Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA024185

[Submit comment/correction]

Sequence
AA024185
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA024185
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGGATCCGCAAGGGCAGGCGCAGGCGCAGGCGCAGGCGGAGGCCGATGC
GGCGGCGGTGCTGGGCGCGGACCCGGCGCCGCTCACGGCGCTGCTCGGGG
ACCTGGTCTCCCCGGCCAACGAGGCGCGCTCGCGGGCGGAGCGGATGTTC
CACTCGCTCCGCGCCTCCCACCCGGACGCGCTCGCGCTCCGCCTCGCCCA
CCTGCTGCTCTCCCCGTCGCACCCCTCCGCGCCCATGGCCGCCGTGCTCC
TGCGCCGCCTCATCTCGCCGGGCTCCCAGGCCTTCGTCTACCCCGCCATG
GCACCCGCCACGCAGTCCTCGCTCCGGGCGCTCCTCCTCTCCGCGGCCTC
CGCCCCCGCGCTCTCCAAGTCAATCTCGAAGAAGCTCTCCGACGCCGTCG
CCGAGCTCGCCACCTTCCTGCTGCCCTCCAACTCGTGGCCCGATCTCCTC
ACCTTTCTCTACAAATCCATCGCCTCCCCGTCCTCGCCTCCCGCGCTGCA
GGAGTCGGCGCTCAACACCCTGGCCCGCCTCGCCTCCCACCTCGCCGCCG
GCTTTCCCAACCTCCACGCGCTACTCCTCGCCGCGCTCTCGCACCCTTCG
TCCGCCGATGTCCGCGTCGCGGGGCTCAACGCCGCCATCAGCGTCATCCA
GTCCCTCTCCTCCGCCGCTGACCGCGACCAGTTCCAGGACCTCCTCCCGG
CCATGATGCGAGCCCTAGCAGAGTCGCTCAACTGTGGCAACGAGGGCTCC
GCGCAGGAGGCGCTGGAGATGATGATCGAGCTCGCCGGTGCGGAGCCACG
CTTCCTCCGCCGCCAGCTGCCTGACGTGGTCGCCTCCATGCTGCAGATCG
CCGAGGCCCCCGGATTGGAGGACGGCACACGCCACCTGGCCGTCGAGTTT
GTCGTTACCCTTGCCGAGGCAAGGGAGCGTGCGCCTGGGATGATGAGGAG
GCTGCCACGGTACGTGGGCAGGCTCTTTGCGGTGGTCATGACGATGCTGC
TTGATGTCCAGGATGAACCCGCATGGTATGCTGCGGTGACAGAGGAGGAG
GATGCTGGGGAGACCGGAAGCTTTGTTTTTGCGCAGGAGTGTCTTGACCG
GCTTGCCATCGCTGTCGGCGGGAATACGATTCTGCCTGTGGCTGCTGAGC
TGCTCCCATCGTTTATCGGCGCTGAAGAGTGGAAGAGACGGCATGCGGCG
CTGGTGACGATTGCGCAGATTGCAGAGGGCTGTGCTAAGGTGATGACTAA
GAATCTGGATCAGGTAGTTGGGATGGTGCTGAATTCCTTCAAGGATCCTC
ATCCTCGTGTGAGGTGGGCAGCGATCAATGCAGTAGGGCAGCTTTCGACG
GACCTGGGACCGGAGTTGCAGAACCAGTTGCACCATGTGGTACTACCTGC
ATTGGCTTCAGCCATGGATGATTCCGAGAACCCACGCGTGCAGGCAAGTG
ATTGCTGAACATTTGCATTCTAACTCATCTGTATGGCTCCCCTTTCATTA
TTATTTCTTCTACTACCCAAATTTCTTAAAGAAGTGATAATCATCATATT
GTGTAATCCACATGCTTGCTACATTACCCTACAGATCACTCAGATGATAC
TTAGACAAGTGATTGCTATAATCCAGATGTTGCTAACAGCTTTCTACATA
TTGGTTGCTGGATGTTTGTGTTTGTCATCATGCGTTTAGAGACAATTTAC
