Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA044525

[Submit comment/correction]

Sequence	AA044525
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA044525
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGGCCGTGTCACGGTGGACGGCGTGGGTGGCGGCGGGACTCCTGGCGCG TCTGCTCATGATCGCCGTCCTGCTCATGTCCGTGCGCTTCCTCCTGGCCA ACCACACCGACGTCGAGCTCACCGACAACGACTTCTACAAGCTCCAGACG TACCCGTACGTGGTCGCGTCGGGAATGCTGGGGGTGGCCGGGAGCGTGCT GCAGATACCCGTCGCCGTCTACCTCGTGTGCAAGAGCAAGAGGATGGCCA CCAGCCCCATGATCCTCGACATCAGCATGGGCGCAGACATGGTACGTATC AGAACGCACATCGTACGTGAGTACGTAGTAATAAGCTAGGCTGGACCGAT GTAAATTTCTATCTGCACGACGGATGCAGGTGGTCAGCCTCGTGCTGACG AGCGGCGTCAGCGCCGGGTTCGGCGCCACCAACGACGTCCTGCGGTACGT CCGCGGCGTCAGGTGGGATGACCCGCAGGTGAAGAAGATTCTCGAGGACT ACTACGACAGGGCCATCGTCGCCCTCATCTTCCTCCTCGTCGGCATGCTC CTCTCCATCTGCGCCACGGCCGTCTCGGCCAGGCTCCGATCCAAGGCCAT AAACGAACGTCAGTTCGACGGTGCCGCCTGACCTACTCCCAGTCCAGACC ACCAGAATTAATGATGCAGTTTCCCTTGTCTCGGCACCGATCGAATTGTA GCTTCTTCTTTCATTGCCAAAAAATTATACTAGCGGATTTGCTATTTTAA CATTGTACCTGAGGAATTACCATTCCCATTCGTTGGTATCTTTGGTTGAT TCTGAATCATCTAACGGGAATTGTGGTACGGTGTTTGCATAACTACAAGA GGAAACTAGATAAGCAGTGGAAACTACCATTCATGTTCAATCAGGAATTT GTTTTTTTTTTCATAAAGAGGATTTTTGTGTATTGAAAAGATAAAGAGTC TTGTCTGTTGAAGTATGATTCAAATGCATTAAGGGGGCTAATTTCTAACG AGCGGAGTGAGGACCGAAGCCCCCCCTCCCTCTCGCGCGGTACCGTTCTC CACCGCTATATATACCTCTTATAAGTCGCCGACCAGGATAAATTGCATCT GTGAAAATCACTGGCGTTTGTAAACATTTCTCGATATAATAAAGTTTGGT TGGCTGGTGCCCATGATTTTTTTCTCTCTTTTTTGAAGAGGTTTTTCCAC GTTAAATCTATGTCCCCTTACTGTGATTTTCTTTTTGTTCTATTTGCTTG TCGCGATTATAACATTGTCTTTGCAAGATAAGAATCTGGATAAGCACCCT ATGATAATTCCATCTCATATATAATTTGAGGAAAGAGCTTCCACTTGTGT GATGTCTAAAATATTGTTCGAGGGGATCTCTCTCCCATTGGATACCGAAA TAAAATGTCTTCAAGAGAGAGTTTTCTGTGAGGAGGCACAATGCCGAGCA ACCTAGTCGGGCTTGAGGTCACGTTTTTTCACGAGATTATGGATCTCTCA CTTGGATGAGTTGTGCCAAAACCCTGTTCAAAATAATGGATCTCTCACTT GGATGAAGTGTTTTATCTCTTGTATGAAGTTTAACTAGATTTAATGAAAA ATGTGTCAATATCTACAACATCAAATCCATGTAGCATGAAAACATATCGT