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GrainGenes Sequence Report: AA026776

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Sequence
AA026776
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA026776
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGGGCCCTGATCGGTTATTAACAAGGAGGGCTACTACTCCGGCTCGGCT
AAACACCCACGTACTACTACTCCGGCCGCCGTACCCTACCCGCCGCCGCA
CGCACGCACGCCTCCGCCCGAGTGAACTCCTGAATCGAGCGCGCCCCGCC
GCCGCGAGCGCGTGGGAGAGGTACGCCTCTTGCATTCCGCTTCCACCCAC
CGCGTCCGTCCTCCCTCCTCACCCCTGCAGCTCGGGCCTGTCGCCCTCAC
GGAAAGAAAAGGTACGGGAACCATAAATCCCCACTTCCCAAACCCTAACC
CCTAGAAGTTCGATCCGTGTGGCATTGGTCTCACAACCTCTGATGCACAC
TGGGAGTGATTATCTGTTTACTTTTTCCTCTTTGAGTTCAAAGTTTAACA
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TTCCAAATACTCCAAAGAACGGCAGAAGAAACCACATTCAAATGAAGATG
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TGCACAGATTCTATTTCTTTGCAGAGATTGCATTCTAAAGGTTTTGGAAT
TCCCCTGGCTCTAAGATTATCTCTAGTCAGAATCTTATTTTGAGAAAATA
ACCAAAGGAAAATCTGGATCCTGGGTGGAATAAGTAATTTCCAAACACCA
GGAAGATAAACCTGAGTGATACCTCTAAAATTGACCAGTGAATACATAGA
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TGCAGCATTAAATCCTCAGTAAAGGTTCTTCTAAAGTCACATCTAAGATG
TGTGCCATCCCATAACTCAGCTAACGTTTTAGTTTGCTGATTAGAAATCA
AATAAATTTCCCAGAATTGGGTAGCTAAGTTAGAATTTCCAAACCAGATA
TCCTCCCAAAATCTAATAGTTTTACCATTGAAAAAAGTCTACATAACCCC
CACAACTATTAGATTGTGGACTCTAAACCCCCCTAACTTCAAAACGGCAC
ACTTAACCCCCACAAGTATTAAAAACCGGGCAACTACCCCCCTAAGGACG
CTGAGAGCGGTTTTGGACCCTGTTTGGCAGACGTGAGCAGTGGATTAGTC
TATGAAATTGCATGCCAATGAGATCGTGGAGAGAAGCACCGGACTGGCGA
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GGTGGCAATATCTTTGGTGGTCGTTGTGCTATTCAGCTATCGCTGCAGGA
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GGCCGAGCCACTGGCTCTTGGAACAGAGCAGGCAGTACTAACACTACTGT
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GTCCCGGAGGCGACCGACGTGGATGACTGCGGCGTCCATCTTGGAAGATG
CGACCGCGGTGTTGCCATCCCAGAGGCGACTGGCGTGGATGAACATATAG
GTGTTGTCGTTCTTGCAGAATCCCTAGTACAGCCACGGGCGCACGGCTTC
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TTGTAGCCCAGGCCGGGCCGTACGAGAACATGTCGCCCATACCAGGGCTC
GGGCACTCCACACCGTCGAAGGTCCAGAACGCAAGCTCATCCTGTAGCTG
GAAGTCATCCATGGGTGTGTTCCCAGCACGAGGAAAGAACGGCGCCGCGC
