Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA043416

[Submit comment/correction]

Sequence	AA043416
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA043416
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	GTTAACGTATATCGCCGCGAACGGAGTCTTTACGCAAAGGTAACCAAGGA ACGACGACGAGTCCACCACTGCACTCGCCGCTCTGGCTGGCACTCGCTAA TCACTTTCCGGTTTAAATCCCGCGAAGCCTCGTCGATCAGATCCAGCCAA GGAAGTCAGCCAATTCGTCCGAGGAATCCCCACCCGCCGACGCGGCGAAG CTTCCTTCCCCGTTCCCCCACCGCCCAGCCCGCGCGGCGATCTCGATTCG GCCGGCGCGGCCGCGGATCAGAGGCGCGGGGGAATGGGGCAGCAGGGGGA GGGGGATGGCGCCGTCAGCGGCGTCGAGGAGCGGGCCGGCCTCGCGGCGG CGCCGTACGACCGCTGGGTCCTGCTCCGCCCCGCCGAGGGCTCCTCCCGC CCGCCCGCGCGCTACAAGGTGCGTACGCCGTTCCGCTCCGCGCTCGCATT GGATGTCGCGGTCCTCGCTCGCGTCCGAACTCTGGTCTCTCCTGTTCCGA TCCGCCCGCCAGTGACGAGATGTACTAGCTGTTAGTGCGTAGAGATGTTG CGTTGTGCTCTTAAACTTAGCGCCCTGGAACATGTTCAGCAAAAAAATGT TCTGACAGAAGATACGCCAAGGAACATGATCATACGAATGATATGCTGTT CCGTCGTGCCGTGCGATTGCCTCTTACACCATGTCCTGTGTATTCGATGC TGACTGTTGGAAGTGCTAATACATGGCAGCATGCCGCGGAAGTGGTTCAA GACAAGCTGTACGTGGTCGGGGGAAGCCGAAATGGCCGTTCTCTGTCAGC CGTTCAGGTTTGGCACCCGTGCACGATGACTGATCATGCCATTGCGCCTT CTTTATCCATGTGCTAACATTGGTAATTTCGGCAGGTTTTTGATTTTAAG ACATCCAAGTGGTCAGTGCTAAATCCTAGCCGAGATCCGAACCAGCTGAA TCCTGAAAATAATGCCGGAAACCAGCCATTTCCACCGATAGTTGGCCACA GTTTGGTAATGCTATCATCTTAAGCTCTTGTTAAACCTTTTCGAGCGGAA GGGTGTTGTTTTCTATGCTGACTAGTGTTCTCACTCAGGTCAAGTGGAAG AATAATCTTCTGGTTGTAGCTGGAAACTCCAGAGCAGCAGCGTCGAATAA GGTTTCAGGTGCTTCTTTGGAATTCCCTTTTTTCTTCAGTTCCATACTAA AACATGTAGCAGCAAAATGTTGGCTCACGGTTTGCTTAAACATACGTTGT AGGTTTTCATTATGTTCTGCCTAAAAACATGACCACCTGTTTGTAAATAC CTTTCCGCGCTCTTAATTAAATAAGTTCTACTGCCGGTTGCTAAAAAACA TGAAAATAATAATAGCTGAACTATCGGTTTATGGTTTTGCACCGCCACCA AAGACAGTGACATGTCTGTTTATGCCCCTAAATATTATAACTTCCATTAT CATAGAGTCGTCGTAGATGAACTGATATGTGCACATACCTCAGTATTAAG ATGGACTTCTACGTCGGTCCATATGTTTCTGGCAAAATTTCAGATTGAAA AATGAGTAGTACAGGGATGGGTCTCAATTACTGTCTGTGCATTTAGTGAC TATTGAGATTGACCTTGGTATCAACATGCCCCATTTCAACTTCACAAGTT ACATCTTCCATGTTCACAAAATGTTACCTATTTCAAGCACATGCATAATT AACATAATGATACGTGCTTTAACATATTTTCCTCATTTTTTGGTGTGGTC TCCCAAACTTTACAAGTACGACTGAAACTGATTGTAAATAATTTTGCTGA ATTCTGTGTGCAGTCTGGCTTATCGATGTGGAAACAAATAGCTGGTCTGC TGTTAATACATATGGAAAAGTTCCAGTAAGATATTTTTTGTCCTCTGTTT