Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA024690

[Submit comment/correction]

Sequence	AA024690
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA024690
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	GAACGTTTTCACCAGCGAGAGGCATCTCCGCCTCCCACGCCGCCTCGCTT CCCGGCGAAAGCCACGGCCGCCGCTTCCGCCTTCCCTTTCCTCCACACCG CGTGCTCCGCACGTAATCGCATTAGTGCCTTCCTCCTCCCCCCACCCCCA CCCCCGCGTCGCCGCCCGGGCTGATGCTGGTACCTCTCGATCTGAATTGC GCCATCGAGGGGGCGGAAGTAAGGAAGTGTACGGCTCGCAATGGCGGTTG CTGCGCTCCTGCGCCGGAGGGCTCTCTCTTCGTCGTGCCACCATGGTCAG TGTCCGCTTTCGCTTATGGCATATTTATTGGGTTCCTGGCTGCCTGGGCG TCCTGTACTCTATGTGCTTGGTCCGTGGTGTCTCATGAGCTGCTGATTTC GTCGCGCCCCCACCTGCTGCACGGTGTGTGTTCGGCTGAATGCCCAAAAC CAGGCTAGCGGTGTGTGGAATGACTGATGTCACTTATCAGTATCCATTTG AAGGTCAGCTTCACGCTGCACGTTTGATTAGAGATGGAGCAGTTGAGTTG GGCAACGGGCTGCAGTTATTTGGGAAAATGGAAGAAATGGAGATACTTTA TAGTGTTGGTTGTGGCCGAGTGTTGTTCTGATGAGTAGAATGTAGCTAAG GATTTACCTTTTTGTGGAGTACTGCCTTGGTTGCAAAATAGTTGACGTCC TAGAAAGCATCTAACCAAACTTCTTTAACTTTGACCATCGATGTATGAAA GGTAACTGAGATTGGTCAAATTAAATAATCATATTATCGCTTCATTATAT TTGTTGTGGGAAAAAATTCAGGCTATGCAATCTTTTGTTTTTCTTATCAA CTTATTCATACCGAAAATAACCGGTTGTAGATGCATCTTGGAGACTGTGT CCATATCTTAAAACATCATTTACCTTGGAAGGAGGGAGTATAACCTTGTG TTCTTATGATATTACTGTTCGACACAATGAGAACAATTATATTTGGGGTG AACATGTCATATACGGAAGGCTGGAAGCCTAATTTATTGTGATTCAAACA ATCTTACTCACTTCTGTAAGCACGTTCAACTCCGAGCGCTATCGGCCGCA CATGCAGCTTCTCCCTACCATGTTAGGTAGAAATAGAGTCAGGGAGATGG TGCTTGCGGCTGTGCGTTAGTCACTTGCATTTGTGATTTACCGATGTGGA CTGTTATTTTGTACATCTCTGCAATATGCTTTGTTGTGGTATCAAGAACT TTGGTTGGTTGGTCCATTGTACAGGTTTCCATTTGCTAAGAGTTTTGTAA ATATCTTTTGTGTACAGATGTTTATATTCGCTGCATTCTCTCCTATTCTG GTCTACATTCATTGGTCAATTCTGCCAATTTGAGATTTTGGAGGGGCTAC CACAACTCTGGAAAGTTTGATTTTACTGATATGACGTAAGAATACATTTT TTCTTTTTAATCACCAAATATCCAAGTTTCCTCTACATATTCTTGCCAAT GTACAAGTTTGTGCATTATGTGCCGTACTACCATATATTGAAGGATTCCA TTTTAAAACAGTTGTCCCGTGCGGGATGCTGGTATCTGACAATTCTTATT CTAGTTTAAGTATGACAACTGGTGACACAACAGTGGTGCACATGCTACTT TAGTTTCAATTAATTTACTTAAGCAATTGTCATACCAAAATGCAATGTAA GTCTTCGAGATTAATTATGTACCAAGATATGTTGTAAAGCACTGTTTGTT TTCTCATTTTCCATACTACAAAGACTTGATTAAGTTCTGTGCTATTTTGA ACAACAGCCATCCTCATTTGTGGTACCCAAATGCCCGAGAAAAGAAGCGT AAGGTATTTTTACATGTTGGTCCTACAAACAGTGGGAAAACACATAATGC TCTCAAACGATTAGAAGCGAGCTCTTCAGGTACTACTTTGATCTACCCAG TGAAACTTTAAGAGCATAAAGTTTTAATGACTGCTCTGAGTCCTAACAAA TGATGTAGGTGTGTACTGTGGACCTCTAAGATTGTTAGCACGGGAGGTAG