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GrainGenes Sequence Report: AA028324

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Sequence
AA028324
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA028324
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
AACGAGGCATCGCATCGGTGGATGGACTTGATTCGTCCGCCGCACCAAAA
GCGCCTCGTCCCCACCCACACTCCTCGCTCTGCTGCTGTGCGCCCTCTGC
TCCCCGCACCATTACTGCCACTGCCACCACTCTGCCCAACTCCCCACTCT
CCCCGGTCGCATCCGTCCGTCAGCCACCACACTCGCCCAGCCCAGCCGCA
GCGCGCTCCTCCTCCGGGCGGCGACCGCCCACGCCATGGACGGCGGCGCG
TGGCCCGCGCGGTGGCCGCCACCGCCTCCCCAGCCCCCTCCTCCTCCTCC
TCCGCTACCCTCGGCCGCGCTCGCGCCGCCGCCGCTGGCGATCCAGGTAC
GTCACACTCGGACGGCCGCCGCCCGCATTCGGGTGGGATGGGGATTTTTC
GGGGCAGCAGAATGCCAGGGGTTTACAAGTAGGCAGAGAGACGCTCACAT
TCCGTTTCCTTTCGCGCTGCTCGTCTGCAGATGGACAACACGAATCTGCG
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AGCAATTCCAACAGTGCTGCTGCTGCTGGTGCCGTTGACCTTGCTCGCGC
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CGTGCAGGATTGTCACACGGCGGCGGCGCCTTGCAGTTTCAGGATCCAGG
TGCGCACGCGATGCCCAAGTTGGCATCCAGGTCAATCCCTCACCATCAGC
GCGTGCTTCCCGGGGAACGTATCCGTGTCTCCTGTTTGAGCGTCGGTGGG
TTCAACTGATCTGCAACCTAATTAGAAAACTACTAGGATTGGCTATTAGC
TTGATATCTTTTTCAGCCTTTTGATTCTGCTCCTTAGAACTGTTACGAGC
GCTAAGTTAATATCCTTCTTTTGGTAAATATCTTCTCAAATTCTACCGAC
ATTTAAACAGGTGGAGAGTTCTTCATGGGTGAAGCTGGTCTTTTTGGAGT
CCTTTGTTCATGTCATCAGTTGAGGATGTCTGTAGCTAAGTTCTGTGAGG
TACTATAGGATCGTTGTCCTAATTGTTGTATTTAATTATCCATGTACCCA
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TGTTGATGTAGCATGCAGGAGGGCCTGCTGAAAAAGCTGGTGAAATTGTC
CTCATGGAGAATGGCATGAGTATTGCACATTGGTTCAGATACTGTGTAGG
GGTAAGTACTATATTATTAGACCTAGTTTAAAAAAAGTTTAATGATTAGA
TCTAAGTGTGGCTTGATCTATTATATTTTGCTTGGCAATTAAATTCATTT
GGACACCATGAATTAGTTGCAAAACTTCTGAGCTATGATGTATCACATGT
CATGTGATTCTGTGACCTAATGAATGCAGAGGAATTAGAAAGTCACAGAT
GTTGCATCTTAGCAACAAGAAATAAGTGTTTTTTATATTTTCCTCAGATG
TGCAGTCCAGCATCTCCTGATAGTTTTGAGCAAGCTTTAGTTCAAACATG
TGCTCCCAGCTAAATTTTTTTTTTGCACAGAACTGCCATGACAGTTCCCT
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CCATACTGTTGATGCAGTGAATCTAAACCATTTTAGCAGGCCAAGTGGAA
GCCCACATTTTACAGGAAGCACAGGTGGACACTACAACGGGAATCATTTT
GCACACAATTATGCAGATATTTTGGAGAAAAATCCCTCTTTTCGTAATCC
AGCTCCCAGATCTATAGGAGTTTTGAGCTATGATAGTACATGCAGGCCTC
ATTTTTCCAACAAAATACTCCAAGATAGTTTGGGCAGTGCTTCGAACACT
GAATTGAAGCTTGGGCAATCATCTTATCATCAATCTCGGACTTCCCTATT
TCCATCGGTGCAGTCAACATCAATTGATTTTCAGAAACCTCAGTCACATC
TGCCGTTGATAACTCAAAGTGAGTTGTTTCTTATCATGCTCTTCTTTCAT
CATTTTTCTGTGAGTTGTCATTCAAGGTCAAACATACCTGCAATAATTAC