ACTGACTAAGTCTATCCGGTTTTGAGCCGTGTTCTTAATTCCTGAGATGT
TAGCCTGCATTCAGATCCTTTTTGGGTTCTTCCTGATATGGATGCATTTA
GCCTGCATTCATATGTAGAAGTCATGAATTACGTAGAAAATCTATGAGGG
TAAAATTTGTTGTGTGCAAATAATGATGATGACCAAAGAGTATCTACTGG
TTGTAATGTGTAAATTCTATTCGAAACACTAACTGCTTCTGAAGACAACC
TAAATGAGAGTTAAGAAGCATCTCCAATTTCTAATGTCCATATGTGCAAT
ATCTTCTAGAAATGAATTTGAAAGTGGAGACCAGAGAGATTCAATAATCA
TTTTTTTCTCTGAGAACTTCACTTAAATCAAAATGTATAGCACAAAGTAG
GGTCTAGGCCTCTAAGTTGGCTCTTGTACTTATAATAGCATTTAATTAGG
GAACGTGTACGTTGGAAGATATCATCCAACTTGTATCTTATCTATTATTT
ATATTGCTTTCAATAATGGCAACATCATAAAGATAAATACCACATCGTTA
TAGATCACCTGCAGAAATTCCCAGGGTGTTATTTGCACCTGTCTTAGAAG
GTTGGTGTCTGGATTGTTCGTTTGTTGCTCTTAGGTGTTTATGTAGCCGC
TAGGTATACGTTTTGGTAGTGACCATAAGATGTAACTTCTGCTTTCTTGG
ATATGTACATGTGATAGAATGTTCATGAGACCATCAAGTAATCAACAAGG
CATGCTCTAACATTTGGATTGCATTATATATTTCCAACGAGTTCAGGCAC
ACGCAGCTTCTGCAATTTTAAACTTCAGCGAAAATTGCAGACCTGACATT
TTAACACCATACTTGGATGTGATAGTCAGCAAACTTCTCGTGTTGCTTCA
GGTAAATTTTGCTTCCAACCTTGAATCTTCAGTGGCTATGTTATATACAT
GTGCTTAATTTGATACATATTTTGCAAAATTTGTTTGTTTTCCTTACAGT
CTGGAAGCCAAATGGTGCAAGAAGGTGCTTTAACTGCTTTAGCATCAGCT
GCAGATTCGTCTCAGGTACAATAGGAAATACCGTTGACGGTTTTCTGGTA
AATATTATTGCTAATTCGTTTCAAACATATTGCTTCAGGAACACTTCCAA
AAATATTATGATGGAGTCATGCCCTATCTCAAGGCTATACTCATGAATGC
AACTGATAAATCAAGCAGAATGTTGCGTGCCAAATCCATGGAATGCATTA
GTTTAGTTGGTATGGCTGTTGGGAAACAAAAATTTAGGGATGATGCTAAG
CAGGTAATTATTTTCTAGTTGCTCTGATTCATATCTATTTCATGTTGTGA
AAGCTTTTCAAGTTATTTAATACCAGATCTTAAATATCCAATTAGATTGT
AGAGATGTTATATGCAGTTTGTTGTTCTGATTTTATTGCTGACGTGTTCA
CTTGAATGTTATCAGCAAAATTCATTAGTTGGACCTTTGAGTATAATACA
TTTTGCTTGTTAGGTGATGGAGGTTTTGATGTCACTGCAAGGATCTCAGA
TGGAGGCTGATGACCCGATAACAAGTTACATGCTGCAAGTACGTTGGAAT
CAAAACCCAAATGGCAGTTATACGATCACTTGCGTGCTTACTTTGACTTA
ATCAAATTGTGATCGCTGGTGTGCCTCACTTTTGCTTAATCTAATTGCAT
TTGTAGGCATGGGCGAGACTGTGTAAATGCCTTGGTCAAGAGTTCCTTCC
GTACATGAGTGTCGTTATGCCCCCTCTACTTCAGTCTGCTCAGCTGAAAC
CAGATGTGAGCATCACTTCTGCAGGCGACGATGGTGAATCTGACGACGAG
GGGTATGTTTTAGGATTTCCATCCATGCCTAAATTGGTATTTGTCATATT
TTGTTTTCTTGTAGGGTGTAGGTGGGGTGAGGCGGGTTGCCTCTTTTGCT
