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GrainGenes Sequence Report: AA008295

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Sequence
AA008295
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA008295
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GGAAGAGGGAGAGGGACTGGTGAGGGAGCTCGCCAATGTCGGTTAGGGTT
TCGCCTCTAGCCTCCTCCGCTTCTAGCCGCGGCACAATTCCAGAAGCTGC
TGCTCCTCCCACCCGTGGGACGCGCGCGGGGTCTCCAGCGATGGGGGAGA
AGCCGGGCCGGGGCTGGGGCGGGAACGACGCGTGGCACGGCAAGGCGCTG
CACACGAGCATGAAGGTGAGCTCCTCCCGATCACCGTCTCTCCTCTATGT
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GAAGTTTCAGTGCTATATTACAGTAATTTGCAGACTACGTTTATTTTGGG
CAGAGGAGTAACTGAGCGTTGCCCTGCTGGCGAAAGGTGCGGGTGCGTGC
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ATTACAGTAATTTATAGATCAATATGGGGGAATTATGATACTGCACAACT
TTATTATTATTTGAATCGTGTTTCAACTGCAAATTACAAATTGGTGTGGT
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TTAATCTACTTATTATCTTAACCATAATTCTTATTTAAGCATTTTTGACA
TTTAAAAATTGCTCCAGCGTGTCAAAGTGTACCGGTTAGAAGATAATGGG
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CCAACCCATTGACCCATTGTATGTTTGCTTAATAACTTTTTTTTAAGTAT
GTATGCAAAGTGGACCACTGATTGAGTGAGAACTGAGTTATTAACATAGC
ATGGAAGTGGTCCGGTGGGTCAGTTGCATCTTTACATGACATTACCCTGT
GATGGAGCCTGGAGTTCAGTTTGTGTATTACTTGACAAAAAGTAAGGCAT
GAAGCAGTGATTGGCAACAAAATCTTTATAAGTGTTGTTGTTTGTCATTC
AACATTTACTTTGTCAACCTTTTTCTGACTTAGGGGTCAAAAGAACTTGT
TCTGGCTGTTGTGGATGAAGAGGATAATGACACCCTACTGCTTCACAACA
TTACTCCTGATGATATCTACAGGAAACAAGAAGGTGAACTGGCATTCTAT
CCTTTTTTGAGAGCCATTTCTTTCCCTAACACAACTGTTTTGCCTATTTA
TTTGGCAGAAACAATCATCTTATGGAGGGATCCTGAAAAGGCGCTAGAAT
TAGCTCTGAGCTTTCAAGAAGCTGAAGGATGCTCGTACATATGGTGATTC
ATCGATTATTGGTGTTATTGTTCTGTTTCTTTAGCGTCTTAATCATCTGC
TTTACATTCTGATGACTTTATGTAGGGAGAACATGTGTAATATACGGAAA
GACCTACAATCTAAGATCATTCTCCGTGAGTTCGTTAAATCAGTTTTTTT
TTTCTGGTTGGTCTCATGCTTCCTTGTAATTACTTAGCCATGTTCTGCAG
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GGTTCTCTTTTGCATGCTAAGTACTTATTCCTTTCACGTGCAACATATGC
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GTTGGTTGTTATGGTACAGTATGTGCGTGTAATCTCTATCACACTGCTAA
