Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA043785

[Submit comment/correction]

Sequence	AA043785
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA043785
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CTCATTTTTGTTCACTTGTCTTTTGTCCAATTTATCTACAGATGGGATTT AGCATGGGGCCCCACATTTGGCAAATTAAAGACTCTTGTACTCAATGAGT GGTTTACAGCTGTTGACCTGGTTTGCATTCTCCAGCAGTCTCCCATTCTT GAGATGCTCACTCTTATGCTTAGTAACACTGAGGTATATTCTGTATGTAT ATACATAGATGCTATATTATTTAAGTTATTGCCACTATGCTCGTTTGATC TTACTAAATACTTTGTATCATACAGAAACTTGTAGGAGGAGCCCAACTAA CTATACAGAAATCATGTTTGTGTGTGCGCCTTAAGGTTGTAACCATTGAA TGTGGAAGGGTTGATGAGGGAGTTCACAAAATTTTGAATATCTTGGCTAC ATGTGGCATACACCATGAGAAAATTAGCATCAAGCTTCCAGGGTCACACT AGAACGTGAGTTACCTTTGAAATTCGCTCAAAATATTGCCGCAATCTTCC TACTTATTATTCTAACATGTCTATTCTAATTACGCATTAATTAGAGTGGA CCGTGCCCTTTACAAATCCACTCATATCCATTTTCCTTTCGAATTATTGG ATTACATGGAGGTGGAATTCAAAATGGTTAGCACAAATTGCTAGTAAATT TCACCAAATAAAGTGTTTGGTAACTACCGGTGACAATATAATAGTCACCA CACATTGCTGTCCATCCATGCAAATCATTTGTGTTTTGATTTCCTTGTCA TTTTACTGTTTTGTTACTTCAAAAATATAGTAAATGATGAATTCCTTTTG AAAAGAAAAATATTTTGGTCAAGTTGCATGATATCGATTAATGTGGAAGG GTCATCGAACTACTAGGTAAGCTATCGTACCATCTATATCGATTGAGGAT ATCTCAGAACCAGACTTATTGTGCCTTGTCACGTCATTTGCAGGTTTCTC TTTCTAGAAAGGCAGCTTCCATCAACTCTGGCACCAGTGGCTGCAACTTC CACCACCGACAGCACCTGAGATGTGGCTAGCTTGTTATGTTGTCCGGAAG CATTTTCTGTTTCTTCGAACAAGTCGGTATTCGTTGACACTACCATTGCC ATGTTTACTTGCTTTCTATCGCTTGGTCATGTGCTGGAAGTTGAAGTACT CGTAATGCCACGGGCCAGTCGGACATTCTGTTGTCTGGTAATGGAAACCG GGTTCGACTTCATGAGTTCCTTTTGCACGAGTCACGCTTTATTTAGTTTT AGCAGAAACGTTTTAAGATCTTTTGGGGTGAGATGTTGGGCCTGAACCTG GTTTGAAACCAGGAGGCAACGGCGGATTTTGGTGCACGCTTATCTTTGCA GTGTCAAGTCTTAGTTTGTCTGTGTGATGGTCCGTAATCGCTGCCCCTTT TAGTTCCCCGTTTTCTCTCTCTTGTCCCCTTTTTCTGCAAATCTGGTTCT GTTGCTTTTTTGAATTAGTGCGGGAGGAGAGGAGCGGAGGATACAACAGC AGTAGCATATTCGGCAGCCGAACCGCGGAGGTCCGATTCAAAGACATTTA TATTCAGTACTATCCATTATCGTCTCATAAGAGTGGGATGGCATGCTAGT