ATGATGAATCAATAAAGCTAAATCGGTGTTGTTATTTTCTTTCTGTTACT TTGGTCAATCTTAAAATTGTGTTAGTGCTTGACATCTAGCGATAAGATTG TTGTGTACAACCTTTATGGGGCTGACAATTCTACTCGTTGCTCGGCGCTT TTTATTTGTTGTATTTTCTCATGTCTCCAGCTTTGCGTGTGTTCTCATCG ATCATTCGCTTACCATTTACCGATGCCATTCGGAGTTTGGGACAGAGCTG TACATTTAGTTCCTTGTTCCTGTCTTTATCCCAGTATATTTATCAATTTT GTTTTTTCTACAACTAGCATAGCACTCCACCTAGACACACTACAGGACGC GCGCGCTACGCCGAGGGCAAAAAGCCGTCGGCGTAGGCTAAAATGCCCTC GGCGTATGCTACGCCGACGGCTGCCCTCGGCGTAGCCTCCTCGGCAAAGG GCTCCCTCGGCGGAGCACATAAAGGCCGTCGGCGTATCAAAATGCCGTCG GCGTATGCGTAGCGGCCATCGGCATAGCTTGTCGACAGGTTGCAAAAATA TTTTAAAAAAAAAAAATTAAAATTTTTATTTTATTTTTTTTCTCAATTTT TGAATCTTTGAATTGTTTGACTCGTTAATCTCTCACTTTGAACATTTTAA CACTAATTACACTTAATATTTAATTAAATTGCAATCTTGGTCGAATTTCT TGGAAGGTCACCCATCCTAATACTACTCCAGCTCCAGCACGCTTAACTTC CTCGTTCCTTCAGAATCTGTTTCTGCAAAGTAATTCATACATTGTTGTCA ATACTATGATATCAATCCTATTAACCCTTATATCAACATGTCACATGTTT GTATTTTTTGAAATTACAAACAATTATTTAAATAAGCATTAATGAATAGG TAAAATATTATTCAATTCAAATAAAAATATAATAATTTTACTTTTTTGTA TTTTTCTATTTAATATGGAATAATTAATATCTTTAAATCTATAAATCGGA ATTTAATAAATAATATGTCTAACTTGATCAGAAAAATGAGAGGAATCCAA ATATGATATCCATATCAACTAATCACAAACCCTCCGTTTTTGAATTATCT ATTTGGTGGTTGCTTTAGAAAATTCCCTTTTTGCGCTCGGATAATGAAAA ATGGCTTTTTGGTGCGATGAAAGAAAAACTTGCATTGAATCTTTGATAAA ATAGCATATTATGAACCTAAAAATGATTTTTGTAAAAAAACATGAGCATC GTATCATGTACATGTAGTTCATATCTGACCCACTTCCTACCGATTCGGCA TGAATTTGTCTTTTTCACCAAAGGTGGATGGAAAGGTTTCGGAACTCCCT GTTGGGACATTGTCCATATAAGGTGGTATAGTATTTTAGTAAAATATGGT GGTAGTATTTTGAATTAGCCATTTGGTGGTTGCTTCACAAAATCGTCCGT TTTTTATGCTCGGAAAATGGGAAATGGCTTTTTGGTACGACGAAAAGGAA AACTTCCTCCTGAAACATTGTTCGCCATCCCATGATGCATGTGTATGCAC AATATGGGCACATTATCACAAACTATGCCTTGATTCTAGCCATAACATTG GTCATTTGACCAGAAAGCCAAGAAACCTCGAATGAGATAGGTCATTTTGT GAAGGTTTTTTTGACACATAATCAATATATCAAGTTTAATATTTTTACTT ATAACTATGTCACATAATATGACACCACGCGACGGTTTCGCATTGTTTCG ATCGTTTTTGAACTTTTTATGCCCGTTTTAAACTATCGTCAAACTTTGTC GAACGGCGGGCATGAAGATTCTTAACTCGGGGCCGAGCCTCGCTAAACTT GCATTGGATCTTTGATAAAATAGCATATTGTGAACCTAAAAATGATTTTT