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GrainGenes Sequence Report: AA002800

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Sequence
AA002800
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA002800
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
AGAGAATAGGTGCTTGGCGTGGCCGCTTTAACATGCCGACCACGTGTGTG
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CCGGGCCCACCCACCAGTCAAACGCCGACCCCTCACCGCACCACCACCAA
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TGCTGCACAGCAAGGACAATATCTTGCAAAATGCTTTAACAAGATGGAGT
ATGCTGAAGAAAATCCTGAAGGTCCAATCCGCATTAGGGGAGAAGGTCGA
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CAGGTACAGGCATTTAGGCCAGTTTGCCCCACTAGGAGGTGAGCAAACCG
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CTCTGGTACTCAGTCTACGCAACGTAAGTGCCTGTTTCCTTTTTTTATGT
TGATAAAATCAGATTGTGCAGTCACTATTGTGCCCATTTGTGGCTCACCT
ACTGTTGTATCTAACCTAACACTTGCTTTCTCCTCTTCTTTTCTCTGAGT
TCAGCAAACAAATAAGCTGGCGCACGAGGGCGCTGGTGATATCTGACTGG
GGCCGTCGCTTCATCTTCGGTAGAGACTCGAGCGGCATATAGTCAAAGCA
TGATAAGATTTTGTTTGTGAAATTTTCAGAAGCTAAAGGCAGTAGTGGTA
CCTCCCACCTAAGTCTGGTTATTGCAGATGCATATATTCTTCTTTTTTTG
TCAGGGGAAAGAATAAAAGTAACCCTGCACTTCCCTAGTGCTCCACAGAG
AAAATTCCTATGTAGAAGTACCTTTTACTGCTGAGAGTTTTACTTGTGCG
GCATACGCAAACTCGCGG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.