AGTGGAGTTCAGAATGGCCGTCAAGCTTCATCACCCCATAATTCTGCACC ATCAATGCAGTATCTTTTGGGTTTGGTCCTCTGATTTTCCTGCCAATTTA ATTACTTACGAAAACAGCAGTTAGTAGACTCTGTTTTACTAAGATTCCAT AAGGACCATAACCAATAGGGGATAGAAGTATAGTTCTGTGTATATCTAGC AAAAGCTTTGCCTTGCCTCGTCGTTTTTGGCTTCACCTCTGTAAGTCAGT CTGAAGCCCTTCTGAGTCTTCTGAATGGTCATACATATTGGCTAAACTCT GTTAGCAAAGAAATTTGGACAAGGCCATTTTAAGAAAAAGGAAAGAAATT TGGTCAAACGTATGATAATTCCTATGCATCATACAGTTTTCCAAGCTACT CTCGCGTCTATATCAATTGAAGACACCTCGAAATCAAACTCATTAGCTTT TCAGCACAACTCAACAAAATGGTATCCGGCTCGTTGAGCTTGAAATGTAA TGGTTGGCCAGAAAATGGCTATGCTTTTGTTATCCTCAATGCTTTTTTTG AGGGATTTGTTATCTGGCCGTGCAAAACCCCTTTTCTCTACATGGTCTGA TGAGCTGTAAGACCTCTTGTTATATTGATACTAACACCGATAGGGTTATC ATCAGAAGTGAGAATCATCACCGTGCCCTTGTGTTGGCTGCCTTATCCTC TCGCTCGACCCCCTTCCTCCTGCCCCCGTTGAGAGTCCCCCGTCACGGGC CGGGCCGATCCGCCGCCCTCCCCGCCGGAGTAGCCGGCTGGGGTAGGGTC TGGAGAGGCACCAGAGGTAGTCTTAGGTTTCTTAGGCTTAGGATTTGGCG GATTTCCGTCCTGTTTTGGCGTTATGCCGTGTGGAGGTGTGGTCTGGATC TTGGGGCCGAGGTCCGCCCATGGCTGGTGGCCCTGCCCTCCCTGGTGCTG CTCTGGTGGTCGGAGTTGCAGGTGGAGGTTGGAGCTGGCGTCTCCCTGAA TAATCGGCCCGAGGATCCCCTTCTCCCGATGAGGGCGGCGATGGCTGCCA TGTCTCGCCCGGCTGGCCGTGGTGGCAGGGGGTGAGCTGTGGGGGCTTGA AGAGGCGGTCTGCTCATCTTCTCCCGGCCGGCCGTGGTGGCGGGGGGGGG GGGGAGGAGACGACGGTGGTTGTTTCTTCTTTGATTTCCTCTAGGTGGCA CTTGCGCTGGAGACTTCGGAAGGAGAGTAGCGCCGTTTCGCAGCTGTACC TGGCCTGCCGTGGTGGCGAGGAGGAAGGCTGCGATGCTGCTTCACTTTCT TTCAGTCTCTGGTGTTTTTTGCCCAAGATGGAGTGGATCCTTTGCAGCTA CCCCAACGGCAATTCAGGCTTGCTGCTGGAGTGGTCGTTCGTGCTGAATT TTGCGGCTCCGTGGGGGAGCTCCTATTTGGCGTTCTTCGGGCGCTGCTTG TCTAATAAGCCTGTCCCCTGGGTTCGTCGCGGCGTTATCTTCTACGGCTT CTTCAACTCATCTCGGGCAGGAGCTCTGAGGAGAGAGCTCGGTTTCTTCG CGTCGCGTCGACAGAAGGGTCTGTGGATTCCGCTCCAAGCTGATCTTCTT CGCCGTCCGTCTCTCACCCATGGCAGGAGTGTTGAATCGTTCGGCCGGAT TTCTCCGTTGGGCTTGGTAAGGATCCTTCTGTTGCTGGCATTTTCTGCAA GTTCCTGTGCCATGCAACAGTGGAGTTGGGAGGCTATCTTCTTGAGCATC ACCTCGGCGGCGGGTTATGGCCTCCCGACATCCAAGGTCAGCACATGGCC TATCAAAAAGCCGGTAAAGGGTTCCGACATTTTTACAACCTCCTTCGTGA