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GrainGenes Sequence Report: AA019223

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Sequence
AA019223
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA019223
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GATACTCTAAGCTCCGCACCCCTTGCAGCGAGCTGGCCAGACGGGGGACC
TGCCGTCCGGTCGAAGCTACTCGGGCCGTCCTGTGTAGCATCTCGCCTTG
GGAGCGCCGCCTTCACTCTCCCGTTCGTGCCCACCCATTCCAGCATCTAG
GAGGACCACGCAAGACCGCAGTAGGCCGCAATCCAGCGAAAAAGCAGGCG
TCGCCGCACACCGGAGCAGGGGATGGCTAGCGGAGTTCGATCTCGCGGTG
GACGACGCCAAGCCGCACGCGGGGCAGGGGGGCCGGCGGCGAAGAGCACG
GAATTCGGCAGTGGGGGATGACGCACTTACGCACTTCGAATCCTCTGAAA
CCGTGCGCTCCACCATCTCGGCGGCGCGGCGCCACTAAGCTCTCCGTTTC
CCATCCTGTCGTGCCGTGCTCGAGGAAGCGACTTCTGGTGCCGCAACTGA
TTGTTTCCGCGATTAGTCCAGAGCACAAGGACCTAGAGAAGAGAGGGGCA
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CTCTGGTTTTCCGGTTCTCAATGTCTGACTACATGTTGTTTTAGCATGGT
GCATGCATATGATTATGGATAATTTTCATGTTTTATTTTTCAAATGCTTA
AGAAATTAACCCTCGGGCAATTTGCGATCAGTTATCCTGATGCATTGTGC
GGGTTTTTTAGACTAGTTCCTTTTTGTTAGAACAATTTTACAAAGCATTT
CTGTTGCTGAAACATAACTGAATTTTGAGTAACTGAATTTTACAAAGCAT
TTCTGTTGCTGAAACGCTTCACCATCTAGATCTCCCTCAGATTCTTGAAG
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AAAATGCAGCGAAGATTTCACAGCATATGCAGATGTTTGCTTCAGGGAGT
TTGGAGATAGGGTTGCGTCCTGGACAACTATGAATGAGCAAAACATCGGC
GTAGTGGCCTCTTATGATGTTGCTCTGTTCCCCCCTGCCCGTTGTTCGGA
TCCATTCGGATTAACAAAGTGCGCCACTGGGGACTCTGGTGCCGAACCTT
ACATAGAAGCGCATAATATCCTTATGGCGCATGCATCAGTTTTCAGTCTG
TACAAAGAAAAGTATCAAGTGAGTGAATGCTCTTGTACTCAAATTAGTGT
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TTGCTCCAGAATGCACCGTTTTCAGTCATATATTACATATAATAACCACA
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TGTTCTTTTTTTACTAAAAACATTATTACTTAGTTGTTTCCCTTTTACAT
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TGGAGTTATCCATTGACAAATTCCACTGTGGATTTAGAAGCAACGCAGAG
ATGTAAAGATTTCTTGTTTGGCTGGTATGATATTTTACCTCCATTTTGTT
ACAGAAAGCAACACCTGTATAATCTGCATTGTTGAGATCTTAAGTTGCCT
GTACTTGCAGGATACTAGATCCATTGGTGTTTGGGGACTACCCAGAAGTT
ATGAAGAAGAATGTTGGCTCTCGCCTTCCACCCTTTACAAAAACTCAATC
TGAACTTATCAAGGGTTCTTTAGATTTTATAGGAAAATCACTACTATTCT
CTCTACGTGAATGATTGCCCTCTAGGAACAGGTGATTGAGACTACAATGC
TGACATGTCAATTCAAACCAGAGGCAAGTATCTTTTTTTTGGATAGTTAT
ACTAGGAATCCTACTCGACCACTTGAATCATGTGTCATGCCGATTTGTAG
TTTGATTCCTTTTTCTTGTCACGGTGCACTGTGCACACAAGCATTGCAAC
TAAGATATTAAAAAAATAGAGTAGCTAAGACAAGCTGGCAAGCCGCCTTA
TCATGTTCATAGTCACATATGTTGGGCATTTCTCTGAGTGCGGTGTTCGG
TCATCCCAAAAGATGATTGATGTTTATTACTATTACCTTCAGAGCCTGCC
TTTTTGTAACCACTGCCACAGTACTGCATCTGGCAACTGTTTTATGACCA
TTTCAATCTCAAAGTATATTACCTGTTGGCCACTTTACTAGACAAATGCA
ATAGAAAAGAGTTGCAGTAGTGTTCTGTAAGTCATTCCTTTGTATGATGC
AGGTTCTAGGACAGACCCGCCATGTGGCCAGGTAAAAAATTATGTCCCCA
ATGTGCTCTGCAAAGAAGTTGCCAACTCCAGTTCTTTTCGCCACGCACTG
