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GrainGenes Sequence Report: AA036279

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Sequence
AA036279
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA036279
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGGAGAGCAACGGCCTCCTCCCGGAAGAAGAGGAGTACGCCTACTTCGA
CGACCCCGAGGAGGGCTTCCTCCCGGCCGCCGGCGTCGCGAGCAAGCCGC
AGGCCCCGCCGCAGGAGGCCGCCGCTTTCCCTGCAAATCCCGCAGGTACG
CATCGCTCTCCAGCTCGACGAATCACAAATCTAAGCCTGGATTGGCTCGA
TGCTGAATCAGTCGGCCAAATTGTGTACGAAGAGGAAGTGTCGGAAGCAA
ATCTGAAGCGGCCTCCTCCCCCGCCTCCACCGGAGCAGGAGGAGGAGAGG
AGCAAGAGGAGGAACGTGGGCCTGGAGGATTCGGTGGACGAAGACTGGCT
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AGCTATTATGCCTGAGTAAGGGCCTGACTAAGGCATTGTTATGTTTGCTA
CTAGTGTCATGTTAACTGCTGCAATTCTAGGCAACAAGTAGAACTATCTT
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GGCCGACCTTGTTCAGGTACTTCTATGGTTGAAACAATGGGACTCCTGTG
TGTTTGGTTCCCATATTCGGGCTACAAGTGATGATACTTTATCTGCCTTA
CGTCGGCATTCTTGTGCCATCCAAAAGAACTCAAGTAACAGAAGTTTCTT
TTCCAAGATGAAGGGAGGCTATGTCACGAGTCAAGATAGCATGCCCCAAA
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CCTTCTGTCGATAATGCGCCAGAACAAAAGGTGGGTTGGTACCAGTTATT
TCAGTTGTGTTTTGTGTAATTGCTGCAGGATGTGTCTGTACTAAGATGTT
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TTATGTGGTCCGGCTGGCCTTGGGAAGACAACACTTGCTCATGTGGCAGC
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TATATGATTAGTGTATCAGATATATGCATAATTGCACTGCTTAGTCACTC
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TGCCCTTTAGCAACATTCCTCCAAACTCCATTTTAATATTGCTTCTTGTT
AGTTATTGTTGCGTAGCTTGCTATTGGTCTATAGTCCGGCCCTCAGCTGC
TTATCGCTACCTGACTACAAACTCTGTACATTGCTTATGTTAAATACTGC
ATACATGTAGATAAATGCCAGTGATGATCGTTCTGCTTCATCCATTGAAC
CAAAAATTCTTGATGTAGTTCAGATGAACTCTATCATGTCAGATTCTAAA
CCCAAGTGTCTGGTGAGTTAAGCTATGCTATCAGACTGTTAAATTACTTT
CCCCACATTCTGTTAAGTTATGTTGACTTGTATAGGTAATTGATGAAATT
GATGGAGCGCTTGGTGATGGAAAAGGGGCCGTTGAGGTTATTTTAAAGAT
GGTAAGTTGGCAACGTCCTAGTCCTCACTCATACAATGATTTTTCATCAT
TTTTATTTTATCTCATTTTTACTCGTTCCCCCTTTTGAACATTAATTCCC
TCCTTTTTTTTCCATAAAAGGATATTCTGAGTTGTTGTGTAGTTGAGAAC
CTAGAAAGGCTATTCTCCGCAATAATAATGCATTTCTGTGATTCATGGAC
CATTAAGTTTTTTCGGTGCAGATCAATGCTGAAAAGAGCAAAAATTCTGA
CACAAGTACCAATACTGATGAAACTCCAGTACAAAAGGCTTCTTCAAGGA
AAGGTCATAAAATAGCAAAATTGTTGAGGCCTGTAAGCAATGATGTTGTG
CTGTCACTTGCCATCATTTTCAATTTTAGTGCCTTCATAGAGAATTAAAT
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CAGCCTTGAGAAAACTACGCCAAGTAGCCAAGTAATGTTTTCTTCTCCGT
AAATTCTTTTATTTTTGTGCAGGCCTTAAATTGCTTAAACTTATAAGGAT
TTGTGTAACTTTACAGGGTTCATATTTTTGTGCAACCAACAATTAGTCGT
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AAGCACATATGCAAAAAGGAAGGATTCAAGACAAGTTCAATTGCCCTTTC
TGCCTTAGCGGATTATACCGGTACATTTTCTTTTGCCCCATTCAAGCCAG
AAGTATGCTTAATATTTGTGCATAATTATATGTCTATTTTTCCTATAACA
ATAGCAGAACGAAGGTACTGTAGTTAGTTAATGCACATGTGATATCTCCG