CAGCTCCGCCATTCACCAGGCATGCAGATCATCTCGTCGCCTGCTCACAC
CATCCCACATCTGCGAACGCCAATGCTCCTCGAGAACTGGTCGCCAGCAC
ATATTGTCAGTTCCGAAGTCTTGCAACCCACGCGTACTGCCGGAAAGCAC
TCAGCAAGTCGACGCAGCGTGTCGGGACCAAAGCCAACAGTCCACGATGA
TAGCAAGGAAACCGAGAGAGGGGAAGGCGTGCCTCCGTGGCCAGAGTTTT
GCCGCAAGAACAACGACTGGATACCAGGGGTTGATTTGGCCCGAGCCATC
AATTTTGCATGCATACTCAGCCCCCAACCGCCTAAACGTCAGCAAAACCA
GGATCCAAAACCACACCCAGTGTCCCGAGGGGGGTAGTTGCCTGGTTTTT
GATACTTGAGGGGGTTAAGTATACCATTTTAAAGTTGAGGGGGCTTAGTG
TCCGAAATCTAATAGTCATGGGGGTTATCTATACTTTTTCCTTTTACCAT
TCCCCACATGCCATTTATATCCAATCTCAACCGCCCTAGATGCCCACATC
ACCCCTTTCCAGAAGGTAGATGGATGGACATCATGACAACAGAGGATATT
AGGCGACTTGGTCCTATATTTAGCATCTATCACTTTTTTCCACAGAGCCC
CCTCTCCCTGGATATACCTTTTAATCCAGGAGCCAAGGAGGCAAAGATTC
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TACTGATGACCAATTAGCTAGATGCAACCTATGATTACCTTCTTCATCAT
TCCAGAAGAAGTTAGCTAAATGTGAATCTAGGAGTTTCAAAGCCCATTTG
GGAAACTTAAAGAAAGAAAGCAGATAGATAGGAATGCTAGAGAGACAGGC
TTGAATAAGCACCTTCTTAGCAGCATAAGATAGAAGTTTGCCCCTCCAAC
CTATGATTCTATTCAACAGGTTTTCTATCAGAGGCTGCAAATCTTCTCTT
TTTAGCTTCTCAAAGTGAAGAGGAATTCCCAAATATTTAACAGGGAAGTT
ACCCCTAATACATTCAAAAATGTCTAGGAAAGGTTTAGTATCAGACTCTG
ACATGTTAATAGGAATGAGTTCACTCTTATGGTAATTAATACGCATCCCA
GAAATCTGCTCAAAGCAGGTGAGGATCCATTTAAGATTAACAGCTATTGA
CTCACTAGGCTCCAAGAAGAGGAGTGTGTCATCTGCATATTGCAAGCAGA
CAATCCCTCCTGGAAAGAAATTAGGACAGAGACCTTTAATGGCTCCACAA
CTAACCCCCTTAATTAACATCCTAGAAAAAACATCAATCATCAGATTAAA
CAACAGAGGGGCAATGGGATCACCCTGTCTAAGACCTTTACCAGTCAAGA
AAAAATCACTCTCAAAATCATTGACTTTAACCCCCACAGACCCCCCTAAA
GTAATCTGCTTAATAAATCTAATAAAGGTAGGACAAAAGCCTCTTAGCTC
TAAAATCTCAAACAAAAAGTCCAAATTAACTCTATCATAGGCTTTCTCAT
AATCTATTTTGAGCACTAGGCCCTGCTCCTTGTTCCTATGCACCTCATGC
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AAATGCAGACTGACTAGGAGAGATTAATCTACCAACCTTATGCTGCATTT
TTGCACCCAGTCTGAAGAGCATTCTTGTATTCTTGGAACTGAACGAAATT
ATACAATGAACTTTCGCAGGATTATCTGAGTTGGATCATCCTCTGCGGCC
TGCTTCTCTTCAGCAATGGTTTTCTGTGATCACTGCGATACTGATTGCTC
AGTAGTGGATCCTGACACTGGGGCGATGTGAGACCTTCTTTCTTGTTCTT
GAATCGTTCTTCTATTTGCATACAAAACGCCAAAACCAGAGGGTATCGCT
GTTGTAAAAAAAAATCTACTCCCTCCTTCACGGTTTGCAGGGCGTCTAAT
CAAATTTGCGTATTTCCAAAACTACAACGTTCCTATGCGCATAAGAATTA
ATTATTGATTAATGTGGCAGCTTTTCTCTTAGGCTGGTCATAGTGGGAGT
