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GrainGenes Sequence Report: AA013808

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Sequence
AA013808
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA013808
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GTCCTTATTAGCCCTTCAAGTACGAGTTGCTCCAGGAGCAGGACCGACAT
CCATCTATATTGAAGGTAAATTTGGATCCTCAGCTCCCCTTGCTTGCGTC
TACGTTATATTTGTTGTTGTTTCTCATGCATTTCACCACATTCCAGTGCT
GCCCTTTCTTTTTGATGGTTATACTTAGCTAGAATGAGCGGTGAGATGAT
ACAGGGTTTATTTTTGTTACAGAAAACCGCAGCCAAAATGGCGATGGTCC
TGGATGCCTTTGCATCCTACGTGCAAAACATGTTGAAGGAGGTGTCGAGA
GAAGAGGCGCACATGCTGCTTGGAGTCAGAGATGAGATTCACAAGATGGA
CATCAAGCTTGGGGACCTCAAGAACTTCCTCGCTGATGCTGATAAGAGAA
ACATCACCGATAAGAGCGTGCAAGAATGGGTGGGAGAGCTCAAGCGCGCC
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GAGCAGTCCATCCACTGCAGATGTGGGGTGCTTCAACCCCTTGGTCTTTT
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GCATCTTTAATTTAGAGTAAATATATTATTATAGGCACATTCTTTTATGT
ATATTTCTTTGACATTGCAAGATGGGTCCATGCGACACATGAACACAACA
CATGTACATACCCATATGTATTTTGAGTAAAGAAGGTACAATATTACAAA
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TGAATTACTGCATACCCTTCACAACAAAATTCAAATTCATATATTTGAAT
GCTTTCAAGTATTTTGGTAAAATGTGTTTCACTGATTTAAAACTATTTGC
ATTGTTTAATTGTCACACATGTCAAATAAGATGTTCACGTATGTTTCACG
ATTTATGGAAATGTTGGTGCATGAAAAAAAATATTTTAGATAAATTGTTC
GTGGCACATCTAAAAATCTTCTTGGTGGTTAGTAATGTGCCGTATGGAAA
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TGGCAAAATTGTGTAATATGTGTACGCACCTTCTAAAAATTTCTTCGATG
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AAGATTTGACTTTTAACTAATCCTTAGACGTCTTATATTTTGGGATGGAG
GGAGTAATTTATATCCTAAATATTTTATCAAATTAAATTAATAGATTATG
TATTGGTACAAAAATGAAAATAGAAAACGAAGTGCACAAAAGAACTTTGG
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ACATGAAAAGAAGGAAAAAGAAAGGCAATAAAGAACTATGTAGAATAATA
CGAAAGCATATCCAGGCAGCTAGGTCCAGCACCATTCAACATGAGTAGCC
CATCTTCCATGTTTTCCCTAATGCGAGTAAGAATGTAAGGTACTTGTCGA
GTTGATCTTATAGTCCCATATACAATCACATGGAACAACTAATGTTAAAT
CCTGCATGATTGAAACAAGCATTTGTCAAATTAGGTAAATTTGATCGAAT
TGCATGTAATAGGATGATTCAAATCCGTTTTAGTTAATGGGCTATCCACT
CAAAATCTGAGTGTACTCCTATACGGCTACGACACGCATGACACACATAA
