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GrainGenes Sequence Report: AA027113

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Sequence
AA027113
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA027113
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGAACAGAGGCGTCGGCTGTTCCTCCTACCCCTCGAAATCCCACTAAAA
CCAGCATCAAATCCATGGATTTTTAGGGGGATTTCGACCCTCCTCCTCCT
CCCCAAAGGTAAATATCCCTTGCACCTGCTAATTTTACCGGTTAATTTGT
CATTTAAGGCCAATTTCGCAAACCATAGTATGCTCCATAGTTGTAAATCC
ATGAAAATTTTGCAATCTATTTAATAGTTGGCCTCACTTAGTTGTAGATC
CATGTTTGTATGTATGTATGAATCGATGGGCATGGATCCATATGTGGAAT
ATGATGTATGCATGTATGAATGGATGGGCATGGATGCATATGGGGATTAT
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GGCATAACGAGGTGAATGATCGATAAGTTTGTAGAATTTTGTATTGAGAG
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ACCCCGGTATCTGCACAATTGCTCTGCCTATCAAATAGGATTCTGAAACA
ATTCTCGAACAGATCAGAATCAGCAGTTATGAGCTCATAACAAAGGTAAC
AACATACATGGCTGCACGGCACCTGATGTGCGGTGTTCAAGCATTTCATG
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TAAGGGACCATATGCCCAGCTCCCCTCACTGTTGCAAAAACTAACCCTCC
CGTGTATCCTTGAACATACCCTCCAACCTGCAACCGTTCATCAGTGTCAG
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CTTTGCCTGCAATCCATGAGCGCAATGGCTCCGTGACAGTGACACCGAGG
TCATGGATGGTGTACCTTGTGCCGGTGAACGGGCATATGGAGTCGAAATC
GCCGCTGAAAACATTTATTCGTTATACACTTTCTTTGTCATGTTAGAAAC
ACCATTGCAGTTCAATCGGGGATCGATATGTGTTACCTGAACAACCACAC
GGGCAGTTTGTGCTCCATTAGCCATTTGAGTGTTGGCACCATTGAAACCG
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GATCATTGAGGTAGGCCTGTACGTAATAGTCGCTGCAAGGATCATATCCC
GGTAACTGCAAAATTTGGAGCAGAAAAATCTTATTCTGAAAGCAAATATT
CAGGGTAACTGCGCCTGCTTATAATCCAGTGCTGCTCTCTTACATAGCTG
CTGGGGTAGAATGTTCCATCGGATGATTCAATGCAAACTGGTCTGTATAT
GTCGTAGGGATCAGTGTCAGCAGAATCATGGAGCACAGCATCATTGCATG
CGTCGCCATCTGACCCGTCGAATTTGCAGTTCTTGGTGGTGTTGGCCCTT
GACTCATCTGATATCACCCCATGGCTCCATAGGTAGTCATTCCTCCCCTT
TGTGTTCATGGCACCATCAAGGAACGGATTGCCAACCTAATTAACCAAGA
AGAGGGTTGTAAAAGAAACCACTGAAAGTATGCCATGACTATAAAATGTA
TATAACTGGGTAACTAATCGGGCATACCAGGATACCCTGTAGGTTTACAG
AAGTTCTTGTAACATTGTTCGTGTTGTGTCTCAAGATGGTGGCGGCGAGC