TTCCAGCATGACCGCTGTGAAGTATTTAGGGTTAAGGTTTGGCGTGATCC
TCTTAAACAGGGTAACACACTTAACTGGGTTAGGGTCCTAGGGTCAGCCA
TATATGGCTGCAAACACAGATGATACCCATCAACCTGTTAGTTTGCAGCA
CTTGCAAACACAACTCAAACATGTTTCCTGCACATGCCGGTGGATGGTGC
TTGCTTTTGGACACCAGCTATCTGCACTTTGGAGTACGTGGTGAGTGGAG
GTCCTGGCTGTTGCACCACAGCAGTGGCGATGGTCGAGGGCATTAGATTT
GCTGGCGATGGTCGAGGGCATTAGATTTGCTGGCGAGTATGTGGAAGGCA
CCACCCGTGGGTGGTGCAGCGGAAGGGATGGGATGATTGCTTCAGGCATT
TGGGTTGTTTATGCCTTTGCGTTTCTCCTGAGAGGAAGACACTCCGAAGT
TAGGTCCTGGCTCGGTTGACCCCAGGTTTGGTTAGATCATGGCTGCCGTT
CACCCTCATTTTGTATGGGTCGGTCCAGTATGCAGTGGTGCCACAATTTT
AGTGTCGGTTCAGTGGGCCAAGGGGATGATGCCCCCCATCCCTATTTTTC
CTGTATTGATTTTTCATCCGCTGGTCAGTCACATCATGGAAATAGTGAAT
CTGATCATGCAGGCATGTTTTCAGTAGTTTCCTGTGTGCTTTGGCATGAT
GATGGTTGTGGTACTTTGGTTTGCTATTTGGAATTCACATGTGTAAGTCA
GATCCATACAGGATTGAAAGCCCACATTGACTTGTATCCATTTAGTTCAG
CCACTTTTTACTGAACCAGCTGAGACTATTACACCGAGAGATTTCTGCTA
GCCACACTTGTATGAGCTAAAAAAAATCCTTACTGCCTGTACGAAATATG
AATGCAGTGTTGAGACTATTACCCTGGGAGATAAGAGAATTGGCATCAGG
ACCAGTCTTCTGGAAGAGAAAGCAACAGCATGCAGTATGCTGTGTTGCTA
TGCTGATGAGCTCAAAGAAGGGTTTTCCCCATGGATTGATCAGGTCATGT
TGCCCTTCTAAATTAAAATTCATCCTCCCTGTCTCCATTTTCTCATTGTA
TGTGTGTGCGATGAGTTGCAGCTGAATCTTGATTTGTACAGGTTGCAACT
ACTCTGGTACCTCTCCTCAAATTCTATTTTCACGACGAAGTTAGGAAGGC
AGCTGTTTCAGGTTAGGGATCATTAATTTTGTTTTGTTTTTTCTTATTAT
TTACATATTCTCAAGCTGTATGCATAATGCAATGTTCACAGCGATGCCTG
AGCTTCTACGTTCAGCAAAGTTGGCAGTAGAAAAAGGCCAAGCTCAAGGC
CGTGATAATTCTTATCTTAAGCAACTATCTGATTATATAGTTCCAGCTCT
TGTAGAGGTTATAAATAAAGTAAGTACAGCATGCTAAGACTTTCTTCATT
CTGTTAGTTGGATTGTCCTTTGGTTTAAGCATTTTGTTCAAACTCTGTAG
GAACCTGAGACACAAATTTGCGCAAGCATGCTGGAGTCATTGAATGAGTC
AATACAGGTATTGTATTTTGTGTTACTGTACTTCGATTACAGTTACTTGT
GACACTGCATTGGAAAAGTTATGTTTTCTTCAGAAGCCTTGATATCTTGG
CTTTGTGCACAGCTAGCTTTTGCTCATTTTGACATATTTTTTTCATGATT
ATTCAACCTTACTCGACTTGCTAAAATTTACACCTGTGATGTGAGTGAAT
ATGGGAATATTGTACTACTCTGTGGACCTACTATGTAGTCTTTGCTGCAC
AATTTTGGCTGTAAAGTTAGCATGATTATGTCCATAGTGCTGTGCTGATT
GGTTCTTCTGCTAAAGGGTTTGGCGAACGTACTCTATGCCATCCTACTCA
TGCTTTTTATAACATCGAACAATCTTTATCTGCTAGTACATGTTGTCAAC
