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GrainGenes Sequence Report: AA010683

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Sequence
AA010683
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA010683
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GCAGTAGCCATCGTCGATTCCAAAGTGCTTGGTTCACAAACTTTTCCTGG
TTGGAATATTCAAGTCACACAAATTGTGCCTATTGCTTGCCTTGTTTTCT
CGTTTCAAAAAAGCCAATAGGGAAGTGTGGTTCCGACACATTTCAGTCAA
AGGATTTGATAAGTGGAAAGAAGGTCAACAACGGAAAAGATTGTATTTTT
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CGGCACATGGGGCTGCCCCCTTGCCCTCCTCTCTTCATGTGGGTGGACAC
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TCTTAAGTGTGTCACCCTACGGTTCGTGAATAATACAGACATGATCGAGA
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CATCGGTATCTCCATACCTAGTTTGATCTCGTTACTGACATGCACTCTTT
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CTAGGAACTTCCTTTTTGTTTATTAAACACACATGTATTAACGTTTCCGT
ATTAATACAATTATAGCATGCAAAATAAACATTTATCATAAACAAGGAAT
ACGATAATAACCACTTTATTATTGCCGCTCGGGCATGTTCCCTTCAGTCT
CCCACTTGCACTAGAGACAATAATCTAGTTTGAAAACTTTGCGTATTGAA
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AATCTACGGATCTGACACTTTCAGGTCCGTGTGTATTTGCATGTCTTTGC
GTCTTCACGCATCACTCATTCTCCAATGAGATGGCATTGTATAAATTTGG
TCTTTTGGTGAGACCTTTAGTTCCTTGGGGTTAAAACATGTCGATACTAT
TGTCATACAATATATCTTTAGTGTTAGCCCATTGCGAACCACACCTTAGT
TTGATAACAAACTTCTTGACACAAATTCCCTCCTCTGCTGCTACTGTAGC
AGTCATATACTTAGCCTTTTTGTTGTAGTATTCGTCACAATGTCTTAACT
ATGGATTTCAATTAAATCCATCATGGAATCTTCTTTCCATTACATTGTGC
CACCCATAGTTTAAATTGAGATAAACTTAATTTGTATCTTGTGACAAAAC
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TTCTTGTCGTTTCTATATTGAACTCCTTCAGTATCTCATATATGTACGTT
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AAATATTCGGGTTTTGCCTAAGTTTTTCATCGAAATGAAATTCTTAACCT
TTGTCAATAAAAATTACATCATTTATAATCAACAAGATGTCCTCCACATA
ATGTATTAGAAATATGTCTTAGCGCTCCCACTTAATTTCTTGCAAATGCA
AGCATCTTCATCGTCTCCTGATGAAAACTCCTTTTCATCACGGTGAAGAT
TCCAACTCCGCGATGCTTACTTCAACCGTTGAAGTTTGCATGCCCTTTTT
AGCATCCTTTGAATTAACAAAACCCTTTGGACCGTGTCATGTACACGTCC
TAGGTAACCATTCTATTAGAAGAAGTTTGTTTTGTTTATTCATCTACCAT
ATACCAAATTATATGTAGTGGTTGCTACTTTAATCCGTTCAGACTAAATA
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TAAAATACTTTACGACATGTCGAATATTTCATAGATGTGAGACATCCATG
TCTGTTTCTTTATAGATCCAAATACGACCGATAGGTTTTTACACCTTTCC
GGAGGGTCTTCCAAGTTCAAAACTTGATTTCTCGTGTATGGAACTATCAC
GGATTTTATGGCTTCAAGCCATTTGACGGAGTCAGGGCCCATCATCGCTT
CTTTGCATATAGTCGGTTCATCATTGTCAAACAATAATGATTTACTCTCA
AATCTTAATCATTTGATTGTTTATCCGACCTTCTTGGTTCAATAGGAACT
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AAGGTTCGTAAACCTTATCAAAGTTCTATTGTCCTCCCACTTAACATTTA
