Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA040487

[Submit comment/correction]

Sequence
AA040487
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA040487
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CACCGTGCAACCAGAGCTTGCAAATGCCCATCTAATAAAAAGAGCTTGAA
AATGCCTGAATAACCAGTGTACCGCGCGAATACCAACCAAATCGGCAAAC
CTCCACCGCCTCCTCCTCCCCATTCCCTCCCGGCCCGGTCTCCGCGCGCC
ACGGCGGCGGGCATGGACGTCGACGACCCGGTGCCGCGCGGCGGCGGGGA
ACCGCCCCGCATCCGGCGGCTGGAGGAGTCGGTGGTGAACCGCATCGCCG
CGGGGGAGGTGATCCAGCGGCCGTCCTCGGCGGTGAAGGAGCTCGTCGAG
AACAGCATCGACGCCGGCGCGTCCACCGTATCCGTCACCGTCAAGGACGG
AGGCCTCAAGCTCATCCAGGTCTCCGACGACGGCCACGGCATCCGGGTAC
GCCCGCTTCCTAAACCCTAAACCCCGAGACCAATCCCCCCACTCCACTAC
CTTCCAGTCCCAAATTCGTGCAAAATGCTGGGGCTCACGAGCTGTTAATT
GCGATTGCTGCCTAATCGTGTGCGTACAGGGTCATGTGGGTGGGAAATTC
CAAGCATGTGGGCGATTTTAGTCTTGTGCTGTTGCACACTGAATCTGTTT
GTTCCGACTTTAGCTGTAAAAATTGCACAGGGGTGGCCTATGGGGAGGTG
AGGACACTGAATCTGTTTGTTCCGACTTTAGCTGTAAAAATTGCACAGGG
GTGGCCTATGGGGAGGTGAGGACACTGAATCTGTTTGTTCCGACTTTAGC
TGTAAAAATCGCAGAGAGCGGCCTATGGGGAGGTGAGGGCGTACCTTTCC
ATTAACAGGCAACTCAGATTGTTAGTGCCGGTCGCTTCTAGGCAGCATTT
TACTGGTTTGCTGCGCTATGATGTTAATGTATATTGAGCTTGTGGTGCGC
TATCAAGGGATCCTAGTCACTGGCAGCCTATTCTATAGGATTAAATTATT
GATGTTGGGAATATGAAGAGTTGAGCTTGTTCAAAATTTTGCTTAAGCAG
CACAGAGATCAAGCATATGCATATATGCATATGCATATGCATATGCATTG
TTCATCATCAGCACCTTTTGTCAGCTGCTAACTTGGATTCATTTCACAGT
TTGAGGACCTGCCAATATTGTGTGAGAGGCATACTACCTCAAAGTTGTCT
GCATACGAGGATCTACAGACGATTACATCCATGGGGTTTAGAGGAGAGGC
TTTAGCTAGTATGACTTACGTTGGTCATGTTACCGTGACAACAATAACAG
AAGGCCAACTGCATGGCTACAGGTCAGTCCATGTTCAACTTCAAAGCTTT
CTGCTTGACTCTGAAGTCATTTGGTAATTTCCCTGCAAAAAGGAGTCGTT
TGTTAATGATCATTACCATGTTTTCCCCTCAGAGTGTCATATAGGGATGG
AGTAATGGAAAGTGACCCGAAGCCCTGTGCAGCGGTTAAAGGGACTCAAG
TCATGGTGGGTTTGCAGTTTTGCATATAGTACTATAGATGTATTTGATAT
GCACTGCGATTCTTACAGCAATTTTTGTCTATGCAGGTGGAAAATTTGTT
TTTCAATATGGTAGCTCGCAGGAAAACATTGCAGAACTCCAATGATGACT
