Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA005151

[Submit comment/correction]

Sequence
AA005151
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA005151
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CTACACCGAAGCTCCCACCGCCTCCTCCAGCTGCTTCCTCGGTTCCTCCC
CCTCGCCGTAACTCGTCTCGCTTCCCCTTCGCCGTAATCCTCCAAACCCT
AACCCTAGTGAAAAAAGAAATTCTCCAGCCCCGGCCTCCTCGGCGCAGAC
CTGGTTTCGCGCGATGGGGAGGCGGAAGGAGCGCCGCCTGGCCGCCAAGG
CGGCCTCGGGCCGCAGGGTCAAGCTCGATCTCTTCCTCGATCCTCCCGCC
GGTGAGCTTCTGTCCTTGCCCGGCTTTCTTTTTCCTCTGTTTTCTTCGCG
ATTTATTTGTATCGTGCCTGATGGGGATATTAGTTGCTAGTTACCCGCGT
TGCGATGGTAGCTTACATTCGGGCTAGGCTTGGATGGTAGTCGATTACGT
TGAACCTTGAACACTCGGAAGGTTGTAATATATAGGTTCCATGGTTAGTA
AATTTTTGTCTGCCAAATCCGGCAGTCCTGAACGAGTGTATGCTGTTTGA
ACCGCCAGGCAGCTTTTACTATGCCGGTAAATGCTGTTTTGTTTCTGCTA
TTTAGTATGTACTGGTATTCTGGTAGAGTCTTGATGTGGTGCCTGAGACA
TAAGAAGGAACATCCAAGCTACAGCCGAAACCAATCACATTATACAAAAT
CTATTTATACTTCTGAATGCCTAAGAGTGTGACTAGCAACATATGATTTC
ACTAGTATAAGTATCGAGCATAAAATGCGGTTCCAAATATCCAATAGACC
GTGATAAATCTCTATGAATGAGCTGACTGCTGATGCTTTAACTTGCAGGG
GAGGCATCTGTAAAAGAGGGAGTAGGAGGGGAAAACCGTGAGCAGCAAAC
TGGTGTTCCCATTTCACCATCTTCCTCAGGTGGGTTCAATCAATTTCCTT
CCAAGGGATATTTAAAGAAGGAATGCCTATGGAACATAAATTTGATGGAA
ATTTGGAACTTTTGCTCAAGAATGTATATGCTCCACATATCTGGTACAGA
AGCACATGTAGGGTTCCCGGCCTGCAAGGAACATAAATTCTTCAGATCAG
GCTGCCACTGTCAAAACTGGGTGTTTGCCCTACTGGTAACTTCTCTTTTG
GCAGCATCTAAGCGTGGGGATTTCAGGATGTGATTGTTTCCTCCTCGGTT
CGTATGTCTCTTTCTTTATATTGTAGCTCTAACCTGGTCTTTTATTAATG
CTGGGCTGTAAAGTGCATGTTAAGTAATTTTAGTGAACTTCCAAAACTGT
TCACTTATATATCTGTGTCGATTTCCTCACAGATACTTCAGAAAAGAGTA
AAAAATAGATTGTCACATTCAAGCTTTCGCGTTTTTAATGATGAATTTGT
TTTTTCAGATAAGAAGGAAAATCCTCTAGCGTTGCTTGGGCAATATAGTG
ATGATGAAGAGGAGGAGGGAGCAGCAGATCAGCCTAATGGTTATACTAAG
GGGAGTTCAGCAGATGCAAGTGCCGAGGTAATTCAGGTCTTCACTATTTC
ATCTCTTGTACCTTATTCTTAAGCCTTGCCCTACGGGCTCCATGCAGCTT
GAGGTATTCAAACAGGTTGAGGGGGTGTTTTGTTAGGCTTACTTTTGGCA
TTTTAGGCTTTGTCTTATATGCCAGAAAATCACGTAAACATCTGCTTTTG
GCTTTTGACTGGATATTGTTGCATGATGATATAGCCAAAAGCCAAAGGCC
AGAAATAAGCCTAACCAAACACCCCAAAATTTAGGTGCTTTTCTGGCTTG