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GCAGAAGTCTCTAAAGCTTTAATCTTTTAAAACATAATGTCAGTTTTATA
AATAACACCTTTGATCCAACCATGTCAAACAAGGTTTTATTACAAATCTC
AAACATTCCATATTCCTATGGTGTTTCGGGATATGTAAATCTAGGTGTTT
TGCCAAACTTGTAACTCAAATAAATCCCTTTATGATAAAATCATAATTCA
TTTATTTTCTTGTTACACTTGTAACTCAAATAAATCCCTTTATGATCAAA
TCATAAATCATTTATTTTCTTGTTACAATGATTTTGCACTTCATCTTGAA
AGTCTTTGAAACGTTTTCAAAATATTTCATACTTCTTTCTCATTAAGTGA
ACATTCACTCAAATTTCTGGAGAAAGCATATGAAGTTGAAATCCATCGCT
TACGACTATACATAATGGACTACATATATCGATATGTATAAATTCCAATA
ATTTAGTCGTTTGTTCTTCTTTGGCCTTTGAAAGAAGTTTTAATTATCAC
GTGGAAAGTCTCACAAGCGTCACTTGATCAAATCAAAGACTCCAAAAATC
CATGAATATGGAGATTCTTCATGTTTTCTTTCCAATATAATTTAAACAGT
GATGTCACTTCATAAGTGATCTTTCAATCATTTGTCTTGCGACATTTTAA
CATTAGGTTTTATGGATGTGATTTCTCCAACTAGATTTGTAAATCATCCA
TCTTATATGGAATACGGTAATTATTTGAACAACTTTTGTTCTCATAATAC
CTGATTTAAATAACAATTATTAAAACAAATCTTGAAGTCAAGCTTTGATG
TCAACGAGAAATACAAACAACGGTTTGTTTGTTTTCGATGAACATCATCA
CATATTCTCTTGCTAGTTACTTAGGCCATTGTGGTTCATGAATTGCGTTG
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ATAGATTCTCTTTCAGCATTTCTTTTTCCTTTTTAAAAGAATCTATCAAC
ATTAAAAGTGGCACCATATACATGACACATAGTCCAAAGCGTGTATATTC
AAATAATAATACCTTTGGACTTGCACTTTGAATTAGATCACCATCATCAA
AATGATCGGTATTCTTTTAAAATCCATTCTTTAGTAATCTTTTAGTGTAG
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TCCAAAACCCTTTTGGATGATTAGGATGTCTAGCATCTCCAACCTTTGTA
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ATACCAACTATTAAATTTTACGGAGTAAATAGAGTTTGCTGAAAGTATGC
AATAGGACTTTAAACTTTAGATTGACACTCAACTCAATACGATACCAGTT
CGTAAAGTATATATCCAAAATTCTATAGTTCAATTATCTCAATTACAACT
ATGCATAAGGTGGTGAACGAATGCCAATGACTACAACAAATTATGCAAAT
TCACTTTGATTTAATTTATGATAAATTGAGTTCTACTAATCCAAATTAGA
AATGAACTCCCACTCAAAAACGACATCCCTCGTGTCTTTTTGGTGATTAC
ATGAACCAAATCCACTACACCAAGTCCGATCATCACGTGAGTCGGTGTAG
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TTGTTAACCTTTCGGTCCGTGTTCCGAGACCATGTCTGTACATGCTAGGC
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CGACGAAACATTGTCGGTGCATGCTTAAGGAAGAACACATTCTTATTTTG
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AATATAAGATGCTATCAAACATCACATGTTTATTAGTGGAATGATATGGT
TCCCGCATATGATCTCTATCATGTGCACCGTGGTATGATCACTATCATAC
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AGCCCAACAACAATCTAAACTAGACGCCTCTAATTTATCCATTGCAAGTT
TTACGTGGCTGGGGGCTTTCGAGATAGAACCGTTCTTACCTACGAACATG
AACCACAACGAGGATAACCAAATTGTTGACAACTCGTTGCAAATTAGATA
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GTTGCATGTCAAGCGTGGAACAGGTCTCATGTGCGAGGACATGTAAAGTT
TGTCCGGGCCGCTTCATCTCACTATGACACCAATATCCAAAGTACAACTA
AGAAGCAATAAAATGATCATCATCGCCCACATAATCATATGTGTACTACC
CGTGCAAAGTATCTACGCATAGATCTGGCTCTGATACCACTGAAGGGTTC