CAAAAAGATTAAATGAAGCTAATGTCCCTTGTAACTTGACTACTGGACAA GAAAGGGAAGAAATTGAAGGTGCAAAGCATAACTCAGTGACGGTTGAGAT GGCTGATGTGACAACTGAGTATCAGTGCGCTGTCATTGATGAAATTCAGG TATGTGAAGTTACCCAAATTTTGTAGACTTGCTAGGAAGATGTATATTCA TATTATTATTCTGTAAAGAAATGTAAATCGTAGTACAGATAAGAATGTAG AGACTTATTGAGCTATTTTGTACTAAACCATCCAATCATATTTTCAACTG TTTGTGAAATATTGTCAATTGTCCTCATAATTCTCATTTCATTTGCTTTG ACGTAGTAGATGGTTGGCTGTAGAACAAGGGGTTTTTCATTCACACGTGC ACTTCTGGGGATTTGTTCAGATGAGCTTCATGTTTGTGGTGACCCAGCTG CTGTTCCTATTATTCAGCGATTGCTTGAAGCTACTGGTGATGTGGTTACG GTAATTTAACTAAAACTAACCTAATTTTCTGATGATCGTTGATATAGTAT GTACTTTCTGCTACGCACATGATAGTTGTCAAGTAGAATTGTATTATGGT TGCCAGTTATGTTCCTCTGCCAGGATAACACATTAGTTATATGAAACTGG ATTTATTCACATGGACAAAGCACTTGGTCCTTTTTACGAGAGTACAGGCA GTTTAGCACTCAGTGTAGGTAGGATAAAACATTAGTAAATATCATGTCCA CATGTTTTCAAATTGTCTCCCAGTTCAGACAGTGCTTTTCTGAACTTATC ATATTTCACATAGCAAATATCCTAACATGTTCGATCTATGTTGCTAACCA GGTTCAGTATTATGAGAGACTATCTCCTTTGGTTCCTCTGAAGACTACAC TTGGATCTTTCTCTAACATCAAAGAAGGGGATTGCATGGTAACATTCTCA CGTCGCGAGATATATAAGCTTAAGGTTGGTATGCTTCAAGGTACTGTTGT AGATGCTTAGTTATTTTTGGGAACATGTGATAAATATTATTTATCTGATT TCTTAGACATTTCCAAAAGAGTGAAGTTAGAGGACCGCACAAAACATACT GAGAAAGTCTCACTAGTTTGGGGAAAAAGTTTAGAACCTTGAACGTCAAC TTTATTCATCCTATCTGCCCAACTGGATCTCAGCATGTAAATTTGAAAAT GATCCGACCCTTGTGCTGTTTATCTCTCTAGCCAGTTTTAAGTTTTTTAC ACTGTAGCTTTTTATCTCTCCAGAAAGAGAAGGAAGGGACAAATGCGAAA GCAATGGGTTTGTATGATAAACTTTATTCTGTGGGGCTGTTGCCTCACAG TTACAGGTCAAAAAAATTACTATGGCAATGCTAGTTATGTCATATGTGAC AGGATAGATAGTCTCGTTGACAGCAGATTACCAACCCAACTTTTTTTCAC GGACGCAATTTGATGTAACCTGTTTTTCTCATTAGCAATTACCCAAAGTT CTCCTTTTACTTTTTCATGATATACATGCCGGTTGGATATTCCAAAGAAA TTTAAGCAGTTAAAGTAAAAAATGCAAACCGGCCTACTCGAAAGAAGAAC CAAATAAGCCAGGGCTCTCCAGTACTCCAGTGATAGATTCGCTGCTACTG TAAAAAAAAAAAGACTTGGTCCAGTGATCCTGCACTTCCTACCCTAACCC AAGGAAAACTTGATGCTCATAGTGACCTTATTACTTACCATTGTTAGCTA TACCAATGGTATGTGGCTATGTGCCCAAATACATGGCATTTTTTCTTTTG AATAAAGAATACACGACATCGATGCATCATTAATCTGAAGTTTCAACTAC CTATCCTACACTGAATTTTGTCACATGCAGAAAAAAATTGAAATGGCGGG AAATCATCTTTGCTCTGTAGTCTATGGCTCTTTGCCGCCAGAGACACGAA CGAAACAGGTAAATATATTTACATTTGGTGTTTCCTAGCATTAACATATA CCTCGTTGTCAATCATGTGTCTATAGGTCCTCATATAATTAGAAGGTGAA ATATCGCACTTTCCATTTGAACATGTTGATACATACCAGCACATCTGGCT GAATATTGATTGACAAACAAATATTTTACGTGATGGTTGAGTCACAACCA TCGGAACCATAAGGCATTTTTTACGATTATGTATCCCACATTACCAATGC TGCTTTAGATGCTTTGAAATAGAGCATACTGTTCAATGTAGGAAGATGGA