ATACATTAATTTATTGGAGAGCATGCTGAATCCTCCCTCCATCAGATAGC TCGAAGTGGGCAATCTGTATCTCTAGTCGGTTCTAGGTTAATAATGTTTG GTGGAGAGGATAACAAGAGGAGGCTTCTGAGCGATCTACATGTACTTGAC TTGGAAACAATGATCTGGGAAGAGGTTACAACAGAGTAAGAGTTTACTTA TTAGTTATGCTAAACATTGCTATATGCATTTCTACTGGATGTCGAATTTA TTGTGCTCCTTGCTATTGTGAAACAGGAAAGGTGGCCCAGCTCCTAGGTA TGACCATTCGGCTGCTGTTTATGCTGACCATTATCTTCTAATCTTTGGCG GTTCTTCTCACTCCACATGCTTCAGTGATCTGTACTTACTTGACTTGCAA AGTGTAAGAACTGAGTACTCTTATGTATTATGCTGTACAAGTACACTTGT GCATTCAGTCACAGTGCCACATTCAATAAATACTCTAAGCCAAAGTGCTC GCATGTCTTGTGCTGTACTAATACACTTGTGCACTAAGTCGTTCTATGAA AGCTTATTAAAGATTTTCAAGTCTCCACATGCATTCATAGTTCTAGGTTG TAATAGGACTTGGAACTTCAGAATTATATCAAGTTAATAGCAACTGCAGC TTGCAGGGGTGAACTGTTCCTATCAAATGACTAGGTTCTTAACTCCATTC CACTATCTCTAACAGTAACTAGTAGTCTAGTACACATCATAAGTGCATGA AGATATGCTTATCAAATTATGTTGTGCTCTACACAAAAGGGATACCTTGG CGGGCTTTTCCTCTTGAGCCAAGTTTAAAGCATGACTTTAGGACTCATCT GAAAAGCTTATCGAGTTAGTGTTTAACTTCAACAGCTGGAGTGGTCTCAA CCTGACACTCAAGGGGCACACATAACTCCTAGGAGTGGCCATGCTGGTAC AATGATTGATGAAAATTGGTACATAGTTGGTGGTGGAGATAATGCAAGTG GTAATGCCTGAACATACTATGATGTATTTACCGGTTTCTTAAATTCTATT TGCATGCTTATTAGTTATTTCAGCTTCAGTAACTAAGGAAATACACATGT TGTAGGTTCCCCTGATACAATTGTAATGAATGCTTACAAGTTTGTCTGGT CCGTGGTCACCAGTGTATCAGTCCGAGATCCACTTGCTTGTGAGGTAAGA ACTAAGCAGTATTTGTACAATTGTGCTGGTTTGTTCAATCTTAAAGGATT CTCATATGAATTCATGTTCCAGAATCTTAATCATATCACATTCAATATTT GCATGTTTTTGAGAAAAAAATCATGTTCCAGAAGTAGATAACTAGGAATA TGAAATGTGTTTGTATTACTTCTCCTTTTTTGCTGCCGGACCAGTTTACT TCATTTGTTTACATTGATTTCTAATAAATGTTAGGGTACTTAAATTCTAG GTGAAAAGATGTTCCATCTGAACTTAGAGAGAAGCAAATATAAATGCAAC TTGTGTTACTTTCTGCTGCAATAATTTTAACAGTGACTTAAAATTCCACC ATCCAATGCCTTTTAGAGGGCGACACAGAAAGTTGTTATCAGTACACTCA ATCAGTTTCCTGCCAAACAAGATGCATAGAGCTCGAGCTTTTTATAATAC GGTGAATCCCTGACTTTCTGTCCAACATCATGTTACTCTTTTCCAGGGTC TCACGCTTTGCTCGACAACAGTTGATGGTGAAAAGGTTCTAATTGCCTTT GGCGGCTACAATGGGAAATACAACAATGAGGTATTCACTTTGAACAATAG TATCATGTTCACAATGATCTTTTGTAGAATTGTTTCTTTAGATGTCAGGT GTCATGCTTATCTGAGCTTGTCCTTTATGTGTGGCGCCTCTAGTGCTTGA CTTATATAATTGTAACCGTTACTACTTACATTGATGGGGTGAAGTTGCAT TCCCTCTAGTTTCCCTTTTTAGTGCTCTGTTTCCATTAGCAATATTATTC AATGTCTGAGGAAAATGATGACACTATGCAGGTCTTTGTGATGAAACCCA AGCCAAGAAATTTTATGCAACCTCGGCTTCTCCAATCTCCAGCCGCCGCC