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GrainGenes Sequence Report: AA006194

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Sequence
AA006194
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA006194
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGCGGGGCACGTCGCCACCTGACCTGACCACCGGCGTCCGGGCACGTGC
TGCTGCAGCGCACACCGCGTGCCTCCCGCCCCAGCGACCACCCCCGCGCG
TTCCTCCTCCTCCCGAATAAAAGGGCTCGCTCTTTGGCCTTTGCTGCCGT
TCGACACTGAAAGTAAGCTCGTGGCGGCGGCGGCGGCGACGGCGACGACG
AGGAGTTGGAGACGGCCGCCACGAACAAGCGAGGTCAGTACTGCCATTAT
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GTTCAATGGCAGCTTGGGTCTGGTTTATCTCGGGCTCGGGCTGTGGATGC
TGCTGGGGAATACCTTCAGTCAACGAGATGCCTCTGCTTACCTGCCACAC
TGGTGGCTTGTAACTCTATCTCAAGGGTTGATTTTGGCACTTGCCAGCTT
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CTTTGCTAAAGCTGGTTTTTTCAGCGAGATGTCGTTCTGGTGGCTGAATC
CTTTGATGAAGGCTGGCTATGTGAAGCCTCTGGAGGACAAAGACATTCCA
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CTATTGTTTCCTGTCACAAGCGTGCCATCTTGGTGTCTGGATTCTTTGCT
TTGCTCAAGGTTCTCACATTATCTACAGGCCCAGTACTCCTCAAGGCATT
CATCAATGTGTCGCTTGGGAAAGGAACCTTTAAATATGAAGGGTTTGCGC
TTGCTGGGATAATGTTCATCTGCAAATGCTGTGAATCGCTGTCCCAGAGG
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TATGAGATTGAAAGCCATGTCTGAGTCACTAGTTCATATGAAAGTTTTGA
AACTTTATGCATGGGAAGGTCATTTCAAGAAGGTCATCGAAGGGTTGAGG
GAGATTGAGTACAAGTGGTTGTCAGCATTCCAGCTTCGGAAGGCATACAA
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TAACATGCTATCTTATCAAAATCCCACTTGATGCTAGCAATGTCTTCACC
TTCGTGGCAACTCTACGTCTTGTGCAAGAGCCAGTTAGGTCAATACCAGA
TGTTATTGGTGTTGTGATACAAGCTAAGGTTGCTTTCACTCGGATATCAA
AGTTTCTTGATGCACCTGAGCTAAATGGGCAAGTTAGGAAGAAATACTAT
GTTGGCATTGATTACCCTATAGCGCTGAATTCCTGCAGTTTCTCGTGGGA
TGAAAATCCATCAAAACCAACTCTAAAGAATATAAATTTGGTAGTCAAAG
GTGGAGAAAAGGTTGCAATCTGTGGAGAGGTGGGATCAGGAAAGTCGACA
CTTTTGGCTGCTGTACTCGGAGAGGTCCCCAAAACTGAAGGCACGGTATG
CTTTTATTCCCTTCACCTTTTGATTATAGAAAATCACATAGCTGCAAATT
ATTTTTGAAAGAAAACATAGTTGTTAATTGATTTACGAGGTTATGATATG
TTTTTGTTACTTCCGTTAACTTTCCTCTTTATCATGTTGCAAACTTTGTA
ATGTTATTGAACCATACCACGGCATTGCAATTCTAAATGCAGTATCCAAA
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AGCCTGTTGATAATTGCACCATGTTCGGTGTTGCAAAGTTTTTGCCCGAC
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TGGAGAGGTGCTCATTGGTAAAGGACCTTGAAATGTTTCCATATGGGGAT
TGTACTCAAATTGGGGAGAGAGGAGTAAATCTTAGTGGTGGTCAGAAGCA
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TTGATGACCCTTTCAGTGCTGTTGATGCCCATACAGCAACAAGTCTCTTC
