Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA011286

[Submit comment/correction]

Sequence	AA011286
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA011286
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CTCGTTACGACACCCACCCAAACCGCAACGCGAGCCTGTGCGAGGAGAGG ACGCAACGCACCCAAAAGGGGCAACCAACAGAAAAAAAAAATAGCTGCTC CTCCTACCTCCCCTCTCGCTTTCTGCATCCTCCTTTCCACCCTCAAAAAA ATTTCTCACGGCCTGACCACACGAATCTCCCCTGCATCCCTCCGCTCGCT CGATTTCTCCGTGAATCCGTTGACCCGATTTCCTTCGCCGTCGATTTCCC TCTCCTCGCCGTCTCTGGTCGAATCCAATCGTGCCGTGCGTCGCGCGGTG GGGTGGTTGACTTGACCCTGTCGCTGGGGCCCGAGCTCGGGGAGGATGGG GAGCCACGGCGCTGGGCCGGCCGCTGGATCCGACGCCGCGCGCGCCGAGG TATGCGACTTGACCCCCCTGGTTTGATTTCCTTCTAAGCTGCTTCGATTC AGAAAGTATTGGCGCTGGCTTGATTCCTGCTAAGATGCCTGTTTTTGTTT GTTTGTTCTGGGCCTGGTGTAGTTGGGAGCAACCAATTCGTAAGTTACGG TAATCACTGCAGTTGTAGGAGATTTAGCTTCGTTCTGATATGCTGTGGGA ATTAGATTTGTGTGTGTGCATAAGATATCCCCGAGCTAAGTTGATGACGT GGTTAGGAAACCAAAATTTTACTTGATTGAGTAATTCATGCAAGGTTGTT TTGGTGCATTTTGTGCCAATTTTTCTCTATTTTCGGTGTGCTAATTTTCA TAGGCTTTGTTGTAGTAGTATAGTGTGTATAAGCACTTCATAGAGCCGTA CTACTGAATCTCATGGAAACCTAGTCACAGATCATTTTTCTGCTGATAAA TTTCACCAGTGTTGCAATACAAAACCATTTTGTAGCCCCCTTTGTTTGCG GATTTGGTCAGGGTATGTTAGTCTATCTGAATGACGATTATTCCTTCACT AATGGCAGGTCAGCGGCATGGGCCAGACAAACCAACCTGCTTATCCGCCT TTAGCTTCTGGGGATCATCCGTGGTCCTCTTCAACTGGGGCAGCAGCAGT TTCGTGGAACTATCCAGTGGACAGTCAAAAGCAAGATGTTGTTTACTATG ATCCACAGAGGGATGTTTCGGTTTCAGGAGATAATAATCATAGTGTGGCA AGCAGTGCGCCTCCTCCTGTTCAGTCGACTGTGAGCTTGACAAGTGCAAG TCATTCTCATGTGCCTTACTCAAGTTCACTTCAACATGGCTACACTCCCG CAGAATATGGAAATTACTACTATAATAACTACCCACAAGCTACACACAAT TATTCTGCGCAGCAAGGAGGAGCAAATCAACATTCAGGTGCAGCTTATCA GCCTCTTACTTCATTTCAGAATTCCGGGTCTTACGTTGATCCTGCAAGTA ACACATATTACAATGCTGGTGGTCACCAGACCGCACCAGGATATGCAACC AACAACTATTATTATCAGAACGGCACACAGAATGATGGAAGCTCAGGAAA TAATTATGCTCAGTCATACCAGAACTACTCGTCATCTGGCACTAATGCAG TACAGAGTTCCAGTACAGTGCCCGCCAATTCTTTCTCATATCAGCCGCAA TACAACCAGTGGCCATACTATCACAATCACCCCACGCCAAGTCCCGCTGT CAATCCAGTTGCTGGGAGCAGTAACATAGATAACAGAGTTGTTAACACCA CTTCTGGTTACACTTATCCTAGCGCCGAGCCACCTCCACCGGGTACTACA TCATGGAAAAGTGATTCAGGTGCTTCTATTGCACCTCCTGTGCAGGTATG TTGCTTCTTTTCACTGCAACATGCTAGTTCCTGTGCATAGCTTTTTCCAT