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GrainGenes Sequence Report: AA042204

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Sequence
AA042204
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA042204
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGACGATGCTCAAGCTAATGAGGGAAGGCGTGTGGTGCCAGGGTTGTAC
GCGCCGGTGTGAGAAGGCGCATGAGTTGGAGAGGCAACAATGGACCAATG
CAAGAAGGATTAGAGGTGTCTAGCTTGATGCAGAGTTGTTGCATTGTGAA
GGTGATGGCTCGCACGAGGCGGAGCTTGGATGATCCGAGTTGATTGGGTG
CTTGACGACCGATGGAGCAAGAGCTAGAGTAAAATGCTCTCATGTGTCTT
TGTATGCTGGTAAGCTAGATGTGTAGTGGTAGTAGTAAGTGTCATGGAGT
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CTCTGCCATTTTAGGTTCCAATTTAGTGTATTCCTGATATGTGACCAATG
AGTTCAGTTGTAGATCATCAAATTCATAATCAATACAATTAGCAAATTTT
CTCTAGGTTATTATCCAGAAAGCATAGACTGAACGGCTCCCGTGCTGTGG
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CGTCTTCGACTCTCCAAAACAGGGGTGGCCCGGTTTTGCCCTTCTTTGCA
GAATTGGACTCCCCCTTCCCCTCGGGGGCTTTGGTGGGTTATGGCGCCCC
TGTGCTTGTGGTTGGCTTCTAGGCCGTGTTTAGTTTGGAGGTGTCGTTGT
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TATTGGCCTTTTCTTAGGCTTGTAAAAGAAATTTTCTATAAATGAATCGA
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TATAATTTTCCCTACTTACGATTTTGTTTTGCTTCTATCTGAAAAATATC
CTTTGTTTTATATGATTTCCAGGAATTGGATGGAAATCTTGGAAAAAGCG
TTGGTTTATCCTCACTCGAACATCACTGGTTTTCTTCAAGAGCGATCCAG
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TTAATCATATATGTTGATCACTGCCAATATATAATTGTGTGTCTTGATGT
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CATCGTATGTGAGTATACAGTGTTCTGAATTTAGTGCTAATAGGCAGAAC
GGTTACTTAAACTTTGTTTTTTTCAATTAAAATATCAGTAACATCTTATC
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TCAGTGCTTGAACTTTAGCTGTATAAACTTGCTTATTCTTGTCTTTGCCC
TATAGTATACTGTGAATGAGATTTTGTGAAATACTTAATAATATTCTGTC
TTCCATTCATGGTCCATATTACGACATAGTTCTCAGTTCATCTGACTAAT
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GTGTAGTGGTCAGGGAAGACAAGAAGCTGTTGACTGTTCTATTTCCAGAT
GGCCGTGATGGTCGCGCTTTCACCTTGAAGGTATATATTTTCCATTTGAC
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CTCCAAATGCAGCTCTCGTGATAGGGCATAATGGAATATTTCGTAATGAC
ACAACAGATGCATATGAAGGAGCAGCTCCAAACTGTTGGTTCCATACACT
ATGATATGACTTAATGTTACTCATGACAAACTCAATATCTGATTATTCCT
TTTTCATGCATTTCCTTTGATGGTTGTAGGGAGAGAGAAGAGGCCTATCA
AATCCTTGGTTGTTGGAAGGCCAATTCTTCTTGCACTAGAGGATATTGAT
GGCAGCCCCTCTTTTCTAGAAAAAGCTTTGTGTTTTCTTGAGAAACATGG
TAGGGCTAAAGAGAGTTTATTAGCACCAAAGTTCGGAATTGGCTGCATTT
TACATTCGTTATGGCAGCATACTGCCTCACCAACCAATCTATATATTTAA
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GTCAAGCTGCAGATGTTGAGGAGGTTGACAGAAGGATGAGTGAATATGAG
CAAGGTTTATGCGATTACATAGTTTGTATTTAAGAGTGTGGGTTTTAATT