AATGTAAGGATCATATCAGCCGAATGCAGATTGTATTCCTATTTGATAAT
GAACTATTTTATGATGTTTTAAGTTGTATGACAGGAATATGTCATGAGTG
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CCCGTATTTGACTCCATTTTGGTATCTCCCTCCACTTCGAAAAGTCAACA
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ATTTTTTTGTTCATGCCATCTAAAGCTACTGATGATTTTTGGCAGTTAAT
GTCAGATGGAGAGGTTATTCGGTCTGCACATTATCAAGATCTATTGGGAG
ATTGTCAAGAATTTAAGGACCTTGTAAATGCCCATAAAGATACAGTTGGT
GTTTCAGACATTAATAACAGTATGTCACCTCAAAGAACTAAGGAAATATC
AATAAAGGAGACAGATGTTATTCATGGCGGCAGATTTGTAGAGTCTGTAA
AGCCATCAGTAGACCAACTGATCAAAAAGGAGGAAAGAGAAAAAGGGGAT
GCAGGTATTAAGCCTTATATGCTTTACCTGCGGCAGAATAAAGGCTTCCT
GTATGCCTCCTTTTGTGTTATTTCCCACATAATTTTCATAGCTGGGCAAA
TATCGCAGAATTCATGGATGGCTGCTAATGTCCAAAATCCTCACGTTAGT
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CTTCTTGCTAGCGAGATCTTTAGCAGTTGTTGTTCTTGGGGTCCAAACAT
CAAGATCCTTATTTTCCCAGTTACTCAATTCATTGTTCCGCGCACCAATG
TCCTTTTTTGATTCCACTCCTCTTGGAAGGATTCTTAGCCGGGTAAGAAT
CCTTAAACAAATGGCATATATGAATTCCAGTTCTGTTTTCAATCCGGAGG
TTTTCTCATGATGAGTTAATTTGCTGTACTTTTTTCTTCTAATGCAGGTG
TCTTCAGATTTGAGTATCGTTGACCTTGATATTCCATTTACCTTCGTGTT
TGCTGTTGGTGCCAGCTTAAATGCATATAGCAATCTAGGGGTATTGGCTG
TTGTTACATGGGAAGTTCTGTTTGTTTCCGTGCCTATGATAGTTTTGGGA
ATTAAGTTGCAGGTAATTGGCTAAGCCCCAGTTCTCGGGTTATTTTGGCA
AGTAGGTTAAAGTATATTTATTGCTAAGCCTATTTCTAGTTGCTGCTAAG
GCATTCTCTTTTGCATTCAAATTTTCATTAGCTGAACCTTGTTATGTTCG
TTCATGGAGAGGTACTATCTAGCCTCAGCTAAGGAGTTGATGCGGATCAA
TGGCACTACCAAATCTGCTCTAGCAAATCACTTGGGCGAATCGATTTCAG
GGGCTATAACAATAAGGGCCTTCGAGCAAGAAGATCGTTTCTTTGCTCAA
AATTTGGATCTTGTTGACAAGAATGCCAGTCCATATTTCTACAACTTTGC
ATCAACCGAGTGGTTGATTCAACGCTTGGAAATAATGAGTGCTGTAGTTC
TTTCTTTTTCTGCCTTTGTCATGGCTCTTCTTCCTCAAGGAACTTTTAGC
CCTGGTAAGCGATTGTATGGCCACTACCTTGCTTCGGGTCCATTGTTAAT
TGCACATGAGTTGTGACAAAATCATAGATGCATTTCCATGAAAGTGTTAC
TACCTTTTGATAGCATCCTGATACTGAGTTATGAAAAGCTTTGTTATGAA
AACATACTTGAATGTAAACAATAGCCTCCTGGTACTAATTGTTGCAAGAA
AATAATAGGTGCCATGTTTTGCCAGGCAGGGTTACATGGTGAACAGGAAT
GCAGTTTTAGTCCTATTTGTGCACTGGAGTCAATGAAATATAAGTATCTG
ATACTATTCAGTTCATGGGAAATTAGCATTACAATTAGTAAAATAAATTC
TCTGCTTTCGTACTTGCACAGGTTTTGTGGGAATGGCATTGTCCTATGGT
CTTTCCCTAAACATGTCATTTGTGTTCTCTATTCAAAACCAATGCAACCT
TGCAAATCTAATAATATCGGTGGAACGGCTGAACCAGTATATGGACATAC
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CCCCAAGACGGCAATGTAGAGCTTATAGATTTGAAGGTAATCTAATATAA
ATATCTACATGTCATACCTTACAAGACGTAATCCTATGAACAGTTCTAAC
AAGTTCATGTGATTGATTTCCATTCGACAGATTAGGTATAGGAAAGATTC
CCCCCTTGTTCTTCGTGGAATCACTTGCAGATTTGAAGGTGGAGATAAGA
