Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA028964

[Submit comment/correction]

Sequence	AA028964
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA028964
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	GTTCGTCGTCATCCGCGCGCGGCCTGCCGCTCCTGTTGTCTTCGCTCGCC ACCTCCCCATTGCCGCCCGCAACTCGCCCCGTCGCCGGAATCTGCCGCCC CCTTCGCTTTCGCCTCCCATTTCCTAATCGTCCAACCACCTCCTTCCCTC CCTCGTCATGTCCTCCCCAGAGCCCCACTCGCCACCCCCACCTGACACTC CTCCCCATTTCGCCTCCCCCCTCTTCCCACGCCGCCCCCGCCGGCACGAT GCTGCCGTCCTCTCCCGCTCCCCGCTTCCTCCTGCTCGCCGTAGTGCTTT CCTGCGCCGCGTCGTCGGTCAGCTGCTCGGGCCGGCAGTTCGGGCACCTA GACCGCGTCCGCGAGCTCCAGCAGAGGGATCGCCGGCCTCCCGCCGAGCA GGTGGACGCGGCGGTCGGGCTCCTCGCGCGCCTCCTCCCCTCCCACTCCG CCAGCTTCGAGTTCGGGGTTATCTCCACGGTACGCGTGCTTCGTTCCAGC CGAATTCTAGGGTTTTAGCGACTGCTGGAATTCGCGACGCATAAGGAGAG TAGCCGAGGGATTTAGTGTAGTGAGCAATTCGCTTGTTTCAGAAGCCAAT TCACGATGCCGTGTCACGTGGTCATGGAGCATTTGATTGATGTGGGGAGC CGGTTGTTTTGGACACCGGATGTGGTGGCAATTGAGGTTACAGGCTTAAC CGAAAACCATTGTGGGCTAGTAAATTTTGCAACTGCTATTTAGTGATTTC AAGCAGTTGTTAAAATTTAAGCCATAGACATGATTGATGTCGACCAAGCA TCATTTTGGTCTTTGACCTGGTGGATTTCTAGCTAAGTTCATAATAGGTC TGTTTTTTTAGACTCTAGTATCCGTCGACAAGGACTCACAATCTCTTCGT CTGCATGAACAATCTACAGGAGCAATGTGGCGGAAAGGCATGTTTCATCA TCAACAACCATCCTTTGTCTGATGGAGAAGGAACTCCTGAAATATTGTAC GCCTCTTCCTTTTGTTCTGAACTGGGTGAAAAATCTTTTGCATCTGTAGA ATGTTACCTTTAGCCTAATTAATATTTTTATGTAAAGGATATTGTGCATG TATCATTACTTAAGAAAATTGTATCTTGACAAAAAAATAAATGTTAGTTA TCCACTTAAGACTGATCTAAGTATCTCTCTTACTCTGCAAACAACGACTT TGAAAAACCTTCTTTTAGTTCCTATATAAGAGTTAAATTTACTCCCCATG ATATATGGGCATCGCTAATAGATATGTCATTTCACTGAACAAAACTTTCC AGTATTTAAATGTGTTCAGTTAGTAGCACTGGATTTTTGGATGTTATATT ATATATGTGTCCATAGTGATGTTGCTTTTACATATATTTTTAGACACAAG TCCTGCTAGAATTGTGTACCAGTCCTACTTGCTAATGTGAGTGGCTAGTG TATAGTTTAAAATACCAGTCTGCTATATTAAGGGTTACTTAGACATGGTA CCACATTTCTGTATGGTCTTTTTGTTGTCAACTTATGCCTCTAGTTTCTA TTGTAGTAAAATCAGACAGAAGTCATCTACATTTGTTCATGTCTTTTGGT CAGGATACTTGGAGTAAGTGGGGTAGAAATTTCTGCCGGTCTTCATTGGT ATTTGAAGCATTATTGTGCAGCACATATATCATGGGCTAAAACTGGTGGT