GGCCCTTGAAGTCAGCCGCTGCATTGTTCGTCGACTCAGGAGCAAGTGGT TTTGTCCCCGCTCCTGTGCTTGATGGTAGCGTGCCTGTCTTCCTGCTCGG TGGTGGAGAAGAGGAAGGACCAGTTTGGTTTGTGTTTTTTATCTGTGAGG TCTTTTCTACTTATATCAGGGACCTATGTGAGTATTTAAATCTTATGGAG TCCTTTGTAATCTTTGTAACTTCCATCACTTGAATTATATGTGAAGCCTC CAGCCCCTTTGGGGGCACTCCTTGTTCAAAAAAAAAGAAGTGAGAATCAT TCAATCTTGTTGTATTTCCACCCAGGATGCCCAGTTGTTGAATGTTGTCT GGTAGACTAGGCATTAGAATCACAACTCATGATGTATAGCCTTGGTTTTT TACTGGAAATTCGGTACACGTATCTTAACTCTGTTTTCCACGAGTGACAC AGCTCTACATATATTCAGTTTAAAAGTAATGATCAACTCATAACTCACCA GCTGCCTCGTTAAATCCACATTTTCTCATTTATCTCCTCCACAAGCTCTA TTCACAGATCGGATGGCCCTAATGGGCCCTCTCCTCAACCGTTGACGCCT CCGGTTCCTGTCTAGCCTCGCATTTGTGCACCTCCGGCCATCGGCCTTCA TCGACACTTTAGGGAAGCCATGTTCTCATTTGATTGTCTCTCTGACTCGA AACAGAGGACAACGATGAAGTTTGTGATGACATTATGATGCACAGGTGCG GAAGGACAAGGTGTGGTGTCGATCCCATTCCGGTGCATGCGACATGCCCC CGGTCGTGTCCTCTGGGCTTGAGGTGTCAAAATGGTCGTGTATATATCCT GGTCTCACAAGGCTAAACTACAAACAAATTTGTTCAAGGTAACTTTGAGA AACAAAATATAAATTTGGTCAAGTTGCATGATAATTCATTTAGATCAATC AAAGCTACTCTCCCATTTGTATTAACTCAAGAGTTTGTAACTGTGGTTTG TGGTCTGGTGTTAACCATTACCCTTAAGTTATTTTTCCACTTCTAATGTT TCGGTACGTACCGGTTGTTAATGACCAAGTGTGCAAAAAAAGAAAAAAAG AAAGTACGAAAAGCATAGACATGATTTTTTATAAAATTAAATTTTTTTTT TTTAATGACAGTCAGCTTCTCCCCACTTGTTATTGGGCTAGGGGCTGACA CGACCGAGCCCAGAAGCCTACTCCCCACTTGTTATTGGGCTGTGGGGCCG ACACGACCGGGCCCAGCAGTGACCGTCAATTGCCCCCTCATCATCTGGGT TACAAGTTCGCGCCACCGAACTCGGCGAACGATAAGCGAAACTTCGATAT GTAAACTGCTCGTTACGCCTGTGATGTTTCGAGGTGGGACTATTATCCCA GTCTCGAAGGCTTGAGACTTGAGAGAGCACGTCTACGCTACCGGGCCTGG ACATGGGCCGTCTTAGGAAGATCCCCTCCATCTGCTCCTCCGCTGCTCCA TCTGCTTCTCCGCTGCTCCCGCCCCCTTCCGGCGATGTGTAGCTCGACGG CGACCCCTCCCCTTTCCCGGCGACTCCCCTCCATCCTCTCCCTGTCTCCT CCCCACCTCGCTCCACCAGCAACATCTGCTAGAACCAACAGCCAAGAACC AGCGGCGGCAGCAAGAGGAGGTCCCCTGCTCGGCTGATCCCTAGATTTCG CACTTCCGCAAGCTGCAGGTGAGGGAAAATAGCCCACCTCTCCTCCGCTC CCTAAACCACGACTGCTCATTTTTAACTGAAAGTCACCAAGTGCCATGTT TTTTGGCATATTTTTTCAGTTGTTCTTCACCTATTATTAGTACTCTGCAG