GGTGGTGTTTCTGGTTTGCAAGTTTTCGTGTCATTATACCAACTTGTGCA
CATCTTTTGTTTTATCTCAGGAAGGACCGAGTTTGCACTGGATGAGGATG
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GTCGTTTCTTCAAAGTATTCATTTTTGTTATAGAGTTTCAATAGTTCATG
CTTTGCTTGCGAACTGTATTCATGTGAACATACATCTGCAGCATGTTCTA
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GGAAGCTTTCCGTAAGTGCTCTGTCCGGGTTAACCTAAATATATGTTGCA
AGAAGTCGTCTGTTAGGATGGTCAGTGAAGTTTCCTTTTCTACTAGAACT
GACAAATCTTTCAATAAATTTTACATGATATTAGAATAAGCATCTGTAGT
ATGTTAGATACTGCATTTAACCATGGGTATATCAAATATAAGAGTACCTG
TAGCATTTACTGCTTTGCACACCTATAGGTTACTATACAATCATATCGTT
GACTGAGAGTATATCTTCTTAATAAGTAAGGAAGGATGATCTTTCTTCTG
TGCACCTTTCTATTTTATGAAAGATATAGATCCAGAGACTGTATTGGTAT
TGTAATCTAAGAGCCAAACATAAAGAGTACATCAGGACTCCTAGACTAGA
CAAAACCAGTGGTTCTGAATCTAAGCTATTATAACATCCGACTACAATCT
TGTAACATTTGGTACCTAGCATGTAGCATGCTTGTATTATGGCCATTGAT
ATATCAGAGGTTGCAGTTTATCAGGTACAGTATAATATATGGAACTTCAT
GTTGCTATTGCTTTAAAAATGTCTGAAGAAACATGACTATCAGTACCTAG
CTGATTTTTTTGTGTCTGTAGGTCCTAAGTTTTGTTTGCTTCCATATTCT
GTTTTTATCAGTTGTTTTCACTTCATCCCTGTGTAGGTCTGGAAAGTAAG
GAATCTCGAATAAATTCTATGCGTGCAGCCATATCTGAGACATTTCCCGA
GCCTAATAAGAGGCTGCTGCAGAGGTTAGTTTTTTGTTAATGGGGAAATC
TTTTGTGTCCGAGTTAGCTTTTGATCTGCTGAATAATACATTCTAAATAT
AATTCTTTTGTGATTGAGCATATGGTGAGCTGTCTTGATTAAAAGCATGC
AGCTGGAAATCACAGAATATGTACATTTGTATTAATAATTTATTGTAGGC
GGTGACATTTTCTTATCAGTTTTTTTGTAATGGCAAACATTAAATTCTAG
CTCATAAATCTAATGTTTGCAGAATTTTGAGAATGATGCACACTGTTGCT
TCTCATACTGCTGAGAATCGAATGACTCCACCAGCAGTTGCTGCTTGTAT
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CGAGGGCATATTTGATGTAAGTTTACCGATGCTATGCCAGAAGTTCATTG
CCGTGATGGTGCTTCTGTGCACATTATAGGCTGATGCAGCACTATTTGTT
CTTCCACTTACCTTAAAAGTTTTTTATCATTCTTTTTATTACTTTTACAG
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CTGAGTGGAAAATTAAGTGAAAGCAGTGCGTGTACTGGTGGTGACCTCTA
TAACTACCAGGTTTGATATGCTTTGCAATTCTGAAGTTTCTGATCTGTAG
AATTTTCTGGCCTGCTACCAGTTCTATTTAAGAGAAAATTGCACTTACCA
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GCAGTTTACACTAGACAAATAGCATTGCACATTGCACTGCCTCCCGTTAC
TCCCCATTCACTCTAACAAAACCTGAAGCATGGATCTTACGTGTCAATGT
AGCTGAAAGGATAGCTCCATCCCTACCTGTAAGAATTTGGTCCGGCTCGT
CCAACAAGGATGCCATGTCCTCCGATCCCTAGTGCTGATGAGTAGAGGGA
GGTTTTGGCATGGAGAAATCTAGTAGCGACCTTCACACTGACTGCTCCTG
TTCTCTATGCGGAAACAAACGTTAGTTCCCTCCCCTGTATCTGATCTGCT
CCTCATCAGCAGATCCATCGACCTCAAGCACTTGCAAGTTGCTAAAGATC
CACCAGCCTCCAAATCTTGTCCCTGAGTTTGCTGCTTTCCTATTCTTGAT
GGCTGCTGCAGAGCTTGTTCCATGTGCTGGTTTAGGATGGAGGGCATGTG
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GACATGTGGGGCCAATGCAACCCTTACAAGACTGGTGGGGTCAAATTTAT
TTTAGCGAAGCTGGCAAAGGAGAGTAATGGGAGGTGGTGTAATGTGCAAT
ACTATTTCTCAACCTGGTGTAAATTGCTTATCTTAGGCGAAGGTGGTGTG