TAACCAGGCATCTGCACTTTTGCGTATTCTTAGCCATGGGAAGTCTTTGT
TTGGTTAGTACTGAAGTGAGTATAAGATACATGCGGCAAGAAAATTAATG
TTGATGAACAACAAACTAAATTTACTATGGTTTAGAGCCTGTAGAAGAAA
CATCCGATTTGATCCTTCCTTGTACGTGCACTGCCTGTGAGCGTTTCCCC
CTCTGATAACATAACAATATCATTACTGTTTCGCGCAGATCCTCGTCCAA
GGCAACCAATCAAGGTCAACAAAAGTATAGGGGGGCATAATGAACCACCT
CTTGGTACAGGAACTAACAAACAATCAATCAAAGTTGCTAATGGCATCAA
TCGTTCTGAAGGTGGCAAGCTTACAGATGATGCAGCCAAGAATTCATTTA
TCTCAATATTTCTTTCGCATCTTGAGAGGAATAGTGAAGCCATCGATAAT
ATTCTCAACAGTAGTGAGCATAACCTTCCCAAGGCTTCGGATGGTGCATA
TAGTCCCAATCATTCAAAAATTGCAAGTAGTCAAGTTGAGACAAGAGCTA
ATGATGATCATTCCAAGTTGGCCTCTACCAGTATTCATGCCAAAAGGAGA
TCAGATGGTGGGTCTCTTTCAATGGCACCCAGTGGATATGTTTCAAACAT
TTCACCTCTTGCAAATAGTCATGGGCCTTTAGTCCATAGTGACTGCCGGT
CGTATTTGCTTCCTAGGCAACCCAATGCTGGAATCTCCAAAGTTTGTGCA
GGAGTTTCATGTCCTGCATATTGCAGGAGTTGCAATCATGTGGGCATATC
CCATCAGATTGCACATGCTGAGACTGGGGAATCCTGTCTACATGATAAAA
TGGTTAGTTGGTCTTGCATTTCCACACATGACACATCGTAATTCAACAGT
AACCACCAGCACAACAATCAAGCACCGATATTATTTATATTTTACAAAAA
TTTGATGCTCAAACTATTTTGTGCAGGCCAAGGGACACAGTACTTCTGAG
TGTGTAGACGACTTATGCACTCACAAAAGAATGAGAGTTGCTGAAATCAT
CTACCAGTGTAGAAAATCTTGTTCTACATCTAGGGAGTTTCTACCTAGTT
CAGGCCAGAATGATCAATCAATACATCCATGCTGTTACAAAGTTCAGGAA
GATGTTTCTAGACTTGGTTTTAGAGCTGGCGACTTTTGCCACACTCATTT
TTCTAATGATGGTGCTCCAATCCATAAACCTGCCGCTGCAGGTGGGTTTC
TTCATAAAGAACGTTGTGCTGTGATCTTCTCTCTTCTTTGTTGAATGTTG
CCTTTTCTTGATTCGGTGGCATACTTTCTTATTTTTTCAGGGATAGATAA
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AACATATATTGCAGTCCTCTTGCCGTGAATGCCCCCTTGGTGGGCTTTAT
TGCAGAAGGTAAACTGTTATATCTGCACCTTTTCTTTTCCCAGGTTCTGG
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GCTCTGAGCATACTTGTATTAGGCATTAACTGATTAATAGGTTCATTTGG
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ATATACCAAAGCATTTAGAAACAGAGTATGCAGGTTCTGCATCTTCCCTT
TCCCCTTCTGGCTATGATAGCATGCATTATTATCATGTTTTCTCACTTTT
CTTCTTCTGTTTTTGCATTTTACAACAAATGATTATAACATTTCCTTAAT
GGAGAAGCTGTGTTATATTATAACTCAGAAATGTATGTAATCATTTGTTT
TAATATGGTTTTGTATAATACATGAATTCTTCAACTTATCTTATCCCCTG
TGACCTGCATGCCTTCCTGCCCTTTTTCTGGGTGCAGGGTCGGATTTTCT
GTTACTGTTTGTATTTTCGTTTACCATTTGCTACCCCGGTCCTGGTATCT
TCATGTTACCCTTGTTGCCTGTTACGTTTTATATTTTCCTTTGATTATTT
GCACCTTTTTCTTGTAGCAAATCATAACAAATGTAATATAATAGTGGTTA
TTTTCTCTATCATGTGCCATATATTTCTCTAGCAGATCAGAAAAATGTGC
TCGTGTTGCTATCTTCATGCTTGCTTTCACATTCTTGTATTTGTTGCAGT
TCTGTGGGGCATGCAACCAACAGCTTGACCAAATTCCCTCTGCTTGATTC
ACTTAATAAGAAAGAATCAGGCCTCCGTTGCGATGGCACAGGCTGCTACT
CTGTAGTCCCAAAATGTTTGGCAGGTTGTGGCTTTATAAAGCGCTCTGAT