ATCATAATACTAGTATCATGCATATGATACTAGTATATGATACTATGTCT
CTAGTGCATTGTATCATGTAGTAGTATCATATTATTAGTATATTTATTGA
TTTGTAGAATCTCTATGTAAAATATGTGTACTAGATTTACTTGCCATTAT
GATTTTTAGTTTTACGTGCTATGATATGGTATCTACCTATGATACTCTAA
TCACTTCTCTCTTCATTAATTGTCATGCCACATCAGATTTTTGCCAAGTT
GGCATGCATGATACACCTTATGATACTAGCACTAGGACCAGCCTTAACTT
CCTATGCATGCAATAGTCTCCCACCAATGCATGCGCCTTAACCACTCATT
AATAGGCCTAATTTTCAGCCAATACGTTTGCGCCTAGGTCCGTGAGATTT
TTGTAGAGCGCCCTGCAAACCGTGAAGGAGGTAGTACTCAGTCTGTTCCA
AAATGTAAGGCATGTTTTGATTGGTTAAGAGAGTTTTGATGAGCCACGCG
ACATAAAATTAATATCATTCACATTCAGTATTAAAAAATATGATTTGTGA
TCTTGGGATGGAGGGCATATTAGTTGCTCCGAAAATATCTCCATGACACA
GCTTAAACACTTGCGCATCTGTGTCTTTATTTAATTGCCATGTTGATTGC
CAGATGTTGTGGACAGTGCGGGAAGGTTCTTCTTGATAACGGACAGTTTG
ATGAAGGGATTCAGTTTGTCAAGGGTGCCTCAGGATTGGTTCGTCTTGAT
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GCTGATTTGTTTTGAATATGCATAGAGTGAAAGACAGGGAAACGTTTTAA
AAAGCATTGAGGCTGCTTCGATATCCCGTGAAAGAACTGAAGAGAAAGGT
ATCTCTTTTATTGCATTCCTTTTATGCTGTCTCATTATGCATCTCACTTT
GGGAATTATGATCTGCTCTATTTGACCAGGGAAATATGAGATTGGGCTGA
TTGTCCATGGTCTGCATGTGAGTGGTGGAGAAGATATCATTTGCACTGCT
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GTAGCTAGCTCTTGACAGTAACTTTACTAAGGGCCGTCGAACAACTCATG
TTGCAGCTGCTTGTCTTTACATTGCTTGCCGGTAAGCTATCGCCTAACTA
GTCCGTTGATTTAACGAAAGCTTTCCTATCCACTGGACATATTTCTTGTT
CAAACAAGGCCTCCTCCCTTACTTTGGGTGGGCCTTTGAGTATTCTACAT
TGTATTTGCCATCGATTTGACCACTGCTGCGGCTTGTTTAGGAGCTGCAC
TGCATGGATGCAAAATTTGGCTTACCAATGTTTGGGCAAGCCCCAGGCTA
CCAGATTGCCTTGTCAACCTCTTAAAAGTTGCCATTTCCACATATGGGCT
TCCAGAGCAAGCATGCCCTTAAATAGAACCTGTAGAAGTGTTACTTATTA
TATCGCTTTCAAATGCAATAGAGTGTCCTATTGTGCCTTGGACTTGAGAG
AAGTTCATCAAAGTGCAAGAATTAAAACCAAGATGGCAGGACTTAAAGTG
TGTAAACTATGAGATAACTAAGCTTCTCTGGAAATATGCATGAAAACTTG
TGCTAAGTACAAAAACTTAAGTTTTATTATCCATACTGGTTAAATATTAA
CTTTGACCATCAATTTTTAAAAGAGTAGATGTCTACCCTGACTATAAAGT
TCTAGTTTGCTACGTAACACTCAGCAATTTCCAGATAAATCTCATATATA
ATGGTTAAATATTAACTTTGATCGTTACTAAAAGAGTAGGTGTCTACCCC
GTCTATGAAAGGAAATGTACTTTCATAATAATATGCTTTAAATGATTCTA
TTTAGCAAGTTATCAGTCAACGTGACACCTTGTAGTCTTTGGTCTTGTCC
GGCAGAAGGCGCACTACACACTTATGTTTTGGTATTTACTGGTTATTATC
GCTGTCCTTTAGCTATCAAATTTCCTTTTCTTCTTCTGTTTTCCTGTCCC
