCGTCCCGCTTCCCCAATTTGGGTTAGAGCTTCGA
TTTGACGGTGCTCTAGGTTAGAATATTCGGGCAGCTGCGTCTTACTCCTC
GTCGTTCCATTTGTGCAATCGCTGTGCTGGCCATGCTATTTGGTTGAAGT
CTCGAAAGCCTGAAAAACCTAGTTTAGCGCTCACATCACAGTAACAGGAT
TTAGTAATCATCAAATTATAACTGTAGTCTAGCTCTCAATCAGTTCCTGA
TGTGGTGTGTAATGATTTAGCTGCTAGTCACTTACCAGTATGACATGGGT
GCCATCCACCTTACCCCATTAAACATTCGTTGATAACATTGGCATGGGCA
CCATTCTGGGTCCAGAGCTGGAATCACTAGAGGAATTGCTTAATTTTGAC
TATACATGGCTTTGATCCCCTTTTGTTTCCTTTTCACTATAGGTCTGTGC
TAAGCTTTGTGAGAAATTGGGAAGTCATGGCATCGTAAAGCCTAAGCAAG
CTGTGCGGAGCCTTGCTGCGCCTTTGCGAATGAATGCGGGGATGGAGGAG
GTGAAAGCTCCGAAGAAGACAGAATATATTTTCGATGCACCCCCACTATC
CGCACGTGACAAAGCCAAGATTGAACGGAACAAGAGGAAAGAAGATAGGC
AAAGAGAGGTAAGCTGTTCACTCCTAGATTGCCTGGTGACAATATTCCTG
TCTTTCATGAATATGTTTCTAGCGGTTGAATTGTTGTGCTCAGCACATTT
TCCCCCTTCGACAAAACTTTGCATGAAGTTAAAAAATGCCTTCCCTCATC
AAACTTGATCCATAAGGTATAACATGTTTCTTGTTGGTGCAGGCCCAGTA
CGAAATGCATGTTGCTGAAATGGAGGCGCTCAGGGCTGGAATGCCTCCAG
TTTATGTAAATCACAGTAATGTTGGTGGGTCAACCATTAGGGATATCCAT
ATGGAGAATTTCAGTGTTACTGTTGGTGGTCGTGATCTTATTCAAGATCA
AACTCTAACACTTGCTTTTGGAAGGCACTATGGTGAGTTACAACTTCAAT
TTCTACATTTATAAAACTCTTCCACCTATTGAGGATGCTCTCGATGGTAG
AGATTGTGGATGGCCATGTCCCACCTGCTCAGGATAATATCATTTAGTGA
TGCAAGTGGTTGGTTCACCATTAGGGTACACTTTACCCTCTTTAGTTCAA
AAAAAATGAACTAACTTTTCGAAAATGATGATGTCGTTGCAAAAGTTAGT
TTGTTGAACTAAATAGGGTAGAAGGTACCCTAATATTGACCCACTTGCAT
ATCTGATCTCACTACTTCTGTTGATGGAAAACTATGTGATGTGTAGTAGC
TCTCTTGGAATAGCCTTCGAACAAGGAAACACAGATTTTGAAGTACTCCC
TCTGACCCATATTAGTTGACTTAGATTCATCTATATACGAATGTATCTAG
TCAAGTTTTTGTGCTACATACATCGTATCTAGACAAATTTGACTCAACTA
ACATGGGTCGGAGGGAGTATCAGTTCTTGAGAGAGCATCCAAGCACCTCC
ACTCATAGAAATTTGCTGTATCAGTAACTATTCCTTTTTTTGTTCAACGA
TTTAGTTTATTTGCATACTCAGGTCTTATTGGAAGAAATGGTACTGGAAA
GACATCTCTTCTCAGAGCTATGGCGCAACATGCAATTGATGGAATTCCTA
AGAATTGCCAAATATTGCACGTTGAGCAAGAGGTCACGGGTGATGACACA
ACAGCTTTGCAGTGTGTGCTGAATGCCGATGTTGAACGGGTTCAACTTAT
GCAAGAAGAGGCCCGTTTGGGTCAACAGCTGGTTAAGTACTGCTGAATTA
GCTTTCTACATGCTTTTATTGGTTGATGTGTTCTTTTCTCTTGGCAACTT
TCCCCTTCATTTCGATTTTTTTATATTTTCTTATACTCAGCTACTTTTAT