TGCGGCACATAGTGACCGCCGTAGCTCTCCCCGGAGATGTAGAAGGCTTG
GCCTTTATACTCCGGGAACCTCTCGAGCCAGTTGACGAGGAAGACAAGTG
CGTCGTCCGCCGTCCTCCGGTCTCCGCAGCTGCCGTAGTCGGAGGTCGTG
TTGGAGTAGGAGAACCTGACGCCGGCAGGCGATTCCAGGAATATCACATT
AGCCACTGCAAAATCTCACATGTGACTTACAAGAAATATGTGTACATATT
GGATCGATGGTGGTTTAGTTGCTGTGAGCATGTGCCTCACCGTTGTTCCA
AGCCTGCATGTTTCTGCTGAGAGTTTTGTTGTCCCTGTTCACGCGGAATG
GGCCCAGCTCCATCATCGCCCCGTAGCCAATCGACGAGCATCCAGGACCT
GTAAATGCATCCTCAATTAAGCATATAGATAGTAGAAAACGCAAGAGGTT
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GGAGTGGCTTCGCCGTCGGGTCGGTCGCTGCCTCAACGAAGTAGTAGAAG
AGCGCCCGGCCGTTCTTCTTGTTGACGGTCACGTATCCGCCGTACTGGCT
GAAGTTGACCACAGGCTGCCCTGGCAGCGCAGAGATCTTATCAGCGGCCT
TCAGCTTGGTCTGGTCAGAGACAGAGTACTCTGCCCTGAGGATCCTGGAA
GTAGCAGTAACTTGTACCCTCGGCTCATCTACGCTGTAGACATTGCTACT
GCTCCTTCTGTACCGGATGAACTCTCTGAGTTGAGCCTCTTGCGATGCAT
CTGCGTGCAACGCGGCCACACAGATGAGGAGGAATAGACCGAAGGTGGTG
TTCCTCATGATCTCTTCTTGTGAAATGAGTTGTAGTTGCCAGGATGATGA
AGATGGGTTGGGTTGGGGCTATATATAATGGCTGGGATTATGCGTGATGC
TTACCTCGTATTTTCTCTCACAGTTTTGGAGGTTGGTTTGCAGCAGGTGG
TAGAGCGAAAGCGAAGCTCTCACATTTTAGCGGGTGTGGCAATTATGTTG
ACTGATTTGGCTATGTTAAAATGATATATTTTTCAATAAGAAGTAATTAA
CCTACCCCTTGCCGCCCATTTAATTATGTATCAGTTGATTTATATCATGG
TCTGGTATTTTAGGAAGTTGCTTGCTTCTCAGATACTCCACATTCCAAAT
GTGTAAGGGCCGACCAAATTTTAATCCCACTTTGACCATGAGCAAAATAT
GAGTATCCCACAAAAGTAAGTCATTGGACTCTTATTGCAAAAGTGTTTGA
GTCTCACGTTACTTGAACTCATGTTCAAAGTTAGGCCCGAAGTTCAAGGA
TTTGGAAGGAGGGAGTAGAAAGCTACGCTCACACATTCTAGTCGGTGTGG
CAGTTACCTTGATCAATATCTGATTATACAGAAACGAAATTGGTTTTTAT
ACAAGGAAACTAATCAATCATTTTAAGCACGTCTATGTGTCTATCACGAG
AAATTGAGACTTTGGAAACAGGAGGTTAGAGATGGCTATGTAATATTTCC
TTTTCTTTTTCTCTAGCTCGTCCCTTGCCTTTTCCATGTCCTGTGCTGCA
ACTCATGTATCAACGTTATAATAAATTAGTTTGCGCTGCATTTCGAATGG
AGAGGCTGAGAGGTTTTATGCTCCAACAAAGTTTTAGACCTTCATTTTTT
TTTTCATATTTTTAGACCAAAATTTTATGTTCATACTCCTACCAAACTTT
TTTTCAATAAATTTTTCTGTATGGATTTTCCTGTAATTAAATAAGTAGGT
ATTGCCAAAAGGATGAAGATAGATTTGGTTGGTGTTATAATGGTTGGGCA
TAATGGAATGAGTATTTTGAGATGATTAGTCATGCCATCATGTATCGTGT
CTCCCATTTTTGGAGATTGGTTGGGAGTGGTAGAGTGGAAGCTACAGTCC
