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GrainGenes Sequence Report: AA019896

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Sequence
AA019896
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA019896
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GGTAAATCCTGGAAATTTAGTCAATCCTTGGTTGGATCCTGTTCATAATT
TCAACAACTTACCCTTTGCTTCTTCAAAAACTTCACCACGAGTGCCCTTG
TTCCTCTTTTCCCCCGTTCAGTTGGAGCAAAACCCCTCTCCCTCTCGCCG
TCTCGCGTCGCCCCCCAAGGAGACAGACGCGACGAGAATTGGAAATCCAC
AATCCCCAGAACACCCAATCTCCCTCCTGAGCCGCCCTTCCGCCGCAATC
CCCAATCTAATCCCGATTCCTTCCTTCTCGTGTCCCAATCGCGAGGATTT
GGAGGATTTTGTAGCCGCCCAATTCCGCTCCCTTCTGCAAAACCCTCGCC
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AAGACGCTGCCGTCGAGAGCGAGGGGAGTCTGCGGCGCCGCCGACGCCGC
GGAGCCCGACTCGCCGAGCCCTAGCGGCCGCGCCCCCTCCAAATTGAAGC
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GGGCGCTGGACGAGGGGTACACGATGTCGGGGGACAGCAGCAAGAGGTGC
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TAAGCCTTCGACGTGCGTGCCTTACATCTCATGATCTCATGTGTTGTTAT
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TTGGTAGAAATATTTAGTTTTATGCAATCCGGAATCGCACCTAATAAAGT
TATTTGTCTTATGATAGCACCGTTCTCTTTCTGGCTGTTATTTGATGTTT
TTCTCTACTACTTGTTGATATAGGGGCGCAGGGCTGTTAGAAGAGAAGCT
GCCTGATTTACTTCCCCATCTCAGACCATATCAACTTCGTGCAGCAAATT
GGATGGTTGAGCGTGAAAAGGGGAATACAGCTGTTTCATCACCCAATGAG
GGTTATGTTCATCCTGCACCCTATTGTGTTCCAGTAGATTATATTAGCAA
GAAGTCCAGGATGTTCTACAATCCCTTCAAGTAAGAGGCCAATGCATTTC
ACTTGTACTTCCGCGACGTTGCTGTGCTTTCCTAATATTTAGATTAACAT
GTTTGAACTATTGTTATATTAATTATCCTTGAACTTTTGTGACCATGAAA
CGAAAATATACAGAAATTTGGTTCATGTAGGATCATGGGGTAGTGTTGTC
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GTCAAGGTTTAGCTTGATTTAGAATTTTAGTCATGGACACAGAACAAGAG
CTCAATGCTTATAGGATATGACATTGAAAACATCTTAGACTCCCATGCAT
ATTATTATCTGCTTTGCATATTTATTGTCCTTGTACTTGGTTGATTTTTT
TTCCCGAAAGTATACTATTCCCAATGCTCTATATTTGTTTTTTTTTTGTT
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GTGGGAATGTTTCACTTCAACCAGAGCCTTCTCCACCTTATGTCTCCGGG
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AAATGGGCTTGGGGAAAACTGTTGAGCTTTTGGCTTGCATTTTTGCCCAT
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TGTGATGCTTGGCAGCATGCTGATTGTGTTGGTTACTCACCCAAGAAAGA
TTTAACCTTCGATGATGATAATATTTTGTCAAATTGTGAAAAAGACACCA
TGAAGTCAAAACTCAGAAGGGGAAAGAGAGTCAGATATTCTATTGCAGAG