TTGGTATCGTTGGTCGAACAGGAAGTGGCAAGACAACGTTGATTGGTGCA
TTGTTTCGTCTTGTTGAACCTGCTGAAGGAAAAATTATTATAGATTCTGT
GGACATCAGTAAAATAGATTTACATGACCTGCGTTCGCGCTTGGGTATCA
TTCCACAAGATCCAACACTTTTTCAGGGTACAATAAGATACAATTTAGAT
CCTCTTGGGCAATTCTCGGATCCACAAATATGGGAGGTAAGATGCACACA
GCTCTCTTTGTTTATTTTTCCCATCTTATGGAATGATCTGATAAGATTAC
CATGAGAAGTGGTTTCACTGAAAAAACCTGACGGTGTCCTTTTCAGTGCC
ATTGCAATCCAACTTGGTTACTTTAATAATATATCTGATGATTTCAGAAA
GTTGAACACATTGTCAAAAATGGGGTGAGTAAATTGAATTGGGGAATCTG
AAATGGCAAACCGCCTTTCTTACAATCTAGATTGCGTAGGAGGATCTAGG
GAACTTTTCACTAATAGAAGAAATAGGTACCCAAAATTCATGTCGAGGAG
AACTCGAACCTGGGTGGCAGGAGTGTAACAATGAACTCCCACCGACAGCT
CTAGTCTCAGATCCCCCTTTCTAATTTTATGCCATGTGGACATTTAAAAA
GAATCATTGAAGTAGCTAAAGTAGCTACACCATTTGTTATTGTGCTGCAG
GCTCTTGACAGCTAAAGTAGCTACACCATTTGTTATTGTGCTGCAGGTTC
TTGACAAATGTCAACTTCGTGAAGCTGTCCAGGAGAAGGAACAGGGATTG
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ATTGTTGAACTTAATAAATTGGGCAAACAGACTCTGCTCTAGTCATTTCA
GAGATTCAAAATAGGTGTTAAATACATGTGCCACTAGATATGTGAAAGTG
TTAATAGTCCTAGGCGTATAGCTATACCCTTTTGCTATCATGATGTCTGG
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ATTCAAATATTGCACAGTCATTACAGTTGCCCACCGAATACCAACAGTTA
TGGACTGCGATATGGTACTTGCCATGAGCGATGGTATGTTTCTGTCTCGA
TGATTTTTTTCTTTATTCTCTTAAACACAACACCAAAATGTGTGTCACTT
TGTATTAGAGGAAGAATACCGAGATGGCGCATAAGTTTACATAGGTAAAT
CTGCAGTGCCAAGAAGAGCCGATAGGCCTAAGCTAGCAAAAATCTAAAGG
CTTCAACAAGAAGAAAGCCAAAGTGCTACCATTAATATGGAATATATGAA
TTATCATATACTTGAAACCAAATGCATTGTTAATCTTTCCGCCCAAAACT
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TTTTTCCACGGATGTGAGAACTGTACTGTTGCCATACAGTGAAACATCAA
ATCTGCACTCCTATAACATCAATTAGACCTTTCCCTCTTTTCCAATCTAT
TTTTTTATTTTGCGGAGGAATCTCGGTCTTAACTTATATCTGAAGCATAT
GATTCCATTTTCTATAGTAATGAGTTGTATGTACACACATCCAGGGAGAG
CGGTGGAGTATGACAAACCTACGAAGCTTATGGAAACTGAAGGATCTCTC
TTCCGCGAACTGGTCAAGGAGTATTGGTCATACACATCGAACACAGATAT
TTAGAAGAGCGTTGCCGTTTATGTTGTTTCAGCTTTTCAAGAGATATATG
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GACAATCCCGTCTTTGTTATCTACTGCTACCTGAGAGATGCTGAGCGACA
TAGAGTGGATCGTTCCTGTCCTTGAGAATTTCTGAACCCGAACAGAGTAA
ACCCCTGAAGATTCCGTTGCTCCAGTAATCAGATATGGAAGGCTAAATGG
CAGGGGCTTCGAATCTGCAACCCTGCTGAGTATCAAGGATGAACGGGAAC
TCGTAGTAGTATTATAGCAAGGGAATAGTTGCTGTGCCTGCGTACGGCTT
GAACATATGTCGACAGTTTATGCTCATTATAGTAGCTCAGCAAATCCTCT
GACCTTATAAATGAAGTTTCATACGGTGCATGTTTGCAGGCGATATTACA
GTATAGGAAGGCAAGCTTTTTTATGCTCACTAAATAAGACTAGCATAATG
CCCTTGCGTTGCTACGGGCCAGAAAAATAAAAATAGTCTCATATAAACTT
GAAAAGACAGTTTAATATACTCA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.