TGCATCCTAGGGGAGAAAAACTCCTTGAGGGGATATTTCGTTCAAAGGAA
TTATGTAGGAAGTTTTCCTATAGAGTCCCTTTGTTTCAAAGGAATGAATT
CTACAAAATTTCTTTGCATTGCTTTCCTACACTATAATCCTATAGAATTT
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CCGATTCCTACATTTTTCACCCCCTGCGATTTCAAGTGCCATGCCATTCT
GTTCTGTATTTTTCCTATTTCCATGTTTCACAAATCCTTTGAATCAAACA
AGCCGCTGAGCATGTGTCCTAGTCGTCTCAGGAGCAATCCCCCTCGACCC
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TTTCCCTCGTGGTTGGGCGACATGGTCTCGAGCAGCAAAAGTGGTCAAAC
ACTAAGCGTGGTGCCATAAGTAAACTGTTATGAGGTCAATGCATGCAAAA
TCTTCAAATTTTGGTGGAGTTTGTCCAAATTTTGGTCGTGGTTGGGTGAC
ATGGAGTTTGTCCAAATAAAGAAGAAGAGAGCTGCCCAGTTAATTACGAC
AAACTACATGCTTGTCCCATGACCGCCGACCAACCGAGCCGCCGGCTCTA
CCTTCCATGCGACCGGAGACGACACCCTACTACAACGGAGCCGCTGCTCA
TGCATCCACCCCAGCCCGAGGCCATAGACCCGCCGAGCGGACGACTCTGT
CACTCAAGAAACAAGAGCAGACGCTCTACTATACAGGGAATATATAGACG
CCGCTTCGGCTACAACCTAAACAACACAGACACACGCCAAGCCAGGTCTA
GGCACCAAACCGGTTCACAGGTCACCCGTGCAACAAAACACGACATCAAC
GAAAAGAGCCACTAATTCGAACCCCACACGGACCCCGAGGTCGTGCCCCT
GCCTAAACGATGATGGAATTCTTGGCATCGTCCACCGTTACCATCTTTCG
CTTGTCACTCTGGCAAAATCACGACTCAAGGACGAAGCCTTCAAGAGGAA
GAAGCGACACCGAAATGTTGCCATCGTCTGATCGCGAGGATCTATGGTCC
CTCCGAAGTTTACTCAGGTGGGGGAGGAGAGGTTCACCTCAACGTCGACT
CCAAAAAGGAACGACGGTAGGGCATCGATGTCGTCGGTTCCAGCCAGCAC
CGGAGAGGGATACAAGGTTTGCGCAAAGATCTAGCCCGTGAGCCTACACC
CACTCCTCTACCAGACCCACCAACCTCCGCCGCATCCTCCACATGCCGAA
CCCGAGTCCGCACCAGACTGATCGATGGCTTCGCCACCCAAGTATCTAAA
ACACACACCAAAGAGATCCGCTGCTCCACCTTACATGCCGGCTAAAGGCC
ACGCACCCAAATGGATCATCGCCTCTGCCGCCAAAGCGACCAAATTAGAC
ACCCAATAGAGAAAGCGGGTGCCACTACAACTTCCACGCCGAACCGAGGC
TGTGCCCCAACCTTGCTCCTTGCCAACAAGGAAACCCAAATTGCTTGATT
TGTCACCTCCACAGCCGTGAACACCGCTCCCAGATCTAGTTGGAGCTGGG
AAGCACGCGCACAGCCATGCCTGCACTAGAGCAGGCCAACTCCGCCGCGC
TACTTCACGCCACCACCCTGCTAGGTCTATGCCACGCTGCACCTGCGCAC
CACGGCTGCTGCCAACATCAGCGCCAAGACTTCTTTCACACCATGCACGA
CTATGAAACAGCCCACGTCACGTGCCAGCCAAGCTCCTCTTGGCCACTTC
CTCCGGCGCCACGGTGCATCCCATCGAGCTGCCCCTCCTACTTGCACACA
CCTTTGTTGCTTCCTCCCCCTTGCTACGGGCAGCCACAAAGAGCCGCCTC
CATTGCCAAAACACCTCCCCCGCGTCATCTCCGCATACGGTCGGTGCTAG
AAACCACCACACGCTGGAGAAGGATCTCCGACCGCCACACCCTCGCACGC
TGGAGAAGTCCCCATTCGTTGGTTCATTTTCCACTCGTTGGCAAAGATCT