GATTCAGTGCTGAGTTATCCTTACTATTTTCCATTTTGGTTCAACAATCT
CAAGAACTTCGCTTGATCCTTAAATAGTTATTTGGTGGCCTGATTGCATT
AGATTTGATATCACAGACTTAAGTTTAATAAATAATTATGTTCTTATACT
TATTTGTTCAACTGAGAAAATATTTGTGACCTGATCACTTGGAACTTGGA
AAGCTCAGAATATTAATCAACTATTGCTTTACCGGCAGGTAAGCCCTTAA
GTTCTGTTAATGGTGAACTGAAGGAACTTCCTCCTCTTGAGTTGTCCAGT
CTTTCTGTTATTTTAAAGGTGCGATTTACCTTCAGTGATCTTTCATGTAA
ACCTTTTAACATTTTGTGTTTTCATAATACTGAATTTGATGATGTCTTCT
TGGTTGCCAAAGTAGAACATCATATATTTTGCAAGCAGATATTAGGAGCT
CCAATGTATTGGGAAGAGATTTAGCAAATTAGGGAGTCTTCATGTATTTG
TAGGATTCAATTCAACTTGGTCAAAATGCCTGGAGAAAACTTTTGGAATG
AATTATACAATGTTTTATTCTTTAAAATTGTACAGGTAGACCACCATGGT
TCAACCCTCACTGGCCCAAACTTTGGATCTTATTCTTATATATCAGTTGT
ACCAAGGGGTTCTCCCCCTTTAGTCCTACATTTTCTCAAACAATGTTGTA
CATATTGAATATTGAAATATTGTTCACCAGAATGTACAGACTACATTGCA
AGGCACGGCGGAGCAGATCATGGGTGTTGCAGATTCAATATCAAAAGATG
TAAGTCATCTACTTGTTTAAATGTGTCATGATGCTCCCTGTAGCATATTT
CTCTCAGCGCAATTACGTGCACACATGTAGATTTGACGCAACTGTCAAGT
CAAATGCAGCGCAGGGAGGGTGTGCCGACACATGATTAGTACAATATTCA
TTTTTAATTTTAAACACACAAATGTATAACATATAATTTGTTCAAATCAC
ATATTGTTCATGTACACTGAGTTCAGAATAATCTAAGGGGAAAATGAAGT
ACCAATCATACATTTGCCTGATGAGATTAAGACTAGACAGTTAGTCTGGT
ACTCATCTTCCAATATTTTGTCAGCTTCCACAAAATTCTTTGCAGAGCCA
GAAAGTTCTTCTGCAAAGAAGTTCTTCTGCACATATGAAGCCAAATCTGA
ACTAGAACCATGACAAGAATTATGGAACGAAGGGAGAACAGAATAAGACA
GGGGATTCTTATTCCTGTAATAGAAATGGTAGTAACTAACTAGACAGTCA
ATAGATTGCATTTGCACTCATGCTTTGCTGAACTTGATATATTTATGTAT
GTATACTGAGATGTTTTTAACTAGTCTATTTACACTTCTCCAACATGTTG
CAGTGTGATTTTTTCCCCAAGATAGTGAACCTTTTCAGAAAGTGCAAGGA
TTTAGGAGACAGGGATGGTCTCCATATGATCTTCAGATTAGTCAAGGCAA
TCAGTAAGTACATACTTAGTAAGCATCGCCATAGATTATTTCAGCATGCC
ACTGATGTTGTTTCTGATTGTGCAGTATTGTTGAACAGCTCTGTGATATT
TGACAAGATTCTCTCTGATGCTTTTATTCTTGACATAATTGATGTCCTTG
AATGTAAACACAATACCTTATACCTCCCATTCATGCTCTACATCAGTAAA
CTATAAACTCCTGCCATGTTCTACAAAATGACATACCTTTAGAACTGCAT
GCACCATTCTTCAACGAATTCTGATCTATGCAGACGATCCAGAGGTTCAT
ATTGTGCAAAGTCATCGTGCATTCTTGGAGGACCATGCAGTTCTAAAGCA
GGTAACTGGAGTATCATATTTTATGTATCTTAATCTGGTTGAGTTGAAAT