GCTGCTGCTGCTTCTGTGACAGCTGCCTATGCTGTAATAACTGCAACTGA TGACAAAACTAAAGATATTGTTGCTACTGATGATCTAGATGTGAAGAGAG TTGAACCTGGAAGTTCTTCCAAACAAATTGTTGCTGAAATTGATGCACTT AATGGGGAGAAAGGAGAACTAGAGTCTCGACTGGCAGAAGTTCGTGCTGA AAACTCAAAGCTAAAGGATAAACTAGATATGGTAAAGTTGTCCTATGGTG AACTAACAGAGGTAAAACTTGTCTTCCCATTTGTTTCTTCGAGAGTGCAA ACTTTCTCTCCATACCCAAATGAAATTATTGATTCGCTACAATAAATTCC CACTGTTTTCTCTTTTTATTGTGAAGGAACTTAGATCAGTTGAAAATCAG CTAGCTTCTGAAGGTTCAAGATGCCAAAAACTGGAGGTTATGAACGTGCA CACTGCAATTACTTATGAGCATGCATATTTTGAACTCTCCTTTTATGTTT TTGACAGTTTACCTCTTTCTTCTGTCTGATGAATTCAGTCCCAAATTGCT GCCGCACATAAAAGGTTGGAATCTGCTGATTCTTTGGAAAATGAACTGGA AGCATTGCAGCAACAAATATCTCAGGCAGAACAAACCATGACAACTTCTC AGAGGCGGAAATCTGGGGGCGTGTGGAAGTGGGTGGCAGGAAGTGCAGAG GTCTCCGACAATGAATAGTAAGTCTTATGTGCAACATGCTTGATGGTACA ATGTCTGATGTGCTTGTGTTAGGATATATTATCGGAGATCTCTGGTTATC ATTTTGCACAACATTTAGTTGGAGGTTGATGCGATCCCTGGGTTTCAAGG ATACAATGCATGGTGATTGTGCTAGACCTTATTATGATATCATAGCAAAT GTGCTTCTATGTAATTTAGAATGATATGTGAAATGAACACTAAAGCGCGA ATATCTTACAAAAAATTGCATCTACTCCCTCTGCCCCAAAAACGGAGCGA GTACGTTTTTTATGAAAAGATAATCTGAAAAGTATCATTTCTGAACAAAA TGTTACTTCACATATATCATATATGGAACCCATATTGGATTTGGACATTT ATCTCAATCAATTGTTTCTGAAACAATTTCTTGTATGCTTACTGAACGAA AAAACACAGAAGATGCTAATTGAAATCCCCTGGACGTAAAAGAAATGTAA ATGCATGATAAAGCTGCATTCTTTCTGATATACCAGTATCATATTATGCT GATATCTACGGAGTAGAGGCCACACCTGCTCAATATTCCATATACTCCCT CCATCCAGAAATAAGTGACTTGGGTTTGTCTAGATTTGCATGTATCTTTA CACTAAAATGCGTCTAGTTATACGAATTAGGCAAAACCAAGTCACTTATT TCAGCACGGAGGGAGTATAACTCAATATTCTGTAGTTCAACATTGGAGGG TGTAACTCTTTAGGCATTGTATTGTATATGTCAGGTCCACCAAGACAAGC TTGATTTCCCTGAGCCTAGAGTGCATACAAGCTCTCGGTTCCTTTCACAA TTTACCATGTAGCTCAACATCTTACAGTACAACTTCTGAGAGCACTCATA ACTCTTTAAGCACTCTATGCCAGGTTCATCAAGACAAGCCGCCACCCAAC AGCGAGACCCAAGTGGAGCTGCTACAGTTTTGAGACGGCCTGTTTGTCAC TGACTACTGGGTGCCTCCTCAAGAACTTGCCCGCGATCGATTTTGTCAAA ATGTCTCCGATAACAGTCCTCTGGATCTTCTGAAGTGGCGCCACCTGGTA GAAATTTTCCATAGGCCAGTTTAGACAATTGCATAGTGAAAGCATGGCAT CATACATACAAATATACCGAAGATTGTACCGCATTGGGAATATAATTGGT TGGGATTATTAGCTTTCTTTTTCATCATATAGCAATATACAAGTATGTTC ATTGGTTGTGGTGACTGGAGGAAATACATTTGTTTATAGCGTAAATTTTA CAGGAGATATATTATCAAGCCGTCTTCATTTCAGATGTCATCATGCTATG TGGATGTGTTTCGATTTGTT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.