TAAGCCAAAAGTAAGCTTGAACCTTGTTGTGCTTATCATATATACTGAGA
AGATTATTGTAGCCCCAAATACGCTGAAGCCAGTGAGGAATTAGCTTAAC
CTCCAATTTGTTTGTGATCTGTTTTCTGGACATTGCAAGCATTAATATGA
TCCTCTCATGCTTTTTTAGATTCCTGTCAACTAAGATCGTTAACATTAAG
AAGTTTGAGCTCAGTTGGTCTGATGATGAAATTTGTTTGATTGTTTCAGG
TTATTCACGATCAGGGCGTAACTGACGATAAATTTGATGAGGATAATGAG
CTGCCTGCTTCTGCTAGTGTTCAGCAGGAGATATCGCAAGCTGATGAACT
CAAGAATTTCGCGGAAAATGTTGCCGAGGAAATCATTGTTGCCCCTGAGC
CAACTCCGGAAAATAAGTTTGTGGTGGCAACCGAAGCCAACCCAGATTCA
TCTGGCATGCAAATTGTTGGTGACATTGGTGGGACTTGGAAGGCTATCAT
GCATGAACAGAGCAATCAGTATTATTACTGGAACACAATTACTGGAGAAA
CTTCTTGGGAAATCCCTAATGGATTAGCTTCAGGGGTTGCAGCTGATGGA
GTAATGTCTGGATCTATGCCTACTCATATGGAATACTCCATAGAAGCTCA
AGCACATGTCCTCCCACACAGCAATGTCGAAGCATATCCAAGTGCTGTAT
CTGTTGGAAATGGCACTGCAACTTATACTGCTATGGGTATGGTATGTGGA
AGTGGGGAGCTTACTCACAATGCTTACGCTTATACTGGAGCTGTTGCTAG
TCATGAGTCAGTGGACATTGATCCCTTGCAGCTTGCAAAATACGGTGAGG
ATTTGCTGCAAAGATTGAAGCTGCTGGAAAGGTGCTTGTTATTTCCTAAT
TCTCTTTTCAACTATTCCTATACCTGGAAGTGTGTAACTAATTTTTCAGC
ATTATCATGCAGGCCACATGTTGCCGTTGACAGTCTTGAATTGATAAAGA
GAGAAATTGAAATACGAATATCAGACTGCAATGCACTCTCCTCGTATGGG
TCTTCTTTGCTTCCGTTGTGGTTACATGCTGAGGTGCATCTTAAGCAACT
AGAACTTTCGGTTTCTGGGTATGAAGCTAGCTACGCAACCAAACCTGGAT
ATCCGGAGGCAGTGGATGCAGAATACAAAGTGCCTAATGAAGCTGAAGTT
GTGGCACCCTCCAATGTTGACCATTTGAAGTTTGACGTTAGCACTGTTGG
TACTGTAGATGCAGATGTCAAGGTTGAGGAGCCATGTTCAACATCTGCTC
AGAACCCACAAGGTGCCACAGTAATTACTTCAAGAGTTGAATCAGACATT
GATGAAGACATGGATGTGGAAATGGAGGTTGATGATGAAAGTGTTGAAGA
ACAAGGAGGTTCCGCTTCTATGCTGAATAAGGAGCATCCTTCTTCAGAGC
AAGTAGGATCACCAACTTTGTCATCATTGGAGGATTCTGCTCCTCCACAG
GATAATGACATTCCTCCACCACCGCCACCACCAGAAGAGGAATGGATTCC
ACCTCCACCACCTGAGAATGAACCAGCTCCTCCACCTCCTCCCGGGACTG
AAGAGCCTGTTGTGTCATATGCTCAGGCTGATACACTTCCTCAGCCATAT
GTAGATCAACCAAACTTGGGTTATATGGTTCCAGGAGTGGAGTACTATCC
TGCTGCAGGTACAGATGGCACAAATGCCGACTACTATATGCAACCGAGCG
AGTCTCATATTCTTCAGTCGCAGCAGCATTCTTATTATGCACCAGTGTCT
GCAAGTGGCATGCCTATTCCTGTTGATGCCACATCTATTCCCCCAGTACC
AGTTTCTTACTATGGTTATCCTTCTGTGGCTATGGCTGCCACTAATGTAG
CAGCTGAATCTTCTGGATACTATGCTTCATCAACCTCGGTCATTTCTAGC