TCGTTTGTTATTGAAGTAACCACGACAGTTGTCAATCAGTAGTTCATCAT AGACATGGTAGAAAGCTCATGGTTATAGAATGATTCGGCAAAATATGCTA AAGGAAATTTGACTATCCATATTCTAGAATATTTCAGTCTCAAGAAAAGG AGGAGATCACCTTGTTTTTTTGGGTGAGCTAGCATTGGTTGTGTGCTCCT GTAGCTCTGACCAGACGGAGGAGATGATTTTTTTTTCCAGTTGATGGTCT TTGGTGCTGGCTTGCTTGCCTTGCCTTGACCACGAAGAGATCATCCATTC TTATAACTAATCAAGTGATCTATTATAATGACATGTTCTTTATTTGTTGT CTGCTGTAATTAGAGTAATTTTTCATGCCTATTCCATATGTAGTTTCACA TGTGCTGTTTGTATGCAGGGCTGTAGTGATCCCTGTTGCCGCCGATGATC ACCGGGACGTGAGGTAGATACAAGATGCTTGTGGAGAGCAACAACACCTT GAGGAAGAAGAAGATCTAGAGGAGAGCAGGAGAAAAACAGAGGAAGGAGA AGCCGAGACGGTTATGTCGTTTCTGTTCGTCGATGCCTCTCTCACTACTG CCTCTCCTTGCTATATAGTCACCAGCCTGCGCTTAGCCCAAGTCCATCTA TAGTCTAGTGCCCCAGCCCACGACCTCCAATCCAGAATATCCACAGGATG CAGGTATTACACTCTTTGCCCCTTGAAACTGTGCTTGACCCCAAGTTGCG GCTGTGCATACCTTGAGCATACCGCATCATCATTTGTCGGTTCTCTCTGA GTAGTGATGGCCACTCAAACAGCATGCACCTGAACCAAGGGCTTCCATGC GTGCATTGGCGGCTAACACCAGGATCCCAGGGCCAGAGAAGTAGCACACA AACCATCCACTTTCAATAGAACAAGAAGGTCCAGATGGCAGTACCTTTTA TCAGACTTGAACCAGCAAGGAATGCATAACCAGGATGCCAATTTCTTGTG GCCAATTGCATGACATGGACCTGCAACGTAAAACAGAGCCACGTTTGTGA AGTCGTTGAGTCCAAGATGCACTAGATTTGAGAAATGAATTGATTCTCGG TTTGCAAGTGGACGCCGGCGTGAACCAGGGTACGCTCTCGGCCACGAGGG CGACTCAAGGTGGAAGTGACCAACAACGGTAGCAGCAGCGTTCCCAGTAG TTTGGCTATCCTTGTTGCTCTGGTGTCTTCTTGCATCGTACCATGCAATG TGGTGTCGGCTGTTACTGGTATTCCCAGTAGTTTGGCTGTTTGTGCTTGC AGATAATACTTTATTTTTGCTTGCAGATAATACTTCATTGTTGCTTGCAG ATCATACTCCATGGTTTCTTGCAGTTCATACCATATCAACCAATTTTTGT CCTCTTAAAAATGTCTGCAATCTAATTCTGCAATTACCACCATGGTTACA GCCTCGCCGGTTGCCCTCTTTACTGTAGTTTTCTTACAATATGAAGGCAA AAACTCCCTTGCACGGCAACAAAATTTGCTTATGCTTACTGCTATTGGCT ATTCATTTTTTTAGAAGCTTGTCATTACTGGTTTGTTATTCTTTCTTTGA ATCTTCCTGCTATTGGTTCTTGGAGGGACATGATGGCTTCCATCAGCCAT CTGCATAGATAAATCTTCACATACGCTTTGCATGTTCACTTTCATGGAAG CAAATGATGCAGTTTTGTTTTTTTTTATTTGCAGAAAATTAGTTTCAAAC TGAAGGGGAAAACTAATTTACGTCTTGAAGAGAGCATCATGGAACCAGCA GATATGTTCTTTTTGTTATTTCAGAAAATTATTTTCAAAGTGATGTGGAA