GATTATTTAGTGAGGCTTCCTTCTCATAGGCCAAGCCCATTAGAAATGCT
TCTGTGGTTTCAAGGATTCATCAAACATACAGAATACGTTATATAAAGGT
CAGTGCTCCCCCGCACCGCTCTGCACTTCTGCTAGCTGGAGTTTTTATTT
ATTTGGTTTCTGTTGCCAACTTTTATGCTTAACTATAACTGAGGTGTTTG
GAATCTACAGGATGTTATATTATTGAAAGTACTGAATGATGCTACTAAGG
CAAGCCTTGACAGAATTATTCAGGCGAACAACGCTTTTGTTAGTGTTATA
ACTTGCAAAGTTTTTCACATGATTTAAATCAAAATTTCTTTCTGTAATGT
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TATTTTATCCATGAACTGTTTGAAACGATGAGATCTTCAAATGTTTCTGC
TGGATCAAAGAGCGAACTGGTGAAACTAGCATTTTTCATTCTATTGCTTG
TTTCTTTTAGACATGCCCTTCTGTGGCAGAACCTGGAACACTATATTACT
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TGATTGTTTGTTCCTTTTATGGATCGCACATGATGTGTCTTGGGAAGTTG
GCACTTGTAGGAAATAAAATAAACAATGAAACTAAGGATGTGTCTGAATG
AACTGGGTGTGGGCCTTTGCTGATGTTAGTGTCTAGATGAAGCAATTTAT
TTGTTCACCTTGTACTTTTACGGGATAATTTTGAATTAGATTAGAAAATA
TTTCATCTCTGCTTGGGCATTGGCCTTCATCAGTTGAGAGATGATATGAT
TGTGGGTTATGAATCTTTGTAGTTTGTACCAAGCACCTTACCACGTTTCT
AGGTTGTTCTGCCAGTTCTGTATATTGATATTATATAGCATTGTGTGTGT
TCGGTTTGGGGAGGGTGGTGGTGTGTATGCACTCAGTTCAACAAGGGATC
TTGTTTTGAATGCCATTTATATGTTGGTTCTTCGCAGGTCTTTCTTTTGC
GTGAATTTTGCACTGTCAGCATGCAGTCTGATCAACAAATACAACTATCT
AGGTTGGTATCTGGATGATCTATTTTCTCTTCTTCTCATTATAATCAAAA
TTTTCTTTTGTGAAAGTTATCTGTCTATCGAATATATTATAACCTGGGAG
CGTGCAACCCTGTATCTATGATAATGTAGATCAGGTTTTGCTCATGATTG
TGGCAAAATTTATTTCTTAGTTGGTGGGTATTTGTTGCATCATTTTATGG
ATGGAATAAACCACTAGTTTGCAGTGTTTCTTTTTTCCTTTCTCTCCCTC
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GCTTGAAACTTAAAAGTTCCTATAGTTTGTGTTTTGATCAATATGTACCT
TCTTTGATGCAATAAAGACATGCCTCTTGTTCAATATAAGTCAATCTGAA
CTAAACAACATTTAAGTACAATTTCTTATAAGTGTATAATCAGAGACTAT
CGTAGCAGTTTAGTAATCATGTTTCTCTATTCAGGGATCTGGCAAATCAA
GGTGTCCTTGATATAATTTCTGATGTGTTGCGGAGTCAGGATAAAGTGCT
TGTCTCAGCTGGGTAACCTCTGGAGCAATGCATGGATATACTTCTTTGGT
TGTTTCTGTGTCCGTTCTAATTGCACTATATTTTGGGTAAATGCAGGACA
GACATCCTTTTACATTTTCTTAATCAAGATCCTAACTTACTGAGATCATA
CATTGCAAATCATGAAGAAAATTCTGGAGAAGACATTTCTCTTCTTGGGA
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GTTATCTGGATCTGTCAAGCTGACCATCGGAGCAGAGCCAATTCTGCTCT