CACATTTCAGTCAGTGCACACGCTATATTGATGGATTTGGCTATGTATAG
ATGGCCCGGTTTACGATAAAAGAACAACTTAACCACCCTTTGCAGGCTAT
TTAATTCTACATCAGTTGGTTGCTACCATGGCCATTACTGCAGCTGCGGA
GTCGGACTTGATAGCCTTTTTAAGCAAAAGATATATCTGCCTGACTCTAT
CTAGATAAATAAAGTCTCAAGCCATGCTTAGTCAGCTTAGGTTGGAAGAG
TTAAACAACCACCACTTTCCATAACCCAGAGGTTAGATCTAGGTGGTAGG
AGTGGAGAGGTTTAATAACGACTACATGTAATGTCTATGTTTTTTTCTCA
CTTTATTGTGTAGCTTGTTGCTTCCTTCCTGTACTATGGCACAATTCTTA
TATCAACTTTGTAATAAATTGAATGTTAGGCATTTTTGTATGATGACGTC
GAAGAATGTTTTCTCTTCAGTTATATGAAAAAAAAATCGACCTTGGGGAA
CATTTCCATATTTAGAAACCAAAATATATATACTCCATCTAACAAGTTAC
ATCTATCTTTTCTTTCTTTAATAGTTTAGCTATGCTGATTTAGAGGTTAA
GTCCTACAAATAATTCAAAATAGAAAATGGGTCAATCCAATAGTTTTTCA
TAAGAAGTGGACTTCTTTGTGAAGATTTGTTCCAACTTATTCAAGGAAAA
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ACATTTTTTCTAGCTTGTGTGGCAATTAAGTTGACAGATTTGACTATGTT
GAAATGACACTGTTTTCAATAAAAAGTAACTAATCTACCCTTTGCAGGCT
ATTTAATTCTGTATCATGGTCGAGTATTTTATTTTTAGGAAGTTGCTTGC
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AAAGTAAACAATTGGATTCTTATTTGTAATAAGTTGCCAGTGGTATAACT
TTTGTTTTAGGTAACATACATTTTGTTACACTAGAGTTCATGTTGAAAGT
TAGGCCGAACATTCGAGGAGGCCTTTTATTTGGAGGAGGGAGTGGAAAGC
TACGGTCACACGTTCTGTGTGGGTGTGGCAGTTATGTTGATCACATAAAT
GACATTGGTTTTTATACAAGGAAACTAATTAATCATTTTTAGCATGTCTA
TGTCTGTATCATCTGGTTGTAGTTGTGATACTTTACCGGAATGGCCATTC
AACCAGGAAATTGAGCCTTTGAAAACGGAGGTTAGAGTTGGTTCCATGTT
AGCATAATCATTTCGGCATTTTTTGCATGTAGAGGTCGAATAGTGTTTTC
CCTTATATGGAAATTATCTATTGGACCTTGAATTATTTTTCCATATTTAT
AAACCAAAATTATGTGTATACTCCATACAACAAGTTACATCTATGTTTTC
CTTTTTAAATATAAATATTCTTGGAAAATAAGTAATGTGTGGTGTTCTCC
TTTATTAAATTTGGCTATGATGTTTCGTGGTTAAGTCCCAAAAATAATTC
AAAGGAGAAAGTGGATCAAACCAATAGTAGCATAAAAAGTGCCTTTTTCC
TGTAGATTTGTTCCAAAGTTATTCAAGGAAAAAAGGTGATTCTACCGTGG
CTTAACCGAACTTTACATTCGTTGGATATATGTCATCAAGTTCTATACAG
GCTTATTGAAGTTAAAAATAAAGAATAAAGCACCATCTGGCATGTAGTCC
TGGTGCTGTATGAGTTTTTTTATCAGTACATATACATACCTTGTCCATAT
ACATCTGCTACAAGAGTTGAGTATGAAGGTTCTAGTTTGATGTAATCCTA
AGCTATGATTATGGTTATGGAACGACGAGGAGTGTCAATGATGATCACCT
AGACCTATACAGTTTTTGTCTTCCCAGCAAAAGACATTGAATTTCACTTA
GATTTGGAATTGTCCTGATGATCCCGTGTTTAACAATATAAACTAATTTA