ACGGAAGATACCTACAGTTGTGCAGTGTGCTTGGAACTTGCTGAAGCTGC
TCAAACTACTATTTTCAGTCATGCTACATTGATAGTATGCCCATCACCAA
TATTGGCACAGTGGCACTCTGAAATTACACGGTATGATTTCTCTTGTCCA
AATAATAGTTGCGCAATATTGTCTCAATTCTTGAATGAATAGTGGAACTC
TGCATTTTTTAAGTTCATAGATAGCCAGACCACTTATCAGAGAACTTAAA
GCATGTGCATGACCAGTTGACCATTATATGTGCTGTTATTTCTTCATTTT
GTTAGATGTATGTTTCTTTGATTGGAATGTAGAATGGTTATTTTGCTTTA
ACCGTGCCATTTCATGCAATAACTTCCTCTTCTTCTCTGTTTGTAATCGG
ATCATTGTAGAAGTTCTGCAACTTTTGAGTTGAAATCCTTCTCACGTGTC
TAGGAATTAAGAATGCTCATGACCAAAAGGCTTTTTTAGAATAAGACGAG
TACAGTTTAGATTTTAAGAAGTTCCGAACTATTAAGAAAATTTGTTTGTA
TCCCTCAAAAATGAAAATTTGTTTGCATGTGCAACAGATTTTGCCAGCTG
CTTCCAGTGTGGTCCAATAAATGCATATAATTGAAGCTTCAAGTGCCTTA
TCCAGTCTCAGATTTTTGGATGCTTAGCATTACCTGTTCTGTTCAGTGAT
TATCTGCATACTATGATAGTGCTGACTATTACGTTCCTTTTCACATAGAC
ACACAAGGCCAGGATCTCTGAACATCCGCATTTATGAAGGTGCAAGGAAC
TTGGACTCAGCTTCTAACCAAAGAAATGATCTGACTGAGATAAGCACTGC
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ATTCTGATAGACATGATGGAGATCGCCGCTTCTTGAGATTTCAGAAGAGG
TAATGTTCAATTTTCTCGGGAAGTTTGGTCATACATGATATCAACTAATT
ATGTTATTTTAGAAGTTGACTATATATGGCATTCTGACCCCTCAGTTAAT
AGTGTCCTTAACTGAAAAGGGAGTGCTGTTAGCCTATTTGATCTGCAGGG
TGTTTACACGTTCATTATTGCACTTTATGTCATATGGTTGCTTCAAAGCA
GGGGAGAGATGCTCATACTTGTATTGTATCTTTAAGGGTGCTCTTTATTG
TGTTCTGCTGAGTTATGATTACGAGTTTCAAAATTATGAGTTTATGATAC
GTATGAATTGGTCTTGCATGATTTGAATGTGGAAACTTGCTAAACCTGAA
AATATTAGCATTTACATGTAATTGATTTGAGCTTCTGCTCTGCTTAGAAT
GATGTTTATTCTAGTAATAGCTGACATAGAAGGGAACTAACTAGTGCCAT
TAGGCCCGCCAATCATTCAATAGTATGAAATAACTATGGGTTAACTTCTA
CTGAACTCTCATTGCACACCTAGGTACCCTGTCATTCCAACTGTCCTAAC
AAGGGTCCACTGGTGGCGGCTTTGTTTGGATGAAGCTCAAATGGTAGAGT
CCAGCAAAACTTCTGTTACTGAGATGGCAATGAGGCTAAATGCGCAACAC
CGCTGGTGTATCACAGGAACTCCAATACAGCGCAGGCTTGATGATCTTTT
CGGCCTTCTCCGCTTTCTCAGGACAAGTCCATTTGACACATACAGGTGGT
GGGTGGACATTATTAGAGACCCATATGAGGTACATAGACTGCCAGCACCA
TCTGCGAGCATTCAATACATCTTTATTAAACCTGTATGTTGCTCTAACTA
CATGACAAAAGAATAAACACCATGATGTATTATGTACCATTCTTAGAATC
TTAGGAATATTATAATCACTTATTGCACACATATCATTAATGGTGAAGAA
GGTTTAGAGAGGCACTAATAACCTATTAACCTAGGATGATACGAGTGTTA
CTGTAAGCTCATAAGCTAATTGCTCATCTGTAGGTTCATGCATGGATAAT
GAGGATATTTAAAGAACTGTACAATCTAATTAAAGAATGCCAATCTTAGT
GCCATTTGTTGATTCACATAGCAACATATGAATGCTGCTGTGATGGAAGA
GCATGTAATGCTGGTTACTGCTCTGCAGCTTCCATGACATACATTTCTTG