ATCCCAAGATAGTGGACTTCATCAGTCGGTTTGCAGTCCATCACATCAAC
GTGAACTTCTCTTGCAGAAAGGTAAATATTACTGTCTTTGTGAATTCATC
ACTTTTTAGAGGGTGACATTTGCATCCTCTCTTGTCACAGCATGGAGTGA
ATAGAGCAGATGTTCATAGTGCGAGCACAACTTCAAGGCTAGATGCTATC
AGGAATGTCTATGGGGCTTCTGTTGTCCGTGATCTGATGGAAATAGAGGT
TTCAGATGAGAATGCTGTAGATGAAATATTCAGGATGGATGGTTTCATCT
CCAATGCTAACTATGTGGCAAAGAAGACTACTATGATTCTTTTCATAAAT
GGTACTCCCTCCTTCCATTAATGTAAGACCTTTTAGATATTTCAAAATAG
ACTAGATTCGGACTAAAATGGATGAACCTAAACAACAAAACATGTCTAGA
TACATGCAGTTTCAAAAAAAGCTAGAAGGTCTTACATTAGTGAACGGAGG
GAGTACATAAGATAGCTGCAGCTCGATGACATAGGCAGATCACACAGATG
GCAGTAGTCATGTTTCTAGATATTTTCATCCATAAATAAATTATATTGAG
ATTTTGGATGTACTAAACGTGTGGATAATACATGTTATGTAACTCTAATT
AGAGTTTGCCAATTTGGCCATTTAACTGAATATATAGGGTAGAGATATAC
TTTTCAGTTAAAAAAGAGTTTGGCAATTCGGCGATTCAACTGATGTGTAA
TTTGATGGACACAGGTTTATCTTTTCAGAATGCTTTTTTAAGGCCAACAA
AGTTTCAAATTATGCATCCATTGAACTTGTGTATAGTTCCTATGTTATCA
TGCCTGTGCTTGTTTTTTTGTTTTAGCGAATAACTGTTTCTATTTTACTC
TCCAGATAGGCTTGTAGACTGCACTTCTTTGAAAAGAGCTATTGAATTTG
TGTACTCTGCAATATTGCCTCAAGCATCTAAACCCTTCATATACATGTCC
ATCAATCTTCCACCGGAACACGTGGATGTCAATATACATCCAACCAAAAA
AGAGGTAAATTGTGACAAGATCAGGTGCTTGATGTGCAAGTATTTCTGCA
ATTTTCAGATTCGAATAATTGGTTTAATGATTCTGTTGCGTCTTGCAGGT
TAGCCTCTTGAATCAAGAGCGTATTATTGAAATGATTAAAGATGCTATTG
AGGAAAAGCTGATGAACTGTAATACCACAAGGATATTCCAAACTCAGGTT
ATCCATTGGTTATGCTTTACATAATTCCACTGGTACTTGGCCTTTTAGCC
TGTGTTAAGTGTAAATATGGTTACTTCTCTGACAAAACTGTTTGGTTATG
TGCATCTGTTTCAAAGCTACTACCAGGTGCATAGGTGCGTCCATTAAAAT
ATGCGTAATACTTGCATAAAGTTACGCACAAATTCGTACAATTGTCATTT
TCTAAAAAATTGCTCTCATGGAAAATGGACTTGTCACTAGATGATCCTCG
GCGAAATAGTCAAGCATAGATATTGAGTCAATCATCACCCCTGTATTTGT
ACAATTGTATGTCTATGGTCAATGCTGTTTATATACCCCTTTCAAAATAG
ATTGTTACGATCTTTGGCTATTTGCTACACTTAGAAATGCAGTATATTGC
AGAACTTCACCTGGGGTTTCTACATTTAGGCAACGACCCACTTGTAGTTC
AATAATTGATGCTAGTGCTTTTAGCTAATTTTTAGATGTACCTGCTTGCA
AAAGCAACTTACCTCCAGTGCAAATTATGTGCAGATATATTTTGCATTTT
GATGCGAACTTTTGTGCGCATCAGTGATGCTTTTCATTGTGCATTGCAGA