GCTGGAATTGACCAAAGTGGTAGTACTGTACAAAAGTCCAAGCATGATGT
GCAACTGCCTGCTAGATGCTGCACACCAGGAGAGAGTGAAAAGTTAAGAT
GCCAGTACTCATGTAGTGCTCAAACATCTTCCTTGAAAGATGTCTCTAAT
AAAATAACAAACCGGCCTTACGTTGCTATAACTGAGAGACCAAAGAATGT
ATCAGAAGAATCAGTGGCCAACGTCAGCTTGCCTTATATAGCTGTATCAG
AGAAAAAGGACTCCTGTAGAGGTTCTGGAGTATGTAAAGAACAACTGAAG
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CTTGGACAAATCTGAAGTAAAGAGAAAATGTAACCAGATTTCTGAGGGAG
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ATGAGGCAAGTTCAGATTCTTGCAGGGTGTCAAAAGTCAAATGGAAACGT
GCTACCATGCAACAAAATAAGCCTGGGAAGCGGCCACACAGCCCTGCAGA
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ATGGAGACCCTCAACCACAGAATGAGGCTAGCTCATATTCTTGTAGGGTG
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GCTAGTTCATATTCTTGCAGGGTGTCCAAAATGAAACGGAAACATGCTAC
CATGCAACGACATAAACCTGTGAAACGTCCTCACAGCCATCACAAGATTT
TGAAAGGTGATGAGCAGTCAGACAGCAAGGGCATTATGGTTGGAGAATTA
ATTTCCTCTGTTGAAAAAAAGCAAGTAGATGGTATGGACACTCTGGTTAG
AAAAAAATATCAGCAGGAAGGGAGCCGAGTGTTTGTTCGCAAACTGCCGA
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TATTGGTAATCAAAATTACAGTCCACATACTGAAGATGGAAGGCAGAGTT
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TGCCACAAACCTTCCATTGGTATATTTCTACATCTCAACTAGTACCAACA
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TTTCAGTACCAGCATCAAGAAGGTGAGCCTGTTGGCCTAACAGTGTATGC
TGGAAGGTTATAGTTCCACTGGGTGTGATTTTTAGTTTTTCGAAAAAAAG
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AAGGCTTAGCTCAGATGATTCATGTTGCGTTTGTCGAATTCCATACCTGG
AGCCTTGCAATCAATTGATGGAGTGCAGCAACTGCACTATCAAAGTCTGT
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GGTCAATGGTTCTGTAGACCCTGCAAAGCCAAGGCCAATACCCAGGGCAT
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TATCGCTTAATAATATATTGGTAAAAGCATCGGTGTGGTGATTTGCATCC
CAAATCCAAAGTATCATATGTGCAAATTTGGGGAGGGGCTTCGCTAGTTC
ATCCTATCATCACTAATTAAGCAATTTAGAATCTTTGTTGATTTCTCTCC
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ACAATGTTACCATGAAAGCCTGATTTAGCTGGTTAAGGATGATGCACATT
GTTCATTTGTTTGGGAGAGTAGGATGCTTAATTACAGAACAGCTGATAGT
TCTTCCATTAAAAGTGATCATACAGTATTATGCATGGATGCCATGCGTAA
GGATACTTGCCATTCTGATTCCGTTACTGAAGGTATTTACGTCAGCTGTG
GTTTTGTGATTATGTTAAAGGGTAATCAGGCCTTACTGGTCTGATATCTG
GATCTCACCACATTAACAAAATCCGGCAGATGCTACTGGAAGAGATGTAC
AGCCGCTGTATGCCTTAGGATATCTGTGTCTGATCATGGTGGTGTTTAAT
GAGCTTAATTTCCTGCATGCTAATTTGTTTTTCATATTTTATGATTATTT
CTGTGGCATAAGAAGTGTTACTGGTCTCCCATTGCGCTTATTTTTTTCAG
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ATCCACAAAGGATGCAGTGGATTCATGTGGTTTGTGGGTTGTGGACACCT