CCTTGGCAAGGTTTTCTGTGGCCCAACTACTCTCTTGCCTGGCAAAGCTA
ATACTTCTAAGTTCTATATGCTGCTATCAAACACCAAGTCTGGCCAGTAA
AGGTTAGGAATAATCTAGCTTTGGATCCAAATGCACCCTAAATTTTGGAC
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TTATATTTTGGTGGAGCATTTGGGCATTGAGTTGTGTATTTGCATGTCCA
CTCTGTTTTTCTCCTTTTAAATCCATGCAAATCGCTTGCCCTTTTTCTGT
TCATTTTGACACTGCAAACGATAGCATGGCTGTGACAGGTGAGGATGTGA
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TGCTTTTATGCAAAGAGGCTGACTGGAAACCAAGACCTCCAGGACGCCAG
TTTTCTAGTACTTTTTCGGTTTGTCTTCCCCATTGTAGGAGTTTTAGCCC
AACTGGGTAACTCAGGGTTTTTGCTTCTCGGAAGTCAAGAAAGGTACTAG
GGATTGACCTAAAGCTACGACGTTGGAGAAGTTCATAGGTTCACACGTTG
AAAGAAGAACGTCGGATTGAGACGAGAAAGCAAGTGCAAGGCATTCAATA
AAGTAAGCTAGGGTTGGCAGAGAAGAAGGATAGAGAAGAAATAGAAAGAA
TCGAATACAAAACAACTCCGTTGATTGAATGTCAAAGCCTTCGGCCCTTC
TTCTTTCTCAACTTGAAAGCTCTTGCTTAAACCGATTGTTTTTCCTCCAT
CTCTCTTAAAGTTTGCAGTAATCATTTCTTTTTCATTCCAATTCATGTCC
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GGATAAGACATGGCTATCGCTTCGACAGCTTCTCCGGAGGAAAAGACGCC
GCCCATAAGATGTGCCTAGAGATAACAATCATTTCATAATCTCGTAGAAG
TGATCATTCACTCGGTGAAGAGCCAAGAAAAGGTACAACTGTTGGGTTTC
TTTGCTAAGAAGGTACGAGGTGAGTCGGCAATTGAACCTATATTCATTCC
ACTAGCCCTAAAAGCATTCTCAATATAGTCAAGAGGGGGAATGGATTCTA
CAAGAAAAGGCGGGCAAAGGTAGTTCTGGGGTCAATTCTTGGAGCATAGC
TCATTTCTAAGTCCCCAACCCATCTCGTGCTCGTGCTGTACGCGATCGAA
TCTTGCGGCCGGATAGAGCAATGGAATCACCGAGTCGTATGAAAAGAGGG
CTCTTCTTTTTAATCTTAACACAAAGGCTAGCTCCCCTGGGGAAAAAAAT
GACAATCATTTGTATTACTTTCCTACCAATCCTGAACTAGCTATGACCCT
TATAGCGAGCCTCGCTTTACCGTTTCAGATAGAAATGGCGCTCCTAAAGT
CGATTGGATACTTTCTTTTTTATTGTCAGCTAAGCCGTGGACTTTCTCAC
GTGAAGAACTCCTTCTTATGAGCTCATGGATTCAGCAGACAGTTCACGTC
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TGCGCTACTCGGAAAGTACTGACTAGAGGGGCGTGTGGATCCACAGTCCT
AGCCATTCTCACAACGGGATAATAAAGCGAACAAAGACCATGAGAAGAGA
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GGGGTCTCCTCCGAGTTATTCTCGGTAGCCAAGGCAAGTAAATCTCTACG
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TGAGCCATGAAATGGAAGCATTGGGCTTAACCAGTGATCCGAAAGTTTAT