CTGTAGACTCTTCAGCACTTACTCAACCTAACACACAAAAGGAAAAAGGT
ACCGAGGTCAGCACACCTACTGGTATGTAGCATATATCCCATAAATATGC
TTCAATATCAATTTTAATACCTTTTCAAACAAAAAAGTTTTGAAGTATAC
ACTACATTGCTACAGCACATTAGTTAGCTGTGTATTATTGAGCTATCTGG
TAAACAGTGCATGAAACCAACACCTCCCTACCGAGCAAATAATCTTACTA
TAATCATTTTATTCCATAGGAGCAAAATCTCAAAAGGTTCCAAGCCAAAT
GGTCAGAACAGATCCACGCGATCCATCTGGAAGGTTGCACACTTATTGGC
ACGGACAATCTTCAAATCTTGAAAAGAAATCCGACCTTGTTTCCGTAAGG
TGTGGTCCTGAACTCCTCATTAGCTAGCTGACAGCGTCACCACTTTCTGT
ATTTCTATGCCCTCCAAATGCTGTACGAAGTACCTGTTGTTCGCCTTCCC
TCTGTGAGGATTTAATAATTCATGCTGTTTGCATGCTATGACTTGTTTAG
CTGCAAGTGCTGGCCCTTTTCGTACACTGGTGGCTAATTCATAAATTTTA
TTCGAGGAACAGAGTAGGGTACACTCACATTTCTTCTTTACTGCGACTGA
TTATTACTTCTATTGCTCTGCTTCCCCAAGAAATGTTGTAAGATCAAGAA
GAAATCAAAAAGATGCTGGTGATTTGTCCAGTCGCCATGAGCTTCTTACA
GAAATAGATTCAAACTTGCATCTTGGTGAGCTCATTTTAACTTGCGATAT
CTGTCTCCATATTTTTAGACTGATCGTTTATGTATTGTTTTAGGACTTCT
GGATATTGTTAAGAACTGCACATATGTTGGAGTTGCCGATGAAGTTTTCG
CTTTGATACAGCACAATACCCGCTTATACCTTGTGAATGTGGTAAATGTT
AGGTAAACCCTATATGTTGATGTCTAGTGTTATTGTTCTATGCCTAATTT
ATCTAAGCTAGAAATTCCAAATATCAGATATGAATTGAAGGTAACTGAAA
CTCTATTCTATCTTCACACATGCAAATGCACGCAGGCGTAAACAGACAAT
ATTGCTGGCATGCACCATAATCAAACCGTTATACATGCATTCATATCATG
TTGAAAGCTCGCAAGTACTACCACCTCTTCCAAATATTGCATTGATATTT
TCTGTTCTAAACCATTATATGGTATTTTTTATGTGATAAATTGATGATCC
AACTTTGTGATGCAGTAAAGAACTCATGTACCAACAATCTTTGTGCCGTT
TTGGAAACTTCAATGCTATACAACTCAGTGAACCAGCTCCTCTTCGGGAG
TTGCTGATGATGGCACTGAAGGATGATGAATCAATGACTATGAGTGATGA
AAATGACAAGGAGAAACTGGAAATTGCAGAAGTAAGTTGTTTTCTTAATC
GATCGATTTTTTGTTAATCTTGTAGATGATGGAACAAATGTAAATTCTTA
TCTGTCCAAGTTCATGCTGTTTCTATTTCTTGATTTTTTGTATTACAGCT
TCATCCCCTGACTCCTGTAGCATCATGCTGTTGATAAAGATACTACTTTT
TTTTTTGATCGAGATAAAGATACTACTTGTGTACAGGTGAACGCAGAGAT
ACTGAAAGAAAATTCTGAGATGATTAATGAGTACTTCTCTATTCACATTG
ACCAAAGCGGCAACCTGACCAGACTTCCTGTTGTACTTGACCAGTACACG
CCTGATATGGACCGCCTTCCAGAATTCGTGCTGACTCTGGCAAATGATGT