TCAGAAACATCTGTGCGATATCAGTTCTGTCATCTGTGGCGTATTCCAGT
GCACTCTGTGAGATCACTGATAAGTAGTAATAATCTGTAATCTGTTTTTT
TTTGTTCAGGTGTCAGGAACACTACTTGACGAAGGCCAAGTTAGATTTAT
AGTGGAATGTATCAAAGAAGTACTAACAGCAAGCTCTAATAGGAGGACAG
ACCGAATAGAGAGGTCAAAGGCTGAAGACTTTGATTCAGAGGAAGATGAG
CTACTAAGGGAAGAAAATGAACAGGAGGATGAAATCTTTGATCAAGTAAG
CTAACGAAATTCTAGACTGTAACTTTTGGACAACACAGCATAGCAGTACT
TCTATTTCTGATCCATATAGTGATATAGACAAGTGACAAGTATGTGTACT
GAAATCAAGGATTTAATTGGATGCCTCATTACTTACCTTATAAACATAAT
TAAAGCAATGAAAGTTGCATGCATGATTGTTTTGCACTTTTATCTGCTAA
TGCTAATTGCGAAGCATCATTACCGGTAGCTTACACAAGTTCACCCTTTG
TGATTTCACAGGTTGGTGATTGTTTGGGCACTCTGGTCAAAACTTTCAAG
ACTTACTTCCTCCCATTTTTTGATGAGCTCTCTGTCTATTTGACACCTAT
GTTGGTAAGTGAAATGATTAACCATGGAATTTGGAGGCTATGTTTCATTA
GCCTAAGAGTAGTTCTGAAAACTGAACTTTACACCCAAATTTTTTTTGAC
CTGCTAATGCCAAGTCTTAAACCATTCTCTGTTACCCTTTTGGTCATTTT
CAGATAATATGTCCTTAGACCCAATTGCTTTCTTAGTTATTCAAGGTTTC
TCATTTGTAATCCTTTCTTAGGATGTTTTCTTGTTTCAAAGGAAACTTCA
ATGTGTATACATACTCCTGTTCTGTTTTTTATGCGGATCTGATGACCCGT
GACCGTGACCGTGACCGTGATAACAACTACACATCTAATTGCACAAGTTG
CACTCTTGTTACACAATGCATTATGGATGGACCTCATAAATTTTAAGTTA
TTTTCTATTACTTTTGATCATTTACTAGGGCAAGGATAAGTCATCAGAAG
AAAGAAGAGTTACCATATGCATTTTCGATGATGTCGCAGAACACTGTCAA
GAAGCAGCAGTTAGGTAACAGCTTTATGATCCTCCTACTCTTTTCTATGA
GAAATTATTCTTAAAACCTTTTCCCATGAAGCAAAGTTTTTATGTTATCT
GTTCCTCAGGTATTATGACACATATCTTCCTTCTCTATTAGAAGCCTGCA
CTAGTGAAAATCCAGATGTTAGACAGGTCTGATTCTTTCAATGCACAGAG
GTTCATGTGTTAATATTGCATAATTTCTCAATAAGTTCTATCTAGAAATG
TGTGGGTTCATATTTAACCTGCTGTTTTCAGGCTGCAGTTTATGGTATTG
GCATCTGTGCGGAGTTTGGTGGTTCAGCATTCAGGCCTCATACTGGGGGT
ATGTGTTTTGCTTACTGTCACTCGGACTATTTTATTGTTACATTTCTTGT
TGACATCGATTATTTGTTTCTGCAGAGGCACTGTCTAGATTATACAATGT
AATCAAACATCCGAATGCATTGGATTTGGATAACGCAATGGCATATGACA
ATTCTGTTTCTGCTCTTGGAAAGATATGTCAATTTCATCGTGATAGCATT
GATGCATCTCAGGTACCGATGAGACATATGCCTTTATTTTCTTATTCTGA
GGTGCATTGCACTTTGCACCCCAACTGCATGCCTGCTTCGGAACACGTGG
TGAACTGGTGATTAAAATTTAATGTAGGAAGTATTTAACTTCAACTCCTG
CACTTGTTTCCTTGAGAATCCAAAAAGGCTTGGGAATGGGTATTGATGTC