CATGTGTCTTGGTAGTTGAGCCATTAAGTTGTACCAATCATTGTTTTAGT
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TCTAACAGTTGTCAAATTTCAGGTTAAAGGCATGGTAACTGACTTCAGTG
GCGAAACGCTCTGGCAGTTTCAGGAAATTCTGAGGATGCTGCTGAATGAA
TCATCTCTGGATATGGTTACACAATGTGTAAGATGCTGACTGTAGCATGA
ACTTTTGGCATTTTGTATTGAGAACATTAAACAATACACATCCTCGGTAT
CGTGAATCTTTTCTGGAAATAGATGAATATTTAATTTTCCATGTTTCTGC
CCCTCTGCTGTCCGATGTATAGCTATGAGCTTTGTGGTCATTACAAAATA
GTGTAAGCTTCAAATGCTGGTGTTTAACTAGATTGTGGTATGAAATTCTG
TTGCAGAGAGCCGTCATCGAGTTATTTTACAAGAAGTACTTTGATTGGTT
GCCTGATATAATAGAATCATCTTGTCTTCCAAAGAGCATTGTGCGGTCAA
CATGTGGTTCAGGTGGTGTTGGTACAAAAGTTGAAGAATATTCTGCTACA
CCTGAAATATTGCTTAACATTTGCGAGTTCTTACGCTTTTGTGTAGTTCA
TCACCCCTACAAGACCAAGTAATGCTCGATACAAATCCCCCTCCCCCTCC
TTGTTATTCATCCGTTCATTTGGACATGTTACTTACTTTTTGTGTGTTTG
CTAACACGTGGCTCTCGATCTTGCAGTATCAACTTTTTAGAAAGTAATTC
AATGGAGAAAATCCTTACTCTAACCCGTCGAAGAGAGAGGGTTTTGGTCG
TGGCAGCTGTCCGTTTTATGCGTACTGTTATTGGCACAAACGTAAGTTTA
CTTTGTCCCATAAATAAATTAAGCACTGCATGGTTCAGGGTTCTTTTATG
TCCGGGAGTACTATATAATTGAATATTTCTGTTCTTCTATGCACCATTAA
GCTTATTGATCCTTCTTGACTACGTCTATGACTGCCAACTTAAAACTAGA
TCTAGACCATTGAATGACGGATGACCCACTTACATGTTGCTAACATACTT
CACGACACAAATTTTTAGTTAACCCACTTACATGTTGCTAACATAATTAT
GATGGTTCCCACGTTCTCAAGAGTGGAGTATCAAAACACCCAAATCTAAC
TCATCCTTAATGCAATGATCCACACGTGAGCTTGCAGGATTGCACCTAGG
CTTGTGTGCGCTGTGTTACATACGCCCCGTATCTTGTAACAAAGTAAAGA
ATAATCTATAGCAAATATCTCTTGATTTCTATAGTCAAATTCGCCTTTTA
TGTACAAGTGTACTAGAAGTGGTACCAGCTGGCGCAGCACGATATAAAAC
CAAATAATCAACTGATGATTCCAAGGTGCGGAATTAGCTCTCTTGCGCGG
AGGCAATAGTAAACATGTTTGTCAATCATGCATGCTTGCTTTTTTGTAGC
AAAACTGTGTGGTACAAGTTATACCTCTAATTGCTAGAAAACAGTCATAC
CAGCTAGCAACGTAGCAAGCATATCCTAACTTTAATTTCCTTGTTAAAAA
ATTCTGTGTTCTGTAGGATGAGCTTCTAATTAGCCATGTTATCGTGCTCA
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AACTTGCTACAGTCCACGGCCCTTGGGCTGTTGGAATACATAAGAAAGGT
ACATCCTGTCCATTGGTGTGTACCGCAAAATATCTACTATTTTTCTCGAA
AACAAAGTGAAATCCCTATCCAGTGGGCTTTGCCATCTGATGCATGTCTG
TCTTCAGGAAAATAAAAAATCCCTTGTTGTACATGTTGTGGAGTCCTTTT