ATGCAGTTTAGTCCTATATGGCTATCGATCCATTTGGTCAGTAGGTAGAG
TCATTAATGCATCTTGCGTAGGCACGGGGTAATTTGGACTCTAGGTGATG
CCAGTTAGGGATTGTTTGGTTGCAGAGAATCCTCCTGGGATACCCGTCTA
AACCCAGGGCACAGATTCCACGGGGCAAGCTAGCCCGGGAAAAACCAGCG
GTCCATTTGGACACCCTCCTGCATCGGTGTATCACCTCGATCCGAGCTGT
TTCCACGGGAAAACGTTCCACGTCTCGAGCCGTCATAAGATCCAAAGGTT
AGAGGAGCATCCGCCTCCTCCACCACCTCCATCTCCCTGTTCTTGTTCTT
TGCTGAGATCCACATGGCACATCCACAGATGCCTTCTCCACTGTCCTCAC
CGATAGATTTTATGGCCTCAGCCCGCATATCCACAAGTCACATCGCAACT
AGCAAGATCTTTTTTTTTCTAGCAAGAAACTAGCAAGATCTATAGCGCCA
GCAGGAAAGACCTTCTAGCCAGCAAGCCATATCTATTGATTTGGTACATA
TCCAGTTCAATTTGATTGGTTTTTTGTTCAATCAGTGCACATTGTGCTTA
GCATTTACATGCCTAGTAAAATTTACGCATCTCAGCGTCTAGCTTTGTTA
CCTAGATGTAGACAAATATTCTTGGTTTGAATGAAATATTTTGCTATAAA
ATTCAGATACACGTCCATCTATGTCTGTTCATGTAACTGCACACTGAATT
TGCATCATGATGTTAGTTTTATATTGCTACAAATTTCAGATTATTGGTGC
ATATATTACTCTTTGTTTCCCTGTGCCTAAACAAATAGTTGTTCCTGTTG
TCTGTTGACGTGATGGCAATGTGGCTCTCTCCTCCTGCATCATTAATTTC
TTGTATCGATCATATTGAGGTGTTGTTAGTGCTTCTTGTTCGCTGCATAA
ATTGTACTTATGGATGGTTTGTTCGCATGACATGTCCCTTTGCCTCTACA
TACCCAAGCACTTAATTGTACTGCTTATGAATTGATTCCTTATACTCCCT
CCATCCAGAAATAAGTGATTTGAATTTATCTAGATTTGCATGTATCTGGA
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TTTTAGGACGGAGGGAGTATTTGTTATTCCTGCTAGAGCATTTGTACATG
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GCAGAGGACGTAATAACCGGAGGAACCGCTGGTGTCGTGGTGGAGACGCC
TCTGTACCCAATCGACACCATCAAGACCAAACTTCAGGTGAACCACTTGT
GCACTGAAAAGCAGTAACCAATTTTTTGTCTGAATATGTGCCCTTCAGTC
TTACATGAATGCTTAGCGGTTGCTTGTGGTCTTTGATTGTGCTCGGTTGC
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TATACAGTGTGCTGAAAAGTTACCTGGATACTTGTCTGGTAGTGCTACAA
TGCCTTGTAGTAGTCTAAACCTTAAAAAATCCTAGTTCTCTATAGCCTAT
GTTCTACTTGGGATTGCAGTATATTAATTATAAGAATAAGAATCCTGGTT
GTGCTTGAGATTGCAGTATATTAATCATATGTGCTTCAGTTAGAGATTCC
TTGTGTGCAACAACCAAACTAGCCAAAAGGGCTAGTGTCCCATCGTGGAA
GGGGATATTTTCCCATCGTGGAAGGGGGTCCCTTGTGGGCAAGGAAATCC
CCTGTGGGGTTTACTGTCAGGGTTTTCCATCCCCAACAACCAAACTAGCC
CTTAGAGATGCTACCATGGGTGTTGTTCAGTTCAGCCGATTTAGACGGCA
ATCTAGGAGTAGGATTTGTGGCACATTGCTCGTGCCATGTAATCTGTCTG