TGAAAATCTGTTATCGTTTCATGCAATGCTTGTGTTGGTGTTTGTTCCCT
GTACAATATTGTCATTTTGGTGTTGTCAAGCTATATGGGTAATACTAATG
TCCAAGTTCAACTACTTGTTTTGTCAGGCGACGTGAAAAACCTTATCTTC
TTATTGATTTCTCAGACTATTTGCATATAAGTGTGTAAGTGTAGTCTCAT
TCATGTCCTTCATCTTGCAGTTTTGAGTGAAAGGGCTTATCTTGATTTAT
GTTTCAGTTATGTCCTAGGTGCTGTTTTCCTGCAGCTTTGTCAAACATTG
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CATCCACCGTTTTACCGAACGTAAGTTGATAGCATATTCTATTCTATTTT
TTATTTTTTTGAATTCCTTTATGACATACATGTGCATTCTTGTATATAAG
ATATAGAGAACTTCTTGTTACATACTATTAATTAAGGATTGTGGAAGCAT
TTGCAGTTCTTCACGTGTTTCTTATGTTTGTCATAATGTAGTTCTTTGTG
GGGTCTAGTTACACAAATCTTTTTTTTGTATGGGACATAGGACATGTTTG
GATCTCTTGATTGCGTTGTTAGACACGGAAATATTAACACACAGAGAATA
ACTTAAGGAAGCAAGGTTACAAAATCTAGATGTTTTTTTTGCATTGAAGA
CATAAATTAGTGCGCCTTTTTCAGAGAAGGTTTTATACTCATAAGCTATT
AATTTCAAACTCTAAGGTGGACAACAGCATATTCAAAATATTTTTTACAT
AAATCCTGGGACCACAAGGGTCAAGATTTTCTTTACCTGTCATGGGTTCG
AGTTCTACTAACCATATATAGACTTCATTTGGAAAGCTGAAAGGACAATT
ACACTGGTTGGCAAAGAGAATCAATGTGCTATTAATTGTTTGTGATTTTG
CTTCGTTATTGGTAATTTGTAGGTTTATTGGGAAAAAGGGACAGTGCTGT
CTCAGACACAGCTCTACGCCTCGTAGCTAGCATGAAGCGAGACTGGATGC
AGGCTAGTATCTTCATCATTTTAGCTTCTTACTTAGGTTCTTTAAGGTTG
TGATAGCTTTTCCTGTGTTGCAGACTGGGAGGAAGCCAAGTGGTGTATGT
GGTGCAGCATTGTATATTGCTGCACTTTCTCATGGATATGATTACTCCAA
GGCAGATATTGTAAGCCCAAATGCTTGAACAGATCTACTTATTCGAGAAT
TGTGTTCTGAATGTCTTTCCTTTGTAGTAATTAGTGCTTATTTCTTTTTG
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CAAGAAAAGACTTCCAGGGAACAAAATTTCAGATTAGCATTCGATCCACA
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CTACTAATCCTAGCATAATTTGAGATCAGATACTATTTACAGTGCACATT
GTCTTTTGTTTTTCAAGTGGGCAACGTATCAGGTGAAAGCGTATATTCGG
TGCAAATCTGAAAACTAACGACTGGAGCCACCGATCTCAGATGGACTGTC
CAGATGCAAGGTGGGATGCCCTCCGGCATTTAATATGTATTTTTCGAAAA
CCCCCCTGACCCATGTCTTTAGACTCATCGCCTCCAGCAGCAAAAGCCTA
TCGGAGACCAGAGACGGCGGTGCCCATCCCTGTACATCATCTCACCTCTG
GTTAACCTGATGACGCCTAGAACTCATCCTGGCATTTCTCCATAGTTATT
GCGCGTGCCGTACCTGCATATCATCTATCTTGTGCCGCCTCCCACTCCCC
TTATTTCTCATCCCTCCCTGTACTAGCCCTGAGCAGGACATGCCATGGGA
TGTGGTCCTTAACTCGCGTTATCAACGTTTGGCCCTTAGAAGGTCAAATT
TTGCCTCTACAACTACAAGATACCCTGATTAACAAGATCACACAGATTGT
GTCGAGTCTTATTCATGTATTACCATCTGGATCTTAAATTGCGTGCGAGA