GCAGAAAGATCTGGAGTATGAGACAGAGTCCAACCAGAGCCTAGACAAGA
GCAAGGATGGTCTTGAGAAAGATGCTATCGGCAAGAGGCTTGAGGAGATA
TATAAGCGACTTGAGTACATTGATGCAGATGCAGCAGAGGCTCGTGCGGC
ATCAATTCTGGCGGTATGTTTCTTTGTTGACATCCAGTTTGTGGTGATTT
TTTTTGTCTCATTTGCACTACTTAGTATTATTCGTATACTGTTTCTGTCA
TTTCTATTGCAGTAGCCAGTATAGTTAACTTAATTTAAACATGTATAGTT
CTCACATACTAACATTGAACTGTTCTGATTGGTTGGAATCTTTTTACAGG
GTCTTAGTTTCACTCCAGAAATGCAACTTAAAAATACAAAAGCATTTTCT
GGTGGATGGCGCATGAGGATAGCGCTAGCACGTGCTCTATTCATTGAGCC
AGATTTACTGCTGCTTGATGAACCAACAGTGAGTTTAGAATATGTCGTTG
CCTGTCTTCTCTTGCTGCCACATGCTAACAACCTATCACTTTGCAGAACC
ATCTTGATCTCCATGCCGTGTTATGGTTAGAAACATATCTCCTGAAGTGG
CCAAAGACATTCATTGTTGTGTCACATGCTAGAGAGTTCCTGAATACGGT
ATGACCACATAGTGTCGTTATGCAGGAGCTAATATTGTCATAATTTGTCA
ACTCATATGTAGTATATTTGCATGTGCACCGTTTTATCTTGGTTTTCTTG
TTAATAACTGAATAACTGAAGGAAATAACTTTTAGGTTGTCACCGACATT
CTTCATCTACATGGGAAAAAACTGCATGCTTACAAAGGTGACTATGACAC
ATTTGAGAGGACAAGGGAGGAGCACCTTAAGAATCAAATGAAAGCCTTTG
AAACAAATGAGAAGGCCAGAGGGCATATGCAGGTTGGTCTCTGCATTTAG
TGGGTATCATTAGTCCCTGAAGTCTGTTACAGTAATAACCATTTTTAATG
AAACTTGTGATTCTGTGGAAAAAAGGTGAGTTGAAAAAACAGATGACTTC
CATAGTGCAATATGGCTCTTTAATCTACTATACTAATCTGTTTAGCATAT
AAGCCCATCTGATGCTGAACATCTCATCTCTTTTCCTTAACATAAAAATG
CTATTTAAATAATTCAGTACTGTATAGCTTTATTAGCTTGAAATGGCCAT
ACCAGTAGAGCTTGTGCAAGTCTGGCCGTGTTCTGCTTGCATTGTTTAAG
CTTGAGCACGATATACCAAATTAAGATTTGAACTATCTGATTTTTGCTCA
AAGATGGAAGCAAAATTTCAGTACCTTGGAAACATCAACATATTCTGTAC
AGCTAGATATTTTTGGGAAGGTCGAGGATGATGTTTGTTGAACTGTTCTA
TGTAGGCATTCATTGACAAGTTCCGGTACAATGCAAAGAGAGCATCACTT
GTTCAATCGAGAATCAAGGTACATTTTATACTCCTGTTTCCATGACTTTC
ATCTAGAATTCTAGACATCCTTGGATTTCAACACATAACTTTAAATTTTA
TTTCATCATTTCACTAACAGATGATCTCCAAATTTTTTTTTTTGCATGTT
CATGTCAATTCTGATGTTTTTGCCCTAATTTTTGTATCTGCATTATCCCA
GGCATTGGAGCGAATGGAACATGTTGATGCAGTTGTTAGTGACCCTGAGT
ATGCGGCCTCCCTAAATCTTTTTATTTGGTCTTTTATCTACAGTTGACTT
AGTACTTGCCCAAATAATCCTTTGCAGCTATAAATTCGAATTTCCAACCC
CAGAGGACCGCCCTGGACCACCAATCATTAGCTTCAGGTTTCATTGCTGA
CCCTTGTATTTCACCATTTATGGAAGCTTGTTCTCCGCTTTGAATACCTT
TTGTTTGTAACCCACTCTACCATTTACTGTCAAGGCATGACAGTTAGTTG
