Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA003001

[Submit comment/correction]

Sequence	AA003001
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA003001
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	GGATATTCTGGATTCCCTCATTAGGGATTGTAACATTGCTTAATACAATC CCTTTTCCCCCCGAAAAAAACAAAACCCGTCAGGGCCCAGAGCGACCAAG AAGCAGGTGAACCGGACAACAGGCCATCCACTGCGCGAATGGGAGCGCCT CCCTTTCCTCGCCCCTCTTCCTCTCCCTCTCCCTCGCTCCCGCCACCGTC CTCTTCCTCCATCCATTAATACCCCTCCAAATTGGAGCCTGGGATCAGCC ACGAACCCCAGTTCTCGGACGCGCGGAGCCCGCACAGGCCGGCGACAGGC AGGCCAAACCTCGGGACCACAGGTAAACAACCACACGCGGCGCGCGCTAA AATTACTCTCATCTAGATTTCTTGATTAGAAAATTCCATGTGTCGTGAGC ACGTTGGTGCGCAGGATCTCATCTTGGTAGCCGGTTTGTGATGATGCCGC AGCAATTGATGCATCCGTGTTTTTTATTCGTAAATTCTGATCTTGATTAT ACATGTTAACCAGGTGAACAGGCAATTTGCGACACATTTTTGGATTCTTT CTGATACACAAGTTGATGCCTGTTTTTTCTTAATCAATCGATCGATTGAA CGGAGACTACACATTTTTGGATTCTTTCTGATACACAAGTTGATGCCTGT TTTTTCTTAATCAATCGATCGATTGAACGGAGACTAAATTTTAACTTGTT AGAGTACAAGATAAACCAGTCATTTCGAAAATAAAAAACAAGATAAACCA GTAATATTCTACTAGTATTTTTGGATTTCCATAGAATCGATTGTTATCTG TAAAACAATTCTTCATTCGAAAAAAATTAGTCTGCGAAATGTGTCATGGT TGCATAGTATTTATGCATTTCTAAGCAACGGAAGGGAAGGCCGCCACTTA TGATTCTTATTATTTTTTAAAAATTCTTAGACGTGAGAAATTTAACCTTA CATGATACTTATATCTATTTTAACATTACGATAAGAGAGATGGAAGAAAA AAAGGCTCTTGTTATCCCAGACTCACGTTTTCTTATATTAATGATATATT GGATTGCTAATTACTAAAAAGAATGAGTTTTTTGGAGTATTTTAAGGCCC TACCTAGGACTGAACTCATTTCTTATTTTTGCGCCCTTGTGGTATCTACC CTGAAATTAGTCGCTATTACTCTAGCAAATATGTGCGATTCGTTATTTCC TTGGTACTAAATCCGAGGAATCTTAAAGTTAAATTGTGGTCTGCTGAGTT ACACTAAAACATTAAAATGTGCAGAGCTATTTTGTGGAATGGAAGAGGAG ATAGACACCCCTATAGATTTTTGTTCTAAGCCGTGTGGGCCTTTGGAGGA GTACCGTATTCCAGATTACATTTTGAAGCCAGATGCCCAACAGGTGCTTG TTGATCATGCTCCACAATGTCCTGTATTAGTGTTCATCAACTCTAAATCT GGTGGCCAACTTGGAAGTAGTTTGATCAAATCATACCGTGAACTTCTCAA TGAAGCCCAGGTACTTTCTCTGTCTCTCCGAGGATCCTAGTACTGTAGCA TCTTGGACTCTGGAACTATTGACAGAACCATTAAGTTCTTCAGGTTATTG ATCTCTCAGAAGAGGCTCCTGATAAGGTTTTGCACCGTTTATATGCCAAC GTTGAAAGGCTCAAGATTGAGGGAGACATTCTCGCTGTTCAAATTTGGAG GACGATGAGATTAATTGTAAGTGATGACAATTTCAAAGTTATAATGTCAG ATGATGCCTTTCTAGGCCTGCTGTTTCATGTATTGATTGAATAAATTTGG ATAGGTTGCAGGCGGCGATGGTACAGCGAGTTGGCTGCTTGGGGTAGTCA GCGATCTTAAGCTTTCTCACCCCCCTCCAGTGGCCACGGTGCCTCTGGGA ACTGGAAACAACCTTCCCTTTTCATTTGGATGGGTGGGTCGTAGGTGGTC AAATTAATGTATACAGTATGCACGATGCATGTAAAACATATCCCATGCAT GCATTTGTGTGCCTCATACTGTGCGCCAACCATGAAAGATCAAACCATTT TTATTTATTCTCACTGATGAAAGGTACCAGAAAGAAGGTTACTCTGCTGA TGCATGAACTAGTACTGTGCATAGCGTGAACCTCTTGTATTTTAGTGTTT TCTTTTGTCTAAGCTACGGTGGATGTAGAAGTTCTTTGATTTCTAGCAGC TTGGATGATGATGCTATTTGCCGACTGGTTTAGCTCTTTCTTTCACCCGA AGCTTGTTTCCGATCAGGGCCTTGTATACACTTGCTTCTGTATGTAGGGA AGTATTATAACTCATTCTGAGTTCTACATTGCAGGGAAAGAAAAATCCTT CTACAGACCAAGAGGCTGTAAAATTGTTCCTTGGTCTTGTCAAGCATGCA AAAGAGATTAAAATTGATAGGTACCTCCTGAAATGTAATGTTTATAATTC ACTATGTTTCCTGTATGTAATGCTTGTCCGGAGGATTAAAAAACTGCTTA