AGGTTTCCTTTTATTAACCACGTTCATTGTATATGGTAACTAAATTTGGG
CATGTTATTTGATTACCCACTCCCTGCTGAGGCAATGGCATGTAGATTTG
CAGGCTGATACTGCGTGTTCAAATTTTAGTTTTGGTGTTTCATGTAGATA
TGCCAGCTAGGTATCTGGAAGTAACTTCTGTTTCCTGTTTTACATTCTAA
GTAGTTTCATAATCTCACTCCGAAGAGATTTTGCTTCATGAAATATTTTG
TTTTAGATTCTTCATTAGTTCTCCAAACTGTCAATCCTCATTTTTAGTGA
TTACCATCTTACAATAGGTTACCTGGGATGTTGAGAGAGATTGCTTCAGA
ACGGCAGCAGCTGCTATTGGGAACTTCTATGCACTTCATCCTCCCATCCT
TCCAAATCCATCTGGCAATGGCATTCAGTTATACAAGAAAAGTAAAGATT
GCATGGCAAGTGGTGAATGTGATGACGATTTAACAAACACAGGTGAGATT
GTTGGTAACTGTATTCTATATCCATTGAAGTGCAAAGAACATGTATGCTT
AGTGTAACACCATAATTGTTGTAATTGAGTCGTTCTTCCCAGTTCATTAC
TCATTAACCACCTAGATAACATGACACTGAAACTGATACTAAAGAAACAT
CAGTGATCTGCGATGCTGCAGCTAGATATTCAATAGAGCCATTTTTGTAT
GGTATCAGAAAAGACAATTGCAGTGTTAATTCTATGCATGTATTCTTTTT
TTGAATCTACTGTATAATTATATATCGCACTACAGATGAAGATGAAATTG
ACCAAGAACTGCTTGCGGAAGCAGAAGCAGCATGGGCTCAGCGCGAGTGG
ACCATCCAGCACGTCTTGTTTCCGTCCATGCGACTTTTCCTCAAGCCTCC
AAAGTCCATGGCAACAGATGGGACGTTTGTGCAGGTTCTCTTCTAACTTC
GGCTTTGCTTTCCTGCATGTTTGGTAGTTATATATGCTTCAGTATTCTAC
ATGTGCCCTGGACTTGTAGAAATTTAAAAAGTCTTTGCTATATGGCATTA
TAGCCTGTTACTGCACTCCTGTCCATGAAATGCTCAGTCCTGGCACTGCA
ATACCTGAGATGCATGTCTAGAAGTTTTCCTTCCACGATTCTTTCTCATC
AAAGTGTGCACACTGCCTTGCTCAGAGAATTGCATATAAGGTCGTTAAGT
TTTGTTACCAACCTTAGCGTAAAAATAAGTTCCTTAGGAACCACCGAGCT
ACATACACACGACATTTTTTCAGGTAGATTATCTGGTTTGCTGTTGACAT
ATACTCCCTCCGTCTATAAATATAAGCGTTTTAGCTTTGTGAAAAGAATG
TATGTAGATGGCTTTTATGTACAGATTCAGATCAAACCTATACACTAAAA
GACATCTAGATACATTCGTTTCGCAAAGCTAGAATGTCTTATATTTCTGA
ACAGAGGGAGTAGCAAACAGAACTGACATGAAAGTGCAACCACTAGAAGC
TGTGCAATTTACCTTTTTTATAGATGACAGTGGATTAACGATTGCTAAAC
CTGAGTTGTTTATTTGTGAACCTATACGCAGGTTGCTTCTCTGGAGAAAC
TCTACAAGATTTTCGAAAGGTGCTAGCTCGACACAAATCATCACGAGATA
GAAGGAAGTAACCGTAGCGTGACGTTGGTCCGTGTGTTTTGGGTAGCGTT
GCTAATATTTGAAGAGCGAGCGAAATTTGACTCCACTTCTGAACTGAAAT
AGTGCGTAGCTTTCTTGTGAATACTTTGGCT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.