TGTACATTCTCTTTGAGATATCTATGTCGAGTAGGCATGTGTTTGTGTTG
ATCTTGTCAGGTGAAATATAATACTTTTGATTTGTGCAGTGATGCATCAT
TTGGTTATCCTGGAGGTCCCATTTTGTTTAAAAACTTGAATTTTGGTATT
GACCTCGACAGCCGTATAGCAAGTATGATATCTTTGTTCCGCTCATCTTT
CGTTGACTAAACAATAATATCTAGCTTCTCCCGTGGTGGTTCTCCCATTT
CTCTCACATTTTATTTATTGTTTCAGTGGTTGGTTCAAATGGCATTGGCA
AGTCCACTATACTTAAGTTAATTTCTGGAGACCTGCAACCAACTTCTGGA
ACAGTGTTTCGCTCGCCCAAGGTGCTTTATTCTCTTACAGCTGTCATCTT
GATGTTTTACTGCTATAACCTTACCCATATCAAGTTAACTAGTTCTGCAT
GATTTTACTGCTTTCTCGTGCGTCTTTTGCTTCTCATCATTTGTCAAGGT
GTTGTGCTGTTTGTGCCAAACCATTGTGGAATCAAAAAGAACACTCTATA
CCATGTGCATGAGAACTTCACTTTTAGAATACAACCACTTACTGTTATTT
ATTGCTGTAAGGAGAAATCTGCAGCACCGTGTATATTGTTTGTTGATTTT
TTTATTGTTATTTCAACAGGTCAGGATGGCTGTATTCAGTCAACATCATG
TTGATGGACTTGATTTAACGGTGAATCCCCTTTTGTACATGATGAGATGT
TTTCCGGTAAGCTCAACCATCATTATATTTATTTGTGGGGATGAAATGCG
AGCATGAAGTTCGCTTGGTGGGTAGTTAAGACATACATATTCTCATTCTC
TGTTTAGTATTTTACTCAAATATAAATTTCAGCTCCAATATTGAAAAAGT
GAGCTGGGCTGGAATGCAACTCAAATACGAATTTTAGCTCTAATATGGAA
AAAAATGCATTGTGCTCTGTTTTGGTATTCAACTGAAATATACACTTCAG
CTCTACTAGAAAAAATTACTCCCTTCGTCCCGAATTAGTTTTCAGAGATT
TGTCTAGATTCGTATGTAAACATGTCTAGATGCATACGGATCTAGACAAA
TCTGTGACATCTAATTCGGGAGAGGGAGTATTATCCTATGTTTTATTAAC
TTAAATATAAATTTCAGCTCTTACATGTGAAAAATTTACTATGCTCTGCA
GGGTGTACCTGAACAGAAACTGAGGTCACATTTGGGTTCCTTTGGTGTCT
CAGGAAATCTCGCCCTCCAATCTATGTACACTTTATCAGGTAATATAACA
CAGCAGTTCATTAGATTGATTTAGCTGATAGTCAATTTGCAGGTACAACA
ATTCTAAGCTTTCCTCTTCAAGTTGTGTTGTGTTCACCCAAGGGTTCATC
GCTTGTATATTTTTAATTTTATTGATCCTAATCTAAGCATGCACAATTGC
AGGTGGTCAGAAAAGTAGGGTTGCGTTTGCCAAAATCACCTTCAAGAAGC
CACACATTATTCTCCTTGACGAGCCTTCTAACCATCTTGTAACCCCCGCT
CGCTCCCTCTCCCACTTCGATCATTTGTACAAGCAAGATGAGAAACCATG
GTAACTGGCAAATTCTAACATGGCGAACTTGTCTCTGTTGCAGGATCTTG
ACGCGGTGGAGGCGCTGATCCAGGGTTTGCTCATATTCCAGGGAGGAGTG
CTGATGGTAAGTACACATCCCCTCTGGGTTGCATGTCTTCTTTGTTGTGT
TAAGGTTGCATCGTTCTAACCCTAACATTGTACTCTTACAGGTGAGTCAC
GATGAGCATCTGATCACGGGAAGCGTTGATGAGCTCTGGGCGGTGACGGA
TGGCAAGGTCGCTCCGTTCGAAGGCACGTTCAAGGATTACAAGAAGATGC
TCACGGCATAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.