Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA018147

[Submit comment/correction]

Sequence	AA018147
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA018147
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	GTAACGGCCAGGCCCCATCGCCGCATCCACTCCAAACCCCTACCACTAGA CCAAACTGAAGGGAAGTGCCGCCGCTCCTCTCCTCCAAGCACGAAGCTGT GGAGGTGGAGCCAGTACCGCCATGCTACCGCTTTCCTATGCGCCGCCGCA CCCGCGGCCGAACCCCTGCCCTAGCCACAAGCCCAAGTCGCAGTTGTTGC CCTGCGCGCTCCCCTTCCCCGACGCCCTCCGTGCGGCAGCGGCGGCGGCC GCCATCTCCCTCTCCCTGCTCGCCGGAAACGCCGCGGGCGCAGCGTCGAC GGCGGCGGCGGTAGAGCAGCCCCCTGAGATATGCCGTGGCGACGACGGAG GAGGGGATGCAGAGGTGAAGGCCGAGGCGGTGACCAACGAGCAGCTCGTG GAGGAGGCGTGGGAGGTGGTCAACGAGGGCTTCCTCCCCGATGCTGGCAA CCGCCCGTGGTCACCGGAGCTGTGGATGGTAAGCTTGTCTTGTAGCAATG CGATGAATAATAGATGTATTCAGTGGTTCAGCTGAACTATCATAAAGTCC CAATGCTCCTCCCGGTGGGAATAAGCTTAGTTCGTATGCTATTCTTCTTC TTAGATTTCGTTTCCCTTCTGTTTTGGTTTCCTGATGAGTGATAGTTAAC CTTTTAATTTTAATCTGATGCAGCAACGCAAACAAGATATTCTTCAAGGC TCAATCAAATCCCGCTCTAGAGCCCATGACATCATTACGAAAATGCTAGC TAGCCTGGGTGATCCATACACAAGATTCCTATCGCTCTCAGACGTAAGTT ATTTACAAGTGGGCACTATATATGCTATGCTGTTGACTTGGATGGGCGAA ATACAAACCAGTTACATGACTAGAAACCGTCGTCTTAAAGCTAAGGCTCG AATAATTGGGAGAGATGCTTAGTTTGAAATTCAGGATAAGCTCGCAATCG TGGCTCCCCAATCCACCGAGGTCATTCTTTTTTCCCTTCATGACCCATGG TAGACATTTTTTGTATATTGGAAACATTGCGGCTAGCACTTCAGTTCCAT GTTGTTATCAATTGCAAGTGGTAAAATTGATGTAAACCATATTTGTTGTT TTGAGATTATCTAGAAGAAAGTATTAATTTAAAGAAGCGTGCAATTTCAT CATATTCATTTATAGTCATATGAAGTCATAGTGTCATGTATGCTGATCTT CAGAGAGTTTTCTAGAGCACATTGCTATTCAGACAAAGTTCTACAATACC GTGTGAATCAGACCTTTACTGTCAGTTGTTTTTTACAGTTAGTACTTGGT ACATACTACATACATTGATACACCCTCTGGGCCAGCAAACTCTGTTTAGA CGCTGCAGCCAATGCCATCTTATGTTCCTCTTTTCCTTTACTTTCACAGT GATGACGATACAAAACAATGTTTTGTTGCCTTTCTTTGCTTTAGTGATTT TACTTATTGCTGACCTGCGGTGCCTTTCTTTCTTTATTCTACATGTTCAA TCAATCTGATAAAGTTCTCGAAGATGTCGAAATATGACATGACGGGGATA GGGTTGAACTTAAGAGAGATTCCTGATGACAATGGTTCTTTAAGGTTGAT GGTATTAGGACTGATACTAGATGGGCCTGCCCACGCTGCTGGTGTTAGAC AGGTATCGACTGATATGCAGTTATGCCTTTGAATCGATAGTTTGTTTTTG