TCACTGCTAGTACTTGTAGTTCTAGAGTCTTCTTCCTATGTTTAAACAAA
GTGATAGTTCTGGACTCCTAGAAATATCTGTTGAGCAAAATTTACCAGAT
TTTCGGCCAACCAAACACCTGTAGTGTATATCTCATTAATTAGTTTAATT
GTGTACCAAAACACTCAACATATGACATAACTGTTAGTATCTTTGTTTAC
TTTGAACTTCCTATATTGTGTGTTCAGATTAACTGGATAGCTATATCCTA
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CTAAAATATCCTTATACGCTGACATACTTTGGGATGCCTGTTTTTATGCT
TCCCAGATACGCATGATCCTCACTGTAGTTTATGTAAATTGACTCCGCGC
TATGCTGGCTGGCTAATGCTTTTGTCTTGGAACTGGAACCTGTTATTTTG
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TGAGGGAGTACCGGAGTATTGTTTTATTTGATGACATGACTGGTTAGCTC
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ACATTGTAAGTGAGCTGATTGAGATAGCCACCTGTTGGCTGATGCTACTG
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CTTTGATGTTTGGAAACAGGTCTGATGTTTTCTTACTTTAATGCCTTCTC
TGTATCTTGTTTATTTGATTTGCTGCGGATACCATCATTGGCAATCGATA
AACGTATCCTGGTACGGAAATGAGTGCAAAGCCTAAGTTCACAAGGCAAT
CCACGTCAGAGATTGCTGCTAGCAATGTTTCATGCAAAAAATAATTTCGC
TCATTTTTCAATTTTTCATATAGCAAGTTTGCTTCACAGGTTCTTCAGAA
GAAAAAACCCAAGCGGGCAGAAATGGCTGATAGTCATGTGAGTGGAGACA
AGGACATTGGTTCTCTCTTCTCACTCATATCTAACCGGTAAACTTTATTT
TTGTCTACTCCAAACTTTGTTTGTACATGAACTTGCTTCACTTTCTTATT
ATGTAATATTGCACTTGCAGTGGTGACTATGATGTTACTATGGATGGGAT
TCACGAAAACCTCTTAAGACTCTCTTACCATGACCCAATGTTGCAAAAGA
CGGTATTAATTCTAACTAATCATACACTGCGTTTGATTTTTTTACTCTTC
ATGCACCCACACTTCAAATTAAGTAGAGGCTAGGATGGATCCTTAATATG
TGGACCTTGTGCATCCAACATCGCGCCTTCTCAGGGAGAGCTCATTGATT
TCTTGCTTTTGTAATATATTGCGAACTTACTGTAGCTCAAACCACCTTAG
GTGAAATGCCTTGATGTACTTGGAGTTTCTGATTCTTTGACGCAATATGT
TTACCGAACACAGCATATGTCAATCCAAGGTACTATGTGACTGTTTATTA
CCTTCTTTTTGTATAAATACTGGACTAACTTAAATAGTTTATCTCTATAC
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GGCAAAACCGAATGTCACCGCTCATATCAAGGCACCTGTCCGTGGAATCT
TTTGTTGAAGATATTGCTTCCCCCTTTTTACATATTCTTTCCCCATTGAG
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CTATCTTTGCACCGCCCTTACAAAAAATATTATACAAATTACCCAAAAGT
GAAAAATGTTTGAATTGGTGTCAATATGTGTACATGGCTACTTTTGGACT
TGGAATATGTGGAGGGTTAGATGTTGGAGTTGAACACACGTAACCTGGGC
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GTAGGCTAAACCCAAAATCACGAAGGAGATGGTCTGGGTGCTGTGGCAGG
ACTGACAGACGGGTCATGGTATGGTGGCCGAGATGTGTCTGCTGGTCTCG
GTGGTCTTGTCACCGATTGTACTATCTTGATTTAGTACATGGGCAGGAGT
GCCCGTGGTCAAGCACTGGAGATGTAGGCGTTGATTGCTCAACCTCGTTA
ACAAATTTCATCTCAGTCTACTTTCTACAGTGGTCTAATTGCACAAAACT
CTTAACAAAAATGAACCTACCTAAAACAAATTTATCAAGCAAGAAAGGAG
TCGAACTTCCTGGAAGGACCCTATGTTAATCCAATTTTACTACGGAGTAG
TTTGGAACCTGCGGATTTCCATGTCATTTTTTCGAGAAAACGCAAAAGCT
TTGGATAGTAAAAAAGGGTTCAGTCAAGCCTGGAGGGGCCACACCCAAGA
ATACAACAGGAAATAAATCCTAAAAGTTAGGCTGCCTGCAACAAAGCAGG
AAGTCACGCTCCCAACACTGCCCACTATCCGGCCTCCTCCTTGTTTGTGT
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ACAGTGCATAATCTATTCAGGTGGCACTGAATTTGCAGTCAGAGAGGGCA
AAAAATGAACTCATGCAGCTGGTTGATACTATGGTTTCTTACTCGGTTAC
ATATAGAAACACAAAGTTTGAACCTCAAGAAAGAGCAAATGGATATTCTG
