Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA018146

[Submit comment/correction]

Sequence	AA018146
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA018146
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CGACAAGTGTACGCGGCGACGGATAGAGATTAGAGAGAGCTTAGGCGAGG ACAAAAATGGGAAACTAGTTTTTAATAATCCGTTTCTTTCTTCTTCCCGC ATCGCATCGAGCTATATAAAGGTAGGCGAGAGAGGGGAGGGAGGGTTTTG GAATTTGGCCGCCGTTGGTCGCGCGGAAGCAGAGACCGAGCGCCCAAGCG GAGGAGTAGTAGTAGTAGGAGGAGGAGGCGCTCGTGCTGTGCTGCTGCCA CGAGCCCAGGCGTCCCACGACCACTCGCGCGCGCGGCGTTCGTGGGCGGA GCTACTTTGGCGGCGGTTCCCGGCGCCGAGGATGAGCGGCGGCGGAGGGG GAGGGAGGGGGCCGGCGGCGGGCCCGGTGCCGGCGTCCGCGAGGAAGCTG GTGCAGGGGCTGAAGGAGATCGTCAGCCGCCCCGACGCGGAGATCTACGC GGCGCTGCGGGACTGCGGCATGGACCCTGACGAGGCGGTCAGCCGCCTCC TCTCCCAAGGTCTCGCCTCCTCTGCCGCACCTCGCACCCTCACGTTTTGG TTGCGTTGGTTAGTCTTTCGAGTGTGTTTGCGCGAATGGATTGGAGGAAC GTGCCTTTCTTTTCGTTCTACCCCAGGGATTTATGGTGATCTGTTCTTGT GCTGTTGGAGTTTCTCACCGGAACCGGATGTGCTGCAGTGCAGCCTAGTA GGTTTGAACTGCTGTTACCAAGATTTGTTCCTCTATAGAGTTTTTTTTTT CTGTTGGATTCAGGCCTCTCGTTTGGGATGGGGTCGTACGCAGCGTCGAT ATATGTTTGTGCGTGGACCTTTTATTTTATTACTACATTTCCGAGTTCAG TCAGTGAATCTTAATTAGGTCTTGGTTTGCGATTGTTAGACTGTGCTATG CCACATCTAGAATGTTGTTAGTCAAGGGACACTTCACTAATTCTAGTAAA TATCGCTGTTACATACAAATAAAAGTCTTTCAACTAGCTATAATATTGTA AAGACAAATAGTTAAGTGCTTTTCAAAAGCCAATTGCAGCCTAGATTTGT GGGAAGAACGGTGTTGACAAACCTTAATTGCTGCAGAAAATGTTGAAAGC CAAAGCCTCCAAGAAAATGTGATGGAGCACTCGAGATGCTTTTGGATCTT AAGTGCTTTCATGATGCCCAGGTTTCTTTGAACTGGACTCAGGGGCCTAA TATTGTAAGCACTTGAGATTGAGGAATTTAGGATAAGAGAAAGCCATGAT ATCAAAAACGTGTTAACAACATCAGATGTCCAAATTACCATGCAGGTTGC CAAACTTGAATCTTCTTGAATGAAGACAGTCTTTTGAAAAGATGGATTGT TTCATTTCAATTTGCAAATGATCTAAGTGATGTGGTTTTGTCCCTTTGAT CTTTGATGTTCCTTACATTCATGTCTTTTATGCGACACAGAATTTGGATA AACTTGCACACGTCTTGTTGAATCAATTTGCTTTTGGAACGAGGCTTAAG GTGTGTGGGTCTGCTTTAAAGGGGGTTAGTCTTTTGCTCTAACACCCCAT GAGTATAAGTTCGGATTTCCATTAAGATGTTCAACTTCAAGCTGTCTCCC