AGATGGTTGAAATAATTAAATTAATCCTTTTCCTCATTTCTTCATTGAAT
TGAACTGCAGAGGGGAGATATGATAGCTATGAATTATACACACAAGTTCT
TCAAGGATATCATGTGGCGCTCCTCTAAAATTCATGTCTCGCGGGAATTA
CAGCTGCCTCCACAAGAAGAGTGTTTCTCATGGCTCATCTTTTCGTCAAT
CGAAGAGTATTTCTATCAGAAGCAGCATGCAACTTGCATGGACCATGCAC
ATGAAATTATTAGACGTTTAAGAAACAATGCCAACAAAAGGGAACCAACA
TCAGGTACTTTGTCCATTATATCAGCTATTTTCTGCTTCTAGTTGCAAGA
TTTATACTGCAGGGACAGCATTTAACAATTTTGTTTCTTTTCAGCTGCCT
TCTTTATTTTTGTGTTTGGATGGAAATAATTATAGTCTAATTGACATGTA
TATTACAGCAATCATGGATATCTGCATCTTTTCTTGTTTTTCTCTCTCAA
ATGCCATGCCAGTGAGATAATTTCTGCCTGAATTTTCCATTTTTTCCACA
TCTGGCGAACAAAGAAATCATGTGTACTACACAAACCAGAGGGTTTTGTT
AATGAGCACATGGTTACAGTACGGTTAATGGTTTTATTCAGTTGCCGTAA
CAGATCATGCTATACAACTGTATTAAAAAAAATCTGAAACCTCCTTTAAC
TTTTATTTTTGTTGTAGATTCAAATGCTTTATCAAATGTGTACCTCTCCA
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GGTGATCCTTTTCTACCCAGGTACTTATCGGTAAAGCAAAAGTTGAAGGG
GAGGAAGAACTTAGGAAAGTAGTTGTTTCCCTAAACGGTCTTGCTGGAAT
CGCTATCATCGAACAAAAGAACCAAGAAGCTATTTCTTTGTACAAGGAAG
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CGAATATTTACAAGAATGCCCACTGAAAATACAAACTTCTGTTCTCTACT
ACAAACGAAAAAGAAAAGAAACTAGCCCTGTGGATTCAGATCTACGTGGT
ATAAAGCGAAATAAAATATCGTCAGATTCGGCAGCTGATGGTGCTGAAAC
CTCCGAGGAAATTGATATTATTGGACAAGCACCCAAAAGTGTAGATGCAG
GGAATGGTGCGGGATGCCACTCATCATCTGAATGTTTTGCTGATGGTTGT
TTGAGAAAGACATGCAGCACTCTCAAAGAAAAATATTTGTCAGTTTTTAC
TACAAAGCTACTAATAGCACAGAAGGATTTCAGAGCATCAATGGAAGAGG
TGATCTCGTCACTATACTGTTATTTTTGGGGTCGCAACTTGCAGCGAGTG
ATCCATGTCTTCTTTTCTTCCTTGGAATGTTCTATGTATTGCTGTAATAT
TCTTGTGTGTATTCGATCTTTCTTAGTGCTTTACTCCATGATGTTTGCCT
TTACTATAGTTCTTACAGTCTTCTAGACTAAATTCATCACTGTTTTCTGA
TGAACTTCTGCCTCTAGGTCACCACTCTTAATAAAGAATTACAAAATCAG
GGTAAGCATTGGTGGCTATATGCTTTAGATTCCATTGAGAAGCATAAAGA
AGCCGCTGATGAGCTATTTAAGAAGGTCGATAGTTTTTCCACTAAGAGCA
CCACTGGCTTGGGTATAGGAGGAATATCGTCCAGGTCAGCGCAGAACTTT
GTTCAGTTTGTTCTCCTTGCAATTTGTGGTGGTTTTAATATTTAGGAACT
TGTAGTGGTTTAACTATCTAGGAATGAGTATCATGAAATTAACATCTTTA
TAGTAGTTGATGGATAACTTGATTGTTTTGTTCTATGCATAGGGTTCAAA
CTATTGCTGCCTTGAAGTATACCATTCAATCTGGAATTGATTCCCTGCGA
GGTTCAAGGCAACAATTAATAAATAGGCTTTTGGAAATAGACAAAACGAT
GGATAACCCAAGGGACGATGATATTGAGGGTCAGCGATATTGTCCGAAGT
GCTATGATGGTACTGGTTCTTTGTGCATACAGTGTGAATTAGATGAGCTG
TTTCAGGTAATCTTATATGCTCGTGCTCTTTAATGTATCCGTTATCAAAT