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ATTGTCATACCGAGGAATTTAAATTCAAAATTTGATTTTCAAATTCGTCT
GGTAACCGGTTGGGATTTTCTGGTAACAGAGCTAACCGGAAATCCTTACC
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GCCTGCTGGTTATCGATCCACTGGCGGTTGAGGAGGGGTAGCGCCATCGC
GTGGAATTTTCAAGGGCGTCACGCAGGATGGGGGCGTGGCGTGACCGGAG
CGACACCATTTCTTGCTGGTTGCCGGCTAGGGCATGCTCTGAGGTCTGAG
GAGTGGCGTATCGGACGAGAAACGTGGGTGGGAGGTTTGGTGCCGTCATT
TTGTTAGTCGCTGGGCTTGGTTTTGGAGAGGGGACCAGGAGTTGGACTGG
ATGACGGGAGGAAGAAGACGGTTTAATCAATGCATTATGATGATAAGTCA
GGGTTTTTCAGAAACTATCTGTTAAGTGGTGGAGCGCACCCCCACCTCGC
ATCTATACAGTCCATCTGAGATCTGATGGCTCTGGTCACTAGTTGCAGAT
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AAAATTAAAATTTTGAAATCTTGTTTCATGTCCGGTGCATATTTTGTTAA
TGTTGTCAAAATATATCAGAATTTTTGTGACTTTTTGGTGGTGCTATTGT
ACGTTGGTAGCACGGTAGCATCAGAAGGTAGGAAGCACCAGATATGTGTA
ATGTAAGGCTTGAATACTAATTATGTTTTATCTTTTTCAGGCTGCTGTTG
TGCATGTTTGTGAGGCGACACTATTTAAGCGCTTGATAGAGTTTGAAAAT
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ATTGTGGGCTGTCTATTATCAATTCTGCCAGCTGCTGTTCCACATCACAC
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TTGAGCTGATGACAATGATGCTCCAAGTCCATGCTGTTTACGATAGACAG
TGCAAATGCAACTGTCAATCAGGATTAGAGATAAGAAGGTGTTTCAACAT
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TGAAGAGCCAGTTCCAAAATGTTCAGCCAAGTCTGGAGAAGTCCTTTGCA
AGCACAAGGATAAGGGTGCAGAGCATTTTTCTCATGGACTTTGTGAGGAA
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GATACTTTATTGATGACTGGGATGACTCGATTGCTCAGTTCGCTGAGCTG
TCAGGTGGACTGGAAGGTGGTGCTGACCCTCCAGCCTTCCAACGAGCTGA
AAAACAGAGAGTGGATGCTGCTAAAAGAGCTAATGAGTTACATAGTTCTG
ATGTTGAAGATAACATCATGGACCCTGGGAAGGTAATATTCCTGAACATT
CTTAAACGCAGCCATCTCCTATGCAAAAATGTTAACGTAGACATTTAAAG
AAAGAAAAAATGCAAGTGCCCACGTAAGCGTCACAACTGCGTAAACTACT
AGTTTAGGGGCACTTAGAGAACTAAAAGACATTACTGATTCACTTAAGCA
CCGGTCTCCAAGTTAAGCGTCGATGCCAACCTTTCAGTTGGGAGTAAATC
CCTTGCAAGCTAAATTACTTACAAAACCCTGTTAATCTGAGATTCTTTCT
TTTGTAACTGTAATTCTCAACTATTGTTTTACACTCTTAGTGTTCACTAT
TTTTAAATTATATTTCATCATTCTTGCAAAGTTATTTGAAGATTTTCATC
AGTCGACTGCACAAACCCCTGACCAATCCAGTTCTATAATTTTTTACTCC
CTCTGTCCCAAAATATAAGGCGCCTATGGTTTAGTCAAAAGTCATCGTTT
TCTAAGTTTGACCAAGATTATACACAAAAATATAAATATTTACAATACCA
AATCAATATTAATAGATTTATCATAAAGTATATTTTCTTAATGTGTCCAT