GCGCAATTATCATCTGTTCCTTATCCTGGCTCACTACCTCGTGTTCCTGC TGGTGGGATTTTGATTCAAAGACCTGTTGACTGGAGCTACTACCAGAATG CAGTTACATCCAGTTGTAAGCTGATTTCTTATTCCGTGTACAACTTTGAT ACTTTCTCTTTTGCCATCCACTGAGCATATTTTCTAGTTACAAGCATTCG AACACTTGTGGGATTTAATTTTGAAGCTGTGTAACTGATAGAGCCTTTTG GACCCCATGACGTGGTATCCTGCTAATGTATGACTTCCCGCTACGTTAAC AGACATATGATGGATATGCTCAGCTTCTTGTACATGTCATATTATTTCCC TCTGTTATACACCATGGACTAATAGTGATGTCATTCCTTCTGCCAAGAGC TCATACTGGTTTTTGACTTTTGGCATACTTGTATACCCGTGTTCTGCTCA AGTTCTACCAGATCTTTCCCTTAAAAAAACTAATTACCAGATTTTATAAC TTTTTTTTTTACTTTTGAGTTCTTGTTGGTATTGGTTGGCATCATTTTGG GTGATGGCGATGTTGATCTTTTTGGTTGTTGAATCTGGTATTTATGATAT AGACATATCCCATGCTGACTTAAAAACAAAAAAAAAAATCTTCCGTACTG GTAATGATGTGTTTAATGATTATTTTCTTGCTTTTTAAGATTCTTTTGCT TGGTATGATTGGGAGCGTTGGGAGAAGGAGATTGACTGGATGGCTCTTCA AGGAATCAATTTACCTCTAGCTTTCACTGGGCAAGAGACTATATGGCAGA AGGTTTTTCAGGTTCGTGTGCATTTATTTTTTGAAACTGCTGTTTACTGA ATAATTTAAACCACACATCTTGCTTAACATTAAATCTTAGCAAAGAACAG CACATAATCTTAGTAGAAATATAAGCGGATGGTTGATGTAGAACAACAAA TGCTAGCATGAATACTAATCAAGAGTTAGACTGTTGAAACAATTCGGATA GGTGCCTCATCGTATTTCCAAGCATGAACCATGTTGCAATGGTGGCATAG ATGATTTAGGTCGGGTTCATGAACTTTAAAATTCTCCTTTTGTGAAGTGA GGAGGAGCTTCTGTGATCCCTGGTAGAATAAATGTTTTTTTTGCCGGAAC TGATAGAATAAATGCTCCATGTTGGCAATCTGTTGTTTAAGACAAAATTG ATTAATTTTGTGAAATACCAACGTGGCAATAATGTCCTGTGTCCATTTGT AATTGTGTTAACTCATATTTTACAAATGGTTTGCTAGTAATTCAAATTTC ATCTCCCCATACTACTTGCAGAGGTACAACATTAGTAAATCTGATTTGGA TGATTTCTTTGGTGGGCCTGCCTTTCTTTCATGGTCTCGGATGGCCAATA TGCATGGGTAAGTTAAGCGGTGTTTCATTTTTGCACGAGACCCTCCATCT AGTTTATTTAACCTTACAAAAATCTTAGTTGATCACATATTCTTGCATTA TAATCAAGACATGTTCTTTGTGTTTGAATTCTTTTCATCTTCAACTTAAG TCTGATCCCAAGTCTTCCGAAGGAAGTTATGACTTTTGCTGTCTTAACTG CTAATAAGACTCTAAAAAACCCTGCTAATAAGACATTGTTTCCTCTTTAG TACTTGTCATGGAAATGGATAATTGACAACTAGTCTATGCAGTTTTTTCC TTAACTCAAAGAACATATCATGAATGCATTAGTTATTCATGGTGGGTAGT CGACTAGTTGTAGATGGAAGCGATCATCGGTAGTAGGATGGATTTCTGAA ACTCTTCTTTTGTAAGAGTAGATATCTAGACTAAATATCGTGTGATAGCA TGATATACATTGATGTTCTGCTCTCAGTTCATCTTTTAAGCAAGAAGGAA