GAAATTAATCATGTGTTATTTATGTCATCACTTCTAGGGGTATGAGGCAC
GGCTCTTTGTTGTAAAGAAATCAAACAATGATTCTGTTATTGCTTCAGTA
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CCGTAACAAAAAAACTAATGAAGGATCTGAAGTTGACGGTGACAGTAACA
ATCCAAGATCTGCCCGGGAAAACATACAGGTGACTTTTGCTATATCTTCA
TCCAGATGAGTGTCATGTCTTCCATTTGTACATATAGTTTGGTAGTTGTC
AGTTGTCACTTCATTTAATTATTCATTGAAGTTGCTCTTGGGGAGTGTTA
CACATTTCTATTTTTGAAGGAGGGTGTATACCCTTTATTTTACCCTGTTA
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GTATGTTTGTTCCAATTGTGGAAACATTGTGTGTTTTACAATTCACATTT
GAACATCTTGCATGCCTGCATATAAATCATGTAATCACATGCTCACGCGA
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CTCACTCTTTTTTATAAGCTGTTTTTTCGAGCTTATACAAGGCTATTCTT
TCTAATAATGTCTTAGTTTCATGATTTATATATGATACGTAAGGGCCTAA
ATACATCACTGGACCACTGTCAGATACAATTTTGGTTTAACTTCTATCTA
GCCTAAGTTAGCTAGACATGTTTTTTTCTAGTGTCAGCTATCTTCAATTA
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TACAGGCATCCTTCTCGAACCGAGACTGCTCTGAGGGCTATTCGGACCCA
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ATTGTAAAACCTGCTCTATCTCGTCTCGGTAGTATTTGGTAATATCTGAG
AAAACATCAAGGAGTCATAATGACAGAGAACTATAAAGGAGACCCCTACA
TAAATAGGAACACAAATTTGCATCCATGGGACTTGAACCCAGGTGATGAG
GTCATACACCCACTCCCCCTAGCCCACTTCCTACATCAAGTGGACATACA
TGTCAATCTTCTTAGTTAGCCATCATTTTAGAAATCCTGGCTTATCTCAA
ACCTTAAAATACTGCTTACCTAGTGGTCCAGTCCTGCTAGGGTCTGTATA
TTTAGTTAAAATATTGAGGTTCAAAACACATCCGGAGCTAGGATATTCTC
TGACCATGATCGTTAATTTAGGCAATGCGCAAGGAGTTTTCTCTTGCAAG
GAGTTTGTCAATTTGTCAGAACCAATTACTGCGTGCTCATGATGAGATCA
AGATGTCTATCTCGCGGCTGCAGCTCAAAGAGAATGACGATGAGCCCAGT
GCTGTCAATATTGTAACCAGAGAAGAGCTCATACCATACAACGTGCAGTT
CACGAGTGAAAAATTCTTAGCCCTTTCATCTTTAGCTCGTATAAGAGGCC
AACTCCGGTACTTGAAGGTAAATAATCAACTCTGTCTACCTGATATTTTT
TTCCCAAATTGTCTACACAAAAGCAGAACTATTTTCCGTCTGGATAACTT
CTAATCATTTAGTTTAAATCTACTTGTATGTTTCCACAATCTGTGTCAGC
GAGTTCTTTTATAGATGTTGACCACATTTTCATGTACTTTTAGGGATTGA
TGCTGCCCAAGTCAGGCAATACTGTTGCTACAGCAGCTTCCTCCCCTGTC
ACAGCGCAATCTGGTTCTGAAATTAGCAATGAACAATGCCCAGTTTGTCA
GGAGAAGATTCTCGAGCAGAAAATGGTTTTCCAATGTGGCCACTCCATGT
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ACACTGATACTCTATGTAACTATGCTTAAATTTACTTCAGTTGTACCTTT
GGCCCTTCTGTTATATGCATATGATGTGTCTGCCTGCTTGTTGTATTACA
GAATTTGCTTTATATATATATTCAGTTTTCAAATCCAATTGCAACTCCTT
TTTATAGAAATATTGCAACACTGATATGGCATCTGGGAAAACCATCGTTT
ATTCATGACATATGTCCCTTTGATGTATAGCGAACTCTTTATCTTCACTG