TACATCCATTCGATTACGTGTTCTGAACAGAATCAAGAGATTAGACAGAA
AATAATGCACTTGAAAACTGATATCTCAGTTGAAAATAACTGTTGAAAAT
AATCAATTTTGTCTGCAGGGTGCCCCCACAAATGTTCCAAGTGATCCCAA
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CCATCTATGTTCAAGAGAATGGCAAGCACAATTCCCAACAAGAAGCAACC
TGTGTTAACGAACAAATTACCTTGAGTAATCATGTGGCCTTTTTTACATC
TCTTCAGGTATGGGATCTGCTGACGGCAGTCTCGACGACAGGGACAGGGT
CGTTTACTTGAGAAGCTACATGGAGAGCACACTTAGCGCACTGAGGTGTG
TCAAGATCAAAGACATATGGAGTCTAGTAATTTTCATTTATTTCAAATGC
AACGGAATTCAAAACTGAAAATGCACCAGCACACGCCTGAATACTTCTTA
CTCGGATACTTGACACCCAAACAAGTGTACAGAGATTCCGTCCTGATGCC
CTCGCTTCTGATCTTGTGCAGGAATGGAGCTAAGGTGAGAGGCTACTTTG
CATGGGCATTCATGGACTTGTTCGAGCTGCTTTCAGGGTACCAGTCGAGG
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CAGGCTCTCCGCTCTCTGGTACTCCGCTTTCCTGAAGGAGAAGGTTCTAG
TCTCCGCGGTTCTGCCAACAACGCAGGGTCAGAACCAGGCGCTGAACGTC
GTGTCCTGACTCCCGTACCCGCCCCTGAGTCTGGTCTGGGATATGCTTGG
TGCCGGGCGCTGGGACCTGAGGATTTTGATCAGAATGTGCAATATTTTGT
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TGCTTCGCTGCCGTGAATGTCATCATGATGATCACGTGACGAAACCCAAT
TGCGGTGGGAGTGACGGACTCACGGCTGCTGCTACCGTGTAAGGCTCAAC
CTGATGCAGTATATTCAGATTAGTTCTTCAGTCATACTGATTTGTGCGCA
AGTGACCAGCGACGTCGATCTTTGATCTCACAGCTCAAGATGAAATCACT
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CTTTTACTTCCTTCGGAATTAAGTGTCGCAAATTTGAACGGAGGGAGTAT
TGTCAATTGTAAGGCTGTGAAGCCAGTGATACAAGGCACCGTGGCCTATC
TTCTCCTTCCCTGGGTTAAACCTTGGCCGGCCTTGGACGGTCCAACTCGA
TCTGTAATAAGATTAAACCCTTGTAATCAGTCAATCCAAACTTTGCTACT
ACTGTACTTCTCTTGCTAGATCGTTCTGGAAGTGACTGCTGGAGCCGCAG
CTGATTATTTACGTGATTACTCCAGAGCACAAGGACCTAGAGATGAAAGG
GCAGATGCTGTCCTGCTCATAGTGTTTGGTATGCGTCCCAACTATGCAGC
CTCATCCTTTCTACGTTTCATTCCTGTAATTTAGACGGCATTGATTTTCT
AATCGAGTATGTCTTTTCTTAATCGATGCTGGTACTAATTTGTGTTTATC
CATGACCCTTAAAATATTTCCACTGATGCGTGTAGGCGCACCACTGCCAA
TATGGTAGTTGCACATGTCGTTATGTGGTCTGACTTTAGATATATGCTAG
TACAATACTTAATTTGTTTTTTTCTCACGAGGTTGAGGTTGCTGTTGAGA
TTAATTGCTGATATAAGCCTTCCCCAAAGCGCATGAACCATCGGTCAAGC
ACAGAAAAGAACCAGCAGAGATGGGTGCTGCTGCCTTCTGCCTTTTGCTG
TCCCTGTGTGTTCACAGCGCAACTGCGGCAATTGGCTTCACAGGAAGTGA
TTTTCCACAGGACTTCGTCTTCGGAGCTGGAACCTCAGCATATCAGGTTA
GTAGTTTGAGCTGAAACTTCCTGTGTGTTTTAGTTGCTGTGGTAACGCAT
AAATTTTATGTGTTATCCCACTTACTGAATATGGATGCTTCTTTTTCCTG
CAGTATGAGGGTGCTGTTACTGAGGATGGAAGGAGCCCAAGCATTTGGGA
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GGTTTTCCTGAGCTTGAAGGCTTCATAACATTTTGTTTTAGCATGGGATC
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TTGCGACCACTTTTCGTGATTCATCGAGTAGATATGTGAGAGTAGTTCCT
GCTTGGTAGAACACTTTCACACAACATTTCTGTTGCTTAAGCATAACTGA
ATTGTATGTGACGAATTGGCAAGAGCCCAAGACCATAACTTCATATAGTT
GACCACGAATTCGTTCGTCGTGGTTAGGTTCAGTTCCGGGATTTAAAATA
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ATCTGATTTTGCAGGAGGATGTGAAGCTCATATCCGAGACAGGCCTAGAG
GCCTATAGGTTCTCCATCTCCTGGTCAAGGCTTATTCCAAGTCAGAATTC