AGCTCGTGAGCCTACACCCACTCCTCTACCAGACCCACCAACCTCCGCCA
CAACCTCCACATGTCGAATCGGAGTCTTGCACCAGACTGGTCGATGGCTC
CTCCAATCAGTTATCAATTCATCATGTGATCATTTTTGATTATTGTGTTC
ATTGCACGTACATTATTACTAGTAATAACTACATATCCCGATTGACGCAG
TATCCTGGTTACCAATTGATGCACTTAACAATTCAGTTTCGATAGTACAT
TGATTCTTTCATTACTTTTTTTAGTGAGCTTATGATAAAGTAAAGGTAAA
CACTACATATCGTGGTCCGACGGAAAACAAGCCATCGGAACCTTCCAATA
CCATCCATTTACTAGTCTCCATCGAACGGCCTGACATTTCTTTTCCAGTT
TTTCTCCCGTTAACTGCGCAGATTAATTGCTATCCCAAAATTTCCGGCTA
GTTATGATACCGCCCGCTAGCCTCCCGCAAATGAATCCTCTGCTCGTCAT
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TCACTGCGTGGTGACATGCGCCTCCATCTAGATCGATTCCTGCACCGACA
CGCGACGTTTCACCATGGGGATAGTTTTTCGGGGCATCCCTGATGCGTCC
GACTGACGAGTCTACACTCTGGCAGCAAGTAATGGGTCAGAGGTTGATTT
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GCAAGCGGCTTGGGTCCTAATCTGCCCATATCTTCTCTACTTTCGAAGTT
TAAATCTGTGCAATCTCTCTCTATAATTTATCTCCTGAACATGCCTCCTT
CACTGTCAACCAGGCTTTCATGTTGCAGCGTCATTTTGTCCATGCCGCTC
CAATCCCCGGCGTAGCCGAGGAGCGGAAGGAAGCATAACCAACATCTGCC
AGAAGCACGGTCACCATCTGAATGAAGCACACGATCACCATCGGATGGAT
GTAGGCCAGAATCAGGTTGTGGCATCCGAAGGAAGCACGACACCGTCATA
TGAAGGAAGCACTGCCACCGTCTGTAAGAAGCACGATTTTACCGTCATAA
GGAAGGACGACAAAATCGAACGGTGGCGTCTGAAGGAAGCACGGCCATCA
TCTGAATGGAGTATGGCCACCATCGAAAGGAAGCAGTTTAATTCCTAGAC
TATGCAAAGCCTAACCACATACTCCTAGACGGAGTATAACACATTTTGGT
CTATGGAAGCATACATGAAGCAAATAAAGTTGTGCTTCATCCAGCGCAGG
GGCATGTGTAGCCGCATACGAGGAAGCATACAAGAAGAAAGTAGCACAAG
TAATAGTCATTTGTAATTACCTCTCATGTAAAAAAATGTTATTTCAGACT
TAAATGTTTTGTCTATAAAGCAATTTTTTCATTCGATGGTAGCAAAAGTT
TATTTCTTTCCAAGCATCGTCCCCAATTTATATGAAGCATGCATAATAAT
GAACAATTTTATTACGGTTGGAAATAATTTTATGTTCGTATGTTGGAAGC
AGTAGTAGATGGTCGATGGAAGCAATAACATCCTTCTCTGGAAACATAAA
ATATTATGTATATATCATAAAAAATTGTTTCGATTACATCTAAAATAAGT
AGTAACAAGCAACATTTTTTTCCTCATAAAATCCTATATTAGTTTCCTAA
AATAACAATGACAATTCAAATTGGAGTATTTAATTCTAGAAACCATTTAA
TTAGCGTTAGTTACTGAAATAAATGCCGAGATTTTCTGCATGCAAACTAC
TAGTCCCAAGTTTCCATCCTACGCTCAAGATGAAACAAATCATCGGCTGT
GCCGGGGTCCGATGGAAAGCTAGGATCGGAAGCCGATCCCTAGCGGTGCC
CTAAAGTAAAACTGAATTGACACTAGCGGCTAGCAAGAATTATTTTTCTA
TTATGACATACCACTCCTTAATAATTGATTGCTTTAAACTTTCTGTAGAT
TCTCTCAACTGAGGCAGATGGACATGAGATTGATATGCTCAAGGATATTG