CTGGCTATGTGCTTATGAAGCTTATACAGGTGCTCAACCTGGCCAAGACA GCCTCTGAATGATGAACTACAGTACTATTTAAGTGCCTTGTCTGCTTCCT TGGTTTAGTCTTCTGTCTCCGCGTCTGCTGTTGAGAGGCTAAAGTGATGT TTACGGTTCGAGGCTCCCATGTTTTGTTCTTTTCCTTTGTTTGTCTTCAA CAGAATACTTCATTCCCCCCTGTTGTTGGTAGTGCTTTTTTCCTTTCCTC CCGTTAGTTACTGTTTACTATCGGTTGTAGGTGCATTTTCTTTGTTTGCA AGTAGCTTGAGTTCTCATTATATATCACAATGATCCTTATTAACATCCAT TGCTATTGTCTGAGAGATACCCTGAGTTCATAATTTTGTAAAATTCCTAA GCTTATGAGGAAAGATGAGACTTGCGTGTGTGTTAGTTAGAATCTCATTT AACAGAATGTAGTTAAATGAGCCTTTCTTATGGTGCAATTGTCCATCTGT ATACCTTACTTCCGTGCAAAGAACTGGGGGCTATCATTTGGTGCAAAACA TGTCATTATTGTTATAAGATACTAATCGCTACCACAATTTTTTTTTGTAA AAATATCGGTATCACCAACCCTTTGCTAATCCTAATATTATGAATGAACA CTGTAAATATATCGAGAATGAACTGTTGCCTCATCTAAATTACTGTTTGA ATTACATGAACGCCTTTCTTTTATTTACTGGCATGCTTTGGATATAATAA TTTGGGATGCAGGCCTTGCAATTTAAAGATTTTATCCTAGTGTTCATTTT AATATACAGTAATTTTTGTGGCCAATAGGGCTGAGATTGATGATGTTATT TTTTTGGACTCAATAATCCTCTTATGTATGCCATCTCACATATTTCCCAT TTTTCTCCAGATACTTTTCAAGAGGTAAAACACAAGCGCGATAAGAAAAA GGAGGTCAGTTAATTATGATATTGAACTTCTTTTTGTCCCACCTGCAAAT TGGTAGCTATTTTTAGTAGAGACCTCTCAGCTCTTCAAAATGAAAAGGAA GCTTGTGGCTAACCTAACGTTGAACATATAATTTCATTTAGTAGGATGAA TAAACACAATAACAATTGTTCAATATATCAGTCATTTGATCTGTTGACTG GTGTAGACCCTTTTGTGTTACAAAGTTCACATATCCAACTCATTCCCTAA TTGCCGATTTACTATGCCGTGCTTTTTGTCTTCAGAACTTACATCAGTAT CTACTGAATTTCACACAGGTGAATAAAGGCACACCTGAGCCTAGACCCCG AGGAGCAAATAACTCAAATAGTCGTGCCACTAGAGGCGGCACAGATCGTA CTAGCCGAAGCAGTTCAGTTCAGTCTGTATCCAGCGGAACTGGTAAGATA AAATAATGTTTGTATCCATGATTTTCGCATTTTTCTATAATTTATTTCCC ATATTTATATCTCTGTCCAACCAGGTAACTCTGCCTCAAGGTCGTCAATA TTGGGTCCTGGTGTTCCATCAACAAATTCCACTCGGAAGCTGACAGTTCC AAGGTAATGAAGGTTAATGTAGAAGTCTATGCTCCTTCTGTCTGTAGAAG TTTCCACATTTATCTGTTTTACTGGAAATAACGTTTTTTTTGCTTTCTAT TTTGCAGTTCCTATGTAAGCAAGGATGTGGTTCCTGATGTATCATTTGGG GCACTGCAACCATCATCAGGGTTTCAGCAGAACTGGTGTGGGGTGCCTGG TCAGATGTCAATGGCTGATATAGTTAAAATGGGCAGACCGCAAGGAAGGT CTTCTGGCAAGCCTACGGCTACAACAGATAAAGCATTTGCTGATCAAAAC