GGTACAAAATGCCCAAATTCTACCACAATGAGTGCTTTTGATATATCAGG
TGCTTTACCTGCCAAAAGAAATAATGTAAGTTCTCTACATGCATATTCTT
ATGATGGTTTGTTTGATAATCATTCTGCACATGCAAATTAAAAGCAGGCG
AATTGATCTTACCTAGACCATTTAGTTCCTCAACTTAGTTATTGGTCACA
CAATATTACCTCGTATGCAAGAGTTTGTGGCATCTGACAAATTTTTCCTT
GCCTTGATTGTTGCATTTCTTTTGCCATCAGGCATGCTCAATTTGTAACC
GAAGTGGGGGCTCATTCATGATGTGCCGAGATATAAATTGTTCAGCTATC
TTTCATCCTTGGTGTGCACATCAAATGGTAAGCTTTTTTGTTAAGAGCAG
CCTACATGTTCTCAACACATGGACTTACTGCATGCTCATAACATATATTC
TGCACTGTAGGTTAGAACCGATCTAAGGGATGCTTTGCACTAGATAATAT
TCTATGTACTTTTTCTGTAATACAATGATACGAGTCATGTTGAAAAAATT
GTCATTTTCTCTTCCTCCTGTAGTTTTGTTTCATTTTTATCGTTGAAAAA
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AATATAGAGATACATTATGATGATCACATTTACTATTGCCTTGGTGGAGT
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TTTGGCTGAACTTCTTTATCGTCCGAAAATCAGAATCCACATAACTAAAT
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ACTCAAATTTATCAAGATATGGATGAATCTAATACTAAATCATATCTAGA
TACAACCGAATCTAGACAAATCTAAGTCAACTAATTTGGGTCGGAAGGAG
TAACTGTATTACAGTGCAGTTTGCTGTGTTCAGTATTGTAGTATATTGTT
GTGTATCCTAGAGACAACAAAGTTTGCTGCATATTAAAAACTGTGTCAGC
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TGGTAGTGTATAAATCTGGCATACATGGGCTTGGCCTGTACACAGCAGAG
TTTATACCGCGTGGCTCCTTGGTAATTCATCAGTATTATCTTCCCTTTTG
TTCCTTTCGATATAGCATATCCTGATGTACTAGCAATTTAGCAAATGAAG
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TTGGTGAGATTGTTGGGCAGCGTGTCGCTGACAAAAGAGAGATTGAGTAC
CACTCCGGGAAACGGCAACAGTACAAGAGCGTTTGTTATTTCTTTAAGAT
TGACAAGGAACATATCATTGACGCCACCCGTAAGGGTGGTATTGCAAGAT
TCATCAACCACTCATGCTTGGTACTAACCTATGCTTATCCATATATTCTG
GTCCAGTTAAAATGAGTATTGCTGACATGTGCTTCTTTTTTATCTTTTGT
TGGACTAGCCAAACTGTGTCGCGAAGATAATCTCTGTCAGGAACGAGAAG
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CTTTTGCATTGTAGACCTCCCTCGGACGAAAACTCACATGCTTCATTCTT
AATTAGACTGCTCTGCCAAGCAATCACCTGTGGCAAACCACATACATAGC
AATATAGCCAAACCAAATGATAGAGCTAAAGAAGTATTTTGTGTAGTGAA
GTATGGTTTCTGTTTAAAATGATCGTAGTAGGATTATGTGTTCTCTGCGA
GTTCCATCTGATTATATATGAGCTAATAATAACTGTGCTGTCGTTGTCAA
TTCAGGTAGTGTTCTTCTCGGAACGGCATATAAATCCAGGGGAGGAGATC
ACGTACGATTACCACTTCAACCAGGAAGACGAAGGCGAGAGGATCCCTTG
CTTCTGTAGGTCGAGAAGCTGCAGGCGGTATCTCAACTAGTTTTGCTGTT
CTGCCATCCGTTTTAGCTGTGTACATGTAAAGCTCCATGGAACTTGAACT
CGCAGCGGCAGTTCACGAACTGGGGAGCTTTTTTTTCCCACGATGTTCTT
TGGTTTAGCTTTTTTTTCCCATGATGTTCTTTGGTTTGGTCGCAACTGAA
GCATTCTATCGATCTTGTATTCTTGTGTGCTGTACAACGATCCTTGGTAG
ATTGGGTATTCTTGTGTGCTGTACAACGATCCTTGGTATATCCTGTATTC
TTGTGTTCTTGTGGTA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.