GATTGCAAATTGTAGCAAAATGTGATGGTTTGCCTCTTATTGTCAAAGTC
ATGGGGGGACTCTTGTGTCAGAAGGACAATCAGAAGCATGACTGGGAGAT
GGTCTTGAATGATTCGATATGGTCAACATATGAAATGCCCGAAGAGCTAA
ACCATGTGTTATATTTAAGCTACGTAGATTTGCCTCCTTGCATCAAACAA
TGCTTTCTATGCTACTCCCTTCTCCCTAAAACTACATTGTTTTTTAGAGT
TGATATAATTGGCATGTGGATTAGTGAAGGATTTCTTAATGGGCCCTCAG
GTGATTTGGAAGAATTAGGAAGCAGGTACTATAAGGAGTTGATAGTGAGG
AACCTTATTGAGCCAGATTTAGTGTACATTGATCAAAGGCTTTGCAAGAT
GCATGATGTTATTCGCTCATTTGCTCAATTTGTGGCAAGAGATGAGGCAC
TAGCAGTTAATGGAGAAACCAGTATTGTTAATGAACACAGTGCACAAAAA
TTTCTTCGGTTATCTCTAGAAAGCAAAGAATCAGAATCAGATGGGTTAGA
CTGGAGTTCTTTACAACCACAGAAGGCACTGAGAACACTAATATCAGTTG
GCCAAATAAACATCAAGCCTGGTGATTCGTTGGTTCATTTTCCATGCCTA
CGGACTTTACATATAGATTCTCCAAATGTTATTGCATTAGTTGAAACTTT
GCATGAGCTCAAGCATCTGAGGTACTTGTCCTTACATAACTCTGATATAT
CTAGTCTGCCAGATAGCATTGGAAAGATGAAACTCTTGCAGCACATTAGC
CTTAGTGGATGCAAGAAATTTAAGAAACTTCCAGGTAGCATTGTAAACTC
AGAGCAGCTAAGGTATCTTGACTTCTGTGAAACAAGTATAATGGGCATTC
CCAGGGGGTTCTCTGCTCTAGCAAATCTGGTGATATTACGTGGGTTTCCT
GCCCATGTAGAGGGTGATTGGTGTAGTTTGGAAGAGTTGGGTCCTCTCAA
TCGCCTCAAGTATCTTGGTTTACATGGATTGGAGAATGTATCTGCTTCCT
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ATTCTTATCATGTGGTAGTAAATTGGGAGATGATGGTCTGATTGATAAAT
ATATAATCTTCGAGAACAAAAAACAACAAATCGAGAAGGTGTTTGATGAC
CTATGCCCTCCACCTAAGTTAGATTTTCTTGCCATCAATGGATATTTTGG
CCGACGGCTCCCGAGGTGGATGATGTCATCATCAGTTGTGCCTCTCACGA
GCTTAAGGATTCTGTTGATGGGTGACCTGGCATGCTGCACACAACTTCCT
GATGGCTTGTGTCAGCTCCCGTCTTTGGAGTCCATTCAGATCGAGCGTGC
TCCATCCATCAAGCGTATTGGACCTGAGTTCCTACATTCCTACCATGACA
TGAGTCCTTTCACGGTAGTGGCTGCGTTTCCGAGATTGCGCTACATGGAC
TTAACAGGAATGGTAGACTGGGAGGAATGGGAGTGGGAGGAGCAAGTGCA
GGCGTTCCCTGTCTTGGAGACGCTTATGCTAAAGAAATGCAAATTGAAGC
GTGTTCCTCCTGCCCTTGGCTCCCAAGTAAGGACTCTGAATGTATTATGC
ACACAACATGTCCACGGTCTTGTCTCTCTAGAGAACTTTGATTTTCTTGT
TGAGCTGCAAGTACTTTCAAACCTTGACCTGGAGAGGATCACTAATCTCC
CTAGACTGCAAAGGCTTACTATATCCACCTGTCCAAAGCTGAAGGTGGTG
GAGGGTGTTCCTGCACTGCAGAGTCTCTTTTTCGTGGACGAAGACATGGA
AACACTCCCAGAGTACATGGGAGGTATAAACCCAAGTCATTTGGAGCTAC
ATTGCAGCCTAGTGCTGCTCACTTCAATAGCCGCAGGGGAATCTGGTCCT
GAGTGGGACAAGTTCAGCCACGTTGAGCATGTCAAGGCATATGCACAGGA