TTCATAACCTTCATCGCAAAAATCCACTTTGGTTTTCATTTATCTCATTA
TTCCTGCAAACTTTCGGGTTGCAGATGGAACGGGTGCTGTCAGTCCAAAA
GGGCTAGAGTACTACAATAACTTCATTAATGAGCTAGTGAAATATGGTAA
GAGTATTTATGCAGATCATTGAGTGTTGACATATTTAACTGCAGCCATTT
TTTGAGGTTCATAGTAGACAATCATTTAGTTTCAAATGTCTACAAAAAAG
AGTTGAAGGCATTGACCATCTGAACCCTCCTATCTCTGTGATATTTATCC
AGGAATTCAAGTACACATAACACTTCATCATCTAGATCTCCCTCAAATTC
TTGAAGACAAGTACGGTGGATGGTTAAGCCCTAGAATTGTGTAAGTATAT
ACTCCCTCCGTACCAAATTAACTGACTCAACTTTGTCTAGATGCGGATGT
ATCTACACACTAAAATGCGTCTAGATACAAACGTATCAGACAAAACTGAG
TCGGTTAATTTGAGACGGAGGGAGTACATGGTTTCACTATCAAATAAATA
ACTCCATTGCAGCGGCAGTTAATAGTACCAGTGACATATTAATGATATTT
TTTTTCATTGACATATTAATGATATTTTTTCATATTTTTACATCTACGAA
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GTTGGCTCTTATGATAATGGTGTATTCCCTCCTGCCCGTTGCTCAGATCA
ATTTGGAGTAACAAATTGCACCGCTGGGGACTCTAGTGTTGAACCATACA
TAGCAGCTCATAATACTCTTATGGCGCATGCATCTGTTTTCTGTCTATAC
AGAGAAAAGTATCAAGTGAGTGAATGATTATGTACTCACAATAGTTTTGG
TGGTGCTTTGGTTTCTTCATAAACTGCGCTAAGCCATCTTTGCTTTGCTC
AAGAGTGGAGGCACTGTTTTCAGTCATTACATTAACCACATCGTAATTCG
TCTTTGTAATGCATGTTTCAGCATTGAGCCACGCATTGACAGTAGTATTG
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CCTGTTTTTTTCCCATTACTGTGCAAAAGAGGTATAGGCTCATTAAAAAC
TAAAACGGAACCATTTTGATGCAGCCCATACAAAAAGGAATTGTTGGCAT
AAATGTCTACTCCTACTGGAGTTATCCGCTGACAAATTCCGCTGCGGATT
TTGAAGCAACGCAGAGATGTAAAGATTTCTTGTTTGGCTGGTATGATATT
TTACCTCCATTTTGTCATAGAAAGCATTTCACCTGTATAATCTGTGCATT
TTGAGATCTTAAGTTCCTGTACTTGCAGGATACTAGAGCCATTGGTGTTT
GGGGACTACCCAGAAGTTATGAAGAAGAATGTTGGCTCTCGCCTTCCACC
CTTCACAAAAGATCAGTCTGAACTTATCAAGGGTTCTTTAGATTTTATAG
GAATAAATCACTACTATTCTCTCTACGTGAATGATCTCCCTCTGGGAACA
GGTGCTCGGGACTATGGTGCCGACATGTCAATTCAATACAGAGGTAAGTA
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GCAAAACAACGCAACTAAGATATGCAAAAAAATAGACTAGCTAAGCTGCT
GGAAGCGATGTCCTACTAATGCCGGCACAAGCTGGCAAGTAGCCTTTCCA
TGTTCATAGTCACATATGTTAAGCATTTCTCTGGGTGTGGTGTCTGATTT
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GTTGCAGTAGTGTTCTGTAAGAAGTTCCTTTGTATGATGCAGGTTCTAGG
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TGGTCCGCAGGGTCCGCCAACAAATATTCCAAGCGACCCAAAAGGGCTGC
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GTCCAAGAGAATGGCAAGCACAATTTCTAACCAGAAACAAGTCAGCTAGC
AAAAATAGTTGCTTCATGAACCACCATGTGGCTTATTGTACATCTTGTCA
GGTTCCGGATCTGCCGACGACGGCCTTGACGACACCGACAGGATCGATTA
CCTGAGCAGCTACATGCAAAGCACGCTAAACGCGATCAGGTGCGTCAAGT
CTAAACACATGCAGTTTCAGCATTATCTTACTACTCGTAGAAGAAGTTCC
ATTTCGATACCCTCTCTTGTTGTGCAGGAATGGAGCCAAGGTGAAAGGCT
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GCAGGCCAGGCTATCCGCCCGCTGGTACTCCGCCTTCCTGAAGAACAAGG
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TATATTTAGACAAATATACGACAACCTTTTCGATACGAAGACAGTACATG
AGTTAGAGTATGTAATGCAAGCTAGCTAGTGGACAGGGCTGGTGTTAAGC
TAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.