TGCATAAATACATTGTAAAAATGATTTGGCAGATGGGGTGGGCCTCTTCC CCAGACTTGGCTTGATGATCAATTAACCCTTCAGAAGAAAATCCTTTCTA GGATGTATGCTTTTGGCATGTCCCCAGGTGACGTTATACTACAGTTTTAC TATTTGTGGGCTTATTGATTTTTCATTTACAGTTTTTTAGTCTATCCACC TCCCTTGCAGTCCTTCCAGCCTTTTCTGGTAATATCCCTGCTGCACTGAA GTCAAAATTTCCCTCAGCTAGAGTCACCCACCTTGGAGACTGGTAAGAAT GATATTCTAAGGAGAACTCGCTGAGCATATTGTTGCCATGATGAAATGCT TAAATAAAACATATCGAGCCATGTTGCAGTTCTGGACACTCCTGAATTCT CAGCAACTTTATATATCCTGTGCTACACGACTGTTGTCTTCGATGATGCT CTCACAACATACCTTATACCTTCTATTCAATTCTCTTAATGTCTTTGCAC ATCTGAGTGTGTTGGCCCTTAGGCTGTTCACTGAACCAATCTTGAATCAT TCGACACATTGTAGTTTTTTATGCCACTAGTGATCGAGACTTAGTTTCGT AGAAAGCTTATGCTCGTGTGCTCTTACATGTTGCTCATATTGGGTTCTTC ATATTAATATTTTTTGAAAATCGACTGTAAAACTTTATTGTTCAAAGTTG ACGTTGGATACTAAACTCCTAACGTATGCCAGCTATTTGCATCAACCTTA TTGGTTAGCGCGACTCAAGTAACTTTTTTTGCGAATCAAGTAATCAACTA ATGTGAAGTAAAGTGATTTATCAGATGTTCTGCAGATTTTTCTGTTGATA TAATTCTTTGTAGTTATATTTAAGCTATTTCACTTATTTTATTCTCTTTT GTGACATTAAGGTTTACAGTTGACAGCAACCCAAGGTGGTGTTGCACATA TCTTCTTGATGCATCTGATCCCTTATTTATAGAAATTGGGAAGTTGTTTA TAGAAGAACAAATCAAAGGTACGAAGGATGTCTTACTCAAAACTGAACTC CAATATGATGCATGGTATTTTCATAGGATGTCTTACTCAAAACTGGTTTT GCTTTAGAATACCAACAGATCATCCATGTAAATTTATCATGATAGTAGGG AGGACCTCTCTTTGGGCCTTTTACCTGGTTTATATGCATTTTTTTCAAAA AGAGGGCCTAACTTCTATTTAGGTGCTAGTTCCTTCTATAATAGAGTAAT TATTTACATTGTTTATTTGCTTATCAGAATAAAAATAATAATCCTTAACA CATCTGATGGGTTTTCTTGTTCTTTGCACAGAATATGGTAGGACAAGTCA TGTATACAACTGGTATGCTCCTTTTTATCATTCAAATTATTAGAAGTCCC CATTTGATGAACTCAATGCCTCATTTGGTGAAATCTTCTGTTCATCTAGT GATACTTTTGATGAGAACACCCCTCCGTTGAGTGATCCAAACTATATATC TTCTTTGGGTGCTGCAACATTCAGGGGAATGCAAAGTGGTGATGATGATG CTATTTGGTTAATGCAAGTGAGTTATTTTGAAGTGTTATACAGTTTCAGG GTTGTAGGTTATTGATGTCTTTATTGATACACTTACTTTTTTCTTCTGGT CCCTCACTCCCTCTTTAGATACACATTTTCTTTCCAGTTGGCATTTTTTT TTCTGGCTGTATGAAAGGCACTTGAATATTTAGATATGATACTCTCGCTA ACATGTATTGTCATCTACAGGGTTGGTTGTTTACTTACGATCCTTTCTGG GAACCCCCACAAATGAAGGTGCAATCTCATGAAAGCTTGATAATATGTTA AGTATTGTTAGTTTTGTTAAGCTTTTGTTTCCTGTACTTTTCTTCAAAAA