AGGAGATAATCCAAGGAAATGGTATGTATTGTACACTGCTAATCCCTACA
ACTTGGAGACAAATGTCAGCCGCTCTTTCATGTCCAGAGGTAAACTAATG
GTCCTCATTCATCTTAATTTCTATGTTTACTTGGTTTATTGCTTTTGTTT
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GGTGACTACATAGATATGATTCATATGGCTAGCTTGATCACTTTGGTCAC
TTGCAAAACTTGGAAGGAGCTACCATTTAGTCTATCGTCCACTGCATCTC
CCAATAAATTCACTAGTGGCAGCTAGCGCTAAGATTCTTACCACGTTGTG
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CTTTTGTCCGACATTTTTCTAGACTCTGCCCTTTCTTCCGACTAGCTTTT
TATGTATGGCTGAAAGAAGATATGACTAGCTTCTTCTCTGAACAATTTAG
ACAACTGTCTTTTTGATGATTTTTCATGGATGCACTCATGTTACTAAATA
TGTGTTGTTCTCACTGGATAACCATGTAATTACAGATGAAAAATAATATC
TACCACTAAAGCTCTTTACCTTGCAAGTTATGGATTGTATAACCGCTTTA
CCATTTTCTTCTCATGCGGGGACCTTATCTTCTTTTGAGGATGCACAAAG
ATTTGAGTCTGTCTTTAAAATGACAAGAAAAACTTTTAAATACATTTGCA
GCTTGGTGAAGGGTCCACTAATGAATAATATGGACATCCACACCTTTGTT
AACGGGAAGGTATTGTCTTTACAAGATGAAGTAGCTGTTGCTCTCAGAAG
GTTGAATTCTAGAGGGTCGGCATGTGACTTAGGATATACCATTGGTGTGA
ACGAGTCAACCGTCTTGTCAGTAACTAAGAGGTTCAGTGATGCTTTGTTC
GTGGGAACAGGTAACCCGTGGAGTTGGCGAGTCTCCAGTAAAATAGATAA
TATAAAATCCATGTTTGCCGAGATCCACAATATGCATAACTGCTGTGGTG
TTATATGTACAACTAACATCCCATTTGGACCCGAGGATGACCATGAAAAC
AAGGACAACATTCTAATGCAAGTCATTGTTGATGCAAAGATGAGGTTCAT
GAACATTTTGTTGGTACCGGCAGGTAGCATGAACCAGTTAAGCCTTTTGC
ATGCCTGCTATCTCTTTGAGGAGTGCAACAAGGGTGCTTGGCTAAATGGG
AGCAAGCTGAAGGTAGCATTGGATGGATCAGAAGTCGGGGAATACATAAT
TGGTGATGCAGGATACCCCCTTCTCCCCTGGCTACTCACACCTTACCCGG
AAGAAAACTTCTCAGACTCTAAGAAGGAGTTCAATAGGAGACACTCCGCA
GCCACAACATGTGCGCTGAAGGCGCTGGCAAGACTCAAAGACACATGGAA
GTACCTGCAGGAAGAGAGGCCGGTCAATCAACAAACTCTAGTATACGCAA
TCTATGCCTCATGCATGCTGCATAACATAGTCATAGATATGGAGGATGAT
GCAGCCATGCAGGGGCTTGAGGAAGGGAAGTACTGCCAAGATGTGCGCCA
GTTAGCAAGTGAGGATGCTGTCAGGGCAAGGGATATGTTGGCGCAATACT
TCTTGACGAGCAGGTCATTAGAATCAGGAGGTGAATTAACATAACTTCTT
GTACATCTTAATTTGTTCATTTCTCACTATTTTAATACTGTCCGAGTTAA
ACTCTCACCTTGCTAGTTATGGATTGTGTAACCACTTTTACATTTTCTAC
TCATACAGGAACCTTGCCTTCTTTTGAAGACATGCAAAGATTTGAGTCTG
TTTTCAAAATGACAAGAAAAACCTTTAATTACATCTGCAGCTTGGTGTTT
GGGTTGTCAATGGAAGAGGTTGACAGCTACACATTTATTGACGGGAGGGT
GATGTGCTTAGAAGATCGAGTAGCCGTTGCTCTAAGAAGGTTGTACTCCA
GTGAGCCATCAGAAATCTTTGCATCCTCTGTTGGTGTGGATGAGTCAACT