TGCCAACTGATATTCCTTCACTCTCTCTTGACCCTCCTATCAGTGATATC
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CTTCTCTTTTCTCACTGCTTGACAAAGCTGCTGATGTCAGGGCTATCAGT
CCGAGCACATTGGTCTCTCTTTGGCTGTGAAACAGGTCTTGGTGCATGAG
GTTAGTAGTACTAAACTTCTATGCGTTGAACCCTTTAGTCCTGTATCTTG
CTTGTGCTTAAGTAACTTCTTTGACCTGATATTAACAGTATTTTGTTTCT
ATGCAACACTTTCCAGCTTACAGTTTGTTGTTCATAATTTCCTGGCAAAC
TATATTGAACCTGTATGCATGAACTCTGGCCAGACCATGTTGTGTTACTA
TACATTACTTGAAAAACTGATTGCAACCATATGACATTGAGTTAGTATGT
TATCTGCAGTGTAATGTATGTGAACGGCCTGATTTCAAATGTCAGCCGCT
ATACAGCAGCTGTTTTGATTGTTTCTAGATCCATGACTTGCTTTCTTTTG
GGGGACCAGACTTTAGACTCTAGTGTCTGTTATATAATTTAGGGAAATCC
ATTTTGAACCCTAAACTATTGTACTTGGTCAACCCTAAACTACAAAACAA
TTTATATTAAATCCTGAACTTTCTAAAATCATTTAAAATGAACCCTAGAA
TGGTTTTATATTTAAGACTTTCAGAAAATATGTGCAAGATGATAACCCTG
CAGAATTCATCAAAAATGTATATCTATGTCGACGACAAAGCCATTTATCT
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TCTGGCTCTCACTTTATAGCATTCTCCACACCCACCGGACTGTTTTAGGT
ATTTTTAGAATGTCAGAAATGAAATCACTCTCCAGACCTTTACCCTGGTT
ATTTAGGGTGGTTTCACAAAGTTTGTGAAAAAAAATCGTGCATGCAGGGG
AGCCTATGGATTGAAAACCTGCAAAAAATCATCAAAATATGACAAATGTA
CGGAAAGAGACAAGATGACTATTTATCTTGTTATTTTTTGCACATCACAC
AATTAGTGATATTTTGTGATGAAATTTGCATGTTATATATTCCTAGCACT
TGTACATCTGTGAGTGTCTTCACATTTTTTGAAGCGCCCAAAATGCAAAA
CCACTAGCCAAAAACAGGGCTAAGGTTCAAGTTGAATGGTTTAATAATGT
CCTGGGCTGGTTCAATTTGGACCAGGCACCATAGTTGATGGCATAAAATG
GACTCAACTTTAACTGTACTCCACAGTTACATATTGTTGTAACTCCTATA
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CACATGAGGAACACAAAAGGAGATTATGCTATTGTTCATGTTAACATCTG
TTGTTCTCTTGCAGGTAGAGAAGCAAAAGATCATCAAAGATAGCGGGGGA
AAATTGTTGAACCAAACTAGTGAAGGACTTAGTAGTGAAGTTTCAACAGT
TACATGCCAGGAAGCAGCAGCTGTTACCGCATTGGATTATTCCAAGGGTA
GCTCTAAGCTTAAATCAGCTACACTTCCAATGCAGTTAAACTCAGCGTCT
AGTTTGAGGGGTAAAGACATGGCACCTGCAAAGAAACTCTCAAGTCGCCC
AACTGATTTCTTTCAGAGGTAATGCAGCAGTTATAATTATTTTCAAACAC
CACTGCAATTGCAAGGCATTGACCACCTGTTTTCCTCGACAAAAAACAGC
TTCAGGAAAGAAAGACCAGCAGGTGCAAAGACTCATAATGATGCAGCGTG
GCAAGGGGCAACAGTTCAGAGGGACTTGCGCCCTCTGATCTTCAAATACA
ATGAGGTTTGTGTGTTTTTCATACCATGATTTCTGAAGTGATATAAACTT
TGACCAGTCTATAATCATCTGTGTGCTCATTATTATAAATTTGAAAACAA
TGGCAATCTTGTAAAAGAATATAAACTATAATATTGTAAACTATCGTTGG
CCGTTTGTCCTATAGAAGTACCACATCATGTTTTATTTTTGTATAGAGGC
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ATTCCCTGTTTGTGAACTGATCCTGTGTGATTTAGTTTTTGACAAATTAC
CCGGTTACTTTTATGTCTTGGCTCTGTAGTTCTTTGGAACAGATTGATCT
TGGACCCTTAAATGCTTCTCGTTGTAGGGTCACCATTATCTCATGAATGT
GATTCTTTGCAGGGCTACACGAATGCCGTTAAAAGACCAGTGAAAGTCCG
CGACCTTCTGCTCTAGCTAGGTGCTTTTGACCTGCAATTTGTCATGTAAA
GTAATGTTTTCTTCTATATTAACTGTCATTTATTTTTGACTAATATACTA
ATCTACTAGTTGGATCTTTCTTGAAAGAAACATTCGGTACTGTCTTACAA
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CTTGTGGAAAAAAGATGCTGACATGATCTTGATTTAAGGGGTTAGTCTGT
TGTGCTATGTTCATTCTACAGTTAAGAAAACAGTCCACCTACAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.