TGATATGTGAACTTTGACTTGGTATGTAATCTGTATTCTTAATGCCTTAA ATATTGTACATTTTGATTTGTGTAAGCAGAACAGTCCCTCCAAAAGTTAG GAGTTAGGATGTGATATATCTAAAATGAATATTGCAACGATGTGAAGTGA TCCCATTCATTCTAAATGACACATGCCTATTGTATCCAGTAAAATATTAT AACACCAACGTTGAGCAAATTGGAGTGATTTTATGTGTAAGGTTGCTGCC TTGATACTATTCAGCTTATGCAAATTAAGAAGTCAGTGTCTGCAGTGATA TATTGTTGCTCTTGCTAGAAAAAAGGTGTTAAGGTTAGATGTAGGAGTTC AAACCTGGAAGTACAATTGATATACACTTAATTCCACAACTGGGATACTC AACAACTGTTTCTGAGAGCATAGACCATGTTTTTCTACTCATTAATTCTA GCCTTATTTACTGAAGCCTTATAAAGAAAAGGTGGCTACTGGGTACTCAT CAGCAAGTTGGCCTTTTTTTCTATTTGGCGCATCCAGTTTCTATGTTATG GGATTTATCTTTCTTTTTTCTAATACTGAATTCTTTGTTGGTTAGGCACT ACTGCATTCTGTTCCAGTTGGCCGAATGATTGTTCTTGATCTGTATGCTG AAGTGAAACCAGTATGGATCAATTCTGATCAGTTCTATGGTGTCCCCTAC ATCTGGAAAGTCATCTCTCCATTCCTGTCAACACCATCTTATATCCTTTT TCTTATTGTGATAAAGGAATTGGTGCTATCCTTTTTTTCAGGTGCATGCT TCATAATTTTGCTGCAGATTTTGAAATGTATGGTGTCTTGGATGCTGTTG CTTCTGGACCTATTGATGCTCGACTAAGTGAAAACTCCACAATGGTATGC ATCATTAGCTTAATCAGTTATTTCTGCCACTGAACTAGCAAATATTCCAT AATGCGGTTTTCTACTTCAAACACTTCCTTTTAGGTTGGAGTTGGCATGT CTATGGAAGGTATCGAACAAAATCCTATTGTTTATGACCTAATGTCAGAA ATGGCTTTTCATCACAGACAAGTGGATCTTCAGGTGAAATTTCATAAACC ATTCGGGAAGAGCTTTATATGCAATAATGTATTTGTCTTCTTTTGTAACA TGACAGTTGAATGTAATACATCATTCAGTTTCTTAGATAAATTGCATATT TTGAGTCCAGTTTTTTATACATTTTCTGCTTCATTTCTGCTTCAGAATTA GCTAGTTCGTCAGATTAGCCCATGATGTGTTTACTACTTCACTTAGCAGC AAATGTGGCGTGCTATTTGCTGTGCATTTCTGTAATTTTTGTTGCTTTGG TAGTTACCTAGCTAATGAGTTCAACCACTTTTTAGCTTGATCAGACTTTC ACTGTTTCCAGGTATGGGTTGAGACATATCCAACAAGAAGATATGGGAAA TCAGTTACGGGGTTGCAAAATGCTTGGCGTATTTTGCACCAAACTCTATA TAACTGTACAGACGGCAAAAATGTAAGTTATGATATTATATGTCCCATAG GTAGCCGCCATACCATCTATCCATTGTCCAGTGTAAGACAAGCATACTAG GATTATATGATCATGTTAACAAACTGGATCGTGTGTATTTTTACACTGCT CTGCGTCACACAGTTCTTACTCCCTCCGATTCATAATAAGTGTAGTGACA CTTATTTTGGATCGGAGATAGTAGCTTTTTTGTTTTTACCTTTTGCTAAT ACCAGTAAACATTTTCTGAAGCTTTGGTTGCATTTTCTATCGTTATTCTG CTCATAAATTTTATTATCGTAACAGGACAAAAACCGGGATGTGATAGTGG CATTCCCAGATGTTGAACCTTTTGTTATTCAAACACCAGGATTGTATACG GGCACTAGCAATATTTCGTCTCCAATGTCATCAAAGAATTATGTAGTGAA