ACCAAGTTGATAACTGATAGGTTCATTGCTGCTGTGTGTGCGGGAGCAAT
GCACCACATGTACTGGCCAGACTCCAGTAAAATGGATAAGATGAAATCCA
TGTTTGGTAGGATCCACAACATGCATAATTGTTGCGGTGTTGTATGTGCA
ACTCACATCCCATTTGTACCAAACTGGGAACACGAGAAGAATGACAACAT
TCTAATGCGAGCCGTAGTTGATCCAGAGATGAGGTTCATGGACATTTTGT
TGGAATGGGAAGGTAGCATGAATTGTTCTAGCATTTTGCAGGGTGCTGAA
CTCTTCAAGGAGTGTGAGAAGGGTGTTTGCCTGAATGGCAGCAAGCTGAA
GGTAGCATTAGATGGATCAGAAGTCGGGGAATACTTAATTGGTGATGCAG
GCTACCCTCTTCTCCCATGGCTACTCACACCTTACCAGAAAGAAGACCTC
TCAGACTCCAAAGCAGAGTTCAATAAGAGACACACCGCAGCCACAACCTG
CGCGACGAAGGCGCTGGCAAAGTTTCAAGAAACATGGAAATTCCTGCAGG
GGCAGACTTCGTGTCCAGTCAATGCGGAGACTCGAGCTGAGGCAATCTAT
GCCTGCTGCATGTTGCATAACATAGTCATAGATATGGAGGATGATGCATC
AATACATAGTGTCGAGGAGCTGAATTACTGTGAGGAAGTGCGCCAGTTAG
CAAGTGAGGATGCTGTCAAGGCGAGGGATATGCTGTCACAATACTTCTTG
ACCAGTAGCTCATCAAAATCAGGAGGTGAATGAACACAACTTCCTGTACA
TCTTAATTTGTTCATTTGATTTCTAACTATTTTAATACTGTCAGAGTTAA
GCTCTTGCCTTGTTACTTATGATTTTTGTAACCAATTTTAACACTTTCTA
CTCATACAGGAACCTTGTCTTCTTTTGAGGACGCGCAAATATTTGAGTCT
GTTTTCAAAATGTCAAGAAAAACCTTTAAGTACATCTGTGGCTTGGTGTT
TGGGCTATCAATGGAAGATATTAGTAGCTACACATTTATTGATGGAAGGA
TGCTTTGTTTAGAAGACCGAGTAGCCGTTGCCCTGAGAAGGCTGTACTCC
AGTGAGCCATCAGAAACCTTAGGATCCTCCTTTGGTGTGGACGAGTCAAC
CATCAAGTTGGTAACTGATAGGTTCATTGCTGCTGTGTGCCAGCGAGCAG
TGCCCCACATAATGTGGCCAGACTCTGGTAAAATGGATAAGATCAAATCC
ATGTTTGCCATGGTCCACAACATGCATAATTGTTGTGGTGTTATATGTAC
AACTCACATCCCATTTGGACCAACCTGTGACCATGAGAAGAATGACAGCA
TTCTAATGCGCGTCATCATTGATCCAGAGATGAGGTTCATGGAGGTTTTG
TTGGACTGGGAAGGTAGTATGAACTGGTCTAGCCATTTGCACGGCTTTGA
CATCTTCAAGGGGTGCAATATGGGTGTTTGCCTGAATGGCAGCAAGCTGA
AGGTAGCATTAGATGGACCAGAAGTCGGGGAATACATAATTGGTGATGCA
GGTTACCCTCTTCTCCCGTGGCTACTAACACCTTACCAGGAAGAAGACCT
CTCAGACTCCAAAGCAGAGTTCAATAGAAGACACTTCGCAGCCACAACCT
TTGCGACGAAGGCGCTGGCAAGGTTCCAAGAAACATGGAAATTCCTGCAG
GGGCAGATTTCGTATCCAGTCAATGCGGAGACTGTAGCCGAGGCAATCTA
TGCCTGCTGCATGTTGCATAACGTAGTCATAGATATGGAGAATGATGCAG
CAATGCGTAGTATTGAGGAGCTGAATTACCATGAGGAAGTGCGCCAGCTA
GCAGATGAGGATGCTGTCAGTGCAAGGGATTTGCTGTCACAATACTTCTG
GATGAGAAAGACCTTGGGTCTTACTGGCTAGCACATGAGGTGGTGTGCAA
GACAGGCAGGTTTCGAGACTCACTACTCTCACTT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.