CGGACTCTGGACAATTATTTATCATAAGTTTTAGTCTGTCTTGCCATGAT AGTTATTCTGAACAATTATTTTTCACAACATTTATCTGTCCTAGACAATG ATTTCTCATAGGTTTTAGTTTGTCTAGACATGTTCCTTATTCTGGAAAGA AAAAATGGCTGTGGCTTTTCTATAGGGACTTTTGTAGTGCCCCTTCCATT TTACAGTAAATTAACCCTTCCTTTGTTAGAATTCTGTTGCTGGTATGACT TTAGGGGCCTTTTAAGTGCTATTCTTTAACCCACTTGAAGTGCGAGTTAA TAATTGTAGCATGATATGTGAATTGTAGCATTTCATCCACAATTTATCTC ATGGGAAGAGAAGCACCTTTCACCTAAGTTCTACTACTGTGCAGGCTCCA AGCGTTACAGAACCTCAAAATCAATACGTCAAACCTGCGCAAGAAACTCC AACGTTGCAAAACCAGTATGCTTATCAGGCACCAGCTGTTCCAGTGTCCC AAAACTATTACGCAAACCAGGCACCAGCATACCCACAGACAGCTTACCCA CAGAACAATATGAATGTGAATCAAGTACCTGTGAACAACCATGGTGATCA ACAGAAGATTGTAGGTTCAAAAGGTTTAAGCTCAAATATTTTCTCAATCA ACCATGTTTCTGATAAATCTTCAGCCAAATTTGCAGGGTTCTTTGACAAC AAATACTTCCAGTGAAAACTTTCCAGCGATTCCTCGAATTGCTCCTGGTT TCTCTATGGTAATACCAAAGAGTGAGAAGAAAATTCAGGGTGCTGATTTG GCGAAGAAACCTGCCTATGTTAGTGTTTCTGTGACAAAGAACGATGCAAA AGCAGTTCAACATTTACCAGATGCTGTAAATTTCTTGTCTCCTTTTTTAA TTGTCATTGTTAGCACATGATACATGCTTAGGTATTTGTTTTCAATCACA AGGGTAAGTTATTGGCACATGAAGGCTTAAAGTACATCTTCATTGGTTAG TTCCAATTGTCGTAATTAAATATGTTTACTGTCTATGGAGGTTTATTTCT TCATAATTTTTAGAACTAGGCTAACAAAAGAATGCTGTAAATCCTATGTT TATAATTCCACAATCCGGGCATGTGATATCTTGTGGTACTTGCATATTCA CCATCCGTTTTTCTTCTCATGTTTAGAGATCCATCCCTTTTTCACTCCGT AACTATACTATGAGGAATCTCAACCGTTGCAAGGATGAGGCCCAGAGGGA TGCCTGCCAAAGTATAATACAACAGGTGAAAATTCTTCCTGTTGGCTTTT GTTAGTTGCCACCATTTCTAAAAAATGACATTCATATCTTAGTCATATAT GGATGGGGTAGTTATCTACAACAGCCTGTGAAAAGTCAATGCCCTACTAA AGGATTGATGCTAAAGTAGGACCTTATCTTTCGTAGGTGGCAACAGAAGT CAGTTTTCTTTTGCTAAGCACATCTGTGAACTAGCATTTTAAATGCCGTA AAGCCATAACAAAGTTAATGTGCTATCAGCTATATATTGGTGATATATGG ATAATGAATGCCTGATTTCAATTCTGGAAATGGAGTTGCTTCAGCTTTTG GGCATCCGATCAAAGCCCATGTTTCATTTAAATTTCTTTATTTTCTTTGG TTCTGATACATCATTTCAATGGTTCAAAGTTGTTCGATCGATTTGGTTGT ATCAATTTTTTTCTTTCCTTTGTGTTTATTTTCAGATAATAAACAAAGCT AAGCACGATGGAACCCTTCTTACTAAGAACTGGGACACTGAGCCGCTGTT TCCGTTGCCAGAGAATCTTTTGACCATGAACGAAACAAGGTCCGTGCTTC TCTTATACCCTCACCTCCCGCCAAAAGAACAAAAAACAGAATCTGTAAGG TGACAATGCAGTGTTGTGGAGACCTAAATACATGAGCTGATGCAATTTTG TGGTCCGTCGCTTTTGACTTTTTTACAATACTGTGGCTCTTTGGCACCTC TATAATTATTGCCTTTTTCCTCGAGAAATGGTTTCATTTTTCAGATCATG