TGACGTTAATGTGATAATACTGTCTCAAGGGTATCATGATCATTTTTTCC
TTAAGAAATAGCTGTGCTTGCTGAAAGCAGATAACAGCACCTCAAGGCTC
AAAGCGGGCACGTAGTGTCCAAACTTTGTATCGACTAGTCGAAAGCCTTA
AACGGGTGTGCAAACATTAAATGGTTTTGAACTAACAAAACTCGATGGAT
TTTAAGTTGAATCAGACTGTGTAATCATATCTAAAGTTAAACTTGTCTTC
CTATTCAACCAGTTAATGTACACCAATAGTAGGTTAACCAAGCAGGTTAT
ATTCGGATATTCTTCCTTTTATTTGAATTATTATTAGTTAGAATCTGATA
ATTCTCAAAAGTGAACTCATTGTCTACAACTCTACTATTTCTACTGTAAG
CTAAAGATGTACTTAATTGCAGTATTGCTGTCTTGCTGCCACTAGAGGTT
TTTTAAAGATATACATCTAAATCCAACAAATACTAAGATATTGTTATGTA
CTTCAAAAAGGAAAAGTGTAGTTCTTTCATCAATTGTTTGTTGGATCTTA
TAGGGATTGAATGTCACTTATCCGTGTCCTACTCCATTTGCCCCAAATGT
CAGATAATGGATTTTACCTCTTAATAGTTACTTTATTATTTTATTAATAA
CCAGTGCTTCTGACATGCAACACTTTTCAATTTTAACAGGTTATTCCTGC
TTGGTTAAGTTGTCTTCCATTGAAAAATGACTTAGTTGAGGCTAGGATTG
TCCATGAACAGATGTGCGCAATGCTTGAGAAGTAAGCAATAGCCAAAAAA
TATTTATTTCCATGGGATTGTGCAGTTTTACCAAGTCTCGTGTATAGAAA
CACCAAACTACATTTACTTAGTAGCATGATTATGTTTCTCTCTTACTGAC
CTTGTTGGCATGACTAACAGGTCCGATAGGGAGCTTTTGGGCCATAACAA
TCAGTATCTTCCAAAGATCGTATCTATTTTTGCAGAGGTATTCTTTTATG
TTTATTTCCCATTTTGTTTTGATTTGCTACTAAACATGTTACTTCCTGGA
TTTTTGGCACCAGAGAGGATTGCTGCCTATATTTGTATACTATTCTGTTT
GATGCCTTAACCTTTAGAAATTGATTTGAAATTAACTTTAAATGATATAT
AAGCTATTATTGAAATGTAGCATCCAATCCACAAATACGGGTACCAAAAG
CTGTCTGTCTTGTTAACAACTCAACCTCTAGATTGAACCTGAAACAGGGT
TGCTGCGACCTTACCTTACCATATGTGGATAATTAGGGCCACAGTGCTGT
CATCAGTAGCATGTGCTTTGGCAACCATTTGCCACACATTTCAATTGCTG
AATCATGTGTTGCTCTTTATGTAATGCTTTCAGTCATCTTTTCTTTTCTT
TTCTTTTCCATGATCCTATTTTAGCATTCACCACTTCATATTATTCTCCT
TCACAAATCATGGGTCCTTCCATAGTGACACAAGTTAACTCTTCATTCCC
CTGTCCATTGAAATTCTACATGGACCATGAATATAATATGCAAGTTTTTC
ATGGAATCTTGTCTATTTTTTTCACGAAACACAGCAGGAGCGCTGCCTAT
TCATTGAGTAGAGAAAAAATCTTATCTATTTTTTTCATGCAACAGTCACA
GGGCTATATTGACCCACAGTGGCTTCAGAACGTTAACACAGTAGTTTTTT
TAACACCATATCTATTTTTGCTGAGTGCAGATACTATGTGCGGGTAAGGA
TCTGGCAACAGAGCAGACTTCTAGCAAGATAGTTAATCTGCTAAGACAGC
TTCAGAGCACTCTGCCTCCTGCAGTACTTGCCTCGACATGGTCTTCTCTT
CAGCCACAGCAACAGCTCGCGCTACAATCTGTATTGACATCATCATAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.