TCATCATTGTCAAATGAAACAAACCTTAACTCAAAACAGTCTGCAAGCAC AGCCCTTCCGACAACGTTCGACCAGAGATTTCCAGCTCTTCCAGATCCTA TTCCTCAAGTTACGAATTCTAGTCATGCTTCTGCCGACAGCCACCAGTTA CATGAGAATGTTTGGTTTCCTCAGGATGAATTACCATCACGAAGACAATT CATAGCCCCTGAGCCATCTGGTGACACATCGTTATCTGCGGTATCATTGG AGTCATCAGTGCTGGTTGCTGATGCTGTTAACCTGCACGAGAAGTCCCAC GGAGAAGATAACTCCTCGATTGTTACGCAAACAGCAATACCTTCTGAGGG ACACTTGGAAGTTCTTCAGGACAACAGTCAATTCAGTGATGGATTATTGC AGAACTCAAGCACATACCAATCTCAAATGCATTCCTATGATGATGAAGGT TAGTATAAATGTCAAGATGCTAATCGTGTGGCCCATTTAATGTCTTTTTC TGGTTATGCGTCTTAAAAGTCAAATACCAATGTGTTTGTCTTTTTCTGTC ACAAAGTGTGGGCTTATGTTTTAGCGCATGCATAATACAGCAGACCATCA CAGTGTATCCTTATGAGGAAACACTGCTCTGTTATCTGATAAATGCTTGA TACCCCCATTCCTGACCAGACAACCAACTTATGTGCTTTGAATTCCAAGT GCATAGTGTTATAGTAAGACAATGCATAAACATGGATCGAGGCATACGAT CTAGTAGCTCCCAAGGCTACCATTCAATATTTGATGGGATTGACTTTGCG CAAGGAACGAAGTAGCTCATTGCTCAATTTTGCACTTTTTGGTTTGCCCG TTCTAGTGCTAGTGCATATAGCTCTAGGAATATTATGTTGAAGGAAGTGT GTTAAACGTTGAAGCTTGATACATCAATAATGTCACACATTATTAAAAAT ACATTGCTTGTCATTTTATGCAAACTTTATTTTTCTTTGATCAATAAAAT GGAAGTTTGATTCTTGAGAACATGCATGACTATTGACTATATTCTTAGAT GCCACAGGCAGTTTTTTTCACCTCAAGATCGATGGTTTTGCAGTTACAAC TGTAGTTTTATGGGGACTCAGATAGATAGTGTATGTTTTGACTAGTTCAT GTTTTTGAATAATATCCAGGATCATAGTCGTATCTTTAAGTATGTACCAT GTGGCTAACTGTGGAGTCTTAAATACTATGAAGCTATACAACCTTATCCC TACTCTGTTATGTTGTCAACTATGAATTGATTAATCATGTGATGTCATTT TAACTTTCAATTGTACCAAAAAGCATTATCTTTCATAATTTGTGATTTAC TTTTTAGGTGTTCTTACGGATTCAATATCAAACTTAGTAATTTACTATAG GATTATCATATCATTCTTTCTTCACAATTTTGATTTACCAATATAATTTG TAACTTGTTTGAAGATATTAGTCGAATCTTCAATGACATACATATGATTA AACTTCTAACCGTGTGAATATACTCTGACCTGAACACAGATGTTCTATAT GTTGTGCTAACTCTTTGCCAGTGGTGAACATTTGTGCACCAATACAACTT GTATCTTGTTTCAGGAAGCTAGTCCAATTTTCCATTGCACATATACCTAA TTTTGAACTTCTAGTTGTATTAATTTATTCCTACCTGTATACACAAATGC TCTATATGTTGTGCCAACATTTTACCAGCAGGATGAGCAATTTAGCCTGT TAGGGATGGTTTGACCAAGACCGATATCTCTAACAGAGCTACTGACACTT ATTCATGGAGGCTGTGGTGGCTGCGGTTTTGTAAAACTGCTCTGCATAGT