AACATCCGGTCTTAATAATGTTAGTTTGCGCCTTCAAGTAAACAACACAA CGGGGTCTTTCTAATATTCTGTACTCCCTCTGTTTCAAAATATAAGATGT TTTAGGTTTGTGAAGAAAATGTATCTAGACTTGTTTTAGTATGTAGATTC ATTCCAAACCTGAGTGAACCTACGTACTAAAAGTAGTCTAGATACATTTG CTTCATAAAACTAAAACATCTTATATTTTGAAACGGAGGGAGTATACAAC AAGCTTCATAGTATGTATATATGAACTGTGTGCAGGTGGTATGGCTTCAA ATTATAGGGGAGGTTTTGCCCAACTTTTGATTTTTTTAAATTAAAATCTG ACCAAAATTTTGAATTAAACTTAGTTCCATGACCAAATATCTGGGGGTCT CATTTGGTCATTTAATCATGACCAGGTATATCATGGCACTGCTGGTTGTA ATTTTTTTTGTCACATAATGCACCAGGGGCAAAAGTGTCTTCTTAGGTTC CCATTTAACACCGTTAGTGCTCACAACGTACTAAATTGTTATATAAGGAA ACAAATTTGCACCTACTGTCAAATAGGGAAGAAAAAGTTTTCCAGGTCCA AATAGGGAATTGAGATTTTAAGTAGTGTCAAATAAGGAATTCTCTCTACT AAATACGGGAGGGTGAGACGAGTCTTTGTGCCCTCCCTGTTCTTCCCCTC GGCTGGCGGCGGCCGGAGTTTCGCCCTATCCACGAGTCCACGAGTCAATC TCAGGTGATGCCGTGTTCTTTTTCTTTAGACCATGGCCTAGTGTAGACGG ATTTCCCCTCCGATCTGATGTTTCTGCTGAATCCTTCTCTCTGCTCTAGC AGGATCCCCCACCTGCTCGACGGAATGCCGAAGAAGGTTGTGTCGGGCGA CAAGGATCGCTTCGACGACCTCCCTGACGACCTCCTCCGCCGGATCCTGT ACTTTCTGCCAGGGGATGATGCCATGCAGACTTGTGTCCTCTCCACCAGG TGGCGTGAGATCTGGAGGCGCACAACCCACCTGTGCTTCGTCTATGATGG ATGGAGTTTCCCTACCTGTGAGCGTTTCCACCAGTTGGTGAAGCTCATAA TCCAACTCCGTGGGAACTCACCTCTGACCTACTGCCAGATCAATCCCTTT ACTGATGATGTGGAGAATTGTACTAGATTCGCACGCACTGAGCAGTTGAT GGAGTATGTTCTGGAGTGCCAAGTTGAGCGGCTCGTAGTTTGTCCTGGTG ATTATCATGACAAGCCATTATCACTCGACGATCGTCTCATCTCCCGGTAC TTGAGGACCATAAAATTTGAACAAGTTGACTTTGAAGGCTCGTCGTTGGA TTTCTCGGACTGCCCAGCATTAGAGGAGCTAACAATGAGATCTTGCAATA TTTTCGTATGCAGGATAGTTTCTGAATCAGTCAAGCATCTGCGGATTATT GAGTTCTGCTTCTTCCCTTATGATTGCCGCATTCAAATTTATGCCCCGCG TCTTATTTCACTGCAACTAGGTTCATTTGATGGTATAGGTTCATTTGATG GTTTTAGTGGCTTGACTCCTTTGCTTGAAAAGATGCCATTGCTAGAAACA GCATTTGTTACGATTGCTGATCTGTGCTGTGATTCCTGTGAAAGTAACCG GGAGGATTTTAATGATCCTTCCTGTACATGTTGTGATGACAAGTGTGTTC TTCTCAACGGGTTGTCCAATGCTGTTCATCTGGAATTGACTGCTGAACCT GAAATGGTATACTTTGCACTCTTTCTTAGTAGTTGCTGCATCTTTATCCA TCATTAGAGCTACTACATATGGTCGATTTGCTTATTTTCACTACCACAGT