TAACTGTCAACATTTCTAACAATGATGTAGTATGCTTCAATGTTCGTTTT ATTTCTTCTCATGCTTCTATACCCTATCTAGGGTAGATGTTTCTTTTTTC CTAAATTAAGAATTGCCTCTTCATCTGTGTCTATCTATGATCTGTATCGT ATACATGCACAAGGGTCCAATCCAATTGTTGCATTACTGTTTCAGTTGGC ATCTAATTTTGAGGATGAGAGCTCCAAAGGAAGGTCCATGTGAACCCATT GCTCCGTTAGAGTTGCCTCATTCATTGCATGCGTTCCACCGTGTGTCAAC TGGTGACTCACTCAATGTGGTAAGCATGTCTGTATACAAGTACTTCTTAT GGTATTATTTTCTTGAGGTCTTGTCAGATATTTTCATAAAATAAATATAT CTGGCGACCAAATCGAATTGAATGTTTCCGCGGTTGTTTTTCCTTGTTCC CTCCAGGAAGGTTACCACACATTCCGCGGAGGATTTTGGAATTACTTCAG TATGGGTAATGAGTTCTATGTTTGTCTGCTTAATTTATTGCAGACATGAA CCACATAGGAGTATGTATGTACCCTAAACAGTCTAACAATTTAATTCCAT AGCAGATTATCACTTCAGATACTTAAAATATCATCCCAATTTCTCCAGTG AACCCTCAAGAATATACTGATGCAGAAAAAATTGGAAAGTCATACATAGT GATCATGATTTTACATATTACAGGGATGGATGCAGAAGTGTCTTATGCAT TTCATTCTGAAAGGAAGAGAAATCCAGAGAAATTCAAAAATCAGCTGTCA AATCAGGTTACTTTATGTTTAGTTCTTTGAAGATTTCCTTCCTATCCTTT CCCTCGGTTGATTAGAAAAATCAGCAGCTAGTGTGGTTCAAGTTATGCTC AGCCTTGTGAATTGTTAATGCAATCATCTATATAGGGTCAATATGCTAAG CTTGGACTTAAACAAGGATGGTTTTGCGCTTCTCTAACTCATCCATCTTC AAGGTAGTTTGTGTATTTATCATACATTTGTATAATCTTCCGAATCACAT GTGTACCAGTTATTTTTTATGTTTTACACATGTTGAAGTATACCGACCTT TCCTCATAATCTTAGACTCTTGGGTATACTGCTGCATACAACTCAATATG ACATCAAAGCCAAGAGATTGTTGGCCTGAGAGAGCCTACAGGTGATGAAG AGTGTTTAAGTATTTGTATGTGACCTTTTAGGTGAACTGGTTTGCCCTGC AACTCAATTGCACAATCTCTATAGTAAAGGTTTCTTTGACCTTTTTGTGA GGGCAGGGTGTATCTGATCTGGATCAGGTAGTTTTCCCCTGATTCTATAA AAAATCAGACCACTGATCTCCGAGAGATCCCTGCTATTAAAACTGGAAGG GGAGGGAGTGTAGTTTACAAGACCACATTTTGGGACTAGTTTATTTGTTT GCGTTTACTCCAATTTCCAAATCACTACTAAGTACCAAGAATTGCAGTTT AATTAGATCTATTTTTGACAAATTTGGGTTCAGATGGATATTACTAACTG TTTTTGCAGTTTGGTCCTTTTTTATCTTTTATTGATAAGCTAGAATGTTC GATCTAGGAATATTCCTCAATTTGCAAAGGTGAAGGTTATGAAAAGAGGT GGTGGCCACTGGGAAGAACTACATATTCATCACAGGTAAACTTTGATGTC TTTTAGTTTCAATGGAGCACACTCTATTTATTCGTGTATTGTACAGCCTT AGATTGTGATATGCTACAAGTATGATGGAAATTTTTGCTTACTTCATTCC TTCTGTTTTTATCACCTTACAAAAATTCTGTTTGGGTTTTACCGATCATG CCAACATTTATAATGTTCTTGGGTAGTAGATGGGCTAATCTGTGTTATTC TACCTCTTGCAGCATTCGATCAATTGTCTGTCTCAATCTGCCTAGTTTTT CCGGAGGTTTTAATCCATGGGGCACACCTGGCACAAGGAGAGTACAAGAT GTGAGTTCCCATGTGCCATCTCAATTGATGTTTGAGATGCATGTTGATAT GATTCACATGTTTTGTGTGGCAATGTTTAGAGGGAATTCACGGAGCCTTA TGTTGATGATGGCCTTCTTGAGGTTGTGGGGTTTCGCGATGCTTGGCACG GGCTGGTTTTGCTGGCCCCTAATGGACACGGGCATCGCCTTGCACAGGTA TGAATTGCTTCTTCTGCTACTCCTGCCCTTTTGGCATCTCAGATAATGTG CTGTGTATTTTCCTGTGCCAAAATTCTCTTCCTTCAATCTCTTGCTGACA TCCTGCAAAACCAGGCCCACAGGATCCGCTTCGAATTCCACAAAGGTGCG GCAGACCACACGTTCATGCGGGTTGATGGGGAGCCATGGAAGCAGCCCCT CCCAAAGGACGACGACACCATTGTTGTGGAGATCTCCTGCCTAGGTCAGG TAACCATGCTAGCGAACGAGCCCTGCAAGTCAAAGAGCTTCAGCGACCCG TCGTCGCTTGGTCACGATGGCCACCACCACGACCATGGCGCCGAAGACAC AGATGGCATGGGGGATGAGGACGAGTGGGAGGATGGCAGGGGGAAGTTTG GGGCCGCGGATACATTCAAGCTCCCTGATGAGATCGACATTGCTCATCTT AGCTGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.