GTAAAAAAACATGAGAATCGTATCATGTACATGTAGTTCATATCTGACCC ACTTCCTACCAATTCGGCAGGAATTTGTCCTTTTCACCAAAGGTGGATGG AAAGGTTTCGGAACCCCCTGTTGGGACATTGTCCATATAAGGTGGTATAG TATTTTTGTAAAATTTGGTGGTAGCATTTTGAATTAGCCATTTGGTGGTT GCTTCACAAAATCATCCGTTTTTTATGCTCGGAAAATGGGAAATGGCTTT TTGGTACGACGAAAAGGAAAACTTCCTCCTGCAACATTGTTCGCCATTCC ATGATGCATGTGTATGCACAATATGGGCACATTATCACAAACTATGCCTT GATTCTAGCCATAACATTGGTCATTTGACCCGAAAGCCAAGAAACCTCGA ATGAGATAGGTCATTTTGTGAAGGTTTTTTGACACATAACCAATATATCA AGTTTAATATTTTTACTTATAACTATGTCACATAATATGACACCACGCGA AGGTTTCGCATTGTTTCGATCGTTTGTGAATTTTTTATGCCCGTTTTATA CTATCGTCAAACTTTGTCGAACGGCGGGCACGAAGATTCTTAGCTCGGGG CCGAGCCTCGCTAAACTTGCATTGGATCTTTGATAAAATAGCATATTGTG AACCTAAAAATGATTTTTGTAAAAAAACATGACCATCGGATCATGTACCT GTAGTTCATATCTGACCCACTTCCTACCGATTCGGCAGAAATTTGTCTTT TTCACCAAAGGTGGATGGAAAGGTTTCGGAACTCCCTGTTGGGACATTGT CCATATAAGGTGGTATAGTATTTTAGTAAAATATGGTGGTAGTATTTTGA ATTAGCCATTTGGTGGTTGCTTCACAAAATCGTCCGTTTTTTATGCTCGG AAAATGGGAAATGGCTTTTTGGTACGACGAAAAGGAAAACTTCCTTCTGA AACATTGTTCGCCATCCCATGATGCATGTGTATGCACAATATGGGCACAT TATCACAAACTATGTCTTGATTCTAGCCATAACATTGGTCATTTGACCCG AAAGCCAAGAAACCTCGAATGAGATAGGTCATTTTGTGAAGGTTTTTTGA CACATAATCAATATATCAAGTTTAATATTTTTACTTATAACTATGTCACA TAATATGACACCACGCGAAGGTTTCGCATTGTTTCGATCGTTTGTGAATT TTTTATGCCCGTTTTATACTATCGTCAAACTTTGTCGAACGGCGGGCATC AAGATTCTTAGCTCGGGGCCGAGCCTCGCTAAACTTGCATTGGATCTTTG ATAAAATAGCATATTGTGAACCTAAAAATGATTTTTGTAAAAAAAACATG ACCATCGGATCATGTACCTGTAGTTCATATCTGACCCACTTCTTGCCGAT TCGGCAGGAATTTGTCTTTTTCACCAGAGGTGGACGGAAAGGTTTCGGAA TTCCCTATTGGGACATTGTCTATATAAGGTGGTATAGTATTTTTGTAAAA TGTGGTGGTACCATTTTGAATTAGCCATTTGGTGGTTGCTTTACAAAATC GTCCGTTTTTTGTGCTCAGAAAATGGGAAATGGCTTTTTGGTGCGACGAA AAGGAAAACTTTGTCCTGCAACATTGTTCGCCATCCCATGATGCATGTGT ATGCACAATATGGGCACATTATCACAAACTATGCCTTGATTCTAGCCATA ACATTGGTCATTTGACCCGAAAGCCAAGAAACCTCGAATGAGATAGGTCA TTTTGTGAAGGTTTCTTTGAGACATAATCAATATACCAAGTTTGATATTT TTCCTTCTAACTATGTCACATAATATAATACCACGCGAAGGTTTCGCATT