TTGCTAACTTTATCTTCACCCAATGGGTATCAAGTCAATAAATTAATAAC ATAATGGCTTGATTGGACAGAATATGATAGTTCAGGCGCTATGGTGTAGG TTTTTCTTTTCTTAGTTTTGAAAATAAAGTATCTAACTGAAGCTCAAAGT AGTATTTTTGTTCATTTGCATTCTGTTCAGTTTATCTACAGATGGGATTT GGCATGGTGCCCCATATTTGGTAAATTAAAGACTCTAGTACTCAATGATT GGTTTACGGCTATTGACCTGGTTTGCATTCTCCAACACTCTCCAGTTCTT AAGAAGCTCACTCTTAAGCTTGATAACACTGAGGTATATTTATTTTATAC AAAGATGTTGCTGAATTTGTATATGTATTATGTTGTATGCTTTTCTGTAT CTTACTAAATGTTATTATGATACAGAACTTTGTAGGAGCAACAATATCCC AAAAAACATTAGAACAACCAATTCAGTGTGCGTGCCTTGTGGTTGTCGAG ATTGAATGTTGGAAAGTGGATCAGGGTGTTCGCAAAATTTTGAAAATCTT GAGTACATGTGGCATACTTGATAAGCAAACTAGCATCAAGGAGTGGTTGC ACTGAGACAGTAAGTTACCTTTGCCCAGACCTAGTATCCATTATCAATTA CATTGTATGTATAACTTGTCTGCTTTAGTTACACATCAAATAAGAATTTA TGCCAGCACGTGCAAATCCATCCATATTTTTACTCATTATCCTTTAGTAT AAATTGGATTTCCGTGCTGATGGAGTTTATGGTGACACTACAATAGTTAG CACACATTTCTGATGTGCCTATAAATCTGTACCACTCATACAAAATCATT TTCTTTTTATTATCTTATTTTCAGGTGAAAAAGTTCTGTTATCTTTTATT CATTTTGCTGTTGATGAAAATAGTACTCCCTCCGTTCACTAATGTAAGAC ATGCATGTATGTAGACGTGTTTTAGTGTGTAGAGTCACTCATTTTTGGAA TGAATCTAGTCCATATCAAAAAGGTCTTACACTAGTGAACGGAGGGAGTA GCTGTTCTCACGTTGAAATTCAGTTTATCTCGGCACTGGTGCTCATTTGG TACAATATATTTTACTAAGAAATTGATAGGGTGTTGGATGTACAACGTAG CGCAATGCATCCATCAGCAAGAACTGCCTTTTGCTTTGCTTTATTTACTG TTGTCAGTCAGTTATATTAGTAGCAAAATTGCATGTCCACACTCATTTCA AGCCTGAAGCCATCTCAAGCTGTGAGGCCTCTCTGAATGTTCATATTTGT GTTGTTGTTTCCCTCGCAAAGCTAAACTCTTTTGCTATCAACAAAAGAGA TTTACGCAGGCTGCAGGATAGTTCCTCCACGACAAATACTATCCAAGTTA CAATTTAAAATTGTTTTCTGTCAACTGAGGACGTCTTTGAACCAAACTTA TCGTGCCTTCTCCTGTTTGTGCAGGTTCATCCACCGATAGCGACTAAGAT GTGGCCATGATGTTCATCGGGTGCTTTTTCTCTAAAGAGTTTGTGATGGT GGCGCATGTGTTGGTCTTTGGTCATGAAGTTCAGTTTCTCGCTTCTTGTC TTTGGTCTTGCTGAAACTATCTTTGGGGGGTTGTTTTTGGTGCAACTGAG CAAATTAGTTCCCACTTTGTTGAATTGGGAATGGTCAGAACATCCTTATG TTTTTATTAATGGAAACCGGGAAGTGAATTGATATGTTTGTGTCCGCGTC ATATACATGTATTTTCTAGATCATCAATATACACTCAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.