TATTGCCTTGCCTGCTTTTGGTTTTCTTTATGTATGGCCTATCTTGCTTT ATCTGTGTGTGCTACAGATACAAGTGTGCGTATGCATAATTATTAATATG AACTCTGATGACACAATCATTTGCAGTTGAGGTTCGCGATGTGGACGTGG AATCAGCTGTGACAAACTTTCAGCATCTAAGGCTACAAAACGAAGATCTA GCTGTAGCTAATTCTGCTGATGATAATCCAGCGGTTATAATCCCCGATCA CCTACAACTTGAAAATACCGACTGCGCACATCTAAGCTTTGGTAGTTTTG AATCTGGTGCCTTCTCTGGGTTGCTTCCATCTAAGGTCCCTAAATACGGT GCAGAAGAGGTGCCTATCCCAGATGAGCAATCAGTTGATCAAACAGATGC CAGGTCATTTCTTTTCCTGCTATGTTAGCTATTCATAACACGAAATGCAA CTTGTCTTCTGACACCTTCCTTACAGGAACCAAGATTACTATGACAGTGG TGCTCTACATTCACCAGCAAATGAGGATGTTGAGGCCAGAATTGGTACCA ACACGGAGAATATTGATGTCCCTTCAGTTTCACAGCCTGATATACTGATG CAAGGTGCTCTAGACGTGTCTGGTCTTCAGTATAACCCACCGTCGGTTTC AGATCATGTGTATCCGAACACAACACAGCCAAGTATAGCAGAGAGTCAAC AAGCAAACGCACAAGCACACCATCTTTCTCATTTTTCAAGCTTCCTGGTA TAGTTTTTATCCCAGATGTTGGATCATTGGTCACATATATTGGGGGTAAT TTGGGACTTGCTGTAGTTGTAGAACTGCATGTTTAGCTTGTTATTGATGT TTATTAGAGCACATGTATTCTGCATATGTTTCAAAAGGTTATTTCTTCTT CCTGGACAAATGTCGCAAATTGACCTTCTCTCCCCTCCTCTCTGCTAAAT TGAAGGTTAATTTCTAGTGGTGGATTGTCATAATCTCGTTTGCCCCACTG TTTTTCCATATTTTAGTGTTTGTTTGACCCGCTTTTCCCTACTTTGGTGG ATAATTTTCAACAACCGATGATGGAATAAGCACAGTTCAACAACCGCATA CCAAGCCTTAGGCTTAAAACCAGATTTTGGCCCGTACAGCACACGGCATC TTAACTAATGTGAATTATAAATCATTTTTAAATATAATATGAAAAATCTA GCTTGGTGCCAAATTTTGACACATTAAATAAGGATAGCTTTATGTAGTAG TGAAATGTAAGAGCTACTGTATCCCTGACGGGAGTATATAATGTTGTATA ATTTGTGTCTGCCTGGTCAACATTGTTTGGCCGAGGAATGTTCTATTTTT GTTGCATGCTGCTCTGATATGCTTTTATTTACTTCTTCTCTTTAGCCTTG ATTATGCTTTTATTTACTAGTTCTCTTTAGCCTTGATTGTGCTGATTCCT GGACACTGTGACTGTTAATATGTGAAGGTGGCTGAAAGTAAATCAACCCT CTAATCGTGCAGTAATGTATGGGATAGTAAAATTTTATTGTTATAGCTTT CTGCTAATTTTAAGATGTTCTTTTTTCGGCTTTGTTGTCCTAATTTCCCC CCTGTTCCGTTCTTACAGCAAGCAAATACTATGCAAAACAACTTGTTGGG GTCAAATCTTACCCCTCACCGGGACTTTGACTTCTCACCGTTTCTGTCGA CACAGTCAGCTATGAAATATAACCTGGCTGTACCAACTACCAGCTACCCG ATTTCCATGCAAGAGGTAATCCCAGTCGTGGCACTGCTTCCTCTTTTATG