AATTTATCTCCTTGTTGCTCTCAGGTTGTTTGTACCTGACAGAACGAGCT
GCTGCGAGGCACCAAAAATGGATTATGTGCCCTACATGCCGTCAACGTAC
TTTTCTTGAGAATGTTGCTTTTGTGGTTGAGAAACAGAGTGAAAATGCTG
ATAAACAAGCTGAGGATTTGGCAGAAAGCGCTATTTCTGTCCAAGGTTCA
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TTTCACGTTTCAAATCTATTGTTTCTGATTATTTGTCTGTTTGTAATAGT
TTAGCATGGAAGGATGCTCCAGTGCAAAAAGTAACCTTTTGTGCTAACCA
AACTTTCTGTAAAACTGAGTTGCTTGAAGCTTGATTCTTGGCCAAGTGCA
TGATTTGATGTGCAACTGATGTATTTGAATGTTTCGGTAAAAGATGATTA
TCTAAAATGCTGGATCTATCAATAATGTCAGACTTTCTAAATGCCATTAG
TTGGTTGCACTTAATTCTTTTTCCGAGGAGTTCTTACGATTTTGCGAAGT
GAACGCACATGCTGTTAAATAAATTTTAGCAGAATAACTGGTTCATAGGC
CATGTAGCTCACCGAGTTCTCCAACTCAGTCTTGTTTAATTAGGGCAATA
ATCCATTTAATTCTTTTTCTTTTCTTTTCTTGAACCAAGATTGAAGCTGT
GACAAGAAGGATTTTGAGGATCATTTCAACTGATGGAGCAGCTAAACTAC
TTGTTTTTTCAAGTTGGAATGATGGTCTTGATGTATTAGAGCACTCCCTT
GCTGCTAACAATATCTCTTATGCTCGGATGAAAGGAGGAAGGTGAGATAC
TTGTAGCCTAGCATGCACGCTTTAATTATCTGTCTCACTGTACCGAGTAC
AGTAATGTTATGAATTAGATTTCCTGAACTTGATCGTTTTTATTTTCTTT
TTTCCTGTTTGCTTTGAGTCTTGTTAGTTGCTATTTTAGAAAAGTCTTTT
TGTATATGCTGATATTATGGACAATGCAGTCGCTTAATGAAAGTCCATCT
TCTTTCAGAAAATCACAGGTGGCGCTCTGTCAATTTAAAGGCCTGGCATC
CAGTATAAACGGAGAGAAAGTGAAAAAGGCAGTTTCGAAAATGCAGCCTG
TTCAAGTATTGCTAATGCTTATCCAACACGGCGCAAACGGCCTGAATCTA
CTGGAAGCACAACATGTAATTCTATTGGAGCCATTACTAAACCCATCAGC
TGAGGCACAAGCTATCAGTAGGGTCCATAGAGTTGGGCAAGACAAGAGCA
CATATATCCACCGGTTTATAGTAAGCACCATTTCCTGTGCCTATTTATTT
TATTTGAAGTATAATTGGGAAAAAAATCTCAAAGCATTATTGTTGTTCAG
GTGAAGAAAACAATAGAAGATAGCATATACAAAATGAACAGGGGTAGAGC
TGTCTGCTCCACGATCAACCGTAAGTCAAAGAACTTCAAAGACGAGCTTG
CTTTGACGCTGAAGGATGTCGAGTCACTGTTTCCTGTGAAAGCACCTGAT
CAGCTTTCAGATGAGGAGAGTGAGGATCATGGTGATAGCTTGAGGAGTTT
GCCTCCATCTGTCGCTGCGGGGTTGGCTGCTGAACTGAGGGCTGTCAATG
GAGCAACATGATAACCAGCATCAAGTTAAGAGAAGCTGTCTTGGTCTGAT
TGGAAATTGCAGTGTTCTGAAAGCTCAAGGCGTCCAAATTCAGATCACAG
TAGGAAGACACCAATAGTTTGAGATGAATGGATACGATATGGTCATGAAG
TTGCCGCATTCCAAGAATCTGGCATGACTGATAGAATGTCATAGATCACT
GGAGCCAATGAGGCCGTGAAGGTGTAGTTTAGGGAGACGATAAATGTGTA
AGATAGCTGGTTAGTTTGGCAGAAGCATGGGCATGTAACATGGCCCATCT
CATTTTGATCCTTTGTTATGGTAATTCTGCCATTACAGCTTGTGTCCCGT
GTACAATGTTTATGAACGTACCATGTATAGTTTTGTCTTAAAACTAATGC
AACTTGTACAGTTGGTGTTACTTATGGCATAATTTAGCTTCT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.