CACCTTTTCTTTTCGATAGGAAGCTTGCTCTTACAACAATGTTTACAGCC TATCATGTTCCATTTTCTGTTATTCACTTCCTGTACAAAGTTTTTTCTTA GCAGATAGTCAAACCCCATCATGTATGAGCAGTTGCTTATGGCAGTATTT GACTGCATATACCCAATTTAAGCTGCTGAAATGATGAAATAATGTTGACA CATGTCTGTGCTAAGAAGGTCAGTAATGCAATTTTTTGTCCTAAAAAAGG ACTAATAACTTTAATGAAGTTGGAAAGGGTTAACTGGAACTTGTGCTAAG AGCTTCACTTTGAAACAAGGTATTTTCAGCTTTAGTTGTTTTTTGTTTCA CTGCTAAAACATACATGCCTTAAGATGTTTTCACAAATGGCAAGTTGTAT ATTGACTTTCCTCATTGTCAATATTTATTTGGAAATACACCTTTTGTGTC TTCATTGGAGAATAATGTTATTTTTATTTTTGGTTGTTGGGAGCCTAAGA CTATTCCACACCTAGTTATATATGGAATTTTGGCACTCCTTGTCCTGTTT GATAATATGCACTCATTACCTAATCCTTTTGGGTAATTTTATCTTCTATA GGGTGATGAGCTTTTGTCGGTCAATGGCATTGATGTAAGAAATAAATCTG CATTTGACGTGTCGTCCATGCTGCAAGGCCCAAAGGATACTTTTGTTACA ATTAAGGTTCTGAATAATCTTATGAATATTGTATTTAGAGTCATCTTACA TCCCTTTGTGTTCCTTATTTTCTAACTATATTATGTTTTTTAATATTACA TGTAGGTTAAGCACAACAACTGTGGTCCCGTTGAGTCAATGAAGGTGCAA AGACAAATGGCTGCTCGCACTCCAATTTTCTACCGTTTGGAGAAAAGAGA CAGTGATAATTCATCCGTCGGATATATTCACATTAAAGAGTTCAATGCAG TGGCCAAAAAAGATTTGGTCAGTGGTGTGTTGCTGGTTTGTTAACCTTAT CCTCTGTCATTTCTATATCTATCTGCCATTATTTTTGCAGCTAATTATAG ATATGCTAATTTTTTGCAAATAGCAATCTAGTGTAATTCTTATTGGCTGA TATGCATACATCTAATCATGTAAACTCTTGCTTATTTAAATTTCAAATTG AGAAGATCGTCACAATTTATAATACTGTTCCCCCTTTTGCAAACTGAATG TGCACTAATGATGGTTTCTGCTTATTGTGTGTCTTTGGCTCACATGTGCA TTAGTTGTAAGTATAACTGTTGTTGTTGATTCACAGCAAGATGTCCTTTT AACATTACTTGTCTTTTGCAGCGCTGAAACGTCTAAAAAATTCAGGCGCC TCCTATTTTGTTTTGGATCTGAGGGACAACCTTGGTGGACTTGTGCAAGT ATGCCTGTTTTCTTTTCATATTCTTCCTTGGCTCCTAAATAGATGCCCTT CTAGGTTTATGGCATTTTTTTGGTGTTAGCATAATACGTCATTAGATCAT TGTAGAAAGTAGACAGCAAACGATGTTTTGTAACGCGGTTCAGCGATCAA CACCTACATCCACGGGGCATGCTTAATGGGATCTCCTCCCCATATACTAT CATAGTACCGTTGACGACAAGCCCGCCGAGGTCAACAGACACATCAGTCT CAAACGATAAGCCGGTCCGGCAGCCCCCCGCCGCCGGACCGTCCTCAAAC TAATCTTGTGTCTAACCTACAACTTGCGTCTAGTCTCTTTTGGCTACTCC TGGTGCCTTTATATATTAGGCCAAGTTACAGGTGTTTGACCCCAACACCT GACCTACCGCGTAATCCAAGTCCAACTGTAGCCTATACACATATTCGACA CAACTTCAACACTTGGCATGCATACAGAAGACTATATTACCACCCTTCAT TGGATCACTTATTGCTCTTGCATGTTGTATAAGAACCAAATATCAATTCT