TTTGTTTGCTTGTCTGTAGAAGGCAGATTGCAAGAGTTTAAGTTCCGAAG TCGAGAAAAAAGTCGTGCTCTTTATTTTGAACAAAACTGAGTTGATGTGG TAGGGCTAATAGGCATCTTTTTCCTGTGGAACTTCATGACTTCATAAAAA ATATTTTGGTAGGTGTAAGCATAAAATCCTGGTTGGTAAATTCTCAACGG ACTGCCTTAGATCATAACTGGAAGGCTGTCCATATCATTTTGCATATTCT TCTATTCTCTGCAACATAAAGGAGCAGCTCCTTTTATCAAATGAATGGAG GTGTTCAAGAAGTGAGGGAGAAAAAGCACTATGGTTGTGACTGTCTGTCA TGACGCCTCCAATACAATTTGGAGAGTACAGTCAAGTAATTGTAGACGTT CACATGACTATCATGTACTTGTGCACTTGTGGTCAATGCATTGTGCTTAT AGTGTGGCAAGTGTCAAAGATTAGGACATAATTTTTGTGTTTCAACTTCT GTTCATACTTCTGAATTTCAGTTTTTCTTGATTACTTTTGCAGAATTTAA GTCAAGGGGGTTTCTCCAACATTCAGTCTACACAAAATCTTCCCAGCACA AGCATTCCACCAGGGCCACCTCACCCTCAGCAATTGCCTGTACATCCGTA CTCTCAGCCAACTCTACCCCTGGGTCCTTTCGCCAGCTTGGTTGGCTATC CATACTTGCCTCAGAACTACTATGTACCACCACCAGCCTTCCAGCAAGCA TACGCAAGTAATGGACCTTTCCACCAATCCAGTGGTGGTAATGCTGCTGT GCCTGAATCTGCTATGAAATACTCGATGCCGCAATACAAAAGCAGCCTTC CAGCTGCAAGCCCACCGCAGCATTCATCAGTAGTCCCTGGTTATGGAGGA GGCTTTGGAAGCTCAGGTAATATTCCGAGTTTTGGGCTAAACCAGAGTGC CCCCTCCCCTGCCACAACGATGGGGATTGATGAAGCTTTGAGCGCACAGT TCAAAGAGGCCAATCACTACATGGCCCTACAGCAGGTAAAGGGGCATACC TTCTTTCATCCAGCTTCTGAAATTCGGGTGCACTTGTTTTGTACCGATGA GGATTTGCTCATTGCATTCTGAGGTGTTCATTTGTGACTCTTCAGGGTGA CAACAACTCTGCGATGTGGCTTCATGGAGCTGCTGGTTCAAGAACTGTTT CAGCTGTTCCGCCTGGTAACTTCTACGGTTTCCAGGGCCAGAGCGCGCAG GGTGGCTTCCGCCAGGCACAGCAGCCTTCTCAGTACGGTGGTCTTGGGTA CCCTGGTTTCTACCAGTCTCAGGCTGGTATGCCACAGGAGCACCAGCAGA ACCCTGCTGAGGGGCGCTTGAACAGCTCCCAGACTGCCCCGGGGCAGCCA TCGCACCAGATGTGGCAGCACAGCTACTAAGGTCTAGCTAGGCCTGCGTT TCTGTGGAAGAAGCCTCGTTTACACTGCCAGGCTATCTGCGCGCCTTGGC ATGCGCCCTGAGCTACTAAGGTCTAGCTAGGCCTGTGTTTCTGTGGAAGA AGCCTCGTTTGCACTGCCAGGCTATCTGCGCGCCTTGGCATGCGCCCTGA AGCGAGCAGATCAGCTGAGCTGCCGTCTTGAGTGCAGATCAGTTGAGCTG CCGTCTTGAGTGCCAACGATGTGTTCCATAGTTTCTGAGTATGCTTGTTT TTCTTTATTTCTGTTCTTATTTTTTCACTTATTGCGTGTGTTTCGGAACT AGTTTCAGCGTATCGTGAGTTCTACTCAATAGTGAGC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.