GGAACCAACTTGTGAAGTTTGGACAACTGGAGAGCATTCAGGCCTTCAAA
CTCAAGTATCAAGAGGTTGAGACTTGGGACTTCTGTTTCTTGCATTCTGT
CATCACTGTCAACTTTCTGTCACTAGCAAGTTTAGGCCTTAGAATACTAT
GTAGTATTGGCATAAACAACGATGATATTTTTTGTTATCTTGCTAGTTCA
TGGATAGCGCTGAAATAGAGGAAACTACTAGTGTGGGTCACATGAGAAAG
AAGGCAGATGAAAGAGGTCTTGATAAGGAAGAGGAAGATTATTTCAATAC
AGACAGGTCTGTTAAGTTTATTTTCCTCGTTTGCTTCTTATTCTATGTTG
GTGGGTCGAATGGATTGCAGATATTGCTTCTTAAAACTCTGATTGTTTCA
TTTTGAGTGAATTTCACTTTTTATCCCCAACTTCTGAATTTTGTGACACA
AGTTACCCCATTTAGTTGAGGTTTTACGAACATATCCAATCTAGAAGGCT
TTAAACAGAGTTTTACCATATTTTAGAATTTTGCTTGTTTTTGTTAGATA
GGACCGACATGCCACGTCAATGTGGTGCGGAATTTTTTGTAAAGATCGGA
TGACACCATCGACAATTATGTCTAGACTTCTCTCATCCATATGTCCCATT
CCTCGTTGTCGTCTTGATATTTTTGAATCCTAGCCATCACCTCACACCTT
ACCCAATGGATACGCTTCCAAAAAAGAGGTCCAAAGCTTCTGAAAGCTGC
AATCTAGACAAATTTGCACTCTAAGGGGTAATATGTGTCACAAATGCATA
AGTAGGAGGTAAAAAGTGGAATTCTTACTTAACCAACGTAAAATTTCCAT
TTTACAATTTACAGTAGCAATGAAGAAGATTCTGCTACACAGACGACACG
ATCACAACAGCAATGCATGGTTAAGCCAGATGATGGAAGTCAAATCCATC
ACATCCCTGCAAGGTATCCCATCTTCCACAACTGGAGATATTACCAGCTG
TATTGTGTTTAATATTTAGTAGTTGTATTTTACTGGTTTACATCGTTAAG
AACTCGGTTATTTTTGTGAAATATGTTAGATTTAGCCAAAGGATTCGCCA
CATCAAAATAGCAAGAACACAGGCAAAACACACAATCTGATTCATCTTGC
CAGTGGCACGTATCCTGCCTCCTTTTTCCTCTATTTTTTTTTCTCAATGT
CACGGTACAAAGCACCTTTACATGTGTATATGTACACACCAATTCAGACC
AGAAGCTAGCTAGGAAGACTAACACAAACTCATAGTATGACACGACACAT
ACTGCCGCCACCATGTGTTCTCAATCAACTATGACTCTTAATTGGACCCA
AACCTGGTCACTTTCCAAACTGTGTAGAGCAGCCATCCAAAGGGTCCAAA
CACCTAATCAAGATTATTCTAACAAAATGTCCCTACTTCTGTGCTAATCA
TGTAATTTCTGCACTCATAAACATACTTGTGCTTCATTGGTCTTTGGTAT
TTTCAGGCCTAAATCTGGTGGTCTTGTGGATCATGATGACGACAAAGATC
ATAAACCACCTCCCAAAAGACCTGCAGAAGCTAGAATTACCAGCTCATCG
GACGGCAAAGATACAGATGGGAATATTCGGAAGAAGCCCAAGCTAGAAGC
TAGAATTAGCTTCTCTAAGAATACTGCAATGGCGAACGTGGCTGGCAGAC
ACTCAGATCTGGAAGATACGCAGTCTCCGCTCTCACCTGCCTCTAGCACA
ATAAACTCTGACGGCAATGTTGATGCAAGGAAGGCAAGCCCGGGCTCTCC
AAATCAACAACCCCCAGAAAGCTTTGATTACACTGCTGGGGACTCGTCTT
CTGAGATGGCTGTAGATACAGCCGAAGGAGCCGACTCTGATCCTTAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.