TATTTTGGTTGAGTAACTTTTATGTTGCTTTTTTAATGGATTTGTAAGAA
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GAGACCGCGTTGATTCTCTTTTTTTAAAAATAATCTACTAGTAACTTTTT
GTACATGACAAACACTCGTAATATTTTGTTCCTCAAGGGGCCAAAAAGTA
ATCTGACCGAAAAAAATCTAGACTTTTACAAATTACAGATACGCTCCATA
CATAGCTGCACGACACCCAGTGTGCAGTGCTCAAGAATTTCGTGCATAAC
TTTTACCGAGGTCCATTATTACTGTCCCTTTTCATTGATTGGAAGCATTC
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GTATGCTTGAACATACCCTCCAACCTGCGAAAATTATCAGCGTTAGCACG
AACAGACAAGTGAAAAAATAACATCCGGTCGTCACGTTTACCTCCTTGCT
TGCGGTCCATGGGCGCCATGGCTCTGTGACGGCAACACCAAGGTCGTGGA
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AAAACATGTCTTGATTTGTTACACTCTTTGGCAGATCAGTTGCTCGTAGC
CGCGGTTTAATCTGAGAAGGTGCCATGTTACCTGAACAGCCACACTGGCA
GCCCGTTCGCCATAAGAAATTTGAGCGTTAGAACCATGGACGCCGGTGAA
TCTTTCCAGTGCAAGTCCCTGCGCAAGTAGAGCATCGGTTAAGGGAAGTG
GTATGTGGACAGAATAGTTGCTGGATCATGGAAGTTTGTTTTTTGCGTGC
AATTTAGAAGTCTTACGTGCAGCCTGCCCACTTTGTCGTTCTAGTATGCA
AAACCTTTTGCACCTCGGGATCATTGAGGTAAGCGTCTACATAATAGGCG
CTGCATGGATCATACCCTGGTATCTGCACAGTTCGGAGAAGATCTTTTCT
TCTTCAGCAAATAAATACTCTAAGAAAAGTGTGTTTACGAGCATTCAGCG
TTAGTGCTATGTGAAAATATGTACTAGCTTTATCTTACATAGCGGCTCGG
GTGGTATGTTCCATCGGGTGCGTCAATGCAAACCGGGCCATAAATGTCGT
AGGGATCAGTGTTAGCGGAATCATACACGGCCATGGCATCGGTGCACGCC
TTACTGTCTGAGTCTGACAGACTGAAATTGCAACTCTTGATGATGTTAGC
GAACACCTCATCCGATATCACGGCATGGCTCCACAAAAAGTCAATCATCC
CTTTTGTGTTCATGTTATCATCAAGATATGGATTGCCAACCTATAGCAAA
GCAGAGATACACATTAGCTATATTACAAAGTTTCCACTAAAAAGATGTGA
CAACTGTTATGAAGGCGATTAACCACACGTACCAAAATACCCTGCAGATT
TAAGGAAGTTCTCGTAGCACTGTTCATGTTGTGACTCAAGATGGTGGCAG
CGAGCTGCGGCACATAGTGGCCGGCGTAGCTCTCCCCGGAGATGTAGAAG
GGGCGGCCTTTATACTCGGAGAACCTCTCGAGCCAGTTGACGAGGAAGAG
AAACGCGTCGTCCGCGGTCCTCTGGTCTCCGCTCTTGTCGTAGTCGGAAG
TCATGTTGGAGTAGGAGAACCCGACTCCGGCCGGTGAGTCCAGGAAGATG
ACATTAGCCTCTGCAAAACCTCACATCGTCATGCCACTTACAAGATGGTT
CATGTAGCCAGAAGAAACCGTTACTAGTTGGTGCGCCTCCCTCACCGTTG
TTCCAGGCGTGCTCATTTATGCTGAGAGTTTTGTTGTCTCTGTTCACGCG
GAACGGGCCCAGCTCTATCATTGCTCCATAGCCAAATGATGAGCATCCAG
GACCTGTGCATCAACAAGATATCTACTCTGGTAAATATTTGTACGAGAGA