TATTACAATATATTTGTATATTGGACTGACACCATCGAAAAGTGCTGCAA ACTAAGCAAATATCAGAATGTGTCATTTGTTTGCAATATTTGTATAATGA CCATTAGATGAGCTTCAACACTTTTTGGACATTTCTAACATTGATAATTC TGGCAAGAACTATAGAAATGAGCCATGGAAGTATCATTTAGTCAAAATTA GAAAAATCTAACCCTCTCTGACTGCGAAGCATAATACAGAAATAAAACTC AAGGCGATTACTGGAAATCATTTCCTTAACTGCTGAACGGAACCCCACAC GATCAATATATTGGCTGCATAATTTATTTGCTTGAGAAACTGTGATCCAT CAAATTTAATGCCGACGTACATCCATTGGTTGCATCATATACATGTTGTA ATATGGTTTCTTCATTGTACTCTGGAAAAATTAGTCCTTGCTGTTTCTGT GGTTTGCAGAATCACAGAATTCTGATAACTTTTATTCTTGTACTGTTTTT TTTCCTGTACAGCAGTGCAAACAATTCAAGTCTTTTGTCAAAATCTACTC CTAAAAAACGCCTGAAAAGTAGGTGGGAGCCTGTTCCGGAGGAAACAGTT ACTGATAAGGTGGAGCCACTAGCAAAACCATTCATGAATGGTAACGCCCA AAATACTTTGGAAGCCAAAAATAGAATGGTGAGAACTGGCATGTTGCTCT TGTTAAAATCTTGTTACCAAGCAGTCAACACACAGGATAGACTTCTTTTC TTAACAAAAAGATACATGATGGACTTCGGCACTGTTATCATTATTGATTT ATGCATTATCACATGCTTGCATTTTTGCTTTAATAAGCTCTTTCTCAGAA ATATTTAACTAGTTGTTATGCAGGGTAACACCTGGAATATTGGGAAGTTT CCCCAGTCTGCACATACACCTTTAAACAAAATCACCCAGAGGCTTTCCAA GAAGCAAAAGATGGGTAGTTATTCAAGCGTGATACACAATGGAAACACTT CAAGTGATAGTGATAAAGAGCAGGATCTGACCAAATATTACGCCAGTGCA TCTACAATAGCAAATTCACCAGAGGAAAAGAAACGCAGGGAGCATAGATC TAAGCGCTTTGAGAAGAGTAAGGATTCAGCACCAAAATCAAGGAATTTGT CGGTCAATAAAGATGCCATGGCTTATGTACATACAAGAAGACCTGTTTCA GCACTTGCTACTAGAAATTCTGAAAATGGCAGCAGCTTGGCTGTCGAGGA TCTGGATTGGGATGCACTGACAGTCAAGGGAACATGTCAGGAAATTGAGA AACGATACCTACGCCTCACATCAGCACCTGATCCTTCCACGGTAATAGCA CCCACCAATTGTCTTTCTTAACTTCAAGTTGAAAGGCATTGATAGTATCA GTCCATCATTGCTATTTCTAGCTGGTGGGTCCTTTCTACTGTTTGGCTGC CTACTCTCTGAATACGCTCTTTGCAGGTAAGACCAGAACATGTCTTGGAG AAGGCGCTTTCCATGGTTGAAACATCTCAAAAGAATTATCTTTTCAAGTG TGACCAACTGAAATCTATTCGTCAAGATCTTACGGTTCAGAGAATCCAGA ATGAACTGACAGTGAAGGTAGTCTTAATCATCAAGTTGTGTGCAACTGTG GATCACATAATATGTCTGTTTAGTTGCTAGACAAGATACTATACTATATA TACTAGTTGTAGAACTCCTGCCGTCCACCAAAAGAAAATATTTGTTAATG TTGTGGCGTTGTGCATTAGGAAATAAGTTCAACAATGCACAATGTTTTGT AACCTTCAGATTTCTTATTTCAGGTTTACGAAACTCATGCGCGTTTAGCA TTGCAAGCTGGTGATCTACCTGAATTTAACCAGGTCTGTTTGTCTCGTCT GATCTGATTCTCTTGAAATATCAAATAACTGTATACATGTTCTGTTTGCT AGCTATTGCAACTTTGCATAGTGATAAATGGAAGTTGTAAGAAGGGTTTT GCTTTCTATTAGTACCAGAAGTGTGCTTACACTTTCTAGTTATCAGGTCG