CTTTGAGTTACTATATTGTTTCTTTTTACCTGCTATTTGTGAAGATCTAA ATGAGCACCACTCTTTTTCTGTTTCTATGATTTGTTGATGCAACACGCCC ACAACTCTTAGCAAGAACTAAGAGATTAGGAGTTATGGTTGTACGTTCAT TTGCTTGCTTGTCATACTTTATTCTTGACAATGGCATGATTGTTTGGATA AATTTGTTAATCTGTTCCCTAAGCTTGCAGGCGACAATGTTCAATGATGA AGCCAGTCACCTAAATGTGCTAGTGGCTAGCGATGCTATTGGAATGGGTC TTAATCTGAACATTTCTAGAATTATTTTCTCTACACTGGAGAAGTTTGAT GGTGTCTGCATCAGGGAACTGACTGTGCCTGAGATCAAACAGATTGCTGG TATTATATTTGCTTCTTAATTTTTTTATCCCTGGCAGTTTTTTCTTCCGC TTATTGCACACGCCTCTTGAGGTGAAACTGAGCAAATTCTGCATGTCTCA TTTTTTTTGTAGGCAGAGCTGGGAGATATGGGTCTAAATTCCCAGTTGGC GAAGTGACCTGTCTAGATGCTGAAGATCTCCCATTACTACACTCGTCTCT GAAGTCACCTTCCCCCATTATAGAGGTGTCCACCCATTACTGTGCAACAT ACTGGTTCCACCTGCTATATGATGAAACTTTCGGAAGCTCTATGAGTCAC AGTTAGCAAAGCTAACCACAGATACTGCATTGTTTTATCTGCAGCGTGCT GGACTTTTTCCCACATATGATTTATTGTCCGTATATTCACGATTGCATGG AACCGATTTTTTTCACCCTATATTGGTAAGCTAAACATACCATGTTTCTG TCTATTGAAATGCATTGATGCAAGCCAGAGCAGCTTCATACTTTTATAAT GTTGTTAGGTGTCAACAGCAAAGATAAATATTATAGTAAAAAATAGTTTG ATGATGATATCATTTTTGTTTTGCTACTTTGGATGGCACAGTGAGTTACT CTGATATTGTATAGCTATCAGAATATTCTAAGCACTTAAGCTTCAAATTT TATTATTGTGGTTAGTGCGATCAATTATGTCAGTGATGTACAATAATTTA GCTATATATTGAGTTATTTTGTCGCATTTGTTTGGAATTCAGCTTGACAA TGCTTGTTTACAGGTCACAGCAATTATAAAGTAGATATTGTTTTTTCTCT ATCTACCTCTTGTTCAATAATGTCTGCTTTCCCATTGAATGTATCTCAAT GCTCTGTGCCTATTTGCAGCTATCCCCTGGTCAGAATTCAGGAATATGCC TTACCCTTTTGTTTTGCTACAGGAACGTTTCTTGGAGAAGGCTAAACTTT CTCCGGACTATTTTATTGCTGATTGTGAAGATATGCTGGTATTTTGCTTT ATTAAATAACACAGTTTTATCTATTTGGTCAAATTATCTACAAGTTAATC ACCTGGATGGAAAAGCACTGACTGTGTGACTGCCTTTCTTTTTAAAAAGG CAACAACTTAGCTTTTGTATTTGGAGTAAATAATAATAGTTAACTTTGTA TAACTTATTTACGTCTGCTGTTCAGTTATGGGTTTAATATTTTATTTAGT CACATTTCGCCTTCCCGCTGTTAACAGAAAGTTGCTGCTATTGTTGACAA GTTACCTCTTGGGTTGTACGATAAATACCTCTTTTGTCAAAGGTGATTTA CTATGATACTAGACCAATATAATCTCTGTATTATCATCATACATTTTCTA CGTTCTCTTTGCTCTATATCTGCTGTCAGTTTTCTGACATCTTGAGTTCC TGACCACTTTCTGGAACTTCATTGCAGTCCAGTAGATGTGAATGATGATA TATCTACCCAAGGATTAATTCAGGCAAACATTTCTACCCTAATACTGTTC ATTTATGTGTTTTTTGTGTGGAACTATGAAACAGTTTTACTCCTTTTTTC GAGATGCAGTTTGCAGAAAATTATGCAAAGAAAGGCATTGTTCGACTTAA AGAAATATTTACACCTGGAACACTGCGGGTACCTACAACACACAATAAAC TCAAGGAGCTTGAATCAGTTCACAAGGTTAGTCTATATGTTTCTCTGTTA TAAATTATGTCAAGAGAATACTTGTAACTTGCCAGTCAATATCAATGCTA CTCTATATCTTTTCAAGGTTCTTCTGAACACAAATTAGCTTGTTCTTAAA GTTCATATTATGCAAAGGCAGTAAACATGTGCATTGTCTATTCTGTTGTG