GTTTCGATCATTTTTGAATTTTTTATGCCCGTTTTAAACTATATATAATG TCTTATGTTTTACTTAATTTTTATTTATAAATATGTAATATTTGAGTGTA GATAGATAGGTCTTATTTTTCTGCAAATTTTGATATATTATTTGTATTTT TCTCAATTAGAATGATTTAGTTATGATTTTTCAAAGTTTAATGAGATAAA ATAAAAAATAGCTATGCCGAGGACAGCCGTCGGCGTAGCATAGAATATGC CGAGGGCAATTCTACGCCGACGGCTGCTTGGCGGAGTTGGCCTAAACGAT GGCTACGCCGACGGTCCCGATGTTTGGCCGTCGGCGTAGCGACTGGCGTC GGCGTAGCTTCCCTTTCCTGTAGTGACACAACGCGGAGACACGAAGACAG AACCAAAATTAAACCCTTAAATTAACAGGGTAATTAATTGTTCGGTCATC ACTGGACATTTTTGCCGCCGTCGCACGCACTGTAAGCTTCCTAGCAACAC ACACGTTCCTTTCTTTGGGAGCTAGCATGCACCTTGCCGTGTCCGCACCA GCTGGTTCTCACTTTCAAGGAAATTCCATGAGTGATGTCATAATTTCAGT TGTTTCATTCTAGTAGTAAGTGCCAAAATTATTAATTACTTTTTTACCAA AACATTTCAGTGACACGTGAAATCAAGCAAATTAAAATAATATCTGAAGA TTTTACCAACATTCTGCAGGCAATTAGGGATGGGTACTTAGGTTTCAGTC AATCTCTCAGGTCACAGTGTTTTCAGTGGCTGTTGAAATGTTTCCAAACG ACCAACCGGGTACGGTGACCCTTCAGCGTTCGTGCCTAGGCGGACGTTTC GACGACAAATGGCGAGGAGTAGGCATCTGGCGTACCGGGGGTAGAGTGAA TACAAGCTTCAAGCCACGCCCCAGCGGCGGCTGTCTCTGTCCCTTGTCTC CCCAATGCAAGGCCGGCTAGGTTATGAACCAAAATAGAAACTACAAATAC CATACTCGGCGGGTGAGCGATCTAGGGTGATCTAAGCTATAGCAGAGCTA GGATATATAGGATCGCGAGCAAAATTAGGATCGATCGAGATGGAGGTGCC ACGGCGGACGGTGTGGATATCCTCCGGCCTCCTCGCGCGCATGGTCATGA TGGCCGTCCTGCTCATGTCCGTGCGCTTCATCCTGGACAACCACCTGACC TACGAGTATAACATCGACTACAGCGAGAGCGACAACCTCGGCGCCTTCAA GCTCCAGAGCCACACGTACGTACACTCCCAAATCCCAATCGGGCATATAA ATCATATATCTTGTATTCTTATGTACTCATGGATGACAATGGCATACAGG TACGTGGTGGCGTCGGCTATCGCCGGGACGGCCGGGAACCTGCTGCAGAT ACCCATCGCCATGTACCTACTGTGCAAGAGCAGGAAGACGACGCCCAGCG CCATGATCCTCGACGTCAGCATGCACGCGGACATAGTAAGCTACTGAACC ATCCTGATTTCTGCTCCTGGTTCGGTTAGCTACTGTATATGCCAAGCTCA CCATGCCACGTACTGACTGACGCGCAGGCGATCAGCGTCGTGCTGGCGAG CGGCGTCGGCGCCGGGTTCGGAGCCACCAACGACGTGATGTGCTTAATCC GCGCGGGCAACTGGGGGAACCTGCAGCAAGTGGAGCAGGATCTCCTCAGC TACTACAAAAGGGCCATCGTCGCCGTCGTCTTCCTCCTCGTCGGCATGCT CCTGTCCCTCTGCGTCACCGTCGTCTCGGCCAGGCTCCGCGCCAGGGCGG TAAACGATAGTGAAGGTGTCTGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.