GGTGCATTAGATAGCAAAGCAAGCTCAGCCTCTGTTGATACAAATAGTCA
TGTAAATCCCATGGAGTCCGCTAAAGTGATTTCCAAGGAGCCCACAGCGG
CATCTTTGAGCCAATCATTAGGAGCAGCACCAGCTTCAGAAACAACAGTA
CATGGATGTTCTACTCAAACTTCTGCTAGTACCACTAATCAGACTAAAGG
TAATTTGTATTAATCTTTTCAAGGAAGCTTCATCTTTCTAGCTTGGTTAT
TTTGCCCAGTGTTGACCATTTTGCATGTTTTGCAGTTCCTCGCACTAAGA
AGCGACCTGCTCCTGTTGCATCATCACTGAGGTCTAATAAGAAGGTCTCG
AGTCTGGTGGATAAGGTATCTCTCGCCCACTAACCTCCCAATGATGCTGT
CAAAATAGCAACCATTTTGGATGATATCATATTTGCTAATTGTGTATATA
GTCGTAGACAGGACCTAGATTATTTTGTTAACAGGAAAACAAACTGCTCG
ACGTTTATTTTATTGTGCAAAATATAGGTCATCCAGAAACAAACAGCTCA
TGAAAATGGGATGTAGCGGTGTTTCCTGACTATTTTATCTCATGTTTATC
ATTTCTTATTCTAAAGGCAGAGCAATCTGTTTACATGGTAATTGGTAAGG
CTTAAAACGAGGTGAGTGTTGATGCATAATAATTGCTTCCCTATCAATCT
ACCTGTACTAAAACAACAGTATTTTATAATTACAGTGGAAAGCTGCAAAA
GAGGAGCTTCGTGATGAAGAGGAAGAGGAACCTGAAGATGCTTTGGAAGC
CCTAGAAAGGAAACGGCGGAAGGAAATAGATGTAACGCTTTTTACTTTGT
CTCTCTTGAGAGCACATGCACACTGAAAAATCTTCTCAAGTCTGAGTTGA
TCGCGTTTCATTCATTCCAGGGGTGGCGTAAGCAACAAATAGCTAGTGGA
GAAGCCAAGGAAAATGCTAACTTTGTTCCCCTTGGTGGCGACTGGTATTG
TTCTTTCATCATATGATCCTTGACTTGTAGAACTTAATACTTTTGTTTCA
CTATAGCATAAAGTACTACGGGCCTCTCACATTTTTACCTCTTTCTCAAC
TTTACCCTTTGCAATATCCTAGAATTTTTTTTAGTAAAATCTTTGGATCC
AGTTTAAAATAAGGCAGGCTTTGTACGCTATTTATGGAGATGAATTCTTC
TTGCTGTAGTGTTTTTCTTTCCTGGGGTTTCAAACCATGGCATTGCAAAG
GATTACAAATATTGCAATTGCATGTGCACATCATTTGTTTTATTTGATTC
ACTGTTGGTAGTTCTTGTTCTTTTTTACCATGGCACAAGGGCTCAACTTA
TTTCATTACTTTTGTAGGCGTGACCGTGTGAAACGCAAGAGGAAAGAAGC
AAAGAAGGAATCAAAGACCGAATCTGTTCATGCTACTGCTGAACAGCAAA
AAGAGCAGCCTGATCTAGCAGAGCTTTCCAAGGGTCTTCCTTCTGGGTGG
CAGGTTAGTGTTTTCCTTGTTCCATATATGCACAGTATATATTTATACTC
CTTCCGTTCATTAATATAAGACATTCTAGCATCTTTCTAAAACACATGTA
TGTAGACGTGTTTTAGTGTGTAGGTTCACTCATTTTAGAATGTACTAGTC
CACTTCGAAATATCTAAAAGGTCTTACATTAGTGAATGAGGGAGTATATA
TTTTCCATAACAAATGCCATTCCTCAGCTTCGACAATTTTCTTGCCGACA
ACCAAATACAAAGTATAATTAGAACCCTTTTTTACCACAGCCTGTATATT
GCTTGCGCCGGTGTAATGTATTAACATTGTTATCCCCTCGCAGGCATACA
TTGACGAGTCTACAAAGCAAGTGTACTATGGGAACAGCCTCACTTCTGAG
ACGAGTTGGGATCGGCCTGGCAAGTAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.