AATGCAGGTGCCTTCCATTCTGCATTCATATAAACATTTTTTGTACCAAT CTTAATGAAGTGGATTATCCCATATGGTCCTAAGATAGAGACATTAAAAT TAATGTATGAAAAGGTTATTAGTAACAAAGTGCTTGCTGTTGGGTTGTTA ATATGATGCAATTACTGCCCATGATGCATGTTGCGGTTAGTACAGACTAT CTGAGAGCCAACCACTTAATAATTTATCGCAATGCTGACCCTAGAATTCC TAAGGAGATCGTAATATGCTTCTCAAAACAGTGGTGTATCCATAATTTTA AAAGGGGAGGGGGAGGGACTACTGTGAGGATCGAACCCCACTGCTCCGGA GCATAGGACAACGCCCTCAGCACTGAGCTCATAGTCAGTTCTTGTGGATC CATAATCTTGTTACTTGCAGGACCTAATATGTCATTACATAATTCAGTGG GGGTTTATCATTTATTCTGTTGCATTGAGTTTTTGAAGCTTTTTGGGGGA AAAGATTGTTTTAGACACTTCGATCTCAGGCAACCGTTACTTTCAAAGAG TTTGCAGCAAAATTAATTATGTAGGTTTCATCTAGGTACGCCACTCTCTC AAGACTTTCTAAAATGAGATTAACGCATTTTTTATTGCTTCAGGTCCTAG AGTTGTATGTGTGGTTAAGCTACAGATTTGAGGACTCTTTCCCAGACCGT GAATTGGCGGACTCCCAAAAGTCAATCTGCAGCATGTGAGTTCCATATAG AATTTATTTTTTCATCATTTTATTCATAAATTATCTGCAGGTCTAATTGG TACTGTCAGGTTGATTGAGGAATATCTTGAGAGGTCAGGATGGCAGCAAC CAGGACAAAGAAGGGTTTTGCCTAGTCTACAGAAATTAAGCCAAGAATAT GACACACCACAATTGTATGACATTTCTCCATAAATTTCAGATATTATTTG CATTCTAAGAGAGGGTTTACTATGCTAGACATGTTCTTTAGCTAAAAGCC TGGTTTCTCAACCCAACTGCGGTTTTCACGAATCTGCAGTTAACTATGAT CCCCCTTTTAGATAACTACGGATGGTTAAACAGAATCTATCACACATCTA TTACAAACACATGTATTATCATGTCAAGTCATTCTGTTGTATTTTCCTCA TTTCACCTTAAAATATTTTTTGTCTACACCGACGTAGTTGATCTTCTCTG TGAAGTTGTTATGAATTGCACTATTTGTTAGTGGGCTCATGTTTTTGCCC TTTACTTTTTTGCTTTATGTTTGGTGGGAGGATGCACTCACTGACTTGAC ATGAATAGAACTGTGCTAAATTTCTAGAGGCCTTTAAAAATGTTGGGGTA GTGAAATATTGCGTCATTTATATGGCATAACTGTTCTATTGTGCTGTCAT TACAACATGTTTGCATGCCCTTTTCTTGCTGTGTGTCTCTAATGCACTTT GACCCCATAATATTGTTGTCCAAAACTTAAAAGGTACTATTGTTAAACTT TCATCTCTTTTTACATCCACGAGAATGCTGTTAGTAATATAATTCATTGC TTTCCTTTTTCTTAGAACAATTTTCTTTATGTATCTTTCAAAAAAAAAGT TGGAGTAACCATCCTGAGGTTAATGAACAGGCGCAAGTATTTCCCAGAAA TTGATGCAAGATCAAAATAGAGGCCGATACAACAAAAGGCACCTCACAAC ATTCAGTCAATATTTGAGCAAATGTCCAGGGCATGCATCTGGCTCTTCCT GTTGGACGTGATTACTGACAAGCAGCGGTAATAACACGTTTTGTGTGGCA GAAGATCTACCTGGACTCACCGTGGTCGTTGAACTTGACCTCAGGTTTAG TCCATGTGGTAGCGACAATTTTTATACTCCCTCCGATCCATATTAGTTGA CTTAGATTTGTCTAGATTCGGATGTATCTAGCACTGAAACATGTCTAGAT ACATCCGAATTTAGACAAATCCAATTAAACTAATATGGGTCGGAGGGAGT AATTATATTCTTTCAGTAGCACTTCCTGGATCCTGTACCTAGTACGAATG GAGCTGTACATTACAAGTAAAATATGAGATACAGGCATAAATAACCATTT GTCTTACTGCACGGCACTAACTGATACAGTATATGCAATGAGATTCTAAT TTACATGTGTATCTTGAATTTAGAGACAACGCGGCTGCAACTCGATGTGC TATCACAAAGACGTGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.