ATGCGCAGGACATTTTTCCTGGTGCCAAATGCAATATGCGCTGTCTCAAT
ATGCGCCCATATTTTTACAGATGGACAGAAAAAAAGATTTACTTCCACTT
TCACTAATGATGTGCTTTCTATATGTGCATATTGTGGTTCAAAATTTTGG
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CCTTGCCTATCCTCAGTTTACACTTCATTGTTTATGTTTGTGGCGTGAAT
CATTCCGAGTAGTCCAATCCAAACCATTTGATTTTCATTTTCATTGGGTT
AGCAATCTTGCTTATGTGACTATGTCATGATTTGTTTTTAACTTTCTTAC
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CCACATAACCATTTAACTCAAAATGGAGCAATAAGTGTCAAGAGACCACT
AAATGAAAAGGATCCAACAAATATGGTGTCCAGTCATGAATCTCCATTGT
CAATGGGAGAGATTCTTTCTTCTTTGGATGCAGGAGTTCCTTTACCTGTT
CCTGGAGCTGAATATTCTGTAGATAGGCACTCCATCAAATCTAATGAAAC
TCAGCCTCAAGTGAAGCGTTCTAACATTTGGGGACGGAATAATGTAAGCG
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AAGTCATTTTTGACCATTGACTTCAAGTGTTTCGATTTTGAAAAGTAGTT
ATGGCTTTACCAGGGAAACCATCACTGGAAATACACTCTAGCTATTCTTG
AAGAAGCTTCTGTAACCATCTATTGTAGCTTTTGTTTTGACCTTGCGGAT
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TCCTAAAACTATACACGTTTGTTTTGTATAACTGTTCGGAATTGCAGTGT
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CACTTGTTGAATCAAACCCGGCCGAAACTGGCTAGCACCTGCTAGTATGA
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TCCCTAAATAACCGTGTCATTAATTCTGTGTTCTGGAGTATTTGCTGTTA
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AGAAAGTAAGTTGTTTCTGCTGTAGCTTTATGGCCTGTTGTACCGTTGAT
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AAAGAAGAAAGCAAGCACTGCATGAGCGCCGTTTGGTGCTGGAACATGAT
GTATGCCATATTCTCTTACTATATGAATCAGCTACTCCCTCCGATCCAAA
TTAGTTGACTCAAGTTTGTCCAGATTTGGATGTATATAGTGCTAGATACA
TCCGAATCTGGACAAACTTGAGTCAACTAATTTGGATCGGAGGGAGTACT
TCATTTTACATTTTCAAATATGATGCGAGTCTACCCATATTATCCAACTT
TATTAAATTTACTTTTTACGATTTTTGTTCAACAGTTTTCATTAATATAC
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AGCTGCATTGGAAGTTGGATTAAGCATGTCCTCTGCACAGTTTTCTAGTT
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AAGTCATTTCCCACAGTAAGACTTTTTCATAATCAACATTCAGTTTATCT
GTCTTTTTAAAAGGAATTCAGCAGGGCGTAATCATGCAATACCCCCAGCT
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AAACTAATATGTACAATTACCTTCAAAATTAACATTACTGGTTGGTACTA
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CAAGAGAAGAAGCAGAGGAACGAGGTAAGCTCCACTCTCCTCTTATCTAC
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ATGAGGATGATACTAAGAGTTGAAGTCACCTAATGTTTTGACAGGAGAGC
TTGTCGGGCACATCACACTGGAGAAGTATCAAGCTGCACGTGCTGACTCA
GGCTTCTTCGAAGCCCTTCTCCCGCAAACACTCCTTGGATGCCTCTTCAA
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GCGCCCGTGCCGTCATCCACTCTGGTTGAGCTGACGACCAGACTAGATTT
CTTCAAGGAACGGAGGTCACAGTTGATGGAACAGCTCCACAGTCTTGATT
TAGGACATGGATCCGCGCCGCAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.