AGAATGACCTGTCTTTAATCTGCTAGAACTAAATGGTGTTTGGTGGGGTG GGGTATCCTATTCTTAATGAGGTTTTTGAAGATGACGTGAATTTCTCGGA ATGGTTTGATGCTCATCACATGGATTCGGAAAGAAACTGTCAAGATATTA TCTTTTTGGATGGGTCATGGTTACACAATCTGATATTTATATTTATCTTG AAGGCTGGAATAGAGATCGCAAAGCTCTTCTTGAACAAAGGAGACACGGT ATGGATCCTTCTTTCTTTTCATCTCGTGGTAGCTATTCTGTAATCCTTAT GCAGATGGTGCATATATTTTACTATGGGTTCAAAGTTCCTTCGGGGATTT TCTAGAATGTAGGAAAAGTAGAGGAAATGTTGGAGGATTTGGATAGGAGT AAAGTTTCTTATGTATGTGTTTGGAATGAAGGAATACCAGCTTAGGATTA CTATGAAATTCCAATGGAATGACCCATTATAGAGCAATGGACAAAAAATA CCCGCTTGGAACGCAGGAAATAAAAATGCAGGATTAGGAGAAAGACGAGA ATTGGATGTCGAGTCTAGATGATTTGTAGAGAAAATGAAGATACAGGAGA TGTTCAATATAGCTGTTGCTCTACATGAAGTTTCAGTAATCTCTTTATTA TATGGAGAAGATGTGAGAGAAAGATTAATCTCGTTCTGTAGTGAGGTTTG AGATCATATTAACAATCCTCCAATATGTAGAGGAGAGGAAGGTTTTCCAT AGGAGTTCCTTGGGCCATTCTGTCATTCCAAAGGCTGTCAGACGGAAAAA ATTCTATGGCATTTGTACAAAATTCTCTAAATTTCCTTTGCTCCAAATAA GTCAGATATATGAAGTCTTGCCTCGTAGAAACTCTCTCTCGTGGAAATTC TTGTATATTTCATGTGAAGCTTCAAAACAGTCATTTGAAACCATCTGTTT ATTTTTTTCCGGTAGGACTACACTATTCCCGTGGCTTCCGGGTTCTGATG TTTTCCCATTTGTGTGTTCCAAAATTCTTAAATCTTACTATGAAAAACTT CTGGTTTCCATTTCAGTAAAGCTTACTTTCCATAAGGCATGAACAGTAAC TGAAGAATTAACTACAAAGCCTGTGCCCTGATGCTTTTAATCTTGGTCGG GACATGGTTATGGACACAACAAATCATGTTAGTTTTGCTTTGATATTGAC CATGGTTTTAAAATCTTAAGCTAAGTCAACTGTTCCAAATATTTTAATAA CGAGAAGAGGTTATCAGCTGTCAGCACCACCACCGGGATTCATATTTTCA ATCAAGAAGAACTTCTATCTTCACTTAGCAAAAACCATGCGGTTTTCCAT TCTAATTGGTTTTAATTTTGATATTTGATGTTTGATAAAAGGGAAAACAC ATCTATTCGACCTAAAAAGGGAATCGAATAATGTCATTTGGCCCATGAGT CAGCTGTCTCCAACTCTCCATAGCAACCAGTAGCCACCTGTAAATCCAGT AACTAGATGTTACCACTGGCTTTGGGCCGTATGTTTTTCCCCTGGCCACC AGCTTAACTCCTCTATTACAGGGTCACTATAAAAGTTCCCCTCATTCTTG AATAGTTACTGCTATTTATTAAATCAATATCATTGTTCTTAGCAGTTAGT TAAATAGCCAATGTATATGAGCTTCTAGTTACTATTTTTCATATGCTTCG AATTAGATCTTTTATAGAACTCCAATCATTTTTCTGTGCATATTAGCAAG TTTGAGGGTGTCAGGTGTTTAATTGCTTGAATCATTTATGTTTTTAGCTT CATGTTGTTGACTTAACTTTGATGGTCAAGGATCTATGGCCTGATGGGAA AATTTTCAGGTCATTTATACTACTGGCCGAGATCGTCAAGTCCAAAATAC AATTGTTGCTGACAGTGGACCTTTGATTACAAGTCCTGTGATGGTAAGTT