GGATGCATCTAATGATGCATATGAACAACCACATATATGGTATGATACCA TTGCCGTTATACATGCCCTAGAGCTTTTCCTTGAACATGGAGATGAGGTA TCTGACAGCAGCACCTTCAGGTGAGAGCACAGGTGCTCATATTGCTTAAT TTATGGGATAGAATAGTACTCTTTTGATGAATGTTTGAGTAATATGATAT ATTGGTCTATTTTGATTTAATTCTTATGAGTGCAAGATAAGTATGTCGTT TGCAAGCTCATGCAAGCTCAAGAAAGTGTTAGCATCTTCCATGGACTTCA TGCTAAACTGCTAATGCTAACTACTCCGAATGGCGGAAGTTAAAAACCTC AAGGACCTTTGTCCGACTCTATTTTCTTCTGGCATTCACAATCTTTGAAA GTGTAGCAGTTTTTTGTTCCTTTTGAGGAATTGCCTTTACCTGAGCTAAA TTTTTTTAAATAATATATTTTTTTTATTGAATTGCACAAATAATACACAA AACGGACAAATTGCAAATCTGTTGGTCGGTCGGCCGTTCGACAGACGACA GACTGAACGGACGAAGGCAGTGTTTCGTCCGTTGAACGGACGAAGGCAGT GTTTCGTCTGTTGAACGGCCGACCGACCAACAGATTTGCAATTTGCCCGT TTTGTGTATTATTTGTAAAATTCAATAAAAAATGTATTATTTAAATTTTT TTAGCTTTACCTGAACTAGTGATATCAACCTTATTGCTTTGTATTCAGCT AAACTAATTTGAATTGACACTAGAACATGATCTGCTTGTGATTCTGAGAT GCAATTCATTGCAGCGAGTTTGTTTTTTCATAAATGATTGAGTCATGCAT ATACATGTTTGGAGCATAAATTGGTGATGTTGGATAAGTTAATTCAATGT TACATGGATTTAACAGGTATGACCTCGTGGATTTAACTCGTCAGGCTCTG GCCAAATATGCCAACCAAATATTTGTAAAGATCATCCAAAGCTACAAATC AAACAACATAAGCCAAGTGACCACCCTTTCTGAGCGCTTCCTAAACCTTG TTAATGATCTTGATATGCTGCTAGCCTCTCATGAGGGATTTCTCCTTGGG CCATGGTTGGAAAGTGCGAAGGGCCTTGCACGAGACCAAGAACAAGAGAA ACAGGTAATGCCTTTTTCTTAGTCCGCTTAGCTTCCTTGCCCAGCCCAAG ATAGACTTGATCAAAACGAGTCAAAACTTCTCGGTAGACCCATCCTGTTC TAGATCATTATGAGCAATAGCCACAAAGCATTAAGCTTTGATCTTGTTCA TGCTAAGATATCTTATATACAAGTCTTAGCATTCCAAAAGCTCATATATT ATTGCTCATTGCTGACACCTAACTGCTTTCATTCGGGTGCAGTATGAGTG GAATGCTAGAACACAAATTACAATGTGGTTTGACAACACCGAAACAAAAG CAAGCTTGCTACGCGATTACGGTGAGGCACACACCATACCACCCACTCAC TTCGTACAGTTTCACTGTGTTTCTTTCTAACATGTTCTGATGCAGCAAAC AAGTACTGGAGTGGCCTGCTGCGAGACTACTACGGACCAAGGGCTGCCAT CTACTTCAAGTACCTGATATCGAGCCTGGAGAAGAATGAACCTTTTGCGC TGGTAGAATGGAGGAGGGAGTGGATTAGCCTCACCAACAACTGGCAGAAC GATAGGAAGGTTTTCCCGACCACAGCCACTGGAGATGCCCTACATATCTC CCGGTCGCTGTACCTAAAGTACCTGCTTGACGCTGGTTCACTTCAGGTAG AAGATCTGGATGGCTCCCTTCGGATGCCCGCAAGCTTATGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.