TGTATCGATTTCTTTAATTCCCTTCAAAAATAAGATTGCTTTTGTGGTAA TGCTAATGGTTCAGGAATTTTGATTGGACTTGGAAGTTCTTGCTGTGGTT TTGTAATGTTCATATCTGTAATTCAACTTCTGCATGTTCGTCATAGTTCA AACTATTTTTGCTTGCACCGTTTTTTCAGTGCCAGTCACAACTGAAGAGG CTATATAGAGATGGAAACAAGGGTTGTTATTTTGAATTCGCTGCGTATAA TTTGCTCTGCGTCATGCTACACTCTAACAACAAACGGGATCTGCTGTCTT CAATGGCAAGGTATCATTTTGTAAACAGTTAGCATGGAAACCTATTAGTT CCTAAGTGGATTACACATTTGATATATTCATTGTATTCAGCTTACCGAAA GAAGCCAAACAAGATGGAGCTGTCAAGCATGCCCTCGCAGTACATTCTGC TGTTTCATCTGGCAATTATGTCATATTTTTCAAATTATACAAGCAAGGCC CCAACTTGAACTCTTGCCTCATGGGTAAAGGGCAATTTTGCAACTTTCTA CGTCAATTCAACGCACTCCTCTTTCTGTAGGAGGTTTTGATGTATGTCGC TCTCCTCTTTGACAGATCTATATGTGGAGAGGATGCGTTTCGAGGCTATA AAATGCATCTCGAGATCATATCGCCCGACAGTACCTGTGGGGTATGTTGC ACGAATTTTGGGTTTCTCACTTATTGTAGATGACAGATCGGAAGAATGTG AAATATGGTTAAAAGCGCATGGTGCTATTCTTTCATTAGATAACACTGGG GAATTGCAGATAGATACAAAGGTAATTATCTCTCTCTCTGGATACACACG AGTTTAACCGCATGAATGCAACCATGTGTTTTTTTATTCTCTCTCTCTTT TGACGAGAGAATGCACATCAGTATGAATGCAAACAAGTTTTTCATGGATT ATTTGGTAAGTTGAATCTCATCCAGTGTTTAAGCCAGTCGGATGGGTTAT GGTTTTTGAATAGTGTAGTCTCTGCTAGGATGGTTTAGTGGACATTCTTC ACCATGGCGAGAAGGCTCATGTGTTGCTTGAGTTACCTCAATGCTACTGT TCACAGCTCCAACCAAATATCTGTTTGATTTCAGCTATGCAAACTTGAAC TATTGTCTTCTCAAATTGTCAAATGTGCAGAGATTAACAAACTGACTGCA TGAGATGATAAAGGAGTGCCTCATAGTGTTGTTATGCTTGAATGTGCTAG TACCCTGTCTAATAGAGAACAATATGTCTAGATACATATGAATCTAGACA AAGTGAAGTCACTTATTTCTGGACGGAGGGAGTATCTGCTTTAGCAAATG GAGAACTATTGCATCTAATTCATTCTGATGTTCTAACCTGGCATTATTTT GCGTTGCGCTACAATTGCTTCCAGGTTTCTGCTACCACGCTTTACATGCC AGAGCCAGAGAACGCGGTTGCGCATGGTGATGCATCGCTCGCAGTTAACG ACTTCTTTGCACGGACATCGTAAAAGGCGTAAAGACGGCATACTGTTATG TTCAACGGGAACATGAAATGGACCAGGCCCGAGAAGCTCAAGAATGCTTC TGGGACTAGGAGGTTTGGAGCGAGGATAGATTGCCCCAACTGGACTAGCA CTCCAGTGAGCTGCCGCAACGCAATTGCGGAGCATTGCCCAACACGACCT GGGGCTTCGCAGGGCAAGACACATTATCTGCCAGGCCTCTCTCCGTGAGG GAAATGTTACAGAAACCGCATACTATATGTAGAAGTTTCAGAGTGACTAT AGTACATGTGTTGTAGTATTACGCAATTTATACTAGGTGGTAGGGGGGAA ATACAGAGACAAGAACGGTTCAGAAAATTATTTTTAACACGGACCGTGGT CTGATTTTTTGTGAAAACTTTCCTACCTGGATATCATTTTGTGAACGGAA CCGATTGGTATTGCTCTATAATAATTCTTCCGTTGCTA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.