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TATGATTTGACTTTTGACCAGTACTTAGGCGCCTTATATTTTGGGACGGA
GGGAGTATGTCTATTTATCATATTGCTGACCTGTTCTCTTTTTGTTAAAA
GGAACATTCAATTTCATCTCCATATTGTTTTTCATCTAGATATATTCCCG
AACTGTAGTTCAGAGCTTCAAAGCGAGGATTCCATCATTGCTATCCCACA
AAACTGTCTGCTGACAAGTATCTCAAATTATCTAGTGCTGAAGCTGCTTC
TCTTTATTTATATTTTTGCACACCTTCTATTGTACTCGAAGTAAGTTGCA
GGATGGGAACAAAATATACTTGCTACATCCAGCAACAACCTGGGATTTAG
CATATACCGGTCTTGTTGCTGCAATCATCCAATGGAACATTTGAACTGTC
ATAATCTACTTCATTGCTTAACTTTGGATTTGCTTGCATTATATCTTGTA
CTATATGTTATCTATTTATACTACACTTATAGTTCATTCAGTGTGATTGA
TGTGCCTGTTTTCTGCTGAATCAAATTGCAAATCTTTGGCAATAATATAT
GTGTCATCATCAGAACCGTGGAGGCAAATATTCGACAATTACTTCCAGCC
AAATTGCAAATGATTCTGTTGCTTCCAAAGATCCTGAAGTGGAAGGTTTG
TTGGTTCCTGTTATATGATGCTCTACAACAACAAATTTCAGCGTCCTTTC
TCCTTTTTTGTTTGTATTGACAATCTGATTGCTGATCAACTCGATGGATG
CTATTTTGCATAATTAGGTGAAAACGATCAAGCTGATTCTGATCCAGAAA
ATCTTTCTGATATTGATGATGTGGAGGTACATTTATCCATCTGATAACTG
ACCAATTCGTTGCAGCCCTTGTTAGAGCCTGAGATTCGATTGCTCATTCT
GATTTCAATATTTTGGTAATAATTTTGCAGGTTGACGGGTATCTTAACAA
TGAGGAAGAAACACAGAACAAAAAGATTATCTGGGAGGAACTGAACAAAG
AATACCTACAGGTAGTTATCACCATGAGGCAGTTTCTTGTTCTGACAACA
TGGTGTAAGTATTTGCTGATCTCCTTTATAGGAACAAGCTGCAAAGGAAG
CTTTAGCGGCTGAATTGGCAGCTCATGGTGTGTCTGTTGGAGGGGGAAAA
CAGAAGGTGTGGAATTTTTCTAGGGTAGAGCGTTTTATGTGCATATCTTT
AATATTACAGATACAGTTTCATAATTTTCTGGGACGTTCTAAAATGTAGA
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GAAGCAACATACAACATGTTGAAACGGAAGGTACTGGACCCTTTTGTACA
GCCATAGACATCTAAAATTTATGTCATGACTACTGTACCGGACTTTTTGT
AATTACATCTTACACTTGAAGTGAAAACACTAACGCTGAATATATAACAA
TGTTCCTTGCAGGGACTTGGGTCAAAAATCAATGTTGAAGCTGTTAATGG
ATTGTACAATGTATGTTTTCTTTTTTTATGTTCACTGGAGCTTGATGTAT
ATCTTAAGATTCATGCAATGTTATTTTGTAAATACTCCCACATCAATTTT
TTTTACTCACTTGTTATTGCCTAAATTCTTACTGAGACTATGCGTGCAGA
CTGAAGACAAAGATGTCAAAGCAAATGGAAAAGACGACATACACTTTGAT
GTGGAACATGAACAGGATATTGATGACGGTGAAACATTTGATGCTGGTTA
TGACTATGGTCATTGTGCTGATAACAACAATGATGGCTACGTTGATGATG
GTGGTGGTGGAGCCTATAATGGTTATGATGACGATGATTACTAGTACTCC
ATCTGTTCACTAATACAAGATGTTTTGGCAAGTTAAATTAGCTTGCCAAA
ACGTCTTACATTAGTGAACAGAGGAAGCAGCTTTTTTCACGAAGTTGCAA
GCTGACTAAGACTATTCAGAATATCAGATGTACAGATAGTT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.