TAACACACAAGCGCAAAGAGGACATGATGATGTGTATCTCTCTAGTATAG
CCATACCTCCATTAAGCCATAGAACTAGTGGCTTCGTCACTGCGTCAGTC
ACTGCCTCGGCGAGGTAGTAGAAGAGGGCGCGGCCGTTCTTTTCGTCGAC
GGTCACGTACCCGCTGTACTGGCCAAAGCTGACGCTGTTGGGCTGCCCAG
GCAACGCCGTGATCTTGTCAGCATCCTTCAGATTGGCCTGCTCAGTGACA
GAGTACTCTGCTCTGAGTCTACTGGTAGCAGTAGCTCCTACCATGGGCTC
ATGTGCGCTGTTGCTGCTGCTATCCATGCTGGTCCTCCTGGAGTGGATAA
ACTCTCTGAGTCGAGCCTGCTGCGATGCATCTGCACGCCACGTGGCCACA
CAGATGAGCAGAAAGAAACAGAAAGGAGTGTTCCTCATGATTTCTTTGAT
GGAGTTAGTAGCTTCTCTCATGACGACGATGATCTGAATGATGTTTATAT
AGGGGCACCAGAGGAGAATGTTTTGCATCGATCAGTTTTGGAGCGTTGAG
AGTTTCTTCTGACAATTTCAAGACAAAAAAAAAAGAAACAAGATCTATGT
GGCCGTTTCTGAATTGAGTACTGCATACGCCGGCTGTATGTTGTCGATTT
CTGTTTTGTATGCAAGAGCTTCTGATTAGGAGAGAGCACCATTTGGCCTG
CTGTCCTCGTGCTGTATGATCTGTATAAATATTCCCCCTTGGGCACATTC
TGTTGTCCTTACGTCCACTTTGGACATTACATCAGGATCTGTTCCGACTT
ATCATGGAGTGATCAGACTGATGATCACGCTGTCAGAAACCTATAGTAAG
CTAAAATAATGACCAACCCAATCATACAGCTATAATATAAGAAGAATAAC
TACTGGATCAACTAGATATTATTCTAACCACATTCTATCATGTGTTTTAT
CTCTGTCCTTGTATAAACTGGCATTGCTACGGAGGATTTTTTTTTTCGAA
AGGGCAAAATAGCCTGGCATCTGGATCAACTGATGCATATAGCATTTATT
ATATTATTACGAAGTACCAGAATTATTACACCCAGTCGTATTTGAACTAT
CTTTCATATGGATTCCGTTTAGCCTATTCTCAAAGAGGTTGGTGCTATTT
ATAATTGGATGTGGTATTGTTTCTTAGTAGAAACCTTGAAATTTGATCTC
CATATGTTTAAGAGTGTTTGCTGATATGTTAGTTTCATTTGCTGACATGG
GGAGCCCATTGTTTTGAAAAAAAAACATGCAGAATGGTAGACCAGAGAGA
TTTAGTTTTCATCATTCTGCTCATAATAGCACGGTTTCAGGAAAAATAGG
GTATCACTAAAATTCAAAGATGCTCATCCGGCACAAGCCATGACGTGGTA
CGCACTTTATTCTTTTCAATGTTAACATCATTGCAATTAATTTCAGCACA
GAAGTGCTAAACCGTAAGACCATAGCTGCATGTAAATAAGAAACTCTTTA
TTGAAAGGAAGAGGGAGTCAATCCACTATTCCAATGAGAGCACACCGTGA
ACATGTGAATGCATTCTCATTTCAGTTTGGGATGCTATCAGGTGGGAGCA
TGCTCTTCAGAAAGGAGTAGAGAAGAACAAGCACTCTCTTGGGCTGGAAA
GTGGGGACTGTGTGGCCAGCTCCCCTCACCGATGCGAATGTGAAGCCTCC
CTTGTACTGTTGGACGTAGCCTCCAACCTGCAGCCACCAGTACTATCCGA
TTTAATTTCCAAAACTTAAAATCGCATCTGAATTTGAACTAACTCTTTGC
TACTTTCCATGTCTGCAGTACAAGCATTAATAACTTACCTCGCTGTCTGG
GGTGTACCAGGGGCGCCATGGTTTGGTGACGGGCAGGTTGAGATCTCTGG
CGGAGTACCTTGTCGCCGCGATCGAACATACAGAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.