GTACTTATGGTGATATACCTATTTTGAAATGCTTCAAGAGTTAGTAATAC AAATAAATTTCAAGCAGAGATCACTTTTCCACTGTTTTGTTGAACCGTGG TATTGTGAATACCTGAATTTACCCATATACTCAGTCCTTACCACATTAAA GCTATTCAGCAACTTAAGCTCACCAATGGAATTTTGACTCTTTTCTATAC TCCCTCCGGTCCATGTTAATGTTCTTAACTTTGTCTAGATTCGTATGTAT CTAGTTAAGCATCTAGACTATTACACAGCCAGCTCCTGCTACCTGGCCAC CTTCCGTGGATCAACCACTTGTTACTCCTGGAAGTTGATCTGGAAAACGT GGGCACCCGCACGGGTCAAATTCTTCCATTGGTTAGCCGAGCAAGATCGC TGCTGGACCGCCGAGCGCCTCGCACGGCATGGGCTTCAACACCACCCCCG CTGCCTCCTATGCGACCAGGAGCCAGAGACTATTCGGCATCTGCTGCTGA CCTGCCCCTTTGCTAGGCAAGTCTGGCATGATACCCTGGCCTGGCTAAGG ATGACAGCCGCCGCACCGAGCAGCGAACCATCCCTCATGGACTGGTGGCA AAAAGCGAAGCACGATACCCCCAAGTCGCTCCAGGGTGCGCTCGCCTCCA CGGCCCTCCTGATCCCCTGGATGAGCTGGAAACACCGGAACGATTGCGTT TTCAACGGCGCCCAGCCTTCTACATCCTCCCTTGCTGCAAAGATTAAGGA AGAGATTAGTTTGTGGGCCAGGGCTGGGGCCAAAGGCCTAAGGGTTGTGT TGCCGTCCACCTGGGATGTTCATTAGTTTTCGTTTTCCCACACCCTGTAT GTTGCCTCCCCGTGAGGTTGTACCTTTTAACTCTACCTATGCAATGAAAT GAAACGCAAAGGTCCTTTGCGTTTTCTCAAAAAAGCATTTAGACTAGATG CATTCGTATCTAGACAAAGTTGATAACAATAATATGGACCGGAGGTAGTA CTAAACTTGAGGATGTAAGAACCAGATCGATATAGTTGTGGATTATTTCT TGATATAGTTGTGCCCATACTCCATAGTTCTTATTTCATGCTTTTTAACC AGATCGATACTATAATGGCATAATGCAGATTTAGCTGTCTGTTGTAGCAA GTCCCTTAGTTAACCGTGTACTTGTTATTTACTGAAATATAGAAGACTGT GCCCATATATTTATTATGCTAGTCAGATCTTCAGAGACCAGAATCTCATT TGTATCTCACGTGTCCATCCACACTTTCTGACACAGGTACTTGTGAATAA TAGGACAGCAAGTGCCAGTGAAATAGTAAGTAAATATTTTCTCACTGGTA GTATTAAAATTAATAGCGGTAAGAGCTCACCAAGATACTAATGTTTTTAT AGGTTGCTTCAGCACTTCATGACAATTGCAAAGCTGTTCTTGTGGGTGAA AGGACTTTTGGCAAGGTTTGACTTTTGAACCGCCTAAGTAACGGATCCTA TGTCAATGCCTGCTGTGATCATTAGGGCAACTCAAGTGTCTGATATTGCA GGGCTTAATCCAATCTGTGTTTGAACTTCATGATGGTTCTGGTATTGTTG TCACAGTTGGCAAATATGTGACGCCAGATCACAAAGACATCAATGGAGAT GGAATAGAACCAGACTACCGCCGTCTTCCTGGTGCTATTCACATTCACCA GATTTCCTTTTTGTTACTCTCGTCATGCAATGTGGTTGACCGCTTGGCTG AATCAACTTTACCTTTGTGACAGATCTCAATGAAGCCAGGGATTACCTTT TGCGTTGCCAAAGCAAGAAATTAAGTTGAGTCAAGTGCTTCATTCTGAAG CTTCTCGTGCAGTAAGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.