GCAGCATAGAAAACAAAAAATTTCCTACGATGGGAACTATGTACCAAGAT
CTATCTACTAGATACAAACAACGGGCAGATGCATATCCGTAGAGAACATA
CCCTTGAAGACCGGCAAAGCTTAACGAGTTCAACTCGTGGTTGATGTAGA
CGATCTCTTGCCGATCTCATGATCGAGACGAAGTCCTAGCGCCGCAAATC
AACAGCGCATCCGTGCTCGCACACACGTTCGAGGCACCGAGCAACCTCCG
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GCCATCGGTAACATGTATCTTGCTAGTCCGAGACCATGGGGGATAAATAC
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GGGGGGCTCCTTTTATAGGAGGAGGGGGGAACCCAAAGGGGGTGGCCGGG
GCATGGGGCTGCCCCCTTGCCCTCCCCTCTTCATGTGGGTGGACACTCCA
CTCACAAAAGTCCTTTAAATTCCCTCCACTCAAAAGTCCACTCAAATTCC
CATTAAATTTCCACCAAATTTAATGCAAACTCTCATTAAATAAAACTCTT
TTATTTTATTCAGAATTTTGTCAATTAATTTAATGACAAACATTCACAAA
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TCACCCGAAAACCCGTTTCGGTATCTAGTGAAATAAATTCCTGCGCTTGT
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TCTTAATCCCTTTGTTTCACGATATATTACATGTCCGAGATTCGATCATC
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GTTCCCGTGATATAACATTCTAATGATCAAATCACTTGCTTGCAAGCTAA
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ATGAACAAATTCCACTCTCGATCCATGGGCCTCAACATAACACTTTAGTA
GTTCTGAACCCATCTTTATAATCACCCTGTTACGGTGTGACGTTTGATGT
TATCAAGAAACTCTTCAAGTGTTAGTGATTGACATGATCTCATGGTCTAA
GGATTAGGATCACTTCGTAAGTTGTTATAGCAATATAAACTCAATGACTT
TGATCGTAATGCTATACTTCGGATGAATGTTCATCACACCATTACACTAA
TGTTGTGATCCCGTTATTGACAACATCCAATGTCCATGATCAGGAAACCT
TGATCATCTTGTTAATCAACGAGCTAGTTTATGAGAGAGGCATAACTAGG
AACTTCCTTTTTGTTTATTAAACACACATGTATTAACGTTTCCGTATTAA
TACAATTATAGCATACAAAATAAACATTTATCATAAACAAGGAATACGAT
AATAACCACTTTATTATTGCCTCTCGGGCATATTCCCTTCACTTAAGGAT
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CCCAAACAAAATGATGAGCTACTGCAAATTCAAGCCACTGAAATTGCAAA
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TATTGCTTGCTGAATTGAGAGAAGGTGGATGGGAAAGTCATATGGAAGAA
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GAGGTATGTATCTTTTCATATGTCCCTACAATTTTACACTTAATCTTTAG
ATATGTAGTAAGTTAACCACTTATAAACCTACTCATTAGGTATGTTGATG
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TGATCGATTCAGTTCTCAAGTAACCGAGCTTCTAAAACTTTGTACATCCT
TGGATCCGGGACATGATAATTTTGACAAGTCAAGGATATGCAGGCTAGTG
GAAAAATTCTATCCCGCTGATTTTTCTAGTCAAGAGAGAGATAGGCTCAA
GTGCGAGCTACCACATTTTCAGCTTGATACATCCAACCATCCAGAGATCA
AAAAGTGTAAATCACTTGCTGATTTAACAAAAGGAATCATCAAGACCGAC
AAATCATCTGATTATCCAATGGTTGAGAGATTATTACGACTAGTGGTAAC
TCTTCCGGTATCAACTGCGACAGCAGAGCGAGCATTTTCTGCTATGAAAC
TAGTCAAGACACGTCTTCGCACTAAATTGGGAAATGACTTTCTCCGTGAC
TGTGTGATAGTCTACATAGAGAGGGAAATAGCAGAAACGTTTAGTGTAGA
TGAAATTATTGAGACCTTTGATCTTGGTGCACGTAAAGCCGAATTTAAAT
TGATAGATATGTAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.